*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603251754091900216.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603251754091900216.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603251754091900216.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1661
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 24.063783 +/- 9.498679 From: 2.506000 To: 47.197000
= 45.737123 +/- 8.762504 From: 25.381000 To: 66.663000
= 24.595954 +/- 10.436138 From: 3.590000 To: 48.894000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.7121 % Filled.
Pdbmat> 585127 non-zero elements.
Pdbmat> 63914 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.96 +/- 19.88
Maximum number = 117
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 1.278280E+06
Pdbmat> Larger element = 495.553
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
214 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603251754091900216.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603251754091900216.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603251754091900216.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1661 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 214 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 16 atoms in block 3
Block first atom: 36
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 52
Blocpdb> 11 atoms in block 5
Block first atom: 61
Blocpdb> 9 atoms in block 6
Block first atom: 72
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 81
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 94
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 110
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 124
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 143
Blocpdb> 21 atoms in block 12
Block first atom: 160
Blocpdb> 12 atoms in block 13
Block first atom: 181
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 193
Blocpdb> 14 atoms in block 15
Block first atom: 209
Blocpdb> 11 atoms in block 16
Block first atom: 223
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 234
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 250
Blocpdb> 10 atoms in block 19
Block first atom: 269
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 279
Blocpdb> 10 atoms in block 21
Block first atom: 295
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 305
Blocpdb> 12 atoms in block 23
Block first atom: 320
Blocpdb> 18 atoms in block 24
Block first atom: 332
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 350
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 364
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 380
Blocpdb> 9 atoms in block 28
Block first atom: 396
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 405
Blocpdb> 14 atoms in block 30
Block first atom: 422
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 436
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 453
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 468
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 481
Blocpdb> 18 atoms in block 35
Block first atom: 496
Blocpdb> 19 atoms in block 36
Block first atom: 514
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 533
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 547
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 564
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 581
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 593
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 612
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 628
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 643
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 661
Blocpdb> 16 atoms in block 46
Block first atom: 676
Blocpdb> 13 atoms in block 47
Block first atom: 692
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 705
Blocpdb> 18 atoms in block 49
Block first atom: 718
Blocpdb> 9 atoms in block 50
Block first atom: 736
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 745
Blocpdb> 15 atoms in block 52
Block first atom: 761
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 776
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 795
Blocpdb> 19 atoms in block 55
Block first atom: 812
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 831
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 845
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 862
Blocpdb> 15 atoms in block 59
Block first atom: 878
Blocpdb> 19 atoms in block 60
Block first atom: 893
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 912
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 923
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 945
Blocpdb> 12 atoms in block 64
Block first atom: 962
Blocpdb> 10 atoms in block 65
Block first atom: 974
Blocpdb> 18 atoms in block 66
Block first atom: 984
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1002
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1024
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1040
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 1059
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1073
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1089
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1102
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1119
Blocpdb> 11 atoms in block 75
Block first atom: 1134
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1145
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1163
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1178
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1196
Blocpdb> 17 atoms in block 80
Block first atom: 1213
Blocpdb> 18 atoms in block 81
Block first atom: 1230
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1248
Blocpdb> 20 atoms in block 83
Block first atom: 1262
Blocpdb> 24 atoms in block 84
Block first atom: 1282
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1306
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1322
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1344
Blocpdb> 12 atoms in block 88
Block first atom: 1361
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1373
Blocpdb> 12 atoms in block 90
Block first atom: 1388
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 1400
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1424
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1439
Blocpdb> 14 atoms in block 94
Block first atom: 1453
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 1467
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1479
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1495
Blocpdb> 16 atoms in block 98
Block first atom: 1512
Blocpdb> 12 atoms in block 99
Block first atom: 1528
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1540
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1556
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1570
Blocpdb> 18 atoms in block 103
Block first atom: 1584
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1602
Blocpdb> 17 atoms in block 105
Block first atom: 1615
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1632
Blocpdb> 13 atoms in block 107
Block first atom: 1648
Blocpdb> 107 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 585234 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4983
Prepmat> Matrix trace = 1278280.0000
Prepmat> Last element read: 4983 4983 192.2447
Prepmat> 5779 lines saved.
Prepmat> 4685 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1661
RTB> Total mass = 1661.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1661
RTB> Number of blocks = 107
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 137337.7346
RTB> 37743 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 642
Diagstd> Nb of non-zero elements: 37743
Diagstd> Projected matrix trace = 137337.7346
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 642 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 137337.7346
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.8847973 4.8106034 7.4779563 8.1824547
10.0998848 10.4136493 11.9480455 12.8772624 13.3942460
15.5326059 16.3212861 17.5154351 17.9872360 18.6039499
19.5179727 19.8933035 20.7578222 21.5961671 22.7284580
24.7637236 27.0635354 27.4042614 27.8754460 30.0138073
30.5271323 31.6121130 32.7168390 33.6527892 34.4304860
35.6662520 36.9908461 37.0722818 38.2309122 38.7802567
39.2617535 40.4880951 41.8432829 42.3695973 43.0252765
43.6096921 45.7906006 46.6389759 47.2086979 47.5516098
50.5253822 51.0016786 52.1927013 52.9075534 53.2150702
54.1762334 54.6734363 55.6185810 56.5870158 57.3697990
58.8708260 59.0354804 60.0346591 60.4848412 61.1988140
61.8150290 63.3369604 64.8992451 65.4616233 66.5094172
67.2321240 67.7487313 68.4996838 70.0998521 70.5955325
71.4305279 71.8010262 72.6321334 73.8023784 74.1024967
75.1340181 76.1352653 78.1806128 79.2995051 79.3511494
80.6119118 81.2044948 81.6929298 82.3526283 83.5640650
84.4042736 85.3400810 86.0114989 86.2502090 86.4833379
87.6794337 88.6458568 89.4682725 90.3105091 91.3433866
91.4754835 92.8589532 93.6405626 95.2584276 96.1285937
96.4924634
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034332 0.0034340 0.0034340 0.0034344 0.0034344
0.0034345 214.0323695 238.1743876 296.9523321 310.6254864
345.1067790 350.4263497 375.3563041 389.6790456 397.4242974
427.9740552 438.7048834 454.4705496 460.5507529 468.3794814
479.7474035 484.3382118 494.7504228 504.6422638 517.7025046
540.3849616 564.9207734 568.4657856 573.3320140 594.9162414
599.9820879 610.5511354 621.1277727 629.9496124 637.1869271
648.5209603 660.4537535 661.1803520 671.4328889 676.2396326
680.4247874 690.9696192 702.4382550 706.8421650 712.2904393
717.1116707 734.8241998 741.6001060 746.1158936 748.8207880
771.8805257 775.5102018 784.5130417 789.8672729 792.1594364
799.2813586 802.9406877 809.8512048 816.8713718 822.5019658
833.1924861 834.3568411 841.3879822 844.5367503 849.5066502
853.7728083 864.2191566 874.8127476 878.5948747 885.5984575
890.3970165 893.8113465 898.7513667 909.1882850 912.3970860
917.7770849 920.1541856 925.4643218 932.8900464 934.7849264
941.2686362 947.5196232 960.1626660 967.0090057 967.3238399
974.9781675 978.5551672 981.4936998 985.4486807 992.6703713
997.6483731 1003.1636932 1007.1021850 1008.4987364 1009.8607708
1016.8201603 1022.4086173 1027.1403876 1031.9637107 1037.8481964
1038.5983708 1046.4227481 1050.8174771 1059.8562972 1064.6860771
1066.6992190
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1661
Rtb_to_modes> Number of blocs = 107
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.885
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.811
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.478
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.182
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.43
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.49
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 642 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998
1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
1.00002 0.99996 1.00001 0.99998 1.00002
1.00002 1.00006 1.00001 0.99999 0.99997
1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001
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1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
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1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
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0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999
1.00004
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 29898 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00004
1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001
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1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998
1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
1.00002 0.99996 1.00001 0.99998 1.00002
1.00002 1.00006 1.00001 0.99999 0.99997
1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001
1.00001 0.99998 1.00003 1.00002 1.00000
0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00003 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000
0.99998 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001
1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999
1.00004
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603251754091900216.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603251754091900216.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603251754091900216.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603251754091900216.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1661
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.885
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.811
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.478
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.182
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.49
Bfactors> 106 vectors, 4983 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.885000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.491 for 214 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.025 +/- 0.02
Bfactors> = 27.346 +/- 11.94
Bfactors> Shiftng-fct= 27.321
Bfactors> Scaling-fct= 620.280
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603251754091900216.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603251754091900216.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 997.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1027.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1039.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067.
Chkmod> 106 vectors, 4983 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1661 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 42 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9183
0.0034 0.7937
0.0034 0.7408
0.0034 0.8240
0.0034 0.9612
0.0034 0.8260
214.0288 0.4593
238.1740 0.3148
296.9405 0.2853
310.6035 0.4073
345.0939 0.5087
350.3499 0.4032
375.3709 0.3436
389.7037 0.6354
397.3442 0.5642
427.9198 0.7336
438.6688 0.4901
454.5103 0.6091
460.5664 0.6470
468.3097 0.3955
479.7517 0.4465
484.2772 0.5743
494.7551 0.5816
504.6654 0.5141
517.6978 0.4974
540.3211 0.6633
564.8596 0.3012
568.3972 0.4103
573.3542 0.4878
594.8530 0.5315
599.9845 0.4151
610.5045 0.6214
621.1311 0.4746
629.8965 0.6810
637.1551 0.3707
648.5272 0.3737
660.4178 0.5236
661.1316 0.4479
671.3961 0.3947
676.2084 0.4541
680.3804 0.4678
690.9562 0.4755
702.3805 0.5338
706.8152 0.3436
712.2990 0.5207
717.0834 0.3709
734.7878 0.4569
741.5764 0.2400
746.0942 0.4206
748.7760 0.4763
771.8827 0.3447
775.4641 0.5570
784.4591 0.3669
789.8516 0.5023
792.1621 0.5232
799.2748 0.4574
802.8810 0.3273
809.8268 0.4099
816.8578 0.4818
822.4681 0.4789
833.1509 0.4893
834.3530 0.5076
841.3192 0.4920
844.4667 0.5119
849.4784 0.3765
853.7705 0.5121
864.2028 0.5909
874.7803 0.4651
878.5463 0.5418
885.5643 0.0891
890.3447 0.4790
893.7813 0.4114
898.7149 0.3848
909.1502 0.4201
912.3868 0.4956
917.7343 0.4431
920.1081 0.4042
925.4110 0.4966
932.8350 0.3190
934.7291 0.3694
941.2031 0.5492
947.5084 0.4100
960.1177 0.4715
966.9705 0.5250
967.2753 0.5066
974.9248 0.4907
978.4861 0.5352
981.4340 0.4879
985.3907 0.4916
992.6036 0.4810
997.5803 0.4396
1003.1202 0.5980
1007.0502 0.5031
1008.4542 0.5372
1009.7979 0.4345
1016.7798 0.3698
1022.3886 0.3635
1027.1062 0.4963
1031.9165 0.4351
1037.7844 0.3867
1038.5794 0.5912
1046.3837 0.4853
1050.7692 0.4263
1059.8195 0.4084
1064.6482 0.4607
1066.6398 0.4572
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2603251754091900216.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603251754091900216.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2603251754091900216.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603251754091900216.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2603251754091900216.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2603251754091900216.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067.
Projmod> 106 vectors, 4983 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1661
Mean number per residue = 7.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.7
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251754091900216 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251754091900216.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 214 5.917 128 1.606
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 214 6.105 130 1.555
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 214 6.324 128 1.451
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 214 6.569 129 1.444
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 214 6.839 128 1.375
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 214 7.441 128 1.342
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 214 7.768 128 1.356
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 214 8.110 128 1.395
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 214 8.465 126 1.412
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 214 8.831 125 1.450
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251754091900216 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251754091900216.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 214 7.363 131 1.468
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 214 7.258 130 1.408
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 214 7.182 130 1.378
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 214 7.135 130 1.366
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 214 7.118 128 1.341
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 214 7.174 128 1.405
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 214 7.246 129 1.463
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 214 7.348 127 1.468
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 214 7.476 126 1.514
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 214 7.631 125 1.552
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251754091900216 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251754091900216.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 214 7.696 117 1.427
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 214 7.532 123 1.485
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 214 7.393 126 1.466
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 214 7.279 127 1.416
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 214 7.191 129 1.404
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 214 7.099 127 1.316
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 214 7.095 129 1.340
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 214 7.120 133 1.428
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 214 7.174 132 1.441
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 214 7.255 133 1.517
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251754091900216 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251754091900216.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 214 8.554 127 1.540
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 214 8.237 129 1.517
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 214 7.934 129 1.464
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 214 7.647 131 1.453
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 214 7.379 129 1.390
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 214 6.905 130 1.381
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 214 6.704 131 1.403
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 214 6.530 127 1.359
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 214 6.386 130 1.425
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 214 6.272 128 1.403
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603251754091900216 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603251754091900216.eigenfacs
2603251754091900216.atom
making animated gifs
11 models are in 2603251754091900216.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603251754091900216.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 214 7.123 123 1.378
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 214 7.060 125 1.325
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 214 7.029 127 1.296
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 214 7.030 130 1.334
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 214 7.064 129 1.320
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 214 7.228 126 1.411
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 214 7.355 124 1.481
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 214 7.511 122 1.572
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 214 7.694 118 1.654
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 214 7.901 111 1.669
2603251754091900216.10.pdb
2603251754091900216.11.pdb
2603251754091900216.7.pdb
2603251754091900216.8.pdb
2603251754091900216.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m4.381s
user 0m4.321s
sys 0m0.057s
rm: cannot remove '2603251754091900216.sdijf': No such file or directory
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