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LOGs for ID: 260408120827651569

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260408120827651569.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260408120827651569.atom to be opened. Openam> File opened: 260408120827651569.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1028 First residue number = 1 Last residue number = 235 Number of atoms found = 8159 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -9.225122 +/- 17.246985 From: -51.955000 To: 31.821000 = 20.911238 +/- 50.311763 From: -41.098000 To: 149.676000 = 0.308408 +/- 21.534502 From: -41.540000 To: 86.696000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9799 % Filled. Pdbmat> 2935619 non-zero elements. Pdbmat> 320785 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.63 +/- 22.97 Maximum number = 130 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 6.415700E+06 Pdbmat> Larger element = 487.332 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1028 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260408120827651569.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260408120827651569.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260408120827651569.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8159 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1028 residues. Blocpdb> 51 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 49 atoms in block 2 Block first atom: 52 Blocpdb> 58 atoms in block 3 Block first atom: 101 Blocpdb> 48 atoms in block 4 Block first atom: 159 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 207 Blocpdb> 51 atoms in block 6 Block first atom: 251 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 302 Blocpdb> 41 atoms in block 8 Block first atom: 341 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 382 Blocpdb> 45 atoms in block 10 Block first atom: 425 Blocpdb> 43 atoms in block 11 Block first atom: 470 Blocpdb> 46 atoms in block 12 Block first atom: 513 Blocpdb> 52 atoms in block 13 Block first atom: 559 Blocpdb> 53 atoms in block 14 Block first atom: 611 Blocpdb> 48 atoms in block 15 Block first atom: 664 Blocpdb> 46 atoms in block 16 Block first atom: 712 Blocpdb> 45 atoms in block 17 Block first atom: 758 Blocpdb> 46 atoms in block 18 Block first atom: 803 Blocpdb> 45 atoms in block 19 Block first atom: 849 Blocpdb> 46 atoms in block 20 Block first atom: 894 Blocpdb> 45 atoms in block 21 Block first atom: 940 Blocpdb> 49 atoms in block 22 Block first atom: 985 Blocpdb> 49 atoms in block 23 Block first atom: 1034 Blocpdb> 50 atoms in block 24 Block first atom: 1083 Blocpdb> 48 atoms in block 25 Block first atom: 1133 Blocpdb> 43 atoms in block 26 Block first atom: 1181 Blocpdb> 47 atoms in block 27 Block first atom: 1224 Blocpdb> 42 atoms in block 28 Block first atom: 1271 Blocpdb> 49 atoms in block 29 Block first atom: 1313 Blocpdb> 51 atoms in block 30 Block first atom: 1362 Blocpdb> 47 atoms in block 31 Block first atom: 1413 Blocpdb> 50 atoms in block 32 Block first atom: 1460 Blocpdb> 43 atoms in block 33 Block first atom: 1510 Blocpdb> 46 atoms in block 34 Block first atom: 1553 Blocpdb> 51 atoms in block 35 Block first atom: 1599 Blocpdb> 48 atoms in block 36 Block first atom: 1650 Blocpdb> 53 atoms in block 37 Block first atom: 1698 Blocpdb> 48 atoms in block 38 Block first atom: 1751 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 1799 Blocpdb> 57 atoms in block 40 Block first atom: 1844 Blocpdb> 50 atoms in block 41 Block first atom: 1901 Blocpdb> 50 atoms in block 42 Block first atom: 1951 Blocpdb> 45 atoms in block 43 Block first atom: 2001 Blocpdb> 49 atoms in block 44 Block first atom: 2046 Blocpdb> 40 atoms in block 45 Block first atom: 2095 Blocpdb> 55 atoms in block 46 Block first atom: 2135 Blocpdb> 43 atoms in block 47 Block first atom: 2190 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2233 Blocpdb> 50 atoms in block 49 Block first atom: 2284 Blocpdb> 46 atoms in block 50 Block first atom: 2334 Blocpdb> 44 atoms in block 51 Block first atom: 2380 Blocpdb> 48 atoms in block 52 Block first atom: 2424 Blocpdb> 44 atoms in block 53 Block first atom: 2472 Blocpdb> 45 atoms in block 54 Block first atom: 2516 Blocpdb> 47 atoms in block 55 Block first atom: 2561 Blocpdb> 61 atoms in block 56 Block first atom: 2608 Blocpdb> 45 atoms in block 57 Block first atom: 2669 Blocpdb> 46 atoms in block 58 Block first atom: 2714 Blocpdb> 44 atoms in block 59 Block first atom: 2760 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2804 Blocpdb> 48 atoms in block 61 Block first atom: 2852 Blocpdb> 51 atoms in block 62 Block first atom: 2900 Blocpdb> 57 atoms in block 63 Block first atom: 2951 Blocpdb> 47 atoms in block 64 Block first atom: 3008 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 3055 Blocpdb> 49 atoms in block 66 Block first atom: 3102 Blocpdb> 46 atoms in block 67 Block first atom: 3151 Blocpdb> 45 atoms in block 68 Block first atom: 3197 Blocpdb> 46 atoms in block 69 Block first atom: 3242 Blocpdb> 50 atoms in block 70 Block first atom: 3288 Blocpdb> 51 atoms in block 71 Block first atom: 3338 Blocpdb> 47 atoms in block 72 Block first atom: 3389 Blocpdb> 47 atoms in block 73 Block first atom: 3436 Blocpdb> 52 atoms in block 74 Block first atom: 3483 Blocpdb> 54 atoms in block 75 Block first atom: 3535 Blocpdb> 44 atoms in block 76 Block first atom: 3589 Blocpdb> 46 atoms in block 77 Block first atom: 3633 Blocpdb> 42 atoms in block 78 Block first atom: 3679 Blocpdb> 45 atoms in block 79 Block first atom: 3721 Blocpdb> 46 atoms in block 80 Block first atom: 3766 Blocpdb> 47 atoms in block 81 Block first atom: 3812 Blocpdb> 57 atoms in block 82 Block first atom: 3859 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 3916 Blocpdb> 45 atoms in block 84 Block first atom: 3966 Blocpdb> 46 atoms in block 85 Block first atom: 4011 Blocpdb> 40 atoms in block 86 Block first atom: 4057 Blocpdb> 50 atoms in block 87 Block first atom: 4097 Blocpdb> 55 atoms in block 88 Block first atom: 4147 Blocpdb> 52 atoms in block 89 Block first atom: 4202 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 4254 Blocpdb> 46 atoms in block 91 Block first atom: 4298 Blocpdb> 46 atoms in block 92 Block first atom: 4344 Blocpdb> 53 atoms in block 93 Block first atom: 4390 Blocpdb> 41 atoms in block 94 Block first atom: 4443 Blocpdb> 47 atoms in block 95 Block first atom: 4484 Blocpdb> 47 atoms in block 96 Block first atom: 4531 Blocpdb> 42 atoms in block 97 Block first atom: 4578 Blocpdb> 42 atoms in block 98 Block first atom: 4620 Blocpdb> 45 atoms in block 99 Block first atom: 4662 Blocpdb> 50 atoms in block 100 Block first atom: 4707 Blocpdb> 43 atoms in block 101 Block first atom: 4757 Blocpdb> 53 atoms in block 102 Block first atom: 4800 Blocpdb> 41 atoms in block 103 Block first atom: 4853 Blocpdb> 55 atoms in block 104 Block first atom: 4894 Blocpdb> 60 atoms in block 105 Block first atom: 4949 Blocpdb> 55 atoms in block 106 Block first atom: 5009 Blocpdb> 56 atoms in block 107 Block first atom: 5064 Blocpdb> 44 atoms in block 108 Block first atom: 5120 Blocpdb> 49 atoms in block 109 Block first atom: 5164 Blocpdb> 49 atoms in block 110 Block first atom: 5213 Blocpdb> 52 atoms in block 111 Block first atom: 5262 Blocpdb> 49 atoms in block 112 Block first atom: 5314 Blocpdb> 43 atoms in block 113 Block first atom: 5363 Blocpdb> 54 atoms in block 114 Block first atom: 5406 Blocpdb> 53 atoms in block 115 Block first atom: 5460 Blocpdb> 50 atoms in block 116 Block first atom: 5513 Blocpdb> 46 atoms in block 117 Block first atom: 5563 Blocpdb> 50 atoms in block 118 Block first atom: 5609 Blocpdb> 49 atoms in block 119 Block first atom: 5659 Blocpdb> 52 atoms in block 120 Block first atom: 5708 Blocpdb> 58 atoms in block 121 Block first atom: 5760 Blocpdb> 57 atoms in block 122 Block first atom: 5818 Blocpdb> 52 atoms in block 123 Block first atom: 5875 Blocpdb> 44 atoms in block 124 Block first atom: 5927 Blocpdb> 49 atoms in block 125 Block first atom: 5971 Blocpdb> 44 atoms in block 126 Block first atom: 6020 Blocpdb> 56 atoms in block 127 Block first atom: 6064 Blocpdb> 49 atoms in block 128 Block first atom: 6120 Blocpdb> 57 atoms in block 129 Block first atom: 6169 Blocpdb> 51 atoms in block 130 Block first atom: 6226 Blocpdb> 59 atoms in block 131 Block first atom: 6277 Blocpdb> 44 atoms in block 132 Block first atom: 6336 Blocpdb> 7 atoms in block 133 Block first atom: 6380 Blocpdb> 42 atoms in block 134 Block first atom: 6387 Blocpdb> 41 atoms in block 135 Block first atom: 6429 Blocpdb> 45 atoms in block 136 Block first atom: 6470 Blocpdb> 43 atoms in block 137 Block first atom: 6515 Blocpdb> 44 atoms in block 138 Block first atom: 6558 Blocpdb> 57 atoms in block 139 Block first atom: 6602 Blocpdb> 41 atoms in block 140 Block first atom: 6659 Blocpdb> 58 atoms in block 141 Block first atom: 6700 Blocpdb> 46 atoms in block 142 Block first atom: 6758 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 6804 Blocpdb> 45 atoms in block 144 Block first atom: 6851 Blocpdb> 51 atoms in block 145 Block first atom: 6896 Blocpdb> 33 atoms in block 146 Block first atom: 6947 Blocpdb> 48 atoms in block 147 Block first atom: 6980 Blocpdb> 47 atoms in block 148 Block first atom: 7028 Blocpdb> 44 atoms in block 149 Block first atom: 7075 Blocpdb> 44 atoms in block 150 Block first atom: 7119 Blocpdb> 33 atoms in block 151 Block first atom: 7163 Blocpdb> 46 atoms in block 152 Block first atom: 7196 Blocpdb> 58 atoms in block 153 Block first atom: 7242 Blocpdb> 39 atoms in block 154 Block first atom: 7300 Blocpdb> 42 atoms in block 155 Block first atom: 7339 Blocpdb> 57 atoms in block 156 Block first atom: 7381 Blocpdb> 37 atoms in block 157 Block first atom: 7438 Blocpdb> 36 atoms in block 158 Block first atom: 7475 Blocpdb> 44 atoms in block 159 Block first atom: 7511 Blocpdb> 49 atoms in block 160 Block first atom: 7555 Blocpdb> 31 atoms in block 161 Block first atom: 7604 Blocpdb> 51 atoms in block 162 Block first atom: 7635 Blocpdb> 49 atoms in block 163 Block first atom: 7686 Blocpdb> 51 atoms in block 164 Block first atom: 7735 Blocpdb> 44 atoms in block 165 Block first atom: 7786 Blocpdb> 46 atoms in block 166 Block first atom: 7830 Blocpdb> 43 atoms in block 167 Block first atom: 7876 Blocpdb> 43 atoms in block 168 Block first atom: 7919 Blocpdb> 34 atoms in block 169 Block first atom: 7962 Blocpdb> 52 atoms in block 170 Block first atom: 7996 Blocpdb> 54 atoms in block 171 Block first atom: 8048 Blocpdb> 50 atoms in block 172 Block first atom: 8102 Blocpdb> 8 atoms in block 173 Block first atom: 8151 Blocpdb> 173 blocks. Blocpdb> At most, 61 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2935792 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 24477 Prepmat> Matrix trace = 6415700.0000 Prepmat> Last element read: 24477 24477 137.1818 Prepmat> 15052 lines saved. Prepmat> 13705 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8159 RTB> Total mass = 8159.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8159 RTB> Number of blocks = 173 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 177171.6386 RTB> 45861 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1038 Diagstd> Nb of non-zero elements: 45861 Diagstd> Projected matrix trace = 177171.6386 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1038 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 177171.6386 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0007322 0.0011040 0.0037842 0.0041704 0.0150184 0.0188684 0.0236630 0.0778129 0.1032803 0.1078291 0.1273112 0.3810263 0.4137266 0.4653546 0.5811615 0.6892803 0.7745113 0.8212910 0.9562770 1.1387654 1.2350993 1.5614759 1.9119969 2.1025045 2.3120078 2.6407531 2.9199324 3.3513416 3.9225610 4.0213396 4.1823280 4.6578277 4.9810170 5.3945958 5.5879290 5.8430529 6.0549563 6.3180334 6.6120225 7.1341702 7.3642785 7.7662132 8.0430468 8.1900173 8.6394700 8.9235415 9.0496354 9.8756347 10.2944306 10.7687331 11.0684986 11.2292258 11.4979081 12.3982709 12.5415548 12.6815933 12.7760831 13.5972159 13.7573746 14.2452752 14.8730338 15.1541291 16.0164633 16.0791088 16.5179358 16.8794209 17.1858412 17.5179264 17.7164048 18.1425646 18.7173855 18.8221168 19.2540052 19.3097579 19.5581516 20.1995621 20.5089312 21.1953574 21.3456722 21.7573822 21.8863996 22.2124022 22.7206179 23.1299658 23.6948458 24.0603268 24.4625338 24.9999219 25.1867432 25.3290858 25.6612540 26.2788339 26.5872342 27.1327693 27.5799977 28.0031254 28.4454675 29.3976376 29.5190376 30.0494972 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034333 0.0034333 0.0034335 0.0034339 0.0034344 2.9384144 3.6081825 6.6800770 7.0126990 13.3078393 14.9163604 16.7043676 30.2915120 34.8982824 35.6585229 38.7461489 67.0305500 69.8476866 74.0776658 82.7834817 90.1557065 95.5672626 98.4110408 106.1908617 115.8810477 120.6830351 135.6947106 150.1546817 157.4576441 165.1162929 176.4652448 185.5588543 198.7946224 215.0701488 217.7612779 222.0773803 234.3618887 242.3562869 252.2172212 256.6969575 262.4914672 267.2088180 272.9519733 279.2302351 290.0460880 294.6865955 302.6216073 307.9679899 310.7690001 319.1823235 324.3873466 326.6711800 341.2540303 348.4146807 356.3506761 361.2764371 363.8900555 368.2177305 382.3629833 384.5660750 386.7071395 388.1451331 400.4241629 402.7755151 409.8554391 418.7888045 422.7277636 434.5888616 435.4379406 441.3398750 446.1429678 450.1742783 454.5028695 457.0703800 462.5350190 469.8052574 471.1177985 476.4922293 477.1816060 480.2409442 488.0521804 491.7753938 499.9374292 501.7070433 506.5223353 508.0219097 511.7914720 517.6132077 522.2552033 528.5939928 532.6550405 537.0886812 542.9559624 544.9809071 546.5187140 550.0905928 556.6706514 559.9275809 565.6429015 570.2855836 574.6435455 579.1643462 588.7778941 589.9923456 595.2698483 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8159 Rtb_to_modes> Number of blocs = 173 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.3221E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1040E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7842E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.1704E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5018E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8868E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3663E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7813E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1033 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1273 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4137 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5812 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6893 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7745 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.235 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.561 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.920 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.021 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.318 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.134 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.639 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.05 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99995 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00005 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003 0.99996 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00005 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99995 0.99998 1.00001 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00005 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 146862 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99995 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00005 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003 0.99996 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00005 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99995 0.99998 1.00001 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00005 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260408120827651569.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260408120827651569.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260408120827651569.atom Openam> file on opening on unit 11: 260408120827651569.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1028 First residue number = 1 Last residue number = 235 Number of atoms found = 8159 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.3221E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1040E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7842E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.1704E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5018E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8868E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3663E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7813E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1033 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1273 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4137 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5812 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6893 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7745 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.235 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.561 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.920 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.351 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.021 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.395 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.318 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.043 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.639 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.05 Bfactors> 106 vectors, 24477 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000732 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.124 for 1028 C-alpha atoms. Bfactors> = 5.364 +/- 8.15 Bfactors> = 67.341 +/- 38.69 Bfactors> Shiftng-fct= 61.978 Bfactors> Scaling-fct= 4.747 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260408120827651569.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260408120827651569.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.608 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.680 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7 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Chkmod> That is: 8159 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 11 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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structure for DQ=0 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260408120827651569 11 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260408120827651569.eigenfacs 260408120827651569.atom 260408120827651569.10.pdb 260408120827651569.11.pdb 260408120827651569.7.pdb 260408120827651569.8.pdb 260408120827651569.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m38.392s user 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