*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603141726122850672.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603141726122850672.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603141726122850672.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 285
First residue number = 69
Last residue number = 1
Number of atoms found = 4753
Mean number per residue = 16.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 25.032507 +/- 15.662024 From: -4.874000 To: 59.849000
= 0.672379 +/- 8.351755 From: -19.176000 To: 21.247000
= 61.606317 +/- 10.037687 From: 42.331000 To: 88.351000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.3298 % Filled.
Pdbmat> 3385319 non-zero elements.
Pdbmat> 373034 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 156.97 +/- 46.16
Maximum number = 246
Minimum number = 25
Pdbmat> Matrix trace = 7.460680E+06
Pdbmat> Larger element = 931.708
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
285 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603141726122850672.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603141726122850672.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603141726122850672.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4753 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 285 residues.
Blocpdb> 31 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 36 atoms in block 2
Block first atom: 32
Blocpdb> 37 atoms in block 3
Block first atom: 68
Blocpdb> 38 atoms in block 4
Block first atom: 105
Blocpdb> 21 atoms in block 5
Block first atom: 143
Blocpdb> 38 atoms in block 6
Block first atom: 164
Blocpdb> 24 atoms in block 7
Block first atom: 202
Blocpdb> 32 atoms in block 8
Block first atom: 226
Blocpdb> 38 atoms in block 9
Block first atom: 258
Blocpdb> 33 atoms in block 10
Block first atom: 296
Blocpdb> 29 atoms in block 11
Block first atom: 329
Blocpdb> 21 atoms in block 12
Block first atom: 358
Blocpdb> 38 atoms in block 13
Block first atom: 379
Blocpdb> 35 atoms in block 14
Block first atom: 417
Blocpdb> 27 atoms in block 15
Block first atom: 452
Blocpdb> 27 atoms in block 16
Block first atom: 479
Blocpdb> 34 atoms in block 17
Block first atom: 506
Blocpdb> 44 atoms in block 18
Block first atom: 540
Blocpdb> 36 atoms in block 19
Block first atom: 584
Blocpdb> 24 atoms in block 20
Block first atom: 620
Blocpdb> 28 atoms in block 21
Block first atom: 644
Blocpdb> 41 atoms in block 22
Block first atom: 672
Blocpdb> 36 atoms in block 23
Block first atom: 713
Blocpdb> 30 atoms in block 24
Block first atom: 749
Blocpdb> 29 atoms in block 25
Block first atom: 779
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 808
Blocpdb> 36 atoms in block 27
Block first atom: 830
Blocpdb> 26 atoms in block 28
Block first atom: 866
Blocpdb> 39 atoms in block 29
Block first atom: 892
Blocpdb> 33 atoms in block 30
Block first atom: 931
Blocpdb> 30 atoms in block 31
Block first atom: 964
Blocpdb> 28 atoms in block 32
Block first atom: 994
Blocpdb> 33 atoms in block 33
Block first atom: 1022
Blocpdb> 38 atoms in block 34
Block first atom: 1055
Blocpdb> 28 atoms in block 35
Block first atom: 1093
Blocpdb> 45 atoms in block 36
Block first atom: 1121
Blocpdb> 38 atoms in block 37
Block first atom: 1166
Blocpdb> 33 atoms in block 38
Block first atom: 1204
Blocpdb> 33 atoms in block 39
Block first atom: 1237
Blocpdb> 29 atoms in block 40
Block first atom: 1270
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 1299
Blocpdb> 43 atoms in block 42
Block first atom: 1325
Blocpdb> 40 atoms in block 43
Block first atom: 1368
Blocpdb> 28 atoms in block 44
Block first atom: 1408
Blocpdb> 39 atoms in block 45
Block first atom: 1436
Blocpdb> 25 atoms in block 46
Block first atom: 1475
Blocpdb> 32 atoms in block 47
Block first atom: 1500
Blocpdb> 43 atoms in block 48
Block first atom: 1532
Blocpdb> 36 atoms in block 49
Block first atom: 1575
Blocpdb> 21 atoms in block 50
Block first atom: 1611
Blocpdb> 30 atoms in block 51
Block first atom: 1632
Blocpdb> 31 atoms in block 52
Block first atom: 1662
Blocpdb> 45 atoms in block 53
Block first atom: 1693
Blocpdb> 26 atoms in block 54
Block first atom: 1738
Blocpdb> 36 atoms in block 55
Block first atom: 1764
Blocpdb> 28 atoms in block 56
Block first atom: 1800
Blocpdb> 37 atoms in block 57
Block first atom: 1828
Blocpdb> 28 atoms in block 58
Block first atom: 1865
Blocpdb> 44 atoms in block 59
Block first atom: 1893
Blocpdb> 25 atoms in block 60
Block first atom: 1937
Blocpdb> 38 atoms in block 61
Block first atom: 1962
Blocpdb> 32 atoms in block 62
Block first atom: 2000
Blocpdb> 39 atoms in block 63
Block first atom: 2032
Blocpdb> 41 atoms in block 64
Block first atom: 2071
Blocpdb> 29 atoms in block 65
Block first atom: 2112
Blocpdb> 40 atoms in block 66
Block first atom: 2141
Blocpdb> 33 atoms in block 67
Block first atom: 2181
Blocpdb> 27 atoms in block 68
Block first atom: 2214
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 2241
Blocpdb> 28 atoms in block 70
Block first atom: 2267
Blocpdb> 33 atoms in block 71
Block first atom: 2295
Blocpdb> 30 atoms in block 72
Block first atom: 2328
Blocpdb> 27 atoms in block 73
Block first atom: 2358
Blocpdb> 36 atoms in block 74
Block first atom: 2385
Blocpdb> 24 atoms in block 75
Block first atom: 2421
Blocpdb> 33 atoms in block 76
Block first atom: 2445
Blocpdb> 36 atoms in block 77
Block first atom: 2478
Blocpdb> 37 atoms in block 78
Block first atom: 2514
Blocpdb> 18 atoms in block 79
Block first atom: 2551
Blocpdb> 29 atoms in block 80
Block first atom: 2569
Blocpdb> 29 atoms in block 81
Block first atom: 2598
Blocpdb> 24 atoms in block 82
Block first atom: 2627
Blocpdb> 34 atoms in block 83
Block first atom: 2651
Blocpdb> 35 atoms in block 84
Block first atom: 2685
Blocpdb> 26 atoms in block 85
Block first atom: 2720
Blocpdb> 31 atoms in block 86
Block first atom: 2746
Blocpdb> 27 atoms in block 87
Block first atom: 2777
Blocpdb> 40 atoms in block 88
Block first atom: 2804
Blocpdb> 33 atoms in block 89
Block first atom: 2844
Blocpdb> 33 atoms in block 90
Block first atom: 2877
Blocpdb> 36 atoms in block 91
Block first atom: 2910
Blocpdb> 35 atoms in block 92
Block first atom: 2946
Blocpdb> 35 atoms in block 93
Block first atom: 2981
Blocpdb> 39 atoms in block 94
Block first atom: 3016
Blocpdb> 33 atoms in block 95
Block first atom: 3055
Blocpdb> 33 atoms in block 96
Block first atom: 3088
Blocpdb> 36 atoms in block 97
Block first atom: 3121
Blocpdb> 37 atoms in block 98
Block first atom: 3157
Blocpdb> 10 atoms in block 99
Block first atom: 3194
Blocpdb> 28 atoms in block 100
Block first atom: 3204
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 3232
Blocpdb> 29 atoms in block 102
Block first atom: 3262
Blocpdb> 39 atoms in block 103
Block first atom: 3291
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 3330
Blocpdb> 38 atoms in block 105
Block first atom: 3351
Blocpdb> 26 atoms in block 106
Block first atom: 3389
Blocpdb> 35 atoms in block 107
Block first atom: 3415
Blocpdb> 40 atoms in block 108
Block first atom: 3450
Blocpdb> 39 atoms in block 109
Block first atom: 3490
Blocpdb> 32 atoms in block 110
Block first atom: 3529
Blocpdb> 41 atoms in block 111
Block first atom: 3561
Blocpdb> 25 atoms in block 112
Block first atom: 3602
Blocpdb> 40 atoms in block 113
Block first atom: 3627
Blocpdb> 33 atoms in block 114
Block first atom: 3667
Blocpdb> 33 atoms in block 115
Block first atom: 3700
Blocpdb> 27 atoms in block 116
Block first atom: 3733
Blocpdb> 35 atoms in block 117
Block first atom: 3760
Blocpdb> 32 atoms in block 118
Block first atom: 3795
Blocpdb> 26 atoms in block 119
Block first atom: 3827
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 3853
Blocpdb> 27 atoms in block 121
Block first atom: 3877
Blocpdb> 35 atoms in block 122
Block first atom: 3904
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 3939
Blocpdb> 38 atoms in block 124
Block first atom: 3956
Blocpdb> 30 atoms in block 125
Block first atom: 3994
Blocpdb> 36 atoms in block 126
Block first atom: 4024
Blocpdb> 43 atoms in block 127
Block first atom: 4060
Blocpdb> 28 atoms in block 128
Block first atom: 4103
Blocpdb> 30 atoms in block 129
Block first atom: 4131
Blocpdb> 21 atoms in block 130
Block first atom: 4161
Blocpdb> 30 atoms in block 131
Block first atom: 4182
Blocpdb> 33 atoms in block 132
Block first atom: 4212
Blocpdb> 37 atoms in block 133
Block first atom: 4245
Blocpdb> 33 atoms in block 134
Block first atom: 4282
Blocpdb> 34 atoms in block 135
Block first atom: 4315
Blocpdb> 36 atoms in block 136
Block first atom: 4349
Blocpdb> 45 atoms in block 137
Block first atom: 4385
Blocpdb> 21 atoms in block 138
Block first atom: 4430
Blocpdb> 31 atoms in block 139
Block first atom: 4451
Blocpdb> 45 atoms in block 140
Block first atom: 4482
Blocpdb> 36 atoms in block 141
Block first atom: 4527
Blocpdb> 28 atoms in block 142
Block first atom: 4563
Blocpdb> 21 atoms in block 143
Block first atom: 4591
Blocpdb> 142 atoms in block 144
Block first atom: 4611
Blocpdb> 144 blocks.
Blocpdb> At most, 142 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3385463 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 14259
Prepmat> Matrix trace = 7460680.0000
Prepmat> Last element read: 14259 14259 391.8044
Prepmat> 10441 lines saved.
Prepmat> 8706 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4753
RTB> Total mass = 4753.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4753
RTB> Number of blocks = 144
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 381444.2782
RTB> 60264 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 864
Diagstd> Nb of non-zero elements: 60264
Diagstd> Projected matrix trace = 381444.2782
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 864 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 381444.2782
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.5825156 6.3735426 7.1078887 9.2493650
10.2557831 11.5200031 14.6301777 15.2698009 16.6095042
17.8936047 21.5558334 22.3507488 22.8559789 23.2031689
25.4685822 27.4015534 29.0567641 29.5862427 31.3622787
33.6346046 33.8486259 36.4147110 39.1320662 42.0638028
43.6331305 44.7815130 45.4963447 46.5715432 49.2568336
50.5342269 51.7894903 53.2413941 54.7437564 57.3123556
57.7959298 58.8983197 60.7438717 61.2793557 62.8173213
64.1402697 64.7910608 67.1109922 68.4878449 70.5238790
71.1887459 73.0428485 74.3185122 76.2558610 78.4563660
80.0869938 80.5028577 82.7421425 84.3664551 87.0728384
88.6035157 89.6433631 92.0988414 92.7467406 94.6236635
95.0419356 96.4031782 97.4040956 99.0181970 99.2091345
100.5447718 102.2241223 104.8273001 106.1524577 107.3688972
110.4614392 111.0110022 111.9562334 114.5131285 115.8409208
116.4309137 117.2970579 119.2285197 120.3394041 121.0261599
123.3792798 124.8647061 125.2703272 126.4520680 127.1450208
127.5583315 129.8136384 133.1173651 134.3764780 135.5617124
137.8047958 138.1895317 140.8224841 141.8200874 144.0827023
144.8288653 146.9930475 148.0908892 149.9936862 150.6173454
153.0534985
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034318 0.0034323 0.0034336 0.0034341 0.0034347
0.0034371 205.5366732 274.1484072 289.5113464 330.2563981
347.7600540 368.5713537 415.3556099 424.3380414 442.5614843
459.3505068 504.1708003 513.3828054 519.1527909 523.0809826
548.0215858 568.4376977 585.3544225 590.6635731 608.1337207
629.7793897 631.7798954 655.2902621 679.3000870 704.2867965
717.3043539 726.6824331 732.4593603 741.0637925 762.1290666
771.9480831 781.4768166 792.3553406 803.4568867 822.0900839
825.5509996 833.3870215 846.3432115 850.0654706 860.6666738
869.6823796 874.0833058 889.5945432 898.6736966 911.9339332
916.2224975 928.0772588 936.1464261 948.2697459 961.8544852
971.7986160 974.3184553 987.7764352 997.4248425 1013.2967067
1022.1644149 1028.1449598 1042.1311170 1045.7902974 1056.3191652
1058.6512547 1066.2055926 1071.7263024 1080.5697048 1081.6110382
1088.8674780 1097.9232338 1111.8148759 1118.8202210 1125.2124439
1141.3021329 1144.1376890 1148.9983886 1162.0449300 1168.7625324
1171.7350823 1176.0853488 1185.7287667 1191.2398374 1194.6340995
1206.1918668 1213.4311230 1215.4004312 1221.1197299 1224.4610051
1226.4495698 1237.2442426 1252.8891163 1258.8005015 1264.3397829
1274.7571198 1276.5353706 1288.6390293 1293.1954104 1303.4704885
1306.8412801 1316.5691583 1321.4765192 1329.9391463 1332.7011568
1343.4357801
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4753
Rtb_to_modes> Number of blocs = 144
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9877E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0018E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.583
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.374
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.249
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.1
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 864 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 0.99997 0.99997 0.99997 1.00002
0.99997 1.00003 1.00002 0.99997 1.00000
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99996
1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997
1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999
1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002
1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003
0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 85554 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 0.99997 0.99997 0.99997 1.00002
0.99997 1.00003 1.00002 0.99997 1.00000
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99996
1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997
1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999
1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002
1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003
0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603141726122850672.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603141726122850672.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603141726122850672.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603141726122850672.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 285
First residue number = 69
Last residue number = 1
Number of atoms found = 4753
Mean number per residue = 16.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9877E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0018E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.583
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.374
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.249
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.1
Bfactors> 106 vectors, 14259 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.583000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.353 for 284 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.006 +/- 0.01
Bfactors> = 72.605 +/- 32.17
Bfactors> Shiftng-fct= 72.599
Bfactors> Scaling-fct= 3290.935
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603141726122850672.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603141726122850672.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4369E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 997.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1098.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1125.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1149.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1162.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1176.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1186.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1224.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1227.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1237.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1259.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1264.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1275.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1288.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1293.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1307.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1330.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1333.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1344.
Chkmod> 106 vectors, 14259 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4753 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9459
0.0034 0.7335
0.0034 0.8194
0.0034 0.7628
0.0034 0.7976
0.0034 0.9782
205.5417 0.0744
274.1465 0.1875
289.5012 0.1254
330.2357 0.5533
347.8166 0.2777
368.5555 0.4041
415.3353 0.2182
424.3226 0.1899
442.5491 0.1700
459.2845 0.2588
504.1979 0.1272
513.3522 0.2854
519.1762 0.3403
523.0228 0.3358
548.0133 0.3133
568.3972 0.5214
585.3619 0.2786
590.6757 0.5334
608.0855 0.4972
629.7092 0.4067
631.7656 0.2815
655.2197 0.4680
679.2530 0.4211
704.2247 0.4495
717.2478 0.4764
726.6390 0.3999
732.4573 0.4687
741.0197 0.4919
762.1208 0.2391
771.8827 0.3390
781.4471 0.4145
792.3110 0.2541
803.3948 0.4329
822.0379 0.5196
825.5446 0.4264
833.3631 0.4847
846.2799 0.3010
850.0334 0.2046
860.6481 0.3443
869.6432 0.2847
874.0386 0.1336
889.5498 0.2739
898.6493 0.4009
911.8697 0.2874
916.1912 0.4250
928.0193 0.4366
936.1156 0.2339
948.2548 0.2706
961.8355 0.4693
971.7751 0.2762
974.2593 0.2565
987.7212 0.5042
997.4030 0.4016
1013.2367 0.3081
1022.1003 0.3962
1028.0815 0.3630
1042.0929 0.4141
1045.7638 0.4278
1056.2534 0.4999
1058.5950 0.4534
1066.1422 0.4507
1071.6578 0.4063
1080.5332 0.4399
1081.5693 0.4048
1088.5783 0.3715
1097.7466 0.3775
1111.6224 0.3676
1119.0227 0.4281
1125.3271 0.2656
1141.4523 0.3127
1144.0319 0.1323
1149.1736 0.4166
1161.9284 0.3354
1168.5059 0.2754
1171.5292 0.4293
1176.0496 0.3417
1185.5360 0.4019
1190.9937 0.4990
1194.4537 0.5120
1206.2414 0.3048
1213.5505 0.5577
1215.4922 0.4046
1221.2987 0.4375
1224.1916 0.5144
1226.5972 0.4047
1237.1261 0.4515
1252.7536 0.3965
1258.8566 0.4956
1264.4640 0.5549
1274.6802 0.5212
1276.5289 0.5538
1288.4808 0.3853
1293.0483 0.5057
1303.4928 0.4353
1306.6549 0.5098
1316.5438 0.3907
1321.4604 0.3908
1329.9100 0.4946
1332.5672 0.4560
1343.5822 0.4252
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603141726122850672 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
making animated gifs
11 models are in 2603141726122850672.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603141726122850672 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
making animated gifs
11 models are in 2603141726122850672.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603141726122850672 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
making animated gifs
11 models are in 2603141726122850672.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603141726122850672 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
making animated gifs
11 models are in 2603141726122850672.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603141726122850672 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603141726122850672.eigenfacs
2603141726122850672.atom
making animated gifs
11 models are in 2603141726122850672.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603141726122850672.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603141726122850672.10.pdb
2603141726122850672.11.pdb
2603141726122850672.7.pdb
2603141726122850672.8.pdb
2603141726122850672.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m18.445s
user 0m18.187s
sys 0m0.249s
rm: cannot remove '2603141726122850672.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
