***  TRANSFERASE 23-JUN-01 1JG7  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603201113534182438.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603201113534182438.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603201113534182438.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 351
First residue number = 1
Last residue number = 351
Number of atoms found = 2869
Mean number per residue = 8.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 9.224504 +/- 9.965071 From: -14.104000 To: 33.314000
= 19.589686 +/- 12.237422 From: -13.618000 To: 45.250000
= 13.526857 +/- 13.965719 From: -16.782000 To: 42.154000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.9497 % Filled.
Pdbmat> 1092690 non-zero elements.
Pdbmat> 119524 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.32 +/- 22.49
Maximum number = 128
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 2.390480E+06
Pdbmat> Larger element = 479.469
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
351 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603201113534182438.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603201113534182438.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603201113534182438.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2869 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 351 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 13 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 16 atoms in block 3
Block first atom: 31
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 47
Blocpdb> 12 atoms in block 5
Block first atom: 63
Blocpdb> 15 atoms in block 6
Block first atom: 75
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 90
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 106
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 126
Blocpdb> 13 atoms in block 10
Block first atom: 140
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 153
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 168
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 183
Blocpdb> 20 atoms in block 14
Block first atom: 203
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 223
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 238
Blocpdb> 12 atoms in block 17
Block first atom: 253
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 265
Blocpdb> 15 atoms in block 19
Block first atom: 281
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 296
Blocpdb> 14 atoms in block 21
Block first atom: 312
Blocpdb> 17 atoms in block 22
Block first atom: 326
Blocpdb> 11 atoms in block 23
Block first atom: 343
Blocpdb> 19 atoms in block 24
Block first atom: 354
Blocpdb> 15 atoms in block 25
Block first atom: 373
Blocpdb> 19 atoms in block 26
Block first atom: 388
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 407
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 423
Blocpdb> 16 atoms in block 29
Block first atom: 438
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 454
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 474
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 493
Blocpdb> 15 atoms in block 33
Block first atom: 508
Blocpdb> 12 atoms in block 34
Block first atom: 523
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 22 atoms in block 36
Block first atom: 551
Blocpdb> 8 atoms in block 37
Block first atom: 573
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 581
Blocpdb> 16 atoms in block 39
Block first atom: 597
Blocpdb> 13 atoms in block 40
Block first atom: 613
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 626
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 640
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 654
Blocpdb> 13 atoms in block 44
Block first atom: 674
Blocpdb> 21 atoms in block 45
Block first atom: 687
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 708
Blocpdb> 17 atoms in block 47
Block first atom: 723
Blocpdb> 24 atoms in block 48
Block first atom: 740
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 764
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 783
Blocpdb> 19 atoms in block 51
Block first atom: 798
Blocpdb> 15 atoms in block 52
Block first atom: 817
Blocpdb> 17 atoms in block 53
Block first atom: 832
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 849
Blocpdb> 21 atoms in block 55
Block first atom: 864
Blocpdb> 15 atoms in block 56
Block first atom: 885
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 900
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 917
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 935
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 954
Blocpdb> 19 atoms in block 61
Block first atom: 974
Blocpdb> 18 atoms in block 62
Block first atom: 993
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 1011
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 1028
Blocpdb> 15 atoms in block 65
Block first atom: 1044
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 1059
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1074
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1090
Blocpdb> 13 atoms in block 69
Block first atom: 1104
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1117
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1133
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1149
Blocpdb> 14 atoms in block 73
Block first atom: 1162
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1176
Blocpdb> 18 atoms in block 75
Block first atom: 1191
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1209
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1224
Blocpdb> 17 atoms in block 78
Block first atom: 1239
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1256
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 1276
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1299
Blocpdb> 18 atoms in block 82
Block first atom: 1314
Blocpdb> 21 atoms in block 83
Block first atom: 1332
Blocpdb> 18 atoms in block 84
Block first atom: 1353
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1371
Blocpdb> 19 atoms in block 86
Block first atom: 1387
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1406
Blocpdb> 15 atoms in block 88
Block first atom: 1423
Blocpdb> 14 atoms in block 89
Block first atom: 1438
Blocpdb> 18 atoms in block 90
Block first atom: 1452
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1470
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1485
Blocpdb> 20 atoms in block 93
Block first atom: 1500
Blocpdb> 8 atoms in block 94
Block first atom: 1520
Blocpdb> 17 atoms in block 95
Block first atom: 1528
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1545
Blocpdb> 13 atoms in block 97
Block first atom: 1562
Blocpdb> 20 atoms in block 98
Block first atom: 1575
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1595
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1610
Blocpdb> 20 atoms in block 101
Block first atom: 1625
Blocpdb> 19 atoms in block 102
Block first atom: 1645
Blocpdb> 15 atoms in block 103
Block first atom: 1664
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1679
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 1691
Blocpdb> 20 atoms in block 106
Block first atom: 1707
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1727
Blocpdb> 13 atoms in block 108
Block first atom: 1742
Blocpdb> 20 atoms in block 109
Block first atom: 1755
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1775
Blocpdb> 20 atoms in block 111
Block first atom: 1793
Blocpdb> 15 atoms in block 112
Block first atom: 1813
Blocpdb> 21 atoms in block 113
Block first atom: 1828
Blocpdb> 21 atoms in block 114
Block first atom: 1849
Blocpdb> 16 atoms in block 115
Block first atom: 1870
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1886
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 1898
Blocpdb> 11 atoms in block 118
Block first atom: 1916
Blocpdb> 17 atoms in block 119
Block first atom: 1927
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1944
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 1959
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1975
Blocpdb> 18 atoms in block 123
Block first atom: 1988
Blocpdb> 14 atoms in block 124
Block first atom: 2006
Blocpdb> 14 atoms in block 125
Block first atom: 2020
Blocpdb> 13 atoms in block 126
Block first atom: 2034
Blocpdb> 13 atoms in block 127
Block first atom: 2047
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 2060
Blocpdb> 12 atoms in block 129
Block first atom: 2076
Blocpdb> 17 atoms in block 130
Block first atom: 2088
Blocpdb> 20 atoms in block 131
Block first atom: 2105
Blocpdb> 16 atoms in block 132
Block first atom: 2125
Blocpdb> 19 atoms in block 133
Block first atom: 2141
Blocpdb> 15 atoms in block 134
Block first atom: 2160
Blocpdb> 18 atoms in block 135
Block first atom: 2175
Blocpdb> 23 atoms in block 136
Block first atom: 2193
Blocpdb> 15 atoms in block 137
Block first atom: 2216
Blocpdb> 11 atoms in block 138
Block first atom: 2231
Blocpdb> 13 atoms in block 139
Block first atom: 2242
Blocpdb> 15 atoms in block 140
Block first atom: 2255
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2270
Blocpdb> 17 atoms in block 142
Block first atom: 2286
Blocpdb> 20 atoms in block 143
Block first atom: 2303
Blocpdb> 15 atoms in block 144
Block first atom: 2323
Blocpdb> 19 atoms in block 145
Block first atom: 2338
Blocpdb> 19 atoms in block 146
Block first atom: 2357
Blocpdb> 16 atoms in block 147
Block first atom: 2376
Blocpdb> 13 atoms in block 148
Block first atom: 2392
Blocpdb> 22 atoms in block 149
Block first atom: 2405
Blocpdb> 19 atoms in block 150
Block first atom: 2427
Blocpdb> 16 atoms in block 151
Block first atom: 2446
Blocpdb> 16 atoms in block 152
Block first atom: 2462
Blocpdb> 17 atoms in block 153
Block first atom: 2478
Blocpdb> 16 atoms in block 154
Block first atom: 2495
Blocpdb> 18 atoms in block 155
Block first atom: 2511
Blocpdb> 17 atoms in block 156
Block first atom: 2529
Blocpdb> 17 atoms in block 157
Block first atom: 2546
Blocpdb> 16 atoms in block 158
Block first atom: 2563
Blocpdb> 15 atoms in block 159
Block first atom: 2579
Blocpdb> 19 atoms in block 160
Block first atom: 2594
Blocpdb> 18 atoms in block 161
Block first atom: 2613
Blocpdb> 16 atoms in block 162
Block first atom: 2631
Blocpdb> 14 atoms in block 163
Block first atom: 2647
Blocpdb> 19 atoms in block 164
Block first atom: 2661
Blocpdb> 16 atoms in block 165
Block first atom: 2680
Blocpdb> 16 atoms in block 166
Block first atom: 2696
Blocpdb> 16 atoms in block 167
Block first atom: 2712
Blocpdb> 16 atoms in block 168
Block first atom: 2728
Blocpdb> 18 atoms in block 169
Block first atom: 2744
Blocpdb> 14 atoms in block 170
Block first atom: 2762
Blocpdb> 23 atoms in block 171
Block first atom: 2776
Blocpdb> 13 atoms in block 172
Block first atom: 2799
Blocpdb> 20 atoms in block 173
Block first atom: 2812
Blocpdb> 14 atoms in block 174
Block first atom: 2832
Blocpdb> 16 atoms in block 175
Block first atom: 2846
Blocpdb> 8 atoms in block 176
Block first atom: 2861
Blocpdb> 176 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1092866 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8607
Prepmat> Matrix trace = 2390480.0000
Prepmat> Last element read: 8607 8607 227.7811
Prepmat> 15577 lines saved.
Prepmat> 13592 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2869
RTB> Total mass = 2869.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2869
RTB> Number of blocks = 176
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 248229.1725
RTB> 68784 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1056
Diagstd> Nb of non-zero elements: 68784
Diagstd> Projected matrix trace = 248229.1725
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1056 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 248229.1725
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.7168984 1.9396142 4.0062355 5.7346662
6.9088314 6.9644197 8.8814463 9.6111696 10.8906028
11.6043663 11.9032459 12.8865356 14.6211289 15.5926477
16.9288548 17.6037781 18.3378907 19.4328786 20.9890228
21.3444590 21.8608661 22.5440643 22.9194205 24.3900004
24.8389854 25.2904562 26.4450680 26.7180455 28.0869383
28.6854545 29.3382244 29.4646394 30.3298015 30.6659927
31.0216981 31.7218718 32.4343321 32.7516132 33.4273227
33.8224996 34.7949519 35.2229158 35.8749078 36.1192437
37.1857473 37.6588349 38.4955713 38.8382629 40.2634203
41.0137143 41.7924012 42.3045898 43.4286716 43.7491723
44.5721398 45.5066002 46.1178196 46.8177422 47.4239803
47.8777223 48.1027740 49.1200992 49.5040584 49.9710546
51.0617296 51.5949405 52.3786766 53.3105223 53.5971097
53.9589740 54.3801033 55.3150919 55.8803738 56.2040070
56.6984382 57.0956160 57.2780779 57.7378522 58.1848226
59.1132363 60.1594362 60.3449878 60.7402213 61.5148808
61.8836931 62.1818993 62.9832643 63.3164218 63.6539542
64.1371410 65.0685740 65.5116219 65.8866083 66.3022994
67.1831187 67.5279794 67.9967122 69.1325210 69.6357229
70.4037777
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034310 0.0034321 0.0034328 0.0034346 0.0034352
0.0034357 142.2877731 151.2352248 217.3519385 260.0455053
285.4286600 286.5746343 323.6213210 336.6537060 358.3614128
369.9184515 374.6519378 389.8193289 415.2271408 428.8004311
446.7957874 455.6152195 465.0182214 478.7004644 497.4980587
501.6927852 507.7254845 515.5981941 519.8728017 536.2918342
541.2055062 546.1018050 558.4285641 561.3033354 575.5028520
581.6023438 588.1826282 589.4484708 598.0397677 601.3451249
604.8226737 611.6101486 618.4402680 621.4577785 627.8358015
631.5360264 640.5505383 644.4777565 650.4151924 652.6263499
662.1914016 666.3903813 673.7529267 676.7451920 689.0498023
695.4402638 702.0110409 706.2997045 715.6217847 718.2575512
724.9816635 732.5419085 737.4450477 743.0200161 747.8151873
751.3841352 753.1480246 761.0705162 764.0392729 767.6345932
775.9666226 780.0076068 785.9095043 792.8695679 794.9978705
797.6770953 800.7838292 807.6386598 811.7549239 814.1021843
817.6752045 820.5341520 821.8442066 825.1361084 828.3237952
834.9061275 842.2619067 843.5598134 846.3177807 851.6975026
854.2468618 856.3026180 861.8027251 864.0790231 866.3791138
869.6611687 875.9532429 878.9303397 881.4422343 884.2184558
890.0724537 892.3539648 895.4456632 902.8933981 906.1734306
911.1570959
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2869
Rtb_to_modes> Number of blocs = 176
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9827E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9891E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.717
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.940
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.006
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.735
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.909
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.964
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.611
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.40
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997
1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005
1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004
0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997
1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001
1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 51642 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997
1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005
1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004
0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997
1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001
1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603201113534182438.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603201113534182438.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603201113534182438.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603201113534182438.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 351
First residue number = 1
Last residue number = 351
Number of atoms found = 2869
Mean number per residue = 8.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9827E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9891E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.717
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.940
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.006
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.735
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.909
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.964
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.611
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.40
Bfactors> 106 vectors, 8607 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.717000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.439 for 351 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.022 +/- 0.02
Bfactors> = 20.259 +/- 7.38
Bfactors> Shiftng-fct= 20.237
Bfactors> Scaling-fct= 368.468
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603201113534182438.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603201113534182438.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4308E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.1
Chkmod> 106 vectors, 8607 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2869 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7586
0.0034 0.7587
0.0034 0.8739
0.0034 0.7831
0.0034 0.8753
0.0034 0.9632
142.2859 0.4488
151.2438 0.5376
217.3362 0.6428
260.0419 0.5131
285.4199 0.3140
286.5537 0.4654
323.5993 0.7577
336.6363 0.4246
358.3361 0.3755
369.8330 0.3567
374.5848 0.1705
389.8550 0.3773
415.1933 0.5330
428.7456 0.5130
446.7917 0.3194
455.5468 0.3745
465.0250 0.5430
478.6445 0.2807
497.4883 0.3227
501.6188 0.3264
507.6936 0.4391
515.5296 0.3375
519.8571 0.2065
536.2688 0.3873
541.1933 0.6195
546.0734 0.3565
558.4567 0.3609
561.2998 0.4977
575.5095 0.5179
581.6235 0.5470
588.1752 0.4633
589.3768 0.3098
598.0161 0.2423
601.3586 0.5624
604.7802 0.3115
611.5658 0.3542
618.3724 0.2960
621.4158 0.2839
627.8340 0.3968
631.4856 0.1919
640.4775 0.4586
644.4234 0.3075
650.3428 0.3249
652.6052 0.3452
662.2008 0.4807
666.3721 0.3244
673.7628 0.3757
676.7313 0.0820
688.9910 0.5514
695.3789 0.4795
701.9607 0.3616
706.2311 0.4867
715.6020 0.3956
718.2335 0.4374
724.9331 0.3556
732.5378 0.4609
737.4308 0.2188
743.0060 0.1834
747.7517 0.3661
751.3698 0.3693
753.0940 0.3719
761.0371 0.4257
763.9752 0.5323
767.5935 0.3733
775.9202 0.3871
779.9368 0.4997
785.8857 0.4414
792.8316 0.4393
794.9852 0.3449
797.6504 0.4278
800.7487 0.5218
807.6398 0.3684
811.7174 0.3958
814.0382 0.3590
817.6514 0.3023
820.5304 0.4285
821.8227 0.3401
825.1160 0.2613
828.2539 0.3392
834.8474 0.2432
842.2297 0.2869
843.4887 0.4195
846.2799 0.4442
851.6272 0.4474
854.1847 0.2693
856.2528 0.5135
861.7434 0.4168
864.0663 0.4097
866.3150 0.4326
869.6432 0.4217
875.9252 0.5601
878.8817 0.4276
881.4271 0.4863
884.1652 0.4181
890.0136 0.4932
892.3290 0.4720
895.4289 0.5287
902.8382 0.4153
906.1624 0.4384
911.0935 0.4323
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603201113534182438 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
making animated gifs
11 models are in 2603201113534182438.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603201113534182438 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
making animated gifs
11 models are in 2603201113534182438.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603201113534182438 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
making animated gifs
11 models are in 2603201113534182438.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603201113534182438 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
making animated gifs
11 models are in 2603201113534182438.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603201113534182438 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603201113534182438.eigenfacs
2603201113534182438.atom
making animated gifs
11 models are in 2603201113534182438.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603201113534182438.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603201113534182438.10.pdb
2603201113534182438.11.pdb
2603201113534182438.7.pdb
2603201113534182438.8.pdb
2603201113534182438.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m22.620s
user 0m22.494s
sys 0m0.113s
rm: cannot remove '2603201113534182438.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|