*** MEMBRANE PROTEIN 26-MAR-24 8YU7 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603191514413998499.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603191514413998499.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603191514413998499.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 281
First residue number = 26
Last residue number = 1
Number of atoms found = 2302
Mean number per residue = 8.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 147.345063 +/- 14.091307 From: 54.379100 To: 166.638000
= 157.088967 +/- 15.198932 From: 42.429100 To: 180.283000
= 129.575848 +/- 18.979803 From: 34.978000 To: 163.522000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'L ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.4625 % Filled.
Pdbmat> 825802 non-zero elements.
Pdbmat> 90235 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.40 +/- 22.32
Maximum number = 134
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 1.804700E+06
Pdbmat> Larger element = 535.953
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
281 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603191514413998499.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603191514413998499.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603191514413998499.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2302 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 281 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 17 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 34
Blocpdb> 17 atoms in block 4
Block first atom: 54
Blocpdb> 13 atoms in block 5
Block first atom: 71
Blocpdb> 19 atoms in block 6
Block first atom: 84
Blocpdb> 17 atoms in block 7
Block first atom: 103
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 120
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 139
Blocpdb> 20 atoms in block 10
Block first atom: 153
Blocpdb> 14 atoms in block 11
Block first atom: 173
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 187
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 206
Blocpdb> 12 atoms in block 14
Block first atom: 221
Blocpdb> 11 atoms in block 15
Block first atom: 233
Blocpdb> 12 atoms in block 16
Block first atom: 244
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 256
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 271
Blocpdb> 15 atoms in block 19
Block first atom: 287
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 302
Blocpdb> 18 atoms in block 21
Block first atom: 318
Blocpdb> 17 atoms in block 22
Block first atom: 336
Blocpdb> 17 atoms in block 23
Block first atom: 353
Blocpdb> 15 atoms in block 24
Block first atom: 370
Blocpdb> 17 atoms in block 25
Block first atom: 385
Blocpdb> 23 atoms in block 26
Block first atom: 402
Blocpdb> 18 atoms in block 27
Block first atom: 425
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 443
Blocpdb> 12 atoms in block 29
Block first atom: 457
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 469
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 485
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 504
Blocpdb> 15 atoms in block 33
Block first atom: 519
Blocpdb> 18 atoms in block 34
Block first atom: 534
Blocpdb> 19 atoms in block 35
Block first atom: 552
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 571
Blocpdb> 12 atoms in block 37
Block first atom: 586
Blocpdb> 13 atoms in block 38
Block first atom: 598
Blocpdb> 26 atoms in block 39
Block first atom: 611
Blocpdb> 15 atoms in block 40
Block first atom: 637
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 652
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 671
Blocpdb> 14 atoms in block 43
Block first atom: 685
Blocpdb> 17 atoms in block 44
Block first atom: 699
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 716
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 731
Blocpdb> 15 atoms in block 47
Block first atom: 750
Blocpdb> 20 atoms in block 48
Block first atom: 765
Blocpdb> 12 atoms in block 49
Block first atom: 785
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 797
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 812
Blocpdb> 16 atoms in block 52
Block first atom: 828
Blocpdb> 14 atoms in block 53
Block first atom: 844
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 858
Blocpdb> 23 atoms in block 55
Block first atom: 874
Blocpdb> 13 atoms in block 56
Block first atom: 897
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 910
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 925
Blocpdb> 15 atoms in block 59
Block first atom: 940
Blocpdb> 15 atoms in block 60
Block first atom: 955
Blocpdb> 18 atoms in block 61
Block first atom: 970
Blocpdb> 20 atoms in block 62
Block first atom: 988
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 1008
Blocpdb> 14 atoms in block 64
Block first atom: 1024
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 1038
Blocpdb> 19 atoms in block 66
Block first atom: 1054
Blocpdb> 11 atoms in block 67
Block first atom: 1073
Blocpdb> 21 atoms in block 68
Block first atom: 1084
Blocpdb> 15 atoms in block 69
Block first atom: 1105
Blocpdb> 13 atoms in block 70
Block first atom: 1120
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1133
Blocpdb> 15 atoms in block 72
Block first atom: 1149
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1164
Blocpdb> 19 atoms in block 74
Block first atom: 1179
Blocpdb> 16 atoms in block 75
Block first atom: 1198
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1214
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1229
Blocpdb> 13 atoms in block 78
Block first atom: 1244
Blocpdb> 19 atoms in block 79
Block first atom: 1257
Blocpdb> 20 atoms in block 80
Block first atom: 1276
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1296
Blocpdb> 22 atoms in block 82
Block first atom: 1310
Blocpdb> 19 atoms in block 83
Block first atom: 1332
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1351
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 1367
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1389
Blocpdb> 18 atoms in block 87
Block first atom: 1403
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1421
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 1441
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1460
Blocpdb> 11 atoms in block 91
Block first atom: 1476
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1487
Blocpdb> 15 atoms in block 93
Block first atom: 1503
Blocpdb> 12 atoms in block 94
Block first atom: 1518
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1530
Blocpdb> 14 atoms in block 96
Block first atom: 1545
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1559
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1577
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1591
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1607
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1622
Blocpdb> 16 atoms in block 102
Block first atom: 1636
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1652
Blocpdb> 19 atoms in block 104
Block first atom: 1665
Blocpdb> 20 atoms in block 105
Block first atom: 1684
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1704
Blocpdb> 17 atoms in block 107
Block first atom: 1718
Blocpdb> 14 atoms in block 108
Block first atom: 1735
Blocpdb> 15 atoms in block 109
Block first atom: 1749
Blocpdb> 16 atoms in block 110
Block first atom: 1764
Blocpdb> 13 atoms in block 111
Block first atom: 1780
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 1793
Blocpdb> 11 atoms in block 113
Block first atom: 1815
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 1826
Blocpdb> 19 atoms in block 115
Block first atom: 1848
Blocpdb> 20 atoms in block 116
Block first atom: 1867
Blocpdb> 12 atoms in block 117
Block first atom: 1887
Blocpdb> 14 atoms in block 118
Block first atom: 1899
Blocpdb> 14 atoms in block 119
Block first atom: 1913
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 1927
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 1946
Blocpdb> 17 atoms in block 122
Block first atom: 1962
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 1979
Blocpdb> 13 atoms in block 124
Block first atom: 1996
Blocpdb> 15 atoms in block 125
Block first atom: 2009
Blocpdb> 20 atoms in block 126
Block first atom: 2024
Blocpdb> 15 atoms in block 127
Block first atom: 2044
Blocpdb> 17 atoms in block 128
Block first atom: 2059
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 2076
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 2099
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2113
Blocpdb> 14 atoms in block 132
Block first atom: 2128
Blocpdb> 13 atoms in block 133
Block first atom: 2142
Blocpdb> 22 atoms in block 134
Block first atom: 2155
Blocpdb> 16 atoms in block 135
Block first atom: 2177
Blocpdb> 14 atoms in block 136
Block first atom: 2193
Blocpdb> 15 atoms in block 137
Block first atom: 2207
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 2222
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 2238
Blocpdb> 19 atoms in block 140
Block first atom: 2255
Blocpdb> 29 atoms in block 141
Block first atom: 2273
Blocpdb> 141 blocks.
Blocpdb> At most, 29 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 825943 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6906
Prepmat> Matrix trace = 1804700.0000
Prepmat> Last element read: 6906 6906 59.8876
Prepmat> 10012 lines saved.
Prepmat> 8666 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2302
RTB> Total mass = 2302.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2302
RTB> Number of blocks = 141
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 182687.1417
RTB> 46305 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 846
Diagstd> Nb of non-zero elements: 46305
Diagstd> Projected matrix trace = 182687.1417
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 846 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 182687.1417
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 12 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
%Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ?
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 1.2370699 1.6926202 1.7947862
2.2333263 2.8735727 3.3309783 4.5987626 4.9666082
5.5088193 5.6957581 6.5600382 6.6271224 7.3883362
7.9899917 8.5241078 8.9145237 9.2970743 9.5479451
10.3523341 10.4368136 11.0329689 11.8843056 12.1622098
12.9264432 13.9077438 14.5312485 15.1428633 15.9553439
16.0546779 16.6964021 18.0894061 18.5862600 18.6916395
19.0727559 20.5006209 21.1669812 21.4781212 22.0589101
22.8050166 23.0905217 23.6260846 25.3819382 25.8951899
26.2852499 27.0851198 28.1170126 28.8617242 29.9598126
30.6933844 31.2567833 31.3749619 32.2317176 32.8574688
33.5667337 33.9146392 34.6256335 34.7590436 35.1002631
35.5557568 36.2727476 36.9520331 37.9856686 38.5533810
39.0060069 39.9674977 40.1268497 41.6499710 42.4396627
43.2911518 44.3926990 44.9305043 45.3235422 46.3762251
47.0609408 47.6051749 48.0244799 49.4146171 49.5217217
49.7451364 50.7885042 50.9097518 52.5876081 52.8866564
53.4846739 54.1592269 54.2264210 54.5904562 55.7134723
56.4832091 56.9607093 57.4606617 57.9218885 58.8718715
59.6782551
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034328 0.0034334 0.0034340 0.0034340
0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034342
0.0034348 0.0034348 120.7792715 141.2781620 145.4794457
162.2823825 184.0799018 198.1897471 232.8711961 242.0054975
254.8734179 259.1618358 278.1304029 279.5488929 295.1675472
306.9505705 317.0441523 324.2233981 331.1070529 335.5445871
349.3931776 350.8158795 360.6961260 374.3537475 378.7054249
390.4224671 404.9707166 413.9489111 422.5706031 433.7588661
435.1070088 443.7176738 461.8568978 468.1567448 469.4820355
474.2441750 491.6757488 499.6026605 503.2611724 510.0201154
518.5736869 521.8097065 527.8264600 547.0886082 552.5923013
556.7386026 565.1460033 575.8108819 583.3865552 594.3808744
601.6136338 607.1100488 608.2566755 616.5055703 622.4612674
629.1436559 632.3956601 638.9901215 640.2199293 643.3546822
647.5156118 654.0116846 660.1071689 669.2758705 674.2586328
678.2050616 686.5129901 687.8802068 700.8137785 707.4263657
714.4878549 723.5208575 727.8902918 731.0670371 739.5081726
744.9473551 749.2424285 752.5348469 763.3487476 764.1755673
765.8973962 773.8877844 774.8109863 787.4753882 789.7112695
794.1635611 799.1558969 799.6514902 802.3311288 810.5417573
816.1217684 819.5641908 823.1530498 826.4501006 833.1998845
838.8867569
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2302
Rtb_to_modes> Number of blocs = 141
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.68
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 846 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003
1.00000 0.99999 0.99996 1.00000 0.99999
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1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00004
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1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000
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1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99995
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 41436 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001
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1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003
1.00000 0.99999 0.99996 1.00000 0.99999
0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00004
1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998
1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000
0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99995
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603191514413998499.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603191514413998499.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603191514413998499.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603191514413998499.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 281
First residue number = 26
Last residue number = 1
Number of atoms found = 2302
Mean number per residue = 8.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.237
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.693
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.795
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.233
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.874
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.331
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.599
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.967
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.509
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.696
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.560
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.627
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.388
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.990
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.524
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.915
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.297
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.548
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.68
Bfactors> 106 vectors, 6906 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 12 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.237000
Bfactors> 94 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.665 for 280 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.046 +/- 0.07
Bfactors> = 13.198 +/- 15.40
Bfactors> Shiftng-fct= 13.152
Bfactors> Scaling-fct= 211.592
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603191514413998499.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603191514413998499.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.3
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.9
Chkmod> 106 vectors, 6906 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2302 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 105 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
120.7707 NaN
141.2879 NaN
145.4819 NaN
162.2636 NaN
184.0857 NaN
198.1819 NaN
232.8672 NaN
242.0047 NaN
254.8667 NaN
259.1562 NaN
278.1177 NaN
279.5343 NaN
295.1482 NaN
306.9376 NaN
317.0285 NaN
324.2181 NaN
331.0915 NaN
335.5311 NaN
349.3388 NaN
350.8544 NaN
360.6321 NaN
374.2699 NaN
378.6548 NaN
390.4594 NaN
404.9862 NaN
413.9134 NaN
422.5125 NaN
433.8035 NaN
435.0249 NaN
443.7464 NaN
461.8447 NaN
468.1837 NaN
469.4413 NaN
474.1896 NaN
491.6472 NaN
499.6168 NaN
503.2616 NaN
510.0108 NaN
518.6081 NaN
521.7814 NaN
527.8475 NaN
547.0442 NaN
552.6199 NaN
556.7650 NaN
565.1727 NaN
575.8168 NaN
583.3441 NaN
594.3572 NaN
601.5546 NaN
607.1152 NaN
608.1825 NaN
616.4627 NaN
622.4585 NaN
629.1473 NaN
632.3253 NaN
639.0030 NaN
640.2013 NaN
643.3247 NaN
647.5264 NaN
653.9588 NaN
660.0607 NaN
669.2853 NaN
674.2001 NaN
678.2107 NaN
686.5050 NaN
687.8777 NaN
700.7839 NaN
707.3988 NaN
714.4477 NaN
723.4678 NaN
727.8550 NaN
731.0071 NaN
739.5065 NaN
744.9079 NaN
749.2482 NaN
752.4674 NaN
763.2803 NaN
764.1295 NaN
765.9020 NaN
773.8660 NaN
774.7796 NaN
787.4595 NaN
789.7023 NaN
794.0948 NaN
799.1273 NaN
799.6436 NaN
802.2933 NaN
810.4817 NaN
816.0636 NaN
819.5239 NaN
823.1130 NaN
826.4012 NaN
833.1509 NaN
838.8630 NaN
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603191514413998499 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603191514413998499.eigenfacs
2603191514413998499.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603191514413998499.eigenfacs
2603191514413998499.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603191514413998499.eigenfacs
2603191514413998499.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603191514413998499.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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getting mode 11
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making small animated gif 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m11.236s
user 0m11.127s
sys 0m0.106s
rm: cannot remove '2603191514413998499.sdijf': No such file or directory
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_INVALID_FLAG IEEE_DIVIDE_BY_ZERO
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