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elNémo has been hacked on november 27th.
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LOGs for ID: 2604010738593453301

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604010738593453301.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604010738593453301.atom to be opened. Openam> File opened: 2604010738593453301.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 382 First residue number = 208 Last residue number = 383 Number of atoms found = 3081 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 145.610355 +/- 10.021411 From: 120.578000 To: 170.004000 = 129.046052 +/- 14.931361 From: 89.581000 To: 163.187000 = 153.599079 +/- 11.605737 From: 122.507000 To: 180.170000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.6318 % Filled. Pdbmat> 1124314 non-zero elements. Pdbmat> 122887 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.77 +/- 21.69 Maximum number = 126 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.457740E+06 Pdbmat> Larger element = 486.535 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 382 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604010738593453301.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604010738593453301.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604010738593453301.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3081 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 382 residues. Blocpdb> 13 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 21 atoms in block 2 Block first atom: 14 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 35 Blocpdb> 12 atoms in block 4 Block first atom: 54 Blocpdb> 12 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 78 Blocpdb> 15 atoms in block 7 Block first atom: 94 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 109 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 124 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 139 Blocpdb> 20 atoms in block 11 Block first atom: 158 Blocpdb> 18 atoms in block 12 Block first atom: 178 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 196 Blocpdb> 5 atoms in block 14 Block first atom: 218 Blocpdb> 9 atoms in block 15 Block first atom: 223 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 232 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 248 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 267 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 282 Blocpdb> 15 atoms in block 20 Block first atom: 294 Blocpdb> 11 atoms in block 21 Block first atom: 309 Blocpdb> 10 atoms in block 22 Block first atom: 320 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 330 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 349 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 365 Blocpdb> 15 atoms in block 26 Block first atom: 377 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 392 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 414 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 424 Blocpdb> 17 atoms in block 30 Block first atom: 440 Blocpdb> 12 atoms in block 31 Block first atom: 457 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 469 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 484 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 504 Blocpdb> 13 atoms in block 35 Block first atom: 523 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 536 Blocpdb> 13 atoms in block 37 Block first atom: 551 Blocpdb> 12 atoms in block 38 Block first atom: 564 Blocpdb> 13 atoms in block 39 Block first atom: 576 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 589 Blocpdb> 13 atoms in block 41 Block first atom: 602 Blocpdb> 17 atoms in block 42 Block first atom: 615 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 632 Blocpdb> 22 atoms in block 44 Block first atom: 649 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 671 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 693 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 709 Blocpdb> 9 atoms in block 48 Block first atom: 724 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 733 Blocpdb> 10 atoms in block 50 Block first atom: 751 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 761 Blocpdb> 18 atoms in block 52 Block first atom: 777 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 795 Blocpdb> 13 atoms in block 54 Block first atom: 812 Blocpdb> 16 atoms in block 55 Block first atom: 825 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 841 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 859 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 876 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 888 Blocpdb> 23 atoms in block 60 Block first atom: 908 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 931 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 944 Blocpdb> 19 atoms in block 63 Block first atom: 962 Blocpdb> 13 atoms in block 64 Block first atom: 981 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 994 Blocpdb> 21 atoms in block 66 Block first atom: 1010 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 1031 Blocpdb> 18 atoms in block 68 Block first atom: 1049 Blocpdb> 13 atoms in block 69 Block first atom: 1067 Blocpdb> 20 atoms in block 70 Block first atom: 1080 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1100 Blocpdb> 17 atoms in block 72 Block first atom: 1116 Blocpdb> 13 atoms in block 73 Block first atom: 1133 Blocpdb> 19 atoms in block 74 Block first atom: 1146 Blocpdb> 13 atoms in block 75 Block first atom: 1165 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1178 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1194 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1208 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1227 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1246 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 1262 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1281 Blocpdb> 12 atoms in block 83 Block first atom: 1297 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1309 Blocpdb> 15 atoms in block 85 Block first atom: 1326 Blocpdb> 15 atoms in block 86 Block first atom: 1341 Blocpdb> 13 atoms in block 87 Block first atom: 1356 Blocpdb> 16 atoms in block 88 Block first atom: 1369 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1385 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1400 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 1415 Blocpdb> 24 atoms in block 92 Block first atom: 1429 Blocpdb> 23 atoms in block 93 Block first atom: 1453 Blocpdb> 11 atoms in block 94 Block first atom: 1476 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1487 Blocpdb> 13 atoms in block 96 Block first atom: 1501 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1514 Blocpdb> 12 atoms in block 98 Block first atom: 1533 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 1545 Blocpdb> 13 atoms in block 100 Block first atom: 1565 Blocpdb> 16 atoms in block 101 Block first atom: 1578 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 1594 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 1616 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1632 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 1651 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1664 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1679 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1694 Blocpdb> 12 atoms in block 109 Block first atom: 1709 Blocpdb> 12 atoms in block 110 Block first atom: 1721 Blocpdb> 12 atoms in block 111 Block first atom: 1733 Blocpdb> 15 atoms in block 112 Block first atom: 1745 Blocpdb> 23 atoms in block 113 Block first atom: 1760 Blocpdb> 22 atoms in block 114 Block first atom: 1783 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1805 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 1821 Blocpdb> 22 atoms in block 117 Block first atom: 1837 Blocpdb> 18 atoms in block 118 Block first atom: 1859 Blocpdb> 15 atoms in block 119 Block first atom: 1877 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 1892 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 1904 Blocpdb> 17 atoms in block 122 Block first atom: 1917 Blocpdb> 13 atoms in block 123 Block first atom: 1934 Blocpdb> 18 atoms in block 124 Block first atom: 1947 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 1965 Blocpdb> 12 atoms in block 126 Block first atom: 1983 Blocpdb> 18 atoms in block 127 Block first atom: 1995 Blocpdb> 19 atoms in block 128 Block first atom: 2013 Blocpdb> 12 atoms in block 129 Block first atom: 2032 Blocpdb> 22 atoms in block 130 Block first atom: 2044 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 2066 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2081 Blocpdb> 21 atoms in block 133 Block first atom: 2097 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 2118 Blocpdb> 13 atoms in block 135 Block first atom: 2140 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2153 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 2168 Blocpdb> 15 atoms in block 138 Block first atom: 2187 Blocpdb> 13 atoms in block 139 Block first atom: 2202 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2215 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 2230 Blocpdb> 23 atoms in block 142 Block first atom: 2252 Blocpdb> 14 atoms in block 143 Block first atom: 2275 Blocpdb> 12 atoms in block 144 Block first atom: 2289 Blocpdb> 15 atoms in block 145 Block first atom: 2301 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 2316 Blocpdb> 17 atoms in block 147 Block first atom: 2336 Blocpdb> 25 atoms in block 148 Block first atom: 2353 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2378 Blocpdb> 14 atoms in block 150 Block first atom: 2393 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2407 Blocpdb> 18 atoms in block 152 Block first atom: 2422 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2440 Blocpdb> 13 atoms in block 154 Block first atom: 2455 Blocpdb> 18 atoms in block 155 Block first atom: 2468 Blocpdb> 16 atoms in block 156 Block first atom: 2486 Blocpdb> 19 atoms in block 157 Block first atom: 2502 Blocpdb> 14 atoms in block 158 Block first atom: 2521 Blocpdb> 14 atoms in block 159 Block first atom: 2535 Blocpdb> 16 atoms in block 160 Block first atom: 2549 Blocpdb> 15 atoms in block 161 Block first atom: 2565 Blocpdb> 12 atoms in block 162 Block first atom: 2580 Blocpdb> 21 atoms in block 163 Block first atom: 2592 Blocpdb> 17 atoms in block 164 Block first atom: 2613 Blocpdb> 12 atoms in block 165 Block first atom: 2630 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 2642 Blocpdb> 13 atoms in block 167 Block first atom: 2664 Blocpdb> 12 atoms in block 168 Block first atom: 2677 Blocpdb> 15 atoms in block 169 Block first atom: 2689 Blocpdb> 17 atoms in block 170 Block first atom: 2704 Blocpdb> 22 atoms in block 171 Block first atom: 2721 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 2743 Blocpdb> 10 atoms in block 173 Block first atom: 2757 Blocpdb> 10 atoms in block 174 Block first atom: 2767 Blocpdb> 22 atoms in block 175 Block first atom: 2777 Blocpdb> 12 atoms in block 176 Block first atom: 2799 Blocpdb> 13 atoms in block 177 Block first atom: 2811 Blocpdb> 19 atoms in block 178 Block first atom: 2824 Blocpdb> 15 atoms in block 179 Block first atom: 2843 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 2858 Blocpdb> 24 atoms in block 181 Block first atom: 2882 Blocpdb> 18 atoms in block 182 Block first atom: 2906 Blocpdb> 13 atoms in block 183 Block first atom: 2924 Blocpdb> 6 atoms in block 184 Block first atom: 2937 Blocpdb> 15 atoms in block 185 Block first atom: 2943 Blocpdb> 17 atoms in block 186 Block first atom: 2958 Blocpdb> 22 atoms in block 187 Block first atom: 2975 Blocpdb> 15 atoms in block 188 Block first atom: 2997 Blocpdb> 18 atoms in block 189 Block first atom: 3012 Blocpdb> 14 atoms in block 190 Block first atom: 3030 Blocpdb> 20 atoms in block 191 Block first atom: 3044 Blocpdb> 18 atoms in block 192 Block first atom: 3063 Blocpdb> 192 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1124506 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9243 Prepmat> Matrix trace = 2457740.0000 Prepmat> Last element read: 9243 9243 246.2321 Prepmat> 18529 lines saved. Prepmat> 16486 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3081 RTB> Total mass = 3081.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3081 RTB> Number of blocks = 192 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 256246.9707 RTB> 70632 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1152 Diagstd> Nb of non-zero elements: 70632 Diagstd> Projected matrix trace = 256246.9707 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1152 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 256246.9707 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.0459395 2.7604637 3.6942835 4.3639015 5.2254483 5.9873640 7.0784055 8.2180209 8.4623048 9.1312132 10.1257323 10.2710634 11.1184223 11.3094401 11.8898555 12.3854820 13.0781727 13.5374430 13.8704339 14.4935869 15.8338996 16.2455314 16.6923174 16.8152394 17.7091837 18.1019131 18.3842705 19.5243964 19.9661329 20.3639002 21.1251595 21.4782838 22.0590915 22.1818333 23.2033194 23.4290886 24.0728503 24.3751157 25.6200562 25.8120883 26.5601372 26.8403864 27.8025844 28.2516888 29.1664979 30.2774135 30.3406855 30.9170556 31.2202612 31.4669157 32.3160684 32.6261401 33.0561102 33.7684917 34.2801017 34.7786069 34.9816182 35.6269225 36.5508463 36.8238523 37.2802774 37.5689226 38.3966178 39.1252378 39.5745890 39.6608788 40.3725141 41.0992854 42.1660275 42.3863609 42.5415898 43.3542855 43.4783736 43.9760986 44.1393375 44.7560378 45.2966667 45.7858744 46.2832702 46.6533875 47.0432225 47.2822587 47.8216562 49.0794108 49.5346618 49.7290631 50.0404178 50.9214709 51.1777595 51.2610350 52.0064370 52.7486728 53.1297273 53.4978083 53.9883814 54.1550226 54.9116292 55.4190599 56.2993065 56.7624834 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034322 0.0034328 0.0034344 0.0034344 0.0034348 155.3251113 180.4206726 208.7182346 226.8468486 248.2315948 265.7131881 288.9102835 311.2998427 315.8927170 328.1402628 345.5480925 348.0190249 362.0902765 365.1874399 374.4411483 382.1657271 392.7071546 399.5430686 404.4271508 413.4121336 432.1049320 437.6855832 443.6633939 445.2939640 456.9772211 462.0165347 465.6059069 479.8263444 485.2239843 490.0334879 499.1088594 503.2630772 510.0222129 511.4391843 523.0826786 525.6213266 532.7936477 536.1281651 549.6488449 551.7049124 559.6421775 562.5869606 572.5822278 577.1882577 586.4586862 597.5230539 598.1470629 603.8017167 606.7552549 609.1473630 617.3117446 620.2662179 624.3399915 631.0316058 635.7938623 640.4000710 642.2664378 648.1632971 656.5140108 658.9612707 663.0325474 665.5943866 672.8864235 679.2408163 683.1302031 683.8745576 689.9826620 696.1653699 705.1420663 706.9819831 708.2753676 715.0086514 716.0311653 720.1179378 721.4532355 726.4757071 730.8502545 734.7862764 738.7666783 741.7146751 744.8071069 746.6969678 750.9440607 760.7552368 764.2754003 765.7736506 768.1671727 774.9001594 776.8477543 777.4795336 783.1119129 788.6804013 791.5239747 794.2610680 797.8944312 799.1248773 804.6878518 808.3973057 814.7920873 818.1368873 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3081 Rtb_to_modes> Number of blocs = 192 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.694 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.225 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.987 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.218 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.462 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.76 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99996 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 55458 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99996 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604010738593453301.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604010738593453301.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604010738593453301.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604010738593453301.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 382 First residue number = 208 Last residue number = 383 Number of atoms found = 3081 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.694 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.225 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.987 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.218 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.462 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.76 Bfactors> 106 vectors, 9243 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.046000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.623 for 382 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.025 +/- 0.02 Bfactors> = 87.098 +/- 38.28 Bfactors> Shiftng-fct= 87.073 Bfactors> Scaling-fct= 1584.282 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604010738593453301.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604010738593453301.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.6 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vecteur en lecture: 714.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.1 Chkmod> 106 vectors, 9243 coordinates in file. Chkmod> That is: 3081 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 65 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8503 0.0034 0.7126 0.0034 0.7756 0.0034 0.9893 0.0034 0.7225 0.0034 0.9162 155.3207 0.4918 180.3978 0.3513 208.7013 0.4521 226.8397 0.4797 248.2103 0.3294 265.6937 0.4499 288.8896 0.4473 311.2861 0.2691 315.8735 0.3580 328.1223 0.2675 345.6061 0.4284 347.9861 0.4166 362.1004 0.2272 365.1808 0.4627 374.4273 0.2905 382.2190 0.5192 392.7177 0.3079 399.5636 0.6242 404.4035 0.4580 413.3432 0.3285 432.0332 0.3533 437.7270 0.4317 443.6136 0.3564 445.3379 0.3153 456.9681 0.4757 461.9723 0.3433 465.5318 0.3330 479.7517 0.3548 485.2501 0.3726 489.9655 0.4240 499.1446 0.3632 503.2616 0.2991 510.0108 0.4202 511.3961 0.3927 523.0228 0.2824 525.6090 0.4547 532.7392 0.2042 536.1589 0.5779 549.6246 0.4063 551.6589 0.4007 559.6167 0.5947 562.5588 0.4573 572.5310 0.4398 577.1462 0.4031 586.4687 0.5113 597.5229 0.3920 598.1146 0.3166 603.8045 0.3335 606.7267 0.4898 609.1511 0.2593 617.3228 0.3836 620.2763 0.2741 624.3499 0.2957 631.0186 0.3588 635.7656 0.4520 640.3854 0.4833 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DQ=-80 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom making animated gifs 11 models are in 2604010738593453301.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010738593453301.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010738593453301.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604010738593453301 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom making animated gifs 11 models are in 2604010738593453301.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010738593453301.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010738593453301.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604010738593453301 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604010738593453301.eigenfacs 2604010738593453301.atom making animated gifs 11 models are in 2604010738593453301.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010738593453301.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604010738593453301.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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