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elNémo has been hacked on november 27th.
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* birA_2ewn_btx_a_Gly118 *

LOGs for ID: 2603192002464052742

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603192002464052742.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603192002464052742.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603192002464052742.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    318
            First residue number     =      3
            Last  residue number     =    320
            Number of atoms found    =   2448
            Mean number per residue  =      7.7

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    37.665575 +/-    12.807961 From:     7.964000 To:    70.407000
 =    42.666616 +/-    14.987537 From:     7.394000 To:    80.384000
 =   -16.870761 +/-     7.794909 From:   -38.544000 To:     1.691000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.2767 % Filled.
 Pdbmat>       883762  non-zero elements.
 Pdbmat>        96586 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     78.91 +/-     22.49
         Maximum number =    130
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.931720E+06
 Pdbmat> Larger element =  483.161    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
318 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603192002464052742.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603192002464052742.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603192002464052742.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2448 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   318 residues.
 Blocpdb>    16 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    14 atoms in block      2
 Block first atom:     17
 Blocpdb>    15 atoms in block      3
 Block first atom:     31
 Blocpdb>    17 atoms in block      4
 Block first atom:     46
 Blocpdb>    13 atoms in block      5
 Block first atom:     63
 Blocpdb>    16 atoms in block      6
 Block first atom:     76
 Blocpdb>    13 atoms in block      7
 Block first atom:     92
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    105
 Blocpdb>    21 atoms in block      9
 Block first atom:    118
 Blocpdb>    10 atoms in block     10
 Block first atom:    139
 Blocpdb>    18 atoms in block     11
 Block first atom:    149
 Blocpdb>    12 atoms in block     12
 Block first atom:    167
 Blocpdb>    16 atoms in block     13
 Block first atom:    179
 Blocpdb>    12 atoms in block     14
 Block first atom:    195
 Blocpdb>    14 atoms in block     15
 Block first atom:    207
 Blocpdb>    16 atoms in block     16
 Block first atom:    221
 Blocpdb>    13 atoms in block     17
 Block first atom:    237
 Blocpdb>    17 atoms in block     18
 Block first atom:    250
 Blocpdb>    18 atoms in block     19
 Block first atom:    267
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    285
 Blocpdb>    19 atoms in block     21
 Block first atom:    301
 Blocpdb>    22 atoms in block     22
 Block first atom:    320
 Blocpdb>    11 atoms in block     23
 Block first atom:    342
 Blocpdb>    15 atoms in block     24
 Block first atom:    353
 Blocpdb>    18 atoms in block     25
 Block first atom:    368
 Blocpdb>    14 atoms in block     26
 Block first atom:    386
 Blocpdb>    13 atoms in block     27
 Block first atom:    400
 Blocpdb>    16 atoms in block     28
 Block first atom:    413
 Blocpdb>    14 atoms in block     29
 Block first atom:    429
 Blocpdb>    16 atoms in block     30
 Block first atom:    443
 Blocpdb>    15 atoms in block     31
 Block first atom:    459
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    474
 Blocpdb>    16 atoms in block     33
 Block first atom:    491
 Blocpdb>    14 atoms in block     34
 Block first atom:    507
 Blocpdb>    17 atoms in block     35
 Block first atom:    521
 Blocpdb>    12 atoms in block     36
 Block first atom:    538
 Blocpdb>    17 atoms in block     37
 Block first atom:    550
 Blocpdb>    12 atoms in block     38
 Block first atom:    567
 Blocpdb>    10 atoms in block     39
 Block first atom:    579
 Blocpdb>    12 atoms in block     40
 Block first atom:    589
 Blocpdb>    15 atoms in block     41
 Block first atom:    601
 Blocpdb>    14 atoms in block     42
 Block first atom:    616
 Blocpdb>    16 atoms in block     43
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    13 atoms in block     44
 Block first atom:    646
 Blocpdb>    17 atoms in block     45
 Block first atom:    659
 Blocpdb>    20 atoms in block     46
 Block first atom:    676
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    19 atoms in block     48
 Block first atom:    712
 Blocpdb>    13 atoms in block     49
 Block first atom:    731
 Blocpdb>    17 atoms in block     50
 Block first atom:    744
 Blocpdb>    10 atoms in block     51
 Block first atom:    761
 Blocpdb>    13 atoms in block     52
 Block first atom:    771
 Blocpdb>    14 atoms in block     53
 Block first atom:    784
 Blocpdb>    14 atoms in block     54
 Block first atom:    798
 Blocpdb>    21 atoms in block     55
 Block first atom:    812
 Blocpdb>    14 atoms in block     56
 Block first atom:    833
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:    847
 Blocpdb>     8 atoms in block     58
 Block first atom:    862
 Blocpdb>    15 atoms in block     59
 Block first atom:    870
 Blocpdb>    20 atoms in block     60
 Block first atom:    885
 Blocpdb>    25 atoms in block     61
 Block first atom:    905
 Blocpdb>    13 atoms in block     62
 Block first atom:    930
 Blocpdb>    15 atoms in block     63
 Block first atom:    943
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:    958
 Blocpdb>    20 atoms in block     65
 Block first atom:    971
 Blocpdb>    14 atoms in block     66
 Block first atom:    991
 Blocpdb>    19 atoms in block     67
 Block first atom:   1005
 Blocpdb>    25 atoms in block     68
 Block first atom:   1024
 Blocpdb>    17 atoms in block     69
 Block first atom:   1049
 Blocpdb>    13 atoms in block     70
 Block first atom:   1066
 Blocpdb>    12 atoms in block     71
 Block first atom:   1079
 Blocpdb>    10 atoms in block     72
 Block first atom:   1091
 Blocpdb>    12 atoms in block     73
 Block first atom:   1101
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1113
 Blocpdb>    15 atoms in block     75
 Block first atom:   1127
 Blocpdb>    12 atoms in block     76
 Block first atom:   1142
 Blocpdb>    15 atoms in block     77
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    13 atoms in block     78
 Block first atom:   1169
 Blocpdb>    16 atoms in block     79
 Block first atom:   1182
 Blocpdb>    19 atoms in block     80
 Block first atom:   1198
 Blocpdb>    17 atoms in block     81
 Block first atom:   1217
 Blocpdb>     9 atoms in block     82
 Block first atom:   1234
 Blocpdb>    17 atoms in block     83
 Block first atom:   1243
 Blocpdb>    18 atoms in block     84
 Block first atom:   1260
 Blocpdb>    16 atoms in block     85
 Block first atom:   1278
 Blocpdb>    21 atoms in block     86
 Block first atom:   1294
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1315
 Blocpdb>    20 atoms in block     88
 Block first atom:   1331
 Blocpdb>    17 atoms in block     89
 Block first atom:   1351
 Blocpdb>    19 atoms in block     90
 Block first atom:   1368
 Blocpdb>    17 atoms in block     91
 Block first atom:   1387
 Blocpdb>     9 atoms in block     92
 Block first atom:   1404
 Blocpdb>    16 atoms in block     93
 Block first atom:   1413
 Blocpdb>    16 atoms in block     94
 Block first atom:   1429
 Blocpdb>    15 atoms in block     95
 Block first atom:   1445
 Blocpdb>    13 atoms in block     96
 Block first atom:   1460
 Blocpdb>    11 atoms in block     97
 Block first atom:   1473
 Blocpdb>    13 atoms in block     98
 Block first atom:   1484
 Blocpdb>    14 atoms in block     99
 Block first atom:   1497
 Blocpdb>    15 atoms in block    100
 Block first atom:   1511
 Blocpdb>    12 atoms in block    101
 Block first atom:   1526
 Blocpdb>     9 atoms in block    102
 Block first atom:   1538
 Blocpdb>    16 atoms in block    103
 Block first atom:   1547
 Blocpdb>    13 atoms in block    104
 Block first atom:   1563
 Blocpdb>    19 atoms in block    105
 Block first atom:   1576
 Blocpdb>    18 atoms in block    106
 Block first atom:   1595
 Blocpdb>    18 atoms in block    107
 Block first atom:   1613
 Blocpdb>    13 atoms in block    108
 Block first atom:   1631
 Blocpdb>    15 atoms in block    109
 Block first atom:   1644
 Blocpdb>    13 atoms in block    110
 Block first atom:   1659
 Blocpdb>    22 atoms in block    111
 Block first atom:   1672
 Blocpdb>    15 atoms in block    112
 Block first atom:   1694
 Blocpdb>    18 atoms in block    113
 Block first atom:   1709
 Blocpdb>     9 atoms in block    114
 Block first atom:   1727
 Blocpdb>    16 atoms in block    115
 Block first atom:   1736
 Blocpdb>    16 atoms in block    116
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    19 atoms in block    117
 Block first atom:   1768
 Blocpdb>    15 atoms in block    118
 Block first atom:   1787
 Blocpdb>    10 atoms in block    119
 Block first atom:   1802
 Blocpdb>    16 atoms in block    120
 Block first atom:   1812
 Blocpdb>    19 atoms in block    121
 Block first atom:   1828
 Blocpdb>    17 atoms in block    122
 Block first atom:   1847
 Blocpdb>    16 atoms in block    123
 Block first atom:   1864
 Blocpdb>    13 atoms in block    124
 Block first atom:   1880
 Blocpdb>    17 atoms in block    125
 Block first atom:   1893
 Blocpdb>    20 atoms in block    126
 Block first atom:   1910
 Blocpdb>    18 atoms in block    127
 Block first atom:   1930
 Blocpdb>    12 atoms in block    128
 Block first atom:   1948
 Blocpdb>    12 atoms in block    129
 Block first atom:   1960
 Blocpdb>    20 atoms in block    130
 Block first atom:   1972
 Blocpdb>    17 atoms in block    131
 Block first atom:   1992
 Blocpdb>    23 atoms in block    132
 Block first atom:   2009
 Blocpdb>    17 atoms in block    133
 Block first atom:   2032
 Blocpdb>    16 atoms in block    134
 Block first atom:   2049
 Blocpdb>    19 atoms in block    135
 Block first atom:   2065
 Blocpdb>    19 atoms in block    136
 Block first atom:   2084
 Blocpdb>    14 atoms in block    137
 Block first atom:   2103
 Blocpdb>    17 atoms in block    138
 Block first atom:   2117
 Blocpdb>    16 atoms in block    139
 Block first atom:   2134
 Blocpdb>    12 atoms in block    140
 Block first atom:   2150
 Blocpdb>    18 atoms in block    141
 Block first atom:   2162
 Blocpdb>    19 atoms in block    142
 Block first atom:   2180
 Blocpdb>    12 atoms in block    143
 Block first atom:   2199
 Blocpdb>    17 atoms in block    144
 Block first atom:   2211
 Blocpdb>    12 atoms in block    145
 Block first atom:   2228
 Blocpdb>    17 atoms in block    146
 Block first atom:   2240
 Blocpdb>    13 atoms in block    147
 Block first atom:   2257
 Blocpdb>    13 atoms in block    148
 Block first atom:   2270
 Blocpdb>    16 atoms in block    149
 Block first atom:   2283
 Blocpdb>    18 atoms in block    150
 Block first atom:   2299
 Blocpdb>    12 atoms in block    151
 Block first atom:   2317
 Blocpdb>    16 atoms in block    152
 Block first atom:   2329
 Blocpdb>    16 atoms in block    153
 Block first atom:   2345
 Blocpdb>    22 atoms in block    154
 Block first atom:   2361
 Blocpdb>     8 atoms in block    155
 Block first atom:   2383
 Blocpdb>    17 atoms in block    156
 Block first atom:   2391
 Blocpdb>    14 atoms in block    157
 Block first atom:   2408
 Blocpdb>    17 atoms in block    158
 Block first atom:   2422
 Blocpdb>    10 atoms in block    159
 Block first atom:   2438

 Blocpdb>   159 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       883921 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       7344

 Prepmat> Matrix trace    =    1931720.0000
 Prepmat> Last element read:    7344   7344        12.1998
 Prepmat>        12721 lines saved.
 Prepmat>        11033 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2448
 RTB> Total mass =        2448.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2448
 RTB> Number of blocks =   159
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  210653.8495
 RTB>     58347 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      954
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    58347
 Diagstd> Projected matrix trace =  210653.8495

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    954 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 210653.8495
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.8302388      1.4173953      1.7659731      1.8243161
      2.4524125      2.6564265      3.6844642      4.5707216      5.1523428
      6.8946206      7.6614776      8.8307868     10.0368413     10.7297736
     11.3674277     12.4072019     12.6556387     14.5028529     15.6337891
     16.3370176     16.5682136     17.0460124     18.1179826     18.4447532
     19.1973468     19.5161891     20.3908010     20.8089988     21.3687801
     21.7923641     21.8813612     22.7564166     23.4152860     23.6605516
     24.3668837     25.5203387     25.7003846     26.3625431     27.1946755
     27.6532042     28.0164989     29.2203888     29.8828056     30.9892983
     31.8547303     32.2752082     33.2440724     33.8536305     34.3504849
     35.0165264     35.2944955     36.0205765     37.0903859     37.4693379
     38.7914568     39.2424039     39.8906501     40.7354585     41.3009567
     42.1200059     42.4175842     42.8453274     43.6223946     43.8193053
     44.9669484     45.4903385     45.9661496     46.6447540     46.8464815
     47.3654253     48.0683044     49.1332338     49.8665740     50.4627533
     50.9430479     51.0561630     51.5920811     52.3269401     52.8297143
     53.2709520     54.5294110     55.4874442     55.5156906     56.0719821
     56.6187807     57.4756521     58.1349975     59.0108594     59.4591465
     61.1441220     61.2257202     61.6193914     61.7325577     62.4207174
     62.6973605     63.6766060     64.2848165     64.5385156     65.5642939
     66.2383397

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034310      0.0034321      0.0034326      0.0034329      0.0034331
      0.0034331     98.9456713    129.2828065    144.3069730    146.6713616
    170.0560331    176.9881483    208.4406662    232.1601443    246.4890638
    285.1349594    300.5740948    322.6970394    344.0280140    355.7054828
    366.1224680    382.5006740    386.3112129    413.5442636    429.3657558
    438.9162583    442.0110463    448.3391669    462.2215606    466.3711803
    475.7906310    479.7254827    490.3570493    495.3599297    501.9785333
    506.9293698    507.9634303    518.0208233    525.4664752    528.2113302
    536.0376268    548.5781393    550.5098466    557.5565627    566.2878203
    571.0419458    574.7807459    587.0002352    593.6165011    604.5067460
    612.8895922    616.9213591    626.1125228    631.8265989    636.4462275
    642.5868168    645.1322750    651.7343477    661.3417743    664.7116493
    676.3372778    680.2570978    685.8526760    693.0771558    697.8712969
    704.7571521    707.2423286    710.7993353    717.2161021    718.8330301
    728.1854355    732.4110108    736.2314121    741.6460429    743.2480345
    747.3533761    752.8781295    761.1722639    766.8316794    771.4019836
    775.0643165    775.9243250    779.9859929    785.5212714    789.2860212
    792.5752557    801.8824039    808.8959129    809.1017745    813.1454464
    817.1006136    823.2604156    827.9690625    834.1828366    837.3453555
    849.1269734    849.6933739    852.4206903    853.2030821    857.9454157
    859.8444831    866.5332538    870.6617884    872.3781236    879.2836030
    883.7918642

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2448
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    159

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9828E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9895E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9939E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9948E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9952E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8302    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.417    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.766    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.824    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.452    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.656    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.684    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.571    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.152    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.895    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.661    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.831    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.24    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    954 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997
 1.00000 1.00002 1.00001 0.99996 0.99996
 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001
 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999
 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996
 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998
 1.00001 1.00000 0.99994 0.99998 1.00002
 1.00001 1.00002 0.99998 1.00003 0.99999
 0.99999 0.99996 1.00002 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998
 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    44064 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997
 1.00000 1.00002 1.00001 0.99996 0.99996
 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001
 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999
 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996
 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998
 1.00001 1.00000 0.99994 0.99998 1.00002
 1.00001 1.00002 0.99998 1.00003 0.99999
 0.99999 0.99996 1.00002 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998
 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998
 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001
 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector  10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603192002464052742.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603192002464052742.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603192002464052742.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603192002464052742.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    318
            First residue number     =      3
            Last  residue number     =    320
            Number of atoms found    =   2448
            Mean number per residue  =      7.7

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9828E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9895E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9939E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9948E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9952E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8302    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.417    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.766    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.824    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.452    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.656    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.684    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.571    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.152    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.895    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.661    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.831    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.24    

 Bfactors>  106 vectors,   7344 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.830200
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.157 for    318 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.050 +/-   0.25
 Bfactors> =     57.769 +/-  26.26
 Bfactors> Shiftng-fct=     57.720
 Bfactors> Scaling-fct=    106.761

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603192002464052742.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603192002464052742.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4309E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   626.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   631.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   645.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   651.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   661.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   664.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   676.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   680.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   685.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   693.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   697.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   704.7    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   710.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   717.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   718.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   736.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   741.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   743.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   747.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   752.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   761.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   766.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   771.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   775.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   775.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   779.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   785.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   789.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   792.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   801.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   808.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   809.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   813.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   817.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   823.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   827.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   834.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   837.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   849.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   849.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   852.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   853.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   859.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   866.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   870.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   872.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   879.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.8    

 Chkmod>  106 vectors,   7344 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2448 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector     9 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    38 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7118
      0.0034      0.7059
      0.0034      0.8733
      0.0034      0.9157
      0.0034      0.7034
      0.0034      0.9460
     98.9391      0.0042
    129.2592      0.4351
    144.3019      0.0326
    146.6524      0.3752
    170.0344      0.2840
    176.9663      0.0059
    208.4186      0.5051
    232.1572      0.5437
    246.4703      0.3147
    285.1306      0.4193
    300.5518      0.5909
    322.6871      0.4395
    344.0674      0.0301
    355.6940      0.3222
    366.1482      0.4594
    382.5274      0.2756
    386.3612      0.3898
    413.4858      0.3786
    429.2953      0.3922
    438.9375      0.1589
    442.0159      0.2343
    448.3724      0.2568
    462.2275      0.2597
    466.2911      0.2318
    475.8031      0.3370
    479.7517      0.3806
    490.3264      0.3668
    495.3506      0.3779
    501.9713      0.2127
    506.8801      0.3081
    507.9258      0.2526
    518.0394      0.3750
    525.4968      0.2084
    528.1825      0.1919
    536.0489      0.3829
    548.5510      0.2798
    550.4821      0.1729
    557.5057      0.1001
    566.2148      0.5829
    570.9843      0.3705
    574.7920      0.4384
    586.9711      0.2175
    593.5632      0.3886
    604.4876      0.3470
    612.8178      0.4713
    616.9407      0.3428
    626.0473      0.3772
    631.7656      0.3403
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    642.5911      0.3067
    645.0635      0.3642
    651.7012      0.2725
    661.3099      0.1506
    664.6890      0.3126
    676.2955      0.4146
    680.2071      0.4966
    685.8176      0.3996
    693.0860      0.3691
    697.8333      0.3163
    704.7268      0.3603
    707.2321      0.3649
    710.8076      0.4677
    717.1656      0.2491
    718.8079      0.4007
    728.1789      0.4041
    732.3768      0.3302
    736.2306      0.5026
    741.5764      0.3103
    743.2440      0.3301
    747.3574      0.4812
    752.8591      0.4235
    761.1145      0.2249
    766.8251      0.4832
    771.3478      0.4469
    775.0079      0.4626
    775.9202      0.5198
    779.9368      0.3714
    785.5105      0.4422
    789.2543      0.4636
    792.5342      0.3449
    801.8523      0.3981
    808.8798      0.4183
    809.0984      0.4127
    813.0962      0.3291
    817.0743      0.3858
    823.2562      0.4787
    827.8979      0.4374
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    849.6866      0.2759
    852.3883      0.4367
    853.1488      0.3536
    857.9037      0.2311
    859.8257      0.4902
    866.5191      0.3664
    870.5918      0.5350
    872.3507      0.4565
    879.2171      0.4313
    883.7650      0.4046
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603192002464052742 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2603192002464052742.atom
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m12.061s
user	0m11.999s
sys	0m0.060s
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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