*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603240626001307580.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603240626001307580.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603240626001307580.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1019
First residue number = 2
Last residue number = 1020
Number of atoms found = 9475
Mean number per residue = 9.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 66.485847 +/- 18.664781 From: 24.130000 To: 122.503000
= 67.394421 +/- 16.425676 From: 19.325000 To: 101.408000
= 73.061918 +/- 23.400364 From: 22.886000 To: 131.830000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.0120 % Filled.
Pdbmat> 4088445 non-zero elements.
Pdbmat> 448045 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 94.57 +/- 27.57
Maximum number = 160
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 8.960900E+06
Pdbmat> Larger element = 584.597
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1019 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603240626001307580.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603240626001307580.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603240626001307580.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 9475 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1019 residues.
Blocpdb> 53 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 51 atoms in block 2
Block first atom: 54
Blocpdb> 52 atoms in block 3
Block first atom: 105
Blocpdb> 66 atoms in block 4
Block first atom: 157
Blocpdb> 49 atoms in block 5
Block first atom: 223
Blocpdb> 58 atoms in block 6
Block first atom: 272
Blocpdb> 84 atoms in block 7
Block first atom: 330
Blocpdb> 59 atoms in block 8
Block first atom: 414
Blocpdb> 63 atoms in block 9
Block first atom: 473
Blocpdb> 62 atoms in block 10
Block first atom: 536
Blocpdb> 62 atoms in block 11
Block first atom: 598
Blocpdb> 52 atoms in block 12
Block first atom: 660
Blocpdb> 66 atoms in block 13
Block first atom: 712
Blocpdb> 50 atoms in block 14
Block first atom: 778
Blocpdb> 54 atoms in block 15
Block first atom: 828
Blocpdb> 54 atoms in block 16
Block first atom: 882
Blocpdb> 59 atoms in block 17
Block first atom: 936
Blocpdb> 64 atoms in block 18
Block first atom: 995
Blocpdb> 53 atoms in block 19
Block first atom: 1059
Blocpdb> 56 atoms in block 20
Block first atom: 1112
Blocpdb> 45 atoms in block 21
Block first atom: 1168
Blocpdb> 48 atoms in block 22
Block first atom: 1213
Blocpdb> 43 atoms in block 23
Block first atom: 1261
Blocpdb> 56 atoms in block 24
Block first atom: 1304
Blocpdb> 52 atoms in block 25
Block first atom: 1360
Blocpdb> 52 atoms in block 26
Block first atom: 1412
Blocpdb> 57 atoms in block 27
Block first atom: 1464
Blocpdb> 52 atoms in block 28
Block first atom: 1521
Blocpdb> 64 atoms in block 29
Block first atom: 1573
Blocpdb> 53 atoms in block 30
Block first atom: 1637
Blocpdb> 55 atoms in block 31
Block first atom: 1690
Blocpdb> 55 atoms in block 32
Block first atom: 1745
Blocpdb> 37 atoms in block 33
Block first atom: 1800
Blocpdb> 51 atoms in block 34
Block first atom: 1837
Blocpdb> 60 atoms in block 35
Block first atom: 1888
Blocpdb> 56 atoms in block 36
Block first atom: 1948
Blocpdb> 67 atoms in block 37
Block first atom: 2004
Blocpdb> 44 atoms in block 38
Block first atom: 2071
Blocpdb> 67 atoms in block 39
Block first atom: 2115
Blocpdb> 55 atoms in block 40
Block first atom: 2182
Blocpdb> 61 atoms in block 41
Block first atom: 2237
Blocpdb> 53 atoms in block 42
Block first atom: 2298
Blocpdb> 57 atoms in block 43
Block first atom: 2351
Blocpdb> 54 atoms in block 44
Block first atom: 2408
Blocpdb> 53 atoms in block 45
Block first atom: 2462
Blocpdb> 68 atoms in block 46
Block first atom: 2515
Blocpdb> 47 atoms in block 47
Block first atom: 2583
Blocpdb> 49 atoms in block 48
Block first atom: 2630
Blocpdb> 61 atoms in block 49
Block first atom: 2679
Blocpdb> 56 atoms in block 50
Block first atom: 2740
Blocpdb> 61 atoms in block 51
Block first atom: 2796
Blocpdb> 54 atoms in block 52
Block first atom: 2857
Blocpdb> 50 atoms in block 53
Block first atom: 2911
Blocpdb> 48 atoms in block 54
Block first atom: 2961
Blocpdb> 48 atoms in block 55
Block first atom: 3009
Blocpdb> 55 atoms in block 56
Block first atom: 3057
Blocpdb> 43 atoms in block 57
Block first atom: 3112
Blocpdb> 50 atoms in block 58
Block first atom: 3155
Blocpdb> 53 atoms in block 59
Block first atom: 3205
Blocpdb> 69 atoms in block 60
Block first atom: 3258
Blocpdb> 67 atoms in block 61
Block first atom: 3327
Blocpdb> 59 atoms in block 62
Block first atom: 3394
Blocpdb> 56 atoms in block 63
Block first atom: 3453
Blocpdb> 60 atoms in block 64
Block first atom: 3509
Blocpdb> 59 atoms in block 65
Block first atom: 3569
Blocpdb> 62 atoms in block 66
Block first atom: 3628
Blocpdb> 57 atoms in block 67
Block first atom: 3690
Blocpdb> 55 atoms in block 68
Block first atom: 3747
Blocpdb> 67 atoms in block 69
Block first atom: 3802
Blocpdb> 64 atoms in block 70
Block first atom: 3869
Blocpdb> 57 atoms in block 71
Block first atom: 3933
Blocpdb> 57 atoms in block 72
Block first atom: 3990
Blocpdb> 48 atoms in block 73
Block first atom: 4047
Blocpdb> 49 atoms in block 74
Block first atom: 4095
Blocpdb> 59 atoms in block 75
Block first atom: 4144
Blocpdb> 60 atoms in block 76
Block first atom: 4203
Blocpdb> 64 atoms in block 77
Block first atom: 4263
Blocpdb> 52 atoms in block 78
Block first atom: 4327
Blocpdb> 61 atoms in block 79
Block first atom: 4379
Blocpdb> 45 atoms in block 80
Block first atom: 4440
Blocpdb> 47 atoms in block 81
Block first atom: 4485
Blocpdb> 52 atoms in block 82
Block first atom: 4532
Blocpdb> 56 atoms in block 83
Block first atom: 4584
Blocpdb> 72 atoms in block 84
Block first atom: 4640
Blocpdb> 68 atoms in block 85
Block first atom: 4712
Blocpdb> 41 atoms in block 86
Block first atom: 4780
Blocpdb> 55 atoms in block 87
Block first atom: 4821
Blocpdb> 60 atoms in block 88
Block first atom: 4876
Blocpdb> 51 atoms in block 89
Block first atom: 4936
Blocpdb> 52 atoms in block 90
Block first atom: 4987
Blocpdb> 56 atoms in block 91
Block first atom: 5039
Blocpdb> 45 atoms in block 92
Block first atom: 5095
Blocpdb> 49 atoms in block 93
Block first atom: 5140
Blocpdb> 71 atoms in block 94
Block first atom: 5189
Blocpdb> 50 atoms in block 95
Block first atom: 5260
Blocpdb> 60 atoms in block 96
Block first atom: 5310
Blocpdb> 57 atoms in block 97
Block first atom: 5370
Blocpdb> 60 atoms in block 98
Block first atom: 5427
Blocpdb> 58 atoms in block 99
Block first atom: 5487
Blocpdb> 48 atoms in block 100
Block first atom: 5545
Blocpdb> 52 atoms in block 101
Block first atom: 5593
Blocpdb> 57 atoms in block 102
Block first atom: 5645
Blocpdb> 51 atoms in block 103
Block first atom: 5702
Blocpdb> 66 atoms in block 104
Block first atom: 5753
Blocpdb> 56 atoms in block 105
Block first atom: 5819
Blocpdb> 56 atoms in block 106
Block first atom: 5875
Blocpdb> 49 atoms in block 107
Block first atom: 5931
Blocpdb> 66 atoms in block 108
Block first atom: 5980
Blocpdb> 63 atoms in block 109
Block first atom: 6046
Blocpdb> 53 atoms in block 110
Block first atom: 6109
Blocpdb> 49 atoms in block 111
Block first atom: 6162
Blocpdb> 55 atoms in block 112
Block first atom: 6211
Blocpdb> 51 atoms in block 113
Block first atom: 6266
Blocpdb> 42 atoms in block 114
Block first atom: 6317
Blocpdb> 55 atoms in block 115
Block first atom: 6359
Blocpdb> 78 atoms in block 116
Block first atom: 6414
Blocpdb> 63 atoms in block 117
Block first atom: 6492
Blocpdb> 59 atoms in block 118
Block first atom: 6555
Blocpdb> 53 atoms in block 119
Block first atom: 6614
Blocpdb> 49 atoms in block 120
Block first atom: 6667
Blocpdb> 57 atoms in block 121
Block first atom: 6716
Blocpdb> 44 atoms in block 122
Block first atom: 6773
Blocpdb> 51 atoms in block 123
Block first atom: 6817
Blocpdb> 50 atoms in block 124
Block first atom: 6868
Blocpdb> 54 atoms in block 125
Block first atom: 6918
Blocpdb> 41 atoms in block 126
Block first atom: 6972
Blocpdb> 67 atoms in block 127
Block first atom: 7013
Blocpdb> 41 atoms in block 128
Block first atom: 7080
Blocpdb> 57 atoms in block 129
Block first atom: 7121
Blocpdb> 57 atoms in block 130
Block first atom: 7178
Blocpdb> 50 atoms in block 131
Block first atom: 7235
Blocpdb> 52 atoms in block 132
Block first atom: 7285
Blocpdb> 42 atoms in block 133
Block first atom: 7337
Blocpdb> 56 atoms in block 134
Block first atom: 7379
Blocpdb> 48 atoms in block 135
Block first atom: 7435
Blocpdb> 53 atoms in block 136
Block first atom: 7483
Blocpdb> 59 atoms in block 137
Block first atom: 7536
Blocpdb> 57 atoms in block 138
Block first atom: 7595
Blocpdb> 58 atoms in block 139
Block first atom: 7652
Blocpdb> 60 atoms in block 140
Block first atom: 7710
Blocpdb> 58 atoms in block 141
Block first atom: 7770
Blocpdb> 59 atoms in block 142
Block first atom: 7828
Blocpdb> 50 atoms in block 143
Block first atom: 7887
Blocpdb> 58 atoms in block 144
Block first atom: 7937
Blocpdb> 58 atoms in block 145
Block first atom: 7995
Blocpdb> 60 atoms in block 146
Block first atom: 8053
Blocpdb> 55 atoms in block 147
Block first atom: 8113
Blocpdb> 74 atoms in block 148
Block first atom: 8168
Blocpdb> 58 atoms in block 149
Block first atom: 8242
Blocpdb> 72 atoms in block 150
Block first atom: 8300
Blocpdb> 50 atoms in block 151
Block first atom: 8372
Blocpdb> 70 atoms in block 152
Block first atom: 8422
Blocpdb> 60 atoms in block 153
Block first atom: 8492
Blocpdb> 57 atoms in block 154
Block first atom: 8552
Blocpdb> 59 atoms in block 155
Block first atom: 8609
Blocpdb> 50 atoms in block 156
Block first atom: 8668
Blocpdb> 58 atoms in block 157
Block first atom: 8718
Blocpdb> 49 atoms in block 158
Block first atom: 8776
Blocpdb> 56 atoms in block 159
Block first atom: 8825
Blocpdb> 55 atoms in block 160
Block first atom: 8881
Blocpdb> 50 atoms in block 161
Block first atom: 8936
Blocpdb> 65 atoms in block 162
Block first atom: 8986
Blocpdb> 56 atoms in block 163
Block first atom: 9051
Blocpdb> 52 atoms in block 164
Block first atom: 9107
Blocpdb> 48 atoms in block 165
Block first atom: 9159
Blocpdb> 47 atoms in block 166
Block first atom: 9207
Blocpdb> 56 atoms in block 167
Block first atom: 9254
Blocpdb> 60 atoms in block 168
Block first atom: 9310
Blocpdb> 68 atoms in block 169
Block first atom: 9370
Blocpdb> 38 atoms in block 170
Block first atom: 9437
Blocpdb> 170 blocks.
Blocpdb> At most, 84 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 37 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4088615 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 28425
Prepmat> Matrix trace = 8960900.0000
Prepmat> Last element read: 28425 28425 133.2377
Prepmat> 14536 lines saved.
Prepmat> 13045 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9475
RTB> Total mass = 9475.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 9475
RTB> Number of blocks = 170
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 212282.3056
RTB> 51090 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1020
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51090
Diagstd> Projected matrix trace = 212282.3056
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1020 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 212282.3056
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.3345034 0.4199283 0.6840941 0.8578310
0.9185581 1.0457582 1.1090700 2.0154183 2.0608638
2.3847888 2.8960166 2.9747898 3.1012190 3.4523671
3.8393117 4.0604937 4.1627403 4.6055252 4.8698660
5.1918605 5.5278662 5.8227198 6.7777088 6.9767674
7.3254298 7.6006174 8.2053138 9.0777493 9.4872662
10.2026788 10.3979369 10.8446625 11.4157951 11.8068833
11.8904336 12.3030517 12.8749602 13.1387159 13.2338357
14.3157212 14.4294316 14.5491757 15.2327304 15.4327890
15.6780314 16.5073498 17.2580746 17.3599188 17.9639260
18.4020206 18.9153531 19.4084635 19.5369596 20.1550809
20.6839172 21.4246748 22.1729526 22.7426500 23.2148359
23.4550246 23.8833683 24.3505420 25.2639754 25.3408609
25.6249278 26.3464405 26.6913066 27.5807124 27.8925643
28.6587472 29.0711151 29.3698597 29.5463479 29.9004089
30.6204904 30.8603244 31.4280888 31.9350316 32.5496904
32.9661053 33.3397721 34.2597008 34.7487052 35.0309350
35.1813736 35.6041798 36.2162274 36.6827647 37.0379946
37.1134560 38.1317371 38.2121130 38.4378977 38.6310853
40.0075932 40.0321265 40.7645315 40.8837548 41.2672807
41.5833188
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034312 0.0034332 0.0034334 0.0034334 0.0034337
0.0034344 62.8051906 70.3692418 89.8158940 100.5764158
104.0755222 111.0480441 114.3601623 154.1621938 155.8905992
167.6950508 184.7973771 187.2938102 191.2324091 201.7686870
212.7756686 218.8188344 221.5567258 233.0423567 239.6369518
247.4325242 255.3136531 262.0343486 282.7071123 286.8285664
293.9082899 299.3778854 311.0590761 327.1782104 334.4766649
346.8585374 350.1618823 357.6047682 366.9005493 373.1323605
374.4502515 380.8918714 389.6442101 393.6150910 395.0373415
410.8676007 412.4961434 414.2041774 423.8226456 426.5966974
429.9728622 441.1984297 451.1193458 452.4484707 460.2522385
465.8306243 472.2832108 478.3996546 479.9806940 487.5145174
493.8688966 502.6346220 511.3367947 517.8641108 523.2124739
525.9121765 530.6926442 535.8578491 545.8158279 546.6457332
549.7010997 557.3862550 561.0223938 570.2929726 573.5080284
581.3315331 585.4989566 588.4996599 590.2652057 593.7913193
600.8988198 603.2474905 608.7714349 613.6616104 619.5390868
623.4894378 627.0130704 635.6046458 640.1247124 642.7190087
644.0975929 647.9563839 653.5019447 657.6976807 660.8745265
661.5474185 670.5614387 671.2677874 673.2480334 674.9377740
686.8572601 687.0678241 693.3244372 694.3375742 697.5867236
700.2528006
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9475
Rtb_to_modes> Number of blocs = 170
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9841E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3345
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4199
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6841
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8578
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9186
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.046
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.109
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.015
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.061
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.385
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.896
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.975
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.101
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.452
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.839
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.060
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.163
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.606
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.870
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.192
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.528
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.823
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.778
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.977
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.325
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.601
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.078
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.487
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.58
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
0.99999 1.00004 0.99998 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000
0.99998 1.00001 1.00002 1.00003 1.00003
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 0.99998 0.99997 0.99997 1.00003
1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000
1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00002 0.99996 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
1.00003 1.00001 1.00004 1.00000 1.00003
0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
0.99997 1.00004 1.00000 1.00003 0.99998
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 170550 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
0.99999 1.00004 0.99998 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000
0.99998 1.00001 1.00002 1.00003 1.00003
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 0.99998 0.99997 0.99997 1.00003
1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000
1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00002 0.99996 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
1.00003 1.00001 1.00004 1.00000 1.00003
0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
0.99997 1.00004 1.00000 1.00003 0.99998
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603240626001307580.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603240626001307580.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603240626001307580.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603240626001307580.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1019
First residue number = 2
Last residue number = 1020
Number of atoms found = 9475
Mean number per residue = 9.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9841E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3345
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4199
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6841
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8578
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9186
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.109
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.015
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.061
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.385
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.896
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.975
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.101
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.452
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.839
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.060
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.163
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.606
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.870
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.192
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.528
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.823
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.778
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.977
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.325
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.601
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.078
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.487
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.58
Bfactors> 106 vectors, 28425 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.334500
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.273 for 1019 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.031 +/- 0.08
Bfactors> = 0.890 +/- 0.08
Bfactors> Shiftng-fct= 0.859
Bfactors> Scaling-fct= 1.029
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603240626001307580.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603240626001307580.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.2
Chkmod> 106 vectors, 28425 coordinates in file.
Chkmod> That is: 9475 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6763
0.0034 0.7504
0.0034 0.6821
0.0034 0.9845
0.0034 0.8848
0.0034 0.8525
62.8022 0.2918
70.3638 0.4846
89.8124 0.1888
100.5703 0.1143
104.0734 0.0885
111.0561 0.4746
114.3516 0.1834
154.1396 0.3770
155.8891 0.3147
167.6953 0.2848
184.7889 0.1483
187.2924 0.4823
191.2174 0.0936
201.7493 0.2588
212.7579 0.2300
218.7961 0.4805
221.5541 0.4129
233.0444 0.2573
239.6300 0.5587
247.4252 0.2194
255.3058 0.3283
262.0294 0.3353
282.7010 0.2499
286.8210 0.5323
293.8871 0.2042
299.3726 0.3721
311.0398 0.3020
327.1687 0.3744
334.4576 0.1006
346.7981 0.3317
350.1816 0.4583
357.5125 0.1705
366.9524 0.3170
373.1656 0.3740
374.4273 0.2505
380.8283 0.4322
389.5524 0.2222
393.6174 0.3361
394.9631 0.2626
410.9114 0.2618
412.4866 0.0733
414.1981 0.2348
423.7665 0.1573
426.5398 0.2048
429.9814 0.2597
441.2149 0.4417
451.1251 0.3778
452.4301 0.2759
460.1822 0.1846
465.7851 0.2654
472.3209 0.3301
478.3981 0.3100
479.9974 0.2835
487.5531 0.2080
493.8009 0.1764
502.5582 0.1648
511.2808 0.3565
517.8117 0.2645
523.1355 0.4278
525.9454 0.3183
530.6324 0.4622
535.8289 0.4247
545.7495 0.5146
546.6130 0.2107
549.6246 0.0893
557.4000 0.2705
560.9846 0.5068
570.2611 0.4597
573.4570 0.3328
581.3193 0.4395
585.4626 0.3470
588.4758 0.2962
590.2763 0.4283
593.7618 0.0647
600.8682 0.4758
603.2184 0.4877
608.7638 0.3789
613.6830 0.4407
619.5154 0.4361
623.4995 0.2735
626.9883 0.4535
635.5801 0.4559
640.1092 0.5013
642.6828 0.4401
644.0574 0.1828
647.8905 0.4081
653.5079 0.4731
657.6447 0.4826
660.8640 0.5003
661.4882 0.4379
670.5174 0.4608
671.2204 0.4453
673.2375 0.4871
674.8993 0.4748
686.8484 0.5119
687.0201 0.1709
693.2561 0.3582
694.2759 0.3198
697.5798 0.3268
700.1948 0.4592
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240626001307580 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240626001307580.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240626001307580 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240626001307580.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240626001307580 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240626001307580.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240626001307580 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240626001307580.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240626001307580 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240626001307580.eigenfacs
2603240626001307580.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240626001307580.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240626001307580.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603240626001307580.10.pdb
2603240626001307580.11.pdb
2603240626001307580.7.pdb
2603240626001307580.8.pdb
2603240626001307580.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m55.761s
user 0m54.911s
sys 0m0.788s
rm: cannot remove '2603240626001307580.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
