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LOGs for ID: 2603261039202145649

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603261039202145649.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603261039202145649.atom to be opened. Openam> File opened: 2603261039202145649.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 104 First residue number = 361 Last residue number = 464 Number of atoms found = 1721 Mean number per residue = 16.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = -17.202517 +/- 10.129012 From: -47.802000 To: 5.969000 = -6.728721 +/- 7.013888 From: -23.897000 To: 14.075000 = 1.809757 +/- 6.194815 From: -12.120000 To: 19.232000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 3 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 8.6105 % Filled. Pdbmat> 1147858 non-zero elements. Pdbmat> 126413 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 146.91 +/- 45.07 Maximum number = 233 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 2.528260E+06 Pdbmat> Larger element = 890.503 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 104 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603261039202145649.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603261039202145649.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603261039202145649.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1721 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 104 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 15 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 20 atoms in block 3 Block first atom: 32 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 52 Blocpdb> 11 atoms in block 5 Block first atom: 71 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 82 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 106 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 123 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 137 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 156 Blocpdb> 7 atoms in block 11 Block first atom: 171 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 178 Blocpdb> 20 atoms in block 13 Block first atom: 197 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 217 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 231 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 251 Blocpdb> 12 atoms in block 17 Block first atom: 267 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 279 Blocpdb> 24 atoms in block 19 Block first atom: 296 Blocpdb> 11 atoms in block 20 Block first atom: 320 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 331 Blocpdb> 10 atoms in block 22 Block first atom: 347 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 357 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 371 Blocpdb> 7 atoms in block 25 Block first atom: 387 Blocpdb> 21 atoms in block 26 Block first atom: 394 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 415 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 432 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 446 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 463 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 478 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 497 Blocpdb> 7 atoms in block 33 Block first atom: 516 Blocpdb> 22 atoms in block 34 Block first atom: 523 Blocpdb> 14 atoms in block 35 Block first atom: 545 Blocpdb> 19 atoms in block 36 Block first atom: 559 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 578 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 594 Blocpdb> 20 atoms in block 39 Block first atom: 609 Blocpdb> 11 atoms in block 40 Block first atom: 629 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 640 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 657 Blocpdb> 15 atoms in block 43 Block first atom: 671 Blocpdb> 12 atoms in block 44 Block first atom: 686 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 698 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 715 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 732 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 751 Blocpdb> 24 atoms in block 49 Block first atom: 770 Blocpdb> 12 atoms in block 50 Block first atom: 794 Blocpdb> 11 atoms in block 51 Block first atom: 806 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 817 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 837 Blocpdb> 17 atoms in block 54 Block first atom: 854 Blocpdb> 16 atoms in block 55 Block first atom: 871 Blocpdb> 16 atoms in block 56 Block first atom: 887 Blocpdb> 22 atoms in block 57 Block first atom: 903 Blocpdb> 19 atoms in block 58 Block first atom: 925 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 944 Blocpdb> 7 atoms in block 60 Block first atom: 966 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 973 Blocpdb> 16 atoms in block 62 Block first atom: 990 Blocpdb> 19 atoms in block 63 Block first atom: 1006 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 1025 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 1036 Blocpdb> 17 atoms in block 66 Block first atom: 1052 Blocpdb> 20 atoms in block 67 Block first atom: 1069 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1089 Blocpdb> 20 atoms in block 69 Block first atom: 1113 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1133 Blocpdb> 11 atoms in block 71 Block first atom: 1157 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1168 Blocpdb> 14 atoms in block 73 Block first atom: 1190 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1204 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1228 Blocpdb> 24 atoms in block 76 Block first atom: 1243 Blocpdb> 19 atoms in block 77 Block first atom: 1267 Blocpdb> 24 atoms in block 78 Block first atom: 1286 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1310 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1327 Blocpdb> 14 atoms in block 81 Block first atom: 1351 Blocpdb> 11 atoms in block 82 Block first atom: 1365 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 1376 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1387 Blocpdb> 14 atoms in block 85 Block first atom: 1407 Blocpdb> 20 atoms in block 86 Block first atom: 1421 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1441 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1458 Blocpdb> 14 atoms in block 89 Block first atom: 1472 Blocpdb> 21 atoms in block 90 Block first atom: 1486 Blocpdb> 11 atoms in block 91 Block first atom: 1507 Blocpdb> 12 atoms in block 92 Block first atom: 1518 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1530 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 1545 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1564 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 1579 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1600 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1619 Blocpdb> 11 atoms in block 99 Block first atom: 1638 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1649 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1663 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1677 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1691 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1704 Blocpdb> 104 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1147962 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 5163 Prepmat> Matrix trace = 2528260.0000 Prepmat> Last element read: 5163 5163 452.7169 Prepmat> 5461 lines saved. Prepmat> 4074 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1721 RTB> Total mass = 1721.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1721 RTB> Number of blocks = 104 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 279078.1306 RTB> 48336 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 624 Diagstd> Nb of non-zero elements: 48336 Diagstd> Projected matrix trace = 279078.1306 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 624 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 279078.1306 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 6.5522898 8.4479026 17.8091592 18.8585008 25.1315090 26.4465371 32.3969890 34.3467229 37.1419461 39.4603665 42.7368723 44.0676860 46.7334008 50.9087181 54.4462304 55.2576085 58.5058245 60.3271313 65.4889153 67.3954066 69.6624780 70.6173253 74.0033036 75.1325273 76.0618812 79.1526693 81.1068492 83.2967710 84.5009741 88.6716805 91.0673915 95.1207072 98.1725980 101.4249541 102.4414488 107.2603986 109.9055140 111.6816103 113.3606049 115.9388088 119.5679906 123.8344357 126.7774030 130.6920780 132.9391646 133.9969431 136.8214379 138.1956258 140.7306197 141.5510438 145.0267164 147.0642149 150.1146401 152.4903273 154.7632545 155.7251570 159.8711919 161.1260112 163.2937355 164.8225183 168.6000913 170.7321241 172.9748386 174.1350223 176.9282541 178.3617693 179.6444217 183.4888045 184.4204504 186.2848154 187.2834322 190.0164133 193.5774234 195.1961838 196.2142089 197.8576880 198.5442380 200.8246042 203.9493671 205.2120295 206.1500173 209.6375459 210.3910470 212.5995474 212.7753934 216.3626581 217.0805924 218.7268406 221.6902183 223.2488478 223.8052144 224.6480436 227.5699235 227.9028765 230.2314874 233.3906386 233.9803132 235.7762921 237.2437492 239.2943803 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034307 0.0034320 0.0034328 0.0034337 0.0034337 0.0034363 277.9660975 315.6237890 458.2653155 471.5729256 544.3830115 558.4440750 618.0841466 636.4113746 661.8012883 682.1436449 709.8991361 720.8674290 742.3504447 774.8031204 801.2705638 807.2189017 830.6055569 843.4349970 878.7780057 891.4775879 906.3474971 912.5379032 934.1590684 941.2592974 947.0628728 966.1133043 977.9666510 991.0814864 998.2197037 1022.5575269 1036.2790747 1059.0898732 1075.9458688 1093.6231384 1099.0896958 1124.6437744 1138.4265642 1147.5883057 1156.1824093 1169.2562424 1187.4155874 1208.4146868 1222.6895653 1241.4233562 1252.0502319 1257.0215575 1270.2007224 1276.5635176 1288.2186442 1291.9681827 1307.7336149 1316.8878316 1330.4752649 1340.9618687 1350.9186807 1355.1103706 1373.0311388 1378.4090260 1387.6503268 1394.1308992 1410.0164619 1418.9036372 1428.1924972 1432.9741077 1444.4212741 1450.2609932 1455.4662803 1470.9572998 1474.6868901 1482.1221856 1486.0894810 1496.8932788 1510.8544662 1517.1584548 1521.1095997 1527.4666796 1530.1144769 1538.8764025 1550.8023887 1555.5955354 1559.1466577 1572.2797239 1575.1028151 1583.3482562 1584.0029327 1597.2997896 1599.9476738 1606.0028815 1616.8455875 1622.5193817 1624.5398937 1627.5959507 1638.1464010 1639.3443327 1647.6980960 1658.9641322 1661.0585433 1667.4213079 1672.6022226 1679.8152904 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1721 Rtb_to_modes> Number of blocs = 104 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9809E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9884E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.552 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.448 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 0.99999 1.00004 0.99998 1.00006 1.00004 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 0.99996 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00004 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 0.99996 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603261039202145649.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603261039202145649.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603261039202145649.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603261039202145649.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 104 First residue number = 361 Last residue number = 464 Number of atoms found = 1721 Mean number per residue = 16.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9809E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9884E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.552 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.448 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81 Rdmodfacs> Numero du 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 161.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.4 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 203.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 205.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 210.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 216.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 218.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 221.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 223.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 223.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 224.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 230.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 233.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 234.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 235.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 237.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 239.3 Bfactors> 106 vectors, 5163 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 6.552000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.031 for 104 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.007 +/- 0.01 Bfactors> = 120.529 +/- 7.48 Bfactors> Shiftng-fct= 120.521 Bfactors> Scaling-fct= 842.521 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603261039202145649.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603261039202145649.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1378. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1388. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1394. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1410. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1419. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1428. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1433. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1444. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1450. 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Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 6 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9854 0.0034 0.6487 0.0034 0.7928 0.0034 0.7700 0.0034 0.8467 0.0034 0.7144 277.9480 0.1193 315.6121 0.0925 458.2565 0.4415 471.5714 0.3252 544.3433 0.3082 558.4567 0.2521 618.0863 0.2868 636.4144 0.1604 661.7555 0.4732 682.1112 0.2705 709.8946 0.1487 720.8554 0.2428 742.2916 0.2951 774.7796 0.6354 801.2639 0.4678 807.2017 0.2267 830.5995 0.3797 843.4188 0.3536 878.7476 0.4328 891.4697 0.2598 906.2925 0.2056 912.5160 0.3715 934.0981 0.2982 941.2031 0.5255 947.0105 0.6192 966.0555 0.4635 977.9437 0.4730 991.0582 0.4513 998.1711 0.2601 1022.5039 0.5194 1036.2494 0.5133 1059.0405 0.4597 1075.8854 0.4219 1093.4417 0.4238 1098.8202 0.4271 1124.8031 0.4376 1138.3491 0.4381 1147.6335 0.3264 1156.3336 0.3480 1169.0103 0.4582 1187.5235 0.3470 1208.1948 0.2835 1222.7460 0.4722 1241.4077 0.4267 1251.8120 0.3118 1256.9819 0.2051 1270.0467 0.5209 1276.5289 0.4067 1288.0232 0.4033 1292.1361 0.4613 1307.5570 0.4108 1316.9915 0.3193 1330.3533 0.3716 1340.9468 0.5585 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