CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  93BM A2  ***

LOGs for ID: 2603171029343533908

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603171029343533908.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603171029343533908.atom to be opened. Openam> File opened: 2603171029343533908.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 357 First residue number = 2 Last residue number = 380 Number of atoms found = 2625 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 132.230852 +/- 9.944498 From: 109.343000 To: 159.046000 = 132.779725 +/- 11.524961 From: 102.671000 To: 159.635000 = 111.509320 +/- 12.997104 From: 86.892000 To: 146.025000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.1070 % Filled. Pdbmat> 963546 non-zero elements. Pdbmat> 105329 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.25 +/- 21.40 Maximum number = 120 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.106580E+06 Pdbmat> Larger element = 511.127 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 357 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603171029343533908.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603171029343533908.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603171029343533908.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2625 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 357 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 10 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 12 atoms in block 3 Block first atom: 25 Blocpdb> 20 atoms in block 4 Block first atom: 37 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 57 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 76 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 92 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 108 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 127 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 139 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 151 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 166 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 180 Blocpdb> 19 atoms in block 14 Block first atom: 195 Blocpdb> 10 atoms in block 15 Block first atom: 214 Blocpdb> 13 atoms in block 16 Block first atom: 224 Blocpdb> 12 atoms in block 17 Block first atom: 237 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 249 Blocpdb> 11 atoms in block 19 Block first atom: 260 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 271 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 283 Blocpdb> 12 atoms in block 22 Block first atom: 299 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 311 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 327 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 340 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 355 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 371 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 385 Blocpdb> 8 atoms in block 29 Block first atom: 403 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 411 Blocpdb> 10 atoms in block 31 Block first atom: 423 Blocpdb> 14 atoms in block 32 Block first atom: 433 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 447 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 460 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 477 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 493 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 507 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 519 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 535 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 552 Blocpdb> 20 atoms in block 41 Block first atom: 565 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 585 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 604 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 616 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 630 Blocpdb> 13 atoms in block 46 Block first atom: 649 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 662 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 678 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 692 Blocpdb> 12 atoms in block 50 Block first atom: 710 Blocpdb> 12 atoms in block 51 Block first atom: 722 Blocpdb> 10 atoms in block 52 Block first atom: 734 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 744 Blocpdb> 12 atoms in block 54 Block first atom: 756 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 768 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 779 Blocpdb> 9 atoms in block 57 Block first atom: 793 Blocpdb> 10 atoms in block 58 Block first atom: 802 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 812 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 824 Blocpdb> 10 atoms in block 61 Block first atom: 836 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 846 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 864 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 878 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 894 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 910 Blocpdb> 13 atoms in block 67 Block first atom: 921 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 934 Blocpdb> 10 atoms in block 69 Block first atom: 950 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 960 Blocpdb> 12 atoms in block 71 Block first atom: 979 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 991 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1002 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1014 Blocpdb> 13 atoms in block 75 Block first atom: 1029 Blocpdb> 12 atoms in block 76 Block first atom: 1042 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1054 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1070 Blocpdb> 18 atoms in block 79 Block first atom: 1089 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1107 Blocpdb> 9 atoms in block 81 Block first atom: 1130 Blocpdb> 13 atoms in block 82 Block first atom: 1139 Blocpdb> 12 atoms in block 83 Block first atom: 1152 Blocpdb> 10 atoms in block 84 Block first atom: 1164 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1174 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1190 Blocpdb> 12 atoms in block 87 Block first atom: 1204 Blocpdb> 13 atoms in block 88 Block first atom: 1216 Blocpdb> 5 atoms in block 89 Block first atom: 1229 Blocpdb> 16 atoms in block 90 Block first atom: 1234 Blocpdb> 19 atoms in block 91 Block first atom: 1250 Blocpdb> 18 atoms in block 92 Block first atom: 1269 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1287 Blocpdb> 12 atoms in block 94 Block first atom: 1302 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1314 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1330 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1345 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1360 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1376 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 1388 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1399 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1419 Blocpdb> 18 atoms in block 103 Block first atom: 1434 Blocpdb> 20 atoms in block 104 Block first atom: 1452 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 1472 Blocpdb> 21 atoms in block 106 Block first atom: 1485 Blocpdb> 12 atoms in block 107 Block first atom: 1506 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 1518 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1535 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1551 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1567 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1581 Blocpdb> 11 atoms in block 113 Block first atom: 1594 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 1605 Blocpdb> 19 atoms in block 115 Block first atom: 1613 Blocpdb> 9 atoms in block 116 Block first atom: 1632 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1641 Blocpdb> 17 atoms in block 118 Block first atom: 1660 Blocpdb> 23 atoms in block 119 Block first atom: 1677 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1700 Blocpdb> 20 atoms in block 121 Block first atom: 1719 Blocpdb> 13 atoms in block 122 Block first atom: 1739 Blocpdb> 23 atoms in block 123 Block first atom: 1752 Blocpdb> 11 atoms in block 124 Block first atom: 1775 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1786 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 1801 Blocpdb> 19 atoms in block 127 Block first atom: 1820 Blocpdb> 14 atoms in block 128 Block first atom: 1839 Blocpdb> 20 atoms in block 129 Block first atom: 1853 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 1873 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 1886 Blocpdb> 15 atoms in block 132 Block first atom: 1901 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 1916 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 1932 Blocpdb> 13 atoms in block 135 Block first atom: 1947 Blocpdb> 16 atoms in block 136 Block first atom: 1960 Blocpdb> 21 atoms in block 137 Block first atom: 1976 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 1997 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2013 Blocpdb> 17 atoms in block 140 Block first atom: 2028 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2045 Blocpdb> 19 atoms in block 142 Block first atom: 2059 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2078 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2093 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2109 Blocpdb> 12 atoms in block 146 Block first atom: 2128 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2140 Blocpdb> 20 atoms in block 148 Block first atom: 2155 Blocpdb> 17 atoms in block 149 Block first atom: 2175 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2192 Blocpdb> 5 atoms in block 151 Block first atom: 2205 Blocpdb> 14 atoms in block 152 Block first atom: 2210 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2224 Blocpdb> 9 atoms in block 154 Block first atom: 2239 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 2248 Blocpdb> 14 atoms in block 156 Block first atom: 2260 Blocpdb> 18 atoms in block 157 Block first atom: 2274 Blocpdb> 13 atoms in block 158 Block first atom: 2292 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2305 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 2317 Blocpdb> 12 atoms in block 161 Block first atom: 2336 Blocpdb> 15 atoms in block 162 Block first atom: 2348 Blocpdb> 13 atoms in block 163 Block first atom: 2363 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 2376 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2385 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2404 Blocpdb> 18 atoms in block 167 Block first atom: 2419 Blocpdb> 14 atoms in block 168 Block first atom: 2437 Blocpdb> 15 atoms in block 169 Block first atom: 2451 Blocpdb> 20 atoms in block 170 Block first atom: 2466 Blocpdb> 13 atoms in block 171 Block first atom: 2486 Blocpdb> 11 atoms in block 172 Block first atom: 2499 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 2510 Blocpdb> 9 atoms in block 174 Block first atom: 2524 Blocpdb> 14 atoms in block 175 Block first atom: 2533 Blocpdb> 15 atoms in block 176 Block first atom: 2547 Blocpdb> 16 atoms in block 177 Block first atom: 2562 Blocpdb> 18 atoms in block 178 Block first atom: 2578 Blocpdb> 19 atoms in block 179 Block first atom: 2596 Blocpdb> 11 atoms in block 180 Block first atom: 2614 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 963726 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7875 Prepmat> Matrix trace = 2106580.0000 Prepmat> Last element read: 7875 7875 216.0110 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14350 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2625 RTB> Total mass = 2625.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2625 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 247052.3838 RTB> 67140 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67140 Diagstd> Projected matrix trace = 247052.3838 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 247052.3838 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.2805673 1.7747923 2.2059989 3.7804942 4.6691947 5.3663656 5.7731550 6.6196639 7.5787241 7.8383705 8.7364994 9.4003829 9.7170082 9.9816346 11.0337183 12.1272647 12.3646280 12.7063922 12.9961453 13.6061414 14.1510321 14.9870805 15.7950077 16.5337270 17.0701145 17.1067397 17.6008309 18.1033274 20.1361319 20.3914331 21.3185393 21.5984089 22.3170768 23.1336535 24.0357070 24.3690606 24.6694925 24.9915478 25.6671527 27.6844197 28.1838666 28.4986095 29.3140733 29.5736450 30.3701443 30.6796708 31.6295818 32.2119740 33.0199269 34.2988866 34.9000598 35.5794641 36.1378208 37.2030958 37.8324891 38.1656186 39.3507744 39.5747242 40.6818308 40.9726449 41.4425022 42.4825059 42.9029924 43.4926200 44.4000260 45.0196326 45.7191912 45.9893800 46.4645150 47.9840834 48.6773372 48.8589169 49.4854358 49.7929226 50.5330141 50.7520694 51.4679151 51.7031828 52.0010181 52.5837908 53.2454324 53.8555976 54.7129663 55.9044406 56.0905264 57.0108109 57.6227766 58.1684486 58.2596764 58.9968443 59.0821068 59.8830070 60.2912011 60.5867136 61.3598018 62.5344512 63.3579179 63.5665136 63.7425202 65.4505319 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034339 0.0034343 0.0034344 0.0034353 0.0034355 122.8843223 144.6668595 161.2864662 211.1395382 234.6476851 251.5564208 260.9167070 279.3915383 298.9464000 304.0242132 320.9696768 332.9415926 338.5022536 343.0805630 360.7083753 378.1609755 381.8438560 387.0850595 391.4736717 400.5555648 408.4974395 420.3913776 431.5739285 441.5507856 448.6560185 449.1370726 455.5770793 462.0345831 487.2852935 490.3646505 501.3880771 504.6684552 512.9959476 522.2968337 532.3824510 536.0615702 539.3558431 542.8650190 550.1538135 571.3641566 576.4950304 579.7050927 587.9404828 590.5378079 598.4373732 601.4792202 610.7198063 616.3167203 623.9981958 635.9680409 641.5172900 647.7314460 652.7941599 662.3458519 667.9250595 670.8592821 681.1957378 683.1313694 692.6207925 695.0919843 699.0661362 707.7833525 711.2775028 716.1484650 723.5805636 728.6118887 734.2510047 736.4174271 740.2117666 752.2182776 757.6326581 759.0444302 763.8955498 766.2651768 771.9388200 773.6101479 779.0468363 780.8253771 783.0711131 787.4468066 792.3853897 796.9126208 803.2309064 811.9297097 813.2798987 819.9245484 824.3134214 828.2072361 828.8564362 834.0837715 834.6862644 840.3246054 843.1837890 845.2476621 850.6232601 858.7266706 864.3621251 865.7838424 866.9816296 878.5204399 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2625 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.206 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.780 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.669 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.366 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.773 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.620 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.579 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.838 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.400 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.982 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.45 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99996 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00004 0.99999 1.00003 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 47250 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99996 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00004 0.99999 1.00003 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603171029343533908.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603171029343533908.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603171029343533908.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603171029343533908.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 357 First residue number = 2 Last residue number = 380 Number of atoms found = 2625 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.206 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.780 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.669 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.366 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.773 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.620 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.579 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.838 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.400 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.982 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.45 Bfactors> 106 vectors, 7875 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.281000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.497 for 357 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.034 +/- 0.05 Bfactors> = 61.145 +/- 29.19 Bfactors> Shiftng-fct= 61.111 Bfactors> Scaling-fct= 633.492 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603171029343533908.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603171029343533908.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5 Chkmod> 106 vectors, 7875 coordinates in file. Chkmod> That is: 2625 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7190 0.0034 0.7927 0.0034 0.9723 0.0034 0.7367 0.0034 0.7954 0.0034 0.8153 122.8998 0.3334 144.6691 0.4188 161.2796 0.3867 211.1167 0.4989 234.6327 0.2502 251.5371 0.2825 260.9020 0.1859 279.3866 0.3068 298.9390 0.3759 304.0040 0.1102 320.9467 0.2942 332.9205 0.2124 338.4876 0.3389 343.0721 0.1896 360.6321 0.1034 378.1874 0.4121 381.7560 0.4816 387.1234 0.4901 391.5149 0.3004 400.5952 0.1108 408.4650 0.4542 420.4143 0.3917 431.6236 0.2790 441.4821 0.2899 448.6353 0.4000 449.1606 0.4505 455.5468 0.4489 461.9723 0.4157 487.3112 0.4389 490.3264 0.3952 501.3837 0.5461 504.6654 0.2219 513.0075 0.4889 522.2332 0.2679 532.4071 0.2485 536.0489 0.2545 539.3382 0.4803 542.8249 0.3708 550.1607 0.4641 571.2940 0.3072 576.4307 0.4451 579.6943 0.2370 587.8744 0.5683 590.4761 0.5306 598.4103 0.3963 601.4566 0.4185 610.6976 0.4627 616.2714 0.4787 623.9721 0.3447 635.9511 0.5243 641.4892 0.5505 647.7085 0.6012 652.7858 0.4533 662.2899 0.5312 667.8744 0.4207 670.8690 0.4671 681.1598 0.5442 683.0613 0.5177 692.5755 0.4169 695.0397 0.1291 699.0150 0.4809 707.7321 0.2833 711.2222 0.4704 716.0962 0.5141 723.5493 0.5583 728.5836 0.4954 734.2260 0.4140 736.3908 0.4068 740.1440 0.4367 752.1540 0.3604 757.6209 0.5840 759.0203 0.3199 763.8980 0.4283 766.2098 0.3567 771.8827 0.3771 773.5612 0.3367 779.0292 0.3627 780.7678 0.3867 783.0298 0.5163 787.3846 0.2712 792.3854 0.4524 796.9110 0.4933 803.1747 0.5246 811.8626 0.3902 813.2412 0.4199 819.8835 0.4722 824.2582 0.4228 828.1827 0.5702 828.8232 0.4481 834.0703 0.4017 834.6356 0.2766 840.2674 0.4824 843.1392 0.4239 845.2343 0.4685 850.5881 0.4719 858.6592 0.3954 864.3392 0.5237 865.7704 0.4824 866.9273 0.4566 878.4792 0.3540 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171029343533908 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom making animated gifs 11 models are in 2603171029343533908.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171029343533908 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom making animated gifs 11 models are in 2603171029343533908.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171029343533908 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom making animated gifs 11 models are in 2603171029343533908.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171029343533908 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom making animated gifs 11 models are in 2603171029343533908.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171029343533908 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603171029343533908.eigenfacs 2603171029343533908.atom making animated gifs 11 models are in 2603171029343533908.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171029343533908.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603171029343533908.10.pdb 2603171029343533908.11.pdb 2603171029343533908.7.pdb 2603171029343533908.8.pdb 2603171029343533908.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m24.368s user 0m24.248s sys 0m0.105s rm: cannot remove '2603171029343533908.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.