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***  model.6  ***

LOGs for ID: 2603170113303461401

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603170113303461401.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603170113303461401.atom to be opened. Openam> File opened: 2603170113303461401.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 713 First residue number = 26 Last residue number = 115 Number of atoms found = 5546 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 157.727266 +/- 13.303669 From: 121.674000 To: 193.077000 = 158.681944 +/- 30.815287 From: 85.036000 To: 218.217000 = 130.000936 +/- 20.424891 From: 85.052000 To: 190.760000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3871 % Filled. Pdbmat> 1919991 non-zero elements. Pdbmat> 209665 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 75.61 +/- 22.26 Maximum number = 131 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 4.193300E+06 Pdbmat> Larger element = 463.256 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 713 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603170113303461401.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603170113303461401.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603170113303461401.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5546 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 713 residues. Blocpdb> 28 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 29 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 54 Blocpdb> 28 atoms in block 4 Block first atom: 85 Blocpdb> 35 atoms in block 5 Block first atom: 113 Blocpdb> 36 atoms in block 6 Block first atom: 148 Blocpdb> 44 atoms in block 7 Block first atom: 184 Blocpdb> 32 atoms in block 8 Block first atom: 228 Blocpdb> 26 atoms in block 9 Block first atom: 260 Blocpdb> 33 atoms in block 10 Block first atom: 286 Blocpdb> 30 atoms in block 11 Block first atom: 319 Blocpdb> 37 atoms in block 12 Block first atom: 349 Blocpdb> 33 atoms in block 13 Block first atom: 386 Blocpdb> 35 atoms in block 14 Block first atom: 419 Blocpdb> 27 atoms in block 15 Block first atom: 454 Blocpdb> 34 atoms in block 16 Block first atom: 481 Blocpdb> 30 atoms in block 17 Block first atom: 515 Blocpdb> 42 atoms in block 18 Block first atom: 545 Blocpdb> 32 atoms in block 19 Block first atom: 587 Blocpdb> 35 atoms in block 20 Block first atom: 619 Blocpdb> 31 atoms in block 21 Block first atom: 654 Blocpdb> 37 atoms in block 22 Block first atom: 685 Blocpdb> 36 atoms in block 23 Block first atom: 722 Blocpdb> 32 atoms in block 24 Block first atom: 758 Blocpdb> 40 atoms in block 25 Block first atom: 790 Blocpdb> 31 atoms in block 26 Block first atom: 830 Blocpdb> 30 atoms in block 27 Block first atom: 861 Blocpdb> 29 atoms in block 28 Block first atom: 891 Blocpdb> 32 atoms in block 29 Block first atom: 920 Blocpdb> 28 atoms in block 30 Block first atom: 952 Blocpdb> 30 atoms in block 31 Block first atom: 980 Blocpdb> 34 atoms in block 32 Block first atom: 1010 Blocpdb> 37 atoms in block 33 Block first atom: 1044 Blocpdb> 28 atoms in block 34 Block first atom: 1081 Blocpdb> 41 atoms in block 35 Block first atom: 1109 Blocpdb> 34 atoms in block 36 Block first atom: 1150 Blocpdb> 28 atoms in block 37 Block first atom: 1184 Blocpdb> 30 atoms in block 38 Block first atom: 1212 Blocpdb> 6 atoms in block 39 Block first atom: 1242 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 1248 Blocpdb> 31 atoms in block 41 Block first atom: 1270 Blocpdb> 28 atoms in block 42 Block first atom: 1301 Blocpdb> 35 atoms in block 43 Block first atom: 1329 Blocpdb> 27 atoms in block 44 Block first atom: 1364 Blocpdb> 33 atoms in block 45 Block first atom: 1391 Blocpdb> 33 atoms in block 46 Block first atom: 1424 Blocpdb> 25 atoms in block 47 Block first atom: 1457 Blocpdb> 32 atoms in block 48 Block first atom: 1482 Blocpdb> 33 atoms in block 49 Block first atom: 1514 Blocpdb> 30 atoms in block 50 Block first atom: 1547 Blocpdb> 26 atoms in block 51 Block first atom: 1577 Blocpdb> 36 atoms in block 52 Block first atom: 1603 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 1639 Blocpdb> 26 atoms in block 54 Block first atom: 1658 Blocpdb> 29 atoms in block 55 Block first atom: 1684 Blocpdb> 30 atoms in block 56 Block first atom: 1713 Blocpdb> 35 atoms in block 57 Block first atom: 1743 Blocpdb> 21 atoms in block 58 Block first atom: 1778 Blocpdb> 29 atoms in block 59 Block first atom: 1799 Blocpdb> 34 atoms in block 60 Block first atom: 1828 Blocpdb> 34 atoms in block 61 Block first atom: 1862 Blocpdb> 34 atoms in block 62 Block first atom: 1896 Blocpdb> 35 atoms in block 63 Block first atom: 1930 Blocpdb> 33 atoms in block 64 Block first atom: 1965 Blocpdb> 35 atoms in block 65 Block first atom: 1998 Blocpdb> 29 atoms in block 66 Block first atom: 2033 Blocpdb> 31 atoms in block 67 Block first atom: 2062 Blocpdb> 36 atoms in block 68 Block first atom: 2093 Blocpdb> 27 atoms in block 69 Block first atom: 2129 Blocpdb> 30 atoms in block 70 Block first atom: 2156 Blocpdb> 24 atoms in block 71 Block first atom: 2186 Blocpdb> 32 atoms in block 72 Block first atom: 2210 Blocpdb> 33 atoms in block 73 Block first atom: 2242 Blocpdb> 29 atoms in block 74 Block first atom: 2275 Blocpdb> 28 atoms in block 75 Block first atom: 2304 Blocpdb> 29 atoms in block 76 Block first atom: 2332 Blocpdb> 27 atoms in block 77 Block first atom: 2361 Blocpdb> 24 atoms in block 78 Block first atom: 2388 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 2412 Blocpdb> 28 atoms in block 80 Block first atom: 2437 Blocpdb> 28 atoms in block 81 Block first atom: 2465 Blocpdb> 30 atoms in block 82 Block first atom: 2493 Blocpdb> 36 atoms in block 83 Block first atom: 2523 Blocpdb> 30 atoms in block 84 Block first atom: 2559 Blocpdb> 28 atoms in block 85 Block first atom: 2589 Blocpdb> 34 atoms in block 86 Block first atom: 2617 Blocpdb> 29 atoms in block 87 Block first atom: 2651 Blocpdb> 31 atoms in block 88 Block first atom: 2680 Blocpdb> 30 atoms in block 89 Block first atom: 2711 Blocpdb> 28 atoms in block 90 Block first atom: 2741 Blocpdb> 34 atoms in block 91 Block first atom: 2769 Blocpdb> 36 atoms in block 92 Block first atom: 2803 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 2839 Blocpdb> 30 atoms in block 94 Block first atom: 2874 Blocpdb> 31 atoms in block 95 Block first atom: 2904 Blocpdb> 36 atoms in block 96 Block first atom: 2935 Blocpdb> 34 atoms in block 97 Block first atom: 2971 Blocpdb> 30 atoms in block 98 Block first atom: 3005 Blocpdb> 30 atoms in block 99 Block first atom: 3035 Blocpdb> 27 atoms in block 100 Block first atom: 3065 Blocpdb> 33 atoms in block 101 Block first atom: 3092 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 3125 Blocpdb> 33 atoms in block 103 Block first atom: 3151 Blocpdb> 30 atoms in block 104 Block first atom: 3184 Blocpdb> 30 atoms in block 105 Block first atom: 3214 Blocpdb> 34 atoms in block 106 Block first atom: 3244 Blocpdb> 32 atoms in block 107 Block first atom: 3278 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 3310 Blocpdb> 35 atoms in block 109 Block first atom: 3335 Blocpdb> 30 atoms in block 110 Block first atom: 3370 Blocpdb> 40 atoms in block 111 Block first atom: 3400 Blocpdb> 37 atoms in block 112 Block first atom: 3440 Blocpdb> 33 atoms in block 113 Block first atom: 3477 Blocpdb> 29 atoms in block 114 Block first atom: 3510 Blocpdb> 35 atoms in block 115 Block first atom: 3539 Blocpdb> 35 atoms in block 116 Block first atom: 3574 Blocpdb> 34 atoms in block 117 Block first atom: 3609 Blocpdb> 26 atoms in block 118 Block first atom: 3643 Blocpdb> 28 atoms in block 119 Block first atom: 3669 Blocpdb> 32 atoms in block 120 Block first atom: 3697 Blocpdb> 26 atoms in block 121 Block first atom: 3729 Blocpdb> 28 atoms in block 122 Block first atom: 3755 Blocpdb> 26 atoms in block 123 Block first atom: 3783 Blocpdb> 29 atoms in block 124 Block first atom: 3809 Blocpdb> 39 atoms in block 125 Block first atom: 3838 Blocpdb> 32 atoms in block 126 Block first atom: 3877 Blocpdb> 31 atoms in block 127 Block first atom: 3909 Blocpdb> 28 atoms in block 128 Block first atom: 3940 Blocpdb> 33 atoms in block 129 Block first atom: 3968 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 4001 Blocpdb> 27 atoms in block 131 Block first atom: 4043 Blocpdb> 30 atoms in block 132 Block first atom: 4070 Blocpdb> 30 atoms in block 133 Block first atom: 4100 Blocpdb> 32 atoms in block 134 Block first atom: 4130 Blocpdb> 29 atoms in block 135 Block first atom: 4162 Blocpdb> 31 atoms in block 136 Block first atom: 4191 Blocpdb> 22 atoms in block 137 Block first atom: 4222 Blocpdb> 29 atoms in block 138 Block first atom: 4244 Blocpdb> 31 atoms in block 139 Block first atom: 4273 Blocpdb> 32 atoms in block 140 Block first atom: 4304 Blocpdb> 28 atoms in block 141 Block first atom: 4336 Blocpdb> 31 atoms in block 142 Block first atom: 4364 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 4395 Blocpdb> 40 atoms in block 144 Block first atom: 4415 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 4455 Blocpdb> 36 atoms in block 146 Block first atom: 4483 Blocpdb> 30 atoms in block 147 Block first atom: 4519 Blocpdb> 30 atoms in block 148 Block first atom: 4549 Blocpdb> 22 atoms in block 149 Block first atom: 4579 Blocpdb> 30 atoms in block 150 Block first atom: 4601 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 4631 Blocpdb> 30 atoms in block 152 Block first atom: 4654 Blocpdb> 35 atoms in block 153 Block first atom: 4684 Blocpdb> 23 atoms in block 154 Block first atom: 4719 Blocpdb> 36 atoms in block 155 Block first atom: 4742 Blocpdb> 26 atoms in block 156 Block first atom: 4778 Blocpdb> 30 atoms in block 157 Block first atom: 4804 Blocpdb> 29 atoms in block 158 Block first atom: 4834 Blocpdb> 28 atoms in block 159 Block first atom: 4863 Blocpdb> 34 atoms in block 160 Block first atom: 4891 Blocpdb> 36 atoms in block 161 Block first atom: 4925 Blocpdb> 27 atoms in block 162 Block first atom: 4961 Blocpdb> 31 atoms in block 163 Block first atom: 4988 Blocpdb> 30 atoms in block 164 Block first atom: 5019 Blocpdb> 29 atoms in block 165 Block first atom: 5049 Blocpdb> 30 atoms in block 166 Block first atom: 5078 Blocpdb> 33 atoms in block 167 Block first atom: 5108 Blocpdb> 31 atoms in block 168 Block first atom: 5141 Blocpdb> 27 atoms in block 169 Block first atom: 5172 Blocpdb> 31 atoms in block 170 Block first atom: 5199 Blocpdb> 32 atoms in block 171 Block first atom: 5230 Blocpdb> 36 atoms in block 172 Block first atom: 5262 Blocpdb> 34 atoms in block 173 Block first atom: 5298 Blocpdb> 31 atoms in block 174 Block first atom: 5332 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 5363 Blocpdb> 32 atoms in block 176 Block first atom: 5397 Blocpdb> 29 atoms in block 177 Block first atom: 5429 Blocpdb> 24 atoms in block 178 Block first atom: 5458 Blocpdb> 36 atoms in block 179 Block first atom: 5482 Blocpdb> 29 atoms in block 180 Block first atom: 5517 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 44 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1920171 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 16638 Prepmat> Matrix trace = 4193300.0000 Prepmat> Last element read: 16638 16638 90.0561 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14896 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5546 RTB> Total mass = 5546.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5546 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 195679.6761 RTB> 47484 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 47484 Diagstd> Projected matrix trace = 195679.6761 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 195679.6761 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0042429 0.0083260 0.0304240 0.0388410 0.0563992 0.1469774 0.1845166 0.3492124 0.3940925 0.4630747 0.5864733 0.7327877 0.7449503 0.7955854 0.8865843 1.0106301 1.2965620 1.6026463 1.8812355 2.0675914 2.3404303 2.6153774 2.8339101 3.0163450 3.2132416 3.5878814 3.7143055 4.2565620 4.4592188 4.8104160 5.4521927 5.6125491 5.9632738 6.1256323 6.6584377 6.8037358 7.1328190 7.5440793 7.8242708 8.3763434 8.5992669 9.0437746 9.2938646 9.5616832 10.2483373 10.9683212 11.1541000 11.3192605 11.3784802 11.6233630 12.0398552 12.1927675 12.6890801 13.0466670 13.0863624 13.3583679 13.8616174 14.5113379 15.1632186 15.3675858 15.8428844 15.9093423 17.0893353 17.2942275 17.5147249 17.5550443 17.6887991 17.9994950 18.0545450 18.8843897 19.1927118 19.5037552 19.9507249 20.0549772 20.5379255 20.8235895 21.8075347 22.4129802 22.8242780 23.2227475 23.5529381 23.7996204 23.9844050 24.2899854 25.0639902 25.5956025 25.8005403 26.4005817 26.7799915 27.2590333 27.7272961 28.0356079 28.1550851 28.5221015 28.9591694 29.2175983 29.9400690 30.0733738 30.1620542 30.5923396 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034333 0.0034336 0.0034340 0.0034344 0.0034346 7.0734053 9.9086335 18.9410331 21.4013088 25.7888448 41.6313626 46.6458517 64.1711881 68.1701724 73.8959781 83.1609453 92.9574875 93.7257511 96.8587082 102.2481148 109.1670033 123.6493736 137.4719585 148.9418896 156.1448411 166.1281143 175.6153448 182.8051031 188.5974379 194.6556311 205.6905407 209.2830658 224.0395874 229.3108862 238.1697472 253.5600783 257.2618307 265.1781004 268.7637813 280.2085944 283.2494021 290.0186203 298.2623286 303.7506508 314.2841783 318.4388108 326.5653824 331.0498928 335.7859007 347.6337920 359.6378231 362.6707644 365.3459584 366.3004142 370.2211113 376.7956781 379.1808762 386.8212722 392.2338488 392.8300952 396.8916662 404.2985964 413.6652191 422.8545215 425.6945626 432.2275123 433.1331194 448.9085382 451.5916096 454.4613351 454.9841263 456.7141372 460.7076674 461.4116485 471.8965015 475.7331900 479.5726406 485.0367223 486.3023482 492.1228924 495.5335651 507.1057862 514.0970177 518.7926380 523.3016217 527.0087499 529.7613811 531.8139865 535.1911299 543.6512441 549.3864689 551.5814863 557.9586673 561.9536518 566.9575007 571.8064370 574.9767306 576.2005946 579.9439749 584.3705631 586.9722063 594.1849931 595.5062947 596.3836636 600.6225402 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5546 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2429E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.3260E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0424E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8841E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.6399E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1470 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3941 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4631 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5865 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7956 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8866 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.603 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.881 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.068 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.340 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.615 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.714 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.452 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.613 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.963 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.804 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.133 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.544 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.824 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.599 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.294 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.562 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 0.99996 1.00000 0.99999 1.00003 1.00005 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99995 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99996 1.00001 0.99997 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 99828 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 0.99996 1.00000 0.99999 1.00003 1.00005 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99995 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99996 1.00001 0.99997 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603170113303461401.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603170113303461401.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603170113303461401.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603170113303461401.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 713 First residue number = 26 Last residue number = 115 Number of atoms found = 5546 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2429E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3260E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0424E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8841E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6399E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1470 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3492 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3941 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4631 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5865 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7956 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8866 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.603 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.881 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.340 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.615 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.714 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.452 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.613 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.804 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.133 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.544 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.824 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.599 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.294 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.562 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59 Bfactors> 106 vectors, 16638 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.004243 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 1.309 +/- 3.42 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -1.309 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603170113303461401.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603170113303461401.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.073 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.908 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom 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animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603170113303461401 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603170113303461401.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603170113303461401 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603170113303461401.eigenfacs 2603170113303461401.atom making animated gifs 11 models are in 2603170113303461401.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603170113303461401.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603170113303461401.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603170113303461401.10.pdb 2603170113303461401.11.pdb 2603170113303461401.7.pdb 2603170113303461401.8.pdb 2603170113303461401.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m28.035s user 0m27.821s sys 0m0.201s rm: cannot remove '2603170113303461401.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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