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***  TRANSFERASE 23-JUN-01 1JG7  ***

LOGs for ID: 2603201113534182438

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603201113534182438.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603201113534182438.atom to be opened. Openam> File opened: 2603201113534182438.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 351 First residue number = 1 Last residue number = 351 Number of atoms found = 2869 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 9.224504 +/- 9.965071 From: -14.104000 To: 33.314000 = 19.589686 +/- 12.237422 From: -13.618000 To: 45.250000 = 13.526857 +/- 13.965719 From: -16.782000 To: 42.154000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9497 % Filled. Pdbmat> 1092690 non-zero elements. Pdbmat> 119524 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.32 +/- 22.49 Maximum number = 128 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.390480E+06 Pdbmat> Larger element = 479.469 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 351 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603201113534182438.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603201113534182438.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603201113534182438.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2869 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 351 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 13 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 31 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 47 Blocpdb> 12 atoms in block 5 Block first atom: 63 Blocpdb> 15 atoms in block 6 Block first atom: 75 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 90 Blocpdb> 20 atoms in block 8 Block first atom: 106 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 126 Blocpdb> 13 atoms in block 10 Block first atom: 140 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 153 Blocpdb> 15 atoms in block 12 Block first atom: 168 Blocpdb> 20 atoms in block 13 Block first atom: 183 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 203 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 223 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 238 Blocpdb> 12 atoms in block 17 Block first atom: 253 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 265 Blocpdb> 15 atoms in block 19 Block first atom: 281 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 296 Blocpdb> 14 atoms in block 21 Block first atom: 312 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 326 Blocpdb> 11 atoms in block 23 Block first atom: 343 Blocpdb> 19 atoms in block 24 Block first atom: 354 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 373 Blocpdb> 19 atoms in block 26 Block first atom: 388 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 407 Blocpdb> 15 atoms in block 28 Block first atom: 423 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 438 Blocpdb> 20 atoms in block 30 Block first atom: 454 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 474 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 493 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 508 Blocpdb> 12 atoms in block 34 Block first atom: 523 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 535 Blocpdb> 22 atoms in block 36 Block first atom: 551 Blocpdb> 8 atoms in block 37 Block first atom: 573 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 581 Blocpdb> 16 atoms in block 39 Block first atom: 597 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 613 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 626 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 640 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 654 Blocpdb> 13 atoms in block 44 Block first atom: 674 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 687 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 708 Blocpdb> 17 atoms in block 47 Block first atom: 723 Blocpdb> 24 atoms in block 48 Block first atom: 740 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 764 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 783 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 798 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 817 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 832 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 849 Blocpdb> 21 atoms in block 55 Block first atom: 864 Blocpdb> 15 atoms in block 56 Block first atom: 885 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 900 Blocpdb> 18 atoms in block 58 Block first atom: 917 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 935 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 954 Blocpdb> 19 atoms in block 61 Block first atom: 974 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 993 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 1011 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 1028 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 1044 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 1059 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1074 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1090 Blocpdb> 13 atoms in block 69 Block first atom: 1104 Blocpdb> 16 atoms in block 70 Block first atom: 1117 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1133 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1149 Blocpdb> 14 atoms in block 73 Block first atom: 1162 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1176 Blocpdb> 18 atoms in block 75 Block first atom: 1191 Blocpdb> 15 atoms in block 76 Block first atom: 1209 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1224 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1239 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1256 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1276 Blocpdb> 15 atoms in block 81 Block first atom: 1299 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1314 Blocpdb> 21 atoms in block 83 Block first atom: 1332 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 1353 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1371 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1387 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1406 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1423 Blocpdb> 14 atoms in block 89 Block first atom: 1438 Blocpdb> 18 atoms in block 90 Block first atom: 1452 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1470 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1485 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1500 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 1520 Blocpdb> 17 atoms in block 95 Block first atom: 1528 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1545 Blocpdb> 13 atoms in block 97 Block first atom: 1562 Blocpdb> 20 atoms in block 98 Block first atom: 1575 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 1595 Blocpdb> 15 atoms in block 100 Block first atom: 1610 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1625 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 1645 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1664 Blocpdb> 12 atoms in block 104 Block first atom: 1679 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1691 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 1707 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1727 Blocpdb> 13 atoms in block 108 Block first atom: 1742 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 1755 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1775 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 1793 Blocpdb> 15 atoms in block 112 Block first atom: 1813 Blocpdb> 21 atoms in block 113 Block first atom: 1828 Blocpdb> 21 atoms in block 114 Block first atom: 1849 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1870 Blocpdb> 12 atoms in block 116 Block first atom: 1886 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1898 Blocpdb> 11 atoms in block 118 Block first atom: 1916 Blocpdb> 17 atoms in block 119 Block first atom: 1927 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1944 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1959 Blocpdb> 13 atoms in block 122 Block first atom: 1975 Blocpdb> 18 atoms in block 123 Block first atom: 1988 Blocpdb> 14 atoms in block 124 Block first atom: 2006 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 2020 Blocpdb> 13 atoms in block 126 Block first atom: 2034 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 2047 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2060 Blocpdb> 12 atoms in block 129 Block first atom: 2076 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2088 Blocpdb> 20 atoms in block 131 Block first atom: 2105 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2125 Blocpdb> 19 atoms in block 133 Block first atom: 2141 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2160 Blocpdb> 18 atoms in block 135 Block first atom: 2175 Blocpdb> 23 atoms in block 136 Block first atom: 2193 Blocpdb> 15 atoms in block 137 Block first atom: 2216 Blocpdb> 11 atoms in block 138 Block first atom: 2231 Blocpdb> 13 atoms in block 139 Block first atom: 2242 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2255 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2270 Blocpdb> 17 atoms in block 142 Block first atom: 2286 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 2303 Blocpdb> 15 atoms in block 144 Block first atom: 2323 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2338 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 2357 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2376 Blocpdb> 13 atoms in block 148 Block first atom: 2392 Blocpdb> 22 atoms in block 149 Block first atom: 2405 Blocpdb> 19 atoms in block 150 Block first atom: 2427 Blocpdb> 16 atoms in block 151 Block first atom: 2446 Blocpdb> 16 atoms in block 152 Block first atom: 2462 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 2478 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2495 Blocpdb> 18 atoms in block 155 Block first atom: 2511 Blocpdb> 17 atoms in block 156 Block first atom: 2529 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2546 Blocpdb> 16 atoms in block 158 Block first atom: 2563 Blocpdb> 15 atoms in block 159 Block first atom: 2579 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 2594 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2613 Blocpdb> 16 atoms in block 162 Block first atom: 2631 Blocpdb> 14 atoms in block 163 Block first atom: 2647 Blocpdb> 19 atoms in block 164 Block first atom: 2661 Blocpdb> 16 atoms in block 165 Block first atom: 2680 Blocpdb> 16 atoms in block 166 Block first atom: 2696 Blocpdb> 16 atoms in block 167 Block first atom: 2712 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2728 Blocpdb> 18 atoms in block 169 Block first atom: 2744 Blocpdb> 14 atoms in block 170 Block first atom: 2762 Blocpdb> 23 atoms in block 171 Block first atom: 2776 Blocpdb> 13 atoms in block 172 Block first atom: 2799 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 2812 Blocpdb> 14 atoms in block 174 Block first atom: 2832 Blocpdb> 16 atoms in block 175 Block first atom: 2846 Blocpdb> 8 atoms in block 176 Block first atom: 2861 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1092866 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8607 Prepmat> Matrix trace = 2390480.0000 Prepmat> Last element read: 8607 8607 227.7811 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 13592 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2869 RTB> Total mass = 2869.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2869 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 248229.1725 RTB> 68784 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68784 Diagstd> Projected matrix trace = 248229.1725 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 248229.1725 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.7168984 1.9396142 4.0062355 5.7346662 6.9088314 6.9644197 8.8814463 9.6111696 10.8906028 11.6043663 11.9032459 12.8865356 14.6211289 15.5926477 16.9288548 17.6037781 18.3378907 19.4328786 20.9890228 21.3444590 21.8608661 22.5440643 22.9194205 24.3900004 24.8389854 25.2904562 26.4450680 26.7180455 28.0869383 28.6854545 29.3382244 29.4646394 30.3298015 30.6659927 31.0216981 31.7218718 32.4343321 32.7516132 33.4273227 33.8224996 34.7949519 35.2229158 35.8749078 36.1192437 37.1857473 37.6588349 38.4955713 38.8382629 40.2634203 41.0137143 41.7924012 42.3045898 43.4286716 43.7491723 44.5721398 45.5066002 46.1178196 46.8177422 47.4239803 47.8777223 48.1027740 49.1200992 49.5040584 49.9710546 51.0617296 51.5949405 52.3786766 53.3105223 53.5971097 53.9589740 54.3801033 55.3150919 55.8803738 56.2040070 56.6984382 57.0956160 57.2780779 57.7378522 58.1848226 59.1132363 60.1594362 60.3449878 60.7402213 61.5148808 61.8836931 62.1818993 62.9832643 63.3164218 63.6539542 64.1371410 65.0685740 65.5116219 65.8866083 66.3022994 67.1831187 67.5279794 67.9967122 69.1325210 69.6357229 70.4037777 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034321 0.0034328 0.0034346 0.0034352 0.0034357 142.2877731 151.2352248 217.3519385 260.0455053 285.4286600 286.5746343 323.6213210 336.6537060 358.3614128 369.9184515 374.6519378 389.8193289 415.2271408 428.8004311 446.7957874 455.6152195 465.0182214 478.7004644 497.4980587 501.6927852 507.7254845 515.5981941 519.8728017 536.2918342 541.2055062 546.1018050 558.4285641 561.3033354 575.5028520 581.6023438 588.1826282 589.4484708 598.0397677 601.3451249 604.8226737 611.6101486 618.4402680 621.4577785 627.8358015 631.5360264 640.5505383 644.4777565 650.4151924 652.6263499 662.1914016 666.3903813 673.7529267 676.7451920 689.0498023 695.4402638 702.0110409 706.2997045 715.6217847 718.2575512 724.9816635 732.5419085 737.4450477 743.0200161 747.8151873 751.3841352 753.1480246 761.0705162 764.0392729 767.6345932 775.9666226 780.0076068 785.9095043 792.8695679 794.9978705 797.6770953 800.7838292 807.6386598 811.7549239 814.1021843 817.6752045 820.5341520 821.8442066 825.1361084 828.3237952 834.9061275 842.2619067 843.5598134 846.3177807 851.6975026 854.2468618 856.3026180 861.8027251 864.0790231 866.3791138 869.6611687 875.9532429 878.9303397 881.4422343 884.2184558 890.0724537 892.3539648 895.4456632 902.8933981 906.1734306 911.1570959 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2869 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9827E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9891E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.006 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.881 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.40 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 51642 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603201113534182438.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603201113534182438.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603201113534182438.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603201113534182438.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 351 First residue number = 1 Last residue number = 351 Number of atoms found = 2869 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9827E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9891E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.006 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.881 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.40 Bfactors> 106 vectors, 8607 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.717000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.439 for 351 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.022 +/- 0.02 Bfactors> = 20.259 +/- 7.38 Bfactors> Shiftng-fct= 20.237 Bfactors> Scaling-fct= 368.468 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603201113534182438.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603201113534182438.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4308E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0 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Chkmod> That is: 2869 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7586 0.0034 0.7587 0.0034 0.8739 0.0034 0.7831 0.0034 0.8753 0.0034 0.9632 142.2859 0.4488 151.2438 0.5376 217.3362 0.6428 260.0419 0.5131 285.4199 0.3140 286.5537 0.4654 323.5993 0.7577 336.6363 0.4246 358.3361 0.3755 369.8330 0.3567 374.5848 0.1705 389.8550 0.3773 415.1933 0.5330 428.7456 0.5130 446.7917 0.3194 455.5468 0.3745 465.0250 0.5430 478.6445 0.2807 497.4883 0.3227 501.6188 0.3264 507.6936 0.4391 515.5296 0.3375 519.8571 0.2065 536.2688 0.3873 541.1933 0.6195 546.0734 0.3565 558.4567 0.3609 561.2998 0.4977 575.5095 0.5179 581.6235 0.5470 588.1752 0.4633 589.3768 0.3098 598.0161 0.2423 601.3586 0.5624 604.7802 0.3115 611.5658 0.3542 618.3724 0.2960 621.4158 0.2839 627.8340 0.3968 631.4856 0.1919 640.4775 0.4586 644.4234 0.3075 650.3428 0.3249 652.6052 0.3452 662.2008 0.4807 666.3721 0.3244 673.7628 0.3757 676.7313 0.0820 688.9910 0.5514 695.3789 0.4795 701.9607 0.3616 706.2311 0.4867 715.6020 0.3956 718.2335 0.4374 724.9331 0.3556 732.5378 0.4609 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DQ=-80 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603201113534182438.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603201113534182438 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom making animated gifs 11 models are in 2603201113534182438.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603201113534182438.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603201113534182438.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603201113534182438 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603201113534182438.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603201113534182438 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603201113534182438.eigenfacs 2603201113534182438.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603201113534182438.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603201113534182438.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603201113534182438.10.pdb 2603201113534182438.11.pdb 2603201113534182438.7.pdb 2603201113534182438.8.pdb 2603201113534182438.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m22.620s user 0m22.494s sys 0m0.113s rm: cannot remove '2603201113534182438.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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