CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  7LO8 A2 single  ***

LOGs for ID: 2603140609202729785

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603140609202729785.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603140609202729785.atom to be opened. Openam> File opened: 2603140609202729785.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 369 First residue number = 1 Last residue number = 383 Number of atoms found = 2827 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 138.111269 +/- 9.798448 From: 115.456000 To: 164.502000 = 136.350699 +/- 13.117252 From: 109.283000 To: 163.758000 = 156.730189 +/- 12.700301 From: 125.302000 To: 183.590000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8938 % Filled. Pdbmat> 1040833 non-zero elements. Pdbmat> 113779 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.49 +/- 21.31 Maximum number = 123 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.275580E+06 Pdbmat> Larger element = 530.244 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 369 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603140609202729785.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603140609202729785.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603140609202729785.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2827 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 369 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 35 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 54 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 69 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 92 Blocpdb> 19 atoms in block 7 Block first atom: 108 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 127 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 146 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 158 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 170 Blocpdb> 15 atoms in block 12 Block first atom: 185 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 200 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 215 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 229 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 249 Blocpdb> 12 atoms in block 17 Block first atom: 266 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 278 Blocpdb> 10 atoms in block 19 Block first atom: 293 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 303 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 319 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 331 Blocpdb> 10 atoms in block 23 Block first atom: 346 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 356 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 372 Blocpdb> 17 atoms in block 26 Block first atom: 386 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 403 Blocpdb> 13 atoms in block 28 Block first atom: 419 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 432 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 447 Blocpdb> 13 atoms in block 31 Block first atom: 458 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 471 Blocpdb> 12 atoms in block 33 Block first atom: 488 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 500 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 518 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 534 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 548 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 560 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 576 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 595 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 608 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 623 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 642 Blocpdb> 11 atoms in block 44 Block first atom: 658 Blocpdb> 18 atoms in block 45 Block first atom: 669 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 687 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 704 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 719 Blocpdb> 17 atoms in block 49 Block first atom: 735 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 752 Blocpdb> 8 atoms in block 51 Block first atom: 767 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 775 Blocpdb> 9 atoms in block 53 Block first atom: 789 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 798 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 813 Blocpdb> 11 atoms in block 56 Block first atom: 828 Blocpdb> 11 atoms in block 57 Block first atom: 839 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 850 Blocpdb> 13 atoms in block 59 Block first atom: 866 Blocpdb> 13 atoms in block 60 Block first atom: 879 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 892 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 905 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 924 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 938 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 955 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 970 Blocpdb> 11 atoms in block 67 Block first atom: 990 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1001 Blocpdb> 14 atoms in block 69 Block first atom: 1017 Blocpdb> 15 atoms in block 70 Block first atom: 1031 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1046 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1062 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1073 Blocpdb> 8 atoms in block 74 Block first atom: 1085 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1093 Blocpdb> 14 atoms in block 76 Block first atom: 1112 Blocpdb> 13 atoms in block 77 Block first atom: 1126 Blocpdb> 21 atoms in block 78 Block first atom: 1139 Blocpdb> 15 atoms in block 79 Block first atom: 1160 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1175 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1198 Blocpdb> 9 atoms in block 82 Block first atom: 1214 Blocpdb> 12 atoms in block 83 Block first atom: 1223 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 1235 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1251 Blocpdb> 16 atoms in block 86 Block first atom: 1267 Blocpdb> 13 atoms in block 87 Block first atom: 1283 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1296 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 1311 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1329 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1344 Blocpdb> 6 atoms in block 92 Block first atom: 1362 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1368 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 1385 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1407 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 1423 Blocpdb> 14 atoms in block 97 Block first atom: 1442 Blocpdb> 13 atoms in block 98 Block first atom: 1456 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 1469 Blocpdb> 15 atoms in block 100 Block first atom: 1484 Blocpdb> 13 atoms in block 101 Block first atom: 1499 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1512 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1527 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1541 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1557 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 1573 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1593 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 1607 Blocpdb> 18 atoms in block 109 Block first atom: 1626 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1644 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 1660 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1680 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1693 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1710 Blocpdb> 13 atoms in block 115 Block first atom: 1724 Blocpdb> 15 atoms in block 116 Block first atom: 1737 Blocpdb> 8 atoms in block 117 Block first atom: 1752 Blocpdb> 12 atoms in block 118 Block first atom: 1760 Blocpdb> 15 atoms in block 119 Block first atom: 1772 Blocpdb> 13 atoms in block 120 Block first atom: 1787 Blocpdb> 20 atoms in block 121 Block first atom: 1800 Blocpdb> 20 atoms in block 122 Block first atom: 1820 Blocpdb> 22 atoms in block 123 Block first atom: 1840 Blocpdb> 17 atoms in block 124 Block first atom: 1862 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 1879 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 1898 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 1919 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 1936 Blocpdb> 18 atoms in block 129 Block first atom: 1953 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 1971 Blocpdb> 20 atoms in block 131 Block first atom: 1984 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2004 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 2020 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2038 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2053 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2068 Blocpdb> 15 atoms in block 137 Block first atom: 2083 Blocpdb> 13 atoms in block 138 Block first atom: 2098 Blocpdb> 12 atoms in block 139 Block first atom: 2111 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 2123 Blocpdb> 15 atoms in block 141 Block first atom: 2149 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 2164 Blocpdb> 14 atoms in block 143 Block first atom: 2179 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 2193 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 2211 Blocpdb> 12 atoms in block 146 Block first atom: 2229 Blocpdb> 19 atoms in block 147 Block first atom: 2241 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 2260 Blocpdb> 18 atoms in block 149 Block first atom: 2276 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2294 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2307 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 2322 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2345 Blocpdb> 13 atoms in block 154 Block first atom: 2359 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 2372 Blocpdb> 20 atoms in block 156 Block first atom: 2384 Blocpdb> 15 atoms in block 157 Block first atom: 2404 Blocpdb> 9 atoms in block 158 Block first atom: 2419 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2428 Blocpdb> 14 atoms in block 160 Block first atom: 2440 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2454 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2472 Blocpdb> 12 atoms in block 163 Block first atom: 2485 Blocpdb> 19 atoms in block 164 Block first atom: 2497 Blocpdb> 12 atoms in block 165 Block first atom: 2516 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2528 Blocpdb> 13 atoms in block 167 Block first atom: 2543 Blocpdb> 9 atoms in block 168 Block first atom: 2556 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 2565 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2584 Blocpdb> 18 atoms in block 171 Block first atom: 2599 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 2617 Blocpdb> 15 atoms in block 173 Block first atom: 2631 Blocpdb> 20 atoms in block 174 Block first atom: 2646 Blocpdb> 13 atoms in block 175 Block first atom: 2666 Blocpdb> 11 atoms in block 176 Block first atom: 2679 Blocpdb> 14 atoms in block 177 Block first atom: 2690 Blocpdb> 9 atoms in block 178 Block first atom: 2704 Blocpdb> 14 atoms in block 179 Block first atom: 2713 Blocpdb> 15 atoms in block 180 Block first atom: 2727 Blocpdb> 16 atoms in block 181 Block first atom: 2742 Blocpdb> 18 atoms in block 182 Block first atom: 2758 Blocpdb> 19 atoms in block 183 Block first atom: 2776 Blocpdb> 16 atoms in block 184 Block first atom: 2795 Blocpdb> 17 atoms in block 185 Block first atom: 2810 Blocpdb> 185 blocks. Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1041018 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8481 Prepmat> Matrix trace = 2275580.0000 Prepmat> Last element read: 8481 8481 164.1355 Prepmat> 17206 lines saved. Prepmat> 15178 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2827 RTB> Total mass = 2827.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2827 RTB> Number of blocks = 185 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 254101.9190 RTB> 70197 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1110 Diagstd> Nb of non-zero elements: 70197 Diagstd> Projected matrix trace = 254101.9190 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1110 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 254101.9190 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.1602594 1.2837712 3.3690124 3.7013650 4.2274272 5.8306065 6.1708666 6.5529248 8.2964623 8.9857763 9.2708225 10.4998417 10.7024665 11.1185150 12.1478333 12.6387953 12.9840793 13.3639371 13.9572111 14.2469083 14.8490700 15.6023033 16.0275702 16.9738034 17.6919903 18.0190937 18.7976064 19.1138339 19.9780707 20.7108018 21.4253710 22.1629043 22.5808044 24.3071435 25.3392584 25.9219058 25.9570045 26.9477475 27.8035510 27.8877433 28.4855055 28.8744617 29.3800012 30.4164055 30.8829548 31.4324873 32.4118687 32.9961299 33.1236156 34.0549469 34.7696206 35.3124605 35.6714296 36.4816010 36.6733534 37.2520295 38.5714014 39.1435321 39.3994215 40.7958725 41.0351468 41.6256333 42.1509425 42.9555865 43.7873654 44.0469154 44.7082035 45.5932720 45.9973913 46.5601457 47.2597020 48.2252972 48.3974943 48.8611190 49.3774706 50.0033090 50.1506829 51.1409048 51.4956015 51.8613966 52.1057594 52.9828892 53.0298092 53.8012639 54.6358590 54.8663415 55.4222776 56.1560784 56.2469288 57.0309005 57.0835178 57.5626508 58.0474964 58.7396166 58.9782497 59.9460580 60.7146675 61.0819126 62.2086582 62.5482299 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034316 0.0034333 0.0034335 0.0034340 0.0034345 116.9695520 123.0379530 199.3180286 208.9181814 223.2715290 262.2117479 269.7542890 277.9795656 312.7820007 325.5165562 330.6392550 351.8735779 355.2525614 362.0917861 378.4815310 386.0540559 391.2919015 396.9743912 405.6902817 409.8789304 418.4512873 428.9331761 434.7395230 447.3885494 456.7553326 460.9584199 470.8109506 474.7546026 485.3690200 494.1897533 502.6427880 511.2209184 516.0181587 535.3801223 546.6284491 552.8772815 553.2514571 563.7110071 572.5921816 573.4584628 579.5717999 583.5152740 588.6012567 598.8929839 603.4686359 608.8140340 618.2260708 623.7733016 624.9771627 633.7024470 640.3173298 645.2964410 648.5680310 655.8918355 657.6133058 662.7813042 674.4161930 679.3995988 681.6166698 693.5909108 695.6219475 700.6089923 705.0159217 711.7133408 718.5710035 720.6975246 726.0873825 733.2391758 736.4815666 740.9731062 746.5188352 754.1065909 755.4517283 759.0615355 763.0617777 767.8822923 769.0130427 776.5679880 779.2563461 782.0191429 783.8593536 790.4294243 790.7793367 796.5105260 802.6647079 804.3559547 808.4207734 813.7549924 814.4129811 820.0689990 820.4472145 823.8832490 827.3457243 832.2634725 833.9523177 840.7668796 846.1397364 848.6949027 856.4868456 858.8212705 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2827 Rtb_to_modes> Number of blocs = 185 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9827E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9860E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.160 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.701 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.227 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.831 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.171 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.553 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.296 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.986 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.55 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 1.00004 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 50886 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 1.00004 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603140609202729785.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603140609202729785.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603140609202729785.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603140609202729785.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 369 First residue number = 1 Last residue number = 383 Number of atoms found = 2827 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9827E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9860E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.160 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.701 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.227 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.831 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.171 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.553 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.296 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.986 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.55 Bfactors> 106 vectors, 8481 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.160000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.225 for 369 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.030 +/- 0.03 Bfactors> = 109.406 +/- 25.66 Bfactors> Shiftng-fct= 109.376 Bfactors> Scaling-fct= 801.172 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603140609202729785.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603140609202729785.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4308E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.8 Chkmod> 106 vectors, 8481 coordinates in file. Chkmod> That is: 2827 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 101 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7747 0.0034 0.8086 0.0034 0.8547 0.0034 0.7384 0.0034 0.7958 0.0034 0.9563 116.9515 0.5177 123.0436 0.4364 199.3091 0.4599 208.8989 0.2134 223.2507 0.4163 262.2093 0.3695 269.7456 0.1017 277.9692 0.4789 312.7599 0.5148 325.5066 0.1657 330.6282 0.3185 351.8611 0.4988 355.1964 0.1647 362.1004 0.4443 378.4990 0.2251 386.0559 0.5338 391.2136 0.3720 396.8989 0.4274 405.7134 0.3920 409.9058 0.2284 418.4464 0.3302 428.8831 0.5554 434.7538 0.2690 447.3192 0.0629 456.7100 0.2855 460.9502 0.1303 470.8207 0.3278 474.6866 0.2874 485.3716 0.4414 494.1590 0.3648 502.6755 0.3454 511.1655 0.3926 515.9868 0.2410 535.3886 0.3885 546.6130 0.3771 552.8332 0.3840 553.2596 0.4827 563.7104 0.3603 572.5310 0.4752 573.4570 0.4186 579.5926 0.4453 583.4451 0.4206 588.5760 0.4143 598.9027 0.4207 603.4139 0.4455 608.7638 0.5421 618.1817 0.5368 623.7831 0.5284 624.9162 0.4292 633.6292 0.3610 640.2933 0.4285 645.2463 0.4651 648.5272 0.3813 655.8493 0.3015 657.5550 0.4884 662.7348 0.3097 674.3750 0.4417 679.3398 0.4052 681.5924 0.5137 693.5962 0.4696 695.6332 0.4955 700.6157 0.4513 704.9778 0.3400 711.7193 0.4952 718.5618 0.4327 720.6918 0.4717 726.0708 0.5283 733.1814 0.5494 736.4708 0.4812 740.9401 0.3672 746.4891 0.3768 754.1110 0.3203 755.4389 0.4763 759.0203 0.4191 763.0486 0.4484 767.8239 0.4535 768.9748 0.5074 776.5278 0.4815 779.2562 0.4147 781.9750 0.3945 783.8576 0.3650 790.3739 0.3772 790.7468 0.2107 796.4670 0.4302 802.6607 0.3274 804.3482 0.4850 808.3695 0.3708 813.7485 0.3876 814.4003 0.3912 820.0273 0.4266 820.3867 0.3721 823.8289 0.3732 827.3280 0.4330 832.2305 0.4837 833.9289 0.1569 840.7584 0.3814 846.0709 0.4160 848.6452 0.5087 856.4593 0.4889 858.7966 0.5318 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140609202729785 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom making animated gifs 11 models are in 2603140609202729785.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140609202729785 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom making animated gifs 11 models are in 2603140609202729785.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140609202729785 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom making animated gifs 11 models are in 2603140609202729785.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140609202729785 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom making animated gifs 11 models are in 2603140609202729785.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140609202729785 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603140609202729785.eigenfacs 2603140609202729785.atom making animated gifs 11 models are in 2603140609202729785.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140609202729785.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603140609202729785.10.pdb 2603140609202729785.11.pdb 2603140609202729785.7.pdb 2603140609202729785.8.pdb 2603140609202729785.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m23.333s user 0m23.221s sys 0m0.102s rm: cannot remove '2603140609202729785.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.