CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2604010735013451688

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604010735013451688.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604010735013451688.atom to be opened. Openam> File opened: 2604010735013451688.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1197 First residue number = 1 Last residue number = 647 Number of atoms found = 9180 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.506750 +/- 20.185674 From: -46.166000 To: 53.962000 = 1.606128 +/- 22.500216 From: -44.199000 To: 52.670000 = 27.014618 +/- 19.245073 From: -27.568000 To: 67.977000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9071 % Filled. Pdbmat> 3440055 non-zero elements. Pdbmat> 376175 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.96 +/- 21.97 Maximum number = 127 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 7.523500E+06 Pdbmat> Larger element = 502.726 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1197 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604010735013451688.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604010735013451688.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604010735013451688.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9180 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1197 residues. Blocpdb> 43 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 42 atoms in block 2 Block first atom: 44 Blocpdb> 38 atoms in block 3 Block first atom: 86 Blocpdb> 53 atoms in block 4 Block first atom: 124 Blocpdb> 46 atoms in block 5 Block first atom: 177 Blocpdb> 44 atoms in block 6 Block first atom: 223 Blocpdb> 50 atoms in block 7 Block first atom: 267 Blocpdb> 56 atoms in block 8 Block first atom: 317 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 373 Blocpdb> 42 atoms in block 10 Block first atom: 416 Blocpdb> 35 atoms in block 11 Block first atom: 458 Blocpdb> 46 atoms in block 12 Block first atom: 493 Blocpdb> 51 atoms in block 13 Block first atom: 539 Blocpdb> 51 atoms in block 14 Block first atom: 590 Blocpdb> 45 atoms in block 15 Block first atom: 641 Blocpdb> 46 atoms in block 16 Block first atom: 686 Blocpdb> 48 atoms in block 17 Block first atom: 732 Blocpdb> 43 atoms in block 18 Block first atom: 780 Blocpdb> 44 atoms in block 19 Block first atom: 823 Blocpdb> 50 atoms in block 20 Block first atom: 867 Blocpdb> 37 atoms in block 21 Block first atom: 917 Blocpdb> 46 atoms in block 22 Block first atom: 954 Blocpdb> 48 atoms in block 23 Block first atom: 1000 Blocpdb> 44 atoms in block 24 Block first atom: 1048 Blocpdb> 43 atoms in block 25 Block first atom: 1092 Blocpdb> 47 atoms in block 26 Block first atom: 1135 Blocpdb> 48 atoms in block 27 Block first atom: 1182 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1230 Blocpdb> 50 atoms in block 29 Block first atom: 1279 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1329 Blocpdb> 47 atoms in block 31 Block first atom: 1371 Blocpdb> 41 atoms in block 32 Block first atom: 1418 Blocpdb> 34 atoms in block 33 Block first atom: 1459 Blocpdb> 49 atoms in block 34 Block first atom: 1493 Blocpdb> 44 atoms in block 35 Block first atom: 1542 Blocpdb> 44 atoms in block 36 Block first atom: 1586 Blocpdb> 42 atoms in block 37 Block first atom: 1630 Blocpdb> 47 atoms in block 38 Block first atom: 1672 Blocpdb> 46 atoms in block 39 Block first atom: 1719 Blocpdb> 50 atoms in block 40 Block first atom: 1765 Blocpdb> 56 atoms in block 41 Block first atom: 1815 Blocpdb> 47 atoms in block 42 Block first atom: 1871 Blocpdb> 50 atoms in block 43 Block first atom: 1918 Blocpdb> 50 atoms in block 44 Block first atom: 1968 Blocpdb> 49 atoms in block 45 Block first atom: 2018 Blocpdb> 44 atoms in block 46 Block first atom: 2067 Blocpdb> 52 atoms in block 47 Block first atom: 2111 Blocpdb> 52 atoms in block 48 Block first atom: 2163 Blocpdb> 41 atoms in block 49 Block first atom: 2215 Blocpdb> 42 atoms in block 50 Block first atom: 2256 Blocpdb> 45 atoms in block 51 Block first atom: 2298 Blocpdb> 44 atoms in block 52 Block first atom: 2343 Blocpdb> 42 atoms in block 53 Block first atom: 2387 Blocpdb> 42 atoms in block 54 Block first atom: 2429 Blocpdb> 47 atoms in block 55 Block first atom: 2471 Blocpdb> 37 atoms in block 56 Block first atom: 2518 Blocpdb> 43 atoms in block 57 Block first atom: 2555 Blocpdb> 48 atoms in block 58 Block first atom: 2598 Blocpdb> 40 atoms in block 59 Block first atom: 2646 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2686 Blocpdb> 50 atoms in block 61 Block first atom: 2734 Blocpdb> 48 atoms in block 62 Block first atom: 2784 Blocpdb> 49 atoms in block 63 Block first atom: 2832 Blocpdb> 56 atoms in block 64 Block first atom: 2881 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 2937 Blocpdb> 48 atoms in block 66 Block first atom: 2984 Blocpdb> 50 atoms in block 67 Block first atom: 3032 Blocpdb> 42 atoms in block 68 Block first atom: 3082 Blocpdb> 57 atoms in block 69 Block first atom: 3124 Blocpdb> 45 atoms in block 70 Block first atom: 3181 Blocpdb> 51 atoms in block 71 Block first atom: 3226 Blocpdb> 42 atoms in block 72 Block first atom: 3277 Blocpdb> 44 atoms in block 73 Block first atom: 3319 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3363 Blocpdb> 36 atoms in block 75 Block first atom: 3409 Blocpdb> 54 atoms in block 76 Block first atom: 3445 Blocpdb> 37 atoms in block 77 Block first atom: 3499 Blocpdb> 45 atoms in block 78 Block first atom: 3536 Blocpdb> 49 atoms in block 79 Block first atom: 3581 Blocpdb> 45 atoms in block 80 Block first atom: 3630 Blocpdb> 38 atoms in block 81 Block first atom: 3675 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 3713 Blocpdb> 38 atoms in block 83 Block first atom: 3757 Blocpdb> 40 atoms in block 84 Block first atom: 3795 Blocpdb> 36 atoms in block 85 Block first atom: 3835 Blocpdb> 42 atoms in block 86 Block first atom: 3871 Blocpdb> 66 atoms in block 87 Block first atom: 3913 Blocpdb> 46 atoms in block 88 Block first atom: 3979 Blocpdb> 46 atoms in block 89 Block first atom: 4025 Blocpdb> 47 atoms in block 90 Block first atom: 4071 Blocpdb> 44 atoms in block 91 Block first atom: 4118 Blocpdb> 53 atoms in block 92 Block first atom: 4162 Blocpdb> 52 atoms in block 93 Block first atom: 4215 Blocpdb> 57 atoms in block 94 Block first atom: 4267 Blocpdb> 51 atoms in block 95 Block first atom: 4324 Blocpdb> 45 atoms in block 96 Block first atom: 4375 Blocpdb> 49 atoms in block 97 Block first atom: 4420 Blocpdb> 46 atoms in block 98 Block first atom: 4469 Blocpdb> 46 atoms in block 99 Block first atom: 4515 Blocpdb> 48 atoms in block 100 Block first atom: 4561 Blocpdb> 34 atoms in block 101 Block first atom: 4609 Blocpdb> 41 atoms in block 102 Block first atom: 4643 Blocpdb> 44 atoms in block 103 Block first atom: 4684 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 4728 Blocpdb> 34 atoms in block 105 Block first atom: 4778 Blocpdb> 54 atoms in block 106 Block first atom: 4812 Blocpdb> 43 atoms in block 107 Block first atom: 4866 Blocpdb> 42 atoms in block 108 Block first atom: 4909 Blocpdb> 48 atoms in block 109 Block first atom: 4951 Blocpdb> 53 atoms in block 110 Block first atom: 4999 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 5052 Blocpdb> 41 atoms in block 112 Block first atom: 5094 Blocpdb> 40 atoms in block 113 Block first atom: 5135 Blocpdb> 54 atoms in block 114 Block first atom: 5175 Blocpdb> 41 atoms in block 115 Block first atom: 5229 Blocpdb> 45 atoms in block 116 Block first atom: 5270 Blocpdb> 46 atoms in block 117 Block first atom: 5315 Blocpdb> 38 atoms in block 118 Block first atom: 5361 Blocpdb> 42 atoms in block 119 Block first atom: 5399 Blocpdb> 41 atoms in block 120 Block first atom: 5441 Blocpdb> 44 atoms in block 121 Block first atom: 5482 Blocpdb> 47 atoms in block 122 Block first atom: 5526 Blocpdb> 46 atoms in block 123 Block first atom: 5573 Blocpdb> 45 atoms in block 124 Block first atom: 5619 Blocpdb> 57 atoms in block 125 Block first atom: 5664 Blocpdb> 46 atoms in block 126 Block first atom: 5721 Blocpdb> 54 atoms in block 127 Block first atom: 5767 Blocpdb> 41 atoms in block 128 Block first atom: 5821 Blocpdb> 45 atoms in block 129 Block first atom: 5862 Blocpdb> 47 atoms in block 130 Block first atom: 5907 Blocpdb> 36 atoms in block 131 Block first atom: 5954 Blocpdb> 48 atoms in block 132 Block first atom: 5990 Blocpdb> 42 atoms in block 133 Block first atom: 6038 Blocpdb> 48 atoms in block 134 Block first atom: 6080 Blocpdb> 40 atoms in block 135 Block first atom: 6128 Blocpdb> 43 atoms in block 136 Block first atom: 6168 Blocpdb> 54 atoms in block 137 Block first atom: 6211 Blocpdb> 49 atoms in block 138 Block first atom: 6265 Blocpdb> 57 atoms in block 139 Block first atom: 6314 Blocpdb> 48 atoms in block 140 Block first atom: 6371 Blocpdb> 46 atoms in block 141 Block first atom: 6419 Blocpdb> 47 atoms in block 142 Block first atom: 6465 Blocpdb> 54 atoms in block 143 Block first atom: 6512 Blocpdb> 42 atoms in block 144 Block first atom: 6566 Blocpdb> 50 atoms in block 145 Block first atom: 6608 Blocpdb> 57 atoms in block 146 Block first atom: 6658 Blocpdb> 46 atoms in block 147 Block first atom: 6715 Blocpdb> 43 atoms in block 148 Block first atom: 6761 Blocpdb> 44 atoms in block 149 Block first atom: 6804 Blocpdb> 45 atoms in block 150 Block first atom: 6848 Blocpdb> 40 atoms in block 151 Block first atom: 6893 Blocpdb> 44 atoms in block 152 Block first atom: 6933 Blocpdb> 49 atoms in block 153 Block first atom: 6977 Blocpdb> 39 atoms in block 154 Block first atom: 7026 Blocpdb> 41 atoms in block 155 Block first atom: 7065 Blocpdb> 36 atoms in block 156 Block first atom: 7106 Blocpdb> 52 atoms in block 157 Block first atom: 7142 Blocpdb> 44 atoms in block 158 Block first atom: 7194 Blocpdb> 50 atoms in block 159 Block first atom: 7238 Blocpdb> 42 atoms in block 160 Block first atom: 7288 Blocpdb> 47 atoms in block 161 Block first atom: 7330 Blocpdb> 52 atoms in block 162 Block first atom: 7377 Blocpdb> 51 atoms in block 163 Block first atom: 7429 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7480 Blocpdb> 50 atoms in block 165 Block first atom: 7525 Blocpdb> 49 atoms in block 166 Block first atom: 7575 Blocpdb> 50 atoms in block 167 Block first atom: 7624 Blocpdb> 50 atoms in block 168 Block first atom: 7674 Blocpdb> 49 atoms in block 169 Block first atom: 7724 Blocpdb> 40 atoms in block 170 Block first atom: 7773 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 7813 Blocpdb> 48 atoms in block 172 Block first atom: 7855 Blocpdb> 36 atoms in block 173 Block first atom: 7903 Blocpdb> 58 atoms in block 174 Block first atom: 7939 Blocpdb> 45 atoms in block 175 Block first atom: 7997 Blocpdb> 45 atoms in block 176 Block first atom: 8042 Blocpdb> 56 atoms in block 177 Block first atom: 8087 Blocpdb> 42 atoms in block 178 Block first atom: 8143 Blocpdb> 39 atoms in block 179 Block first atom: 8185 Blocpdb> 42 atoms in block 180 Block first atom: 8224 Blocpdb> 37 atoms in block 181 Block first atom: 8266 Blocpdb> 37 atoms in block 182 Block first atom: 8303 Blocpdb> 37 atoms in block 183 Block first atom: 8340 Blocpdb> 45 atoms in block 184 Block first atom: 8377 Blocpdb> 64 atoms in block 185 Block first atom: 8422 Blocpdb> 48 atoms in block 186 Block first atom: 8486 Blocpdb> 48 atoms in block 187 Block first atom: 8534 Blocpdb> 50 atoms in block 188 Block first atom: 8582 Blocpdb> 46 atoms in block 189 Block first atom: 8632 Blocpdb> 53 atoms in block 190 Block first atom: 8678 Blocpdb> 50 atoms in block 191 Block first atom: 8731 Blocpdb> 49 atoms in block 192 Block first atom: 8781 Blocpdb> 52 atoms in block 193 Block first atom: 8830 Blocpdb> 43 atoms in block 194 Block first atom: 8882 Blocpdb> 49 atoms in block 195 Block first atom: 8925 Blocpdb> 55 atoms in block 196 Block first atom: 8974 Blocpdb> 37 atoms in block 197 Block first atom: 9029 Blocpdb> 42 atoms in block 198 Block first atom: 9066 Blocpdb> 44 atoms in block 199 Block first atom: 9108 Blocpdb> 29 atoms in block 200 Block first atom: 9151 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 66 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 29 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3440255 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27540 Prepmat> Matrix trace = 7523500.0000 Prepmat> Last element read: 27540 27540 119.1882 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18389 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9180 RTB> Total mass = 9180.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9180 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 217377.0938 RTB> 58596 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58596 Diagstd> Projected matrix trace = 217377.0938 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 217377.0938 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2838914 0.4984695 0.7755533 0.9458746 1.1056887 1.2216138 1.4002557 1.8735742 1.9271478 2.4669906 2.6028393 3.0915558 3.3990283 3.6326441 3.9232180 3.9853783 4.0754404 4.5094534 4.9364032 5.3402872 5.5236173 5.6056694 5.8485759 6.1386440 6.5031708 6.8074678 7.2745498 7.8081693 7.8630404 8.1090031 9.0009555 9.3100112 9.8259373 10.1004134 10.4885074 10.9650172 11.1895766 11.7955163 12.4290765 12.8319850 13.2702601 13.6660638 14.1471395 14.3610993 15.4147070 15.6055872 15.8679179 15.9960268 16.4543616 16.9751233 17.1659261 17.9299734 18.4272383 18.6765543 18.7213563 19.1058924 19.3682875 19.9766050 20.2247703 20.3142374 20.7413937 21.7937799 22.5014316 22.5360149 22.5984339 22.9445640 23.1503757 23.5621840 24.4396838 24.5455251 24.7768650 25.5280095 26.0800848 26.5081082 27.0670057 27.3548935 27.6189165 28.1832682 28.9453737 29.0965718 29.4845274 29.6108704 30.0053469 30.2760319 30.5884387 31.1637609 31.4098485 31.5696586 31.8489822 32.4995036 32.6263502 33.0249688 33.4380149 33.8793362 33.9988085 34.2410256 34.5927559 34.9508371 35.2391632 35.6642629 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034304 0.0034326 0.0034336 0.0034344 0.0034344 0.0034350 57.8590613 76.6680766 95.6315283 105.6117089 114.1856987 120.0223819 128.4987654 148.6383006 150.7484270 170.5607234 175.1938902 190.9342448 200.2039627 206.9696692 215.0881575 216.7854128 219.2212003 230.5989010 241.2684834 250.9444458 255.2155134 257.1041104 262.6154942 269.0490765 276.9222557 283.3270744 292.8858176 303.4379477 304.5022694 309.2281447 325.7913788 331.3373399 340.3942956 345.1158103 351.6836062 359.5836515 363.2470591 372.9527027 382.8377109 388.9933723 395.5806123 401.4366342 408.4412520 411.5182714 426.3467108 428.9783142 432.5688601 434.3115127 440.4897414 447.4059438 449.9133703 459.8170839 466.1496966 469.2925479 469.8550884 474.6559660 477.9042486 485.3512152 488.3566205 489.4355850 494.5546023 506.9458367 515.1104435 515.5061380 516.2195542 520.1578830 522.4855721 527.1121808 536.8377796 537.9989699 540.5283254 548.6605777 554.5615816 559.0937629 564.9569919 567.9535187 570.6878138 576.4889100 584.2313543 585.7552530 589.6473699 590.9093572 594.8323865 597.5094212 600.5842450 606.2059747 608.5947493 610.1410189 612.8342929 619.0612843 620.2682157 624.0458343 627.9362043 632.0664324 633.1799136 635.4313859 638.6866839 641.9838033 644.6263791 648.5028763 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9180 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9790E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2839 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7756 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.106 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.400 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.874 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.927 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.467 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.603 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.092 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.399 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.633 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.075 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.509 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.936 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.340 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.606 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.503 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.807 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.275 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.808 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.109 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.310 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.826 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.66 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995 1.00003 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 165240 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995 1.00003 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604010735013451688.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604010735013451688.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604010735013451688.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604010735013451688.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1197 First residue number = 1 Last residue number = 647 Number of atoms found = 9180 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9790E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2839 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7756 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.106 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.400 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.874 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.927 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.467 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.603 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.092 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.399 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.633 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.075 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.509 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.936 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.340 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.606 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.503 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.807 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.275 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.808 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.109 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.310 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.826 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66 Bfactors> 106 vectors, 27540 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.283900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.360 for 1197 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.06 Bfactors> = 69.723 +/- 15.81 Bfactors> Shiftng-fct= 69.691 Bfactors> Scaling-fct= 244.527 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604010735013451688.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604010735013451688.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.4 Chkmod> 106 vectors, 27540 coordinates in file. Chkmod> That is: 9180 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7396 0.0034 0.7082 0.0034 0.9762 0.0034 0.9810 0.0034 0.6892 0.0034 0.8151 57.8575 0.3673 76.6671 0.5064 95.6303 0.1071 105.6086 0.2558 114.1969 0.2287 120.0362 0.4645 128.4815 0.0755 148.6488 0.4556 150.7362 0.3208 170.5537 0.4867 175.1918 0.5524 190.9398 0.4866 200.1945 0.6097 206.9709 0.6113 215.0729 0.2388 216.7658 0.2979 219.1999 0.1525 230.5774 0.1210 241.2483 0.2526 250.9269 0.1847 255.2134 0.3524 257.1007 0.2026 262.6137 0.5885 269.0453 0.4777 276.9067 0.4154 283.3052 0.3382 292.8823 0.1939 303.4216 0.4552 304.4884 0.1473 309.2148 0.3098 325.7782 0.3347 331.3229 0.1485 340.3808 0.3448 345.0939 0.2820 351.6935 0.4788 359.6499 0.2904 363.2383 0.4101 373.0076 0.3594 382.8355 0.4240 388.9466 0.4098 395.5598 0.4138 401.4772 0.2533 408.4650 0.4869 411.4849 0.2237 426.2633 0.3840 429.0205 0.3673 432.5787 0.4925 434.3468 0.4331 440.4125 0.2531 447.4510 0.3097 449.9474 0.2094 459.7977 0.3513 466.1646 0.0548 469.3157 0.3666 469.8179 0.3814 474.6866 0.2332 477.9049 0.4878 485.3716 0.2583 488.2781 0.0702 489.3635 0.4188 494.5168 0.3591 506.8801 0.2669 515.0719 0.3093 515.5296 0.2350 516.2153 0.2116 520.0838 0.3558 522.4589 0.3006 527.0651 0.3678 536.8182 0.1416 538.0249 0.3218 540.5393 0.3692 548.6584 0.4822 554.5369 0.3925 559.0897 0.4911 564.9640 0.4204 567.8783 0.2413 570.6745 0.3767 576.4307 0.3861 584.2530 0.4250 585.7646 0.4019 589.5768 0.5686 590.8753 0.2988 594.8530 0.4145 597.5229 0.2671 600.5738 0.4545 606.1434 0.2929 608.5701 0.4829 610.1181 0.4658 612.8178 0.3658 619.0394 0.4482 620.2763 0.4128 623.9721 0.2782 627.9279 0.5175 632.0455 0.3389 633.1638 0.3162 635.3946 0.3592 638.6338 0.4572 641.9486 0.4316 644.6064 0.4210 648.4363 0.3720 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735013451688 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom making animated gifs 11 models are in 2604010735013451688.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735013451688 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom making animated gifs 11 models are in 2604010735013451688.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735013451688 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom making animated gifs 11 models are in 2604010735013451688.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735013451688 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom making animated gifs 11 models are in 2604010735013451688.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735013451688 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604010735013451688.eigenfacs 2604010735013451688.atom making animated gifs 11 models are in 2604010735013451688.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010735013451688.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604010735013451688.10.pdb 2604010735013451688.11.pdb 2604010735013451688.7.pdb 2604010735013451688.8.pdb 2604010735013451688.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m59.495s user 0m59.182s sys 0m0.284s rm: cannot remove '2604010735013451688.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.