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LOGs for ID: 2603240900321343854

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603240900321343854.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603240900321343854.atom to be opened. Openam> File opened: 2603240900321343854.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 373 First residue number = 1 Last residue number = 373 Number of atoms found = 2742 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = -8.810594 +/- 13.360580 From: -43.623000 To: 17.382000 = 35.269536 +/- 10.872079 From: 6.412000 To: 66.693000 = -22.921443 +/- 12.590753 From: -54.584000 To: 7.233000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.0357 % Filled. Pdbmat> 1027210 non-zero elements. Pdbmat> 112322 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.93 +/- 21.63 Maximum number = 129 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.246440E+06 Pdbmat> Larger element = 496.010 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 373 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603240900321343854.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603240900321343854.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603240900321343854.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2742 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 373 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 11 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 31 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 46 Blocpdb> 16 atoms in block 5 Block first atom: 62 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 78 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 94 Blocpdb> 18 atoms in block 8 Block first atom: 114 Blocpdb> 13 atoms in block 9 Block first atom: 132 Blocpdb> 14 atoms in block 10 Block first atom: 145 Blocpdb> 9 atoms in block 11 Block first atom: 159 Blocpdb> 12 atoms in block 12 Block first atom: 168 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 180 Blocpdb> 18 atoms in block 14 Block first atom: 197 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 215 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 230 Blocpdb> 15 atoms in block 17 Block first atom: 249 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 264 Blocpdb> 9 atoms in block 19 Block first atom: 281 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 290 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 299 Blocpdb> 11 atoms in block 22 Block first atom: 312 Blocpdb> 15 atoms in block 23 Block first atom: 323 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 351 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 370 Blocpdb> 9 atoms in block 27 Block first atom: 384 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 393 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 407 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 422 Blocpdb> 13 atoms in block 31 Block first atom: 433 Blocpdb> 16 atoms in block 32 Block first atom: 446 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 462 Blocpdb> 13 atoms in block 34 Block first atom: 481 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 494 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 510 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 526 Blocpdb> 18 atoms in block 38 Block first atom: 542 Blocpdb> 15 atoms in block 39 Block first atom: 560 Blocpdb> 10 atoms in block 40 Block first atom: 575 Blocpdb> 21 atoms in block 41 Block first atom: 585 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 606 Blocpdb> 19 atoms in block 43 Block first atom: 621 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 640 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 654 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 671 Blocpdb> 18 atoms in block 47 Block first atom: 690 Blocpdb> 18 atoms in block 48 Block first atom: 708 Blocpdb> 13 atoms in block 49 Block first atom: 726 Blocpdb> 11 atoms in block 50 Block first atom: 739 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 750 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 766 Blocpdb> 13 atoms in block 53 Block first atom: 779 Blocpdb> 16 atoms in block 54 Block first atom: 792 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 808 Blocpdb> 11 atoms in block 56 Block first atom: 822 Blocpdb> 13 atoms in block 57 Block first atom: 833 Blocpdb> 13 atoms in block 58 Block first atom: 846 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 859 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 880 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 894 Blocpdb> 13 atoms in block 62 Block first atom: 910 Blocpdb> 9 atoms in block 63 Block first atom: 923 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 932 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 947 Blocpdb> 12 atoms in block 66 Block first atom: 963 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 975 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 989 Blocpdb> 9 atoms in block 69 Block first atom: 1005 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1014 Blocpdb> 10 atoms in block 71 Block first atom: 1033 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1043 Blocpdb> 9 atoms in block 73 Block first atom: 1059 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1068 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1090 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1106 Blocpdb> 13 atoms in block 77 Block first atom: 1124 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1137 Blocpdb> 11 atoms in block 79 Block first atom: 1152 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1163 Blocpdb> 8 atoms in block 81 Block first atom: 1179 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1187 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 1201 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 1212 Blocpdb> 13 atoms in block 85 Block first atom: 1228 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1241 Blocpdb> 15 atoms in block 87 Block first atom: 1255 Blocpdb> 9 atoms in block 88 Block first atom: 1270 Blocpdb> 11 atoms in block 89 Block first atom: 1279 Blocpdb> 9 atoms in block 90 Block first atom: 1290 Blocpdb> 20 atoms in block 91 Block first atom: 1299 Blocpdb> 10 atoms in block 92 Block first atom: 1319 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 1329 Blocpdb> 13 atoms in block 94 Block first atom: 1348 Blocpdb> 12 atoms in block 95 Block first atom: 1361 Blocpdb> 9 atoms in block 96 Block first atom: 1373 Blocpdb> 14 atoms in block 97 Block first atom: 1382 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1396 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1410 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1426 Blocpdb> 16 atoms in block 101 Block first atom: 1442 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 1458 Blocpdb> 20 atoms in block 103 Block first atom: 1475 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1495 Blocpdb> 14 atoms in block 105 Block first atom: 1511 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 1525 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1545 Blocpdb> 18 atoms in block 108 Block first atom: 1560 Blocpdb> 18 atoms in block 109 Block first atom: 1578 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1596 Blocpdb> 11 atoms in block 111 Block first atom: 1614 Blocpdb> 21 atoms in block 112 Block first atom: 1625 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1646 Blocpdb> 9 atoms in block 114 Block first atom: 1663 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1672 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 1688 Blocpdb> 16 atoms in block 117 Block first atom: 1704 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1720 Blocpdb> 9 atoms in block 119 Block first atom: 1735 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1744 Blocpdb> 14 atoms in block 121 Block first atom: 1759 Blocpdb> 9 atoms in block 122 Block first atom: 1773 Blocpdb> 14 atoms in block 123 Block first atom: 1782 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1796 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1812 Blocpdb> 14 atoms in block 126 Block first atom: 1827 Blocpdb> 14 atoms in block 127 Block first atom: 1841 Blocpdb> 12 atoms in block 128 Block first atom: 1855 Blocpdb> 18 atoms in block 129 Block first atom: 1867 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 1885 Blocpdb> 9 atoms in block 131 Block first atom: 1901 Blocpdb> 15 atoms in block 132 Block first atom: 1910 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 1925 Blocpdb> 13 atoms in block 134 Block first atom: 1940 Blocpdb> 16 atoms in block 135 Block first atom: 1953 Blocpdb> 13 atoms in block 136 Block first atom: 1969 Blocpdb> 10 atoms in block 137 Block first atom: 1982 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 1992 Blocpdb> 10 atoms in block 139 Block first atom: 2012 Blocpdb> 18 atoms in block 140 Block first atom: 2022 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2040 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 2054 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2074 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 2091 Blocpdb> 12 atoms in block 145 Block first atom: 2109 Blocpdb> 18 atoms in block 146 Block first atom: 2121 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2139 Blocpdb> 23 atoms in block 148 Block first atom: 2154 Blocpdb> 13 atoms in block 149 Block first atom: 2177 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2190 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2203 Blocpdb> 11 atoms in block 152 Block first atom: 2218 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2229 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2243 Blocpdb> 13 atoms in block 155 Block first atom: 2259 Blocpdb> 17 atoms in block 156 Block first atom: 2272 Blocpdb> 15 atoms in block 157 Block first atom: 2289 Blocpdb> 13 atoms in block 158 Block first atom: 2304 Blocpdb> 15 atoms in block 159 Block first atom: 2317 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 2332 Blocpdb> 15 atoms in block 161 Block first atom: 2351 Blocpdb> 17 atoms in block 162 Block first atom: 2366 Blocpdb> 13 atoms in block 163 Block first atom: 2383 Blocpdb> 14 atoms in block 164 Block first atom: 2396 Blocpdb> 25 atoms in block 165 Block first atom: 2410 Blocpdb> 10 atoms in block 166 Block first atom: 2435 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 2445 Blocpdb> 14 atoms in block 168 Block first atom: 2462 Blocpdb> 12 atoms in block 169 Block first atom: 2476 Blocpdb> 13 atoms in block 170 Block first atom: 2488 Blocpdb> 13 atoms in block 171 Block first atom: 2501 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 2514 Blocpdb> 17 atoms in block 173 Block first atom: 2528 Blocpdb> 13 atoms in block 174 Block first atom: 2545 Blocpdb> 13 atoms in block 175 Block first atom: 2558 Blocpdb> 14 atoms in block 176 Block first atom: 2571 Blocpdb> 20 atoms in block 177 Block first atom: 2585 Blocpdb> 12 atoms in block 178 Block first atom: 2605 Blocpdb> 15 atoms in block 179 Block first atom: 2617 Blocpdb> 12 atoms in block 180 Block first atom: 2632 Blocpdb> 14 atoms in block 181 Block first atom: 2644 Blocpdb> 18 atoms in block 182 Block first atom: 2658 Blocpdb> 16 atoms in block 183 Block first atom: 2676 Blocpdb> 11 atoms in block 184 Block first atom: 2692 Blocpdb> 15 atoms in block 185 Block first atom: 2703 Blocpdb> 15 atoms in block 186 Block first atom: 2718 Blocpdb> 10 atoms in block 187 Block first atom: 2732 Blocpdb> 187 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1027397 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8226 Prepmat> Matrix trace = 2246440.0000 Prepmat> Last element read: 8226 8226 64.8498 Prepmat> 17579 lines saved. Prepmat> 15410 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2742 RTB> Total mass = 2742.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2742 RTB> Number of blocks = 187 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 264040.0048 RTB> 75243 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1122 Diagstd> Nb of non-zero elements: 75243 Diagstd> Projected matrix trace = 264040.0048 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1122 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 264040.0048 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.3640778 1.6969064 2.2056329 3.6133159 5.3720380 5.7815274 6.4966650 7.4324710 7.6183447 9.1129900 10.0206652 11.2093938 11.5490718 12.3017119 13.2313411 13.7096633 15.2580745 15.5265084 16.5676064 18.0105515 19.0570983 19.4409436 20.6353197 21.1846575 22.1762661 22.3375780 23.0689875 24.2150117 24.6161213 25.7079335 26.1201739 26.2739505 27.4848184 27.9683456 28.2275821 28.6331174 29.0680124 29.8931988 30.6131417 32.0898847 32.7245314 32.9951995 33.4166059 34.8719863 35.3561458 36.0520883 36.3220735 37.6114137 38.0237627 39.0003939 39.5382108 40.3053417 40.6616507 41.7308210 41.8917307 42.5833987 43.3431343 44.4420877 45.4056083 45.9002692 46.3557801 47.3148828 47.6205136 48.2483383 48.7455170 50.1828811 51.0771880 51.4755964 51.6910071 52.5247862 53.3391205 53.5158838 53.8450127 54.9450545 55.7301409 56.1934414 56.3734218 56.8293355 57.9574165 58.6339011 59.2265264 59.7030120 59.8339605 60.7813721 60.8931773 61.8179930 62.0418084 63.2298617 63.9060814 64.9998398 65.1187766 65.2964501 65.6211363 67.1098419 67.5962031 68.2068440 68.7751476 69.5627658 69.7837000 70.3500773 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034323 0.0034330 0.0034331 0.0034334 0.0034367 126.8279139 141.4569283 161.2730854 206.4183235 251.6893382 261.1058324 276.7837049 296.0478359 299.7268091 327.8126641 343.7506721 363.5685792 369.0360743 380.8711310 395.0001066 402.0764845 424.1750755 427.8900433 442.0029469 460.8491443 474.0494726 478.7997896 493.2883748 499.8112235 511.3749996 513.2315213 521.5663299 534.3645293 538.7720924 550.5906907 554.9876412 556.6189264 569.3006978 574.2865817 576.9419524 581.0715295 585.4677113 593.7197216 600.8267095 615.1476349 621.2007886 623.7645071 627.7351518 641.2592211 645.6954682 652.0193634 654.4562156 665.9706793 669.6113802 678.1562627 682.8161528 689.4084210 692.4489851 701.4936513 702.8447932 708.6233201 714.9166922 723.9232185 731.7285993 735.7036258 739.3451486 746.9545282 749.3631241 754.2867183 758.1630605 769.2598678 776.0840720 779.1049685 780.7334325 787.0048833 793.0822048 794.3952367 796.8343038 804.9327253 810.6629989 814.0256605 815.3282284 818.6185266 826.7035248 831.5142102 835.7057906 839.0607410 839.9804060 846.6044175 847.3827092 853.7932770 855.3374830 863.4881786 868.0932402 875.4904706 876.2910914 877.4857364 879.6646779 889.5869187 892.8046249 896.8282040 900.5566675 905.6986093 907.1357368 910.8095378 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2742 Rtb_to_modes> Number of blocs = 187 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.206 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.613 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.782 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.497 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.432 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.618 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.113 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.35 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 49356 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603240900321343854.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603240900321343854.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603240900321343854.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603240900321343854.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 373 First residue number = 1 Last residue number = 373 Number of atoms found = 2742 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.206 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.613 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.782 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.497 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.432 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.618 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.113 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.35 Bfactors> 106 vectors, 8226 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.364000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.049 for 374 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.030 +/- 0.05 Bfactors> = 19.540 +/- 6.50 Bfactors> Shiftng-fct= 19.510 Bfactors> Scaling-fct= 135.913 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603240900321343854.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603240900321343854.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8 Chkmod> 106 vectors, 8226 coordinates in file. Chkmod> That is: 2742 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7055 0.0034 0.9035 0.0034 0.7812 0.0034 0.9064 0.0034 0.8257 0.0034 0.8096 126.8189 0.5705 141.4548 0.7170 161.2796 0.5168 206.4004 0.0279 251.6776 0.3232 261.1053 0.4550 276.7790 0.5682 296.0257 0.2665 299.7072 0.3409 327.7988 0.1894 343.7245 0.0198 363.5628 0.3673 369.0351 0.3565 380.8283 0.3649 394.9631 0.2374 402.0642 0.4418 424.1836 0.3663 427.9198 0.2393 442.0159 0.2908 460.8223 0.2067 474.0652 0.2517 478.7676 0.5685 493.3231 0.3487 499.7348 0.4640 511.3961 0.3476 513.2373 0.4803 521.5554 0.3079 534.3966 0.7166 538.7914 0.2728 550.5892 0.1508 554.9620 0.5671 556.5532 0.1674 569.2264 0.4797 574.2789 0.3939 576.9419 0.3387 581.0150 0.4415 585.4626 0.4334 593.6625 0.2029 600.7701 0.3843 615.1223 0.5178 621.1311 0.3709 623.7831 0.6555 627.7401 0.4982 641.2134 0.4908 645.7029 0.5387 651.9725 0.3954 654.4094 0.4430 665.9296 0.1625 669.5495 0.4547 678.1237 0.4337 682.8023 0.4677 689.4187 0.5944 692.4052 0.5912 701.4566 0.5949 702.8001 0.4911 708.5646 0.5202 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DQ=-80 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom making animated gifs 11 models are in 2603240900321343854.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603240900321343854.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603240900321343854.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603240900321343854.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom making animated gifs 11 models are in 2603240900321343854.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603240900321343854.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603240900321343854.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603240900321343854.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603240900321343854.eigenfacs 2603240900321343854.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603240900321343854.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603240900321343854.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603240900321343854.10.pdb 2603240900321343854.11.pdb 2603240900321343854.7.pdb 2603240900321343854.8.pdb 2603240900321343854.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m29.114s user 0m28.980s sys 0m0.120s rm: cannot remove '2603240900321343854.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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