*** t1 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603251636071865628.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603251636071865628.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603251636071865628.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 350
First residue number = 1
Last residue number = 350
Number of atoms found = 2837
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.081161 +/- 12.283701 From: -25.780000 To: 49.077000
= -0.824924 +/- 10.575991 From: -30.334000 To: 23.861000
= -0.661575 +/- 11.076502 From: -26.547000 To: 27.057000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.0857 % Filled.
Pdbmat> 1117724 non-zero elements.
Pdbmat> 122318 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.23 +/- 25.93
Maximum number = 135
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 2.446360E+06
Pdbmat> Larger element = 511.150
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
350 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603251636071865628.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603251636071865628.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603251636071865628.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2837 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 350 residues.
Blocpdb> 13 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 14
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 45
Blocpdb> 18 atoms in block 5
Block first atom: 61
Blocpdb> 15 atoms in block 6
Block first atom: 79
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 94
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 110
Blocpdb> 11 atoms in block 9
Block first atom: 129
Blocpdb> 15 atoms in block 10
Block first atom: 140
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 155
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 172
Blocpdb> 17 atoms in block 13
Block first atom: 188
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 205
Blocpdb> 17 atoms in block 15
Block first atom: 223
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 240
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 256
Blocpdb> 12 atoms in block 18
Block first atom: 272
Blocpdb> 14 atoms in block 19
Block first atom: 284
Blocpdb> 18 atoms in block 20
Block first atom: 298
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 316
Blocpdb> 11 atoms in block 22
Block first atom: 331
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 342
Blocpdb> 12 atoms in block 24
Block first atom: 358
Blocpdb> 17 atoms in block 25
Block first atom: 370
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 387
Blocpdb> 20 atoms in block 27
Block first atom: 409
Blocpdb> 12 atoms in block 28
Block first atom: 429
Blocpdb> 19 atoms in block 29
Block first atom: 441
Blocpdb> 17 atoms in block 30
Block first atom: 460
Blocpdb> 11 atoms in block 31
Block first atom: 477
Blocpdb> 18 atoms in block 32
Block first atom: 488
Blocpdb> 18 atoms in block 33
Block first atom: 506
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 524
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 540
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 562
Blocpdb> 19 atoms in block 37
Block first atom: 576
Blocpdb> 19 atoms in block 38
Block first atom: 595
Blocpdb> 15 atoms in block 39
Block first atom: 614
Blocpdb> 15 atoms in block 40
Block first atom: 629
Blocpdb> 20 atoms in block 41
Block first atom: 644
Blocpdb> 25 atoms in block 42
Block first atom: 664
Blocpdb> 13 atoms in block 43
Block first atom: 689
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 702
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 720
Blocpdb> 13 atoms in block 46
Block first atom: 742
Blocpdb> 15 atoms in block 47
Block first atom: 755
Blocpdb> 14 atoms in block 48
Block first atom: 770
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 784
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 800
Blocpdb> 21 atoms in block 51
Block first atom: 813
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 834
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 854
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 870
Blocpdb> 14 atoms in block 55
Block first atom: 887
Blocpdb> 17 atoms in block 56
Block first atom: 901
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 918
Blocpdb> 14 atoms in block 58
Block first atom: 929
Blocpdb> 13 atoms in block 59
Block first atom: 943
Blocpdb> 19 atoms in block 60
Block first atom: 956
Blocpdb> 17 atoms in block 61
Block first atom: 975
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 992
Blocpdb> 24 atoms in block 63
Block first atom: 1008
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 1032
Blocpdb> 9 atoms in block 65
Block first atom: 1048
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 1057
Blocpdb> 13 atoms in block 67
Block first atom: 1080
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1093
Blocpdb> 13 atoms in block 69
Block first atom: 1109
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 1122
Blocpdb> 15 atoms in block 71
Block first atom: 1141
Blocpdb> 17 atoms in block 72
Block first atom: 1156
Blocpdb> 18 atoms in block 73
Block first atom: 1173
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1191
Blocpdb> 25 atoms in block 75
Block first atom: 1208
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1233
Blocpdb> 12 atoms in block 77
Block first atom: 1249
Blocpdb> 16 atoms in block 78
Block first atom: 1261
Blocpdb> 21 atoms in block 79
Block first atom: 1277
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1298
Blocpdb> 12 atoms in block 81
Block first atom: 1316
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1328
Blocpdb> 19 atoms in block 83
Block first atom: 1343
Blocpdb> 20 atoms in block 84
Block first atom: 1362
Blocpdb> 17 atoms in block 85
Block first atom: 1382
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1399
Blocpdb> 15 atoms in block 87
Block first atom: 1416
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1431
Blocpdb> 13 atoms in block 89
Block first atom: 1451
Blocpdb> 25 atoms in block 90
Block first atom: 1464
Blocpdb> 12 atoms in block 91
Block first atom: 1489
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1501
Blocpdb> 15 atoms in block 93
Block first atom: 1516
Blocpdb> 16 atoms in block 94
Block first atom: 1531
Blocpdb> 19 atoms in block 95
Block first atom: 1547
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1566
Blocpdb> 20 atoms in block 97
Block first atom: 1584
Blocpdb> 19 atoms in block 98
Block first atom: 1604
Blocpdb> 11 atoms in block 99
Block first atom: 1623
Blocpdb> 11 atoms in block 100
Block first atom: 1634
Blocpdb> 17 atoms in block 101
Block first atom: 1645
Blocpdb> 17 atoms in block 102
Block first atom: 1662
Blocpdb> 15 atoms in block 103
Block first atom: 1679
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1694
Blocpdb> 17 atoms in block 105
Block first atom: 1706
Blocpdb> 11 atoms in block 106
Block first atom: 1723
Blocpdb> 13 atoms in block 107
Block first atom: 1734
Blocpdb> 16 atoms in block 108
Block first atom: 1747
Blocpdb> 15 atoms in block 109
Block first atom: 1763
Blocpdb> 9 atoms in block 110
Block first atom: 1778
Blocpdb> 12 atoms in block 111
Block first atom: 1787
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 1799
Blocpdb> 17 atoms in block 113
Block first atom: 1821
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1838
Blocpdb> 11 atoms in block 115
Block first atom: 1854
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1865
Blocpdb> 9 atoms in block 117
Block first atom: 1877
Blocpdb> 17 atoms in block 118
Block first atom: 1886
Blocpdb> 15 atoms in block 119
Block first atom: 1903
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1918
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 1933
Blocpdb> 12 atoms in block 122
Block first atom: 1949
Blocpdb> 12 atoms in block 123
Block first atom: 1961
Blocpdb> 19 atoms in block 124
Block first atom: 1973
Blocpdb> 14 atoms in block 125
Block first atom: 1992
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 2006
Blocpdb> 19 atoms in block 127
Block first atom: 2024
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 2043
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 2059
Blocpdb> 12 atoms in block 130
Block first atom: 2082
Blocpdb> 18 atoms in block 131
Block first atom: 2094
Blocpdb> 18 atoms in block 132
Block first atom: 2112
Blocpdb> 17 atoms in block 133
Block first atom: 2130
Blocpdb> 15 atoms in block 134
Block first atom: 2147
Blocpdb> 15 atoms in block 135
Block first atom: 2162
Blocpdb> 13 atoms in block 136
Block first atom: 2177
Blocpdb> 23 atoms in block 137
Block first atom: 2190
Blocpdb> 14 atoms in block 138
Block first atom: 2213
Blocpdb> 16 atoms in block 139
Block first atom: 2227
Blocpdb> 13 atoms in block 140
Block first atom: 2243
Blocpdb> 15 atoms in block 141
Block first atom: 2256
Blocpdb> 16 atoms in block 142
Block first atom: 2271
Blocpdb> 16 atoms in block 143
Block first atom: 2287
Blocpdb> 11 atoms in block 144
Block first atom: 2303
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 2314
Blocpdb> 12 atoms in block 146
Block first atom: 2332
Blocpdb> 19 atoms in block 147
Block first atom: 2344
Blocpdb> 15 atoms in block 148
Block first atom: 2363
Blocpdb> 22 atoms in block 149
Block first atom: 2378
Blocpdb> 12 atoms in block 150
Block first atom: 2400
Blocpdb> 16 atoms in block 151
Block first atom: 2412
Blocpdb> 22 atoms in block 152
Block first atom: 2428
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2450
Blocpdb> 17 atoms in block 154
Block first atom: 2466
Blocpdb> 16 atoms in block 155
Block first atom: 2483
Blocpdb> 20 atoms in block 156
Block first atom: 2499
Blocpdb> 11 atoms in block 157
Block first atom: 2519
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 2530
Blocpdb> 18 atoms in block 159
Block first atom: 2550
Blocpdb> 13 atoms in block 160
Block first atom: 2568
Blocpdb> 12 atoms in block 161
Block first atom: 2581
Blocpdb> 15 atoms in block 162
Block first atom: 2593
Blocpdb> 16 atoms in block 163
Block first atom: 2608
Blocpdb> 19 atoms in block 164
Block first atom: 2624
Blocpdb> 23 atoms in block 165
Block first atom: 2643
Blocpdb> 19 atoms in block 166
Block first atom: 2666
Blocpdb> 14 atoms in block 167
Block first atom: 2685
Blocpdb> 21 atoms in block 168
Block first atom: 2699
Blocpdb> 14 atoms in block 169
Block first atom: 2720
Blocpdb> 15 atoms in block 170
Block first atom: 2734
Blocpdb> 16 atoms in block 171
Block first atom: 2749
Blocpdb> 20 atoms in block 172
Block first atom: 2765
Blocpdb> 16 atoms in block 173
Block first atom: 2785
Blocpdb> 18 atoms in block 174
Block first atom: 2801
Blocpdb> 19 atoms in block 175
Block first atom: 2818
Blocpdb> 175 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1117899 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8511
Prepmat> Matrix trace = 2446360.0000
Prepmat> Last element read: 8511 8511 119.9415
Prepmat> 15401 lines saved.
Prepmat> 13349 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2837
RTB> Total mass = 2837.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2837
RTB> Number of blocks = 175
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 257506.2059
RTB> 71211 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1050
Diagstd> Nb of non-zero elements: 71211
Diagstd> Projected matrix trace = 257506.2059
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1050 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 257506.2059
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0262346 0.0719082 0.5555384 0.9102400
1.3424435 3.4990660 3.7773221 4.4702141 5.1471238
6.5806562 7.3671512 8.2842232 8.5589139 9.0452835
9.5327049 9.9644816 11.3245673 11.4728624 12.1442192
12.5647512 13.4329646 13.8588476 14.1764485 15.1434799
15.8289802 16.2317939 16.7354902 17.6278747 17.6689187
18.2818654 18.5638151 19.0140918 19.2013606 20.3860385
20.9322112 21.6529335 22.3939207 22.9877295 23.6636771
24.8721970 25.9132742 26.2011861 26.5330931 28.0571466
28.5870833 29.3988739 29.9570025 30.5263937 31.3254831
31.6210018 32.1284811 32.8766209 33.9259071 34.4466262
35.7419934 36.0864059 37.2171397 37.9117091 38.7245085
39.2296697 39.4702087 39.9829718 40.2659513 41.0611272
42.0351850 42.3105493 42.6928847 43.6679290 44.0712387
45.1142748 46.3228285 46.5777784 46.8903647 47.1391237
48.3444003 48.9380860 50.4528815 51.5489764 51.9126940
52.3162732 52.8865751 53.8712249 54.6125497 54.8306575
55.6556239 56.1932203 56.5467390 57.0706216 57.6348751
57.9043070 58.2982630 60.0253107 60.3810017 61.2012619
62.3251420 63.0656383 63.5116518 64.4600561 64.9367415
65.1702234
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034315 0.0034319 0.0034337 0.0034341 0.0034341
0.0034346 17.5886451 29.1195389 80.9379708 103.6032166
125.8181495 203.1287276 211.0509387 229.5934230 246.3641926
278.5671374 294.7440678 312.5512042 317.6907795 326.5926241
335.2766852 342.7856513 365.4315903 367.8164702 378.4252261
384.9215513 397.9982992 404.2582022 408.8641218 422.5792065
432.0378027 437.5004863 444.2367666 455.9269426 456.4574147
464.3073236 467.8739847 473.5142723 475.8403671 490.2997817
496.8243054 505.3050648 513.8783820 520.6469385 528.2462173
541.5672012 552.7852234 555.8476276 559.3571845 575.1975544
580.6042412 588.7902744 594.3529981 599.9748293 607.7768713
610.6369680 615.5174614 622.6426524 632.5007060 637.3362582
649.2091999 652.3296146 662.4708548 668.6240010 675.7533964
680.1467169 682.2287100 686.6458757 689.0714598 695.8421206
704.0471773 706.3494514 709.5337050 717.5903306 720.8964870
729.3773466 739.0823234 741.1133997 743.5960692 745.5658939
755.0372335 759.6591446 771.3265274 779.6600889 782.4058048
785.4412029 789.7106629 797.0282331 802.4934693 804.0943437
810.1208467 814.0240591 816.5806085 820.3545322 824.3999532
826.3246617 829.1308756 841.3224706 843.8114944 849.5236400
857.2883435 862.3661047 865.4101494 871.8476875 875.0654284
876.6371784
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2837
Rtb_to_modes> Number of blocs = 175
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9856E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9882E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6235E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1908E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5555
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.342
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.499
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.777
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.470
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.147
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.581
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.367
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.284
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.559
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.045
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.533
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.964
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.17
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00005 0.99999 0.99994
0.99996 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001
1.00002 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002
0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 51066 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00005 0.99999 0.99994
0.99996 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001
1.00002 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002
1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002
0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603251636071865628.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603251636071865628.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603251636071865628.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603251636071865628.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 350
First residue number = 1
Last residue number = 350
Number of atoms found = 2837
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9856E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9882E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6235E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1908E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5555
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.342
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.499
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.777
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.470
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.581
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.367
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.559
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.045
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.533
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.964
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.17
Bfactors> 106 vectors, 8511 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.026235
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.483 for 350 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.355 +/- 2.86
Bfactors> = 94.303 +/- 11.61
Bfactors> Shiftng-fct= 93.948
Bfactors> Scaling-fct= 4.067
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603251636071865628.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603251636071865628.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.6
Chkmod> 106 vectors, 8511 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2837 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 0.9998 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 11 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6872
0.0034 0.7219
0.0034 0.7127
0.0034 0.7040
0.0034 0.8245
0.0034 0.9656
17.5880 0.0253
29.1182 0.0211
80.9317 0.0130
103.5965 0.0264
125.7920 0.0319
203.1181 0.0342
211.0329 0.1095
229.5781 0.2920
246.3507 0.3441
278.5625 0.0260
294.7284 0.0436
312.5336 0.3170
317.6787 0.2275
326.5735 0.3338
335.2675 0.1385
342.7627 0.1643
365.3422 0.2117
367.7548 0.3488
378.3432 0.0496
384.8322 0.3297
397.9373 0.3516
404.2577 0.1204
408.8978 0.2533
422.5125 0.1667
432.0332 0.1453
437.4575 0.4219
444.2775 0.4765
455.9349 0.4197
456.4518 0.1845
464.2637 0.1561
467.8058 0.4582
473.4430 0.4977
475.8031 0.2265
490.3264 0.3736
496.7767 0.2187
505.2491 0.4781
513.8113 0.4903
520.6503 0.4533
528.1825 0.4572
541.5200 0.4348
552.7266 0.3477
555.8112 0.3437
559.3006 0.3235
575.2021 0.2359
580.6089 0.2757
588.7763 0.2393
594.3572 0.2233
599.9845 0.2413
607.7946 0.2903
610.6011 0.2434
615.5056 0.1892
622.6479 0.5340
632.5117 0.3407
637.3401 0.3172
649.1632 0.5268
652.3341 0.4015
662.4679 0.3701
668.5802 0.4010
675.6851 0.4558
680.1204 0.3572
682.1976 0.5106
686.5909 0.3861
689.0765 0.3967
695.8027 0.5522
704.0573 0.5118
706.3145 0.5068
709.4793 0.3719
717.5765 0.3572
720.8554 0.1486
729.3115 0.2855
739.0280 0.4721
741.0993 0.3187
743.5613 0.4599
745.5408 0.2483
754.9705 0.1830
759.6414 0.2243
771.2714 0.3686
779.6344 0.3259
782.3519 0.4782
785.4355 0.2010
789.7023 0.4576
796.9850 0.3025
802.4403 0.4898
804.0550 0.3795
810.1179 0.4456
813.9658 0.2726
816.5691 0.3705
820.3148 0.4152
824.3297 0.4193
826.2585 0.4320
829.1076 0.4951
841.3192 0.4973
843.7683 0.2700
849.4784 0.2304
857.2850 0.3792
862.3589 0.3814
865.3617 0.4436
871.8099 0.4562
875.0498 0.3049
876.5980 0.4377
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251636071865628 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251636071865628.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251636071865628 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251636071865628.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251636071865628 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251636071865628.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251636071865628 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251636071865628.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251636071865628 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251636071865628.eigenfacs
2603251636071865628.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251636071865628.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251636071865628.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603251636071865628.10.pdb
2603251636071865628.11.pdb
2603251636071865628.7.pdb
2603251636071865628.8.pdb
2603251636071865628.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m16.187s
user 0m16.107s
sys 0m0.075s
rm: cannot remove '2603251636071865628.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
