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elNémo has been hacked on november 27th.
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* birA_2ewn_btx_b_Gly118 *

LOGs for ID: 2603192008384055873

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603192008384055873.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603192008384055873.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603192008384055873.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    317
            First residue number     =      2
            Last  residue number     =    318
            Number of atoms found    =   2447
            Mean number per residue  =      7.7

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    37.617975 +/-    12.856654 From:     7.705000 To:    70.835000
 =    42.503942 +/-    14.874469 From:     7.172000 To:    79.302000
 =   -16.921897 +/-     7.895072 From:   -38.890000 To:     1.511000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.2632 % Filled.
 Pdbmat>       879384  non-zero elements.
 Pdbmat>        96093 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     78.54 +/-     22.39
         Maximum number =    127
         Minimum number =     14

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.921860E+06
 Pdbmat> Larger element =  482.881    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
317 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603192008384055873.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603192008384055873.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603192008384055873.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2447 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   317 residues.
 Blocpdb>    17 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    15 atoms in block      2
 Block first atom:     18
 Blocpdb>    14 atoms in block      3
 Block first atom:     33
 Blocpdb>    17 atoms in block      4
 Block first atom:     47
 Blocpdb>    16 atoms in block      5
 Block first atom:     64
 Blocpdb>    13 atoms in block      6
 Block first atom:     80
 Blocpdb>    13 atoms in block      7
 Block first atom:     93
 Blocpdb>    12 atoms in block      8
 Block first atom:    106
 Blocpdb>    20 atoms in block      9
 Block first atom:    118
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    138
 Blocpdb>    13 atoms in block     11
 Block first atom:    154
 Blocpdb>    17 atoms in block     12
 Block first atom:    167
 Blocpdb>    13 atoms in block     13
 Block first atom:    184
 Blocpdb>    15 atoms in block     14
 Block first atom:    197
 Blocpdb>    12 atoms in block     15
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    17 atoms in block     16
 Block first atom:    224
 Blocpdb>    10 atoms in block     17
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    16 atoms in block     18
 Block first atom:    251
 Blocpdb>    19 atoms in block     19
 Block first atom:    267
 Blocpdb>    17 atoms in block     20
 Block first atom:    286
 Blocpdb>    15 atoms in block     21
 Block first atom:    303
 Blocpdb>    19 atoms in block     22
 Block first atom:    318
 Blocpdb>    18 atoms in block     23
 Block first atom:    337
 Blocpdb>    15 atoms in block     24
 Block first atom:    355
 Blocpdb>    18 atoms in block     25
 Block first atom:    370
 Blocpdb>    14 atoms in block     26
 Block first atom:    388
 Blocpdb>    11 atoms in block     27
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    13 atoms in block     28
 Block first atom:    413
 Blocpdb>    18 atoms in block     29
 Block first atom:    426
 Blocpdb>    15 atoms in block     30
 Block first atom:    444
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    459
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    475
 Blocpdb>    16 atoms in block     33
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    13 atoms in block     34
 Block first atom:    508
 Blocpdb>    18 atoms in block     35
 Block first atom:    521
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    539
 Blocpdb>    13 atoms in block     37
 Block first atom:    555
 Blocpdb>    16 atoms in block     38
 Block first atom:    568
 Blocpdb>     8 atoms in block     39
 Block first atom:    584
 Blocpdb>    13 atoms in block     40
 Block first atom:    592
 Blocpdb>    12 atoms in block     41
 Block first atom:    605
 Blocpdb>    15 atoms in block     42
 Block first atom:    617
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    632
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    647
 Blocpdb>    15 atoms in block     45
 Block first atom:    661
 Blocpdb>    21 atoms in block     46
 Block first atom:    676
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    697
 Blocpdb>    19 atoms in block     48
 Block first atom:    713
 Blocpdb>    12 atoms in block     49
 Block first atom:    732
 Blocpdb>    17 atoms in block     50
 Block first atom:    744
 Blocpdb>    15 atoms in block     51
 Block first atom:    761
 Blocpdb>    12 atoms in block     52
 Block first atom:    776
 Blocpdb>    11 atoms in block     53
 Block first atom:    788
 Blocpdb>    13 atoms in block     54
 Block first atom:    799
 Blocpdb>    21 atoms in block     55
 Block first atom:    812
 Blocpdb>    18 atoms in block     56
 Block first atom:    833
 Blocpdb>     9 atoms in block     57
 Block first atom:    851
 Blocpdb>    15 atoms in block     58
 Block first atom:    860
 Blocpdb>    15 atoms in block     59
 Block first atom:    875
 Blocpdb>    15 atoms in block     60
 Block first atom:    890
 Blocpdb>    23 atoms in block     61
 Block first atom:    905
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:    928
 Blocpdb>    18 atoms in block     63
 Block first atom:    945
 Blocpdb>     9 atoms in block     64
 Block first atom:    963
 Blocpdb>    16 atoms in block     65
 Block first atom:    972
 Blocpdb>    20 atoms in block     66
 Block first atom:    988
 Blocpdb>    14 atoms in block     67
 Block first atom:   1008
 Blocpdb>    25 atoms in block     68
 Block first atom:   1022
 Blocpdb>    19 atoms in block     69
 Block first atom:   1047
 Blocpdb>    18 atoms in block     70
 Block first atom:   1066
 Blocpdb>    11 atoms in block     71
 Block first atom:   1084
 Blocpdb>    10 atoms in block     72
 Block first atom:   1095
 Blocpdb>    13 atoms in block     73
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    12 atoms in block     74
 Block first atom:   1118
 Blocpdb>    14 atoms in block     75
 Block first atom:   1130
 Blocpdb>    15 atoms in block     76
 Block first atom:   1144
 Blocpdb>    12 atoms in block     77
 Block first atom:   1159
 Blocpdb>    15 atoms in block     78
 Block first atom:   1171
 Blocpdb>    14 atoms in block     79
 Block first atom:   1186
 Blocpdb>    15 atoms in block     80
 Block first atom:   1200
 Blocpdb>    20 atoms in block     81
 Block first atom:   1215
 Blocpdb>    12 atoms in block     82
 Block first atom:   1235
 Blocpdb>    13 atoms in block     83
 Block first atom:   1247
 Blocpdb>    16 atoms in block     84
 Block first atom:   1260
 Blocpdb>    18 atoms in block     85
 Block first atom:   1276
 Blocpdb>    23 atoms in block     86
 Block first atom:   1294
 Blocpdb>    15 atoms in block     87
 Block first atom:   1317
 Blocpdb>    16 atoms in block     88
 Block first atom:   1332
 Blocpdb>    20 atoms in block     89
 Block first atom:   1348
 Blocpdb>    17 atoms in block     90
 Block first atom:   1368
 Blocpdb>    20 atoms in block     91
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    13 atoms in block     92
 Block first atom:   1405
 Blocpdb>    12 atoms in block     93
 Block first atom:   1418
 Blocpdb>    15 atoms in block     94
 Block first atom:   1430
 Blocpdb>    17 atoms in block     95
 Block first atom:   1445
 Blocpdb>    11 atoms in block     96
 Block first atom:   1462
 Blocpdb>    16 atoms in block     97
 Block first atom:   1473
 Blocpdb>    12 atoms in block     98
 Block first atom:   1489
 Blocpdb>    10 atoms in block     99
 Block first atom:   1501
 Blocpdb>    17 atoms in block    100
 Block first atom:   1511
 Blocpdb>    15 atoms in block    101
 Block first atom:   1528
 Blocpdb>     9 atoms in block    102
 Block first atom:   1543
 Blocpdb>    12 atoms in block    103
 Block first atom:   1552
 Blocpdb>    16 atoms in block    104
 Block first atom:   1564
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1580
 Blocpdb>    22 atoms in block    106
 Block first atom:   1593
 Blocpdb>    16 atoms in block    107
 Block first atom:   1615
 Blocpdb>    15 atoms in block    108
 Block first atom:   1631
 Blocpdb>    14 atoms in block    109
 Block first atom:   1646
 Blocpdb>    17 atoms in block    110
 Block first atom:   1660
 Blocpdb>    18 atoms in block    111
 Block first atom:   1677
 Blocpdb>    15 atoms in block    112
 Block first atom:   1695
 Blocpdb>    17 atoms in block    113
 Block first atom:   1710
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1727
 Blocpdb>    12 atoms in block    115
 Block first atom:   1741
 Blocpdb>    16 atoms in block    116
 Block first atom:   1753
 Blocpdb>    19 atoms in block    117
 Block first atom:   1769
 Blocpdb>    15 atoms in block    118
 Block first atom:   1788
 Blocpdb>    13 atoms in block    119
 Block first atom:   1803
 Blocpdb>    13 atoms in block    120
 Block first atom:   1816
 Blocpdb>    16 atoms in block    121
 Block first atom:   1829
 Blocpdb>    20 atoms in block    122
 Block first atom:   1845
 Blocpdb>    19 atoms in block    123
 Block first atom:   1865
 Blocpdb>    10 atoms in block    124
 Block first atom:   1884
 Blocpdb>    17 atoms in block    125
 Block first atom:   1894
 Blocpdb>    19 atoms in block    126
 Block first atom:   1911
 Blocpdb>    18 atoms in block    127
 Block first atom:   1930
 Blocpdb>    13 atoms in block    128
 Block first atom:   1948
 Blocpdb>    13 atoms in block    129
 Block first atom:   1961
 Blocpdb>    19 atoms in block    130
 Block first atom:   1974
 Blocpdb>    14 atoms in block    131
 Block first atom:   1993
 Blocpdb>    25 atoms in block    132
 Block first atom:   2007
 Blocpdb>    18 atoms in block    133
 Block first atom:   2032
 Blocpdb>    16 atoms in block    134
 Block first atom:   2050
 Blocpdb>    19 atoms in block    135
 Block first atom:   2066
 Blocpdb>    16 atoms in block    136
 Block first atom:   2085
 Blocpdb>    18 atoms in block    137
 Block first atom:   2101
 Blocpdb>    16 atoms in block    138
 Block first atom:   2119
 Blocpdb>    16 atoms in block    139
 Block first atom:   2135
 Blocpdb>    12 atoms in block    140
 Block first atom:   2151
 Blocpdb>    17 atoms in block    141
 Block first atom:   2163
 Blocpdb>    17 atoms in block    142
 Block first atom:   2180
 Blocpdb>    15 atoms in block    143
 Block first atom:   2197
 Blocpdb>    14 atoms in block    144
 Block first atom:   2212
 Blocpdb>    15 atoms in block    145
 Block first atom:   2226
 Blocpdb>    16 atoms in block    146
 Block first atom:   2241
 Blocpdb>    18 atoms in block    147
 Block first atom:   2257
 Blocpdb>     9 atoms in block    148
 Block first atom:   2275
 Blocpdb>    16 atoms in block    149
 Block first atom:   2284
 Blocpdb>    17 atoms in block    150
 Block first atom:   2300
 Blocpdb>    17 atoms in block    151
 Block first atom:   2317
 Blocpdb>    12 atoms in block    152
 Block first atom:   2334
 Blocpdb>    17 atoms in block    153
 Block first atom:   2346
 Blocpdb>    21 atoms in block    154
 Block first atom:   2363
 Blocpdb>    12 atoms in block    155
 Block first atom:   2384
 Blocpdb>    13 atoms in block    156
 Block first atom:   2396
 Blocpdb>    14 atoms in block    157
 Block first atom:   2409
 Blocpdb>    19 atoms in block    158
 Block first atom:   2423
 Blocpdb>     6 atoms in block    159
 Block first atom:   2441

 Blocpdb>   159 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     6 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       879543 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       7341

 Prepmat> Matrix trace    =    1921860.0000
 Prepmat> Last element read:    7341   7341        22.7923
 Prepmat>        12721 lines saved.
 Prepmat>        11040 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2447
 RTB> Total mass =        2447.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2447
 RTB> Number of blocks =   159
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  209086.4345
 RTB>     58095 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      954
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    58095
 Diagstd> Projected matrix trace =  209086.4345

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    954 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 209086.4345
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.4563165      1.8244762      2.3222682      3.5328858
      4.2796245      4.6179000      4.9913680      7.0045777      7.3367875
      7.7384979      8.8152656     10.0524177     11.2557637     11.8072877
     12.3419989     12.8098903     13.1289018     14.3350723     14.9471158
     15.4616657     15.6647299     16.1154258     16.5938986     17.2794578
     17.7599190     18.7747152     19.7710167     20.4624725     20.9249986
     21.2721538     21.6605593     22.3273219     23.0950572     23.2050806
     24.4042827     25.1613191     25.5838541     26.3844820     26.8869445
     27.2761766     27.5951698     28.4386788     29.5541249     29.7530799
     30.2278444     31.9278469     32.0179608     32.7358238     33.0823482
     33.6928909     34.6036821     35.4127329     35.6135767     36.6335771
     37.3615436     37.9460206     38.5062141     39.2900891     39.8882182
     41.7357693     42.3460042     42.5089375     43.4016880     43.6003293
     44.3196913     45.4741772     45.4810082     46.3921839     46.9682043
     48.0877995     48.2233107     48.8287102     49.2343280     49.6826140
     50.3035015     50.4779743     51.9122353     52.2571800     53.1250042
     53.4372835     53.7863820     53.9936296     54.5816860     56.3495983
     56.4233732     57.1817861     57.7261335     58.3179260     58.6658796
     59.4977709     59.9732363     60.2608613     61.1928859     61.5080681
     62.6386174     63.1845051     63.4471584     64.3287686     64.6124144
     65.7746415

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034330      0.0034330      0.0034332      0.0034337      0.0034339
      0.0034360    131.0458177    146.6777998    165.4822680    204.1080248
    224.6457006    233.3552329    242.6079759    287.3996652    294.1360473
    302.0811414    322.4133237    344.2948640    364.3197904    373.1387502
    381.4942808    388.6583351    393.4680560    411.1451997    419.8304941
    426.9956196    429.7904244    435.9294131    442.3535284    451.3987328
    457.6313533    470.5241936    482.8472715    491.2180699    496.7387029
    500.8423128    505.3940375    513.1136848    521.8609509    523.1025306
    536.4488323    544.7057793    549.2603699    557.7885137    563.0746893
    567.1357533    570.4424228    579.0952309    590.3428836    592.3266112
    597.0337323    613.5925759    614.4578751    621.3079596    624.5877250
    630.3248344    638.7875413    646.2119753    648.0418851    657.2565824
    663.7548164    668.9264971    673.8460563    680.6702779    685.8317691
    701.5352405    706.6453383    708.0035013    715.3994315    717.0346862
    722.9256662    732.2808978    732.3358962    739.6354003    744.2130109
    753.0307871    754.0910592    758.8097568    761.9549376    765.4159348
    770.1838161    771.5183136    782.4023480    784.9974845    791.4887914
    793.8116470    796.4003572    797.9332118    802.2666770    815.1559304
    815.6893712    821.1531036    825.0523675    829.2706895    831.7409302
    837.6172791    840.9574512    842.9716080    849.4655052    851.6503387
    859.4415813    863.1784201    864.9706444    870.9593770    872.8774323
    880.6929610

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2447
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    159

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9945E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9946E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9958E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9999E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.456    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.824    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.322    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.533    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.280    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.618    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.991    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.005    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.337    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.738    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.815    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.77    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    954 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996
 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00003
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001 0.99997
 0.99999 1.00000 1.00004 1.00003 1.00000
 1.00004 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    44046 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996
 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00003
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001 0.99997
 0.99999 1.00000 1.00004 1.00003 1.00000
 1.00004 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4:-0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603192008384055873.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603192008384055873.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603192008384055873.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603192008384055873.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    317
            First residue number     =      2
            Last  residue number     =    318
            Number of atoms found    =   2447
            Mean number per residue  =      7.7

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9945E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9946E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9958E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9982E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9999E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.456    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.824    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.322    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.533    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.280    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.618    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.991    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.005    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.337    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.738    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.815    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.77    

 Bfactors>  106 vectors,   7341 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.456000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.285 for    317 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.034 +/-   0.04
 Bfactors> =     70.625 +/-  22.63
 Bfactors> Shiftng-fct=     70.591
 Bfactors> Scaling-fct=    507.659

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603192008384055873.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603192008384055873.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   638.7    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   648.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   657.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   663.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   668.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   673.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   680.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   685.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   701.5    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   708.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   715.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   717.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   722.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   739.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   744.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   754.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   758.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   761.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   765.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   770.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   771.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   782.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   785.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   791.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   793.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   796.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   797.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   802.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   815.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   815.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   821.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   825.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   829.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   831.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   837.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   840.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   842.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   849.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   851.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   859.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   863.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   865.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   870.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   872.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   880.6    

 Chkmod>  106 vectors,   7341 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2447 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    55 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7469
      0.0034      0.9465
      0.0034      0.7598
      0.0034      0.7446
      0.0034      0.7099
      0.0034      0.9983
    131.0260      0.5006
    146.6524      0.5431
    165.4656      0.3179
    204.1026      0.2637
    224.6459      0.4777
    233.3477      0.0705
    242.5886      0.2687
    287.3960      0.0872
    294.1277      0.1949
    302.0585      0.4795
    322.3946      0.4077
    344.2387      0.1883
    364.3727      0.2017
    373.1656      0.2018
    381.4470      0.2906
    388.6433      0.0278
    393.4676      0.1885
    411.1982      0.1087
    419.8530      0.2339
    426.9543      0.2166
    429.7071      0.2760
    435.9726      0.3647
    442.2826      0.1790
    451.3864      0.1101
    457.6128      0.2125
    470.4449      0.3279
    482.8141      0.2641
    491.1673      0.5396
    496.6580      0.4738
    500.7955      0.3636
    505.3658      0.1033
    513.1224      0.3667
    521.8944      0.2386
    523.1355      0.3504
    536.3787      0.2004
    544.6681      0.3329
    549.1954      0.4253
    557.7172      0.3840
    563.0825      0.3450
    567.1512      0.1751
    570.4679      0.3318
    579.0838      0.3408
    590.2763      0.4199
    592.2705      0.4392
    597.0294      0.4601
    613.5869      0.2668
    614.4511      0.3096
    621.3209      0.1643
    624.5387      0.2310
    630.2707      0.4445
    638.7261      0.4833
    646.1593      0.2489
    647.9815      0.3698
    657.1963      0.3541
    663.7126      0.3238
    668.9329      0.3573
    673.8503      0.3801
    680.6403      0.4110
    685.8176      0.3829
    701.5407      0.4747
    706.6483      0.4825
    707.9820      0.3717
    715.3548      0.3950
    717.0012      0.5142
    722.8971      0.4117
    732.2158      0.4777
    732.2963      0.3850
    739.5862      0.4833
    744.1953      0.5229
    753.0157      0.4819
    754.0328      0.4242
    758.7872      0.5023
    761.8887      0.2643
    765.3629      0.3291
    770.1239      0.3962
    771.5007      0.5204
    782.3519      0.4610
    784.9850      0.3305
    791.4920      0.4027
    793.7977      0.4610
    796.3930      0.3526
    797.8721      0.5062
    802.2198      0.4803
    815.1238      0.2070
    815.6300      0.2425
    821.1050      0.4508
    825.0446      0.5281
    829.2498      0.4009
    831.7344      0.4690
    837.5970      0.3491
    840.8987      0.4370
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    859.4142      0.2596
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    864.9529      0.3983
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    872.8237      0.4510
    880.6241      0.3083
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603192008384055873 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603192008384055873.eigenfacs
2603192008384055873.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m12.260s
user	0m12.158s
sys	0m0.097s
rm: cannot remove '2603192008384055873.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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