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LOGs for ID: 2603291542303036220

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603291542303036220.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603291542303036220.atom to be opened. Openam> File opened: 2603291542303036220.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1252 First residue number = 1 Last residue number = 647 Number of atoms found = 9535 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.283983 +/- 20.290008 From: -46.166000 To: 53.962000 = 1.878190 +/- 22.430077 From: -44.199000 To: 52.670000 = 26.837130 +/- 18.940699 From: -27.568000 To: 67.977000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.8731 % Filled. Pdbmat> 3572210 non-zero elements. Pdbmat> 390625 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.93 +/- 21.91 Maximum number = 127 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 7.812500E+06 Pdbmat> Larger element = 502.726 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1252 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603291542303036220.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603291542303036220.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603291542303036220.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9535 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1252 residues. Blocpdb> 51 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 51 atoms in block 2 Block first atom: 52 Blocpdb> 49 atoms in block 3 Block first atom: 103 Blocpdb> 55 atoms in block 4 Block first atom: 152 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 207 Blocpdb> 58 atoms in block 6 Block first atom: 259 Blocpdb> 68 atoms in block 7 Block first atom: 317 Blocpdb> 44 atoms in block 8 Block first atom: 385 Blocpdb> 47 atoms in block 9 Block first atom: 429 Blocpdb> 46 atoms in block 10 Block first atom: 476 Blocpdb> 57 atoms in block 11 Block first atom: 522 Blocpdb> 62 atoms in block 12 Block first atom: 579 Blocpdb> 52 atoms in block 13 Block first atom: 641 Blocpdb> 52 atoms in block 14 Block first atom: 693 Blocpdb> 54 atoms in block 15 Block first atom: 745 Blocpdb> 56 atoms in block 16 Block first atom: 799 Blocpdb> 51 atoms in block 17 Block first atom: 855 Blocpdb> 48 atoms in block 18 Block first atom: 906 Blocpdb> 57 atoms in block 19 Block first atom: 954 Blocpdb> 49 atoms in block 20 Block first atom: 1011 Blocpdb> 55 atoms in block 21 Block first atom: 1060 Blocpdb> 52 atoms in block 22 Block first atom: 1115 Blocpdb> 56 atoms in block 23 Block first atom: 1167 Blocpdb> 56 atoms in block 24 Block first atom: 1223 Blocpdb> 58 atoms in block 25 Block first atom: 1279 Blocpdb> 50 atoms in block 26 Block first atom: 1337 Blocpdb> 51 atoms in block 27 Block first atom: 1387 Blocpdb> 42 atoms in block 28 Block first atom: 1438 Blocpdb> 57 atoms in block 29 Block first atom: 1480 Blocpdb> 49 atoms in block 30 Block first atom: 1537 Blocpdb> 48 atoms in block 31 Block first atom: 1586 Blocpdb> 52 atoms in block 32 Block first atom: 1634 Blocpdb> 55 atoms in block 33 Block first atom: 1686 Blocpdb> 59 atoms in block 34 Block first atom: 1741 Blocpdb> 62 atoms in block 35 Block first atom: 1800 Blocpdb> 56 atoms in block 36 Block first atom: 1862 Blocpdb> 56 atoms in block 37 Block first atom: 1918 Blocpdb> 56 atoms in block 38 Block first atom: 1974 Blocpdb> 57 atoms in block 39 Block first atom: 2030 Blocpdb> 57 atoms in block 40 Block first atom: 2087 Blocpdb> 60 atoms in block 41 Block first atom: 2144 Blocpdb> 52 atoms in block 42 Block first atom: 2204 Blocpdb> 50 atoms in block 43 Block first atom: 2256 Blocpdb> 52 atoms in block 44 Block first atom: 2306 Blocpdb> 45 atoms in block 45 Block first atom: 2358 Blocpdb> 52 atoms in block 46 Block first atom: 2403 Blocpdb> 55 atoms in block 47 Block first atom: 2455 Blocpdb> 45 atoms in block 48 Block first atom: 2510 Blocpdb> 50 atoms in block 49 Block first atom: 2555 Blocpdb> 58 atoms in block 50 Block first atom: 2605 Blocpdb> 46 atoms in block 51 Block first atom: 2663 Blocpdb> 57 atoms in block 52 Block first atom: 2709 Blocpdb> 56 atoms in block 53 Block first atom: 2766 Blocpdb> 59 atoms in block 54 Block first atom: 2822 Blocpdb> 61 atoms in block 55 Block first atom: 2881 Blocpdb> 58 atoms in block 56 Block first atom: 2942 Blocpdb> 57 atoms in block 57 Block first atom: 3000 Blocpdb> 53 atoms in block 58 Block first atom: 3057 Blocpdb> 60 atoms in block 59 Block first atom: 3110 Blocpdb> 56 atoms in block 60 Block first atom: 3170 Blocpdb> 56 atoms in block 61 Block first atom: 3226 Blocpdb> 53 atoms in block 62 Block first atom: 3282 Blocpdb> 52 atoms in block 63 Block first atom: 3335 Blocpdb> 44 atoms in block 64 Block first atom: 3387 Blocpdb> 60 atoms in block 65 Block first atom: 3431 Blocpdb> 45 atoms in block 66 Block first atom: 3491 Blocpdb> 54 atoms in block 67 Block first atom: 3536 Blocpdb> 57 atoms in block 68 Block first atom: 3590 Blocpdb> 45 atoms in block 69 Block first atom: 3647 Blocpdb> 51 atoms in block 70 Block first atom: 3692 Blocpdb> 46 atoms in block 71 Block first atom: 3743 Blocpdb> 46 atoms in block 72 Block first atom: 3789 Blocpdb> 45 atoms in block 73 Block first atom: 3835 Blocpdb> 52 atoms in block 74 Block first atom: 3880 Blocpdb> 70 atoms in block 75 Block first atom: 3932 Blocpdb> 60 atoms in block 76 Block first atom: 4002 Blocpdb> 48 atoms in block 77 Block first atom: 4062 Blocpdb> 52 atoms in block 78 Block first atom: 4110 Blocpdb> 59 atoms in block 79 Block first atom: 4162 Blocpdb> 62 atoms in block 80 Block first atom: 4221 Blocpdb> 61 atoms in block 81 Block first atom: 4283 Blocpdb> 63 atoms in block 82 Block first atom: 4344 Blocpdb> 54 atoms in block 83 Block first atom: 4407 Blocpdb> 54 atoms in block 84 Block first atom: 4461 Blocpdb> 54 atoms in block 85 Block first atom: 4515 Blocpdb> 56 atoms in block 86 Block first atom: 4569 Blocpdb> 18 atoms in block 87 Block first atom: 4625 Blocpdb> 45 atoms in block 88 Block first atom: 4643 Blocpdb> 52 atoms in block 89 Block first atom: 4688 Blocpdb> 48 atoms in block 90 Block first atom: 4740 Blocpdb> 58 atoms in block 91 Block first atom: 4788 Blocpdb> 42 atoms in block 92 Block first atom: 4846 Blocpdb> 38 atoms in block 93 Block first atom: 4888 Blocpdb> 33 atoms in block 94 Block first atom: 4926 Blocpdb> 45 atoms in block 95 Block first atom: 4959 Blocpdb> 54 atoms in block 96 Block first atom: 5004 Blocpdb> 48 atoms in block 97 Block first atom: 5058 Blocpdb> 51 atoms in block 98 Block first atom: 5106 Blocpdb> 58 atoms in block 99 Block first atom: 5157 Blocpdb> 49 atoms in block 100 Block first atom: 5215 Blocpdb> 51 atoms in block 101 Block first atom: 5264 Blocpdb> 53 atoms in block 102 Block first atom: 5315 Blocpdb> 57 atoms in block 103 Block first atom: 5368 Blocpdb> 52 atoms in block 104 Block first atom: 5425 Blocpdb> 47 atoms in block 105 Block first atom: 5477 Blocpdb> 60 atoms in block 106 Block first atom: 5524 Blocpdb> 49 atoms in block 107 Block first atom: 5584 Blocpdb> 57 atoms in block 108 Block first atom: 5633 Blocpdb> 48 atoms in block 109 Block first atom: 5690 Blocpdb> 44 atoms in block 110 Block first atom: 5738 Blocpdb> 47 atoms in block 111 Block first atom: 5782 Blocpdb> 52 atoms in block 112 Block first atom: 5829 Blocpdb> 52 atoms in block 113 Block first atom: 5881 Blocpdb> 55 atoms in block 114 Block first atom: 5933 Blocpdb> 61 atoms in block 115 Block first atom: 5988 Blocpdb> 55 atoms in block 116 Block first atom: 6049 Blocpdb> 61 atoms in block 117 Block first atom: 6104 Blocpdb> 52 atoms in block 118 Block first atom: 6165 Blocpdb> 56 atoms in block 119 Block first atom: 6217 Blocpdb> 50 atoms in block 120 Block first atom: 6273 Blocpdb> 44 atoms in block 121 Block first atom: 6323 Blocpdb> 54 atoms in block 122 Block first atom: 6367 Blocpdb> 55 atoms in block 123 Block first atom: 6421 Blocpdb> 47 atoms in block 124 Block first atom: 6476 Blocpdb> 52 atoms in block 125 Block first atom: 6523 Blocpdb> 56 atoms in block 126 Block first atom: 6575 Blocpdb> 65 atoms in block 127 Block first atom: 6631 Blocpdb> 65 atoms in block 128 Block first atom: 6696 Blocpdb> 48 atoms in block 129 Block first atom: 6761 Blocpdb> 58 atoms in block 130 Block first atom: 6809 Blocpdb> 61 atoms in block 131 Block first atom: 6867 Blocpdb> 49 atoms in block 132 Block first atom: 6928 Blocpdb> 67 atoms in block 133 Block first atom: 6977 Blocpdb> 58 atoms in block 134 Block first atom: 7044 Blocpdb> 46 atoms in block 135 Block first atom: 7102 Blocpdb> 55 atoms in block 136 Block first atom: 7148 Blocpdb> 53 atoms in block 137 Block first atom: 7203 Blocpdb> 49 atoms in block 138 Block first atom: 7256 Blocpdb> 51 atoms in block 139 Block first atom: 7305 Blocpdb> 51 atoms in block 140 Block first atom: 7356 Blocpdb> 47 atoms in block 141 Block first atom: 7407 Blocpdb> 43 atoms in block 142 Block first atom: 7454 Blocpdb> 59 atoms in block 143 Block first atom: 7497 Blocpdb> 48 atoms in block 144 Block first atom: 7556 Blocpdb> 58 atoms in block 145 Block first atom: 7604 Blocpdb> 53 atoms in block 146 Block first atom: 7662 Blocpdb> 58 atoms in block 147 Block first atom: 7715 Blocpdb> 62 atoms in block 148 Block first atom: 7773 Blocpdb> 54 atoms in block 149 Block first atom: 7835 Blocpdb> 58 atoms in block 150 Block first atom: 7889 Blocpdb> 56 atoms in block 151 Block first atom: 7947 Blocpdb> 60 atoms in block 152 Block first atom: 8003 Blocpdb> 54 atoms in block 153 Block first atom: 8063 Blocpdb> 51 atoms in block 154 Block first atom: 8117 Blocpdb> 50 atoms in block 155 Block first atom: 8168 Blocpdb> 54 atoms in block 156 Block first atom: 8218 Blocpdb> 55 atoms in block 157 Block first atom: 8272 Blocpdb> 56 atoms in block 158 Block first atom: 8327 Blocpdb> 51 atoms in block 159 Block first atom: 8383 Blocpdb> 64 atoms in block 160 Block first atom: 8434 Blocpdb> 50 atoms in block 161 Block first atom: 8498 Blocpdb> 46 atoms in block 162 Block first atom: 8548 Blocpdb> 48 atoms in block 163 Block first atom: 8594 Blocpdb> 40 atoms in block 164 Block first atom: 8642 Blocpdb> 43 atoms in block 165 Block first atom: 8682 Blocpdb> 52 atoms in block 166 Block first atom: 8725 Blocpdb> 75 atoms in block 167 Block first atom: 8777 Blocpdb> 54 atoms in block 168 Block first atom: 8852 Blocpdb> 55 atoms in block 169 Block first atom: 8906 Blocpdb> 59 atoms in block 170 Block first atom: 8961 Blocpdb> 60 atoms in block 171 Block first atom: 9020 Blocpdb> 56 atoms in block 172 Block first atom: 9080 Blocpdb> 55 atoms in block 173 Block first atom: 9136 Blocpdb> 60 atoms in block 174 Block first atom: 9191 Blocpdb> 53 atoms in block 175 Block first atom: 9251 Blocpdb> 58 atoms in block 176 Block first atom: 9304 Blocpdb> 52 atoms in block 177 Block first atom: 9362 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 9414 Blocpdb> 52 atoms in block 179 Block first atom: 9463 Blocpdb> 21 atoms in block 180 Block first atom: 9514 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 75 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 18 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3572390 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 28605 Prepmat> Matrix trace = 7812500.0000 Prepmat> Last element read: 28605 28605 119.1882 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14792 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9535 RTB> Total mass = 9535.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9535 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 187053.8570 RTB> 51228 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 51228 Diagstd> Projected matrix trace = 187053.8570 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 187053.8570 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3916350 0.6298593 0.8637799 1.1906444 1.2398863 1.5611038 1.6075760 2.2045121 2.5038700 2.7709226 2.8212177 3.3588415 3.5622892 4.0067009 4.2111662 4.4979844 4.7974569 5.0949678 5.4014720 5.9853042 6.1385288 6.4565596 6.5650426 6.9529320 7.0693982 7.7381797 8.2634360 8.4332953 9.2191379 9.4692516 10.0991941 10.6069444 10.6973609 11.4413646 11.7526053 12.6327092 12.9397924 13.1013414 13.7006927 14.2739028 14.5021481 14.8361904 14.9423778 15.7508826 15.8816053 16.6978018 17.0861342 17.3424027 17.8471741 18.0773807 18.4657511 19.0778450 19.5541282 19.9354115 20.5004239 20.6777888 20.9191412 21.1792497 21.1959012 21.4285522 21.9488533 22.4425537 22.9329189 23.1437469 23.2491887 23.8449264 24.0085864 24.2459293 24.5389215 25.4039418 25.6217845 25.8114717 26.2396553 26.4942147 27.2584062 27.7950509 28.4268601 29.0166939 29.1772787 29.7855775 29.9697957 30.2482632 30.4647407 31.2372941 31.3918117 31.7905263 32.2006325 32.5092354 32.6432816 33.1356983 33.6268035 33.6847889 34.2107567 34.4084478 35.0374240 35.1916877 35.3742832 35.6494230 36.0843703 36.3498426 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034329 0.0034332 0.0034338 0.0034349 0.0034359 67.9572843 86.1820951 100.9245531 118.4912618 120.9166794 135.6785429 137.6832268 161.2321046 171.8308621 180.7621405 182.3952732 199.0169348 204.9556356 217.3645640 222.8417040 230.3054695 237.8487208 245.1128051 252.3779140 265.6674778 269.0465515 275.9280573 278.2364698 286.3381880 288.7264038 302.0749321 312.1588230 315.3507987 329.7163135 334.1589584 345.0949789 353.6636512 355.1678163 367.3112180 372.2736996 385.9610948 390.6240110 393.0548528 401.9449191 410.2670582 413.5342159 418.2697712 419.7639490 430.9706824 432.7553832 443.7362726 448.8664922 452.2201538 458.7541546 461.7033566 466.6365673 474.3074414 480.1915451 484.8505391 491.6733860 493.7957274 496.6691736 499.7474261 499.9438427 502.6801024 508.7462227 514.4360754 520.0258689 522.4107629 523.5994492 530.2653790 532.0820093 534.7055573 537.9265951 547.3256920 549.6673831 551.6983228 556.2555323 558.9472273 566.9509793 572.5046480 578.9748866 584.9506724 586.5670620 592.6500053 594.4798947 597.2353452 599.3686495 606.9207464 608.4199847 612.2716334 616.2082116 619.1539644 620.4291382 625.0911406 629.7063510 630.2490439 635.1504651 636.9829696 642.7785341 644.1920013 645.8610651 648.3679409 652.3112160 654.7063413 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9535 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.240 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.561 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.608 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.504 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.771 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.821 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.359 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.562 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.007 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.211 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.498 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.095 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.565 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.953 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.263 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.433 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.219 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.469 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.35 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99995 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 1.00004 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 171630 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99995 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 1.00004 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603291542303036220.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603291542303036220.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603291542303036220.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603291542303036220.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1252 First residue number = 1 Last residue number = 647 Number of atoms found = 9535 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6299 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.191 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.240 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.561 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.608 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.504 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.771 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.821 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.359 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.562 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.007 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.211 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.498 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.095 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.565 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.953 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.263 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.433 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.219 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.469 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.35 Bfactors> 106 vectors, 28605 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.391600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.252 for 1252 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.027 +/- 0.07 Bfactors> = 68.064 +/- 17.33 Bfactors> Shiftng-fct= 68.038 Bfactors> Scaling-fct= 263.522 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603291542303036220.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603291542303036220.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603291542303036220 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom making animated gifs 11 models are in 2603291542303036220.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603291542303036220.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603291542303036220.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603291542303036220 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603291542303036220.eigenfacs 2603291542303036220.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603291542303036220.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603291542303036220.10.pdb 2603291542303036220.11.pdb 2603291542303036220.7.pdb 2603291542303036220.8.pdb 2603291542303036220.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m53.006s user 0m52.698s sys 0m0.289s rm: cannot remove '2603291542303036220.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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