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***  lig_1.pdb  ***

LOGs for ID: 2603231525221102422

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603231525221102422.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603231525221102422.atom to be opened. Openam> File opened: 2603231525221102422.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1038 First residue number = 32 Last residue number = 286 Number of atoms found = 8326 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 5.024436 +/- 24.125903 From: -53.565000 To: 61.201000 = 11.104180 +/- 28.289952 From: -43.845000 To: 93.656000 = 46.649293 +/- 11.815319 From: 17.987000 To: 74.406000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0245 % Filled. Pdbmat> 3195968 non-zero elements. Pdbmat> 349623 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.98 +/- 21.86 Maximum number = 131 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 6.992460E+06 Pdbmat> Larger element = 492.295 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1038 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603231525221102422.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603231525221102422.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603231525221102422.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8326 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1038 residues. Blocpdb> 50 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 52 atoms in block 2 Block first atom: 51 Blocpdb> 41 atoms in block 3 Block first atom: 103 Blocpdb> 53 atoms in block 4 Block first atom: 144 Blocpdb> 46 atoms in block 5 Block first atom: 197 Blocpdb> 48 atoms in block 6 Block first atom: 243 Blocpdb> 46 atoms in block 7 Block first atom: 291 Blocpdb> 51 atoms in block 8 Block first atom: 337 Blocpdb> 47 atoms in block 9 Block first atom: 388 Blocpdb> 49 atoms in block 10 Block first atom: 435 Blocpdb> 50 atoms in block 11 Block first atom: 484 Blocpdb> 22 atoms in block 12 Block first atom: 534 Blocpdb> 43 atoms in block 13 Block first atom: 556 Blocpdb> 44 atoms in block 14 Block first atom: 599 Blocpdb> 53 atoms in block 15 Block first atom: 643 Blocpdb> 49 atoms in block 16 Block first atom: 696 Blocpdb> 48 atoms in block 17 Block first atom: 745 Blocpdb> 40 atoms in block 18 Block first atom: 793 Blocpdb> 46 atoms in block 19 Block first atom: 833 Blocpdb> 53 atoms in block 20 Block first atom: 879 Blocpdb> 45 atoms in block 21 Block first atom: 932 Blocpdb> 49 atoms in block 22 Block first atom: 977 Blocpdb> 53 atoms in block 23 Block first atom: 1026 Blocpdb> 56 atoms in block 24 Block first atom: 1079 Blocpdb> 48 atoms in block 25 Block first atom: 1135 Blocpdb> 44 atoms in block 26 Block first atom: 1183 Blocpdb> 49 atoms in block 27 Block first atom: 1227 Blocpdb> 47 atoms in block 28 Block first atom: 1276 Blocpdb> 47 atoms in block 29 Block first atom: 1323 Blocpdb> 46 atoms in block 30 Block first atom: 1370 Blocpdb> 46 atoms in block 31 Block first atom: 1416 Blocpdb> 50 atoms in block 32 Block first atom: 1462 Blocpdb> 53 atoms in block 33 Block first atom: 1512 Blocpdb> 52 atoms in block 34 Block first atom: 1565 Blocpdb> 43 atoms in block 35 Block first atom: 1617 Blocpdb> 42 atoms in block 36 Block first atom: 1660 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1702 Blocpdb> 44 atoms in block 38 Block first atom: 1751 Blocpdb> 36 atoms in block 39 Block first atom: 1795 Blocpdb> 43 atoms in block 40 Block first atom: 1831 Blocpdb> 55 atoms in block 41 Block first atom: 1874 Blocpdb> 55 atoms in block 42 Block first atom: 1929 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 1984 Blocpdb> 50 atoms in block 44 Block first atom: 2027 Blocpdb> 52 atoms in block 45 Block first atom: 2077 Blocpdb> 49 atoms in block 46 Block first atom: 2129 Blocpdb> 52 atoms in block 47 Block first atom: 2178 Blocpdb> 48 atoms in block 48 Block first atom: 2230 Blocpdb> 39 atoms in block 49 Block first atom: 2278 Blocpdb> 49 atoms in block 50 Block first atom: 2317 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2366 Blocpdb> 52 atoms in block 52 Block first atom: 2413 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 2465 Blocpdb> 52 atoms in block 54 Block first atom: 2517 Blocpdb> 45 atoms in block 55 Block first atom: 2569 Blocpdb> 53 atoms in block 56 Block first atom: 2614 Blocpdb> 52 atoms in block 57 Block first atom: 2667 Blocpdb> 55 atoms in block 58 Block first atom: 2719 Blocpdb> 49 atoms in block 59 Block first atom: 2774 Blocpdb> 44 atoms in block 60 Block first atom: 2823 Blocpdb> 47 atoms in block 61 Block first atom: 2867 Blocpdb> 53 atoms in block 62 Block first atom: 2914 Blocpdb> 56 atoms in block 63 Block first atom: 2967 Blocpdb> 47 atoms in block 64 Block first atom: 3023 Blocpdb> 54 atoms in block 65 Block first atom: 3070 Blocpdb> 45 atoms in block 66 Block first atom: 3124 Blocpdb> 50 atoms in block 67 Block first atom: 3169 Blocpdb> 62 atoms in block 68 Block first atom: 3219 Blocpdb> 48 atoms in block 69 Block first atom: 3281 Blocpdb> 41 atoms in block 70 Block first atom: 3329 Blocpdb> 43 atoms in block 71 Block first atom: 3370 Blocpdb> 52 atoms in block 72 Block first atom: 3413 Blocpdb> 48 atoms in block 73 Block first atom: 3465 Blocpdb> 44 atoms in block 74 Block first atom: 3513 Blocpdb> 41 atoms in block 75 Block first atom: 3557 Blocpdb> 43 atoms in block 76 Block first atom: 3598 Blocpdb> 45 atoms in block 77 Block first atom: 3641 Blocpdb> 43 atoms in block 78 Block first atom: 3686 Blocpdb> 52 atoms in block 79 Block first atom: 3729 Blocpdb> 54 atoms in block 80 Block first atom: 3781 Blocpdb> 40 atoms in block 81 Block first atom: 3835 Blocpdb> 46 atoms in block 82 Block first atom: 3875 Blocpdb> 46 atoms in block 83 Block first atom: 3921 Blocpdb> 59 atoms in block 84 Block first atom: 3967 Blocpdb> 42 atoms in block 85 Block first atom: 4026 Blocpdb> 56 atoms in block 86 Block first atom: 4068 Blocpdb> 51 atoms in block 87 Block first atom: 4124 Blocpdb> 46 atoms in block 88 Block first atom: 4175 Blocpdb> 53 atoms in block 89 Block first atom: 4221 Blocpdb> 52 atoms in block 90 Block first atom: 4274 Blocpdb> 46 atoms in block 91 Block first atom: 4326 Blocpdb> 48 atoms in block 92 Block first atom: 4372 Blocpdb> 47 atoms in block 93 Block first atom: 4420 Blocpdb> 54 atoms in block 94 Block first atom: 4467 Blocpdb> 53 atoms in block 95 Block first atom: 4521 Blocpdb> 49 atoms in block 96 Block first atom: 4574 Blocpdb> 50 atoms in block 97 Block first atom: 4623 Blocpdb> 50 atoms in block 98 Block first atom: 4673 Blocpdb> 47 atoms in block 99 Block first atom: 4723 Blocpdb> 47 atoms in block 100 Block first atom: 4770 Blocpdb> 48 atoms in block 101 Block first atom: 4817 Blocpdb> 48 atoms in block 102 Block first atom: 4865 Blocpdb> 60 atoms in block 103 Block first atom: 4913 Blocpdb> 52 atoms in block 104 Block first atom: 4973 Blocpdb> 52 atoms in block 105 Block first atom: 5025 Blocpdb> 48 atoms in block 106 Block first atom: 5077 Blocpdb> 48 atoms in block 107 Block first atom: 5125 Blocpdb> 46 atoms in block 108 Block first atom: 5173 Blocpdb> 48 atoms in block 109 Block first atom: 5219 Blocpdb> 51 atoms in block 110 Block first atom: 5267 Blocpdb> 41 atoms in block 111 Block first atom: 5318 Blocpdb> 47 atoms in block 112 Block first atom: 5359 Blocpdb> 49 atoms in block 113 Block first atom: 5406 Blocpdb> 44 atoms in block 114 Block first atom: 5455 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 5499 Blocpdb> 45 atoms in block 116 Block first atom: 5546 Blocpdb> 45 atoms in block 117 Block first atom: 5591 Blocpdb> 47 atoms in block 118 Block first atom: 5636 Blocpdb> 46 atoms in block 119 Block first atom: 5683 Blocpdb> 50 atoms in block 120 Block first atom: 5729 Blocpdb> 60 atoms in block 121 Block first atom: 5779 Blocpdb> 47 atoms in block 122 Block first atom: 5839 Blocpdb> 49 atoms in block 123 Block first atom: 5886 Blocpdb> 36 atoms in block 124 Block first atom: 5935 Blocpdb> 47 atoms in block 125 Block first atom: 5971 Blocpdb> 38 atoms in block 126 Block first atom: 6018 Blocpdb> 47 atoms in block 127 Block first atom: 6056 Blocpdb> 52 atoms in block 128 Block first atom: 6103 Blocpdb> 49 atoms in block 129 Block first atom: 6155 Blocpdb> 50 atoms in block 130 Block first atom: 6204 Blocpdb> 38 atoms in block 131 Block first atom: 6254 Blocpdb> 47 atoms in block 132 Block first atom: 6292 Blocpdb> 36 atoms in block 133 Block first atom: 6339 Blocpdb> 56 atoms in block 134 Block first atom: 6375 Blocpdb> 56 atoms in block 135 Block first atom: 6431 Blocpdb> 53 atoms in block 136 Block first atom: 6487 Blocpdb> 42 atoms in block 137 Block first atom: 6540 Blocpdb> 33 atoms in block 138 Block first atom: 6582 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 6615 Blocpdb> 57 atoms in block 140 Block first atom: 6663 Blocpdb> 55 atoms in block 141 Block first atom: 6720 Blocpdb> 50 atoms in block 142 Block first atom: 6775 Blocpdb> 45 atoms in block 143 Block first atom: 6825 Blocpdb> 51 atoms in block 144 Block first atom: 6870 Blocpdb> 42 atoms in block 145 Block first atom: 6921 Blocpdb> 49 atoms in block 146 Block first atom: 6963 Blocpdb> 40 atoms in block 147 Block first atom: 7012 Blocpdb> 49 atoms in block 148 Block first atom: 7052 Blocpdb> 50 atoms in block 149 Block first atom: 7101 Blocpdb> 47 atoms in block 150 Block first atom: 7151 Blocpdb> 54 atoms in block 151 Block first atom: 7198 Blocpdb> 50 atoms in block 152 Block first atom: 7252 Blocpdb> 50 atoms in block 153 Block first atom: 7302 Blocpdb> 37 atoms in block 154 Block first atom: 7352 Blocpdb> 45 atoms in block 155 Block first atom: 7389 Blocpdb> 40 atoms in block 156 Block first atom: 7434 Blocpdb> 54 atoms in block 157 Block first atom: 7474 Blocpdb> 41 atoms in block 158 Block first atom: 7528 Blocpdb> 46 atoms in block 159 Block first atom: 7569 Blocpdb> 52 atoms in block 160 Block first atom: 7615 Blocpdb> 49 atoms in block 161 Block first atom: 7667 Blocpdb> 54 atoms in block 162 Block first atom: 7716 Blocpdb> 54 atoms in block 163 Block first atom: 7770 Blocpdb> 48 atoms in block 164 Block first atom: 7824 Blocpdb> 45 atoms in block 165 Block first atom: 7872 Blocpdb> 45 atoms in block 166 Block first atom: 7917 Blocpdb> 47 atoms in block 167 Block first atom: 7962 Blocpdb> 48 atoms in block 168 Block first atom: 8009 Blocpdb> 55 atoms in block 169 Block first atom: 8057 Blocpdb> 57 atoms in block 170 Block first atom: 8112 Blocpdb> 41 atoms in block 171 Block first atom: 8169 Blocpdb> 47 atoms in block 172 Block first atom: 8210 Blocpdb> 51 atoms in block 173 Block first atom: 8257 Blocpdb> 19 atoms in block 174 Block first atom: 8307 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 62 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 19 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3196142 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 24978 Prepmat> Matrix trace = 6992460.0000 Prepmat> Last element read: 24978 24978 159.8768 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 13805 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8326 RTB> Total mass = 8326.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8326 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 202689.7774 RTB> 48510 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 48510 Diagstd> Projected matrix trace = 202689.7774 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 202689.7774 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2114297 0.2568790 0.6200145 0.7347877 1.0465216 1.1383879 1.2542065 1.5478671 1.7110133 2.2094555 2.9252004 3.3274525 3.4926604 3.8111664 4.0669423 4.2621546 4.9375779 5.2974742 5.7926291 6.3578975 7.3557375 7.8005952 8.7404636 9.1009055 9.5030976 10.2515196 10.4975945 11.3758466 12.0172135 12.5730493 12.7837996 12.9803654 14.3958332 14.5682104 15.9097638 17.0108053 17.2778682 17.8668296 18.3916276 19.2591093 19.5055746 20.4024861 21.0888359 21.9849411 22.2774843 23.6813979 23.8464698 24.1172334 25.2481990 25.8705345 26.4111001 27.4524245 27.9144101 28.3717317 28.6597547 29.0019721 29.5438399 30.3975208 30.5710602 31.1649538 31.7937363 32.1840844 33.2702434 33.4169233 34.3432636 34.8114818 35.2561018 35.7966586 35.8729441 36.1647407 36.6233044 37.5992351 37.9762862 38.3247269 38.6792186 39.1432982 39.5505022 39.9177453 40.6768401 40.8880623 42.0431755 42.6702464 43.2024844 43.5658944 44.3268262 44.6096908 44.8393891 45.1954462 45.8985295 46.2466014 46.6047235 47.2486176 47.3278175 47.8840476 48.7244509 49.0889000 49.3553405 50.7717011 50.9813590 51.0015665 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034329 0.0034333 0.0034335 0.0034337 0.0034344 0.0034349 49.9319181 55.0376075 85.5059258 93.0842553 111.0885682 115.8618391 121.6129456 135.1021038 142.0436998 161.4127757 185.7261647 198.0848289 202.9427137 211.9943253 218.9925232 224.1867189 241.2971881 249.9365116 261.3564003 273.8117256 294.5156596 303.2907409 321.0424892 327.5952397 334.7556183 347.6877615 351.8359206 366.2580204 376.4412167 385.0486368 388.2623312 391.2359363 412.0156218 414.4750409 433.1388571 447.8759242 451.3779697 459.0067039 465.6990610 476.5553824 479.5950089 490.4975314 498.6795791 509.1642857 512.5406952 528.4439710 530.2825405 533.2845764 545.6453797 552.3291710 558.0698060 568.9651066 573.7325731 578.4132091 581.3417517 584.8022642 590.2401532 598.7070363 600.4136132 606.2175766 612.3025448 616.0498543 626.3589235 627.7381325 636.3793254 640.7026726 644.7812888 649.7054725 650.3973911 653.0372553 657.1644222 665.8628497 669.1932103 672.2561978 675.3581208 679.3975687 682.9222794 686.0855647 692.5783067 694.3741511 704.1140907 709.3455616 713.7557849 716.7514785 722.9838541 725.2869891 727.1518672 730.0332138 735.6896838 738.4739696 741.3277344 746.4312846 747.0566208 751.4337673 757.9992173 760.8287767 762.8907626 773.7597556 775.3557010 775.5093499 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8326 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2114 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2569 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6200 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7348 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.047 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.138 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.254 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.548 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.711 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.925 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.327 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.811 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.793 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.358 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.356 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.801 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.740 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.503 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.00 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 149868 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603231525221102422.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603231525221102422.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603231525221102422.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603231525221102422.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1038 First residue number = 32 Last residue number = 286 Number of atoms found = 8326 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2114 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2569 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6200 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7348 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.047 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.138 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.254 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.548 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.711 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.925 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.327 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.811 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.793 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.358 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.356 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.801 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.740 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.503 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.00 Bfactors> 106 vectors, 24978 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.211400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.040 +/- 0.07 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.040 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603231525221102422.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603231525221102422.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603231525221102422 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom making animated gifs 11 models are in 2603231525221102422.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603231525221102422.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603231525221102422.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603231525221102422 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603231525221102422.eigenfacs 2603231525221102422.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603231525221102422.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603231525221102422.10.pdb 2603231525221102422.11.pdb 2603231525221102422.7.pdb 2603231525221102422.8.pdb 2603231525221102422.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m51.333s user 0m50.994s sys 0m0.301s rm: cannot remove '2603231525221102422.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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