***  wt project   ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603192354104080221.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603192354104080221.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603192354104080221.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 208
First residue number = 1
Last residue number = 208
Number of atoms found = 1603
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.028044 +/- 28.199514 From: -64.072000 To: 66.247000
= 0.924949 +/- 17.445163 From: -32.133000 To: 47.848000
= 0.711667 +/- 25.729722 From: -61.383000 To: 56.241000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.5814 % Filled.
Pdbmat> 414217 non-zero elements.
Pdbmat> 44961 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 56.10 +/- 29.26
Maximum number = 132
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 899220.
Pdbmat> Larger element = 494.851
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
208 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603192354104080221.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603192354104080221.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603192354104080221.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1603 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 208 residues.
Blocpdb> 18 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 18 atoms in block 2
Block first atom: 19
Blocpdb> 16 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 8 atoms in block 4
Block first atom: 53
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 61
Blocpdb> 11 atoms in block 6
Block first atom: 83
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 94
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 104
Blocpdb> 11 atoms in block 9
Block first atom: 127
Blocpdb> 13 atoms in block 10
Block first atom: 138
Blocpdb> 13 atoms in block 11
Block first atom: 151
Blocpdb> 8 atoms in block 12
Block first atom: 164
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 172
Blocpdb> 19 atoms in block 14
Block first atom: 191
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 210
Blocpdb> 8 atoms in block 16
Block first atom: 226
Blocpdb> 8 atoms in block 17
Block first atom: 234
Blocpdb> 18 atoms in block 18
Block first atom: 242
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 260
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 276
Blocpdb> 8 atoms in block 21
Block first atom: 290
Blocpdb> 18 atoms in block 22
Block first atom: 298
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 316
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 332
Blocpdb> 8 atoms in block 25
Block first atom: 346
Blocpdb> 18 atoms in block 26
Block first atom: 354
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 372
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 388
Blocpdb> 8 atoms in block 29
Block first atom: 402
Blocpdb> 18 atoms in block 30
Block first atom: 410
Blocpdb> 16 atoms in block 31
Block first atom: 428
Blocpdb> 14 atoms in block 32
Block first atom: 444
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 458
Blocpdb> 18 atoms in block 34
Block first atom: 466
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 484
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 497
Blocpdb> 17 atoms in block 37
Block first atom: 505
Blocpdb> 15 atoms in block 38
Block first atom: 522
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 537
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 559
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 575
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 590
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 606
Blocpdb> 17 atoms in block 44
Block first atom: 621
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 638
Blocpdb> 9 atoms in block 46
Block first atom: 656
Blocpdb> 10 atoms in block 47
Block first atom: 665
Blocpdb> 10 atoms in block 48
Block first atom: 675
Blocpdb> 9 atoms in block 49
Block first atom: 685
Blocpdb> 14 atoms in block 50
Block first atom: 694
Blocpdb> 8 atoms in block 51
Block first atom: 708
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 716
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 728
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 744
Blocpdb> 10 atoms in block 55
Block first atom: 760
Blocpdb> 13 atoms in block 56
Block first atom: 770
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 783
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 800
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 815
Blocpdb> 15 atoms in block 60
Block first atom: 833
Blocpdb> 14 atoms in block 61
Block first atom: 848
Blocpdb> 21 atoms in block 62
Block first atom: 862
Blocpdb> 19 atoms in block 63
Block first atom: 883
Blocpdb> 24 atoms in block 64
Block first atom: 902
Blocpdb> 20 atoms in block 65
Block first atom: 926
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 946
Blocpdb> 21 atoms in block 67
Block first atom: 962
Blocpdb> 19 atoms in block 68
Block first atom: 983
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1002
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 1019
Blocpdb> 23 atoms in block 71
Block first atom: 1038
Blocpdb> 15 atoms in block 72
Block first atom: 1061
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1076
Blocpdb> 18 atoms in block 74
Block first atom: 1093
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 1111
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1128
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1144
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1162
Blocpdb> 13 atoms in block 79
Block first atom: 1180
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1193
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1209
Blocpdb> 18 atoms in block 82
Block first atom: 1224
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1242
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1259
Blocpdb> 14 atoms in block 85
Block first atom: 1273
Blocpdb> 16 atoms in block 86
Block first atom: 1287
Blocpdb> 13 atoms in block 87
Block first atom: 1303
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1316
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1335
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1351
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1366
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1382
Blocpdb> 20 atoms in block 93
Block first atom: 1398
Blocpdb> 14 atoms in block 94
Block first atom: 1418
Blocpdb> 18 atoms in block 95
Block first atom: 1432
Blocpdb> 14 atoms in block 96
Block first atom: 1450
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1464
Blocpdb> 21 atoms in block 98
Block first atom: 1479
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1500
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1520
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1535
Blocpdb> 24 atoms in block 102
Block first atom: 1549
Blocpdb> 20 atoms in block 103
Block first atom: 1573
Blocpdb> 11 atoms in block 104
Block first atom: 1592
Blocpdb> 104 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 414321 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4809
Prepmat> Matrix trace = 899220.0000
Prepmat> Last element read: 4809 4809 148.5404
Prepmat> 5461 lines saved.
Prepmat> 4826 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1603
RTB> Total mass = 1603.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1603
RTB> Number of blocks = 104
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 84560.5237
RTB> 21264 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 624
Diagstd> Nb of non-zero elements: 21264
Diagstd> Projected matrix trace = 84560.5237
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 624 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 84560.5237
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000029 0.0000072 0.0000466 0.0000560
0.0003177 0.0004495 0.0013267 0.0017198 0.0033755
0.0035818 0.0061917 0.0071381 0.0098755 0.0161569
0.0165157 0.0281482 0.0303532 0.0377585 0.0425572
0.0607891 0.0646017 0.0750577 0.0831996 0.0949680
0.1094172 0.1215868 0.1419491 0.1584711 0.1804144
0.2019831 0.2302821 0.2618062 0.2702194 0.3288796
0.3665348 0.4034093 0.4474729 0.4975984 0.5466057
0.6171996 0.6482225 0.7243777 0.7272003 0.8579895
0.8799251 0.9298228 0.9896990 1.0342568 1.1283195
1.1697478 1.3074131 1.3279918 1.4671036 1.5792723
1.6735641 1.7413134 1.8226808 1.9836314 2.1194927
2.1610198 2.2814553 2.3212371 2.4183111 2.6066037
2.6655494 2.7579685 3.1045336 3.2568371 3.3075492
3.4700704 3.6090701 3.6530926 3.8152051 3.9513832
4.0511454 4.4951623 4.5924246 4.8772720 5.0013360
5.1260601 5.7671169 6.0122886 6.0924478 6.2716818
6.4860527 6.7885037 6.9861170 7.2406763 7.3266992
7.5519714 7.7003500 7.8742863 8.1090804 8.2847198
8.4234000 8.6383690 8.9294589 9.4735598 9.6153186
9.8782214
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034338 0.0034338 0.0034339 0.0034339 0.0034340
0.0034340 0.1849751 0.2907460 0.7410916 0.8123168
1.9355691 2.3023854 3.9552677 4.5033779 6.3090417
6.4990231 8.5447567 9.1746084 10.7913462 13.8030417
13.9554617 18.2188410 18.9189680 21.1009831 22.4017321
26.7736852 27.6005103 29.7504042 31.3224595 33.4644606
35.9201483 37.8650498 40.9130309 43.2285085 46.1244144
48.8037002 52.1105192 55.5629404 56.4486508 62.2750047
65.7435060 68.9712678 72.6404671 76.6010612 80.2846173
85.3115991 87.4293642 92.4225216 92.6024106 100.5857039
101.8633935 104.7117395 108.0306155 110.4356942 115.3483347
117.4468565 124.1657166 125.1390859 131.5302581 136.4657885
140.4806343 143.2958954 146.6056096 152.9416479 158.0924899
159.6337287 164.0216842 165.4455270 168.8695565 175.3205320
177.2918004 180.3391145 191.3345794 195.9716717 197.4915143
202.2853460 206.2970136 207.5513779 212.1066204 215.8588492
218.5668000 230.2332111 232.7106703 239.8190994 242.8501044
245.8595744 260.7802267 266.2656793 268.0348024 271.9488879
276.5575481 282.9321562 287.0206931 292.2031179 293.9337535
298.4182976 301.3356494 304.7199454 309.2296173 312.5605709
315.1657334 319.1619833 324.4948829 334.2349657 336.7263629
341.2987181
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1603
Rtb_to_modes> Number of blocs = 104
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9016E-06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1686E-06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6575E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5958E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1771E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4954E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3267E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7198E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3755E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5818E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1917E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1381E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8755E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6157E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6516E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8148E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0353E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7759E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2557E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0789E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.4602E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.5058E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.3200E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4968E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1094
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1216
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1419
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1585
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1804
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2020
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2303
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2618
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2702
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.878
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 624 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 1.00002
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0.99998 0.99997 1.00002 1.00004 0.99999
0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002
0.99997 1.00004 1.00001 1.00001 1.00007
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997
1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998
1.00008 0.99996 1.00004 1.00000 1.00002
0.99998 1.00001 0.99999 1.00005 0.99999
1.00000 1.00003 0.99996 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 0.99999
1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 0.99998
1.00003 1.00001 0.99996 0.99998 1.00004
1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
1.00002 0.99996 1.00005 1.00002 1.00005
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 1.00004 1.00000 1.00000
1.00003 0.99996 1.00003 0.99995 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 28854 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997
0.99998 0.99997 1.00002 1.00004 0.99999
0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002
0.99997 1.00004 1.00001 1.00001 1.00007
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997
1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998
1.00008 0.99996 1.00004 1.00000 1.00002
0.99998 1.00001 0.99999 1.00005 0.99999
1.00000 1.00003 0.99996 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 0.99999
1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 0.99998
1.00003 1.00001 0.99996 0.99998 1.00004
1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
1.00002 0.99996 1.00005 1.00002 1.00005
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 1.00004 1.00000 1.00000
1.00003 0.99996 1.00003 0.99995 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603192354104080221.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603192354104080221.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603192354104080221.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603192354104080221.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 208
First residue number = 1
Last residue number = 208
Number of atoms found = 1603
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9016E-06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1686E-06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6575E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5958E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1771E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4954E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3267E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7198E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3755E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5818E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1917E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1381E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8755E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6157E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6516E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8148E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0353E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7759E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2557E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0789E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4602E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.5058E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3200E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4968E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1094
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1216
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1419
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1585
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1804
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2020
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2303
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2618
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3289
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3665
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4034
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4475
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4976
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5466
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6172
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6482
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7244
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7272
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8580
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8799
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9298
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9897
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.034
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.128
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.170
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.307
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.328
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.467
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.579
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.674
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.741
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.823
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.984
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.119
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.161
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.281
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.321
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.418
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.607
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.666
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.758
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.105
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.257
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.308
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.470
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.609
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.653
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.815
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.951
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.051
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.495
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.592
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.877
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.001
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.126
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.767
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.092
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.272
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.486
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.789
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.986
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.241
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.327
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.874
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.109
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.423
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.638
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.929
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.474
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.615
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.878
Bfactors> 106 vectors, 4809 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000003
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.080 for 208 C-alpha atoms.
Bfactors> = 5016.139 +/- ******
Bfactors> = 70.196 +/- 23.79
Bfactors> Shiftng-fct= -4945.943
Bfactors> Scaling-fct= 0.003
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603192354104080221.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603192354104080221.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.1850
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.2907
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.7411
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.8123
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.935
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.302
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.955
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.309
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.499
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.544
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.174
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.77
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.3
Chkmod> 106 vectors, 4809 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1603 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 51 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 59 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 73 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 88 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 90 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 102 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 104 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 106 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7524
0.0034 0.8957
0.0034 0.7527
0.0034 0.8576
0.0034 0.5083
0.0034 0.8835
0.1850 0.4484
0.2907 0.5618
0.7411 0.5050
0.8123 0.6188
1.9355 0.6198
2.3023 0.5081
3.9552 0.5521
4.5031 0.5016
6.3088 0.4138
6.4987 0.5044
8.5444 0.4125
9.1742 0.4543
10.7909 0.2540
13.8025 0.3394
13.9550 0.3139
18.2180 0.3595
18.9181 0.2221
21.1002 0.3029
22.4007 0.1762
26.7725 0.3060
27.5994 0.1636
29.7492 0.2591
31.3212 0.3511
33.4630 0.1676
35.9158 0.2179
37.8655 0.1997
40.9042 0.1653
43.2306 0.1186
46.1206 0.1592
48.8037 0.2439
52.1103 0.1245
55.5599 0.2127
56.4442 0.2205
62.2743 0.0614
65.7376 0.2866
68.9675 0.2176
72.6396 0.2969
76.5979 0.2702
80.2808 0.2349
85.3080 0.2069
87.4241 0.1257
92.4200 0.2347
92.5984 0.1670
100.5820 0.1484
101.8576 0.1459
104.7060 0.1552
108.0260 0.1159
110.4172 0.2258
115.3271 0.1686
117.4545 0.1624
124.1408 0.2041
125.1341 0.1043
131.5200 0.2427
136.4482 0.1777
140.4929 0.1018
143.2768 0.2409
146.6122 0.1437
152.9493 0.1390
158.0673 0.3093
159.6261 0.2312
163.9983 0.2802
165.4300 0.1525
168.8514 0.2783
175.3263 0.2419
177.2992 0.3512
180.3324 0.2456
191.3407 0.2765
195.9682 0.3532
197.4965 0.3195
202.2746 0.3014
206.2862 0.2803
207.5398 0.3133
212.0918 0.2994
215.8391 0.1182
218.5535 0.2684
230.2192 0.1380
232.6899 0.4466
239.8021 0.1705
242.8315 0.2292
245.8476 0.1415
260.7664 0.1298
266.2479 0.1220
268.0134 0.1500
271.9441 0.2106
276.5446 0.1698
282.9304 0.2265
287.0060 0.2565
292.1971 0.3364
293.9272 0.5299
298.4061 0.2587
301.3159 0.2367
304.7013 0.3106
309.2148 0.1385
312.5524 0.1772
315.1447 0.2815
319.1415 0.0465
324.4726 0.1910
334.2284 0.1703
336.7063 0.2501
341.2802 0.0841
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603192354104080221 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603192354104080221.eigenfacs
2603192354104080221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603192354104080221.eigenfacs
2603192354104080221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603192354104080221.eigenfacs
2603192354104080221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603192354104080221.eigenfacs
2603192354104080221.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603192354104080221.eigenfacs
2603192354104080221.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603192354104080221.eigenfacs
2603192354104080221.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603192354104080221.eigenfacs
2603192354104080221.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603192354104080221.eigenfacs
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MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m3.567s
user 0m3.536s
sys 0m0.030s
rm: cannot remove '2603192354104080221.sdijf': No such file or directory
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