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***  7LO8 A3 single  ***

LOGs for ID: 2603140610172731181

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603140610172731181.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603140610172731181.atom to be opened. Openam> File opened: 2603140610172731181.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 369 First residue number = 1 Last residue number = 383 Number of atoms found = 2824 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 138.085506 +/- 9.805199 From: 115.456000 To: 164.502000 = 136.371673 +/- 13.142796 From: 109.283000 To: 164.207000 = 156.768985 +/- 12.681671 From: 125.302000 To: 183.590000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8933 % Filled. Pdbmat> 1038440 non-zero elements. Pdbmat> 113514 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.39 +/- 21.35 Maximum number = 123 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.270280E+06 Pdbmat> Larger element = 530.241 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 369 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603140610172731181.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603140610172731181.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603140610172731181.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2824 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 369 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 35 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 51 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 89 Blocpdb> 19 atoms in block 7 Block first atom: 105 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 124 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 143 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 155 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 167 Blocpdb> 15 atoms in block 12 Block first atom: 182 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 197 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 212 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 226 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 246 Blocpdb> 12 atoms in block 17 Block first atom: 263 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 275 Blocpdb> 10 atoms in block 19 Block first atom: 290 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 300 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 316 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 328 Blocpdb> 10 atoms in block 23 Block first atom: 343 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 353 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 26 Block first atom: 383 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 400 Blocpdb> 13 atoms in block 28 Block first atom: 416 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 429 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 444 Blocpdb> 13 atoms in block 31 Block first atom: 455 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 468 Blocpdb> 12 atoms in block 33 Block first atom: 485 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 497 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 515 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 531 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 545 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 557 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 573 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 592 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 605 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 620 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 639 Blocpdb> 11 atoms in block 44 Block first atom: 655 Blocpdb> 18 atoms in block 45 Block first atom: 666 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 684 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 701 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 716 Blocpdb> 17 atoms in block 49 Block first atom: 732 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 749 Blocpdb> 8 atoms in block 51 Block first atom: 764 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 772 Blocpdb> 9 atoms in block 53 Block first atom: 786 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 795 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 810 Blocpdb> 11 atoms in block 56 Block first atom: 825 Blocpdb> 11 atoms in block 57 Block first atom: 836 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 847 Blocpdb> 13 atoms in block 59 Block first atom: 863 Blocpdb> 13 atoms in block 60 Block first atom: 876 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 889 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 902 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 921 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 935 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 952 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 967 Blocpdb> 11 atoms in block 67 Block first atom: 987 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 998 Blocpdb> 14 atoms in block 69 Block first atom: 1014 Blocpdb> 15 atoms in block 70 Block first atom: 1028 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1043 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1059 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1070 Blocpdb> 8 atoms in block 74 Block first atom: 1082 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1090 Blocpdb> 14 atoms in block 76 Block first atom: 1109 Blocpdb> 13 atoms in block 77 Block first atom: 1123 Blocpdb> 21 atoms in block 78 Block first atom: 1136 Blocpdb> 15 atoms in block 79 Block first atom: 1157 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1172 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1195 Blocpdb> 9 atoms in block 82 Block first atom: 1211 Blocpdb> 12 atoms in block 83 Block first atom: 1220 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1232 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1247 Blocpdb> 16 atoms in block 86 Block first atom: 1263 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1279 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1293 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 1308 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1326 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1341 Blocpdb> 7 atoms in block 92 Block first atom: 1359 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1366 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 1383 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1405 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 1421 Blocpdb> 14 atoms in block 97 Block first atom: 1440 Blocpdb> 13 atoms in block 98 Block first atom: 1454 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 1467 Blocpdb> 15 atoms in block 100 Block first atom: 1482 Blocpdb> 13 atoms in block 101 Block first atom: 1497 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1510 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1525 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1539 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1555 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 1571 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1591 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 1605 Blocpdb> 13 atoms in block 109 Block first atom: 1624 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1637 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 1653 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1673 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1686 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1703 Blocpdb> 13 atoms in block 115 Block first atom: 1717 Blocpdb> 15 atoms in block 116 Block first atom: 1730 Blocpdb> 8 atoms in block 117 Block first atom: 1745 Blocpdb> 12 atoms in block 118 Block first atom: 1753 Blocpdb> 15 atoms in block 119 Block first atom: 1765 Blocpdb> 13 atoms in block 120 Block first atom: 1780 Blocpdb> 20 atoms in block 121 Block first atom: 1793 Blocpdb> 20 atoms in block 122 Block first atom: 1813 Blocpdb> 22 atoms in block 123 Block first atom: 1833 Blocpdb> 17 atoms in block 124 Block first atom: 1855 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 1872 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 1891 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 1912 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 1929 Blocpdb> 18 atoms in block 129 Block first atom: 1946 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 1964 Blocpdb> 20 atoms in block 131 Block first atom: 1977 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 1997 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 2013 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 2031 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2045 Blocpdb> 16 atoms in block 136 Block first atom: 2060 Blocpdb> 15 atoms in block 137 Block first atom: 2076 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 2091 Blocpdb> 12 atoms in block 139 Block first atom: 2107 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 2119 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2145 Blocpdb> 16 atoms in block 142 Block first atom: 2159 Blocpdb> 14 atoms in block 143 Block first atom: 2175 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 2189 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 2207 Blocpdb> 12 atoms in block 146 Block first atom: 2225 Blocpdb> 19 atoms in block 147 Block first atom: 2237 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 2256 Blocpdb> 18 atoms in block 149 Block first atom: 2272 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2290 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2303 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 2318 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2341 Blocpdb> 13 atoms in block 154 Block first atom: 2355 Blocpdb> 13 atoms in block 155 Block first atom: 2368 Blocpdb> 20 atoms in block 156 Block first atom: 2381 Blocpdb> 15 atoms in block 157 Block first atom: 2401 Blocpdb> 9 atoms in block 158 Block first atom: 2416 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2425 Blocpdb> 14 atoms in block 160 Block first atom: 2437 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2451 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2469 Blocpdb> 12 atoms in block 163 Block first atom: 2482 Blocpdb> 19 atoms in block 164 Block first atom: 2494 Blocpdb> 12 atoms in block 165 Block first atom: 2513 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2525 Blocpdb> 13 atoms in block 167 Block first atom: 2540 Blocpdb> 9 atoms in block 168 Block first atom: 2553 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 2562 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2581 Blocpdb> 18 atoms in block 171 Block first atom: 2596 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 2614 Blocpdb> 15 atoms in block 173 Block first atom: 2628 Blocpdb> 20 atoms in block 174 Block first atom: 2643 Blocpdb> 13 atoms in block 175 Block first atom: 2663 Blocpdb> 11 atoms in block 176 Block first atom: 2676 Blocpdb> 14 atoms in block 177 Block first atom: 2687 Blocpdb> 9 atoms in block 178 Block first atom: 2701 Blocpdb> 14 atoms in block 179 Block first atom: 2710 Blocpdb> 15 atoms in block 180 Block first atom: 2724 Blocpdb> 16 atoms in block 181 Block first atom: 2739 Blocpdb> 18 atoms in block 182 Block first atom: 2755 Blocpdb> 19 atoms in block 183 Block first atom: 2773 Blocpdb> 16 atoms in block 184 Block first atom: 2792 Blocpdb> 17 atoms in block 185 Block first atom: 2807 Blocpdb> 185 blocks. Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1038625 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8472 Prepmat> Matrix trace = 2270280.0000 Prepmat> Last element read: 8472 8472 164.1355 Prepmat> 17206 lines saved. Prepmat> 15178 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2824 RTB> Total mass = 2824.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2824 RTB> Number of blocks = 185 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 253819.7062 RTB> 70197 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1110 Diagstd> Nb of non-zero elements: 70197 Diagstd> Projected matrix trace = 253819.7062 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1110 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 253819.7062 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.1693161 1.2917956 3.3607129 3.7014547 4.2492914 5.8410166 6.1738053 6.5707534 8.1940308 9.0844233 9.3084773 10.5027237 10.7362552 11.1281555 12.2532213 12.6336140 13.0143437 13.3761165 13.9781725 14.1363369 14.6178010 15.5416610 16.0647115 17.1462681 17.9372875 18.4417356 18.5657155 19.7801286 19.8455128 20.4826397 21.0951476 21.9354818 22.6236204 24.0617181 24.7341717 25.1020182 25.8238535 26.5183174 27.3018810 27.8202278 28.1660099 28.9246154 29.0730124 30.3399245 30.8774245 31.4913168 32.4162303 32.9551816 33.0307187 33.9509199 34.6871676 35.1666873 35.7968409 36.4321059 36.5939490 37.0402470 38.3915227 38.8356689 39.2709293 39.6053142 40.7952337 41.4512710 41.9258480 42.2950883 43.2016437 43.9008143 44.5499659 45.3322133 45.8238399 45.9322191 46.5505130 47.4999198 47.6541617 48.4891288 48.9203600 49.2808548 49.5909067 50.2824322 50.9434696 51.2641811 51.9190837 52.4980870 53.0061214 53.3436091 54.3211282 54.9380771 55.4324749 55.8959769 56.1062316 56.8885832 57.4533006 57.6056328 58.0896455 58.4042008 58.7948274 59.7375202 60.5203049 60.5460815 62.4846210 62.7300349 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034322 0.0034328 0.0034333 0.0034344 0.0034346 117.4251823 123.4218878 199.0723699 208.9207122 223.8481637 262.4457238 269.8185131 278.3574595 310.8451355 327.2984600 331.3100434 351.9218651 355.8129026 362.2487317 380.1197358 385.9749168 391.7476644 397.1552440 405.9948059 408.2852814 415.1798830 428.0987856 435.2429501 449.6556820 459.9108596 466.3330284 467.8979319 482.9585236 483.7560877 491.4600757 498.7541983 508.5912328 516.5071443 532.6704409 540.0624295 544.0635115 551.8306321 559.2014156 567.4029184 572.7638787 576.3123739 584.0218241 585.5180629 598.1395614 603.4146003 609.3835003 618.2676668 623.3861291 624.1001568 632.7338274 639.5576523 643.9631416 649.7071269 655.4467560 656.9009946 660.8946215 672.8417769 676.7225920 680.5042935 683.3953383 693.5854806 699.1400901 703.1309385 706.2203831 713.7488407 719.5012758 724.8013078 731.1369658 735.0908547 735.9596326 740.8964535 748.4136822 749.6278232 756.1665658 759.5215528 762.3148785 764.7091819 770.0225055 775.0675246 777.5033922 782.4539543 786.8048340 790.6027009 793.1155745 800.3494871 804.8816152 808.4951421 811.8682461 813.3937484 819.0451430 823.1003228 824.1907881 827.6460433 829.8838687 832.6545126 839.3031934 844.7842998 844.9641846 858.3844673 860.0685059 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2824 Rtb_to_modes> Number of blocs = 185 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9866E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9897E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.361 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.701 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.841 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.194 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.308 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.73 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 0.99997 0.99998 1.00001 1.00005 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 50832 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 0.99997 0.99998 1.00001 1.00005 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603140610172731181.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603140610172731181.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603140610172731181.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603140610172731181.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 369 First residue number = 1 Last residue number = 383 Number of atoms found = 2824 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9866E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9897E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.361 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.701 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.841 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.194 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.084 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.308 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.73 Bfactors> 106 vectors, 8472 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.169000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.222 for 369 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.030 +/- 0.03 Bfactors> = 111.489 +/- 20.43 Bfactors> Shiftng-fct= 111.458 Bfactors> Scaling-fct= 647.037 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603140610172731181.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603140610172731181.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.1 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vecteur en lecture: 748.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.0 Chkmod> 106 vectors, 8472 coordinates in file. Chkmod> That is: 2824 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 39 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8914 0.0034 0.8968 0.0034 0.7163 0.0034 0.8569 0.0034 0.7978 0.0034 0.8017 117.4043 0.5182 123.4264 0.4368 199.0723 0.4605 208.8989 0.2120 223.8309 0.4151 262.4341 0.3789 269.8112 0.1012 278.3507 0.4939 310.8312 0.5027 327.2768 0.2512 331.2873 0.2467 351.8611 0.5017 355.8597 0.1815 362.2632 0.4672 380.0535 0.2469 385.9031 0.5062 391.6655 0.4492 397.1958 0.3895 406.0039 0.2354 408.3206 0.3985 415.1933 0.2781 428.0575 0.5761 435.1604 0.2298 449.6853 0.3449 459.9259 0.2697 466.2911 0.0789 467.9318 0.2687 482.9362 0.1685 483.7900 0.4051 491.4073 0.3391 498.7901 0.3647 508.6218 0.3799 516.4436 0.2275 532.6286 0.3610 539.9937 0.3464 544.0183 0.4527 551.7658 0.4363 559.1952 0.3653 567.3590 0.4803 572.7369 0.4725 576.3285 0.4342 583.9502 0.3744 585.4626 0.4605 598.1146 0.4728 603.4139 0.4609 609.3446 0.5327 618.2771 0.5422 623.4049 0.5491 624.0666 0.3923 632.6981 0.3737 639.5563 0.4396 643.9658 0.4652 649.7079 0.3996 655.3997 0.5125 656.8374 0.3725 660.8640 0.2716 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DQ=-80 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom making animated gifs 11 models are in 2603140610172731181.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140610172731181.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140610172731181.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140610172731181 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603140610172731181.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140610172731181 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom making animated gifs 11 models are in 2603140610172731181.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140610172731181.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140610172731181.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140610172731181 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140610172731181.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603140610172731181 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603140610172731181.eigenfacs 2603140610172731181.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603140610172731181.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603140610172731181.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603140610172731181.10.pdb 2603140610172731181.11.pdb 2603140610172731181.7.pdb 2603140610172731181.8.pdb 2603140610172731181.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.073s user 0m20.971s sys 0m0.090s rm: cannot remove '2603140610172731181.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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