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***  93BM A3  ***

LOGs for ID: 2603171030083534856

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603171030083534856.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603171030083534856.atom to be opened. Openam> File opened: 2603171030083534856.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 357 First residue number = 2 Last residue number = 380 Number of atoms found = 2623 Mean number per residue = 7.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 132.294260 +/- 9.934467 From: 109.343000 To: 159.046000 = 132.739222 +/- 11.510258 From: 102.671000 To: 159.635000 = 111.517743 +/- 13.017113 From: 86.771000 To: 146.025000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.1072 % Filled. Pdbmat> 962117 non-zero elements. Pdbmat> 105171 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.19 +/- 21.32 Maximum number = 120 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.103420E+06 Pdbmat> Larger element = 511.120 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 357 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603171030083534856.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603171030083534856.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603171030083534856.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2623 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 357 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 10 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 25 Blocpdb> 20 atoms in block 4 Block first atom: 40 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 79 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 95 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 111 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 130 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 142 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 154 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 169 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 183 Blocpdb> 19 atoms in block 14 Block first atom: 198 Blocpdb> 10 atoms in block 15 Block first atom: 217 Blocpdb> 13 atoms in block 16 Block first atom: 227 Blocpdb> 12 atoms in block 17 Block first atom: 240 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 252 Blocpdb> 11 atoms in block 19 Block first atom: 263 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 274 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 286 Blocpdb> 12 atoms in block 22 Block first atom: 302 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 314 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 330 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 343 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 358 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 374 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 388 Blocpdb> 8 atoms in block 29 Block first atom: 406 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 414 Blocpdb> 10 atoms in block 31 Block first atom: 426 Blocpdb> 14 atoms in block 32 Block first atom: 436 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 450 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 463 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 480 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 496 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 510 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 522 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 538 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 555 Blocpdb> 20 atoms in block 41 Block first atom: 568 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 588 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 607 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 619 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 633 Blocpdb> 13 atoms in block 46 Block first atom: 652 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 665 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 681 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 695 Blocpdb> 12 atoms in block 50 Block first atom: 713 Blocpdb> 12 atoms in block 51 Block first atom: 725 Blocpdb> 10 atoms in block 52 Block first atom: 737 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 747 Blocpdb> 12 atoms in block 54 Block first atom: 759 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 771 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 782 Blocpdb> 9 atoms in block 57 Block first atom: 796 Blocpdb> 10 atoms in block 58 Block first atom: 805 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 815 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 827 Blocpdb> 10 atoms in block 61 Block first atom: 839 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 849 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 867 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 881 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 897 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 913 Blocpdb> 13 atoms in block 67 Block first atom: 924 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 937 Blocpdb> 10 atoms in block 69 Block first atom: 953 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 963 Blocpdb> 12 atoms in block 71 Block first atom: 982 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 994 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1005 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1017 Blocpdb> 13 atoms in block 75 Block first atom: 1032 Blocpdb> 12 atoms in block 76 Block first atom: 1045 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1057 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1073 Blocpdb> 18 atoms in block 79 Block first atom: 1092 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1110 Blocpdb> 9 atoms in block 81 Block first atom: 1133 Blocpdb> 13 atoms in block 82 Block first atom: 1142 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 1155 Blocpdb> 10 atoms in block 84 Block first atom: 1166 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1176 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1192 Blocpdb> 13 atoms in block 87 Block first atom: 1206 Blocpdb> 13 atoms in block 88 Block first atom: 1219 Blocpdb> 5 atoms in block 89 Block first atom: 1232 Blocpdb> 16 atoms in block 90 Block first atom: 1237 Blocpdb> 19 atoms in block 91 Block first atom: 1253 Blocpdb> 18 atoms in block 92 Block first atom: 1272 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1290 Blocpdb> 12 atoms in block 94 Block first atom: 1305 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1317 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1333 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1348 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1363 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1379 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 1391 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1402 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1422 Blocpdb> 18 atoms in block 103 Block first atom: 1437 Blocpdb> 20 atoms in block 104 Block first atom: 1455 Blocpdb> 12 atoms in block 105 Block first atom: 1475 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1487 Blocpdb> 12 atoms in block 107 Block first atom: 1501 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 1513 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1530 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1546 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1562 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1576 Blocpdb> 11 atoms in block 113 Block first atom: 1589 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 1600 Blocpdb> 19 atoms in block 115 Block first atom: 1608 Blocpdb> 9 atoms in block 116 Block first atom: 1627 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1636 Blocpdb> 17 atoms in block 118 Block first atom: 1655 Blocpdb> 23 atoms in block 119 Block first atom: 1672 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1695 Blocpdb> 20 atoms in block 121 Block first atom: 1714 Blocpdb> 13 atoms in block 122 Block first atom: 1734 Blocpdb> 23 atoms in block 123 Block first atom: 1747 Blocpdb> 11 atoms in block 124 Block first atom: 1770 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1781 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 1796 Blocpdb> 19 atoms in block 127 Block first atom: 1815 Blocpdb> 14 atoms in block 128 Block first atom: 1834 Blocpdb> 20 atoms in block 129 Block first atom: 1848 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 1868 Blocpdb> 14 atoms in block 131 Block first atom: 1881 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 1895 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 1911 Blocpdb> 18 atoms in block 134 Block first atom: 1927 Blocpdb> 13 atoms in block 135 Block first atom: 1945 Blocpdb> 16 atoms in block 136 Block first atom: 1958 Blocpdb> 20 atoms in block 137 Block first atom: 1974 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 1994 Blocpdb> 16 atoms in block 139 Block first atom: 2010 Blocpdb> 17 atoms in block 140 Block first atom: 2026 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2043 Blocpdb> 19 atoms in block 142 Block first atom: 2057 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2076 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2091 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2107 Blocpdb> 12 atoms in block 146 Block first atom: 2126 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2138 Blocpdb> 20 atoms in block 148 Block first atom: 2153 Blocpdb> 17 atoms in block 149 Block first atom: 2173 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2190 Blocpdb> 5 atoms in block 151 Block first atom: 2203 Blocpdb> 14 atoms in block 152 Block first atom: 2208 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2222 Blocpdb> 9 atoms in block 154 Block first atom: 2237 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 2246 Blocpdb> 14 atoms in block 156 Block first atom: 2258 Blocpdb> 18 atoms in block 157 Block first atom: 2272 Blocpdb> 13 atoms in block 158 Block first atom: 2290 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2303 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 2315 Blocpdb> 12 atoms in block 161 Block first atom: 2334 Blocpdb> 15 atoms in block 162 Block first atom: 2346 Blocpdb> 13 atoms in block 163 Block first atom: 2361 Blocpdb> 9 atoms in block 164 Block first atom: 2374 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2383 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2402 Blocpdb> 18 atoms in block 167 Block first atom: 2417 Blocpdb> 14 atoms in block 168 Block first atom: 2435 Blocpdb> 15 atoms in block 169 Block first atom: 2449 Blocpdb> 20 atoms in block 170 Block first atom: 2464 Blocpdb> 13 atoms in block 171 Block first atom: 2484 Blocpdb> 11 atoms in block 172 Block first atom: 2497 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 2508 Blocpdb> 9 atoms in block 174 Block first atom: 2522 Blocpdb> 14 atoms in block 175 Block first atom: 2531 Blocpdb> 15 atoms in block 176 Block first atom: 2545 Blocpdb> 16 atoms in block 177 Block first atom: 2560 Blocpdb> 18 atoms in block 178 Block first atom: 2576 Blocpdb> 19 atoms in block 179 Block first atom: 2594 Blocpdb> 11 atoms in block 180 Block first atom: 2612 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 962297 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7869 Prepmat> Matrix trace = 2103420.0000 Prepmat> Last element read: 7869 7869 216.0110 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14349 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2623 RTB> Total mass = 2623.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2623 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 246911.7614 RTB> 67176 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67176 Diagstd> Projected matrix trace = 246911.7614 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 246911.7614 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.2744015 1.7667336 2.2054618 3.7715444 4.6705462 5.3691738 5.8396035 6.6442733 7.5907185 8.1003130 8.7608942 9.4146863 9.9355772 10.1495074 12.0978941 12.2352157 12.3305261 12.9132155 13.9622003 14.0792587 15.0408027 15.9053490 16.6250643 16.9221062 17.3419876 17.9303261 18.1592716 18.8680697 20.1815623 20.4906993 21.3608565 21.8388152 22.5834015 23.4228772 24.0242917 24.4054019 24.5628840 25.3691445 26.0572809 27.5160841 28.0908437 29.1406323 29.5247107 29.9713714 30.6156709 30.9154416 31.9351640 31.9911588 32.6408010 34.3792039 34.8831136 35.4623513 36.1304094 37.5210238 37.9416871 38.2732254 39.3119972 39.8227445 40.5981175 41.5031563 41.9276117 42.5229026 42.5508165 43.6790707 44.2682726 44.8935300 45.8045700 45.9605834 46.3443705 48.1698705 48.4818333 48.9551005 49.3573627 49.6626098 50.3789953 50.7989259 51.1255079 51.2953177 52.0671520 52.8159407 53.2326962 53.8603476 54.3974300 55.7109392 56.3227708 57.1911790 57.2380127 58.0200626 58.4360671 59.2021658 59.9810244 60.5082440 60.7162808 61.3846218 62.3825019 62.6573007 62.9557718 63.6576396 63.9443346 65.1352994 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034332 0.0034337 0.0034338 0.0034344 0.0034346 0.0034359 122.5881313 144.3380447 161.2668310 210.8894682 234.6816412 251.6222329 262.4139760 279.9103929 299.1828696 309.0624051 321.4174845 333.1947940 342.2881233 345.9535275 377.7027697 379.8403478 381.3169269 390.2226557 405.7627849 407.4601819 421.1441646 433.0787570 442.7687350 446.7067232 452.2147419 459.8216061 462.7479379 471.6925497 487.8346805 491.5567574 501.8854571 507.4693495 516.0478326 525.5516467 532.2560129 536.4611327 538.1891762 546.9507108 554.3190803 569.6244133 575.5428618 586.1985852 590.0490365 594.4955226 600.8515295 603.7859561 613.6628824 614.2006420 620.4055637 636.7122245 641.3615227 646.6645357 652.7272168 665.1699488 668.8882996 671.8043505 680.8600219 685.2686657 691.9078029 699.5775160 703.1457280 708.1197885 708.3521713 717.6818697 722.5061828 727.5907316 734.9362780 736.1868345 739.2541546 753.6731081 756.1096783 759.7911899 762.9063915 765.2618255 770.7615318 773.9671807 776.4510795 777.7394742 783.5689024 789.1831243 792.2906159 796.9477637 800.9113926 810.5233308 814.9618633 821.2205436 821.5567227 827.1501959 830.1102377 835.5339051 841.0120525 844.7001183 846.1509776 850.7952812 857.6827483 859.5697454 861.6146141 866.4041935 868.3530148 876.4022568 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2623 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.274 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.772 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.936 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.14 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 47214 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603171030083534856.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603171030083534856.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603171030083534856.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603171030083534856.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 357 First residue number = 2 Last residue number = 380 Number of atoms found = 2623 Mean number per residue = 7.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.274 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.767 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.772 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.936 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.14 Bfactors> 106 vectors, 7869 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.274000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.516 for 357 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.034 +/- 0.04 Bfactors> = 62.050 +/- 27.83 Bfactors> Shiftng-fct= 62.016 Bfactors> Scaling-fct= 619.421 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603171030083534856.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603171030083534856.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1 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Chkmod> That is: 2623 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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DQ=-80 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171030083534856.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171030083534856 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom making animated gifs 11 models are in 2603171030083534856.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171030083534856.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171030083534856.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171030083534856 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171030083534856.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603171030083534856 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603171030083534856.eigenfacs 2603171030083534856.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603171030083534856.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603171030083534856.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603171030083534856.10.pdb 2603171030083534856.11.pdb 2603171030083534856.7.pdb 2603171030083534856.8.pdb 2603171030083534856.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m29.163s user 0m29.023s sys 0m0.130s rm: cannot remove '2603171030083534856.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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