***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603240900321343854.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603240900321343854.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603240900321343854.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 373
First residue number = 1
Last residue number = 373
Number of atoms found = 2742
Mean number per residue = 7.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -8.810594 +/- 13.360580 From: -43.623000 To: 17.382000
= 35.269536 +/- 10.872079 From: 6.412000 To: 66.693000
= -22.921443 +/- 12.590753 From: -54.584000 To: 7.233000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.0357 % Filled.
Pdbmat> 1027210 non-zero elements.
Pdbmat> 112322 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.93 +/- 21.63
Maximum number = 129
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 2.246440E+06
Pdbmat> Larger element = 496.010
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
373 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603240900321343854.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603240900321343854.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603240900321343854.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2742 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 373 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 31
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 46
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 62
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 78
Blocpdb> 20 atoms in block 7
Block first atom: 94
Blocpdb> 18 atoms in block 8
Block first atom: 114
Blocpdb> 13 atoms in block 9
Block first atom: 132
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 145
Blocpdb> 9 atoms in block 11
Block first atom: 159
Blocpdb> 12 atoms in block 12
Block first atom: 168
Blocpdb> 17 atoms in block 13
Block first atom: 180
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 197
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 215
Blocpdb> 19 atoms in block 16
Block first atom: 230
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 249
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 264
Blocpdb> 9 atoms in block 19
Block first atom: 281
Blocpdb> 9 atoms in block 20
Block first atom: 290
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 299
Blocpdb> 11 atoms in block 22
Block first atom: 312
Blocpdb> 15 atoms in block 23
Block first atom: 323
Blocpdb> 13 atoms in block 24
Block first atom: 338
Blocpdb> 19 atoms in block 25
Block first atom: 351
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 370
Blocpdb> 9 atoms in block 27
Block first atom: 384
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 393
Blocpdb> 15 atoms in block 29
Block first atom: 407
Blocpdb> 11 atoms in block 30
Block first atom: 422
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 433
Blocpdb> 16 atoms in block 32
Block first atom: 446
Blocpdb> 19 atoms in block 33
Block first atom: 462
Blocpdb> 13 atoms in block 34
Block first atom: 481
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 494
Blocpdb> 16 atoms in block 36
Block first atom: 510
Blocpdb> 16 atoms in block 37
Block first atom: 526
Blocpdb> 18 atoms in block 38
Block first atom: 542
Blocpdb> 15 atoms in block 39
Block first atom: 560
Blocpdb> 10 atoms in block 40
Block first atom: 575
Blocpdb> 21 atoms in block 41
Block first atom: 585
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 606
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 621
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 640
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 654
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 671
Blocpdb> 18 atoms in block 47
Block first atom: 690
Blocpdb> 18 atoms in block 48
Block first atom: 708
Blocpdb> 13 atoms in block 49
Block first atom: 726
Blocpdb> 11 atoms in block 50
Block first atom: 739
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 750
Blocpdb> 13 atoms in block 52
Block first atom: 766
Blocpdb> 13 atoms in block 53
Block first atom: 779
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 792
Blocpdb> 14 atoms in block 55
Block first atom: 808
Blocpdb> 11 atoms in block 56
Block first atom: 822
Blocpdb> 13 atoms in block 57
Block first atom: 833
Blocpdb> 13 atoms in block 58
Block first atom: 846
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 859
Blocpdb> 14 atoms in block 60
Block first atom: 880
Blocpdb> 16 atoms in block 61
Block first atom: 894
Blocpdb> 13 atoms in block 62
Block first atom: 910
Blocpdb> 9 atoms in block 63
Block first atom: 923
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 932
Blocpdb> 16 atoms in block 65
Block first atom: 947
Blocpdb> 12 atoms in block 66
Block first atom: 963
Blocpdb> 14 atoms in block 67
Block first atom: 975
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 989
Blocpdb> 9 atoms in block 69
Block first atom: 1005
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 1014
Blocpdb> 10 atoms in block 71
Block first atom: 1033
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1043
Blocpdb> 9 atoms in block 73
Block first atom: 1059
Blocpdb> 22 atoms in block 74
Block first atom: 1068
Blocpdb> 16 atoms in block 75
Block first atom: 1090
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1106
Blocpdb> 13 atoms in block 77
Block first atom: 1124
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1137
Blocpdb> 11 atoms in block 79
Block first atom: 1152
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 1163
Blocpdb> 8 atoms in block 81
Block first atom: 1179
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1187
Blocpdb> 11 atoms in block 83
Block first atom: 1201
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1212
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1228
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1241
Blocpdb> 15 atoms in block 87
Block first atom: 1255
Blocpdb> 9 atoms in block 88
Block first atom: 1270
Blocpdb> 11 atoms in block 89
Block first atom: 1279
Blocpdb> 9 atoms in block 90
Block first atom: 1290
Blocpdb> 20 atoms in block 91
Block first atom: 1299
Blocpdb> 10 atoms in block 92
Block first atom: 1319
Blocpdb> 19 atoms in block 93
Block first atom: 1329
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1348
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 1361
Blocpdb> 9 atoms in block 96
Block first atom: 1373
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1382
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1396
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1410
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1426
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1442
Blocpdb> 17 atoms in block 102
Block first atom: 1458
Blocpdb> 20 atoms in block 103
Block first atom: 1475
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1495
Blocpdb> 14 atoms in block 105
Block first atom: 1511
Blocpdb> 20 atoms in block 106
Block first atom: 1525
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1545
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1560
Blocpdb> 18 atoms in block 109
Block first atom: 1578
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1596
Blocpdb> 11 atoms in block 111
Block first atom: 1614
Blocpdb> 21 atoms in block 112
Block first atom: 1625
Blocpdb> 17 atoms in block 113
Block first atom: 1646
Blocpdb> 9 atoms in block 114
Block first atom: 1663
Blocpdb> 16 atoms in block 115
Block first atom: 1672
Blocpdb> 16 atoms in block 116
Block first atom: 1688
Blocpdb> 16 atoms in block 117
Block first atom: 1704
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1720
Blocpdb> 9 atoms in block 119
Block first atom: 1735
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1744
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1759
Blocpdb> 9 atoms in block 122
Block first atom: 1773
Blocpdb> 14 atoms in block 123
Block first atom: 1782
Blocpdb> 16 atoms in block 124
Block first atom: 1796
Blocpdb> 15 atoms in block 125
Block first atom: 1812
Blocpdb> 14 atoms in block 126
Block first atom: 1827
Blocpdb> 14 atoms in block 127
Block first atom: 1841
Blocpdb> 12 atoms in block 128
Block first atom: 1855
Blocpdb> 18 atoms in block 129
Block first atom: 1867
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 1885
Blocpdb> 9 atoms in block 131
Block first atom: 1901
Blocpdb> 15 atoms in block 132
Block first atom: 1910
Blocpdb> 15 atoms in block 133
Block first atom: 1925
Blocpdb> 13 atoms in block 134
Block first atom: 1940
Blocpdb> 16 atoms in block 135
Block first atom: 1953
Blocpdb> 13 atoms in block 136
Block first atom: 1969
Blocpdb> 10 atoms in block 137
Block first atom: 1982
Blocpdb> 20 atoms in block 138
Block first atom: 1992
Blocpdb> 10 atoms in block 139
Block first atom: 2012
Blocpdb> 18 atoms in block 140
Block first atom: 2022
Blocpdb> 14 atoms in block 141
Block first atom: 2040
Blocpdb> 20 atoms in block 142
Block first atom: 2054
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 2074
Blocpdb> 18 atoms in block 144
Block first atom: 2091
Blocpdb> 12 atoms in block 145
Block first atom: 2109
Blocpdb> 18 atoms in block 146
Block first atom: 2121
Blocpdb> 15 atoms in block 147
Block first atom: 2139
Blocpdb> 23 atoms in block 148
Block first atom: 2154
Blocpdb> 13 atoms in block 149
Block first atom: 2177
Blocpdb> 13 atoms in block 150
Block first atom: 2190
Blocpdb> 15 atoms in block 151
Block first atom: 2203
Blocpdb> 11 atoms in block 152
Block first atom: 2218
Blocpdb> 14 atoms in block 153
Block first atom: 2229
Blocpdb> 16 atoms in block 154
Block first atom: 2243
Blocpdb> 13 atoms in block 155
Block first atom: 2259
Blocpdb> 17 atoms in block 156
Block first atom: 2272
Blocpdb> 15 atoms in block 157
Block first atom: 2289
Blocpdb> 13 atoms in block 158
Block first atom: 2304
Blocpdb> 15 atoms in block 159
Block first atom: 2317
Blocpdb> 19 atoms in block 160
Block first atom: 2332
Blocpdb> 15 atoms in block 161
Block first atom: 2351
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 2366
Blocpdb> 13 atoms in block 163
Block first atom: 2383
Blocpdb> 14 atoms in block 164
Block first atom: 2396
Blocpdb> 25 atoms in block 165
Block first atom: 2410
Blocpdb> 10 atoms in block 166
Block first atom: 2435
Blocpdb> 17 atoms in block 167
Block first atom: 2445
Blocpdb> 14 atoms in block 168
Block first atom: 2462
Blocpdb> 12 atoms in block 169
Block first atom: 2476
Blocpdb> 13 atoms in block 170
Block first atom: 2488
Blocpdb> 13 atoms in block 171
Block first atom: 2501
Blocpdb> 14 atoms in block 172
Block first atom: 2514
Blocpdb> 17 atoms in block 173
Block first atom: 2528
Blocpdb> 13 atoms in block 174
Block first atom: 2545
Blocpdb> 13 atoms in block 175
Block first atom: 2558
Blocpdb> 14 atoms in block 176
Block first atom: 2571
Blocpdb> 20 atoms in block 177
Block first atom: 2585
Blocpdb> 12 atoms in block 178
Block first atom: 2605
Blocpdb> 15 atoms in block 179
Block first atom: 2617
Blocpdb> 12 atoms in block 180
Block first atom: 2632
Blocpdb> 14 atoms in block 181
Block first atom: 2644
Blocpdb> 18 atoms in block 182
Block first atom: 2658
Blocpdb> 16 atoms in block 183
Block first atom: 2676
Blocpdb> 11 atoms in block 184
Block first atom: 2692
Blocpdb> 15 atoms in block 185
Block first atom: 2703
Blocpdb> 15 atoms in block 186
Block first atom: 2718
Blocpdb> 10 atoms in block 187
Block first atom: 2732
Blocpdb> 187 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1027397 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8226
Prepmat> Matrix trace = 2246440.0000
Prepmat> Last element read: 8226 8226 64.8498
Prepmat> 17579 lines saved.
Prepmat> 15410 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2742
RTB> Total mass = 2742.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2742
RTB> Number of blocks = 187
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 264040.0048
RTB> 75243 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1122
Diagstd> Nb of non-zero elements: 75243
Diagstd> Projected matrix trace = 264040.0048
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1122 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 264040.0048
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.3640778 1.6969064 2.2056329 3.6133159
5.3720380 5.7815274 6.4966650 7.4324710 7.6183447
9.1129900 10.0206652 11.2093938 11.5490718 12.3017119
13.2313411 13.7096633 15.2580745 15.5265084 16.5676064
18.0105515 19.0570983 19.4409436 20.6353197 21.1846575
22.1762661 22.3375780 23.0689875 24.2150117 24.6161213
25.7079335 26.1201739 26.2739505 27.4848184 27.9683456
28.2275821 28.6331174 29.0680124 29.8931988 30.6131417
32.0898847 32.7245314 32.9951995 33.4166059 34.8719863
35.3561458 36.0520883 36.3220735 37.6114137 38.0237627
39.0003939 39.5382108 40.3053417 40.6616507 41.7308210
41.8917307 42.5833987 43.3431343 44.4420877 45.4056083
45.9002692 46.3557801 47.3148828 47.6205136 48.2483383
48.7455170 50.1828811 51.0771880 51.4755964 51.6910071
52.5247862 53.3391205 53.5158838 53.8450127 54.9450545
55.7301409 56.1934414 56.3734218 56.8293355 57.9574165
58.6339011 59.2265264 59.7030120 59.8339605 60.7813721
60.8931773 61.8179930 62.0418084 63.2298617 63.9060814
64.9998398 65.1187766 65.2964501 65.6211363 67.1098419
67.5962031 68.2068440 68.7751476 69.5627658 69.7837000
70.3500773
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034323 0.0034330 0.0034331 0.0034334
0.0034367 126.8279139 141.4569283 161.2730854 206.4183235
251.6893382 261.1058324 276.7837049 296.0478359 299.7268091
327.8126641 343.7506721 363.5685792 369.0360743 380.8711310
395.0001066 402.0764845 424.1750755 427.8900433 442.0029469
460.8491443 474.0494726 478.7997896 493.2883748 499.8112235
511.3749996 513.2315213 521.5663299 534.3645293 538.7720924
550.5906907 554.9876412 556.6189264 569.3006978 574.2865817
576.9419524 581.0715295 585.4677113 593.7197216 600.8267095
615.1476349 621.2007886 623.7645071 627.7351518 641.2592211
645.6954682 652.0193634 654.4562156 665.9706793 669.6113802
678.1562627 682.8161528 689.4084210 692.4489851 701.4936513
702.8447932 708.6233201 714.9166922 723.9232185 731.7285993
735.7036258 739.3451486 746.9545282 749.3631241 754.2867183
758.1630605 769.2598678 776.0840720 779.1049685 780.7334325
787.0048833 793.0822048 794.3952367 796.8343038 804.9327253
810.6629989 814.0256605 815.3282284 818.6185266 826.7035248
831.5142102 835.7057906 839.0607410 839.9804060 846.6044175
847.3827092 853.7932770 855.3374830 863.4881786 868.0932402
875.4904706 876.2910914 877.4857364 879.6646779 889.5869187
892.8046249 896.8282040 900.5566675 905.6986093 907.1357368
910.8095378
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2742
Rtb_to_modes> Number of blocs = 187
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0016E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.364
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.697
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.206
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.613
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.372
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.782
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.497
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.432
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.618
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.113
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.35
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997
1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002
1.00000 0.99997 1.00003 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 0.99996
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997
0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000
1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997
0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
0.99996 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 49356 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997
1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002
1.00000 0.99997 1.00003 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 0.99996
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997
0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000
1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001
0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997
0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
0.99996 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603240900321343854.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603240900321343854.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603240900321343854.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603240900321343854.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 373
First residue number = 1
Last residue number = 373
Number of atoms found = 2742
Mean number per residue = 7.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0016E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.364
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.697
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.206
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.613
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.372
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.782
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.497
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.432
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.618
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.113
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.35
Bfactors> 106 vectors, 8226 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.364000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.049 for 374 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.030 +/- 0.05
Bfactors> = 19.540 +/- 6.50
Bfactors> Shiftng-fct= 19.510
Bfactors> Scaling-fct= 135.913
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603240900321343854.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603240900321343854.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8
Chkmod> 106 vectors, 8226 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2742 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7055
0.0034 0.9035
0.0034 0.7812
0.0034 0.9064
0.0034 0.8257
0.0034 0.8096
126.8189 0.5705
141.4548 0.7170
161.2796 0.5168
206.4004 0.0279
251.6776 0.3232
261.1053 0.4550
276.7790 0.5682
296.0257 0.2665
299.7072 0.3409
327.7988 0.1894
343.7245 0.0198
363.5628 0.3673
369.0351 0.3565
380.8283 0.3649
394.9631 0.2374
402.0642 0.4418
424.1836 0.3663
427.9198 0.2393
442.0159 0.2908
460.8223 0.2067
474.0652 0.2517
478.7676 0.5685
493.3231 0.3487
499.7348 0.4640
511.3961 0.3476
513.2373 0.4803
521.5554 0.3079
534.3966 0.7166
538.7914 0.2728
550.5892 0.1508
554.9620 0.5671
556.5532 0.1674
569.2264 0.4797
574.2789 0.3939
576.9419 0.3387
581.0150 0.4415
585.4626 0.4334
593.6625 0.2029
600.7701 0.3843
615.1223 0.5178
621.1311 0.3709
623.7831 0.6555
627.7401 0.4982
641.2134 0.4908
645.7029 0.5387
651.9725 0.3954
654.4094 0.4430
665.9296 0.1625
669.5495 0.4547
678.1237 0.4337
682.8023 0.4677
689.4187 0.5944
692.4052 0.5912
701.4566 0.5949
702.8001 0.4911
708.5646 0.5202
714.8602 0.4770
723.8751 0.4747
731.7326 0.4619
735.6699 0.6083
739.3471 0.4916
746.8839 0.4526
749.3269 0.4308
754.2673 0.5314
758.1654 0.4547
769.2048 0.4254
776.0721 0.4341
779.1048 0.4957
780.6923 0.4336
786.9352 0.4618
793.0547 0.5157
794.3917 0.5086
796.8370 0.5090
804.9344 0.4362
810.6272 0.3665
813.9658 0.4799
815.2685 0.5145
818.5882 0.4823
826.6865 0.3363
831.4509 0.5008
835.6944 0.3426
839.0036 0.5144
839.9165 0.2027
846.5585 0.4274
847.3242 0.2414
853.7705 0.4299
855.2883 0.4877
863.4521 0.3198
868.0826 0.3933
875.4540 0.3553
876.2617 0.4377
877.4719 0.4771
879.6193 0.4351
889.5498 0.5304
892.7914 0.3996
896.8105 0.5362
900.5498 0.5701
905.6417 0.4085
907.0727 0.4519
910.7699 0.4354
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240900321343854.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240900321343854.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240900321343854.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240900321343854.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603240900321343854 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603240900321343854.eigenfacs
2603240900321343854.atom
making animated gifs
11 models are in 2603240900321343854.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603240900321343854.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603240900321343854.10.pdb
2603240900321343854.11.pdb
2603240900321343854.7.pdb
2603240900321343854.8.pdb
2603240900321343854.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m29.114s
user 0m28.980s
sys 0m0.120s
rm: cannot remove '2603240900321343854.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|