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* TRANSFERASE 22-SEP-05 2C1Z *

LOGs for ID: 2603260529132070076

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603260529132070076.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603260529132070076.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603260529132070076.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    439
            First residue number     =      6
            Last  residue number     =    455
            Number of atoms found    =   3430
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -0.102289 +/-    11.728452 From:   -24.467000 To:    32.058000
 =    -7.598275 +/-    11.595596 From:   -34.344000 To:    20.406000
 =    25.834018 +/-    14.769595 From:    -3.182000 To:    60.780000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.4443 % Filled.
 Pdbmat>      1294203  non-zero elements.
 Pdbmat>       141537 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.53 +/-     22.95
         Maximum number =    127
         Minimum number =     12

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.830740E+06
 Pdbmat> Larger element =  510.429    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
439 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603260529132070076.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603260529132070076.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603260529132070076.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  3430 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   439 residues.
 Blocpdb>    22 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    22 atoms in block      2
 Block first atom:     23
 Blocpdb>    20 atoms in block      3
 Block first atom:     45
 Blocpdb>    29 atoms in block      4
 Block first atom:     65
 Blocpdb>    23 atoms in block      5
 Block first atom:     94
 Blocpdb>    17 atoms in block      6
 Block first atom:    117
 Blocpdb>    21 atoms in block      7
 Block first atom:    134
 Blocpdb>    25 atoms in block      8
 Block first atom:    155
 Blocpdb>    24 atoms in block      9
 Block first atom:    180
 Blocpdb>    15 atoms in block     10
 Block first atom:    204
 Blocpdb>    22 atoms in block     11
 Block first atom:    219
 Blocpdb>    24 atoms in block     12
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    28 atoms in block     13
 Block first atom:    265
 Blocpdb>    22 atoms in block     14
 Block first atom:    293
 Blocpdb>    19 atoms in block     15
 Block first atom:    315
 Blocpdb>    25 atoms in block     16
 Block first atom:    334
 Blocpdb>    18 atoms in block     17
 Block first atom:    359
 Blocpdb>    25 atoms in block     18
 Block first atom:    377
 Blocpdb>    26 atoms in block     19
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    23 atoms in block     20
 Block first atom:    428
 Blocpdb>    28 atoms in block     21
 Block first atom:    451
 Blocpdb>    18 atoms in block     22
 Block first atom:    479
 Blocpdb>    23 atoms in block     23
 Block first atom:    497
 Blocpdb>    23 atoms in block     24
 Block first atom:    520
 Blocpdb>    20 atoms in block     25
 Block first atom:    543
 Blocpdb>    27 atoms in block     26
 Block first atom:    563
 Blocpdb>    25 atoms in block     27
 Block first atom:    590
 Blocpdb>    28 atoms in block     28
 Block first atom:    615
 Blocpdb>    23 atoms in block     29
 Block first atom:    643
 Blocpdb>    21 atoms in block     30
 Block first atom:    666
 Blocpdb>    28 atoms in block     31
 Block first atom:    687
 Blocpdb>    21 atoms in block     32
 Block first atom:    715
 Blocpdb>    20 atoms in block     33
 Block first atom:    736
 Blocpdb>    21 atoms in block     34
 Block first atom:    756
 Blocpdb>    22 atoms in block     35
 Block first atom:    777
 Blocpdb>    20 atoms in block     36
 Block first atom:    799
 Blocpdb>    26 atoms in block     37
 Block first atom:    819
 Blocpdb>    18 atoms in block     38
 Block first atom:    845
 Blocpdb>    33 atoms in block     39
 Block first atom:    863
 Blocpdb>    21 atoms in block     40
 Block first atom:    896
 Blocpdb>    21 atoms in block     41
 Block first atom:    917
 Blocpdb>    22 atoms in block     42
 Block first atom:    938
 Blocpdb>    16 atoms in block     43
 Block first atom:    960
 Blocpdb>    29 atoms in block     44
 Block first atom:    976
 Blocpdb>    32 atoms in block     45
 Block first atom:   1005
 Blocpdb>    16 atoms in block     46
 Block first atom:   1037
 Blocpdb>    22 atoms in block     47
 Block first atom:   1053
 Blocpdb>    23 atoms in block     48
 Block first atom:   1075
 Blocpdb>    27 atoms in block     49
 Block first atom:   1098
 Blocpdb>    25 atoms in block     50
 Block first atom:   1125
 Blocpdb>    29 atoms in block     51
 Block first atom:   1150
 Blocpdb>    19 atoms in block     52
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    18 atoms in block     53
 Block first atom:   1198
 Blocpdb>    24 atoms in block     54
 Block first atom:   1216
 Blocpdb>    26 atoms in block     55
 Block first atom:   1240
 Blocpdb>    24 atoms in block     56
 Block first atom:   1266
 Blocpdb>    26 atoms in block     57
 Block first atom:   1290
 Blocpdb>    18 atoms in block     58
 Block first atom:   1316
 Blocpdb>    27 atoms in block     59
 Block first atom:   1334
 Blocpdb>    30 atoms in block     60
 Block first atom:   1361
 Blocpdb>    26 atoms in block     61
 Block first atom:   1391
 Blocpdb>    19 atoms in block     62
 Block first atom:   1417
 Blocpdb>    23 atoms in block     63
 Block first atom:   1436
 Blocpdb>    22 atoms in block     64
 Block first atom:   1459
 Blocpdb>    28 atoms in block     65
 Block first atom:   1481
 Blocpdb>    27 atoms in block     66
 Block first atom:   1509
 Blocpdb>    29 atoms in block     67
 Block first atom:   1536
 Blocpdb>    20 atoms in block     68
 Block first atom:   1565
 Blocpdb>    24 atoms in block     69
 Block first atom:   1585
 Blocpdb>    17 atoms in block     70
 Block first atom:   1609
 Blocpdb>    26 atoms in block     71
 Block first atom:   1626
 Blocpdb>    25 atoms in block     72
 Block first atom:   1652
 Blocpdb>    26 atoms in block     73
 Block first atom:   1677
 Blocpdb>    22 atoms in block     74
 Block first atom:   1703
 Blocpdb>    23 atoms in block     75
 Block first atom:   1725
 Blocpdb>    25 atoms in block     76
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    23 atoms in block     77
 Block first atom:   1773
 Blocpdb>    28 atoms in block     78
 Block first atom:   1796
 Blocpdb>    24 atoms in block     79
 Block first atom:   1824
 Blocpdb>    22 atoms in block     80
 Block first atom:   1848
 Blocpdb>    24 atoms in block     81
 Block first atom:   1870
 Blocpdb>     7 atoms in block     82
 Block first atom:   1894
 Blocpdb>    18 atoms in block     83
 Block first atom:   1901
 Blocpdb>    31 atoms in block     84
 Block first atom:   1919
 Blocpdb>    29 atoms in block     85
 Block first atom:   1950
 Blocpdb>    23 atoms in block     86
 Block first atom:   1979
 Blocpdb>    20 atoms in block     87
 Block first atom:   2002
 Blocpdb>    26 atoms in block     88
 Block first atom:   2022
 Blocpdb>    22 atoms in block     89
 Block first atom:   2048
 Blocpdb>    21 atoms in block     90
 Block first atom:   2070
 Blocpdb>    21 atoms in block     91
 Block first atom:   2091
 Blocpdb>    21 atoms in block     92
 Block first atom:   2112
 Blocpdb>    20 atoms in block     93
 Block first atom:   2133
 Blocpdb>    23 atoms in block     94
 Block first atom:   2153
 Blocpdb>    22 atoms in block     95
 Block first atom:   2176
 Blocpdb>    24 atoms in block     96
 Block first atom:   2198
 Blocpdb>    26 atoms in block     97
 Block first atom:   2222
 Blocpdb>    28 atoms in block     98
 Block first atom:   2248
 Blocpdb>    28 atoms in block     99
 Block first atom:   2276
 Blocpdb>    23 atoms in block    100
 Block first atom:   2304
 Blocpdb>    25 atoms in block    101
 Block first atom:   2327
 Blocpdb>    24 atoms in block    102
 Block first atom:   2352
 Blocpdb>    26 atoms in block    103
 Block first atom:   2376
 Blocpdb>    22 atoms in block    104
 Block first atom:   2402
 Blocpdb>    24 atoms in block    105
 Block first atom:   2424
 Blocpdb>    21 atoms in block    106
 Block first atom:   2448
 Blocpdb>    26 atoms in block    107
 Block first atom:   2469
 Blocpdb>    23 atoms in block    108
 Block first atom:   2495
 Blocpdb>    20 atoms in block    109
 Block first atom:   2518
 Blocpdb>    24 atoms in block    110
 Block first atom:   2538
 Blocpdb>    16 atoms in block    111
 Block first atom:   2562
 Blocpdb>    25 atoms in block    112
 Block first atom:   2578
 Blocpdb>    20 atoms in block    113
 Block first atom:   2603
 Blocpdb>    28 atoms in block    114
 Block first atom:   2623
 Blocpdb>    31 atoms in block    115
 Block first atom:   2651
 Blocpdb>    18 atoms in block    116
 Block first atom:   2682
 Blocpdb>    15 atoms in block    117
 Block first atom:   2700
 Blocpdb>    23 atoms in block    118
 Block first atom:   2715
 Blocpdb>    24 atoms in block    119
 Block first atom:   2738
 Blocpdb>    26 atoms in block    120
 Block first atom:   2762
 Blocpdb>    28 atoms in block    121
 Block first atom:   2788
 Blocpdb>    20 atoms in block    122
 Block first atom:   2816
 Blocpdb>    26 atoms in block    123
 Block first atom:   2836
 Blocpdb>    24 atoms in block    124
 Block first atom:   2862
 Blocpdb>    25 atoms in block    125
 Block first atom:   2886
 Blocpdb>    22 atoms in block    126
 Block first atom:   2911
 Blocpdb>    21 atoms in block    127
 Block first atom:   2933
 Blocpdb>    22 atoms in block    128
 Block first atom:   2954
 Blocpdb>    22 atoms in block    129
 Block first atom:   2976
 Blocpdb>    20 atoms in block    130
 Block first atom:   2998
 Blocpdb>    23 atoms in block    131
 Block first atom:   3018
 Blocpdb>    25 atoms in block    132
 Block first atom:   3041
 Blocpdb>    23 atoms in block    133
 Block first atom:   3066
 Blocpdb>    22 atoms in block    134
 Block first atom:   3089
 Blocpdb>    26 atoms in block    135
 Block first atom:   3111
 Blocpdb>    28 atoms in block    136
 Block first atom:   3137
 Blocpdb>    24 atoms in block    137
 Block first atom:   3165
 Blocpdb>    36 atoms in block    138
 Block first atom:   3189
 Blocpdb>    20 atoms in block    139
 Block first atom:   3225
 Blocpdb>    23 atoms in block    140
 Block first atom:   3245
 Blocpdb>    20 atoms in block    141
 Block first atom:   3268
 Blocpdb>    16 atoms in block    142
 Block first atom:   3288
 Blocpdb>    24 atoms in block    143
 Block first atom:   3304
 Blocpdb>    26 atoms in block    144
 Block first atom:   3328
 Blocpdb>    23 atoms in block    145
 Block first atom:   3354
 Blocpdb>    21 atoms in block    146
 Block first atom:   3377
 Blocpdb>    25 atoms in block    147
 Block first atom:   3398
 Blocpdb>     8 atoms in block    148
 Block first atom:   3422

 Blocpdb>   148 blocks.

 Blocpdb> At most,     36 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     7 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1294351 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      10290

 Prepmat> Matrix trace    =    2830740.0000
 Prepmat> Last element read:   10290  10290        62.8977
 Prepmat>        11027 lines saved.
 Prepmat>         9524 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  3430
 RTB> Total mass =        3430.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  3430
 RTB> Number of blocks =   148
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  191651.9569
 RTB>     51852 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      888
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    51852
 Diagstd> Projected matrix trace =  191651.9569

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    888 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 191651.9569
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.2649926      1.3570708      2.1618708      3.5564354
      4.2942662      5.0931246      5.6140497      5.9345189      7.5595429
      8.1138797      8.4274539      9.2486685     10.3014540     11.6645168
     12.5053815     12.9341746     13.4384445     14.0345611     15.1977592
     16.3247977     17.0904415     17.4698169     17.9348268     18.9335745
     19.9317304     20.2828787     20.7862899     21.5061652     22.8955721
     23.2535419     23.6733570     24.5970284     25.5696677     26.7698396
     27.0614410     27.9449664     28.4079714     28.7784157     29.2125012
     30.4191241     31.1373137     32.1682789     32.7444700     33.0286625
     34.0415764     34.7324037     35.3403845     35.5156124     36.1089274
     37.0426870     37.6848211     38.6110445     39.2823619     39.6414217
     40.1308524     40.3717466     41.4049357     41.9212002     42.0844940
     42.3378051     43.2156667     43.8789440     45.3365163     45.9742964
     46.1564173     46.5991506     47.7213780     48.2127090     48.5160481
     50.0480488     50.4894767     50.7957140     51.9171009     52.5780145
     52.7085221     53.3137164     53.9045552     54.3820312     54.7332721
     55.6135335     55.7593434     56.0851134     56.7077161     57.3522321
     57.9122746     58.1549447     58.7828970     58.8710618     59.7003775
     60.0886436     60.8989108     61.1743339     61.9892416     62.3175855
     63.1622296     63.4955820     63.6982215     64.1146308     65.1060773
     65.7290492

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034327      0.0034328      0.0034343      0.0034344      0.0034348
      0.0034361    122.1347570    126.5017485    159.6651553    204.7871682
    225.0296586    245.0684653    257.2962202    264.5379842    298.5678555
    309.3211118    315.2415637    330.2439626    348.5335131    370.8759378
    384.0110774    390.5392066    398.0794713    406.8128839    423.3358610
    438.7520753    448.9230670    453.8783384    459.8793128    472.5106332
    484.8057730    489.0576731    495.0895621    503.5896189    519.6022591
    523.6484671    528.3542488    538.5631094    549.1080647    561.8471278
    564.8989143    574.0465037    578.7824995    582.5439829    586.9210045
    598.9197469    605.9486906    615.8985665    621.3900044    624.0807312
    633.5780336    639.9745454    645.5515308    647.1499682    652.5331419
    660.9163892    666.6202607    674.7626811    680.6033406    683.7067869
    687.9145142    689.9761032    698.7492227    703.0919640    704.4599948
    706.5769239    713.8646703    719.3220340    731.1716650    736.2966528
    737.7535806    741.2834099    750.1563125    754.0081629    756.3764341
    768.2257423    771.6062110    773.9427120    782.4390136    787.4035548
    788.3801840    792.8933197    797.2747563    800.7980233    803.3799458
    809.8144556    810.8753638    813.2406546    817.7421024    822.3760287
    826.3815105    828.1110958    832.5700288    833.1941554    839.0422279
    841.7661949    847.4226017    849.3367284    854.9750508    857.2363717
    863.0262512    865.3006587    866.6803173    869.5085428    876.2056411
    880.3876779

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   3430
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    148

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9929E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9934E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.265    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.357    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.162    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.556    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.294    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.093    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.614    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.935    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.560    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.114    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.427    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.249    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.73    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    888 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999
 1.00002 1.00002 0.99996 1.00003 0.99997
 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99997
 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
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 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
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 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
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 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    61740 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999
 1.00002 1.00002 0.99996 1.00003 0.99997
 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99997
 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000
 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603260529132070076.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603260529132070076.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603260529132070076.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603260529132070076.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    439
            First residue number     =      6
            Last  residue number     =    455
            Number of atoms found    =   3430
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9929E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9934E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.265    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.357    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.162    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.556    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.294    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.093    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.614    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.935    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.560    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.114    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.427    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.249    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.73    

 Bfactors>  106 vectors,  10290 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.265000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.497 for    444 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.026 +/-   0.03
 Bfactors> =     25.984 +/-   6.88
 Bfactors> Shiftng-fct=     25.958
 Bfactors> Scaling-fct=    203.376

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603260529132070076.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603260529132070076.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4326E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4327E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4347E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4359E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   122.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   126.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   159.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   204.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   225.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   633.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   645.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   652.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   660.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   666.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   674.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   680.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   683.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   687.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   689.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   698.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   703.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   704.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   706.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   713.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   719.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   731.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   736.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   737.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   741.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   750.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   754.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   756.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   768.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   771.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   773.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   782.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   787.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   788.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   792.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   797.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   800.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   803.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   809.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   810.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   813.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   817.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   822.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   826.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   828.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   832.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   833.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   839.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   841.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   847.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   849.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   854.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   863.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   865.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   866.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   869.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   876.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   880.4    

 Chkmod>  106 vectors,  10290 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   3430 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7388
      0.0034      0.7046
      0.0034      0.9273
      0.0034      0.8076
      0.0034      0.7629
      0.0034      0.8079
    122.1299      0.5842
    126.4930      0.3474
    159.6631      0.4472
    204.7658      0.3565
    225.0130      0.3766
    245.0549      0.3554
    257.2840      0.0845
    264.5373      0.2430
    298.5641      0.5793
    309.3101      0.4012
    315.2195      0.2023
    330.2357      0.6403
    348.4940      0.3104
    370.7882      0.1691
    384.0655      0.1492
    390.4594      0.5904
    398.0854      0.5135
    406.7293      0.2801
    423.3489      0.2715
    438.6688      0.3440
    448.8980      0.2949
    453.8612      0.3713
    459.7977      0.2946
    472.4457      0.5169
    484.7639      0.3540
    489.0020      0.2470
    495.1125      0.4052
    503.6129      0.5251
    519.6302      0.3378
    523.5861      0.3215
    528.2941      0.4880
    538.5725      0.4565
    549.0881      0.2924
    561.8247      0.4453
    564.8596      0.3357
    573.9709      0.3853
    578.7783      0.3503
    582.5350      0.5731
    586.8707      0.2810
    598.9027      0.3286
    605.9488      0.4110
    615.8886      0.2981
    621.3209      0.3009
    624.0666      0.4197
    633.5362      0.4424
    639.9249      0.4782
    645.5203      0.4191
    647.1622      0.4800
    652.5148      0.4944
    660.8640      0.4031
    666.5490      0.4536
    674.7246      0.4105
    680.5537      0.5437
    683.6652      0.4420
    687.8777      0.4232
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    698.6776      0.4450
    703.0517      0.5691
    704.3921      0.3920
    706.5649      0.5835
    713.8698      0.4659
    719.2998      0.3681
    731.1684      0.5490
    736.2306      0.3470
    737.7505      0.4783
    741.2583      0.4198
    750.1133      0.3842
    753.9546      0.4988
    756.3748      0.4620
    768.2077      0.5268
    771.5771      0.2595
    773.9421      0.4393
    782.4273      0.3542
    787.3846      0.3823
    788.3574      0.3742
    792.8316      0.4180
    797.2068      0.3239
    800.7487      0.4757
    803.3214      0.2755
    809.7540      0.4533
    810.8453      0.3093
    813.2412      0.2955
    817.7235      0.3577
    822.3247      0.3771
    826.3298      0.4144
    828.0403      0.4332
    832.5138      0.5528
    833.1509      0.5704
    839.0036      0.4200
    841.7396      0.3399
    847.3938      0.4793
    849.2702      0.4699
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    865.2936      0.5235
    866.6552      0.4453
    869.4398      0.4751
    876.1944      0.5082
    880.3563      0.5044
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603260529132070076 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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2603260529132070076.atom
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making animated gifs
11 models are in 2603260529132070076.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603260529132070076.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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making animated gifs
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603260529132070076.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603260529132070076.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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2603260529132070076.eigenfacs
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2603260529132070076.eigenfacs
2603260529132070076.atom
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calculating perturbed structure for DQ=60
2603260529132070076.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
11 models are in 2603260529132070076.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603260529132070076.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603260529132070076.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603260529132070076 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2603260529132070076.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2603260529132070076.eigenfacs
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2603260529132070076.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 2603260529132070076.11.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603260529132070076.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603260529132070076.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603260529132070076.10.pdb
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2603260529132070076.7.pdb
2603260529132070076.8.pdb
2603260529132070076.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m13.615s
user	0m13.457s
sys	0m0.145s
rm: cannot remove '2603260529132070076.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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Should you encounter any unexpected behaviour,
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Still some additional cleaning from time to time
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* TRANSFERASE 22-SEP-05 2C1Z *
