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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
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* Ahmad Khan *

LOGs for ID: 2603140834172769745

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603140834172769745.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603140834172769745.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603140834172769745.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    159
            First residue number     =      6
            Last  residue number     =    168
            Number of atoms found    =   1533
            Mean number per residue  =      9.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    24.771010 +/-     7.000698 From:     7.643000 To:    41.011000
 =    11.632895 +/-     8.829579 From:    -7.645000 To:    31.578000
 =    77.709633 +/-    10.441236 From:    52.587000 To:   102.166000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   6.0201 % Filled.
 Pdbmat>       636783  non-zero elements.
 Pdbmat>        69740 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     90.98 +/-     26.08
         Maximum number =    144
         Minimum number =     17

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.394800E+06
 Pdbmat> Larger element =  582.194    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
159 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603140834172769745.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603140834172769745.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603140834172769745.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1533 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   159 residues.
 Blocpdb>     7 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    12 atoms in block      2
 Block first atom:      8
 Blocpdb>     9 atoms in block      3
 Block first atom:     20
 Blocpdb>    10 atoms in block      4
 Block first atom:     29
 Blocpdb>     9 atoms in block      5
 Block first atom:     39
 Blocpdb>    10 atoms in block      6
 Block first atom:     48
 Blocpdb>    17 atoms in block      7
 Block first atom:     58
 Blocpdb>     8 atoms in block      8
 Block first atom:     75
 Blocpdb>     8 atoms in block      9
 Block first atom:     83
 Blocpdb>     5 atoms in block     10
 Block first atom:     91
 Blocpdb>    13 atoms in block     11
 Block first atom:     96
 Blocpdb>     9 atoms in block     12
 Block first atom:    109
 Blocpdb>    10 atoms in block     13
 Block first atom:    118
 Blocpdb>    16 atoms in block     14
 Block first atom:    128
 Blocpdb>     8 atoms in block     15
 Block first atom:    144
 Blocpdb>     6 atoms in block     16
 Block first atom:    152
 Blocpdb>     9 atoms in block     17
 Block first atom:    158
 Blocpdb>     9 atoms in block     18
 Block first atom:    167
 Blocpdb>    12 atoms in block     19
 Block first atom:    176
 Blocpdb>    13 atoms in block     20
 Block first atom:    188
 Blocpdb>     8 atoms in block     21
 Block first atom:    201
 Blocpdb>     8 atoms in block     22
 Block first atom:    209
 Blocpdb>     9 atoms in block     23
 Block first atom:    217
 Blocpdb>     9 atoms in block     24
 Block first atom:    226
 Blocpdb>     5 atoms in block     25
 Block first atom:    235
 Blocpdb>    12 atoms in block     26
 Block first atom:    240
 Blocpdb>     8 atoms in block     27
 Block first atom:    252
 Blocpdb>    13 atoms in block     28
 Block first atom:    260
 Blocpdb>     9 atoms in block     29
 Block first atom:    273
 Blocpdb>     9 atoms in block     30
 Block first atom:    282
 Blocpdb>    12 atoms in block     31
 Block first atom:    291
 Blocpdb>     5 atoms in block     32
 Block first atom:    303
 Blocpdb>     9 atoms in block     33
 Block first atom:    308
 Blocpdb>     9 atoms in block     34
 Block first atom:    317
 Blocpdb>     7 atoms in block     35
 Block first atom:    326
 Blocpdb>    13 atoms in block     36
 Block first atom:    333
 Blocpdb>     9 atoms in block     37
 Block first atom:    346
 Blocpdb>     8 atoms in block     38
 Block first atom:    355
 Blocpdb>    12 atoms in block     39
 Block first atom:    363
 Blocpdb>     9 atoms in block     40
 Block first atom:    375
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    384
 Blocpdb>    10 atoms in block     42
 Block first atom:    398
 Blocpdb>    11 atoms in block     43
 Block first atom:    408
 Blocpdb>     6 atoms in block     44
 Block first atom:    419
 Blocpdb>    12 atoms in block     45
 Block first atom:    425
 Blocpdb>     9 atoms in block     46
 Block first atom:    437
 Blocpdb>     8 atoms in block     47
 Block first atom:    446
 Blocpdb>     5 atoms in block     48
 Block first atom:    454
 Blocpdb>    11 atoms in block     49
 Block first atom:    459
 Blocpdb>    14 atoms in block     50
 Block first atom:    470
 Blocpdb>     7 atoms in block     51
 Block first atom:    484
 Blocpdb>     6 atoms in block     52
 Block first atom:    491
 Blocpdb>     6 atoms in block     53
 Block first atom:    497
 Blocpdb>    16 atoms in block     54
 Block first atom:    503
 Blocpdb>    17 atoms in block     55
 Block first atom:    519
 Blocpdb>    10 atoms in block     56
 Block first atom:    536
 Blocpdb>    13 atoms in block     57
 Block first atom:    546
 Blocpdb>    14 atoms in block     58
 Block first atom:    559
 Blocpdb>     9 atoms in block     59
 Block first atom:    573
 Blocpdb>    17 atoms in block     60
 Block first atom:    582
 Blocpdb>     6 atoms in block     61
 Block first atom:    599
 Blocpdb>     5 atoms in block     62
 Block first atom:    605
 Blocpdb>    14 atoms in block     63
 Block first atom:    610
 Blocpdb>     6 atoms in block     64
 Block first atom:    624
 Blocpdb>    17 atoms in block     65
 Block first atom:    630
 Blocpdb>     8 atoms in block     66
 Block first atom:    647
 Blocpdb>     9 atoms in block     67
 Block first atom:    655
 Blocpdb>     7 atoms in block     68
 Block first atom:    664
 Blocpdb>     9 atoms in block     69
 Block first atom:    671
 Blocpdb>     8 atoms in block     70
 Block first atom:    680
 Blocpdb>     8 atoms in block     71
 Block first atom:    688
 Blocpdb>    13 atoms in block     72
 Block first atom:    696
 Blocpdb>     7 atoms in block     73
 Block first atom:    709
 Blocpdb>     9 atoms in block     74
 Block first atom:    716
 Blocpdb>    12 atoms in block     75
 Block first atom:    725
 Blocpdb>     8 atoms in block     76
 Block first atom:    737
 Blocpdb>     8 atoms in block     77
 Block first atom:    745
 Blocpdb>     9 atoms in block     78
 Block first atom:    753
 Blocpdb>     7 atoms in block     79
 Block first atom:    762
 Blocpdb>     9 atoms in block     80
 Block first atom:    769
 Blocpdb>    12 atoms in block     81
 Block first atom:    778
 Blocpdb>    16 atoms in block     82
 Block first atom:    790
 Blocpdb>    10 atoms in block     83
 Block first atom:    806
 Blocpdb>     7 atoms in block     84
 Block first atom:    816
 Blocpdb>     8 atoms in block     85
 Block first atom:    823
 Blocpdb>     9 atoms in block     86
 Block first atom:    831
 Blocpdb>    14 atoms in block     87
 Block first atom:    840
 Blocpdb>    12 atoms in block     88
 Block first atom:    854
 Blocpdb>     9 atoms in block     89
 Block first atom:    866
 Blocpdb>    17 atoms in block     90
 Block first atom:    875
 Blocpdb>    13 atoms in block     91
 Block first atom:    892
 Blocpdb>    12 atoms in block     92
 Block first atom:    905
 Blocpdb>    13 atoms in block     93
 Block first atom:    917
 Blocpdb>    10 atoms in block     94
 Block first atom:    930
 Blocpdb>    12 atoms in block     95
 Block first atom:    940
 Blocpdb>    12 atoms in block     96
 Block first atom:    952
 Blocpdb>    10 atoms in block     97
 Block first atom:    964
 Blocpdb>    10 atoms in block     98
 Block first atom:    974
 Blocpdb>     6 atoms in block     99
 Block first atom:    984
 Blocpdb>     8 atoms in block    100
 Block first atom:    990
 Blocpdb>     6 atoms in block    101
 Block first atom:    998
 Blocpdb>     6 atoms in block    102
 Block first atom:   1004
 Blocpdb>     5 atoms in block    103
 Block first atom:   1010
 Blocpdb>     9 atoms in block    104
 Block first atom:   1015
 Blocpdb>     8 atoms in block    105
 Block first atom:   1024
 Blocpdb>    14 atoms in block    106
 Block first atom:   1032
 Blocpdb>     5 atoms in block    107
 Block first atom:   1046
 Blocpdb>     9 atoms in block    108
 Block first atom:   1051
 Blocpdb>     9 atoms in block    109
 Block first atom:   1060
 Blocpdb>     9 atoms in block    110
 Block first atom:   1069
 Blocpdb>     9 atoms in block    111
 Block first atom:   1078
 Blocpdb>    13 atoms in block    112
 Block first atom:   1087
 Blocpdb>     5 atoms in block    113
 Block first atom:   1100
 Blocpdb>     6 atoms in block    114
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    17 atoms in block    115
 Block first atom:   1111
 Blocpdb>     5 atoms in block    116
 Block first atom:   1128
 Blocpdb>    10 atoms in block    117
 Block first atom:   1133
 Blocpdb>     9 atoms in block    118
 Block first atom:   1143
 Blocpdb>     5 atoms in block    119
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>     6 atoms in block    120
 Block first atom:   1157
 Blocpdb>     9 atoms in block    121
 Block first atom:   1163
 Blocpdb>     8 atoms in block    122
 Block first atom:   1172
 Blocpdb>     9 atoms in block    123
 Block first atom:   1180
 Blocpdb>     8 atoms in block    124
 Block first atom:   1189
 Blocpdb>     8 atoms in block    125
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    10 atoms in block    126
 Block first atom:   1205
 Blocpdb>     6 atoms in block    127
 Block first atom:   1215
 Blocpdb>    10 atoms in block    128
 Block first atom:   1221
 Blocpdb>    11 atoms in block    129
 Block first atom:   1231
 Blocpdb>    17 atoms in block    130
 Block first atom:   1242
 Blocpdb>     6 atoms in block    131
 Block first atom:   1259
 Blocpdb>    10 atoms in block    132
 Block first atom:   1265
 Blocpdb>     6 atoms in block    133
 Block first atom:   1275
 Blocpdb>    11 atoms in block    134
 Block first atom:   1281
 Blocpdb>    17 atoms in block    135
 Block first atom:   1292
 Blocpdb>    12 atoms in block    136
 Block first atom:   1309
 Blocpdb>    12 atoms in block    137
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>     8 atoms in block    138
 Block first atom:   1333
 Blocpdb>     8 atoms in block    139
 Block first atom:   1341
 Blocpdb>     9 atoms in block    140
 Block first atom:   1349
 Blocpdb>     7 atoms in block    141
 Block first atom:   1358
 Blocpdb>     9 atoms in block    142
 Block first atom:   1365
 Blocpdb>     9 atoms in block    143
 Block first atom:   1374
 Blocpdb>    16 atoms in block    144
 Block first atom:   1383
 Blocpdb>    11 atoms in block    145
 Block first atom:   1399
 Blocpdb>    13 atoms in block    146
 Block first atom:   1410
 Blocpdb>     9 atoms in block    147
 Block first atom:   1423
 Blocpdb>    14 atoms in block    148
 Block first atom:   1432
 Blocpdb>     6 atoms in block    149
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>     9 atoms in block    150
 Block first atom:   1452
 Blocpdb>    12 atoms in block    151
 Block first atom:   1461
 Blocpdb>     8 atoms in block    152
 Block first atom:   1473
 Blocpdb>     5 atoms in block    153
 Block first atom:   1481
 Blocpdb>     6 atoms in block    154
 Block first atom:   1486
 Blocpdb>     5 atoms in block    155
 Block first atom:   1492
 Blocpdb>     9 atoms in block    156
 Block first atom:   1497
 Blocpdb>     6 atoms in block    157
 Block first atom:   1506
 Blocpdb>    12 atoms in block    158
 Block first atom:   1512
 Blocpdb>    10 atoms in block    159
 Block first atom:   1523

 Blocpdb>   159 blocks.

 Blocpdb> At most,     17 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     5 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       636942 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       4599

 Prepmat> Matrix trace    =    1394800.0000
 Prepmat> Last element read:    4599   4599       227.8676
 Prepmat>        12721 lines saved.
 Prepmat>        10696 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1533
 RTB> Total mass =        1533.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1533
 RTB> Number of blocks =   159
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  262139.7600
 RTB>     70479 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      954
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    70479
 Diagstd> Projected matrix trace =  262139.7600

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    954 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 262139.7600
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      5.7984982      6.9319137      7.8205523      9.0599917
     11.5764153     11.7670068     12.5322659     14.7645099     15.5343113
     16.8099266     17.4346792     19.2872162     21.1275953     21.2789595
     21.9349990     22.7777754     23.3230467     24.3712934     25.8629797
     27.4945096     28.9794014     29.6502952     30.1769836     30.6135323
     30.6725384     32.6058817     32.8009317     35.3787598     36.1127334
     37.6063522     38.7231724     39.8386710     41.1358302     41.8822774
     42.5812974     43.5872330     45.1616728     45.8282184     47.1176110
     47.4461206     48.1342978     49.6740741     50.2416310     52.0736262
     52.6192191     53.7436760     54.7579423     55.6749268     55.9844788
     56.7685517     58.2111524     58.3615564     60.1412120     60.9738041
     62.2785924     63.5477488     64.0055115     64.9470309     65.3930938
     66.0690678     66.5913698     67.1864908     67.8942791     69.3337628
     70.0888898     70.9624931     73.2434635     73.6734839     74.4610816
     75.2636999     76.1472357     77.2128093     78.0031920     79.1308962
     81.0125191     81.3359656     81.7412891     82.9789877     83.0175165
     83.8196464     84.5394195     84.7495001     85.2786497     86.3367318
     86.9500491     88.1503967     89.3411007     91.0667374     91.3235117
     92.3540825     93.0993061     94.9252144     95.0022584     97.0528647
     98.3181262     98.7898568     99.5878431    100.0044899    100.5552592
    101.0298948

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034323      0.0034332      0.0034332      0.0034334      0.0034343
      0.0034348    261.4887717    285.9050673    303.6784624    326.8580461
    369.4726796    372.5017194    384.4236350    417.2581215    427.9975498
    445.2236123    453.4216575    476.9030002    499.1376324    500.9224253
    508.5856353    518.2638694    524.4304758    536.0861283    552.2485185
    569.4010570    584.5746601    591.3026028    596.5312422    600.8305433
    601.4092999    620.0736191    621.9255089    645.9019309    652.5675309
    665.9258666    675.7417394    685.4056838    696.4748099    702.7654866
    708.6058364    716.9269895    729.7603958    735.1259735    745.3957484
    747.9897293    753.3947689    765.3501482    769.7100283    783.6176168
    787.7120326    796.0841263    803.5609811    810.2613210    812.5107208
    818.1806183    828.5111906    829.5808401    842.1343230    847.9435207
    856.9681363    865.6560437    868.7683015    875.1347537    878.1348694
    882.6618780    886.1439044    890.0947910    894.7709402    904.2065846
    909.1171921    914.7653647    929.3508849    932.0750522    937.0439272
    942.0806038    947.5941071    954.2011975    959.0725647    965.9804177
    977.3977809    979.3469922    981.7841615    989.1891555    989.4187787
    994.1872575    998.4467578    999.6865589   1002.8025690   1009.0044524
   1012.5819841   1019.5473867   1026.4101304   1036.2753532   1037.7352804
   1043.5741900   1047.7761349   1058.0009892   1058.4302535   1069.7922807
   1076.7430490   1079.3230654   1083.6734754   1085.9379979   1088.9242642
   1091.4911799

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1533
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    159

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9903E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9958E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9965E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.798    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.932    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.821    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.060    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.0    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    954 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002
 0.99998 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999
 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99995 1.00001 0.99998
 0.99996 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004
 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    27594 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002
 0.99998 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999
 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99995 1.00001 0.99998
 0.99996 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004
 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603140834172769745.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603140834172769745.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603140834172769745.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603140834172769745.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    159
            First residue number     =      6
            Last  residue number     =    168
            Number of atoms found    =   1533
            Mean number per residue  =      9.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9903E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9958E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9965E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.798    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.932    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.821    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.060    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.0    

 Bfactors>  106 vectors,   4599 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     5.798000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.460 for    159 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.019 +/-   0.01
 Bfactors> =      3.978 +/-   3.80
 Bfactors> Shiftng-fct=      3.959
 Bfactors> Scaling-fct=    255.752

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603140834172769745.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603140834172769745.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4321E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   878.1    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   890.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   894.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   929.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   932.0    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   942.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   947.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   954.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   959.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   965.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   979.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   989.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   989.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   994.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   998.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1058.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1070.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1077.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1079.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1084.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1086.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1089.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1091.    

 Chkmod>  106 vectors,   4599 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1533 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7870
      0.0034      0.8552
      0.0034      0.9004
      0.0034      0.7674
      0.0034      0.7617
      0.0034      0.7990
    261.4663      0.4588
    285.8946      0.3898
    303.6741      0.1775
    326.8442      0.0955
    369.5140      0.3384
    372.5331      0.3974
    384.3724      0.2126
    417.1765      0.1209
    427.9198      0.3232
    445.2055      0.3648
    453.3413      0.3406
    476.9169      0.4170
    499.1446      0.2946
    500.9132      0.2096
    508.5058      0.2581
    518.2669      0.4717
    524.3737      0.2196
    536.0489      0.3732
    552.1930      0.4027
    569.3299      0.1989
    584.5556      0.4025
    591.2743      0.3904
    596.5354      0.3037
    600.7701      0.4918
    601.3586      0.5311
    620.0862      0.5534
    621.8900      0.3328
    645.8855      0.2417
    652.5148      0.4576
    665.9296      0.2610
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    685.3877      0.3552
    696.4802      0.3751
    702.7162      0.4209
    708.5646      0.2713
    716.9190      0.5000
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    753.3288      0.3603
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    810.1907      0.3761
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    894.7043      0.5027
    904.1432      0.4516
    909.0854      0.4231
    914.7100      0.3475
    929.2890      0.4293
    932.0130      0.4400
    936.9969      0.3404
    942.0170      0.3595
    947.5706      0.2197
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    959.0118      0.1802
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    979.3292      0.3930
    981.7343      0.4215
    989.1527      0.3161
    989.3911      0.3374
    994.1467      0.4010
    998.4073      0.2036
    999.6466      0.3819
   1002.7675      0.3469
   1008.9802      0.3954
   1012.5382      0.4009
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   1036.2494      0.3773
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   1089.1197      0.3683
   1091.2828      0.3543
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603140834172769745 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603140834172769745.eigenfacs
2603140834172769745.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603140834172769745.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m10.508s
user	0m10.445s
sys	0m0.060s
rm: cannot remove '2603140834172769745.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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