CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  8YTW_AF  ***

LOGs for ID: 2603162356193430308

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603162356193430308.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603162356193430308.atom to be opened. Openam> File opened: 2603162356193430308.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 288 First residue number = 1 Last residue number = 288 Number of atoms found = 2090 Mean number per residue = 7.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = -5.596943 +/- 18.122120 From: -60.009000 To: 22.041000 = -6.613070 +/- 19.088338 From: -92.490000 To: 16.195000 = -1.997246 +/- 9.946437 From: -24.892000 To: 21.502000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.9015 % Filled. Pdbmat> 767024 non-zero elements. Pdbmat> 83846 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.24 +/- 29.29 Maximum number = 135 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 1.676920E+06 Pdbmat> Larger element = 496.240 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 288 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603162356193430308.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603162356193430308.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603162356193430308.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2090 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 288 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 18 atoms in block 3 Block first atom: 34 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 52 Blocpdb> 25 atoms in block 5 Block first atom: 68 Blocpdb> 18 atoms in block 6 Block first atom: 93 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 111 Blocpdb> 11 atoms in block 8 Block first atom: 128 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 139 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 154 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 166 Blocpdb> 13 atoms in block 12 Block first atom: 181 Blocpdb> 10 atoms in block 13 Block first atom: 194 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 204 Blocpdb> 13 atoms in block 15 Block first atom: 212 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 225 Blocpdb> 10 atoms in block 17 Block first atom: 237 Blocpdb> 12 atoms in block 18 Block first atom: 247 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 259 Blocpdb> 17 atoms in block 20 Block first atom: 276 Blocpdb> 11 atoms in block 21 Block first atom: 293 Blocpdb> 14 atoms in block 22 Block first atom: 304 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 318 Blocpdb> 10 atoms in block 24 Block first atom: 332 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 342 Blocpdb> 11 atoms in block 26 Block first atom: 358 Blocpdb> 12 atoms in block 27 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 28 Block first atom: 381 Blocpdb> 12 atoms in block 29 Block first atom: 398 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 410 Blocpdb> 12 atoms in block 31 Block first atom: 421 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 433 Blocpdb> 17 atoms in block 33 Block first atom: 448 Blocpdb> 11 atoms in block 34 Block first atom: 465 Blocpdb> 15 atoms in block 35 Block first atom: 476 Blocpdb> 8 atoms in block 36 Block first atom: 491 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 499 Blocpdb> 24 atoms in block 38 Block first atom: 513 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 537 Blocpdb> 10 atoms in block 40 Block first atom: 551 Blocpdb> 11 atoms in block 41 Block first atom: 561 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 572 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 591 Blocpdb> 12 atoms in block 44 Block first atom: 605 Blocpdb> 14 atoms in block 45 Block first atom: 617 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 631 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 646 Blocpdb> 21 atoms in block 48 Block first atom: 659 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 680 Blocpdb> 14 atoms in block 50 Block first atom: 695 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 709 Blocpdb> 11 atoms in block 52 Block first atom: 731 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 742 Blocpdb> 11 atoms in block 54 Block first atom: 760 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 771 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 789 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 807 Blocpdb> 9 atoms in block 58 Block first atom: 821 Blocpdb> 15 atoms in block 59 Block first atom: 830 Blocpdb> 13 atoms in block 60 Block first atom: 845 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 858 Blocpdb> 14 atoms in block 62 Block first atom: 873 Blocpdb> 13 atoms in block 63 Block first atom: 887 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 900 Blocpdb> 13 atoms in block 65 Block first atom: 920 Blocpdb> 17 atoms in block 66 Block first atom: 933 Blocpdb> 13 atoms in block 67 Block first atom: 950 Blocpdb> 13 atoms in block 68 Block first atom: 963 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 976 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 998 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1010 Blocpdb> 12 atoms in block 72 Block first atom: 1024 Blocpdb> 10 atoms in block 73 Block first atom: 1036 Blocpdb> 18 atoms in block 74 Block first atom: 1046 Blocpdb> 13 atoms in block 75 Block first atom: 1064 Blocpdb> 15 atoms in block 76 Block first atom: 1077 Blocpdb> 11 atoms in block 77 Block first atom: 1092 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 1103 Blocpdb> 11 atoms in block 79 Block first atom: 1125 Blocpdb> 9 atoms in block 80 Block first atom: 1136 Blocpdb> 20 atoms in block 81 Block first atom: 1145 Blocpdb> 12 atoms in block 82 Block first atom: 1165 Blocpdb> 8 atoms in block 83 Block first atom: 1177 Blocpdb> 11 atoms in block 84 Block first atom: 1185 Blocpdb> 17 atoms in block 85 Block first atom: 1196 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1213 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1226 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1240 Blocpdb> 11 atoms in block 89 Block first atom: 1255 Blocpdb> 14 atoms in block 90 Block first atom: 1266 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 1280 Blocpdb> 11 atoms in block 92 Block first atom: 1294 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1305 Blocpdb> 12 atoms in block 94 Block first atom: 1320 Blocpdb> 22 atoms in block 95 Block first atom: 1332 Blocpdb> 12 atoms in block 96 Block first atom: 1354 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1366 Blocpdb> 17 atoms in block 98 Block first atom: 1383 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1400 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1416 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1432 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 1446 Blocpdb> 11 atoms in block 103 Block first atom: 1465 Blocpdb> 14 atoms in block 104 Block first atom: 1476 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1490 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1506 Blocpdb> 12 atoms in block 107 Block first atom: 1521 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1533 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1545 Blocpdb> 12 atoms in block 110 Block first atom: 1564 Blocpdb> 18 atoms in block 111 Block first atom: 1576 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 1594 Blocpdb> 10 atoms in block 113 Block first atom: 1614 Blocpdb> 9 atoms in block 114 Block first atom: 1624 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1633 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 1649 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1667 Blocpdb> 13 atoms in block 118 Block first atom: 1684 Blocpdb> 9 atoms in block 119 Block first atom: 1697 Blocpdb> 18 atoms in block 120 Block first atom: 1706 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 1724 Blocpdb> 14 atoms in block 122 Block first atom: 1746 Blocpdb> 12 atoms in block 123 Block first atom: 1760 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1772 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 1787 Blocpdb> 17 atoms in block 126 Block first atom: 1801 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 1818 Blocpdb> 13 atoms in block 128 Block first atom: 1831 Blocpdb> 22 atoms in block 129 Block first atom: 1844 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 1866 Blocpdb> 18 atoms in block 131 Block first atom: 1886 Blocpdb> 12 atoms in block 132 Block first atom: 1904 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 1916 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 1932 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 1954 Blocpdb> 18 atoms in block 136 Block first atom: 1968 Blocpdb> 10 atoms in block 137 Block first atom: 1986 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 1996 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 2012 Blocpdb> 12 atoms in block 140 Block first atom: 2021 Blocpdb> 11 atoms in block 141 Block first atom: 2033 Blocpdb> 22 atoms in block 142 Block first atom: 2044 Blocpdb> 13 atoms in block 143 Block first atom: 2066 Blocpdb> 12 atoms in block 144 Block first atom: 2078 Blocpdb> 144 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 767168 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6270 Prepmat> Matrix trace = 1676920.0000 Prepmat> Last element read: 6270 6270 74.0855 Prepmat> 10441 lines saved. Prepmat> 8895 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2090 RTB> Total mass = 2090.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2090 RTB> Number of blocks = 144 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 195073.7393 RTB> 53460 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 864 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53460 Diagstd> Projected matrix trace = 195073.7393 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 864 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 195073.7393 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0001341 0.0002242 0.0032820 0.0046830 0.0054262 0.0159995 0.0310113 0.0628779 0.0959168 0.1891509 0.2262088 0.3792928 0.5623798 0.5995331 0.7561488 1.0391548 1.0592031 1.2700717 1.6401917 1.7350812 1.9947013 2.5208478 2.8860890 2.9274840 3.2314902 3.7654378 4.3021588 5.1418692 5.5961233 6.4529564 6.6817617 6.7690604 6.9383785 8.1033837 8.9399387 9.7121600 9.9151031 10.5847359 10.7230727 11.5814838 11.9145757 12.2418892 12.5654354 13.4461561 13.9781113 14.4274961 14.5027689 15.8054808 16.7102879 17.7233611 19.1594261 19.9198129 20.4412995 20.8074689 21.1011711 21.6645430 22.9325189 23.6087339 23.9522516 24.4364704 24.9895012 25.7296095 26.1722018 26.9796235 27.7779037 28.7424044 29.0810713 29.3118091 29.7943432 30.4120947 31.0607444 31.6681296 32.5022713 33.3950854 33.8791781 34.5272705 35.3528413 35.8331427 37.2641678 38.6419262 39.0782503 39.5587086 40.3982374 40.9606844 41.6020641 41.6496427 42.3165448 43.0906848 43.5080215 44.9105578 45.8394549 46.8748751 47.6295042 48.0056440 48.2639836 48.6083677 49.1581384 49.3965211 50.0883991 50.3357977 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034328 0.0034333 0.0034340 0.0034341 0.0034343 1.2576765 1.6261115 6.2210159 7.4312087 7.9991688 13.7356436 19.1229670 27.2297963 33.6312116 47.2279869 51.6475853 66.8778886 81.4348212 84.0817711 94.4275948 110.6968879 111.7596155 122.3797034 139.0729243 143.0392347 153.3678109 172.4124375 184.4803616 185.7986456 195.2075910 210.7186702 225.2363597 246.2384067 256.8851016 275.8510530 280.6989391 282.5266859 286.0383561 309.1209798 324.6852429 338.4177974 341.9352677 353.2932126 355.5943942 369.5535524 374.8301960 379.9439231 384.9320312 398.1936727 405.9939184 412.4684763 413.5430661 431.7169851 443.9021476 457.1601046 475.3204820 484.6608139 490.9638673 495.3417191 498.8254005 505.4405094 520.0213331 527.6326094 531.4573925 536.8024861 542.8427900 550.8227612 555.5400973 564.0443104 572.3280279 582.1793913 585.5992079 587.9177765 592.7372052 598.8505427 605.2031922 611.0918431 619.0876432 627.5329865 632.0649581 638.0818681 645.6652927 650.0364795 662.8892769 675.0324700 678.8328267 682.9931263 690.2024376 694.9905232 700.4106153 700.8110169 706.3994949 712.8316566 716.2752546 727.7287033 735.2160895 743.4732409 749.4338594 752.3872549 754.4090034 757.0957340 761.3651502 763.2089634 768.5353637 770.4310156 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2090 Rtb_to_modes> Number of blocs = 144 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3414E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2424E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2820E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6830E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4262E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6000E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1011E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2878E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.5917E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1892 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3793 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5624 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7561 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.039 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.059 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.270 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.521 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.886 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.927 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.231 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.765 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.302 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.142 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.453 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.769 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.712 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.915 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 864 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00004 1.00002 1.00003 0.99999 1.00004 0.99998 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 0.99996 1.00003 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00005 1.00004 1.00004 0.99998 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00006 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 37620 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00004 1.00002 1.00003 0.99999 1.00004 0.99998 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 0.99996 1.00003 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00005 1.00004 1.00004 0.99998 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00006 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603162356193430308.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603162356193430308.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603162356193430308.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603162356193430308.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 288 First residue number = 1 Last residue number = 288 Number of atoms found = 2090 Mean number per residue = 7.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3414E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2424E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2820E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6830E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4262E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6000E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1011E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2878E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5917E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1892 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3793 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5624 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7561 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.039 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.059 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.270 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.640 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.521 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.886 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.927 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.231 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.765 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.302 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.142 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.453 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.769 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.712 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.915 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34 Bfactors> 106 vectors, 6270 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000134 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.639 for 288 C-alpha atoms. Bfactors> = 85.868 +/- 171.23 Bfactors> = 90.343 +/- 18.14 Bfactors> Shiftng-fct= 4.475 Bfactors> Scaling-fct= 0.106 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603162356193430308.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603162356193430308.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.258 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.221 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.431 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.999 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4 Chkmod> 106 vectors, 6270 coordinates in file. Chkmod> That is: 2090 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 70 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 81 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 94 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 104 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.3563 0.0034 0.3038 0.0034 0.7693 0.0034 0.9428 0.0034 0.9628 0.0034 0.8282 1.2576 0.4994 1.6260 0.2692 6.2208 0.1436 7.4309 0.1788 7.9988 0.3318 13.7353 0.1553 19.1221 0.0986 27.2286 0.1149 33.6298 0.0454 47.2321 0.0685 51.6444 0.0877 66.8757 0.0781 81.4328 0.0331 84.0758 0.0709 94.4205 0.0547 110.6839 0.0265 111.7441 0.0769 122.3710 0.0949 139.0588 0.0823 143.0297 0.1045 153.3727 0.0931 172.4102 0.0800 184.4696 0.0485 185.7753 0.0162 195.1844 0.0650 210.6974 0.0512 225.2225 0.0594 246.2310 0.0655 256.8712 0.0608 275.8401 0.0736 280.6919 0.0827 282.5133 0.0928 286.0183 0.0566 309.1004 0.0594 324.6724 0.1153 338.4005 0.2071 341.9188 0.1752 353.1990 0.3855 355.5282 0.0332 369.5140 0.1854 374.7421 0.1064 379.8983 0.0354 384.9854 0.0773 398.2335 0.0825 406.0039 0.1896 412.4866 0.1274 413.4858 0.0801 431.7602 0.1023 443.8793 0.1969 457.0971 0.3976 475.3072 0.2944 484.6423 0.2918 490.9272 0.3157 495.3506 0.1265 498.7901 0.6715 505.3658 0.5321 519.9705 0.3050 527.6241 0.0893 531.4096 0.5170 536.8182 0.2449 542.8249 0.1680 550.8033 0.3489 555.4929 0.5378 564.0240 0.0160 572.3251 0.5713 582.1301 0.4451 585.5633 0.2537 587.8744 0.5449 592.6686 0.0549 598.8042 0.5573 605.1700 0.2288 611.0837 0.0492 619.0394 0.2652 627.5522 0.2990 632.0455 0.2756 638.0797 0.1733 645.6116 0.3107 649.9801 0.0948 662.8238 0.1632 674.9867 0.1799 678.8189 0.1633 682.9750 0.3252 690.1879 0.2207 694.9549 0.1624 700.3632 0.2246 700.7839 0.3391 706.3980 0.3720 712.7954 0.1607 716.2608 0.3587 727.6929 0.1803 735.1889 0.5011 743.4027 0.2894 749.4056 0.2514 752.3891 0.1485 754.3455 0.0571 757.0759 0.2382 761.3469 0.0586 763.2031 0.2415 768.5147 0.1047 770.4301 0.3075 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2603162356193430308 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom making animated gifs 11 models are in 2603162356193430308.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603162356193430308 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom making animated gifs 11 models are in 2603162356193430308.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603162356193430308 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom making animated gifs 11 models are in 2603162356193430308.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603162356193430308 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom making animated gifs 11 models are in 2603162356193430308.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603162356193430308 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603162356193430308.eigenfacs 2603162356193430308.atom making animated gifs 11 models are in 2603162356193430308.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603162356193430308.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603162356193430308.10.pdb 2603162356193430308.11.pdb 2603162356193430308.7.pdb 2603162356193430308.8.pdb 2603162356193430308.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m11.847s user 0m11.745s sys 0m0.099s rm: cannot remove '2603162356193430308.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.