*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604010735153451758.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604010735153451758.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604010735153451758.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1168
First residue number = 1
Last residue number = 629
Number of atoms found = 8967
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -10.724322 +/- 24.825924 From: -71.326000 To: 55.500000
= 2.696654 +/- 22.277134 From: -56.164000 To: 53.271000
= -10.960160 +/- 13.735826 From: -43.204000 To: 26.783000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.9274 % Filled.
Pdbmat> 3355671 non-zero elements.
Pdbmat> 366931 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.84 +/- 24.87
Maximum number = 165
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 7.338620E+06
Pdbmat> Larger element = 626.308
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1168 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604010735153451758.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604010735153451758.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604010735153451758.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 8967 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1168 residues.
Blocpdb> 43 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 42 atoms in block 2
Block first atom: 44
Blocpdb> 38 atoms in block 3
Block first atom: 86
Blocpdb> 53 atoms in block 4
Block first atom: 124
Blocpdb> 46 atoms in block 5
Block first atom: 177
Blocpdb> 44 atoms in block 6
Block first atom: 223
Blocpdb> 50 atoms in block 7
Block first atom: 267
Blocpdb> 56 atoms in block 8
Block first atom: 317
Blocpdb> 43 atoms in block 9
Block first atom: 373
Blocpdb> 42 atoms in block 10
Block first atom: 416
Blocpdb> 35 atoms in block 11
Block first atom: 458
Blocpdb> 46 atoms in block 12
Block first atom: 493
Blocpdb> 51 atoms in block 13
Block first atom: 539
Blocpdb> 51 atoms in block 14
Block first atom: 590
Blocpdb> 45 atoms in block 15
Block first atom: 641
Blocpdb> 46 atoms in block 16
Block first atom: 686
Blocpdb> 48 atoms in block 17
Block first atom: 732
Blocpdb> 43 atoms in block 18
Block first atom: 780
Blocpdb> 44 atoms in block 19
Block first atom: 823
Blocpdb> 50 atoms in block 20
Block first atom: 867
Blocpdb> 37 atoms in block 21
Block first atom: 917
Blocpdb> 46 atoms in block 22
Block first atom: 954
Blocpdb> 48 atoms in block 23
Block first atom: 1000
Blocpdb> 44 atoms in block 24
Block first atom: 1048
Blocpdb> 43 atoms in block 25
Block first atom: 1092
Blocpdb> 47 atoms in block 26
Block first atom: 1135
Blocpdb> 48 atoms in block 27
Block first atom: 1182
Blocpdb> 49 atoms in block 28
Block first atom: 1230
Blocpdb> 50 atoms in block 29
Block first atom: 1279
Blocpdb> 42 atoms in block 30
Block first atom: 1329
Blocpdb> 47 atoms in block 31
Block first atom: 1371
Blocpdb> 41 atoms in block 32
Block first atom: 1418
Blocpdb> 34 atoms in block 33
Block first atom: 1459
Blocpdb> 49 atoms in block 34
Block first atom: 1493
Blocpdb> 44 atoms in block 35
Block first atom: 1542
Blocpdb> 44 atoms in block 36
Block first atom: 1586
Blocpdb> 42 atoms in block 37
Block first atom: 1630
Blocpdb> 47 atoms in block 38
Block first atom: 1672
Blocpdb> 46 atoms in block 39
Block first atom: 1719
Blocpdb> 50 atoms in block 40
Block first atom: 1765
Blocpdb> 56 atoms in block 41
Block first atom: 1815
Blocpdb> 47 atoms in block 42
Block first atom: 1871
Blocpdb> 50 atoms in block 43
Block first atom: 1918
Blocpdb> 50 atoms in block 44
Block first atom: 1968
Blocpdb> 49 atoms in block 45
Block first atom: 2018
Blocpdb> 44 atoms in block 46
Block first atom: 2067
Blocpdb> 52 atoms in block 47
Block first atom: 2111
Blocpdb> 52 atoms in block 48
Block first atom: 2163
Blocpdb> 41 atoms in block 49
Block first atom: 2215
Blocpdb> 42 atoms in block 50
Block first atom: 2256
Blocpdb> 45 atoms in block 51
Block first atom: 2298
Blocpdb> 44 atoms in block 52
Block first atom: 2343
Blocpdb> 42 atoms in block 53
Block first atom: 2387
Blocpdb> 42 atoms in block 54
Block first atom: 2429
Blocpdb> 47 atoms in block 55
Block first atom: 2471
Blocpdb> 37 atoms in block 56
Block first atom: 2518
Blocpdb> 43 atoms in block 57
Block first atom: 2555
Blocpdb> 48 atoms in block 58
Block first atom: 2598
Blocpdb> 40 atoms in block 59
Block first atom: 2646
Blocpdb> 48 atoms in block 60
Block first atom: 2686
Blocpdb> 50 atoms in block 61
Block first atom: 2734
Blocpdb> 48 atoms in block 62
Block first atom: 2784
Blocpdb> 49 atoms in block 63
Block first atom: 2832
Blocpdb> 51 atoms in block 64
Block first atom: 2881
Blocpdb> 47 atoms in block 65
Block first atom: 2932
Blocpdb> 48 atoms in block 66
Block first atom: 2979
Blocpdb> 50 atoms in block 67
Block first atom: 3027
Blocpdb> 42 atoms in block 68
Block first atom: 3077
Blocpdb> 57 atoms in block 69
Block first atom: 3119
Blocpdb> 45 atoms in block 70
Block first atom: 3176
Blocpdb> 51 atoms in block 71
Block first atom: 3221
Blocpdb> 42 atoms in block 72
Block first atom: 3272
Blocpdb> 44 atoms in block 73
Block first atom: 3314
Blocpdb> 46 atoms in block 74
Block first atom: 3358
Blocpdb> 36 atoms in block 75
Block first atom: 3404
Blocpdb> 54 atoms in block 76
Block first atom: 3440
Blocpdb> 37 atoms in block 77
Block first atom: 3494
Blocpdb> 45 atoms in block 78
Block first atom: 3531
Blocpdb> 49 atoms in block 79
Block first atom: 3576
Blocpdb> 45 atoms in block 80
Block first atom: 3625
Blocpdb> 38 atoms in block 81
Block first atom: 3670
Blocpdb> 44 atoms in block 82
Block first atom: 3708
Blocpdb> 38 atoms in block 83
Block first atom: 3752
Blocpdb> 40 atoms in block 84
Block first atom: 3790
Blocpdb> 36 atoms in block 85
Block first atom: 3830
Blocpdb> 42 atoms in block 86
Block first atom: 3866
Blocpdb> 66 atoms in block 87
Block first atom: 3908
Blocpdb> 46 atoms in block 88
Block first atom: 3974
Blocpdb> 46 atoms in block 89
Block first atom: 4020
Blocpdb> 47 atoms in block 90
Block first atom: 4066
Blocpdb> 44 atoms in block 91
Block first atom: 4113
Blocpdb> 53 atoms in block 92
Block first atom: 4157
Blocpdb> 52 atoms in block 93
Block first atom: 4210
Blocpdb> 57 atoms in block 94
Block first atom: 4262
Blocpdb> 51 atoms in block 95
Block first atom: 4319
Blocpdb> 45 atoms in block 96
Block first atom: 4370
Blocpdb> 49 atoms in block 97
Block first atom: 4415
Blocpdb> 46 atoms in block 98
Block first atom: 4464
Blocpdb> 46 atoms in block 99
Block first atom: 4510
Blocpdb> 41 atoms in block 100
Block first atom: 4556
Blocpdb> 44 atoms in block 101
Block first atom: 4597
Blocpdb> 50 atoms in block 102
Block first atom: 4641
Blocpdb> 34 atoms in block 103
Block first atom: 4691
Blocpdb> 54 atoms in block 104
Block first atom: 4725
Blocpdb> 43 atoms in block 105
Block first atom: 4779
Blocpdb> 42 atoms in block 106
Block first atom: 4822
Blocpdb> 48 atoms in block 107
Block first atom: 4864
Blocpdb> 53 atoms in block 108
Block first atom: 4912
Blocpdb> 42 atoms in block 109
Block first atom: 4965
Blocpdb> 41 atoms in block 110
Block first atom: 5007
Blocpdb> 40 atoms in block 111
Block first atom: 5048
Blocpdb> 54 atoms in block 112
Block first atom: 5088
Blocpdb> 41 atoms in block 113
Block first atom: 5142
Blocpdb> 45 atoms in block 114
Block first atom: 5183
Blocpdb> 46 atoms in block 115
Block first atom: 5228
Blocpdb> 38 atoms in block 116
Block first atom: 5274
Blocpdb> 42 atoms in block 117
Block first atom: 5312
Blocpdb> 41 atoms in block 118
Block first atom: 5354
Blocpdb> 44 atoms in block 119
Block first atom: 5395
Blocpdb> 47 atoms in block 120
Block first atom: 5439
Blocpdb> 46 atoms in block 121
Block first atom: 5486
Blocpdb> 45 atoms in block 122
Block first atom: 5532
Blocpdb> 57 atoms in block 123
Block first atom: 5577
Blocpdb> 46 atoms in block 124
Block first atom: 5634
Blocpdb> 54 atoms in block 125
Block first atom: 5680
Blocpdb> 41 atoms in block 126
Block first atom: 5734
Blocpdb> 45 atoms in block 127
Block first atom: 5775
Blocpdb> 47 atoms in block 128
Block first atom: 5820
Blocpdb> 36 atoms in block 129
Block first atom: 5867
Blocpdb> 48 atoms in block 130
Block first atom: 5903
Blocpdb> 42 atoms in block 131
Block first atom: 5951
Blocpdb> 48 atoms in block 132
Block first atom: 5993
Blocpdb> 40 atoms in block 133
Block first atom: 6041
Blocpdb> 43 atoms in block 134
Block first atom: 6081
Blocpdb> 54 atoms in block 135
Block first atom: 6124
Blocpdb> 49 atoms in block 136
Block first atom: 6178
Blocpdb> 57 atoms in block 137
Block first atom: 6227
Blocpdb> 48 atoms in block 138
Block first atom: 6284
Blocpdb> 46 atoms in block 139
Block first atom: 6332
Blocpdb> 47 atoms in block 140
Block first atom: 6378
Blocpdb> 54 atoms in block 141
Block first atom: 6425
Blocpdb> 42 atoms in block 142
Block first atom: 6479
Blocpdb> 50 atoms in block 143
Block first atom: 6521
Blocpdb> 57 atoms in block 144
Block first atom: 6571
Blocpdb> 46 atoms in block 145
Block first atom: 6628
Blocpdb> 43 atoms in block 146
Block first atom: 6674
Blocpdb> 44 atoms in block 147
Block first atom: 6717
Blocpdb> 45 atoms in block 148
Block first atom: 6761
Blocpdb> 40 atoms in block 149
Block first atom: 6806
Blocpdb> 44 atoms in block 150
Block first atom: 6846
Blocpdb> 49 atoms in block 151
Block first atom: 6890
Blocpdb> 39 atoms in block 152
Block first atom: 6939
Blocpdb> 41 atoms in block 153
Block first atom: 6978
Blocpdb> 36 atoms in block 154
Block first atom: 7019
Blocpdb> 52 atoms in block 155
Block first atom: 7055
Blocpdb> 44 atoms in block 156
Block first atom: 7107
Blocpdb> 50 atoms in block 157
Block first atom: 7151
Blocpdb> 42 atoms in block 158
Block first atom: 7201
Blocpdb> 47 atoms in block 159
Block first atom: 7243
Blocpdb> 52 atoms in block 160
Block first atom: 7290
Blocpdb> 51 atoms in block 161
Block first atom: 7342
Blocpdb> 45 atoms in block 162
Block first atom: 7393
Blocpdb> 50 atoms in block 163
Block first atom: 7438
Blocpdb> 49 atoms in block 164
Block first atom: 7488
Blocpdb> 50 atoms in block 165
Block first atom: 7537
Blocpdb> 50 atoms in block 166
Block first atom: 7587
Blocpdb> 49 atoms in block 167
Block first atom: 7637
Blocpdb> 40 atoms in block 168
Block first atom: 7686
Blocpdb> 42 atoms in block 169
Block first atom: 7726
Blocpdb> 48 atoms in block 170
Block first atom: 7768
Blocpdb> 36 atoms in block 171
Block first atom: 7816
Blocpdb> 58 atoms in block 172
Block first atom: 7852
Blocpdb> 45 atoms in block 173
Block first atom: 7910
Blocpdb> 45 atoms in block 174
Block first atom: 7955
Blocpdb> 56 atoms in block 175
Block first atom: 8000
Blocpdb> 42 atoms in block 176
Block first atom: 8056
Blocpdb> 39 atoms in block 177
Block first atom: 8098
Blocpdb> 42 atoms in block 178
Block first atom: 8137
Blocpdb> 37 atoms in block 179
Block first atom: 8179
Blocpdb> 37 atoms in block 180
Block first atom: 8216
Blocpdb> 37 atoms in block 181
Block first atom: 8253
Blocpdb> 45 atoms in block 182
Block first atom: 8290
Blocpdb> 64 atoms in block 183
Block first atom: 8335
Blocpdb> 48 atoms in block 184
Block first atom: 8399
Blocpdb> 48 atoms in block 185
Block first atom: 8447
Blocpdb> 50 atoms in block 186
Block first atom: 8495
Blocpdb> 46 atoms in block 187
Block first atom: 8545
Blocpdb> 53 atoms in block 188
Block first atom: 8591
Blocpdb> 50 atoms in block 189
Block first atom: 8644
Blocpdb> 49 atoms in block 190
Block first atom: 8694
Blocpdb> 52 atoms in block 191
Block first atom: 8743
Blocpdb> 43 atoms in block 192
Block first atom: 8795
Blocpdb> 49 atoms in block 193
Block first atom: 8838
Blocpdb> 55 atoms in block 194
Block first atom: 8887
Blocpdb> 26 atoms in block 195
Block first atom: 8941
Blocpdb> 195 blocks.
Blocpdb> At most, 66 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3355866 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 26901
Prepmat> Matrix trace = 7338620.0000
Prepmat> Last element read: 26901 26901 123.6399
Prepmat> 19111 lines saved.
Prepmat> 17460 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8967
RTB> Total mass = 8967.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 8967
RTB> Number of blocks = 195
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 211086.1826
RTB> 56475 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1170
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56475
Diagstd> Projected matrix trace = 211086.1826
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1170 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 211086.1826
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1503930 0.2096594 0.2424529 0.2547142
0.5390881 0.6656555 0.8191738 1.0277077 1.3477589
1.4666094 1.7243962 1.7475680 1.8268387 2.1807986
2.2477365 2.5722323 2.6385263 2.7363569 2.9028462
3.1551671 3.2034929 3.6522582 3.8508837 4.1282120
4.4133592 4.5443443 4.6106358 5.0341785 5.0922803
5.2293968 5.4290554 5.5982408 5.9050006 5.9945330
6.2721300 6.7186391 7.0589191 7.2757957 7.3045637
7.6491777 8.0292081 8.2964086 8.5733215 8.8750279
9.7527391 10.1572384 10.5336178 11.2221065 11.8078574
12.5889919 12.9452771 13.2188958 13.9196434 14.7756153
15.0549503 15.1471202 15.7058189 15.9027527 16.5286122
17.1848524 17.3440356 17.8465361 17.9647860 18.5482306
19.0394788 19.5713400 19.9377724 20.6403799 20.8015610
21.1047651 21.3853699 21.6998315 22.1923112 22.3269309
22.5834647 23.1457697 23.4636282 23.6976368 24.0985568
24.2835919 24.4162214 24.8200382 25.1480026 25.5201531
25.5574919 25.8697414 25.9716105 26.4326876 26.9262643
27.2085486 27.7901031 28.1316356 28.3643466 28.6764185
28.9343849 29.2631330 29.5641513 30.0103780 30.3629150
31.2070638
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034328 0.0034334 0.0034336 0.0034339 0.0034340
0.0034348 42.1123071 49.7224440 53.4698545 54.8052090
79.7306236 88.5972118 98.2841121 110.0854898 126.0669892
131.5081045 142.5981210 143.5530152 146.7727337 160.3625888
162.8050915 174.1607852 176.3908270 179.6311513 185.0151491
192.8885552 194.3601217 207.5276728 213.0960908 220.6359495
228.1286957 231.4892843 233.1716190 243.6461691 245.0481523
248.3253618 253.0214940 256.9336989 263.8792578 265.8722173
271.9586065 281.4724775 288.5123329 292.9108970 293.4894010
300.3327233 307.7029343 312.7809883 317.9580568 323.5043638
339.1240450 346.0852605 352.4390791 363.7746846 373.1477521
385.2926790 390.7067874 394.8142959 405.1439287 417.4150158
421.3421858 422.6299946 430.3537311 433.0434085 441.4824813
450.1613280 452.2414429 458.7459541 460.2632554 467.6775502
473.8302769 480.4028342 484.8792476 493.3488539 495.2713933
498.8678796 502.1733532 505.8519878 511.5599634 513.1091919
516.0485547 522.4335922 526.0086239 528.6251233 533.0780461
535.1206907 536.5800322 540.9990508 544.5616186 548.5761443
548.9773117 552.3207048 553.4070921 558.2978328 563.4862620
566.4322445 572.4536906 575.9605954 578.3379247 581.5107333
584.1204449 587.4294167 590.4430139 594.8822532 598.3661427
606.6269980
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8967
Rtb_to_modes> Number of blocs = 195
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1504
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2097
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2425
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2547
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5391
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6657
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8192
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.028
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.348
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.467
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.724
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.748
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.827
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.181
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.248
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.572
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.639
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.736
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.903
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.155
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.203
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.652
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.851
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.128
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.413
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.544
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.611
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.034
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.092
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.229
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.429
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.598
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.905
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.995
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.272
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.719
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.059
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.276
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.305
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.649
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.029
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.296
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.573
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.875
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.753
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.21
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 0.99998 0.99996 1.00002
0.99998 1.00002 1.00003 1.00004 1.00001
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00004 0.99998 1.00000
1.00001 1.00002 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 0.99998
1.00002 0.99997 0.99998 0.99999 1.00005
1.00003 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002
0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001
0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
1.00003 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 161406 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 0.99998 0.99996 1.00002
0.99998 1.00002 1.00003 1.00004 1.00001
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00004 0.99998 1.00000
1.00001 1.00002 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 0.99998
1.00002 0.99997 0.99998 0.99999 1.00005
1.00003 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002
0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001
0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
1.00003 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604010735153451758.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604010735153451758.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604010735153451758.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604010735153451758.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1168
First residue number = 1
Last residue number = 629
Number of atoms found = 8967
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1504
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2097
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2425
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2547
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5391
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6657
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8192
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.028
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.348
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.467
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.724
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.748
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.827
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.181
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.248
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.572
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.639
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.903
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.155
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.203
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.652
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.851
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.128
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.413
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.544
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.611
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.034
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.092
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.229
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.429
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.598
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.905
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.995
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.272
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.719
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.276
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.305
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.649
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.029
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.296
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.573
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.875
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.21
Bfactors> 106 vectors, 26901 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.150400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.322 for 1168 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.065 +/- 0.28
Bfactors> = 72.259 +/- 14.78
Bfactors> Shiftng-fct= 72.193
Bfactors> Scaling-fct= 52.912
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604010735153451758.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604010735153451758.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.6
Chkmod> 106 vectors, 26901 coordinates in file.
Chkmod> That is: 8967 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 50 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9729
0.0034 0.8577
0.0034 0.5563
0.0034 0.9373
0.0034 0.7697
0.0034 0.7445
42.1115 0.0062
49.7251 0.3986
53.4727 0.0166
54.8013 0.4318
79.7281 0.0090
88.5964 0.4938
98.2815 0.3794
110.0964 0.5882
126.0729 0.2492
131.5200 0.2611
142.5756 0.6904
143.5646 0.0060
146.7729 0.3996
160.3631 0.3903
162.8076 0.2293
174.1454 0.4284
176.3991 0.0957
179.6117 0.0232
185.0121 0.2487
192.8752 0.2314
194.3368 0.3082
207.5114 0.6480
213.0902 0.4237
220.6208 0.3817
228.1096 0.0997
231.4706 0.1803
233.1708 0.0893
243.6314 0.2828
245.0309 0.2771
248.3053 0.2550
253.0093 0.3050
256.9171 0.2981
263.8679 0.2294
265.8712 0.1399
271.9441 0.1466
281.4680 0.3230
288.5016 0.3400
292.9024 0.2871
293.4856 0.1690
300.3163 0.3780
307.6857 0.2095
312.7599 0.2206
317.9384 0.0942
323.4900 0.0675
339.1140 0.2139
346.1174 0.2011
352.3634 0.3939
363.7249 0.4302
373.1656 0.0381
385.2916 0.3462
390.7613 0.3535
394.8138 0.4074
405.1317 0.2151
417.4590 0.3692
421.2548 0.2954
422.6520 0.4120
430.3925 0.3060
432.9873 0.4528
441.4821 0.1442
450.0784 0.0512
452.1694 0.2025
458.7708 0.3659
460.1822 0.3215
467.6798 0.4138
473.8164 0.2967
480.3658 0.5368
484.8855 0.1600
493.3231 0.2837
495.2315 0.1932
498.7901 0.3484
502.2062 0.2890
505.8322 0.1869
511.5114 0.4018
513.1224 0.4194
515.9868 0.1993
522.4589 0.1378
525.9454 0.2226
528.6288 0.1629
533.0711 0.3990
535.0581 0.3053
536.5985 0.3182
540.9754 0.3404
544.5599 0.3196
548.5510 0.3289
548.9807 0.0582
552.2998 0.2473
553.3662 0.3220
558.2455 0.2290
563.5012 0.4272
566.4230 0.4589
572.4281 0.4535
575.9191 0.3211
578.2688 0.3947
581.5221 0.1097
584.0511 0.4143
587.3728 0.5184
590.3762 0.3852
594.8530 0.4793
598.3117 0.4998
606.6295 0.4718
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735153451758 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
making animated gifs
11 models are in 2604010735153451758.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735153451758 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
making animated gifs
11 models are in 2604010735153451758.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735153451758 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
making animated gifs
11 models are in 2604010735153451758.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735153451758 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
making animated gifs
11 models are in 2604010735153451758.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604010735153451758 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604010735153451758.eigenfacs
2604010735153451758.atom
making animated gifs
11 models are in 2604010735153451758.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604010735153451758.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604010735153451758.10.pdb
2604010735153451758.11.pdb
2604010735153451758.7.pdb
2604010735153451758.8.pdb
2604010735153451758.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m55.268s
user 0m54.937s
sys 0m0.311s
rm: cannot remove '2604010735153451758.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
