*** extreme ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603271231172402632.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603271231172402632.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603271231172402632.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 1
Last residue number = 803
Number of atoms found = 12711
Mean number per residue = 15.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.520814 +/- 16.122328 From: -40.045000 To: 39.320000
= -0.126546 +/- 16.842932 From: -53.432000 To: 33.872000
= 0.072575 +/- 18.668360 From: -51.513000 To: 45.695000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.2455 % Filled.
Pdbmat> 9056027 non-zero elements.
Pdbmat> 997981 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 157.03 +/- 45.54
Maximum number = 249
Minimum number = 27
Pdbmat> Matrix trace = 1.995962E+07
Pdbmat> Larger element = 912.247
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
803 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603271231172402632.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603271231172402632.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603271231172402632.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 12711 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 803 residues.
Blocpdb> 71 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 70 atoms in block 2
Block first atom: 72
Blocpdb> 82 atoms in block 3
Block first atom: 142
Blocpdb> 55 atoms in block 4
Block first atom: 224
Blocpdb> 71 atoms in block 5
Block first atom: 279
Blocpdb> 81 atoms in block 6
Block first atom: 350
Blocpdb> 77 atoms in block 7
Block first atom: 431
Blocpdb> 100 atoms in block 8
Block first atom: 508
Blocpdb> 95 atoms in block 9
Block first atom: 608
Blocpdb> 90 atoms in block 10
Block first atom: 703
Blocpdb> 76 atoms in block 11
Block first atom: 793
Blocpdb> 68 atoms in block 12
Block first atom: 869
Blocpdb> 93 atoms in block 13
Block first atom: 937
Blocpdb> 77 atoms in block 14
Block first atom: 1030
Blocpdb> 92 atoms in block 15
Block first atom: 1107
Blocpdb> 73 atoms in block 16
Block first atom: 1199
Blocpdb> 77 atoms in block 17
Block first atom: 1272
Blocpdb> 97 atoms in block 18
Block first atom: 1349
Blocpdb> 76 atoms in block 19
Block first atom: 1446
Blocpdb> 65 atoms in block 20
Block first atom: 1522
Blocpdb> 85 atoms in block 21
Block first atom: 1587
Blocpdb> 69 atoms in block 22
Block first atom: 1672
Blocpdb> 75 atoms in block 23
Block first atom: 1741
Blocpdb> 75 atoms in block 24
Block first atom: 1816
Blocpdb> 76 atoms in block 25
Block first atom: 1891
Blocpdb> 100 atoms in block 26
Block first atom: 1967
Blocpdb> 80 atoms in block 27
Block first atom: 2067
Blocpdb> 84 atoms in block 28
Block first atom: 2147
Blocpdb> 56 atoms in block 29
Block first atom: 2231
Blocpdb> 88 atoms in block 30
Block first atom: 2287
Blocpdb> 88 atoms in block 31
Block first atom: 2375
Blocpdb> 81 atoms in block 32
Block first atom: 2463
Blocpdb> 87 atoms in block 33
Block first atom: 2544
Blocpdb> 84 atoms in block 34
Block first atom: 2631
Blocpdb> 88 atoms in block 35
Block first atom: 2715
Blocpdb> 74 atoms in block 36
Block first atom: 2803
Blocpdb> 88 atoms in block 37
Block first atom: 2877
Blocpdb> 82 atoms in block 38
Block first atom: 2965
Blocpdb> 87 atoms in block 39
Block first atom: 3047
Blocpdb> 71 atoms in block 40
Block first atom: 3134
Blocpdb> 83 atoms in block 41
Block first atom: 3205
Blocpdb> 81 atoms in block 42
Block first atom: 3288
Blocpdb> 81 atoms in block 43
Block first atom: 3369
Blocpdb> 100 atoms in block 44
Block first atom: 3450
Blocpdb> 95 atoms in block 45
Block first atom: 3550
Blocpdb> 83 atoms in block 46
Block first atom: 3645
Blocpdb> 84 atoms in block 47
Block first atom: 3728
Blocpdb> 90 atoms in block 48
Block first atom: 3812
Blocpdb> 99 atoms in block 49
Block first atom: 3902
Blocpdb> 80 atoms in block 50
Block first atom: 4001
Blocpdb> 81 atoms in block 51
Block first atom: 4081
Blocpdb> 85 atoms in block 52
Block first atom: 4162
Blocpdb> 79 atoms in block 53
Block first atom: 4247
Blocpdb> 70 atoms in block 54
Block first atom: 4326
Blocpdb> 65 atoms in block 55
Block first atom: 4396
Blocpdb> 81 atoms in block 56
Block first atom: 4461
Blocpdb> 105 atoms in block 57
Block first atom: 4542
Blocpdb> 89 atoms in block 58
Block first atom: 4647
Blocpdb> 80 atoms in block 59
Block first atom: 4736
Blocpdb> 84 atoms in block 60
Block first atom: 4816
Blocpdb> 65 atoms in block 61
Block first atom: 4900
Blocpdb> 94 atoms in block 62
Block first atom: 4965
Blocpdb> 86 atoms in block 63
Block first atom: 5059
Blocpdb> 73 atoms in block 64
Block first atom: 5145
Blocpdb> 98 atoms in block 65
Block first atom: 5218
Blocpdb> 76 atoms in block 66
Block first atom: 5316
Blocpdb> 76 atoms in block 67
Block first atom: 5392
Blocpdb> 92 atoms in block 68
Block first atom: 5468
Blocpdb> 88 atoms in block 69
Block first atom: 5560
Blocpdb> 80 atoms in block 70
Block first atom: 5648
Blocpdb> 74 atoms in block 71
Block first atom: 5728
Blocpdb> 85 atoms in block 72
Block first atom: 5802
Blocpdb> 97 atoms in block 73
Block first atom: 5887
Blocpdb> 68 atoms in block 74
Block first atom: 5984
Blocpdb> 66 atoms in block 75
Block first atom: 6052
Blocpdb> 76 atoms in block 76
Block first atom: 6118
Blocpdb> 63 atoms in block 77
Block first atom: 6194
Blocpdb> 83 atoms in block 78
Block first atom: 6257
Blocpdb> 81 atoms in block 79
Block first atom: 6340
Blocpdb> 83 atoms in block 80
Block first atom: 6421
Blocpdb> 64 atoms in block 81
Block first atom: 6504
Blocpdb> 63 atoms in block 82
Block first atom: 6568
Blocpdb> 76 atoms in block 83
Block first atom: 6631
Blocpdb> 67 atoms in block 84
Block first atom: 6707
Blocpdb> 64 atoms in block 85
Block first atom: 6774
Blocpdb> 75 atoms in block 86
Block first atom: 6838
Blocpdb> 62 atoms in block 87
Block first atom: 6913
Blocpdb> 77 atoms in block 88
Block first atom: 6975
Blocpdb> 67 atoms in block 89
Block first atom: 7052
Blocpdb> 97 atoms in block 90
Block first atom: 7119
Blocpdb> 79 atoms in block 91
Block first atom: 7216
Blocpdb> 85 atoms in block 92
Block first atom: 7295
Blocpdb> 69 atoms in block 93
Block first atom: 7380
Blocpdb> 78 atoms in block 94
Block first atom: 7449
Blocpdb> 68 atoms in block 95
Block first atom: 7527
Blocpdb> 68 atoms in block 96
Block first atom: 7595
Blocpdb> 90 atoms in block 97
Block first atom: 7663
Blocpdb> 69 atoms in block 98
Block first atom: 7753
Blocpdb> 84 atoms in block 99
Block first atom: 7822
Blocpdb> 61 atoms in block 100
Block first atom: 7906
Blocpdb> 71 atoms in block 101
Block first atom: 7967
Blocpdb> 73 atoms in block 102
Block first atom: 8038
Blocpdb> 91 atoms in block 103
Block first atom: 8111
Blocpdb> 86 atoms in block 104
Block first atom: 8202
Blocpdb> 76 atoms in block 105
Block first atom: 8288
Blocpdb> 70 atoms in block 106
Block first atom: 8364
Blocpdb> 82 atoms in block 107
Block first atom: 8434
Blocpdb> 78 atoms in block 108
Block first atom: 8516
Blocpdb> 72 atoms in block 109
Block first atom: 8594
Blocpdb> 80 atoms in block 110
Block first atom: 8666
Blocpdb> 80 atoms in block 111
Block first atom: 8746
Blocpdb> 95 atoms in block 112
Block first atom: 8826
Blocpdb> 64 atoms in block 113
Block first atom: 8921
Blocpdb> 85 atoms in block 114
Block first atom: 8985
Blocpdb> 82 atoms in block 115
Block first atom: 9070
Blocpdb> 87 atoms in block 116
Block first atom: 9152
Blocpdb> 81 atoms in block 117
Block first atom: 9239
Blocpdb> 74 atoms in block 118
Block first atom: 9320
Blocpdb> 96 atoms in block 119
Block first atom: 9394
Blocpdb> 75 atoms in block 120
Block first atom: 9490
Blocpdb> 76 atoms in block 121
Block first atom: 9565
Blocpdb> 74 atoms in block 122
Block first atom: 9641
Blocpdb> 84 atoms in block 123
Block first atom: 9715
Blocpdb> 81 atoms in block 124
Block first atom: 9799
Blocpdb> 79 atoms in block 125
Block first atom: 9880
Blocpdb> 79 atoms in block 126
Block first atom: 9959
Blocpdb> 78 atoms in block 127
Block first atom: 10038
Blocpdb> 86 atoms in block 128
Block first atom: 10116
Blocpdb> 78 atoms in block 129
Block first atom: 10202
Blocpdb> 58 atoms in block 130
Block first atom: 10280
Blocpdb> 92 atoms in block 131
Block first atom: 10338
Blocpdb> 85 atoms in block 132
Block first atom: 10430
Blocpdb> 91 atoms in block 133
Block first atom: 10515
Blocpdb> 81 atoms in block 134
Block first atom: 10606
Blocpdb> 83 atoms in block 135
Block first atom: 10687
Blocpdb> 84 atoms in block 136
Block first atom: 10770
Blocpdb> 72 atoms in block 137
Block first atom: 10854
Blocpdb> 83 atoms in block 138
Block first atom: 10926
Blocpdb> 85 atoms in block 139
Block first atom: 11009
Blocpdb> 82 atoms in block 140
Block first atom: 11094
Blocpdb> 71 atoms in block 141
Block first atom: 11176
Blocpdb> 48 atoms in block 142
Block first atom: 11247
Blocpdb> 65 atoms in block 143
Block first atom: 11295
Blocpdb> 62 atoms in block 144
Block first atom: 11360
Blocpdb> 84 atoms in block 145
Block first atom: 11422
Blocpdb> 69 atoms in block 146
Block first atom: 11506
Blocpdb> 78 atoms in block 147
Block first atom: 11575
Blocpdb> 80 atoms in block 148
Block first atom: 11653
Blocpdb> 76 atoms in block 149
Block first atom: 11733
Blocpdb> 84 atoms in block 150
Block first atom: 11809
Blocpdb> 75 atoms in block 151
Block first atom: 11893
Blocpdb> 68 atoms in block 152
Block first atom: 11968
Blocpdb> 73 atoms in block 153
Block first atom: 12036
Blocpdb> 100 atoms in block 154
Block first atom: 12109
Blocpdb> 86 atoms in block 155
Block first atom: 12209
Blocpdb> 69 atoms in block 156
Block first atom: 12295
Blocpdb> 83 atoms in block 157
Block first atom: 12364
Blocpdb> 91 atoms in block 158
Block first atom: 12447
Blocpdb> 64 atoms in block 159
Block first atom: 12538
Blocpdb> 63 atoms in block 160
Block first atom: 12602
Blocpdb> 47 atoms in block 161
Block first atom: 12664
Blocpdb> 161 blocks.
Blocpdb> At most, 105 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 47 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 9056188 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 38133
Prepmat> Matrix trace = 19959620.0000
Prepmat> Last element read: 38133 38133 302.0152
Prepmat> 13042 lines saved.
Prepmat> 11493 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12711
RTB> Total mass = 12711.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 12711
RTB> Number of blocks = 161
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 357585.4862
RTB> 53313 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 966
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53313
Diagstd> Projected matrix trace = 357585.4862
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 966 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 357585.4862
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2498057 0.6372246 1.1521749 2.5370752
3.0867532 4.7608712 5.2533286 6.1159713 6.6701463
7.5474692 7.6057056 9.7990418 10.1551312 11.9991618
12.7706533 13.2605071 13.7666507 14.6556296 15.8804071
16.9595147 17.8888775 18.8917522 19.4336476 19.9090278
21.0280336 23.6242019 25.4370184 25.7023940 27.1171109
27.5884210 28.3815225 28.7719627 31.6097813 33.4437820
33.7584126 34.9192474 36.3084339 37.1988407 38.2954921
40.0482925 40.6453767 40.8490890 41.7156816 43.4004917
44.7483620 45.3040178 45.6506775 46.8613313 48.4093276
49.2996879 50.3421181 50.9352636 52.6280742 54.5251641
54.8897213 56.5878453 58.6242486 59.5948622 59.9152313
60.1552147 61.2240701 61.6006707 62.5072596 63.4889405
64.7158413 66.2730420 66.7843169 67.1700648 69.6405479
70.2780174 70.3513906 71.6514859 72.5647971 73.6064916
74.3084718 76.8769759 77.7599802 80.0315195 80.3762753
81.0079148 81.7667284 82.8922887 83.9452045 84.1584938
85.3454956 86.3403791 87.1555571 88.7780412 89.1622569
90.8318711 91.1684920 91.3441767 92.4082717 93.1238905
94.4767453 95.5381000 97.0851553 98.0558243 99.6294789
99.9272211
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034293 0.0034323 0.0034326 0.0034342 0.0034345
0.0034349 54.2745782 86.6845199 116.5613251 172.9664810
190.7858812 236.9400614 248.8929315 268.5517581 280.4548538
298.3293315 299.4780769 339.9281137 346.0493598 376.1583753
388.0626429 395.4352182 402.9112805 415.7167466 432.7390588
447.2002010 459.2898258 471.9884813 478.7099368 484.5295930
497.9601753 527.8054289 547.6818928 550.5313672 565.4796609
570.3726633 578.5130026 582.4786671 610.5286176 627.9903529
630.9374244 641.6936144 654.3333241 662.3079725 671.9997443
687.2065378 692.3104015 694.0431431 701.3663935 715.3895720
726.4134076 730.9095556 733.7006334 743.3658252 755.5440776
762.4605277 770.4793839 775.0050978 787.7783105 801.8511765
804.5273137 816.8773590 831.4457637 838.3004327 840.5506732
842.2323545 849.6819240 852.2911926 858.5399521 865.2554033
873.5757723 884.0233432 887.4267680 889.9859774 906.2048241
910.3429450 910.8180391 919.1954816 925.0352296 931.6511821
936.0831878 952.1238103 957.5762169 971.4619870 973.5521467
977.3700058 981.9369234 988.6722529 994.9316032 996.1947702
1003.1955167 1009.0257652 1013.7779057 1023.1706164 1025.3822772
1034.9381838 1036.8541395 1037.8526849 1043.8803058 1047.9144669
1055.4987954 1061.4109907 1069.9702319 1075.3057740 1083.8999833
1085.5183901
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12711
Rtb_to_modes> Number of blocs = 161
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9727E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9920E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2498
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6372
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.152
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.537
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.087
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.761
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.253
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.116
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.670
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.547
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.606
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.799
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.93
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 966 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 0.99996 1.00001 1.00003
1.00002 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998
0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997
1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99997
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 228798 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 0.99996 1.00001 1.00003
1.00002 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998
0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99997
1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99997
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603271231172402632.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603271231172402632.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603271231172402632.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603271231172402632.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 1
Last residue number = 803
Number of atoms found = 12711
Mean number per residue = 15.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9727E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9920E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2498
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6372
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.152
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.537
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.087
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.761
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.253
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.116
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.670
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.547
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.606
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.799
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.93
Bfactors> 106 vectors, 38133 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.249800
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.012 +/- 0.03
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.012
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603271231172402632.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603271231172402632.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4291E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085.
Chkmod> 106 vectors, 38133 coordinates in file.
Chkmod> That is: 12711 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6473
0.0034 0.8492
0.0034 0.8900
0.0034 0.9299
0.0034 0.8292
0.0034 0.6622
54.2716 0.2089
86.6791 0.0942
116.5475 0.1369
172.9565 0.1966
190.7853 0.1673
236.9331 0.5245
248.8745 0.4231
268.5409 0.3575
280.4397 0.3793
298.3073 0.4501
299.4710 0.3382
339.9128 0.3283
346.1174 0.3075
376.1554 0.3815
388.0361 0.4140
395.4107 0.4822
402.9430 0.2157
415.7609 0.1441
432.7149 0.5578
447.1874 0.5037
459.2845 0.2763
471.9463 0.2624
478.6445 0.5127
484.5206 0.4839
497.9621 0.4686
527.7358 0.6427
547.6905 0.3769
550.4821 0.3762
565.4855 0.3806
570.3645 0.3456
578.4727 0.3481
582.4338 0.4009
610.5045 0.6176
627.9279 0.4678
630.9252 0.4698
641.6730 0.4745
654.3193 0.5013
662.2899 0.3906
672.0104 0.5695
687.1917 0.4654
692.3201 0.4172
694.0211 0.3991
701.3726 0.4612
715.3548 0.3326
726.3955 0.4067
730.8458 0.2177
733.6637 0.2612
743.3234 0.4715
755.5169 0.2442
762.4302 0.4025
770.4301 0.4241
775.0079 0.4497
787.7589 0.4925
801.8523 0.4936
804.4948 0.4426
816.8578 0.3474
831.3799 0.3711
838.2302 0.2155
840.5480 0.3342
842.2297 0.5551
849.6172 0.3977
852.2500 0.4772
858.5219 0.3722
865.2255 0.3610
873.5663 0.5146
883.9651 0.4360
887.3600 0.4925
889.9473 0.3927
906.1624 0.5128
910.3167 0.5332
910.7699 0.5555
919.1465 0.4360
924.9649 0.4932
931.6334 0.4073
936.0526 0.5231
952.1017 0.5168
957.5352 0.4518
971.4111 0.3943
973.5329 0.4429
977.3406 0.5541
981.9144 0.2157
988.6162 0.4459
994.9173 0.4627
996.1609 0.3935
1003.1789 0.4542
1008.9802 0.4236
1013.7602 0.3219
1023.1380 0.4655
1025.3253 0.5094
1034.8831 0.4705
1036.8182 0.5090
1037.7844 0.4302
1043.8453 0.5147
1047.8476 0.4435
1055.4717 0.4902
1061.3760 0.3526
1069.9510 0.4800
1075.2825 0.5347
1083.8563 0.5792
1085.4869 0.5945
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2603271231172402632.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603271231172402632.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2603271231172402632.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603271231172402632.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2603271231172402632.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2603271231172402632.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4291E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085.
Projmod> 106 vectors, 38133 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 1
Last residue number = 803
Number of atoms found = 12711
Mean number per residue = 15.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 1
Last residue number = 803
Number of atoms found = 12711
Mean number per residue = 15.8
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 12711 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 8.14
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.035 Sum= 0.001 q= 31.6988
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.002 Sum= 0.001 q= -2.2516
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.008 Sum= 0.001 q= 7.3096
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.014 Sum= 0.001 q= -12.9475
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.034 Sum= 0.003 q= -31.0755
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.010 Sum= 0.003 q= -9.0112
Vector: 7 F= 54.27 Cos= 0.076 Sum= 0.008 q= 69.4828
Vector: 8 F= 86.68 Cos= -0.460 Sum= 0.220 q= -421.7322
Vector: 9 F= 116.55 Cos= -0.200 Sum= 0.260 q= -183.8573
Vector: 10 F= 172.96 Cos= -0.231 Sum= 0.313 q= -212.0769
Vector: 11 F= 190.79 Cos= -0.149 Sum= 0.336 q= -137.0782
Vector: 12 F= 236.93 Cos= -0.162 Sum= 0.362 q= -148.3596
Vector: 13 F= 248.87 Cos= -0.220 Sum= 0.410 q= -201.8862
Vector: 14 F= 268.54 Cos= -0.088 Sum= 0.418 q= -80.6556
Vector: 15 F= 280.44 Cos= 0.262 Sum= 0.486 q= 240.0831
Vector: 16 F= 298.31 Cos= -0.000 Sum= 0.486 q= -0.0007
Vector: 17 F= 299.47 Cos= -0.091 Sum= 0.495 q= -83.2839
Vector: 18 F= 339.91 Cos= 0.019 Sum= 0.495 q= 17.2687
Vector: 19 F= 346.12 Cos= -0.105 Sum= 0.506 q= -95.8963
Vector: 20 F= 376.16 Cos= -0.028 Sum= 0.507 q= -25.8909
Vector: 21 F= 388.04 Cos= -0.073 Sum= 0.512 q= -67.4404
Vector: 22 F= 395.41 Cos= -0.034 Sum= 0.513 q= -31.3903
Vector: 23 F= 402.94 Cos= -0.057 Sum= 0.516 q= -51.9600
Vector: 24 F= 415.76 Cos= 0.219 Sum= 0.564 q= 201.1075
Vector: 25 F= 432.71 Cos= -0.029 Sum= 0.565 q= -26.8239
Vector: 26 F= 447.19 Cos= 0.010 Sum= 0.565 q= 9.3525
Vector: 27 F= 459.28 Cos= -0.027 Sum= 0.566 q= -24.8147
Vector: 28 F= 471.95 Cos= 0.089 Sum= 0.574 q= 81.7644
Vector: 29 F= 478.64 Cos= 0.008 Sum= 0.574 q= 7.4751
Vector: 30 F= 484.52 Cos= 0.009 Sum= 0.574 q= 8.1911
Vector: 31 F= 497.96 Cos= -0.007 Sum= 0.574 q= -6.0999
Vector: 32 F= 527.74 Cos= 0.081 Sum= 0.581 q= 74.4607
Vector: 33 F= 547.69 Cos= -0.029 Sum= 0.582 q= -26.6092
Vector: 34 F= 550.48 Cos= 0.021 Sum= 0.582 q= 19.4067
Vector: 35 F= 565.49 Cos= 0.057 Sum= 0.585 q= 52.4396
Vector: 36 F= 570.36 Cos= 0.089 Sum= 0.593 q= 81.8212
Vector: 37 F= 578.47 Cos= -0.022 Sum= 0.594 q= -20.0981
Vector: 38 F= 582.43 Cos= 0.011 Sum= 0.594 q= 9.7213
Vector: 39 F= 610.50 Cos= -0.003 Sum= 0.594 q= -2.8173
Vector: 40 F= 627.93 Cos= 0.019 Sum= 0.594 q= 17.1916
Vector: 41 F= 630.93 Cos= 0.019 Sum= 0.595 q= 17.4512
Vector: 42 F= 641.67 Cos= -0.027 Sum= 0.595 q= -25.1022
Vector: 43 F= 654.32 Cos= 0.066 Sum= 0.600 q= 60.4724
Vector: 44 F= 662.29 Cos= -0.094 Sum= 0.609 q= -86.2908
Vector: 45 F= 672.01 Cos= 0.012 Sum= 0.609 q= 11.1363
Vector: 46 F= 687.19 Cos= 0.072 Sum= 0.614 q= 66.0969
Vector: 47 F= 692.32 Cos= -0.012 Sum= 0.614 q= -11.1381
Vector: 48 F= 694.02 Cos= 0.011 Sum= 0.614 q= 10.1099
Vector: 49 F= 701.37 Cos= -0.004 Sum= 0.614 q= -3.7985
Vector: 50 F= 715.35 Cos= -0.192 Sum= 0.651 q= -175.9187
Vector: 51 F= 726.40 Cos= -0.018 Sum= 0.651 q= -16.8358
Vector: 52 F= 730.85 Cos= -0.027 Sum= 0.652 q= -24.8050
Vector: 53 F= 733.66 Cos= 0.022 Sum= 0.652 q= 19.7463
Vector: 54 F= 743.32 Cos= -0.067 Sum= 0.657 q= -61.3587
Vector: 55 F= 755.52 Cos= -0.003 Sum= 0.657 q= -2.6613
Vector: 56 F= 762.43 Cos= -0.007 Sum= 0.657 q= -6.2376
Vector: 57 F= 770.43 Cos= 0.011 Sum= 0.657 q= 10.2265
Vector: 58 F= 775.01 Cos= 0.024 Sum= 0.658 q= 21.8293
Vector: 59 F= 787.76 Cos= 0.030 Sum= 0.659 q= 27.1977
Vector: 60 F= 801.85 Cos= -0.075 Sum= 0.664 q= -68.8985
Vector: 61 F= 804.49 Cos= 0.093 Sum= 0.673 q= 85.7359
Vector: 62 F= 816.86 Cos= -0.081 Sum= 0.679 q= -74.2757
Vector: 63 F= 831.38 Cos= -0.027 Sum= 0.680 q= -24.4527
Vector: 64 F= 838.23 Cos= 0.057 Sum= 0.683 q= 52.3061
Vector: 65 F= 840.55 Cos= -0.007 Sum= 0.684 q= -6.1165
Vector: 66 F= 842.23 Cos= 0.125 Sum= 0.699 q= 114.3065
Vector: 67 F= 849.62 Cos= -0.051 Sum= 0.702 q= -46.4976
Vector: 68 F= 852.25 Cos= -0.017 Sum= 0.702 q= -15.3809
Vector: 69 F= 858.52 Cos= -0.030 Sum= 0.703 q= -27.3931
Vector: 70 F= 865.23 Cos= -0.173 Sum= 0.733 q= -159.0827
Vector: 71 F= 873.57 Cos= -0.024 Sum= 0.733 q= -22.2216
Vector: 72 F= 883.97 Cos= -0.006 Sum= 0.733 q= -5.0766
Vector: 73 F= 887.36 Cos= 0.074 Sum= 0.739 q= 68.0894
Vector: 74 F= 889.95 Cos= -0.025 Sum= 0.740 q= -22.9333
Vector: 75 F= 906.16 Cos= 0.005 Sum= 0.740 q= 4.9467
Vector: 76 F= 910.32 Cos= 0.040 Sum= 0.741 q= 36.5067
Vector: 77 F= 910.77 Cos= -0.023 Sum= 0.742 q= -20.7261
Vector: 78 F= 919.15 Cos= -0.015 Sum= 0.742 q= -13.6624
Vector: 79 F= 924.96 Cos= -0.039 Sum= 0.743 q= -35.5651
Vector: 80 F= 931.63 Cos= 0.035 Sum= 0.745 q= 32.3843
Vector: 81 F= 936.05 Cos= -0.021 Sum= 0.745 q= -19.6550
Vector: 82 F= 952.10 Cos= 0.040 Sum= 0.747 q= 36.3984
Vector: 83 F= 957.54 Cos= 0.047 Sum= 0.749 q= 43.1733
Vector: 84 F= 971.41 Cos= 0.027 Sum= 0.750 q= 24.5078
Vector: 85 F= 973.53 Cos= -0.019 Sum= 0.750 q= -17.1856
Vector: 86 F= 977.34 Cos= 0.025 Sum= 0.751 q= 22.9416
Vector: 87 F= 981.91 Cos= -0.029 Sum= 0.751 q= -26.7987
Vector: 88 F= 988.62 Cos= -0.047 Sum= 0.754 q= -43.0497
Vector: 89 F= 994.92 Cos= -0.006 Sum= 0.754 q= -5.7901
Vector: 90 F= 996.16 Cos= 0.020 Sum= 0.754 q= 18.6670
Vector: 91 F= 1003.18 Cos= 0.025 Sum= 0.755 q= 22.8323
Vector: 92 F= 1008.98 Cos= -0.064 Sum= 0.759 q= -58.6362
Vector: 93 F= 1013.76 Cos= 0.073 Sum= 0.764 q= 67.3857
Vector: 94 F= 1023.14 Cos= 0.019 Sum= 0.765 q= 17.5667
Vector: 95 F= 1025.33 Cos= 0.030 Sum= 0.765 q= 27.9312
Vector: 96 F= 1034.88 Cos= 0.026 Sum= 0.766 q= 24.2801
Vector: 97 F= 1036.82 Cos= -0.073 Sum= 0.772 q= -67.3966
Vector: 98 F= 1037.78 Cos= -0.005 Sum= 0.772 q= -4.6746
Vector: 99 F= 1043.85 Cos= 0.001 Sum= 0.772 q= 1.0157
Vector: 100 F= 1047.85 Cos= -0.006 Sum= 0.772 q= -5.3026
Vector: 101 F= 1055.47 Cos= -0.071 Sum= 0.777 q= -65.3115
Vector: 102 F= 1061.38 Cos= -0.091 Sum= 0.785 q= -83.9271
Vector: 103 F= 1069.95 Cos= 0.031 Sum= 0.786 q= 28.6275
Vector: 104 F= 1075.28 Cos= 0.009 Sum= 0.786 q= 8.1167
Vector: 105 F= 1083.86 Cos= 0.005 Sum= 0.786 q= 4.5298
Vector: 106 F= 1085.49 Cos= -0.040 Sum= 0.788 q= -36.2798
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003429
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 54.271629
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.46 for mode 8 with F= 86.68 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.211 0.333 0.470 0.563 0.611 0.788
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603271231172402632 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
making animated gifs
11 models are in 2603271231172402632.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 803 7.943 628 1.390
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 803 7.915 628 1.390
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 803 7.891 628 1.389
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 803 7.870 628 1.389
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 803 7.853 627 1.385
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 803 7.840 627 1.385
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 803 7.830 628 1.388
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 803 7.824 628 1.387
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 803 7.822 628 1.387
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 803 7.823 628 1.387
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 803 7.828 628 1.387
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603271231172402632 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
making animated gifs
11 models are in 2603271231172402632.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 803 7.473 624 1.377
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 803 7.540 624 1.376
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 803 7.610 626 1.383
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 803 7.684 628 1.390
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 803 7.760 628 1.389
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 803 7.840 627 1.385
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 803 7.922 628 1.388
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 803 8.007 628 1.387
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 803 8.095 628 1.385
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 803 8.185 629 1.389
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 803 8.278 629 1.389
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603271231172402632 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
making animated gifs
11 models are in 2603271231172402632.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 803 7.690 624 1.364
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 803 7.713 625 1.370
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 803 7.739 627 1.380
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 803 7.769 629 1.389
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 803 7.803 629 1.391
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 803 7.840 627 1.385
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 803 7.880 627 1.387
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 803 7.925 627 1.388
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 803 7.972 627 1.391
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 803 8.023 627 1.393
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 803 8.077 626 1.393
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603271231172402632 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
making animated gifs
11 models are in 2603271231172402632.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 803 7.660 617 1.369
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 803 7.688 621 1.376
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 803 7.720 625 1.385
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 803 7.756 627 1.388
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 803 7.796 629 1.393
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 803 7.840 627 1.385
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 803 7.887 628 1.390
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 803 7.938 630 1.401
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 803 7.993 628 1.398
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 803 8.051 624 1.387
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 803 8.112 621 1.383
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603271231172402632 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603271231172402632.eigenfacs
2603271231172402632.atom
making animated gifs
11 models are in 2603271231172402632.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603271231172402632.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 803 7.749 621 1.477
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 803 7.759 622 1.456
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 803 7.773 625 1.441
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 803 7.791 627 1.426
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 803 7.814 628 1.408
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 803 7.840 627 1.385
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 803 7.870 628 1.371
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 803 7.904 629 1.374
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 803 7.942 631 1.352
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 803 7.983 632 1.343
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 803 8.029 629 1.329
2603271231172402632.10.pdb
2603271231172402632.11.pdb
2603271231172402632.7.pdb
2603271231172402632.8.pdb
2603271231172402632.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m24.741s
user 1m24.046s
sys 0m0.645s
rm: cannot remove '2603271231172402632.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
