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elNémo has been hacked on november 27th.
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* birA_2ewn_btx_b *

LOGs for ID: 2603191724404031879

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603191724404031879.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603191724404031879.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603191724404031879.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    317
            First residue number     =      2
            Last  residue number     =    318
            Number of atoms found    =   2454
            Mean number per residue  =      7.7

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    37.606341 +/-    12.840215 From:     7.705000 To:    70.835000
 =    42.526844 +/-    14.859444 From:     7.172000 To:    79.302000
 =   -16.942728 +/-     7.893872 From:   -38.890000 To:     1.511000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.2622 % Filled.
 Pdbmat>       884160  non-zero elements.
 Pdbmat>        96619 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     78.74 +/-     22.36
         Maximum number =    127
         Minimum number =     14

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.932380E+06
 Pdbmat> Larger element =  482.881    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
317 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603191724404031879.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603191724404031879.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603191724404031879.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2454 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   317 residues.
 Blocpdb>    17 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    15 atoms in block      2
 Block first atom:     18
 Blocpdb>    14 atoms in block      3
 Block first atom:     33
 Blocpdb>    17 atoms in block      4
 Block first atom:     47
 Blocpdb>    16 atoms in block      5
 Block first atom:     64
 Blocpdb>    13 atoms in block      6
 Block first atom:     80
 Blocpdb>    13 atoms in block      7
 Block first atom:     93
 Blocpdb>    12 atoms in block      8
 Block first atom:    106
 Blocpdb>    20 atoms in block      9
 Block first atom:    118
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    138
 Blocpdb>    13 atoms in block     11
 Block first atom:    154
 Blocpdb>    17 atoms in block     12
 Block first atom:    167
 Blocpdb>    13 atoms in block     13
 Block first atom:    184
 Blocpdb>    15 atoms in block     14
 Block first atom:    197
 Blocpdb>    12 atoms in block     15
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    17 atoms in block     16
 Block first atom:    224
 Blocpdb>    10 atoms in block     17
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    16 atoms in block     18
 Block first atom:    251
 Blocpdb>    19 atoms in block     19
 Block first atom:    267
 Blocpdb>    17 atoms in block     20
 Block first atom:    286
 Blocpdb>    15 atoms in block     21
 Block first atom:    303
 Blocpdb>    19 atoms in block     22
 Block first atom:    318
 Blocpdb>    18 atoms in block     23
 Block first atom:    337
 Blocpdb>    15 atoms in block     24
 Block first atom:    355
 Blocpdb>    18 atoms in block     25
 Block first atom:    370
 Blocpdb>    14 atoms in block     26
 Block first atom:    388
 Blocpdb>    11 atoms in block     27
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    13 atoms in block     28
 Block first atom:    413
 Blocpdb>    18 atoms in block     29
 Block first atom:    426
 Blocpdb>    15 atoms in block     30
 Block first atom:    444
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    459
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    475
 Blocpdb>    16 atoms in block     33
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    13 atoms in block     34
 Block first atom:    508
 Blocpdb>    18 atoms in block     35
 Block first atom:    521
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    539
 Blocpdb>    13 atoms in block     37
 Block first atom:    555
 Blocpdb>    16 atoms in block     38
 Block first atom:    568
 Blocpdb>     8 atoms in block     39
 Block first atom:    584
 Blocpdb>    13 atoms in block     40
 Block first atom:    592
 Blocpdb>    12 atoms in block     41
 Block first atom:    605
 Blocpdb>    15 atoms in block     42
 Block first atom:    617
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    632
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    647
 Blocpdb>    15 atoms in block     45
 Block first atom:    661
 Blocpdb>    21 atoms in block     46
 Block first atom:    676
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    697
 Blocpdb>    19 atoms in block     48
 Block first atom:    713
 Blocpdb>    12 atoms in block     49
 Block first atom:    732
 Blocpdb>    17 atoms in block     50
 Block first atom:    744
 Blocpdb>    15 atoms in block     51
 Block first atom:    761
 Blocpdb>    12 atoms in block     52
 Block first atom:    776
 Blocpdb>    11 atoms in block     53
 Block first atom:    788
 Blocpdb>    13 atoms in block     54
 Block first atom:    799
 Blocpdb>    21 atoms in block     55
 Block first atom:    812
 Blocpdb>    18 atoms in block     56
 Block first atom:    833
 Blocpdb>     9 atoms in block     57
 Block first atom:    851
 Blocpdb>    15 atoms in block     58
 Block first atom:    860
 Blocpdb>    22 atoms in block     59
 Block first atom:    875
 Blocpdb>    15 atoms in block     60
 Block first atom:    897
 Blocpdb>    23 atoms in block     61
 Block first atom:    912
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:    935
 Blocpdb>    18 atoms in block     63
 Block first atom:    952
 Blocpdb>     9 atoms in block     64
 Block first atom:    970
 Blocpdb>    16 atoms in block     65
 Block first atom:    979
 Blocpdb>    20 atoms in block     66
 Block first atom:    995
 Blocpdb>    14 atoms in block     67
 Block first atom:   1015
 Blocpdb>    25 atoms in block     68
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    19 atoms in block     69
 Block first atom:   1054
 Blocpdb>    18 atoms in block     70
 Block first atom:   1073
 Blocpdb>    11 atoms in block     71
 Block first atom:   1091
 Blocpdb>    10 atoms in block     72
 Block first atom:   1102
 Blocpdb>    13 atoms in block     73
 Block first atom:   1112
 Blocpdb>    12 atoms in block     74
 Block first atom:   1125
 Blocpdb>    14 atoms in block     75
 Block first atom:   1137
 Blocpdb>    15 atoms in block     76
 Block first atom:   1151
 Blocpdb>    12 atoms in block     77
 Block first atom:   1166
 Blocpdb>    15 atoms in block     78
 Block first atom:   1178
 Blocpdb>    14 atoms in block     79
 Block first atom:   1193
 Blocpdb>    15 atoms in block     80
 Block first atom:   1207
 Blocpdb>    20 atoms in block     81
 Block first atom:   1222
 Blocpdb>    12 atoms in block     82
 Block first atom:   1242
 Blocpdb>    13 atoms in block     83
 Block first atom:   1254
 Blocpdb>    16 atoms in block     84
 Block first atom:   1267
 Blocpdb>    18 atoms in block     85
 Block first atom:   1283
 Blocpdb>    23 atoms in block     86
 Block first atom:   1301
 Blocpdb>    15 atoms in block     87
 Block first atom:   1324
 Blocpdb>    16 atoms in block     88
 Block first atom:   1339
 Blocpdb>    20 atoms in block     89
 Block first atom:   1355
 Blocpdb>    17 atoms in block     90
 Block first atom:   1375
 Blocpdb>    20 atoms in block     91
 Block first atom:   1392
 Blocpdb>    13 atoms in block     92
 Block first atom:   1412
 Blocpdb>    12 atoms in block     93
 Block first atom:   1425
 Blocpdb>    15 atoms in block     94
 Block first atom:   1437
 Blocpdb>    17 atoms in block     95
 Block first atom:   1452
 Blocpdb>    11 atoms in block     96
 Block first atom:   1469
 Blocpdb>    16 atoms in block     97
 Block first atom:   1480
 Blocpdb>    12 atoms in block     98
 Block first atom:   1496
 Blocpdb>    10 atoms in block     99
 Block first atom:   1508
 Blocpdb>    17 atoms in block    100
 Block first atom:   1518
 Blocpdb>    15 atoms in block    101
 Block first atom:   1535
 Blocpdb>     9 atoms in block    102
 Block first atom:   1550
 Blocpdb>    12 atoms in block    103
 Block first atom:   1559
 Blocpdb>    16 atoms in block    104
 Block first atom:   1571
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1587
 Blocpdb>    22 atoms in block    106
 Block first atom:   1600
 Blocpdb>    16 atoms in block    107
 Block first atom:   1622
 Blocpdb>    15 atoms in block    108
 Block first atom:   1638
 Blocpdb>    14 atoms in block    109
 Block first atom:   1653
 Blocpdb>    17 atoms in block    110
 Block first atom:   1667
 Blocpdb>    18 atoms in block    111
 Block first atom:   1684
 Blocpdb>    15 atoms in block    112
 Block first atom:   1702
 Blocpdb>    17 atoms in block    113
 Block first atom:   1717
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1734
 Blocpdb>    12 atoms in block    115
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    16 atoms in block    116
 Block first atom:   1760
 Blocpdb>    19 atoms in block    117
 Block first atom:   1776
 Blocpdb>    15 atoms in block    118
 Block first atom:   1795
 Blocpdb>    13 atoms in block    119
 Block first atom:   1810
 Blocpdb>    13 atoms in block    120
 Block first atom:   1823
 Blocpdb>    16 atoms in block    121
 Block first atom:   1836
 Blocpdb>    20 atoms in block    122
 Block first atom:   1852
 Blocpdb>    19 atoms in block    123
 Block first atom:   1872
 Blocpdb>    10 atoms in block    124
 Block first atom:   1891
 Blocpdb>    17 atoms in block    125
 Block first atom:   1901
 Blocpdb>    19 atoms in block    126
 Block first atom:   1918
 Blocpdb>    18 atoms in block    127
 Block first atom:   1937
 Blocpdb>    13 atoms in block    128
 Block first atom:   1955
 Blocpdb>    13 atoms in block    129
 Block first atom:   1968
 Blocpdb>    19 atoms in block    130
 Block first atom:   1981
 Blocpdb>    14 atoms in block    131
 Block first atom:   2000
 Blocpdb>    25 atoms in block    132
 Block first atom:   2014
 Blocpdb>    18 atoms in block    133
 Block first atom:   2039
 Blocpdb>    16 atoms in block    134
 Block first atom:   2057
 Blocpdb>    19 atoms in block    135
 Block first atom:   2073
 Blocpdb>    16 atoms in block    136
 Block first atom:   2092
 Blocpdb>    18 atoms in block    137
 Block first atom:   2108
 Blocpdb>    16 atoms in block    138
 Block first atom:   2126
 Blocpdb>    16 atoms in block    139
 Block first atom:   2142
 Blocpdb>    12 atoms in block    140
 Block first atom:   2158
 Blocpdb>    17 atoms in block    141
 Block first atom:   2170
 Blocpdb>    17 atoms in block    142
 Block first atom:   2187
 Blocpdb>    15 atoms in block    143
 Block first atom:   2204
 Blocpdb>    14 atoms in block    144
 Block first atom:   2219
 Blocpdb>    15 atoms in block    145
 Block first atom:   2233
 Blocpdb>    16 atoms in block    146
 Block first atom:   2248
 Blocpdb>    18 atoms in block    147
 Block first atom:   2264
 Blocpdb>     9 atoms in block    148
 Block first atom:   2282
 Blocpdb>    16 atoms in block    149
 Block first atom:   2291
 Blocpdb>    17 atoms in block    150
 Block first atom:   2307
 Blocpdb>    17 atoms in block    151
 Block first atom:   2324
 Blocpdb>    12 atoms in block    152
 Block first atom:   2341
 Blocpdb>    17 atoms in block    153
 Block first atom:   2353
 Blocpdb>    21 atoms in block    154
 Block first atom:   2370
 Blocpdb>    12 atoms in block    155
 Block first atom:   2391
 Blocpdb>    13 atoms in block    156
 Block first atom:   2403
 Blocpdb>    14 atoms in block    157
 Block first atom:   2416
 Blocpdb>    19 atoms in block    158
 Block first atom:   2430
 Blocpdb>     6 atoms in block    159
 Block first atom:   2448

 Blocpdb>   159 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     6 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       884319 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       7362

 Prepmat> Matrix trace    =    1932380.0000
 Prepmat> Last element read:    7362   7362        22.7923
 Prepmat>        12721 lines saved.
 Prepmat>        11033 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2454
 RTB> Total mass =        2454.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2454
 RTB> Number of blocks =   159
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  209920.8650
 RTB>     58347 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      954
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    58347
 Diagstd> Projected matrix trace =  209920.8650

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    954 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 209920.8650
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.4648563      1.8418845      2.3690191      3.7080694
      4.4303804      4.6449173      5.0254011      7.0961598      7.3582818
      7.8311392      8.8221846     10.1703758     11.5382094     12.2672384
     12.4815230     12.8893891     13.2528309     14.3597344     15.0368146
     15.7342050     16.0882277     16.4556422     17.1682305     17.3794024
     17.9733102     18.9384546     20.0923143     20.7170041     21.3250578
     21.5286301     21.8889214     22.4104940     23.1754751     23.6900454
     24.5558430     25.2790668     26.3172601     26.6456031     27.0083025
     27.4198999     27.7678973     28.7067862     29.7580405     30.1941841
     30.8591195     32.0620110     32.3611447     32.9417250     33.1250585
     34.1611473     34.7830379     35.4536171     35.8182938     36.9019876
     37.5394682     38.4548459     39.4461800     40.0357584     40.4335800
     42.0496747     42.5127803     43.1715128     43.6341911     44.5783511
     45.0188706     45.7724947     45.8893901     47.1406896     47.9259185
     48.4568986     48.6221188     49.3237966     50.1271572     50.7182917
     50.9117426     52.2206293     52.8663478     53.4468188     53.7588166
     53.8432865     54.3529111     54.7370547     55.8883753     56.5334627
     57.4715733     57.6792899     58.3423214     58.7374091     60.0334990
     60.2956712     60.4417902     61.3674445     61.9728589     62.5455775
     63.2412208     64.0680250     64.6093836     64.8906895     65.9032028
     66.1336459

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034318      0.0034330      0.0034343      0.0034345      0.0034349
      0.0034351    131.4294794    147.3759011    167.1396769    209.1073073
    228.5681906    234.0368668    243.4336688    289.2723830    294.5665917
    303.8839422    322.5398288    346.3090011    368.8624856    380.3370927
    383.6445838    389.8624856    395.3207484    411.4987151    421.0883278
    430.7424589    435.5613977    440.5068831    449.9435685    452.7022981
    460.3724381    472.5715248    486.7548212    494.2637460    501.4647251
    503.8525706    508.0511761    514.0685027    522.7687314    528.5404456
    538.1120339    545.9788240    557.0774982    560.5418698    564.3440170
    568.6279633    572.2249338    581.8185556    592.3759871    596.7012249
    603.2357134    614.8804141    617.7421255    623.2588425    624.9907753
    634.6897783    640.4408650    646.5848962    649.9017812    659.6600137
    665.3334187    673.3964427    682.0210149    687.0989897    690.5042851
    704.1685112    708.0355020    713.4998956    717.3130713    725.0321762
    728.6057231    734.6789083    735.6164345    745.5782769    751.7622307
    755.9152163    757.2028155    762.6469350    768.8326495    773.3526691
    774.8261356    784.7229077    789.5596300    793.8824668    796.1962545
    796.8215311    800.5835924    803.4077058    811.8130389    816.4847431
    823.2312032    824.7175427    829.4441203    832.2478335    841.3798529
    843.2150459    844.2361408    850.6762337    854.8620662    858.8030607
    863.5657369    869.1924565    872.8569598    874.7550831    881.5532300
    883.0931438

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2454
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    159

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9872E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.465    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.842    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.369    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.708    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.430    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.645    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.025    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.096    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.358    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.831    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.822    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.13    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    954 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00002
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00006
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00002 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002 0.99997
 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003
 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000
 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    44172 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00002
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00006
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00002 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002 0.99997
 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003
 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000
 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603191724404031879.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603191724404031879.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603191724404031879.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603191724404031879.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    317
            First residue number     =      2
            Last  residue number     =    318
            Number of atoms found    =   2454
            Mean number per residue  =      7.7

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9872E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.465    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.842    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.369    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.708    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.430    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.645    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.025    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.096    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.358    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.831    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.822    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.13    

 Bfactors>  106 vectors,   7362 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.465000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.285 for    317 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.033 +/-   0.04
 Bfactors> =     70.625 +/-  22.63
 Bfactors> Shiftng-fct=     70.592
 Bfactors> Scaling-fct=    511.071

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603191724404031879.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603191724404031879.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4316E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   757.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   762.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   768.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   773.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   793.9    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   796.2    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   858.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   863.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   869.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   872.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   874.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   881.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.0    

 Chkmod>  106 vectors,   7362 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2454 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8675
      0.0034      0.7144
      0.0034      0.7871
      0.0034      0.8879
      0.0034      0.9651
      0.0034      0.6259
    131.4303      0.4977
    147.3742      0.5468
    167.1318      0.2887
    209.0964      0.2250
    228.5486      0.4744
    234.0289      0.0769
    243.4135      0.2702
    289.2567      0.0969
    294.5483      0.1539
    303.8682      0.5460
    322.5226      0.4090
    346.2877      0.1372
    368.8753      0.2731
    380.3636      0.0567
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    389.8550      0.0917
    395.2616      0.1315
    411.4849      0.1012
    421.1148      0.2226
    430.6664      0.2288
    435.5667      0.2308
    440.5463      0.2348
    449.9474      0.4305
    452.6906      0.1139
    460.3103      0.2952
    472.5705      0.3169
    486.7059      0.3088
    494.2783      0.5619
    501.5013      0.2139
    503.8470      0.2880
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    725.0145      0.5453
    728.5836      0.4269
    734.6273      0.3600
    735.5897      0.5227
    745.5408      0.5321
    751.7620      0.4917
    755.9070      0.4360
    757.1538      0.4713
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    789.5530      0.3001
    793.8720      0.4594
    796.1708      0.4313
    796.7630      0.3798
    800.5278      0.3758
    803.3948      0.5277
    811.7900      0.3660
    816.4247      0.3957
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    881.4940      0.3550
    883.0309      0.3961
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603191724404031879 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603191724404031879.eigenfacs
2603191724404031879.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603191724404031879.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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STDERR:
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user	0m13.387s
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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