*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603270735402317746.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603270735402317746.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603270735402317746.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 376
First residue number = 4
Last residue number = 438
Number of atoms found = 2939
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 32.007434 +/- 9.238587 From: 9.052000 To: 56.891000
= 41.180042 +/- 12.881734 From: 15.695000 To: 74.336000
= 13.458169 +/- 14.237108 From: -15.159000 To: 46.583000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.7669 % Filled.
Pdbmat> 1075612 non-zero elements.
Pdbmat> 117572 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.01 +/- 22.04
Maximum number = 129
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 2.351440E+06
Pdbmat> Larger element = 479.490
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
376 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603270735402317746.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603270735402317746.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603270735402317746.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2939 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 376 residues.
Blocpdb> 10 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 15 atoms in block 2
Block first atom: 11
Blocpdb> 18 atoms in block 3
Block first atom: 26
Blocpdb> 18 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 18 atoms in block 5
Block first atom: 62
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 80
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 94
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 107
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 127
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 139
Blocpdb> 18 atoms in block 11
Block first atom: 158
Blocpdb> 23 atoms in block 12
Block first atom: 176
Blocpdb> 16 atoms in block 13
Block first atom: 199
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 215
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 229
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 241
Blocpdb> 9 atoms in block 17
Block first atom: 259
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 268
Blocpdb> 14 atoms in block 19
Block first atom: 285
Blocpdb> 7 atoms in block 20
Block first atom: 299
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 306
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 318
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 334
Blocpdb> 13 atoms in block 24
Block first atom: 353
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 366
Blocpdb> 15 atoms in block 26
Block first atom: 380
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 395
Blocpdb> 12 atoms in block 28
Block first atom: 411
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 423
Blocpdb> 12 atoms in block 30
Block first atom: 437
Blocpdb> 15 atoms in block 31
Block first atom: 449
Blocpdb> 18 atoms in block 32
Block first atom: 464
Blocpdb> 16 atoms in block 33
Block first atom: 482
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 498
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 515
Blocpdb> 21 atoms in block 36
Block first atom: 532
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 553
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 567
Blocpdb> 18 atoms in block 39
Block first atom: 584
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 602
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 623
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 639
Blocpdb> 14 atoms in block 43
Block first atom: 653
Blocpdb> 20 atoms in block 44
Block first atom: 667
Blocpdb> 19 atoms in block 45
Block first atom: 687
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 706
Blocpdb> 13 atoms in block 47
Block first atom: 720
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 733
Blocpdb> 12 atoms in block 49
Block first atom: 749
Blocpdb> 9 atoms in block 50
Block first atom: 761
Blocpdb> 12 atoms in block 51
Block first atom: 770
Blocpdb> 15 atoms in block 52
Block first atom: 782
Blocpdb> 17 atoms in block 53
Block first atom: 797
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 814
Blocpdb> 20 atoms in block 55
Block first atom: 834
Blocpdb> 17 atoms in block 56
Block first atom: 854
Blocpdb> 12 atoms in block 57
Block first atom: 871
Blocpdb> 13 atoms in block 58
Block first atom: 883
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 896
Blocpdb> 13 atoms in block 60
Block first atom: 914
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 927
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 942
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 957
Blocpdb> 14 atoms in block 64
Block first atom: 971
Blocpdb> 11 atoms in block 65
Block first atom: 985
Blocpdb> 17 atoms in block 66
Block first atom: 996
Blocpdb> 17 atoms in block 67
Block first atom: 1013
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1030
Blocpdb> 16 atoms in block 69
Block first atom: 1047
Blocpdb> 18 atoms in block 70
Block first atom: 1063
Blocpdb> 10 atoms in block 71
Block first atom: 1081
Blocpdb> 15 atoms in block 72
Block first atom: 1091
Blocpdb> 13 atoms in block 73
Block first atom: 1106
Blocpdb> 13 atoms in block 74
Block first atom: 1119
Blocpdb> 11 atoms in block 75
Block first atom: 1132
Blocpdb> 17 atoms in block 76
Block first atom: 1143
Blocpdb> 19 atoms in block 77
Block first atom: 1160
Blocpdb> 12 atoms in block 78
Block first atom: 1179
Blocpdb> 13 atoms in block 79
Block first atom: 1191
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1204
Blocpdb> 20 atoms in block 81
Block first atom: 1222
Blocpdb> 17 atoms in block 82
Block first atom: 1242
Blocpdb> 19 atoms in block 83
Block first atom: 1259
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1278
Blocpdb> 18 atoms in block 85
Block first atom: 1292
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1310
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1327
Blocpdb> 12 atoms in block 88
Block first atom: 1344
Blocpdb> 13 atoms in block 89
Block first atom: 1356
Blocpdb> 19 atoms in block 90
Block first atom: 1369
Blocpdb> 21 atoms in block 91
Block first atom: 1388
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1409
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1423
Blocpdb> 12 atoms in block 94
Block first atom: 1437
Blocpdb> 17 atoms in block 95
Block first atom: 1449
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1466
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1483
Blocpdb> 22 atoms in block 98
Block first atom: 1499
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1521
Blocpdb> 14 atoms in block 100
Block first atom: 1537
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1551
Blocpdb> 11 atoms in block 102
Block first atom: 1566
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1577
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 1593
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 1613
Blocpdb> 18 atoms in block 106
Block first atom: 1629
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1647
Blocpdb> 19 atoms in block 108
Block first atom: 1662
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 1681
Blocpdb> 17 atoms in block 110
Block first atom: 1700
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1717
Blocpdb> 16 atoms in block 112
Block first atom: 1734
Blocpdb> 16 atoms in block 113
Block first atom: 1750
Blocpdb> 17 atoms in block 114
Block first atom: 1766
Blocpdb> 12 atoms in block 115
Block first atom: 1783
Blocpdb> 18 atoms in block 116
Block first atom: 1795
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1813
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1830
Blocpdb> 15 atoms in block 119
Block first atom: 1845
Blocpdb> 14 atoms in block 120
Block first atom: 1860
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1874
Blocpdb> 9 atoms in block 122
Block first atom: 1888
Blocpdb> 5 atoms in block 123
Block first atom: 1897
Blocpdb> 12 atoms in block 124
Block first atom: 1902
Blocpdb> 17 atoms in block 125
Block first atom: 1914
Blocpdb> 11 atoms in block 126
Block first atom: 1931
Blocpdb> 16 atoms in block 127
Block first atom: 1942
Blocpdb> 20 atoms in block 128
Block first atom: 1958
Blocpdb> 12 atoms in block 129
Block first atom: 1978
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 1990
Blocpdb> 17 atoms in block 131
Block first atom: 2006
Blocpdb> 16 atoms in block 132
Block first atom: 2023
Blocpdb> 20 atoms in block 133
Block first atom: 2039
Blocpdb> 15 atoms in block 134
Block first atom: 2059
Blocpdb> 12 atoms in block 135
Block first atom: 2074
Blocpdb> 22 atoms in block 136
Block first atom: 2086
Blocpdb> 18 atoms in block 137
Block first atom: 2108
Blocpdb> 12 atoms in block 138
Block first atom: 2126
Blocpdb> 14 atoms in block 139
Block first atom: 2138
Blocpdb> 20 atoms in block 140
Block first atom: 2152
Blocpdb> 17 atoms in block 141
Block first atom: 2172
Blocpdb> 14 atoms in block 142
Block first atom: 2189
Blocpdb> 9 atoms in block 143
Block first atom: 2203
Blocpdb> 15 atoms in block 144
Block first atom: 2212
Blocpdb> 23 atoms in block 145
Block first atom: 2227
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2250
Blocpdb> 18 atoms in block 147
Block first atom: 2267
Blocpdb> 10 atoms in block 148
Block first atom: 2285
Blocpdb> 19 atoms in block 149
Block first atom: 2295
Blocpdb> 17 atoms in block 150
Block first atom: 2314
Blocpdb> 16 atoms in block 151
Block first atom: 2331
Blocpdb> 17 atoms in block 152
Block first atom: 2347
Blocpdb> 17 atoms in block 153
Block first atom: 2364
Blocpdb> 22 atoms in block 154
Block first atom: 2381
Blocpdb> 12 atoms in block 155
Block first atom: 2403
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 2415
Blocpdb> 11 atoms in block 157
Block first atom: 2430
Blocpdb> 14 atoms in block 158
Block first atom: 2441
Blocpdb> 15 atoms in block 159
Block first atom: 2455
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2470
Blocpdb> 10 atoms in block 161
Block first atom: 2486
Blocpdb> 16 atoms in block 162
Block first atom: 2496
Blocpdb> 18 atoms in block 163
Block first atom: 2512
Blocpdb> 15 atoms in block 164
Block first atom: 2530
Blocpdb> 14 atoms in block 165
Block first atom: 2545
Blocpdb> 19 atoms in block 166
Block first atom: 2559
Blocpdb> 8 atoms in block 167
Block first atom: 2578
Blocpdb> 10 atoms in block 168
Block first atom: 2586
Blocpdb> 17 atoms in block 169
Block first atom: 2596
Blocpdb> 14 atoms in block 170
Block first atom: 2613
Blocpdb> 17 atoms in block 171
Block first atom: 2627
Blocpdb> 17 atoms in block 172
Block first atom: 2644
Blocpdb> 21 atoms in block 173
Block first atom: 2661
Blocpdb> 22 atoms in block 174
Block first atom: 2682
Blocpdb> 9 atoms in block 175
Block first atom: 2704
Blocpdb> 15 atoms in block 176
Block first atom: 2713
Blocpdb> 23 atoms in block 177
Block first atom: 2728
Blocpdb> 17 atoms in block 178
Block first atom: 2751
Blocpdb> 21 atoms in block 179
Block first atom: 2768
Blocpdb> 18 atoms in block 180
Block first atom: 2789
Blocpdb> 14 atoms in block 181
Block first atom: 2807
Blocpdb> 14 atoms in block 182
Block first atom: 2821
Blocpdb> 16 atoms in block 183
Block first atom: 2835
Blocpdb> 12 atoms in block 184
Block first atom: 2851
Blocpdb> 12 atoms in block 185
Block first atom: 2863
Blocpdb> 15 atoms in block 186
Block first atom: 2875
Blocpdb> 15 atoms in block 187
Block first atom: 2890
Blocpdb> 12 atoms in block 188
Block first atom: 2905
Blocpdb> 23 atoms in block 189
Block first atom: 2916
Blocpdb> 189 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1075801 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8817
Prepmat> Matrix trace = 2351440.0000
Prepmat> Last element read: 8817 8817 374.2184
Prepmat> 17956 lines saved.
Prepmat> 15939 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2939
RTB> Total mass = 2939.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2939
RTB> Number of blocks = 189
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 251953.3009
RTB> 69741 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1134
Diagstd> Nb of non-zero elements: 69741
Diagstd> Projected matrix trace = 251953.3009
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1134 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 251953.3009
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.1440343 2.2322431 3.3004700 4.0814733
5.3643839 6.2508300 6.6297041 7.7835358 8.3448675
8.9786137 10.1916231 10.6464700 11.2975235 11.7968838
12.8551958 13.6436198 14.4840200 14.5846188 16.6622911
17.0232179 17.4015831 17.6970520 18.3304819 20.1125474
20.4854774 21.0383071 21.5261556 21.9399343 22.7935104
23.0460691 23.5485383 23.8563995 24.4753601 24.5848450
25.5525898 25.6232029 26.6189974 26.8551234 28.5337214
28.8316166 29.2505954 29.8493715 30.6035708 31.3379040
31.5689005 32.0796717 32.3387166 33.3087348 33.9845027
34.5693915 34.8871530 35.8068248 36.1611093 36.2509184
36.5895369 37.4622804 38.2104809 38.6231290 38.8452415
39.5720072 40.2084225 40.3529285 41.5837028 41.7679976
42.4253704 42.9608341 43.6545697 43.8434187 44.2450565
44.6355589 44.9843476 45.6396075 46.1436861 46.3526898
46.9240528 47.2867402 48.6260273 48.8783911 50.0400492
50.6249605 50.8297354 51.5711212 51.8056026 51.9397362
53.2237232 53.5082127 54.3251716 54.7010611 55.0979634
55.5878925 56.2932265 56.7372397 57.3117582 57.6158097
58.4545298 58.9415385 59.1726067 59.5451453 60.3415302
60.8501807
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034331 0.0034332 0.0034334 0.0034338
0.0034347 159.0051319 162.2430222 197.2800515 219.3833999
251.5099708 271.4964302 279.6033384 302.9589196 313.6931268
325.3867944 346.6705564 354.3219829 364.9949928 372.9743206
389.3450239 401.1068551 413.2756692 414.7083904 443.2641817
448.0392995 452.9910901 456.8206677 464.9242746 486.9998425
491.4941184 498.0818025 503.8236127 508.6428472 518.4428486
521.3071849 526.9595231 530.3929336 537.2294667 538.4297119
548.9246607 549.6825974 560.2619480 562.7413865 580.0620977
583.0821911 587.3035632 593.2843277 600.7327817 607.8973540
610.1336933 615.0497381 617.5280232 626.7211461 633.0466861
638.4709583 641.3986551 649.7977244 653.0044679 653.8148602
656.8613926 664.6490452 671.2534517 674.8682673 676.8059894
683.1079191 688.5790379 689.8152786 700.2560337 701.8060506
707.3072372 711.7568126 717.4805562 719.0307867 722.3167024
725.4972469 728.3263011 733.6116690 737.6518269 739.3205035
743.8631376 746.7323535 757.2332489 759.1956852 768.1643438
772.6407846 774.2018498 779.8275374 781.5983706 782.6095624
792.2238380 794.3382994 800.3792739 803.1435126 806.0519882
809.6277493 814.7480897 817.9549442 822.0857990 824.2635879
830.2413626 833.6927293 835.3252914 837.9506842 843.5356462
847.0834882
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2939
Rtb_to_modes> Number of blocs = 189
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.144
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.232
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.300
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.081
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.364
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.251
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.630
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.784
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.345
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.979
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.85
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99997 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 52902 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99997 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603270735402317746.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603270735402317746.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603270735402317746.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603270735402317746.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 376
First residue number = 4
Last residue number = 438
Number of atoms found = 2939
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.144
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.232
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.300
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.081
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.364
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.251
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.630
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.784
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.345
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.979
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.85
Bfactors> 106 vectors, 8817 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.144000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.444 for 376 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.028 +/- 0.04
Bfactors> = 51.694 +/- 10.99
Bfactors> Shiftng-fct= 51.666
Bfactors> Scaling-fct= 309.900
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603270735402317746.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603270735402317746.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0
Chkmod> 106 vectors, 8817 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2939 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7410
0.0034 0.7305
0.0034 0.7351
0.0034 0.8355
0.0034 0.7842
0.0034 0.7800
158.9970 0.4677
162.2272 0.6165
197.2575 0.5499
219.3613 0.6090
251.4902 0.5410
271.4885 0.7498
279.5976 0.6082
302.9549 0.5085
313.6822 0.4766
325.3798 0.3092
346.6281 0.0572
354.3655 0.3972
365.0193 0.6409
373.0076 0.1782
389.4011 0.4313
401.0364 0.3132
413.2006 0.3956
414.6249 0.3559
443.2147 0.2418
447.9777 0.3140
452.9510 0.0674
456.8391 0.3529
464.8982 0.2663
486.9481 0.3899
491.5273 0.3669
498.0805 0.3346
503.8470 0.1470
508.6218 0.3506
518.3807 0.3320
521.3293 0.3149
526.9533 0.3946
530.4102 0.3463
537.2573 0.4325
538.3535 0.3300
548.8733 0.3199
549.6246 0.2143
560.2484 0.4086
562.7683 0.2764
579.9994 0.3326
583.0408 0.2349
587.2724 0.4360
593.2651 0.5108
600.6719 0.3104
607.8916 0.4127
610.1181 0.4029
615.0265 0.2715
617.5138 0.3237
626.7061 0.2658
632.9776 0.3966
638.4492 0.2762
641.3973 0.3596
649.7986 0.3203
652.9664 0.4878
653.7785 0.5150
656.8374 0.4590
664.6003 0.3627
671.2204 0.4837
674.8120 0.2729
676.8184 0.3783
683.0613 0.3575
688.5630 0.5212
689.7606 0.4777
700.1948 0.4420
701.7927 0.3523
707.3155 0.2554
711.7193 0.2097
717.4122 0.3002
718.9719 0.3642
722.3260 0.2582
725.5022 0.1640
728.2598 0.2599
733.5833 0.4334
737.5907 0.5227
739.2673 0.4141
743.7991 0.4566
746.7260 0.3674
757.2317 0.2226
759.1756 0.4359
768.1310 0.2440
772.5698 0.2504
774.1706 0.3876
779.7856 0.3102
781.5980 0.3677
782.5780 0.2941
792.1621 0.4635
794.3175 0.5058
800.3805 0.2318
803.1012 0.3706
806.0323 0.3394
809.6083 0.3744
814.6898 0.3460
817.9397 0.3518
822.0379 0.5108
824.2582 0.3097
830.1736 0.3518
833.6461 0.3058
835.2710 0.2719
837.9489 0.3428
843.4887 0.3610
847.0459 0.3091
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603270735402317746 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
making animated gifs
11 models are in 2603270735402317746.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603270735402317746 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
making animated gifs
11 models are in 2603270735402317746.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603270735402317746 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
making animated gifs
11 models are in 2603270735402317746.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603270735402317746 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
making animated gifs
11 models are in 2603270735402317746.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603270735402317746 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603270735402317746.eigenfacs
2603270735402317746.atom
making animated gifs
11 models are in 2603270735402317746.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603270735402317746.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603270735402317746.10.pdb
2603270735402317746.11.pdb
2603270735402317746.7.pdb
2603270735402317746.8.pdb
2603270735402317746.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m21.206s
user 0m21.079s
sys 0m0.106s
rm: cannot remove '2603270735402317746.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
