*** Turbo-2ewn-B-together ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603191738254036268.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603191738254036268.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603191738254036268.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 317
First residue number = 3
Last residue number = 320
Number of atoms found = 2451
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 37.754597 +/- 12.826144 From: 7.434000 To: 71.529000
= 42.574355 +/- 15.126245 From: 6.214000 To: 79.350000
= -16.903909 +/- 7.645652 From: -38.292000 To: 1.607000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.2880 % Filled.
Pdbmat> 888967 non-zero elements.
Pdbmat> 97159 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.28 +/- 22.33
Maximum number = 128
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 1.943180E+06
Pdbmat> Larger element = 484.672
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
317 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603191738254036268.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603191738254036268.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603191738254036268.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2451 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 317 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 31
Blocpdb> 17 atoms in block 4
Block first atom: 46
Blocpdb> 13 atoms in block 5
Block first atom: 63
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 76
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 92
Blocpdb> 13 atoms in block 8
Block first atom: 105
Blocpdb> 21 atoms in block 9
Block first atom: 118
Blocpdb> 10 atoms in block 10
Block first atom: 139
Blocpdb> 18 atoms in block 11
Block first atom: 149
Blocpdb> 12 atoms in block 12
Block first atom: 167
Blocpdb> 16 atoms in block 13
Block first atom: 179
Blocpdb> 12 atoms in block 14
Block first atom: 195
Blocpdb> 14 atoms in block 15
Block first atom: 207
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 221
Blocpdb> 13 atoms in block 17
Block first atom: 237
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 250
Blocpdb> 18 atoms in block 19
Block first atom: 267
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 285
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 301
Blocpdb> 22 atoms in block 22
Block first atom: 320
Blocpdb> 11 atoms in block 23
Block first atom: 342
Blocpdb> 15 atoms in block 24
Block first atom: 353
Blocpdb> 26 atoms in block 25
Block first atom: 368
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 394
Blocpdb> 13 atoms in block 27
Block first atom: 408
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 421
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 437
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 451
Blocpdb> 15 atoms in block 31
Block first atom: 467
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 482
Blocpdb> 16 atoms in block 33
Block first atom: 497
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 513
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 527
Blocpdb> 12 atoms in block 36
Block first atom: 544
Blocpdb> 17 atoms in block 37
Block first atom: 556
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 573
Blocpdb> 10 atoms in block 39
Block first atom: 585
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 595
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 607
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 622
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 636
Blocpdb> 13 atoms in block 44
Block first atom: 651
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 664
Blocpdb> 20 atoms in block 46
Block first atom: 681
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 701
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 717
Blocpdb> 13 atoms in block 49
Block first atom: 736
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 749
Blocpdb> 10 atoms in block 51
Block first atom: 766
Blocpdb> 13 atoms in block 52
Block first atom: 776
Blocpdb> 14 atoms in block 53
Block first atom: 789
Blocpdb> 14 atoms in block 54
Block first atom: 803
Blocpdb> 21 atoms in block 55
Block first atom: 817
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 838
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 852
Blocpdb> 10 atoms in block 58
Block first atom: 867
Blocpdb> 15 atoms in block 59
Block first atom: 877
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 892
Blocpdb> 25 atoms in block 61
Block first atom: 912
Blocpdb> 13 atoms in block 62
Block first atom: 937
Blocpdb> 15 atoms in block 63
Block first atom: 950
Blocpdb> 13 atoms in block 64
Block first atom: 965
Blocpdb> 20 atoms in block 65
Block first atom: 978
Blocpdb> 14 atoms in block 66
Block first atom: 998
Blocpdb> 24 atoms in block 67
Block first atom: 1012
Blocpdb> 25 atoms in block 68
Block first atom: 1036
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1061
Blocpdb> 15 atoms in block 70
Block first atom: 1078
Blocpdb> 12 atoms in block 71
Block first atom: 1093
Blocpdb> 5 atoms in block 72
Block first atom: 1105
Blocpdb> 12 atoms in block 73
Block first atom: 1110
Blocpdb> 12 atoms in block 74
Block first atom: 1122
Blocpdb> 14 atoms in block 75
Block first atom: 1134
Blocpdb> 12 atoms in block 76
Block first atom: 1148
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1160
Blocpdb> 13 atoms in block 78
Block first atom: 1175
Blocpdb> 14 atoms in block 79
Block first atom: 1188
Blocpdb> 19 atoms in block 80
Block first atom: 1202
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1221
Blocpdb> 9 atoms in block 82
Block first atom: 1238
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1247
Blocpdb> 18 atoms in block 84
Block first atom: 1264
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1282
Blocpdb> 21 atoms in block 86
Block first atom: 1298
Blocpdb> 16 atoms in block 87
Block first atom: 1319
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1335
Blocpdb> 17 atoms in block 89
Block first atom: 1355
Blocpdb> 19 atoms in block 90
Block first atom: 1372
Blocpdb> 17 atoms in block 91
Block first atom: 1391
Blocpdb> 9 atoms in block 92
Block first atom: 1408
Blocpdb> 16 atoms in block 93
Block first atom: 1417
Blocpdb> 16 atoms in block 94
Block first atom: 1433
Blocpdb> 13 atoms in block 95
Block first atom: 1449
Blocpdb> 12 atoms in block 96
Block first atom: 1462
Blocpdb> 11 atoms in block 97
Block first atom: 1474
Blocpdb> 13 atoms in block 98
Block first atom: 1485
Blocpdb> 14 atoms in block 99
Block first atom: 1498
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1512
Blocpdb> 12 atoms in block 101
Block first atom: 1527
Blocpdb> 9 atoms in block 102
Block first atom: 1539
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1548
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1564
Blocpdb> 19 atoms in block 105
Block first atom: 1576
Blocpdb> 18 atoms in block 106
Block first atom: 1595
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1613
Blocpdb> 13 atoms in block 108
Block first atom: 1631
Blocpdb> 15 atoms in block 109
Block first atom: 1644
Blocpdb> 13 atoms in block 110
Block first atom: 1659
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 1672
Blocpdb> 15 atoms in block 112
Block first atom: 1694
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1709
Blocpdb> 9 atoms in block 114
Block first atom: 1727
Blocpdb> 16 atoms in block 115
Block first atom: 1736
Blocpdb> 16 atoms in block 116
Block first atom: 1752
Blocpdb> 19 atoms in block 117
Block first atom: 1768
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1787
Blocpdb> 10 atoms in block 119
Block first atom: 1802
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1812
Blocpdb> 19 atoms in block 121
Block first atom: 1827
Blocpdb> 17 atoms in block 122
Block first atom: 1846
Blocpdb> 16 atoms in block 123
Block first atom: 1863
Blocpdb> 13 atoms in block 124
Block first atom: 1879
Blocpdb> 17 atoms in block 125
Block first atom: 1892
Blocpdb> 20 atoms in block 126
Block first atom: 1909
Blocpdb> 18 atoms in block 127
Block first atom: 1929
Blocpdb> 12 atoms in block 128
Block first atom: 1947
Blocpdb> 12 atoms in block 129
Block first atom: 1959
Blocpdb> 20 atoms in block 130
Block first atom: 1971
Blocpdb> 18 atoms in block 131
Block first atom: 1991
Blocpdb> 23 atoms in block 132
Block first atom: 2009
Blocpdb> 17 atoms in block 133
Block first atom: 2032
Blocpdb> 16 atoms in block 134
Block first atom: 2049
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 2065
Blocpdb> 19 atoms in block 136
Block first atom: 2084
Blocpdb> 14 atoms in block 137
Block first atom: 2103
Blocpdb> 17 atoms in block 138
Block first atom: 2117
Blocpdb> 16 atoms in block 139
Block first atom: 2134
Blocpdb> 12 atoms in block 140
Block first atom: 2150
Blocpdb> 18 atoms in block 141
Block first atom: 2162
Blocpdb> 19 atoms in block 142
Block first atom: 2180
Blocpdb> 12 atoms in block 143
Block first atom: 2199
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2211
Blocpdb> 12 atoms in block 145
Block first atom: 2228
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2240
Blocpdb> 13 atoms in block 147
Block first atom: 2257
Blocpdb> 13 atoms in block 148
Block first atom: 2270
Blocpdb> 16 atoms in block 149
Block first atom: 2283
Blocpdb> 18 atoms in block 150
Block first atom: 2299
Blocpdb> 12 atoms in block 151
Block first atom: 2317
Blocpdb> 15 atoms in block 152
Block first atom: 2329
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2344
Blocpdb> 22 atoms in block 154
Block first atom: 2360
Blocpdb> 8 atoms in block 155
Block first atom: 2382
Blocpdb> 17 atoms in block 156
Block first atom: 2390
Blocpdb> 14 atoms in block 157
Block first atom: 2407
Blocpdb> 17 atoms in block 158
Block first atom: 2421
Blocpdb> 14 atoms in block 159
Block first atom: 2437
Blocpdb> 159 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 889126 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7353
Prepmat> Matrix trace = 1943180.0000
Prepmat> Last element read: 7353 7353 36.6109
Prepmat> 12721 lines saved.
Prepmat> 11009 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2451
RTB> Total mass = 2451.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2451
RTB> Number of blocks = 159
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 211754.7057
RTB> 59211 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 954
Diagstd> Nb of non-zero elements: 59211
Diagstd> Projected matrix trace = 211754.7057
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 954 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 211754.7057
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.3588272 1.6987174 2.2676163 3.4766600
3.6089708 4.5705235 5.9799209 7.2093346 7.7074041
9.2764602 9.6256533 9.8373346 11.4699830 13.0592646
13.4353721 14.4677126 15.5968605 16.0868349 16.3704300
17.1251938 18.5956933 19.2443201 19.9240050 19.9720937
20.3742591 21.4197101 22.1951519 22.4922230 23.0497892
23.7526850 25.1864889 25.7160168 26.2564998 27.5357985
28.0352181 28.1793702 29.3268813 29.5238798 29.9750937
30.8037596 30.9968612 32.1452730 32.3837807 33.9041211
34.5902387 35.0890556 35.8922032 36.9172603 37.4856589
38.0388092 38.5695104 38.9625874 40.3238778 40.6344146
41.2405687 41.8704857 42.7359300 43.1162467 43.6794606
44.8279308 44.9302328 46.1623743 46.3891490 46.9839221
47.7762242 48.0214650 48.2052346 48.9621440 49.3983766
49.8297557 50.8565599 51.1933099 51.5589017 52.5320125
53.2127442 53.9317407 54.2848251 55.1901863 56.1914910
56.5185365 57.0158183 57.9744089 58.2932479 59.2812924
59.6498133 60.4757435 60.5322178 62.5974089 62.6708869
63.1009600 63.6328912 64.3406973 65.1061140 65.7319945
66.0721865 66.3602579 67.1405563 67.9506434 68.2207386
68.5881801
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034334 0.0034336 0.0034340 0.0034343
0.0034348 126.5835870 141.5323927 163.5234575 202.4773245
206.2941744 232.1551120 265.5479786 291.5700235 301.4736394
330.7397727 336.9072740 340.5916549 367.7703112 392.4231693
398.0339624 413.0429531 428.8583541 435.5425431 439.3648648
449.3792636 468.2755334 476.3723724 484.7118093 485.2964089
490.1581100 502.5763811 511.5927024 515.0050303 521.3492570
529.2387503 544.9781563 550.6772441 556.4340468 569.8284353
574.9727330 576.4490416 588.0689117 590.0407342 594.5324375
602.6943818 604.5805062 615.6782898 617.9581373 632.2975890
638.6634454 643.2519627 650.5719575 659.7965069 664.8564015
669.7438540 674.3996607 677.8274852 689.5669295 692.2170371
697.3609153 702.6665500 709.8913101 713.0430550 717.6850733
727.0589527 727.8880920 737.8011869 739.6112064 744.3375255
750.5872661 752.5112254 753.9497135 759.8458464 763.2232971
766.5485374 774.4061086 776.9657684 779.7351440 787.0590185
792.1421237 797.4757746 800.0820036 806.7262903 814.0115330
816.3769500 819.9605558 826.8247055 829.0952116 836.0920846
838.6868325 844.4732333 844.8674396 859.1588314 859.6629321
862.6075671 866.2357602 871.0401256 876.2058887 880.4074022
882.6827100 884.6048434 889.7904658 895.1422724 896.9195466
899.3317375
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2451
Rtb_to_modes> Number of blocs = 159
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.359
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.699
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.268
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.477
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.609
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.571
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.980
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.209
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.707
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.276
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.626
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.837
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.47
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.59
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 954 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998
0.99997 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00003 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997
1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 0.99998
0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 44118 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998
0.99997 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00003 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997
1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 0.99998
0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603191738254036268.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603191738254036268.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603191738254036268.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603191738254036268.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 317
First residue number = 3
Last residue number = 320
Number of atoms found = 2451
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.359
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.699
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.268
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.477
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.609
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.571
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.980
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.209
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.707
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.276
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.626
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.837
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.59
Bfactors> 106 vectors, 7353 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.359000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.557 for 319 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.033 +/- 0.04
Bfactors> = 52.042 +/- 17.48
Bfactors> Shiftng-fct= 52.008
Bfactors> Scaling-fct= 467.057
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603191738254036268.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603191738254036268.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.3
Chkmod> 106 vectors, 7353 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2451 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 93 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7504
0.0034 0.7509
0.0034 0.9387
0.0034 0.7068
0.0034 0.8502
0.0034 0.9484
126.5862 0.5094
141.5381 0.5511
163.5303 0.3915
202.4785 0.3421
206.2862 0.3657
232.1572 0.1328
265.5383 0.1602
291.5507 0.4684
301.4528 0.6282
330.7174 0.4940
336.8989 0.0885
340.5712 0.3849
367.7548 0.4747
392.4174 0.4103
398.0854 0.3030
413.0579 0.3786
428.8831 0.1540
435.5667 0.1867
439.3402 0.4040
449.4230 0.1985
468.3097 0.2827
476.2985 0.2236
484.6423 0.2550
485.2501 0.0702
490.0858 0.3914
502.5582 0.2961
511.6266 0.4478
514.9575 0.3811
521.3293 0.2559
529.1861 0.3903
544.9927 0.3470
550.6962 0.3231
556.4472 0.3013
569.8474 0.5072
574.9971 0.3801
576.4307 0.4555
588.0749 0.2267
589.9766 0.3182
594.5556 0.4887
602.6317 0.2273
604.5852 0.3558
615.6971 0.4416
617.8955 0.5207
632.2320 0.3025
638.6338 0.4322
643.2330 0.4662
650.5241 0.3874
659.7927 0.3036
664.8664 0.3341
669.7256 0.3430
674.3750 0.3385
677.7759 0.3677
689.5042 0.4156
692.1497 0.3433
697.3262 0.2962
702.6323 0.3025
709.8946 0.3895
713.0435 0.3868
717.6587 0.4629
727.0445 0.3735
727.8550 0.5021
737.7505 0.4547
739.5862 0.4164
744.2745 0.4248
750.5847 0.4630
752.4674 0.2984
753.9546 0.4844
759.7966 0.5309
763.2031 0.2306
766.5175 0.5074
774.3991 0.3561
776.9073 0.4277
779.7100 0.4437
787.0102 0.3923
792.0877 0.5755
797.4287 0.4034
800.0121 0.2957
806.6903 0.3375
813.9658 0.3443
816.3525 0.3812
819.9554 0.3985
826.7578 0.3079
829.0365 0.3908
836.0471 0.4551
838.6521 0.3868
844.4667 0.4881
844.8157 0.3924
859.1397 0.5268
859.6199 0.3548
862.5640 0.4888
866.1789 0.4346
870.9980 0.4345
876.1944 0.4261
880.3563 0.4067
882.6302 0.4211
884.5652 0.4794
889.7486 0.3528
895.0996 0.5229
896.8762 0.4796
899.3051 0.4694
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2603191738254036268.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603191738254036268.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2603191738254036268.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603191738254036268.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2603191738254036268.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2603191738254036268.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.3
Projmod> 106 vectors, 7353 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 317
First residue number = 3
Last residue number = 320
Number of atoms found = 2451
Mean number per residue = 7.7
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 317
First residue number = 2
Last residue number = 318
Number of atoms found = 2454
Mean number per residue = 7.7
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 482 of first conformer: PRO 65 N not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603191738254036268 7 -100 100 20 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 315 2.357 275 1.593
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 315 2.086 290 1.516
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 315 1.860 297 1.343
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 315 1.699 301 1.204
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 315 1.621 302 1.155
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 315 1.639 298 1.161
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 315 1.749 292 1.217
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 315 1.935 284 1.291
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 315 2.179 274 1.323
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 315 2.463 263 1.377
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 315 2.774 251 1.413
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603191738254036268 8 -100 100 20 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 315 2.755 265 1.621
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 315 2.445 276 1.525
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 315 2.164 282 1.406
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 315 1.924 293 1.334
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 315 1.742 298 1.232
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 315 1.639 298 1.161
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 315 1.628 300 1.216
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 315 1.712 295 1.283
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 315 1.878 286 1.385
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 315 2.106 273 1.458
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 315 2.379 258 1.489
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603191738254036268 9 -100 100 20 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 315 1.370 306 1.123
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 315 1.215 306 0.921
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 315 1.165 306 0.827
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 315 1.232 306 0.861
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 315 1.401 306 1.020
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 315 1.639 298 1.161
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 315 1.921 291 1.336
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 315 2.231 274 1.422
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 315 2.558 257 1.463
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 315 2.896 243 1.477
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 315 3.243 229 1.472
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603191738254036268 10 -100 100 20 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 315 2.217 283 1.475
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 315 1.989 290 1.365
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 315 1.805 296 1.276
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 315 1.677 296 1.178
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 315 1.619 301 1.194
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 315 1.639 298 1.161
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 315 1.734 297 1.193
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 315 1.893 292 1.257
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 315 2.101 281 1.280
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 315 2.345 271 1.338
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 315 2.616 261 1.409
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603191738254036268 11 -100 100 20 0 on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603191738254036268.eigenfacs
2603191738254036268.atom
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 315 2.176 273 1.470
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 315 1.941 286 1.392
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 315 1.754 294 1.265
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 315 1.633 297 1.154
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 315 1.593 296 1.081
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 315 1.639 298 1.161
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 315 1.765 297 1.274
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 315 1.955 290 1.350
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 315 2.193 283 1.445
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 315 2.464 273 1.503
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 315 2.760 263 1.594
2603191738254036268.10.pdb
2603191738254036268.11.pdb
2603191738254036268.7.pdb
2603191738254036268.8.pdb
2603191738254036268.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m12.275s
user 0m12.199s
sys 0m0.072s
rm: cannot remove '2603191738254036268.sdijf': No such file or directory
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