***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603291542303036220.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603291542303036220.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603291542303036220.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1252
First residue number = 1
Last residue number = 647
Number of atoms found = 9535
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.283983 +/- 20.290008 From: -46.166000 To: 53.962000
= 1.878190 +/- 22.430077 From: -44.199000 To: 52.670000
= 26.837130 +/- 18.940699 From: -27.568000 To: 67.977000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.8731 % Filled.
Pdbmat> 3572210 non-zero elements.
Pdbmat> 390625 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.93 +/- 21.91
Maximum number = 127
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 7.812500E+06
Pdbmat> Larger element = 502.726
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1252 non-zero elements, NRBL set to 7
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603291542303036220.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 7
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603291542303036220.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603291542303036220.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 9535 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 7 residue(s) per block.
Blocpdb> 1252 residues.
Blocpdb> 51 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 51 atoms in block 2
Block first atom: 52
Blocpdb> 49 atoms in block 3
Block first atom: 103
Blocpdb> 55 atoms in block 4
Block first atom: 152
Blocpdb> 52 atoms in block 5
Block first atom: 207
Blocpdb> 58 atoms in block 6
Block first atom: 259
Blocpdb> 68 atoms in block 7
Block first atom: 317
Blocpdb> 44 atoms in block 8
Block first atom: 385
Blocpdb> 47 atoms in block 9
Block first atom: 429
Blocpdb> 46 atoms in block 10
Block first atom: 476
Blocpdb> 57 atoms in block 11
Block first atom: 522
Blocpdb> 62 atoms in block 12
Block first atom: 579
Blocpdb> 52 atoms in block 13
Block first atom: 641
Blocpdb> 52 atoms in block 14
Block first atom: 693
Blocpdb> 54 atoms in block 15
Block first atom: 745
Blocpdb> 56 atoms in block 16
Block first atom: 799
Blocpdb> 51 atoms in block 17
Block first atom: 855
Blocpdb> 48 atoms in block 18
Block first atom: 906
Blocpdb> 57 atoms in block 19
Block first atom: 954
Blocpdb> 49 atoms in block 20
Block first atom: 1011
Blocpdb> 55 atoms in block 21
Block first atom: 1060
Blocpdb> 52 atoms in block 22
Block first atom: 1115
Blocpdb> 56 atoms in block 23
Block first atom: 1167
Blocpdb> 56 atoms in block 24
Block first atom: 1223
Blocpdb> 58 atoms in block 25
Block first atom: 1279
Blocpdb> 50 atoms in block 26
Block first atom: 1337
Blocpdb> 51 atoms in block 27
Block first atom: 1387
Blocpdb> 42 atoms in block 28
Block first atom: 1438
Blocpdb> 57 atoms in block 29
Block first atom: 1480
Blocpdb> 49 atoms in block 30
Block first atom: 1537
Blocpdb> 48 atoms in block 31
Block first atom: 1586
Blocpdb> 52 atoms in block 32
Block first atom: 1634
Blocpdb> 55 atoms in block 33
Block first atom: 1686
Blocpdb> 59 atoms in block 34
Block first atom: 1741
Blocpdb> 62 atoms in block 35
Block first atom: 1800
Blocpdb> 56 atoms in block 36
Block first atom: 1862
Blocpdb> 56 atoms in block 37
Block first atom: 1918
Blocpdb> 56 atoms in block 38
Block first atom: 1974
Blocpdb> 57 atoms in block 39
Block first atom: 2030
Blocpdb> 57 atoms in block 40
Block first atom: 2087
Blocpdb> 60 atoms in block 41
Block first atom: 2144
Blocpdb> 52 atoms in block 42
Block first atom: 2204
Blocpdb> 50 atoms in block 43
Block first atom: 2256
Blocpdb> 52 atoms in block 44
Block first atom: 2306
Blocpdb> 45 atoms in block 45
Block first atom: 2358
Blocpdb> 52 atoms in block 46
Block first atom: 2403
Blocpdb> 55 atoms in block 47
Block first atom: 2455
Blocpdb> 45 atoms in block 48
Block first atom: 2510
Blocpdb> 50 atoms in block 49
Block first atom: 2555
Blocpdb> 58 atoms in block 50
Block first atom: 2605
Blocpdb> 46 atoms in block 51
Block first atom: 2663
Blocpdb> 57 atoms in block 52
Block first atom: 2709
Blocpdb> 56 atoms in block 53
Block first atom: 2766
Blocpdb> 59 atoms in block 54
Block first atom: 2822
Blocpdb> 61 atoms in block 55
Block first atom: 2881
Blocpdb> 58 atoms in block 56
Block first atom: 2942
Blocpdb> 57 atoms in block 57
Block first atom: 3000
Blocpdb> 53 atoms in block 58
Block first atom: 3057
Blocpdb> 60 atoms in block 59
Block first atom: 3110
Blocpdb> 56 atoms in block 60
Block first atom: 3170
Blocpdb> 56 atoms in block 61
Block first atom: 3226
Blocpdb> 53 atoms in block 62
Block first atom: 3282
Blocpdb> 52 atoms in block 63
Block first atom: 3335
Blocpdb> 44 atoms in block 64
Block first atom: 3387
Blocpdb> 60 atoms in block 65
Block first atom: 3431
Blocpdb> 45 atoms in block 66
Block first atom: 3491
Blocpdb> 54 atoms in block 67
Block first atom: 3536
Blocpdb> 57 atoms in block 68
Block first atom: 3590
Blocpdb> 45 atoms in block 69
Block first atom: 3647
Blocpdb> 51 atoms in block 70
Block first atom: 3692
Blocpdb> 46 atoms in block 71
Block first atom: 3743
Blocpdb> 46 atoms in block 72
Block first atom: 3789
Blocpdb> 45 atoms in block 73
Block first atom: 3835
Blocpdb> 52 atoms in block 74
Block first atom: 3880
Blocpdb> 70 atoms in block 75
Block first atom: 3932
Blocpdb> 60 atoms in block 76
Block first atom: 4002
Blocpdb> 48 atoms in block 77
Block first atom: 4062
Blocpdb> 52 atoms in block 78
Block first atom: 4110
Blocpdb> 59 atoms in block 79
Block first atom: 4162
Blocpdb> 62 atoms in block 80
Block first atom: 4221
Blocpdb> 61 atoms in block 81
Block first atom: 4283
Blocpdb> 63 atoms in block 82
Block first atom: 4344
Blocpdb> 54 atoms in block 83
Block first atom: 4407
Blocpdb> 54 atoms in block 84
Block first atom: 4461
Blocpdb> 54 atoms in block 85
Block first atom: 4515
Blocpdb> 56 atoms in block 86
Block first atom: 4569
Blocpdb> 18 atoms in block 87
Block first atom: 4625
Blocpdb> 45 atoms in block 88
Block first atom: 4643
Blocpdb> 52 atoms in block 89
Block first atom: 4688
Blocpdb> 48 atoms in block 90
Block first atom: 4740
Blocpdb> 58 atoms in block 91
Block first atom: 4788
Blocpdb> 42 atoms in block 92
Block first atom: 4846
Blocpdb> 38 atoms in block 93
Block first atom: 4888
Blocpdb> 33 atoms in block 94
Block first atom: 4926
Blocpdb> 45 atoms in block 95
Block first atom: 4959
Blocpdb> 54 atoms in block 96
Block first atom: 5004
Blocpdb> 48 atoms in block 97
Block first atom: 5058
Blocpdb> 51 atoms in block 98
Block first atom: 5106
Blocpdb> 58 atoms in block 99
Block first atom: 5157
Blocpdb> 49 atoms in block 100
Block first atom: 5215
Blocpdb> 51 atoms in block 101
Block first atom: 5264
Blocpdb> 53 atoms in block 102
Block first atom: 5315
Blocpdb> 57 atoms in block 103
Block first atom: 5368
Blocpdb> 52 atoms in block 104
Block first atom: 5425
Blocpdb> 47 atoms in block 105
Block first atom: 5477
Blocpdb> 60 atoms in block 106
Block first atom: 5524
Blocpdb> 49 atoms in block 107
Block first atom: 5584
Blocpdb> 57 atoms in block 108
Block first atom: 5633
Blocpdb> 48 atoms in block 109
Block first atom: 5690
Blocpdb> 44 atoms in block 110
Block first atom: 5738
Blocpdb> 47 atoms in block 111
Block first atom: 5782
Blocpdb> 52 atoms in block 112
Block first atom: 5829
Blocpdb> 52 atoms in block 113
Block first atom: 5881
Blocpdb> 55 atoms in block 114
Block first atom: 5933
Blocpdb> 61 atoms in block 115
Block first atom: 5988
Blocpdb> 55 atoms in block 116
Block first atom: 6049
Blocpdb> 61 atoms in block 117
Block first atom: 6104
Blocpdb> 52 atoms in block 118
Block first atom: 6165
Blocpdb> 56 atoms in block 119
Block first atom: 6217
Blocpdb> 50 atoms in block 120
Block first atom: 6273
Blocpdb> 44 atoms in block 121
Block first atom: 6323
Blocpdb> 54 atoms in block 122
Block first atom: 6367
Blocpdb> 55 atoms in block 123
Block first atom: 6421
Blocpdb> 47 atoms in block 124
Block first atom: 6476
Blocpdb> 52 atoms in block 125
Block first atom: 6523
Blocpdb> 56 atoms in block 126
Block first atom: 6575
Blocpdb> 65 atoms in block 127
Block first atom: 6631
Blocpdb> 65 atoms in block 128
Block first atom: 6696
Blocpdb> 48 atoms in block 129
Block first atom: 6761
Blocpdb> 58 atoms in block 130
Block first atom: 6809
Blocpdb> 61 atoms in block 131
Block first atom: 6867
Blocpdb> 49 atoms in block 132
Block first atom: 6928
Blocpdb> 67 atoms in block 133
Block first atom: 6977
Blocpdb> 58 atoms in block 134
Block first atom: 7044
Blocpdb> 46 atoms in block 135
Block first atom: 7102
Blocpdb> 55 atoms in block 136
Block first atom: 7148
Blocpdb> 53 atoms in block 137
Block first atom: 7203
Blocpdb> 49 atoms in block 138
Block first atom: 7256
Blocpdb> 51 atoms in block 139
Block first atom: 7305
Blocpdb> 51 atoms in block 140
Block first atom: 7356
Blocpdb> 47 atoms in block 141
Block first atom: 7407
Blocpdb> 43 atoms in block 142
Block first atom: 7454
Blocpdb> 59 atoms in block 143
Block first atom: 7497
Blocpdb> 48 atoms in block 144
Block first atom: 7556
Blocpdb> 58 atoms in block 145
Block first atom: 7604
Blocpdb> 53 atoms in block 146
Block first atom: 7662
Blocpdb> 58 atoms in block 147
Block first atom: 7715
Blocpdb> 62 atoms in block 148
Block first atom: 7773
Blocpdb> 54 atoms in block 149
Block first atom: 7835
Blocpdb> 58 atoms in block 150
Block first atom: 7889
Blocpdb> 56 atoms in block 151
Block first atom: 7947
Blocpdb> 60 atoms in block 152
Block first atom: 8003
Blocpdb> 54 atoms in block 153
Block first atom: 8063
Blocpdb> 51 atoms in block 154
Block first atom: 8117
Blocpdb> 50 atoms in block 155
Block first atom: 8168
Blocpdb> 54 atoms in block 156
Block first atom: 8218
Blocpdb> 55 atoms in block 157
Block first atom: 8272
Blocpdb> 56 atoms in block 158
Block first atom: 8327
Blocpdb> 51 atoms in block 159
Block first atom: 8383
Blocpdb> 64 atoms in block 160
Block first atom: 8434
Blocpdb> 50 atoms in block 161
Block first atom: 8498
Blocpdb> 46 atoms in block 162
Block first atom: 8548
Blocpdb> 48 atoms in block 163
Block first atom: 8594
Blocpdb> 40 atoms in block 164
Block first atom: 8642
Blocpdb> 43 atoms in block 165
Block first atom: 8682
Blocpdb> 52 atoms in block 166
Block first atom: 8725
Blocpdb> 75 atoms in block 167
Block first atom: 8777
Blocpdb> 54 atoms in block 168
Block first atom: 8852
Blocpdb> 55 atoms in block 169
Block first atom: 8906
Blocpdb> 59 atoms in block 170
Block first atom: 8961
Blocpdb> 60 atoms in block 171
Block first atom: 9020
Blocpdb> 56 atoms in block 172
Block first atom: 9080
Blocpdb> 55 atoms in block 173
Block first atom: 9136
Blocpdb> 60 atoms in block 174
Block first atom: 9191
Blocpdb> 53 atoms in block 175
Block first atom: 9251
Blocpdb> 58 atoms in block 176
Block first atom: 9304
Blocpdb> 52 atoms in block 177
Block first atom: 9362
Blocpdb> 49 atoms in block 178
Block first atom: 9414
Blocpdb> 52 atoms in block 179
Block first atom: 9463
Blocpdb> 21 atoms in block 180
Block first atom: 9514
Blocpdb> 180 blocks.
Blocpdb> At most, 75 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 18 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3572390 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 28605
Prepmat> Matrix trace = 7812500.0000
Prepmat> Last element read: 28605 28605 119.1882
Prepmat> 16291 lines saved.
Prepmat> 14792 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9535
RTB> Total mass = 9535.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 9535
RTB> Number of blocks = 180
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 187053.8570
RTB> 51228 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1080
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51228
Diagstd> Projected matrix trace = 187053.8570
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1080 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 187053.8570
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.3916350 0.6298593 0.8637799 1.1906444
1.2398863 1.5611038 1.6075760 2.2045121 2.5038700
2.7709226 2.8212177 3.3588415 3.5622892 4.0067009
4.2111662 4.4979844 4.7974569 5.0949678 5.4014720
5.9853042 6.1385288 6.4565596 6.5650426 6.9529320
7.0693982 7.7381797 8.2634360 8.4332953 9.2191379
9.4692516 10.0991941 10.6069444 10.6973609 11.4413646
11.7526053 12.6327092 12.9397924 13.1013414 13.7006927
14.2739028 14.5021481 14.8361904 14.9423778 15.7508826
15.8816053 16.6978018 17.0861342 17.3424027 17.8471741
18.0773807 18.4657511 19.0778450 19.5541282 19.9354115
20.5004239 20.6777888 20.9191412 21.1792497 21.1959012
21.4285522 21.9488533 22.4425537 22.9329189 23.1437469
23.2491887 23.8449264 24.0085864 24.2459293 24.5389215
25.4039418 25.6217845 25.8114717 26.2396553 26.4942147
27.2584062 27.7950509 28.4268601 29.0166939 29.1772787
29.7855775 29.9697957 30.2482632 30.4647407 31.2372941
31.3918117 31.7905263 32.2006325 32.5092354 32.6432816
33.1356983 33.6268035 33.6847889 34.2107567 34.4084478
35.0374240 35.1916877 35.3742832 35.6494230 36.0843703
36.3498426
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034329 0.0034332 0.0034338 0.0034349
0.0034359 67.9572843 86.1820951 100.9245531 118.4912618
120.9166794 135.6785429 137.6832268 161.2321046 171.8308621
180.7621405 182.3952732 199.0169348 204.9556356 217.3645640
222.8417040 230.3054695 237.8487208 245.1128051 252.3779140
265.6674778 269.0465515 275.9280573 278.2364698 286.3381880
288.7264038 302.0749321 312.1588230 315.3507987 329.7163135
334.1589584 345.0949789 353.6636512 355.1678163 367.3112180
372.2736996 385.9610948 390.6240110 393.0548528 401.9449191
410.2670582 413.5342159 418.2697712 419.7639490 430.9706824
432.7553832 443.7362726 448.8664922 452.2201538 458.7541546
461.7033566 466.6365673 474.3074414 480.1915451 484.8505391
491.6733860 493.7957274 496.6691736 499.7474261 499.9438427
502.6801024 508.7462227 514.4360754 520.0258689 522.4107629
523.5994492 530.2653790 532.0820093 534.7055573 537.9265951
547.3256920 549.6673831 551.6983228 556.2555323 558.9472273
566.9509793 572.5046480 578.9748866 584.9506724 586.5670620
592.6500053 594.4798947 597.2353452 599.3686495 606.9207464
608.4199847 612.2716334 616.2082116 619.1539644 620.4291382
625.0911406 629.7063510 630.2490439 635.1504651 636.9829696
642.7785341 644.1920013 645.8610651 648.3679409 652.3112160
654.7063413
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9535
Rtb_to_modes> Number of blocs = 180
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3916
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6299
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8638
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.191
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.240
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.608
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.504
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.771
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.821
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.359
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.562
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.007
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.211
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.498
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.797
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.095
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.401
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.985
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.139
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.457
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.565
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.953
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.069
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.738
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.263
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.433
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.219
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.469
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.35
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 0.99998 0.99995 1.00001 1.00000
0.99996 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 1.00004
1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003
1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 171630 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 0.99998 0.99995 1.00001 1.00000
0.99996 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 1.00004
1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003
1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603291542303036220.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603291542303036220.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603291542303036220.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603291542303036220.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1252
First residue number = 1
Last residue number = 647
Number of atoms found = 9535
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3916
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6299
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8638
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.191
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.240
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.608
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.504
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.771
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.821
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.359
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.562
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.007
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.211
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.498
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.797
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.095
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.401
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.985
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.139
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.457
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.565
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.953
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.069
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.738
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.263
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.433
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.219
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.469
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.35
Bfactors> 106 vectors, 28605 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.391600
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.252 for 1252 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.027 +/- 0.07
Bfactors> = 68.064 +/- 17.33
Bfactors> Shiftng-fct= 68.038
Bfactors> Scaling-fct= 263.522
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603291542303036220.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603291542303036220.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.7
Chkmod> 106 vectors, 28605 coordinates in file.
Chkmod> That is: 9535 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9040
0.0034 0.8025
0.0034 0.9224
0.0034 0.7509
0.0034 0.9647
0.0034 0.7302
67.9513 0.3059
86.1812 0.4588
100.9214 0.1231
118.5039 0.0570
120.9170 0.5800
135.6682 0.4611
137.6955 0.0844
161.2430 0.3282
171.8279 0.4350
180.7569 0.4972
182.3804 0.3131
199.0131 0.2955
204.9385 0.1430
217.3633 0.6677
222.8277 0.1498
230.2960 0.4655
237.8272 0.3835
245.1031 0.4438
252.3561 0.2133
265.6493 0.3532
269.0453 0.2457
275.9256 0.4131
278.2236 0.4311
286.3273 0.2928
288.7059 0.5266
302.0585 0.3725
312.1372 0.0835
315.3317 0.1538
329.6997 0.4352
334.1402 0.3879
345.0939 0.4121
353.6994 0.4134
355.1964 0.3419
367.2735 0.4386
372.2165 0.3761
385.9031 0.3973
390.6104 0.3318
393.0179 0.4143
401.9175 0.3957
410.1934 0.6015
413.4858 0.3374
418.3055 0.3687
419.7125 0.4383
430.9401 0.0040
432.7149 0.4883
443.7464 0.4939
448.8980 0.2268
452.1694 0.3093
458.7708 0.4703
461.7170 0.3681
466.6702 0.4836
474.3139 0.4001
480.1202 0.3230
484.8855 0.3040
491.6472 0.3273
493.8009 0.3388
496.6580 0.2897
499.7348 0.2382
499.9707 0.3603
502.6755 0.2281
508.7377 0.2902
514.3847 0.1949
519.9705 0.2829
522.3460 0.3495
523.5861 0.3701
530.1878 0.2803
532.0748 0.2342
534.7275 0.3676
537.9153 0.4327
547.2597 0.4289
549.6246 0.4060
551.6589 0.4865
556.2353 0.3837
558.8788 0.4495
566.9432 0.3149
572.5310 0.4154
578.9820 0.3425
584.9589 0.4391
586.5692 0.4481
592.6686 0.4171
594.4564 0.3720
597.2269 0.3684
599.2963 0.5322
606.9210 0.5600
608.3763 0.5255
612.2403 0.5017
616.1757 0.5011
619.1347 0.5347
620.3713 0.5156
625.1049 0.4147
629.7092 0.4112
630.1772 0.1712
635.1162 0.4212
636.9700 0.3738
642.7746 0.4474
644.1489 0.4926
645.7942 0.4810
648.3454 0.2364
652.2437 0.2826
654.6797 0.4824
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603291542303036220 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
making animated gifs
11 models are in 2603291542303036220.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603291542303036220 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
making animated gifs
11 models are in 2603291542303036220.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603291542303036220 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
making animated gifs
11 models are in 2603291542303036220.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603291542303036220 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
making animated gifs
11 models are in 2603291542303036220.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603291542303036220 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603291542303036220.eigenfacs
2603291542303036220.atom
making animated gifs
11 models are in 2603291542303036220.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603291542303036220.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603291542303036220.10.pdb
2603291542303036220.11.pdb
2603291542303036220.7.pdb
2603291542303036220.8.pdb
2603291542303036220.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m53.006s
user 0m52.698s
sys 0m0.289s
rm: cannot remove '2603291542303036220.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|