*** 7LO8 A1 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603140434492684793.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603140434492684793.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603140434492684793.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 369
First residue number = 1
Last residue number = 383
Number of atoms found = 2831
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 138.089249 +/- 9.801657 From: 115.456000 To: 164.502000
= 136.356691 +/- 13.144240 From: 109.283000 To: 164.207000
= 156.785361 +/- 12.670970 From: 125.302000 To: 183.590000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.8929 % Filled.
Pdbmat> 1043477 non-zero elements.
Pdbmat> 114069 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.59 +/- 21.40
Maximum number = 123
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 2.281380E+06
Pdbmat> Larger element = 530.244
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
369 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603140434492684793.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603140434492684793.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603140434492684793.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2831 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 369 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 18 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 35
Blocpdb> 15 atoms in block 4
Block first atom: 54
Blocpdb> 23 atoms in block 5
Block first atom: 69
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 92
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 108
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 127
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 146
Blocpdb> 12 atoms in block 10
Block first atom: 158
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 170
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 185
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 200
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 215
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 229
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 249
Blocpdb> 12 atoms in block 17
Block first atom: 266
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 278
Blocpdb> 10 atoms in block 19
Block first atom: 293
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 303
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 319
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 331
Blocpdb> 10 atoms in block 23
Block first atom: 346
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 356
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 372
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 386
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 403
Blocpdb> 13 atoms in block 28
Block first atom: 419
Blocpdb> 15 atoms in block 29
Block first atom: 432
Blocpdb> 11 atoms in block 30
Block first atom: 447
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 458
Blocpdb> 17 atoms in block 32
Block first atom: 471
Blocpdb> 12 atoms in block 33
Block first atom: 488
Blocpdb> 18 atoms in block 34
Block first atom: 500
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 518
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 534
Blocpdb> 12 atoms in block 37
Block first atom: 548
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 560
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 576
Blocpdb> 13 atoms in block 40
Block first atom: 595
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 608
Blocpdb> 19 atoms in block 42
Block first atom: 623
Blocpdb> 16 atoms in block 43
Block first atom: 642
Blocpdb> 11 atoms in block 44
Block first atom: 658
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 669
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 687
Blocpdb> 15 atoms in block 47
Block first atom: 704
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 719
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 735
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 752
Blocpdb> 8 atoms in block 51
Block first atom: 767
Blocpdb> 14 atoms in block 52
Block first atom: 775
Blocpdb> 9 atoms in block 53
Block first atom: 789
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 798
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 813
Blocpdb> 11 atoms in block 56
Block first atom: 828
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 839
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 850
Blocpdb> 13 atoms in block 59
Block first atom: 866
Blocpdb> 14 atoms in block 60
Block first atom: 879
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 893
Blocpdb> 19 atoms in block 62
Block first atom: 906
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 925
Blocpdb> 17 atoms in block 64
Block first atom: 939
Blocpdb> 15 atoms in block 65
Block first atom: 956
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 971
Blocpdb> 11 atoms in block 67
Block first atom: 991
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1002
Blocpdb> 14 atoms in block 69
Block first atom: 1018
Blocpdb> 15 atoms in block 70
Block first atom: 1032
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1047
Blocpdb> 11 atoms in block 72
Block first atom: 1063
Blocpdb> 12 atoms in block 73
Block first atom: 1074
Blocpdb> 8 atoms in block 74
Block first atom: 1086
Blocpdb> 19 atoms in block 75
Block first atom: 1094
Blocpdb> 14 atoms in block 76
Block first atom: 1113
Blocpdb> 13 atoms in block 77
Block first atom: 1127
Blocpdb> 21 atoms in block 78
Block first atom: 1140
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1161
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 1176
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1199
Blocpdb> 9 atoms in block 82
Block first atom: 1215
Blocpdb> 12 atoms in block 83
Block first atom: 1224
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1236
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1252
Blocpdb> 16 atoms in block 86
Block first atom: 1268
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1284
Blocpdb> 15 atoms in block 88
Block first atom: 1298
Blocpdb> 18 atoms in block 89
Block first atom: 1313
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1331
Blocpdb> 18 atoms in block 91
Block first atom: 1346
Blocpdb> 6 atoms in block 92
Block first atom: 1364
Blocpdb> 17 atoms in block 93
Block first atom: 1370
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 1387
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1409
Blocpdb> 19 atoms in block 96
Block first atom: 1425
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1444
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1458
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1473
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1488
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1503
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1517
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1532
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1546
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 1562
Blocpdb> 20 atoms in block 106
Block first atom: 1578
Blocpdb> 14 atoms in block 107
Block first atom: 1598
Blocpdb> 19 atoms in block 108
Block first atom: 1612
Blocpdb> 13 atoms in block 109
Block first atom: 1631
Blocpdb> 16 atoms in block 110
Block first atom: 1644
Blocpdb> 20 atoms in block 111
Block first atom: 1660
Blocpdb> 13 atoms in block 112
Block first atom: 1680
Blocpdb> 17 atoms in block 113
Block first atom: 1693
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1710
Blocpdb> 13 atoms in block 115
Block first atom: 1724
Blocpdb> 15 atoms in block 116
Block first atom: 1737
Blocpdb> 8 atoms in block 117
Block first atom: 1752
Blocpdb> 12 atoms in block 118
Block first atom: 1760
Blocpdb> 15 atoms in block 119
Block first atom: 1772
Blocpdb> 13 atoms in block 120
Block first atom: 1787
Blocpdb> 20 atoms in block 121
Block first atom: 1800
Blocpdb> 20 atoms in block 122
Block first atom: 1820
Blocpdb> 22 atoms in block 123
Block first atom: 1840
Blocpdb> 17 atoms in block 124
Block first atom: 1862
Blocpdb> 19 atoms in block 125
Block first atom: 1879
Blocpdb> 21 atoms in block 126
Block first atom: 1898
Blocpdb> 17 atoms in block 127
Block first atom: 1919
Blocpdb> 17 atoms in block 128
Block first atom: 1936
Blocpdb> 18 atoms in block 129
Block first atom: 1953
Blocpdb> 13 atoms in block 130
Block first atom: 1971
Blocpdb> 20 atoms in block 131
Block first atom: 1984
Blocpdb> 16 atoms in block 132
Block first atom: 2004
Blocpdb> 18 atoms in block 133
Block first atom: 2020
Blocpdb> 14 atoms in block 134
Block first atom: 2038
Blocpdb> 15 atoms in block 135
Block first atom: 2052
Blocpdb> 16 atoms in block 136
Block first atom: 2067
Blocpdb> 15 atoms in block 137
Block first atom: 2083
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 2098
Blocpdb> 12 atoms in block 139
Block first atom: 2114
Blocpdb> 26 atoms in block 140
Block first atom: 2126
Blocpdb> 14 atoms in block 141
Block first atom: 2152
Blocpdb> 16 atoms in block 142
Block first atom: 2166
Blocpdb> 14 atoms in block 143
Block first atom: 2182
Blocpdb> 18 atoms in block 144
Block first atom: 2196
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 2214
Blocpdb> 12 atoms in block 146
Block first atom: 2232
Blocpdb> 19 atoms in block 147
Block first atom: 2244
Blocpdb> 16 atoms in block 148
Block first atom: 2263
Blocpdb> 18 atoms in block 149
Block first atom: 2279
Blocpdb> 13 atoms in block 150
Block first atom: 2297
Blocpdb> 15 atoms in block 151
Block first atom: 2310
Blocpdb> 23 atoms in block 152
Block first atom: 2325
Blocpdb> 14 atoms in block 153
Block first atom: 2348
Blocpdb> 13 atoms in block 154
Block first atom: 2362
Blocpdb> 13 atoms in block 155
Block first atom: 2375
Blocpdb> 20 atoms in block 156
Block first atom: 2388
Blocpdb> 15 atoms in block 157
Block first atom: 2408
Blocpdb> 9 atoms in block 158
Block first atom: 2423
Blocpdb> 12 atoms in block 159
Block first atom: 2432
Blocpdb> 14 atoms in block 160
Block first atom: 2444
Blocpdb> 18 atoms in block 161
Block first atom: 2458
Blocpdb> 13 atoms in block 162
Block first atom: 2476
Blocpdb> 12 atoms in block 163
Block first atom: 2489
Blocpdb> 19 atoms in block 164
Block first atom: 2501
Blocpdb> 12 atoms in block 165
Block first atom: 2520
Blocpdb> 15 atoms in block 166
Block first atom: 2532
Blocpdb> 13 atoms in block 167
Block first atom: 2547
Blocpdb> 9 atoms in block 168
Block first atom: 2560
Blocpdb> 19 atoms in block 169
Block first atom: 2569
Blocpdb> 15 atoms in block 170
Block first atom: 2588
Blocpdb> 18 atoms in block 171
Block first atom: 2603
Blocpdb> 14 atoms in block 172
Block first atom: 2621
Blocpdb> 15 atoms in block 173
Block first atom: 2635
Blocpdb> 20 atoms in block 174
Block first atom: 2650
Blocpdb> 13 atoms in block 175
Block first atom: 2670
Blocpdb> 11 atoms in block 176
Block first atom: 2683
Blocpdb> 14 atoms in block 177
Block first atom: 2694
Blocpdb> 9 atoms in block 178
Block first atom: 2708
Blocpdb> 14 atoms in block 179
Block first atom: 2717
Blocpdb> 15 atoms in block 180
Block first atom: 2731
Blocpdb> 16 atoms in block 181
Block first atom: 2746
Blocpdb> 18 atoms in block 182
Block first atom: 2762
Blocpdb> 19 atoms in block 183
Block first atom: 2780
Blocpdb> 16 atoms in block 184
Block first atom: 2799
Blocpdb> 17 atoms in block 185
Block first atom: 2814
Blocpdb> 185 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1043662 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8493
Prepmat> Matrix trace = 2281380.0000
Prepmat> Last element read: 8493 8493 164.1355
Prepmat> 17206 lines saved.
Prepmat> 15178 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2831
RTB> Total mass = 2831.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2831
RTB> Number of blocks = 185
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 254432.1130
RTB> 70197 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1110
Diagstd> Nb of non-zero elements: 70197
Diagstd> Projected matrix trace = 254432.1130
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1110 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 254432.1130
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.1728806 1.2955931 3.3688438 3.7166395
4.2561682 5.8569489 6.1810421 6.5731917 8.3026884
9.0993014 9.3051193 10.5201946 10.7152943 11.1938706
12.2294330 12.6359546 12.9882175 13.3662244 13.9657754
14.1416618 14.7648681 15.5604935 16.0677033 17.2937530
17.8964337 18.3757575 18.8277807 19.2674168 20.0232720
20.6393643 21.3925866 22.1608031 22.7590960 24.1623522
24.8823563 25.8544482 25.9402038 26.5801077 27.7961866
27.8567830 28.3754884 28.7889170 29.1846800 30.3464815
31.0044600 31.4728092 32.4602479 32.9750565 33.0568455
33.9935093 34.8072430 35.1501462 35.8161738 36.6222336
36.7439824 37.2838589 38.3682631 38.9187193 39.2900403
39.5977935 40.7671751 41.5887533 41.9236348 42.1455687
43.2353253 44.0019363 44.6225754 45.6004586 45.9180312
46.0286899 46.8258952 47.6136614 47.8722811 48.6337874
49.1618230 49.5688390 49.8881442 50.5383038 51.1193171
51.3167909 52.0588982 52.6587068 53.1483790 53.4814957
54.3640827 54.9484650 55.5754417 56.0684821 56.1051123
56.9853053 57.6548968 57.8102833 58.4219072 58.7719966
59.3336825 59.8331535 60.6176459 60.6988274 62.7654987
62.8899077
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034337 0.0034337 0.0034340 0.0034350
0.0034364 117.6040241 123.6031667 199.3130432 209.3488106
224.0292234 262.8034111 269.9766040 278.4091023 312.8993412
327.5663673 331.2502796 352.2144478 355.4653991 363.3167501
379.7505762 386.0106693 391.3542518 397.0083622 405.8147300
408.3621714 417.2631825 428.3580807 435.2834764 451.5854147
459.3868175 465.4980920 471.1886771 476.6581537 485.9177947
493.3367167 502.2580772 511.1966843 518.0513196 533.7831816
541.6777948 552.1574254 553.0723817 559.8525346 572.5163441
573.1400544 578.4515018 582.6502593 586.6414542 598.2041929
604.6546073 609.2044048 618.6872930 623.5740795 624.3469353
633.1305658 640.6636633 643.8116751 649.8825482 657.1548151
658.2462481 663.0643953 672.6379248 677.4457940 680.6698552
683.3304498 693.3469186 700.2985563 703.1123804 704.9709799
714.0270189 720.3294555 725.3917235 733.2969618 735.8459595
736.7320908 743.0847089 749.3092084 751.3414373 757.2936694
761.3936840 764.5390166 766.9975110 771.9792214 776.4040676
777.9022457 783.5067934 788.0075435 791.6628980 794.1399651
800.6658629 804.9577066 809.5370724 813.1200683 813.3856355
819.7411185 824.5431342 825.6535057 830.0096572 832.4928319
836.4614528 839.9747417 845.4634033 846.0293529 860.3115871
861.1637872
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2831
Rtb_to_modes> Number of blocs = 185
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.76
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.16
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.94
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.79
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.37
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.92
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.83
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.87
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.63
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.16
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.89
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.89
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 0.99994 0.99998
1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
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1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
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0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 50958 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
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1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
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1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 0.99997
0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002
0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603140434492684793.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603140434492684793.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603140434492684793.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603140434492684793.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 369
First residue number = 1
Last residue number = 383
Number of atoms found = 2831
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.173
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.296
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.369
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.717
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.256
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.857
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.181
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.573
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.303
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.099
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.305
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.89
Bfactors> 106 vectors, 8493 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.173000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.435 for 369 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.030 +/- 0.03
Bfactors> = 113.755 +/- 13.73
Bfactors> Shiftng-fct= 113.724
Bfactors> Scaling-fct= 430.047
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603140434492684793.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603140434492684793.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.1
Chkmod> 106 vectors, 8493 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2831 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 34 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8863
0.0034 0.8598
0.0034 0.7983
0.0034 0.8637
0.0034 0.7630
0.0034 0.7153
117.6050 0.5159
123.6173 0.4371
199.3091 0.4557
209.3500 0.2161
224.0152 0.4035
262.7933 0.3724
269.9641 0.1031
278.3931 0.4842
312.8918 0.5291
327.5469 0.2137
331.2339 0.2621
352.1961 0.5003
355.5282 0.1798
363.2383 0.4623
379.7431 0.2218
386.0559 0.4859
391.3643 0.3902
397.0474 0.4495
405.8587 0.3008
408.3206 0.3166
417.1765 0.2883
428.3329 0.5804
435.2959 0.2602
451.5170 0.3048
459.4129 0.2635
465.5318 0.0762
471.1962 0.2716
476.6696 0.1661
485.8572 0.4715
493.3231 0.3618
502.2062 0.3631
511.1655 0.4129
518.0394 0.2310
533.7343 0.3727
541.6289 0.3917
552.0862 0.4571
553.0465 0.4175
559.8274 0.3683
572.5310 0.4433
573.1485 0.4770
578.4727 0.4088
582.6362 0.3862
586.5692 0.3772
598.2132 0.4526
604.5852 0.4826
609.1511 0.5218
618.6584 0.5522
623.5940 0.4262
624.3499 0.5555
633.0707 0.3361
640.6615 0.4327
643.7827 0.4419
649.8894 0.3915
657.1066 0.5496
658.1823 0.3406
663.0016 0.2799
672.6243 0.4855
677.4279 0.3630
680.6403 0.4246
683.3202 0.5437
693.3412 0.4308
700.2790 0.4354
703.0517 0.4227
704.9778 0.3822
714.0350 0.4517
720.2827 0.4735
725.3397 0.4664
733.2618 0.5529
735.8301 0.4418
736.7109 0.5234
743.0854 0.4140
749.2482 0.4046
751.2913 0.3744
757.2317 0.4256
761.3469 0.4091
764.5152 0.5208
766.9789 0.5600
771.9590 0.4593
776.3759 0.4516
777.8932 0.3218
783.4815 0.2865
787.9834 0.4249
791.6410 0.3689
794.0948 0.3463
800.6014 0.3284
804.9344 0.4333
809.5355 0.3805
813.0962 0.3968
813.3861 0.3941
819.7397 0.3814
824.4727 0.3160
825.6160 0.3415
829.9605 0.4329
832.4430 0.4298
836.3996 0.3910
839.9165 0.4479
845.4435 0.4895
846.0012 0.4568
860.3055 0.5117
861.1275 0.5188
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2603140434492684793.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603140434492684793.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2603140434492684793.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603140434492684793.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2603140434492684793.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2603140434492684793.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.1
Projmod> 106 vectors, 8493 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 369
First residue number = 1
Last residue number = 383
Number of atoms found = 2831
Mean number per residue = 7.7
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 369
First residue number = 1
Last residue number = 383
Number of atoms found = 2835
Mean number per residue = 7.7
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 2067 of first conformer: ILE 284 N not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603140434492684793 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
making animated gifs
11 models are in 2603140434492684793.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 369 1.851 325 1.390
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 369 1.481 350 1.303
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 369 1.111 368 1.101
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 369 0.740 369 0.740
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 369 0.370 369 0.370
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 369 0.001 369 0.001
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 369 0.370 369 0.370
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 369 0.740 369 0.740
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 369 1.111 368 1.101
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 369 1.481 350 1.303
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 369 1.851 325 1.389
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603140434492684793 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
making animated gifs
11 models are in 2603140434492684793.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 369 1.857 326 1.352
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 369 1.485 348 1.255
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 369 1.114 365 1.073
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 369 0.743 369 0.743
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 369 0.371 369 0.371
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 369 0.001 369 0.001
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 369 0.371 369 0.371
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 369 0.743 369 0.743
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 369 1.114 365 1.072
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 369 1.485 348 1.255
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 369 1.857 326 1.352
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603140434492684793 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603140434492684793.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2603140434492684793.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2603140434492684793.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
making animated gifs
11 models are in 2603140434492684793.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 369 1.827 332 1.326
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 369 1.462 352 1.234
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 369 1.096 364 1.034
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 369 0.731 369 0.731
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 369 0.365 369 0.365
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 369 0.001 369 0.001
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 369 0.365 369 0.365
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 369 0.731 369 0.731
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 369 1.096 364 1.034
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 369 1.462 352 1.234
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 369 1.827 333 1.336
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603140434492684793 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2603140434492684793.atom
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2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
making animated gifs
11 models are in 2603140434492684793.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 369 1.828 345 1.158
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 369 1.462 356 1.028
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 369 1.096 363 0.849
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 369 0.731 366 0.608
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 369 0.366 369 0.366
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 369 0.001 369 0.001
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 369 0.366 369 0.366
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 369 0.731 366 0.608
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 369 1.096 363 0.849
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 369 1.462 356 1.028
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 369 1.828 346 1.166
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603140434492684793 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603140434492684793.eigenfacs
2603140434492684793.atom
making animated gifs
11 models are in 2603140434492684793.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603140434492684793.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 369 1.815 344 1.387
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 369 1.452 358 1.211
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 369 1.089 366 0.985
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 369 0.726 367 0.670
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 369 0.363 369 0.363
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 369 0.001 369 0.001
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 369 0.363 369 0.363
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 369 0.726 367 0.670
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 369 1.089 366 0.985
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 369 1.452 358 1.211
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 369 1.815 344 1.387
2603140434492684793.10.pdb
2603140434492684793.11.pdb
2603140434492684793.7.pdb
2603140434492684793.8.pdb
2603140434492684793.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m18.511s
user 0m18.415s
sys 0m0.086s
rm: cannot remove '2603140434492684793.sdijf': No such file or directory
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