***  93BM A3  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603171030083534856.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603171030083534856.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603171030083534856.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 357
First residue number = 2
Last residue number = 380
Number of atoms found = 2623
Mean number per residue = 7.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 132.294260 +/- 9.934467 From: 109.343000 To: 159.046000
= 132.739222 +/- 11.510258 From: 102.671000 To: 159.635000
= 111.517743 +/- 13.017113 From: 86.771000 To: 146.025000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.1072 % Filled.
Pdbmat> 962117 non-zero elements.
Pdbmat> 105171 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.19 +/- 21.32
Maximum number = 120
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 2.103420E+06
Pdbmat> Larger element = 511.120
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
357 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603171030083534856.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603171030083534856.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603171030083534856.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2623 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 357 residues.
Blocpdb> 14 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 10 atoms in block 2
Block first atom: 15
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 25
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 40
Blocpdb> 19 atoms in block 5
Block first atom: 60
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 79
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 95
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 111
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 130
Blocpdb> 12 atoms in block 10
Block first atom: 142
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 154
Blocpdb> 14 atoms in block 12
Block first atom: 169
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 183
Blocpdb> 19 atoms in block 14
Block first atom: 198
Blocpdb> 10 atoms in block 15
Block first atom: 217
Blocpdb> 13 atoms in block 16
Block first atom: 227
Blocpdb> 12 atoms in block 17
Block first atom: 240
Blocpdb> 11 atoms in block 18
Block first atom: 252
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 263
Blocpdb> 12 atoms in block 20
Block first atom: 274
Blocpdb> 16 atoms in block 21
Block first atom: 286
Blocpdb> 12 atoms in block 22
Block first atom: 302
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 314
Blocpdb> 13 atoms in block 24
Block first atom: 330
Blocpdb> 15 atoms in block 25
Block first atom: 343
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 358
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 374
Blocpdb> 18 atoms in block 28
Block first atom: 388
Blocpdb> 8 atoms in block 29
Block first atom: 406
Blocpdb> 12 atoms in block 30
Block first atom: 414
Blocpdb> 10 atoms in block 31
Block first atom: 426
Blocpdb> 14 atoms in block 32
Block first atom: 436
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 450
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 463
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 480
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 496
Blocpdb> 12 atoms in block 37
Block first atom: 510
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 522
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 538
Blocpdb> 13 atoms in block 40
Block first atom: 555
Blocpdb> 20 atoms in block 41
Block first atom: 568
Blocpdb> 19 atoms in block 42
Block first atom: 588
Blocpdb> 12 atoms in block 43
Block first atom: 607
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 619
Blocpdb> 19 atoms in block 45
Block first atom: 633
Blocpdb> 13 atoms in block 46
Block first atom: 652
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 665
Blocpdb> 14 atoms in block 48
Block first atom: 681
Blocpdb> 18 atoms in block 49
Block first atom: 695
Blocpdb> 12 atoms in block 50
Block first atom: 713
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 725
Blocpdb> 10 atoms in block 52
Block first atom: 737
Blocpdb> 12 atoms in block 53
Block first atom: 747
Blocpdb> 12 atoms in block 54
Block first atom: 759
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 771
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 782
Blocpdb> 9 atoms in block 57
Block first atom: 796
Blocpdb> 10 atoms in block 58
Block first atom: 805
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 815
Blocpdb> 12 atoms in block 60
Block first atom: 827
Blocpdb> 10 atoms in block 61
Block first atom: 839
Blocpdb> 18 atoms in block 62
Block first atom: 849
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 867
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 881
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 897
Blocpdb> 11 atoms in block 66
Block first atom: 913
Blocpdb> 13 atoms in block 67
Block first atom: 924
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 937
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 953
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 963
Blocpdb> 12 atoms in block 71
Block first atom: 982
Blocpdb> 11 atoms in block 72
Block first atom: 994
Blocpdb> 12 atoms in block 73
Block first atom: 1005
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1017
Blocpdb> 13 atoms in block 75
Block first atom: 1032
Blocpdb> 12 atoms in block 76
Block first atom: 1045
Blocpdb> 16 atoms in block 77
Block first atom: 1057
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1073
Blocpdb> 18 atoms in block 79
Block first atom: 1092
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 1110
Blocpdb> 9 atoms in block 81
Block first atom: 1133
Blocpdb> 13 atoms in block 82
Block first atom: 1142
Blocpdb> 11 atoms in block 83
Block first atom: 1155
Blocpdb> 10 atoms in block 84
Block first atom: 1166
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1176
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1192
Blocpdb> 13 atoms in block 87
Block first atom: 1206
Blocpdb> 13 atoms in block 88
Block first atom: 1219
Blocpdb> 5 atoms in block 89
Block first atom: 1232
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1237
Blocpdb> 19 atoms in block 91
Block first atom: 1253
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 1272
Blocpdb> 15 atoms in block 93
Block first atom: 1290
Blocpdb> 12 atoms in block 94
Block first atom: 1305
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1317
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1333
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1348
Blocpdb> 16 atoms in block 98
Block first atom: 1363
Blocpdb> 12 atoms in block 99
Block first atom: 1379
Blocpdb> 11 atoms in block 100
Block first atom: 1391
Blocpdb> 20 atoms in block 101
Block first atom: 1402
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1422
Blocpdb> 18 atoms in block 103
Block first atom: 1437
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 1455
Blocpdb> 12 atoms in block 105
Block first atom: 1475
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1487
Blocpdb> 12 atoms in block 107
Block first atom: 1501
Blocpdb> 17 atoms in block 108
Block first atom: 1513
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1530
Blocpdb> 16 atoms in block 110
Block first atom: 1546
Blocpdb> 14 atoms in block 111
Block first atom: 1562
Blocpdb> 13 atoms in block 112
Block first atom: 1576
Blocpdb> 11 atoms in block 113
Block first atom: 1589
Blocpdb> 8 atoms in block 114
Block first atom: 1600
Blocpdb> 19 atoms in block 115
Block first atom: 1608
Blocpdb> 9 atoms in block 116
Block first atom: 1627
Blocpdb> 19 atoms in block 117
Block first atom: 1636
Blocpdb> 17 atoms in block 118
Block first atom: 1655
Blocpdb> 23 atoms in block 119
Block first atom: 1672
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 1695
Blocpdb> 20 atoms in block 121
Block first atom: 1714
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1734
Blocpdb> 23 atoms in block 123
Block first atom: 1747
Blocpdb> 11 atoms in block 124
Block first atom: 1770
Blocpdb> 15 atoms in block 125
Block first atom: 1781
Blocpdb> 19 atoms in block 126
Block first atom: 1796
Blocpdb> 19 atoms in block 127
Block first atom: 1815
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 1834
Blocpdb> 20 atoms in block 129
Block first atom: 1848
Blocpdb> 13 atoms in block 130
Block first atom: 1868
Blocpdb> 14 atoms in block 131
Block first atom: 1881
Blocpdb> 16 atoms in block 132
Block first atom: 1895
Blocpdb> 16 atoms in block 133
Block first atom: 1911
Blocpdb> 18 atoms in block 134
Block first atom: 1927
Blocpdb> 13 atoms in block 135
Block first atom: 1945
Blocpdb> 16 atoms in block 136
Block first atom: 1958
Blocpdb> 20 atoms in block 137
Block first atom: 1974
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 1994
Blocpdb> 16 atoms in block 139
Block first atom: 2010
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2026
Blocpdb> 14 atoms in block 141
Block first atom: 2043
Blocpdb> 19 atoms in block 142
Block first atom: 2057
Blocpdb> 15 atoms in block 143
Block first atom: 2076
Blocpdb> 16 atoms in block 144
Block first atom: 2091
Blocpdb> 19 atoms in block 145
Block first atom: 2107
Blocpdb> 12 atoms in block 146
Block first atom: 2126
Blocpdb> 15 atoms in block 147
Block first atom: 2138
Blocpdb> 20 atoms in block 148
Block first atom: 2153
Blocpdb> 17 atoms in block 149
Block first atom: 2173
Blocpdb> 13 atoms in block 150
Block first atom: 2190
Blocpdb> 5 atoms in block 151
Block first atom: 2203
Blocpdb> 14 atoms in block 152
Block first atom: 2208
Blocpdb> 15 atoms in block 153
Block first atom: 2222
Blocpdb> 9 atoms in block 154
Block first atom: 2237
Blocpdb> 12 atoms in block 155
Block first atom: 2246
Blocpdb> 14 atoms in block 156
Block first atom: 2258
Blocpdb> 18 atoms in block 157
Block first atom: 2272
Blocpdb> 13 atoms in block 158
Block first atom: 2290
Blocpdb> 12 atoms in block 159
Block first atom: 2303
Blocpdb> 19 atoms in block 160
Block first atom: 2315
Blocpdb> 12 atoms in block 161
Block first atom: 2334
Blocpdb> 15 atoms in block 162
Block first atom: 2346
Blocpdb> 13 atoms in block 163
Block first atom: 2361
Blocpdb> 9 atoms in block 164
Block first atom: 2374
Blocpdb> 19 atoms in block 165
Block first atom: 2383
Blocpdb> 15 atoms in block 166
Block first atom: 2402
Blocpdb> 18 atoms in block 167
Block first atom: 2417
Blocpdb> 14 atoms in block 168
Block first atom: 2435
Blocpdb> 15 atoms in block 169
Block first atom: 2449
Blocpdb> 20 atoms in block 170
Block first atom: 2464
Blocpdb> 13 atoms in block 171
Block first atom: 2484
Blocpdb> 11 atoms in block 172
Block first atom: 2497
Blocpdb> 14 atoms in block 173
Block first atom: 2508
Blocpdb> 9 atoms in block 174
Block first atom: 2522
Blocpdb> 14 atoms in block 175
Block first atom: 2531
Blocpdb> 15 atoms in block 176
Block first atom: 2545
Blocpdb> 16 atoms in block 177
Block first atom: 2560
Blocpdb> 18 atoms in block 178
Block first atom: 2576
Blocpdb> 19 atoms in block 179
Block first atom: 2594
Blocpdb> 11 atoms in block 180
Block first atom: 2612
Blocpdb> 180 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 962297 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7869
Prepmat> Matrix trace = 2103420.0000
Prepmat> Last element read: 7869 7869 216.0110
Prepmat> 16291 lines saved.
Prepmat> 14349 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2623
RTB> Total mass = 2623.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2623
RTB> Number of blocks = 180
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 246911.7614
RTB> 67176 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1080
Diagstd> Nb of non-zero elements: 67176
Diagstd> Projected matrix trace = 246911.7614
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1080 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 246911.7614
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.2744015 1.7667336 2.2054618 3.7715444
4.6705462 5.3691738 5.8396035 6.6442733 7.5907185
8.1003130 8.7608942 9.4146863 9.9355772 10.1495074
12.0978941 12.2352157 12.3305261 12.9132155 13.9622003
14.0792587 15.0408027 15.9053490 16.6250643 16.9221062
17.3419876 17.9303261 18.1592716 18.8680697 20.1815623
20.4906993 21.3608565 21.8388152 22.5834015 23.4228772
24.0242917 24.4054019 24.5628840 25.3691445 26.0572809
27.5160841 28.0908437 29.1406323 29.5247107 29.9713714
30.6156709 30.9154416 31.9351640 31.9911588 32.6408010
34.3792039 34.8831136 35.4623513 36.1304094 37.5210238
37.9416871 38.2732254 39.3119972 39.8227445 40.5981175
41.5031563 41.9276117 42.5229026 42.5508165 43.6790707
44.2682726 44.8935300 45.8045700 45.9605834 46.3443705
48.1698705 48.4818333 48.9551005 49.3573627 49.6626098
50.3789953 50.7989259 51.1255079 51.2953177 52.0671520
52.8159407 53.2326962 53.8603476 54.3974300 55.7109392
56.3227708 57.1911790 57.2380127 58.0200626 58.4360671
59.2021658 59.9810244 60.5082440 60.7162808 61.3846218
62.3825019 62.6573007 62.9557718 63.6576396 63.9443346
65.1352994
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034332 0.0034337 0.0034338 0.0034344 0.0034346
0.0034359 122.5881313 144.3380447 161.2668310 210.8894682
234.6816412 251.6222329 262.4139760 279.9103929 299.1828696
309.0624051 321.4174845 333.1947940 342.2881233 345.9535275
377.7027697 379.8403478 381.3169269 390.2226557 405.7627849
407.4601819 421.1441646 433.0787570 442.7687350 446.7067232
452.2147419 459.8216061 462.7479379 471.6925497 487.8346805
491.5567574 501.8854571 507.4693495 516.0478326 525.5516467
532.2560129 536.4611327 538.1891762 546.9507108 554.3190803
569.6244133 575.5428618 586.1985852 590.0490365 594.4955226
600.8515295 603.7859561 613.6628824 614.2006420 620.4055637
636.7122245 641.3615227 646.6645357 652.7272168 665.1699488
668.8882996 671.8043505 680.8600219 685.2686657 691.9078029
699.5775160 703.1457280 708.1197885 708.3521713 717.6818697
722.5061828 727.5907316 734.9362780 736.1868345 739.2541546
753.6731081 756.1096783 759.7911899 762.9063915 765.2618255
770.7615318 773.9671807 776.4510795 777.7394742 783.5689024
789.1831243 792.2906159 796.9477637 800.9113926 810.5233308
814.9618633 821.2205436 821.5567227 827.1501959 830.1102377
835.5339051 841.0120525 844.7001183 846.1509776 850.7952812
857.6827483 859.5697454 861.6146141 866.4041935 868.3530148
876.4022568
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2623
Rtb_to_modes> Number of blocs = 180
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.274
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.767
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.772
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.671
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.369
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.840
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.644
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.591
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.100
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.761
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.415
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.936
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.14
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001
1.00003 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001
0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001
0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999
0.99998 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00003 1.00000 0.99996 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999
0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 47214 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001
1.00003 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001
0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001
0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999
0.99998 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00003 1.00000 0.99996 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999
0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603171030083534856.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603171030083534856.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603171030083534856.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603171030083534856.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 357
First residue number = 2
Last residue number = 380
Number of atoms found = 2623
Mean number per residue = 7.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.767
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.772
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.671
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.369
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.840
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.644
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.591
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.100
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.761
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.415
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.936
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.14
Bfactors> 106 vectors, 7869 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.274000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.516 for 357 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.034 +/- 0.04
Bfactors> = 62.050 +/- 27.83
Bfactors> Shiftng-fct= 62.016
Bfactors> Scaling-fct= 619.421
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603171030083534856.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603171030083534856.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.4
Chkmod> 106 vectors, 7869 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2623 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8259
0.0034 0.9021
0.0034 0.8732
0.0034 0.9736
0.0034 0.8197
0.0034 0.7351
122.5636 0.3370
144.3427 0.4211
161.2430 0.3880
210.8932 0.5118
234.6830 0.2509
251.6074 0.2872
262.4116 0.1845
279.8926 0.3138
299.1756 0.3691
309.0432 0.1668
321.4056 0.3065
333.1860 0.2655
342.2807 0.5169
345.9471 0.2194
377.7194 0.3389
379.8983 0.4734
381.2924 0.5178
390.1573 0.4960
405.7134 0.3329
407.4534 0.4655
421.1148 0.3915
433.1235 0.3341
442.8154 0.2418
446.6597 0.4819
452.1694 0.4780
459.7977 0.3211
462.7374 0.2870
471.6964 0.0332
487.7949 0.4353
491.5273 0.3773
501.8539 0.4984
507.4613 0.2431
515.9868 0.5635
525.4968 0.2154
532.1856 0.2596
536.4886 0.2742
538.1345 0.4746
546.9365 0.3188
554.3242 0.3506
569.6405 0.2963
575.5095 0.4037
586.1671 0.5690
589.9766 0.3650
594.4564 0.3707
600.8682 0.4941
603.8045 0.3194
613.6830 0.3941
614.1632 0.4826
620.3713 0.5475
636.6923 0.4779
641.3054 0.5502
646.6153 0.6062
652.6955 0.4245
665.1323 0.6288
668.8447 0.4273
671.7472 0.4700
680.8135 0.5886
685.2156 0.5579
691.8941 0.4407
699.5209 0.4054
703.1356 0.0759
708.0652 0.4633
708.3150 0.4805
717.6587 0.4627
722.4893 0.5699
727.5309 0.4475
734.8681 0.5063
736.1506 0.3474
739.1876 0.4064
753.6418 0.3607
756.0629 0.4942
759.7966 0.3651
762.8940 0.4559
765.2089 0.3642
770.7361 0.4241
773.9421 0.4095
776.4519 0.3716
777.7416 0.3662
783.5567 0.4441
789.1796 0.3338
792.2365 0.4310
796.9110 0.4157
800.8959 0.5247
810.4817 0.4232
814.9068 0.2612
821.1768 0.4938
821.5357 0.5144
827.1142 0.4937
830.1025 0.4411
835.4828 0.3852
840.9688 0.4084
844.6761 0.4084
846.1406 0.4435
850.7267 0.4798
857.6287 0.3904
859.5514 0.3809
861.6066 0.4426
866.3831 0.5333
868.2863 0.5497
876.3963 0.4168
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603171030083534856 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
making animated gifs
11 models are in 2603171030083534856.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603171030083534856 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
making animated gifs
11 models are in 2603171030083534856.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603171030083534856 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
making animated gifs
11 models are in 2603171030083534856.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603171030083534856 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
making animated gifs
11 models are in 2603171030083534856.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603171030083534856 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603171030083534856.eigenfacs
2603171030083534856.atom
making animated gifs
11 models are in 2603171030083534856.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603171030083534856.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603171030083534856.10.pdb
2603171030083534856.11.pdb
2603171030083534856.7.pdb
2603171030083534856.8.pdb
2603171030083534856.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m29.163s
user 0m29.023s
sys 0m0.130s
rm: cannot remove '2603171030083534856.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|