*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604021340283643070.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604021340283643070.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604021340283643070.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 773
First residue number = 1
Last residue number = 773
Number of atoms found = 12396
Mean number per residue = 16.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.141288 +/- 18.130190 From: -56.639000 To: 41.871000
= 0.112762 +/- 14.952790 From: -39.614000 To: 36.666000
= -0.100010 +/- 16.496401 From: -41.699000 To: 51.771000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.2927 % Filled.
Pdbmat> 8938606 non-zero elements.
Pdbmat> 985085 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 158.94 +/- 43.41
Maximum number = 244
Minimum number = 20
Pdbmat> Matrix trace = 1.970170E+07
Pdbmat> Larger element = 876.334
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
773 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604021340283643070.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604021340283643070.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604021340283643070.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 12396 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 773 residues.
Blocpdb> 54 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 60 atoms in block 2
Block first atom: 55
Blocpdb> 67 atoms in block 3
Block first atom: 115
Blocpdb> 58 atoms in block 4
Block first atom: 182
Blocpdb> 50 atoms in block 5
Block first atom: 240
Blocpdb> 73 atoms in block 6
Block first atom: 290
Blocpdb> 61 atoms in block 7
Block first atom: 363
Blocpdb> 81 atoms in block 8
Block first atom: 424
Blocpdb> 56 atoms in block 9
Block first atom: 505
Blocpdb> 74 atoms in block 10
Block first atom: 561
Blocpdb> 83 atoms in block 11
Block first atom: 635
Blocpdb> 80 atoms in block 12
Block first atom: 718
Blocpdb> 59 atoms in block 13
Block first atom: 798
Blocpdb> 58 atoms in block 14
Block first atom: 857
Blocpdb> 46 atoms in block 15
Block first atom: 915
Blocpdb> 73 atoms in block 16
Block first atom: 961
Blocpdb> 55 atoms in block 17
Block first atom: 1034
Blocpdb> 61 atoms in block 18
Block first atom: 1089
Blocpdb> 70 atoms in block 19
Block first atom: 1150
Blocpdb> 56 atoms in block 20
Block first atom: 1220
Blocpdb> 64 atoms in block 21
Block first atom: 1276
Blocpdb> 65 atoms in block 22
Block first atom: 1340
Blocpdb> 72 atoms in block 23
Block first atom: 1405
Blocpdb> 49 atoms in block 24
Block first atom: 1477
Blocpdb> 56 atoms in block 25
Block first atom: 1526
Blocpdb> 66 atoms in block 26
Block first atom: 1582
Blocpdb> 50 atoms in block 27
Block first atom: 1648
Blocpdb> 60 atoms in block 28
Block first atom: 1698
Blocpdb> 66 atoms in block 29
Block first atom: 1758
Blocpdb> 64 atoms in block 30
Block first atom: 1824
Blocpdb> 76 atoms in block 31
Block first atom: 1888
Blocpdb> 68 atoms in block 32
Block first atom: 1964
Blocpdb> 70 atoms in block 33
Block first atom: 2032
Blocpdb> 65 atoms in block 34
Block first atom: 2102
Blocpdb> 66 atoms in block 35
Block first atom: 2167
Blocpdb> 57 atoms in block 36
Block first atom: 2233
Blocpdb> 70 atoms in block 37
Block first atom: 2290
Blocpdb> 67 atoms in block 38
Block first atom: 2360
Blocpdb> 74 atoms in block 39
Block first atom: 2427
Blocpdb> 62 atoms in block 40
Block first atom: 2501
Blocpdb> 72 atoms in block 41
Block first atom: 2563
Blocpdb> 69 atoms in block 42
Block first atom: 2635
Blocpdb> 58 atoms in block 43
Block first atom: 2704
Blocpdb> 73 atoms in block 44
Block first atom: 2762
Blocpdb> 62 atoms in block 45
Block first atom: 2835
Blocpdb> 56 atoms in block 46
Block first atom: 2897
Blocpdb> 81 atoms in block 47
Block first atom: 2953
Blocpdb> 65 atoms in block 48
Block first atom: 3034
Blocpdb> 73 atoms in block 49
Block first atom: 3099
Blocpdb> 69 atoms in block 50
Block first atom: 3172
Blocpdb> 65 atoms in block 51
Block first atom: 3241
Blocpdb> 58 atoms in block 52
Block first atom: 3306
Blocpdb> 53 atoms in block 53
Block first atom: 3364
Blocpdb> 64 atoms in block 54
Block first atom: 3417
Blocpdb> 81 atoms in block 55
Block first atom: 3481
Blocpdb> 82 atoms in block 56
Block first atom: 3562
Blocpdb> 69 atoms in block 57
Block first atom: 3644
Blocpdb> 65 atoms in block 58
Block first atom: 3713
Blocpdb> 71 atoms in block 59
Block first atom: 3778
Blocpdb> 70 atoms in block 60
Block first atom: 3849
Blocpdb> 71 atoms in block 61
Block first atom: 3919
Blocpdb> 64 atoms in block 62
Block first atom: 3990
Blocpdb> 58 atoms in block 63
Block first atom: 4054
Blocpdb> 66 atoms in block 64
Block first atom: 4112
Blocpdb> 67 atoms in block 65
Block first atom: 4178
Blocpdb> 73 atoms in block 66
Block first atom: 4245
Blocpdb> 67 atoms in block 67
Block first atom: 4318
Blocpdb> 54 atoms in block 68
Block first atom: 4385
Blocpdb> 50 atoms in block 69
Block first atom: 4439
Blocpdb> 65 atoms in block 70
Block first atom: 4489
Blocpdb> 88 atoms in block 71
Block first atom: 4554
Blocpdb> 77 atoms in block 72
Block first atom: 4642
Blocpdb> 71 atoms in block 73
Block first atom: 4719
Blocpdb> 76 atoms in block 74
Block first atom: 4790
Blocpdb> 51 atoms in block 75
Block first atom: 4866
Blocpdb> 63 atoms in block 76
Block first atom: 4917
Blocpdb> 62 atoms in block 77
Block first atom: 4980
Blocpdb> 76 atoms in block 78
Block first atom: 5042
Blocpdb> 63 atoms in block 79
Block first atom: 5118
Blocpdb> 55 atoms in block 80
Block first atom: 5181
Blocpdb> 55 atoms in block 81
Block first atom: 5236
Blocpdb> 70 atoms in block 82
Block first atom: 5291
Blocpdb> 69 atoms in block 83
Block first atom: 5361
Blocpdb> 68 atoms in block 84
Block first atom: 5430
Blocpdb> 69 atoms in block 85
Block first atom: 5498
Blocpdb> 87 atoms in block 86
Block first atom: 5567
Blocpdb> 80 atoms in block 87
Block first atom: 5654
Blocpdb> 60 atoms in block 88
Block first atom: 5734
Blocpdb> 74 atoms in block 89
Block first atom: 5794
Blocpdb> 71 atoms in block 90
Block first atom: 5868
Blocpdb> 68 atoms in block 91
Block first atom: 5939
Blocpdb> 74 atoms in block 92
Block first atom: 6007
Blocpdb> 54 atoms in block 93
Block first atom: 6081
Blocpdb> 52 atoms in block 94
Block first atom: 6135
Blocpdb> 68 atoms in block 95
Block first atom: 6187
Blocpdb> 53 atoms in block 96
Block first atom: 6255
Blocpdb> 53 atoms in block 97
Block first atom: 6308
Blocpdb> 64 atoms in block 98
Block first atom: 6361
Blocpdb> 76 atoms in block 99
Block first atom: 6425
Blocpdb> 58 atoms in block 100
Block first atom: 6501
Blocpdb> 67 atoms in block 101
Block first atom: 6559
Blocpdb> 69 atoms in block 102
Block first atom: 6626
Blocpdb> 53 atoms in block 103
Block first atom: 6695
Blocpdb> 62 atoms in block 104
Block first atom: 6748
Blocpdb> 69 atoms in block 105
Block first atom: 6810
Blocpdb> 56 atoms in block 106
Block first atom: 6879
Blocpdb> 67 atoms in block 107
Block first atom: 6935
Blocpdb> 52 atoms in block 108
Block first atom: 7002
Blocpdb> 54 atoms in block 109
Block first atom: 7054
Blocpdb> 54 atoms in block 110
Block first atom: 7108
Blocpdb> 71 atoms in block 111
Block first atom: 7162
Blocpdb> 59 atoms in block 112
Block first atom: 7233
Blocpdb> 81 atoms in block 113
Block first atom: 7292
Blocpdb> 65 atoms in block 114
Block first atom: 7373
Blocpdb> 70 atoms in block 115
Block first atom: 7438
Blocpdb> 72 atoms in block 116
Block first atom: 7508
Blocpdb> 53 atoms in block 117
Block first atom: 7580
Blocpdb> 58 atoms in block 118
Block first atom: 7633
Blocpdb> 62 atoms in block 119
Block first atom: 7691
Blocpdb> 55 atoms in block 120
Block first atom: 7753
Blocpdb> 62 atoms in block 121
Block first atom: 7808
Blocpdb> 76 atoms in block 122
Block first atom: 7870
Blocpdb> 59 atoms in block 123
Block first atom: 7946
Blocpdb> 66 atoms in block 124
Block first atom: 8005
Blocpdb> 53 atoms in block 125
Block first atom: 8071
Blocpdb> 47 atoms in block 126
Block first atom: 8124
Blocpdb> 60 atoms in block 127
Block first atom: 8171
Blocpdb> 61 atoms in block 128
Block first atom: 8231
Blocpdb> 63 atoms in block 129
Block first atom: 8292
Blocpdb> 84 atoms in block 130
Block first atom: 8355
Blocpdb> 52 atoms in block 131
Block first atom: 8439
Blocpdb> 58 atoms in block 132
Block first atom: 8491
Blocpdb> 64 atoms in block 133
Block first atom: 8549
Blocpdb> 58 atoms in block 134
Block first atom: 8613
Blocpdb> 62 atoms in block 135
Block first atom: 8671
Blocpdb> 52 atoms in block 136
Block first atom: 8733
Blocpdb> 60 atoms in block 137
Block first atom: 8785
Blocpdb> 70 atoms in block 138
Block first atom: 8845
Blocpdb> 59 atoms in block 139
Block first atom: 8915
Blocpdb> 67 atoms in block 140
Block first atom: 8974
Blocpdb> 71 atoms in block 141
Block first atom: 9041
Blocpdb> 47 atoms in block 142
Block first atom: 9112
Blocpdb> 72 atoms in block 143
Block first atom: 9159
Blocpdb> 65 atoms in block 144
Block first atom: 9231
Blocpdb> 70 atoms in block 145
Block first atom: 9296
Blocpdb> 58 atoms in block 146
Block first atom: 9366
Blocpdb> 64 atoms in block 147
Block first atom: 9424
Blocpdb> 57 atoms in block 148
Block first atom: 9488
Blocpdb> 74 atoms in block 149
Block first atom: 9545
Blocpdb> 66 atoms in block 150
Block first atom: 9619
Blocpdb> 67 atoms in block 151
Block first atom: 9685
Blocpdb> 62 atoms in block 152
Block first atom: 9752
Blocpdb> 54 atoms in block 153
Block first atom: 9814
Blocpdb> 59 atoms in block 154
Block first atom: 9868
Blocpdb> 67 atoms in block 155
Block first atom: 9927
Blocpdb> 53 atoms in block 156
Block first atom: 9994
Blocpdb> 62 atoms in block 157
Block first atom: 10047
Blocpdb> 84 atoms in block 158
Block first atom: 10109
Blocpdb> 71 atoms in block 159
Block first atom: 10193
Blocpdb> 65 atoms in block 160
Block first atom: 10264
Blocpdb> 72 atoms in block 161
Block first atom: 10329
Blocpdb> 70 atoms in block 162
Block first atom: 10401
Blocpdb> 39 atoms in block 163
Block first atom: 10471
Blocpdb> 72 atoms in block 164
Block first atom: 10510
Blocpdb> 69 atoms in block 165
Block first atom: 10582
Blocpdb> 64 atoms in block 166
Block first atom: 10651
Blocpdb> 72 atoms in block 167
Block first atom: 10715
Blocpdb> 56 atoms in block 168
Block first atom: 10787
Blocpdb> 76 atoms in block 169
Block first atom: 10843
Blocpdb> 61 atoms in block 170
Block first atom: 10919
Blocpdb> 81 atoms in block 171
Block first atom: 10980
Blocpdb> 53 atoms in block 172
Block first atom: 11061
Blocpdb> 62 atoms in block 173
Block first atom: 11114
Blocpdb> 67 atoms in block 174
Block first atom: 11176
Blocpdb> 66 atoms in block 175
Block first atom: 11243
Blocpdb> 57 atoms in block 176
Block first atom: 11309
Blocpdb> 59 atoms in block 177
Block first atom: 11366
Blocpdb> 41 atoms in block 178
Block first atom: 11425
Blocpdb> 47 atoms in block 179
Block first atom: 11466
Blocpdb> 52 atoms in block 180
Block first atom: 11513
Blocpdb> 55 atoms in block 181
Block first atom: 11565
Blocpdb> 61 atoms in block 182
Block first atom: 11620
Blocpdb> 67 atoms in block 183
Block first atom: 11681
Blocpdb> 70 atoms in block 184
Block first atom: 11748
Blocpdb> 64 atoms in block 185
Block first atom: 11818
Blocpdb> 51 atoms in block 186
Block first atom: 11882
Blocpdb> 54 atoms in block 187
Block first atom: 11933
Blocpdb> 75 atoms in block 188
Block first atom: 11987
Blocpdb> 73 atoms in block 189
Block first atom: 12062
Blocpdb> 53 atoms in block 190
Block first atom: 12135
Blocpdb> 71 atoms in block 191
Block first atom: 12188
Blocpdb> 57 atoms in block 192
Block first atom: 12259
Blocpdb> 58 atoms in block 193
Block first atom: 12316
Blocpdb> 23 atoms in block 194
Block first atom: 12373
Blocpdb> 194 blocks.
Blocpdb> At most, 88 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 8938800 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 37188
Prepmat> Matrix trace = 19701700.0000
Prepmat> Last element read: 37188 37188 414.2604
Prepmat> 18916 lines saved.
Prepmat> 16798 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12396
RTB> Total mass = 12396.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 12396
RTB> Number of blocks = 194
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 457333.4563
RTB> 73302 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1164
Diagstd> Nb of non-zero elements: 73302
Diagstd> Projected matrix trace = 457333.4563
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1164 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 457333.4563
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.8570231 2.2635815 2.8247703 3.8815447
4.5402262 5.9384750 7.0302002 8.2572482 8.4742010
9.3093499 10.5850865 11.2630991 12.2235490 13.5931624
15.2990082 16.0307739 16.3921453 16.9716259 18.4038450
19.1224871 21.0794664 21.9220981 22.7564347 23.1466866
24.9455883 25.6587220 26.4362501 28.8610333 29.3931677
31.7368810 32.4164048 33.8974154 36.0835105 37.1104439
38.9633878 39.7267233 40.0747609 40.7276634 41.0468816
42.3108609 43.6989029 45.0317331 45.2903738 45.6448992
46.3119908 47.4156537 48.3644687 50.5158008 50.9631440
52.2261079 52.8911403 53.3823116 55.1361410 55.4664226
56.2594162 57.5161566 57.9741109 59.3675228 60.3614094
61.6711615 62.7036703 63.1449001 64.1788504 65.3339407
65.5473699 67.1507248 68.5312271 70.3915966 70.9857097
71.6950165 71.7703618 73.4273192 75.4765475 77.0541592
78.0586259 78.4742898 78.9615503 80.4163017 81.3788288
81.8482893 83.2624345 84.3393609 85.4941060 85.7572071
86.7119848 87.8554956 88.6157109 88.9700822 90.3383628
90.5666468 90.9955810 91.3338531 93.1161062 93.5732232
94.7567807 95.5166681 96.0834954 96.6195903 97.6149090
98.6757688
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034312 0.0034331 0.0034334 0.0034346 0.0034351
0.0034368 100.5290404 163.3779154 182.5100772 213.9427521
231.3843736 264.6261428 287.9248357 312.0419252 316.1146774
331.3255735 353.2990640 364.4384857 379.6592098 400.3644728
424.7436732 434.7829694 439.6561753 447.3598509 465.8537150
474.8620560 498.5687885 508.4360528 518.0210300 522.4439395
542.3656236 550.0634535 558.3354541 583.3795727 588.7331314
611.7548232 618.2693307 632.2350563 652.3034437 661.5205726
677.8344472 684.4420018 687.4335917 693.0108395 695.7214039
706.3520522 717.8447807 728.7098013 730.7994853 733.6541972
738.9958601 747.7495348 755.1939307 771.8073341 775.2171759
784.7640707 789.7447459 793.4032373 806.3311980 808.7426715
814.5033802 823.5504505 826.8225807 836.6999519 843.6745842
852.7786995 859.8877493 862.9078515 869.9438994 877.7376091
879.1701118 889.8578430 898.9582747 911.0782697 914.9149933
919.4746594 919.9576769 930.5165817 943.4117768 953.2203889
959.4132924 961.9643494 964.9462294 973.7945249 979.6050105
982.4265336 990.8771940 997.2646687 1004.0685590 1005.6123415
1011.1948378 1017.8405451 1022.2347567 1024.2766588 1032.1228383
1033.4260969 1035.8704193 1037.7940350 1047.8706681 1050.4395741
1057.0619224 1061.2919318 1064.4363011 1067.4016653 1072.8854536
1078.6996544
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12396
Rtb_to_modes> Number of blocs = 194
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9841E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0016E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8570
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.264
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.882
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.540
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.938
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.030
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.257
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.474
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.309
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.68
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1164 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 0.99998 1.00003 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 0.99998
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
0.99997 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998
1.00003 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 223128 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 0.99998 1.00003 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 0.99998
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
0.99997 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998
1.00003 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604021340283643070.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604021340283643070.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604021340283643070.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604021340283643070.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 773
First residue number = 1
Last residue number = 773
Number of atoms found = 12396
Mean number per residue = 16.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9841E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0016E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8570
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.264
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.882
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.540
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.938
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.030
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.257
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.474
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.309
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.68
Bfactors> 106 vectors, 37188 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.857000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.006 +/- 0.01
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.006
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604021340283643070.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604021340283643070.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 997.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079.
Chkmod> 106 vectors, 37188 coordinates in file.
Chkmod> That is: 12396 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6513
0.0034 0.8317
0.0034 0.9538
0.0034 0.7664
0.0034 0.7448
0.0034 0.8446
100.5234 0.1890
163.3860 0.2936
182.5097 0.1725
213.9461 0.1625
231.3687 0.4917
264.6042 0.5528
287.9084 0.4001
312.0238 0.3509
316.0974 0.5380
331.3051 0.2628
353.3659 0.5032
364.3727 0.4626
379.5878 0.4722
400.3007 0.5010
424.7392 0.5667
434.7538 0.5342
439.6085 0.3363
447.3192 0.5617
465.7851 0.4261
474.8108 0.3283
498.5537 0.5801
508.3899 0.5915
518.0394 0.5694
522.4589 0.4128
542.3903 0.3183
550.0535 0.3221
558.3511 0.2814
583.3441 0.3358
588.6761 0.5733
611.7586 0.4985
618.2771 0.5933
632.2320 0.4261
652.2437 0.5706
661.4882 0.4363
677.7759 0.1671
684.4408 0.4736
687.3632 0.5738
693.0010 0.3826
695.7180 0.4006
706.3145 0.3478
717.8230 0.4392
728.6645 0.3449
730.7651 0.2543
733.5833 0.2844
738.9483 0.3211
747.7517 0.4619
755.1266 0.3472
771.8063 0.3553
775.1600 0.3798
784.7596 0.4861
789.7023 0.4403
793.3520 0.5064
806.3248 0.4145
808.7340 0.4131
814.4726 0.3993
823.5426 0.3163
826.7578 0.4094
836.6815 0.4537
843.6285 0.4423
852.7341 0.3064
859.8257 0.4568
862.8373 0.4156
869.9143 0.3951
877.6735 0.5259
879.1500 0.3866
889.8148 0.5476
898.9116 0.5634
911.0288 0.3735
914.9034 0.4156
919.4671 0.4730
919.9159 0.5068
930.4936 0.5331
943.3929 0.4876
953.1537 0.4806
959.3806 0.2979
961.8968 0.4154
964.8953 0.4428
973.7751 0.4966
979.5700 0.4448
982.3946 0.3006
990.8202 0.4101
997.2256 0.4819
1004.0013 0.5382
1005.5855 0.4442
1011.1399 0.3937
1017.8229 0.4167
1022.2156 0.4581
1024.2322 0.3614
1032.0879 0.4879
1033.4009 0.4579
1035.8511 0.4306
1037.7276 0.4874
1047.8476 0.3781
1050.3764 0.4473
1057.0345 0.5251
1061.2649 0.4020
1064.3712 0.4508
1067.3581 0.4836
1072.8124 0.4510
1078.6765 0.5896
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604021340283643070 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
making animated gifs
11 models are in 2604021340283643070.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604021340283643070 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
making animated gifs
11 models are in 2604021340283643070.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604021340283643070 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
making animated gifs
11 models are in 2604021340283643070.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604021340283643070 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
making animated gifs
11 models are in 2604021340283643070.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604021340283643070 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604021340283643070.eigenfacs
2604021340283643070.atom
making animated gifs
11 models are in 2604021340283643070.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604021340283643070.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604021340283643070.10.pdb
2604021340283643070.11.pdb
2604021340283643070.7.pdb
2604021340283643070.8.pdb
2604021340283643070.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m33.084s
user 1m32.418s
sys 0m0.605s
rm: cannot remove '2604021340283643070.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
