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***  93BM A1  ***

LOGs for ID: 2603171027573532464

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603171027573532464.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603171027573532464.atom to be opened. Openam> File opened: 2603171027573532464.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 357 First residue number = 2 Last residue number = 380 Number of atoms found = 2631 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 132.314064 +/- 9.936064 From: 109.343000 To: 159.046000 = 132.703592 +/- 11.513332 From: 102.671000 To: 159.635000 = 111.503573 +/- 13.020297 From: 86.892000 To: 146.025000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.1081 % Filled. Pdbmat> 968298 non-zero elements. Pdbmat> 105853 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.47 +/- 21.35 Maximum number = 120 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.117060E+06 Pdbmat> Larger element = 511.127 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 357 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603171027573532464.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603171027573532464.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603171027573532464.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2631 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 357 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 10 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 25 Blocpdb> 23 atoms in block 4 Block first atom: 40 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 63 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 82 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 98 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 114 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 133 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 145 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 157 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 172 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 186 Blocpdb> 19 atoms in block 14 Block first atom: 201 Blocpdb> 10 atoms in block 15 Block first atom: 220 Blocpdb> 13 atoms in block 16 Block first atom: 230 Blocpdb> 12 atoms in block 17 Block first atom: 243 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 255 Blocpdb> 11 atoms in block 19 Block first atom: 266 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 277 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 289 Blocpdb> 12 atoms in block 22 Block first atom: 305 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 317 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 333 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 346 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 361 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 377 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 391 Blocpdb> 8 atoms in block 29 Block first atom: 409 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 417 Blocpdb> 10 atoms in block 31 Block first atom: 429 Blocpdb> 14 atoms in block 32 Block first atom: 439 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 453 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 466 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 483 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 499 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 513 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 525 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 541 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 558 Blocpdb> 20 atoms in block 41 Block first atom: 571 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 591 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 610 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 622 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 636 Blocpdb> 13 atoms in block 46 Block first atom: 655 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 668 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 684 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 698 Blocpdb> 12 atoms in block 50 Block first atom: 716 Blocpdb> 12 atoms in block 51 Block first atom: 728 Blocpdb> 10 atoms in block 52 Block first atom: 740 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 750 Blocpdb> 12 atoms in block 54 Block first atom: 762 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 774 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 785 Blocpdb> 9 atoms in block 57 Block first atom: 799 Blocpdb> 10 atoms in block 58 Block first atom: 808 Blocpdb> 13 atoms in block 59 Block first atom: 818 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 831 Blocpdb> 10 atoms in block 61 Block first atom: 843 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 853 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 871 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 885 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 901 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 917 Blocpdb> 13 atoms in block 67 Block first atom: 928 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 941 Blocpdb> 10 atoms in block 69 Block first atom: 957 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 967 Blocpdb> 12 atoms in block 71 Block first atom: 986 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 998 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1009 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1021 Blocpdb> 13 atoms in block 75 Block first atom: 1036 Blocpdb> 12 atoms in block 76 Block first atom: 1049 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1061 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1077 Blocpdb> 18 atoms in block 79 Block first atom: 1096 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1114 Blocpdb> 9 atoms in block 81 Block first atom: 1137 Blocpdb> 13 atoms in block 82 Block first atom: 1146 Blocpdb> 12 atoms in block 83 Block first atom: 1159 Blocpdb> 10 atoms in block 84 Block first atom: 1171 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1181 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1197 Blocpdb> 13 atoms in block 87 Block first atom: 1211 Blocpdb> 13 atoms in block 88 Block first atom: 1224 Blocpdb> 5 atoms in block 89 Block first atom: 1237 Blocpdb> 16 atoms in block 90 Block first atom: 1242 Blocpdb> 19 atoms in block 91 Block first atom: 1258 Blocpdb> 18 atoms in block 92 Block first atom: 1277 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1295 Blocpdb> 14 atoms in block 94 Block first atom: 1310 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1324 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1340 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1355 Blocpdb> 17 atoms in block 98 Block first atom: 1370 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1387 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 1399 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1410 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1430 Blocpdb> 18 atoms in block 103 Block first atom: 1445 Blocpdb> 20 atoms in block 104 Block first atom: 1463 Blocpdb> 12 atoms in block 105 Block first atom: 1483 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1495 Blocpdb> 12 atoms in block 107 Block first atom: 1509 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 1521 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1538 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1554 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1570 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1584 Blocpdb> 11 atoms in block 113 Block first atom: 1597 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 1608 Blocpdb> 19 atoms in block 115 Block first atom: 1616 Blocpdb> 9 atoms in block 116 Block first atom: 1635 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1644 Blocpdb> 17 atoms in block 118 Block first atom: 1663 Blocpdb> 23 atoms in block 119 Block first atom: 1680 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1703 Blocpdb> 20 atoms in block 121 Block first atom: 1722 Blocpdb> 13 atoms in block 122 Block first atom: 1742 Blocpdb> 23 atoms in block 123 Block first atom: 1755 Blocpdb> 11 atoms in block 124 Block first atom: 1778 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1789 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 1804 Blocpdb> 19 atoms in block 127 Block first atom: 1823 Blocpdb> 14 atoms in block 128 Block first atom: 1842 Blocpdb> 20 atoms in block 129 Block first atom: 1856 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 1876 Blocpdb> 14 atoms in block 131 Block first atom: 1889 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 1903 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 1919 Blocpdb> 18 atoms in block 134 Block first atom: 1935 Blocpdb> 13 atoms in block 135 Block first atom: 1953 Blocpdb> 16 atoms in block 136 Block first atom: 1966 Blocpdb> 20 atoms in block 137 Block first atom: 1982 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 2002 Blocpdb> 16 atoms in block 139 Block first atom: 2018 Blocpdb> 17 atoms in block 140 Block first atom: 2034 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2051 Blocpdb> 19 atoms in block 142 Block first atom: 2065 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2084 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2099 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2115 Blocpdb> 12 atoms in block 146 Block first atom: 2134 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2146 Blocpdb> 20 atoms in block 148 Block first atom: 2161 Blocpdb> 17 atoms in block 149 Block first atom: 2181 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2198 Blocpdb> 5 atoms in block 151 Block first atom: 2211 Blocpdb> 14 atoms in block 152 Block first atom: 2216 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2230 Blocpdb> 9 atoms in block 154 Block first atom: 2245 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 2254 Blocpdb> 14 atoms in block 156 Block first atom: 2266 Blocpdb> 18 atoms in block 157 Block first atom: 2280 Blocpdb> 13 atoms in block 158 Block first atom: 2298 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2311 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 2323 Blocpdb> 12 atoms in block 161 Block first atom: 2342 Blocpdb> 15 atoms in block 162 Block first atom: 2354 Blocpdb> 13 atoms in block 163 Block first atom: 2369 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 2382 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2391 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2410 Blocpdb> 18 atoms in block 167 Block first atom: 2425 Blocpdb> 14 atoms in block 168 Block first atom: 2443 Blocpdb> 15 atoms in block 169 Block first atom: 2457 Blocpdb> 20 atoms in block 170 Block first atom: 2472 Blocpdb> 13 atoms in block 171 Block first atom: 2492 Blocpdb> 11 atoms in block 172 Block first atom: 2505 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 2516 Blocpdb> 9 atoms in block 174 Block first atom: 2530 Blocpdb> 14 atoms in block 175 Block first atom: 2539 Blocpdb> 15 atoms in block 176 Block first atom: 2553 Blocpdb> 16 atoms in block 177 Block first atom: 2568 Blocpdb> 18 atoms in block 178 Block first atom: 2584 Blocpdb> 19 atoms in block 179 Block first atom: 2602 Blocpdb> 11 atoms in block 180 Block first atom: 2620 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 968478 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7893 Prepmat> Matrix trace = 2117060.0000 Prepmat> Last element read: 7893 7893 216.0110 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14347 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2631 RTB> Total mass = 2631.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2631 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 247846.1072 RTB> 67248 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67248 Diagstd> Projected matrix trace = 247846.1072 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 247846.1072 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.2846240 1.7682326 2.2397354 3.8296173 4.7619897 5.5639226 5.8927973 6.7002262 7.6859712 8.2636046 8.8533681 9.5539293 10.0387449 10.6926844 12.2282574 12.2774275 12.4332272 13.0031012 14.1283467 14.3441939 15.2372286 16.1028830 16.8226334 17.1734214 17.6755714 18.1709047 18.5796669 19.5248902 20.3837283 20.7341702 21.6915632 22.5314494 23.6012012 23.9772654 24.5442894 24.8441066 25.2682307 25.6917302 26.8366101 27.6422158 28.2689852 29.2716399 29.7363341 30.6847379 30.8506591 31.7414052 32.0698933 32.8569899 33.6638620 34.9404944 35.5277592 35.8787993 36.4837757 37.8693279 38.3762372 39.0753846 39.7473254 40.2910054 41.1211036 41.6788557 42.7333159 42.8504870 43.2342716 44.2123788 44.5477801 45.3153905 46.1077912 46.1928570 47.7505211 48.6503152 48.7970292 49.4021529 49.6794613 50.3428259 50.7485638 51.3562363 51.6328357 52.0690528 53.0832243 53.6353443 54.0112678 54.8146168 55.1215087 55.9886909 57.1015784 57.4123679 57.6136978 58.3185527 58.9133638 59.9801181 60.5830023 60.8827862 61.0212337 61.7910430 62.8029553 63.4270697 63.6383103 63.9575302 64.5645720 65.5193324 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034329 0.0034330 0.0034339 0.0034342 0.0034346 123.0788122 144.3992628 162.5150708 212.5068679 236.9678926 256.1449621 263.6064485 281.0865166 301.0541770 312.1620078 323.1093607 335.6497215 344.0606366 355.0901746 379.7323234 380.4950139 382.9016304 391.5784217 408.1698786 411.2759874 423.8852182 435.7597356 445.3918544 450.0115840 456.5433402 462.8961358 468.0737024 479.8324122 490.2720004 494.4684765 505.7556057 515.4539179 527.5484285 531.7348258 537.9854267 541.2612954 545.8617922 550.4171494 562.5473833 570.9284791 577.3649153 587.5147941 592.1598998 601.5288889 603.1530157 611.7984258 614.9559926 622.4567306 630.0532403 641.8888081 647.2606255 650.4504684 655.9113842 668.2501717 672.7078183 678.8079356 684.6194537 689.2858011 696.3501301 701.0567473 709.8695985 710.8421326 714.0183175 722.0499153 724.7835270 731.0012909 737.3648637 738.0447451 750.3853349 757.4223382 758.5635523 763.2524691 765.3916485 770.4848002 773.5834296 778.2011612 780.2940029 783.5832052 791.1774989 795.2813842 798.0635324 803.9767164 806.2241967 812.5412853 820.5769944 822.8070610 824.2484810 829.2751455 833.4934484 841.0056984 845.2217731 847.3104051 848.2732502 853.6071483 860.5682530 864.8336995 866.2726440 868.4426074 872.5542104 878.9820617 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2631 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.285 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.768 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.240 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.830 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.762 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.564 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.893 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.700 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.686 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.853 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.52 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 47358 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603171027573532464.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603171027573532464.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603171027573532464.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603171027573532464.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 357 First residue number = 2 Last residue number = 380 Number of atoms found = 2631 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.285 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.768 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.240 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.830 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.564 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.893 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.700 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.853 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.52 Bfactors> 106 vectors, 7893 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.285000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.538 for 357 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.04 Bfactors> = 62.492 +/- 27.51 Bfactors> Shiftng-fct= 62.459 Bfactors> Scaling-fct= 632.724 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603171027573532464.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603171027573532464.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.8 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Chkmod> That is: 2631 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171027573532464 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom making animated gifs 11 models are in 2603171027573532464.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171027573532464.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171027573532464.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171027573532464 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171027573532464.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171027573532464 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171027573532464.eigenfacs 2603171027573532464.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171027573532464.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171027573532464.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603171027573532464.10.pdb 2603171027573532464.11.pdb 2603171027573532464.7.pdb 2603171027573532464.8.pdb 2603171027573532464.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m19.062s user 0m18.935s sys 0m0.117s rm: cannot remove '2603171027573532464.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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