CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  TRANSFERASE 09-SEP-21 7VEJ  ***

LOGs for ID: 260409054632825425

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260409054632825425.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260409054632825425.atom to be opened. Openam> File opened: 260409054632825425.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 887 First residue number = 7 Last residue number = 485 Number of atoms found = 7157 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 6.986705 +/- 25.725740 From: -52.642000 To: 66.253000 = 6.658233 +/- 13.634852 From: -26.449000 To: 41.460000 = -37.876459 +/- 15.108290 From: -74.473000 To: -2.952000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1982 % Filled. Pdbmat> 2762027 non-zero elements. Pdbmat> 302170 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.44 +/- 22.27 Maximum number = 131 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 6.043400E+06 Pdbmat> Larger element = 521.342 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 887 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260409054632825425.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260409054632825425.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260409054632825425.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7157 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 887 residues. Blocpdb> 41 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 45 atoms in block 2 Block first atom: 42 Blocpdb> 37 atoms in block 3 Block first atom: 87 Blocpdb> 38 atoms in block 4 Block first atom: 124 Blocpdb> 43 atoms in block 5 Block first atom: 162 Blocpdb> 36 atoms in block 6 Block first atom: 205 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 241 Blocpdb> 37 atoms in block 8 Block first atom: 280 Blocpdb> 40 atoms in block 9 Block first atom: 317 Blocpdb> 22 atoms in block 10 Block first atom: 357 Blocpdb> 42 atoms in block 11 Block first atom: 379 Blocpdb> 46 atoms in block 12 Block first atom: 421 Blocpdb> 33 atoms in block 13 Block first atom: 467 Blocpdb> 34 atoms in block 14 Block first atom: 500 Blocpdb> 51 atoms in block 15 Block first atom: 534 Blocpdb> 29 atoms in block 16 Block first atom: 585 Blocpdb> 45 atoms in block 17 Block first atom: 614 Blocpdb> 35 atoms in block 18 Block first atom: 659 Blocpdb> 45 atoms in block 19 Block first atom: 694 Blocpdb> 42 atoms in block 20 Block first atom: 739 Blocpdb> 43 atoms in block 21 Block first atom: 781 Blocpdb> 34 atoms in block 22 Block first atom: 824 Blocpdb> 45 atoms in block 23 Block first atom: 858 Blocpdb> 40 atoms in block 24 Block first atom: 903 Blocpdb> 38 atoms in block 25 Block first atom: 943 Blocpdb> 41 atoms in block 26 Block first atom: 981 Blocpdb> 38 atoms in block 27 Block first atom: 1022 Blocpdb> 42 atoms in block 28 Block first atom: 1060 Blocpdb> 36 atoms in block 29 Block first atom: 1102 Blocpdb> 47 atoms in block 30 Block first atom: 1138 Blocpdb> 40 atoms in block 31 Block first atom: 1185 Blocpdb> 40 atoms in block 32 Block first atom: 1225 Blocpdb> 40 atoms in block 33 Block first atom: 1265 Blocpdb> 44 atoms in block 34 Block first atom: 1305 Blocpdb> 44 atoms in block 35 Block first atom: 1349 Blocpdb> 41 atoms in block 36 Block first atom: 1393 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1434 Blocpdb> 36 atoms in block 38 Block first atom: 1483 Blocpdb> 43 atoms in block 39 Block first atom: 1519 Blocpdb> 41 atoms in block 40 Block first atom: 1562 Blocpdb> 39 atoms in block 41 Block first atom: 1603 Blocpdb> 36 atoms in block 42 Block first atom: 1642 Blocpdb> 49 atoms in block 43 Block first atom: 1678 Blocpdb> 41 atoms in block 44 Block first atom: 1727 Blocpdb> 51 atoms in block 45 Block first atom: 1768 Blocpdb> 39 atoms in block 46 Block first atom: 1819 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 1858 Blocpdb> 35 atoms in block 48 Block first atom: 1899 Blocpdb> 11 atoms in block 49 Block first atom: 1934 Blocpdb> 42 atoms in block 50 Block first atom: 1945 Blocpdb> 45 atoms in block 51 Block first atom: 1987 Blocpdb> 41 atoms in block 52 Block first atom: 2032 Blocpdb> 41 atoms in block 53 Block first atom: 2073 Blocpdb> 33 atoms in block 54 Block first atom: 2114 Blocpdb> 39 atoms in block 55 Block first atom: 2147 Blocpdb> 46 atoms in block 56 Block first atom: 2186 Blocpdb> 35 atoms in block 57 Block first atom: 2232 Blocpdb> 33 atoms in block 58 Block first atom: 2267 Blocpdb> 54 atoms in block 59 Block first atom: 2300 Blocpdb> 43 atoms in block 60 Block first atom: 2354 Blocpdb> 44 atoms in block 61 Block first atom: 2397 Blocpdb> 40 atoms in block 62 Block first atom: 2441 Blocpdb> 39 atoms in block 63 Block first atom: 2481 Blocpdb> 39 atoms in block 64 Block first atom: 2520 Blocpdb> 40 atoms in block 65 Block first atom: 2559 Blocpdb> 36 atoms in block 66 Block first atom: 2599 Blocpdb> 40 atoms in block 67 Block first atom: 2635 Blocpdb> 38 atoms in block 68 Block first atom: 2675 Blocpdb> 36 atoms in block 69 Block first atom: 2713 Blocpdb> 30 atoms in block 70 Block first atom: 2749 Blocpdb> 43 atoms in block 71 Block first atom: 2779 Blocpdb> 42 atoms in block 72 Block first atom: 2822 Blocpdb> 49 atoms in block 73 Block first atom: 2864 Blocpdb> 40 atoms in block 74 Block first atom: 2913 Blocpdb> 36 atoms in block 75 Block first atom: 2953 Blocpdb> 31 atoms in block 76 Block first atom: 2989 Blocpdb> 49 atoms in block 77 Block first atom: 3020 Blocpdb> 38 atoms in block 78 Block first atom: 3069 Blocpdb> 41 atoms in block 79 Block first atom: 3107 Blocpdb> 36 atoms in block 80 Block first atom: 3148 Blocpdb> 44 atoms in block 81 Block first atom: 3184 Blocpdb> 33 atoms in block 82 Block first atom: 3228 Blocpdb> 46 atoms in block 83 Block first atom: 3261 Blocpdb> 42 atoms in block 84 Block first atom: 3307 Blocpdb> 45 atoms in block 85 Block first atom: 3349 Blocpdb> 39 atoms in block 86 Block first atom: 3394 Blocpdb> 32 atoms in block 87 Block first atom: 3433 Blocpdb> 33 atoms in block 88 Block first atom: 3465 Blocpdb> 42 atoms in block 89 Block first atom: 3498 Blocpdb> 37 atoms in block 90 Block first atom: 3540 Blocpdb> 41 atoms in block 91 Block first atom: 3577 Blocpdb> 45 atoms in block 92 Block first atom: 3618 Blocpdb> 37 atoms in block 93 Block first atom: 3663 Blocpdb> 38 atoms in block 94 Block first atom: 3700 Blocpdb> 43 atoms in block 95 Block first atom: 3738 Blocpdb> 36 atoms in block 96 Block first atom: 3781 Blocpdb> 39 atoms in block 97 Block first atom: 3817 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3856 Blocpdb> 40 atoms in block 99 Block first atom: 3893 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 3933 Blocpdb> 42 atoms in block 101 Block first atom: 3955 Blocpdb> 46 atoms in block 102 Block first atom: 3997 Blocpdb> 33 atoms in block 103 Block first atom: 4043 Blocpdb> 34 atoms in block 104 Block first atom: 4076 Blocpdb> 43 atoms in block 105 Block first atom: 4110 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 4153 Blocpdb> 45 atoms in block 107 Block first atom: 4182 Blocpdb> 35 atoms in block 108 Block first atom: 4227 Blocpdb> 45 atoms in block 109 Block first atom: 4262 Blocpdb> 42 atoms in block 110 Block first atom: 4307 Blocpdb> 43 atoms in block 111 Block first atom: 4349 Blocpdb> 34 atoms in block 112 Block first atom: 4392 Blocpdb> 45 atoms in block 113 Block first atom: 4426 Blocpdb> 40 atoms in block 114 Block first atom: 4471 Blocpdb> 38 atoms in block 115 Block first atom: 4511 Blocpdb> 41 atoms in block 116 Block first atom: 4549 Blocpdb> 38 atoms in block 117 Block first atom: 4590 Blocpdb> 42 atoms in block 118 Block first atom: 4628 Blocpdb> 36 atoms in block 119 Block first atom: 4670 Blocpdb> 47 atoms in block 120 Block first atom: 4706 Blocpdb> 40 atoms in block 121 Block first atom: 4753 Blocpdb> 40 atoms in block 122 Block first atom: 4793 Blocpdb> 40 atoms in block 123 Block first atom: 4833 Blocpdb> 44 atoms in block 124 Block first atom: 4873 Blocpdb> 44 atoms in block 125 Block first atom: 4917 Blocpdb> 41 atoms in block 126 Block first atom: 4961 Blocpdb> 49 atoms in block 127 Block first atom: 5002 Blocpdb> 36 atoms in block 128 Block first atom: 5051 Blocpdb> 43 atoms in block 129 Block first atom: 5087 Blocpdb> 41 atoms in block 130 Block first atom: 5130 Blocpdb> 39 atoms in block 131 Block first atom: 5171 Blocpdb> 36 atoms in block 132 Block first atom: 5210 Blocpdb> 49 atoms in block 133 Block first atom: 5246 Blocpdb> 41 atoms in block 134 Block first atom: 5295 Blocpdb> 51 atoms in block 135 Block first atom: 5336 Blocpdb> 39 atoms in block 136 Block first atom: 5387 Blocpdb> 41 atoms in block 137 Block first atom: 5426 Blocpdb> 35 atoms in block 138 Block first atom: 5467 Blocpdb> 11 atoms in block 139 Block first atom: 5502 Blocpdb> 42 atoms in block 140 Block first atom: 5513 Blocpdb> 45 atoms in block 141 Block first atom: 5555 Blocpdb> 41 atoms in block 142 Block first atom: 5600 Blocpdb> 41 atoms in block 143 Block first atom: 5641 Blocpdb> 33 atoms in block 144 Block first atom: 5682 Blocpdb> 39 atoms in block 145 Block first atom: 5715 Blocpdb> 46 atoms in block 146 Block first atom: 5754 Blocpdb> 35 atoms in block 147 Block first atom: 5800 Blocpdb> 33 atoms in block 148 Block first atom: 5835 Blocpdb> 54 atoms in block 149 Block first atom: 5868 Blocpdb> 43 atoms in block 150 Block first atom: 5922 Blocpdb> 44 atoms in block 151 Block first atom: 5965 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 6009 Blocpdb> 39 atoms in block 153 Block first atom: 6049 Blocpdb> 39 atoms in block 154 Block first atom: 6088 Blocpdb> 40 atoms in block 155 Block first atom: 6127 Blocpdb> 36 atoms in block 156 Block first atom: 6167 Blocpdb> 40 atoms in block 157 Block first atom: 6203 Blocpdb> 38 atoms in block 158 Block first atom: 6243 Blocpdb> 36 atoms in block 159 Block first atom: 6281 Blocpdb> 30 atoms in block 160 Block first atom: 6317 Blocpdb> 43 atoms in block 161 Block first atom: 6347 Blocpdb> 42 atoms in block 162 Block first atom: 6390 Blocpdb> 49 atoms in block 163 Block first atom: 6432 Blocpdb> 40 atoms in block 164 Block first atom: 6481 Blocpdb> 36 atoms in block 165 Block first atom: 6521 Blocpdb> 31 atoms in block 166 Block first atom: 6557 Blocpdb> 49 atoms in block 167 Block first atom: 6588 Blocpdb> 38 atoms in block 168 Block first atom: 6637 Blocpdb> 41 atoms in block 169 Block first atom: 6675 Blocpdb> 36 atoms in block 170 Block first atom: 6716 Blocpdb> 44 atoms in block 171 Block first atom: 6752 Blocpdb> 33 atoms in block 172 Block first atom: 6796 Blocpdb> 46 atoms in block 173 Block first atom: 6829 Blocpdb> 42 atoms in block 174 Block first atom: 6875 Blocpdb> 53 atoms in block 175 Block first atom: 6917 Blocpdb> 39 atoms in block 176 Block first atom: 6970 Blocpdb> 32 atoms in block 177 Block first atom: 7009 Blocpdb> 33 atoms in block 178 Block first atom: 7041 Blocpdb> 42 atoms in block 179 Block first atom: 7074 Blocpdb> 42 atoms in block 180 Block first atom: 7115 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 54 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2762207 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 21471 Prepmat> Matrix trace = 6043400.0000 Prepmat> Last element read: 21471 21471 199.8116 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14679 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7157 RTB> Total mass = 7157.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7157 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 209375.5716 RTB> 55296 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 55296 Diagstd> Projected matrix trace = 209375.5716 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 209375.5716 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3149370 0.3962457 0.5901380 1.6373147 1.7359419 2.3088218 3.4533573 3.6106531 4.0179412 4.8286720 5.1690950 6.8756809 8.0021378 8.7421467 8.7889931 9.5077663 9.6637690 9.7290850 11.5131466 12.0031644 13.0775285 13.3348493 14.2090906 14.7443186 15.1333029 15.5253657 15.8272429 16.3495227 16.6586226 17.2750918 17.8943708 18.5650416 18.6607373 19.1921749 20.0318006 20.8511502 21.3647443 21.6360497 21.7708535 22.4845692 22.9150532 23.2850282 23.5753807 24.1798650 24.4563238 24.8536983 25.3489871 26.0375562 26.8318926 27.3924910 27.5434240 28.1293204 28.8168716 29.0746691 29.6644037 29.7709133 29.9275460 30.9500734 31.1796645 31.6518277 32.0955209 32.3763121 32.7463833 33.0291280 33.4185200 33.9458517 34.0687007 34.4862492 35.1234391 35.4551396 36.0071528 36.4664121 36.7847799 37.2456578 38.4677169 38.6970988 38.9630581 39.4551757 39.7731993 40.1389499 40.6413315 41.1057261 41.3484138 41.3982617 41.8596144 42.5601382 42.9477792 43.3313867 43.9277021 44.2200731 44.3650643 44.9124517 44.9644042 45.7202711 45.8161738 46.3303414 47.0182781 47.1817718 47.3834958 47.9741223 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034328 0.0034329 0.0034333 0.0034336 0.0034340 60.9406574 68.3561450 83.4203650 138.9509009 143.0747092 165.0024856 201.7976188 206.3422498 217.6692449 238.6212600 246.8894537 284.7430533 307.1837893 321.0733978 321.9325154 334.8378382 337.5736580 338.7125420 368.4616548 376.2211079 392.6974830 396.5421314 409.3345682 416.9727115 422.4371873 427.8742986 432.0140924 439.0842105 443.2153823 451.3417021 459.3603400 467.8894403 469.0937857 475.7265351 486.0212682 495.8613842 501.9311277 505.1080219 506.6791199 514.9173981 519.8232682 524.0028686 527.2597724 533.9765878 537.0205046 541.3657693 546.7333741 554.1092372 562.4979368 568.3436919 569.9073316 575.9368941 582.9330734 585.5347452 591.4432660 592.5040993 594.0607147 604.1240458 606.3606348 610.9345364 615.2016546 617.8868739 621.4081585 624.0851295 627.7531296 632.6865979 633.8304010 637.7027086 643.5670441 646.5987788 651.6128961 655.7552825 658.6115777 662.7246198 673.5091276 675.5142011 677.8315793 682.0987777 684.8422466 687.9839130 692.2759503 696.2199153 698.2721283 698.6929051 702.5753235 708.4297571 711.6486603 714.8198007 719.7215768 722.1127419 723.2956247 727.7440471 728.1648348 734.2596766 735.0293634 739.1422550 744.6096157 745.9030842 747.4959253 752.1401968 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7157 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3149 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5901 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.637 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.453 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.018 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.829 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.002 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.664 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.729 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.97 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 128826 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260409054632825425.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260409054632825425.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260409054632825425.atom Openam> file on opening on unit 11: 260409054632825425.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 887 First residue number = 7 Last residue number = 485 Number of atoms found = 7157 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3149 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.637 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.453 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.018 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.829 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.664 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.729 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.97 Bfactors> 106 vectors, 21471 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.314900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.616 for 891 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.029 +/- 0.02 Bfactors> = 37.318 +/- 14.04 Bfactors> Shiftng-fct= 37.289 Bfactors> Scaling-fct= 785.418 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260409054632825425.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260409054632825425.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.1 Chkmod> 106 vectors, 21471 coordinates in file. Chkmod> That is: 7157 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9022 0.0034 0.9254 0.0034 0.9096 0.0034 0.8607 0.0034 0.7187 0.0034 0.9051 60.9345 0.7179 68.3493 0.7640 83.4141 0.6289 138.9316 0.8512 143.0710 0.8073 165.0018 0.7007 201.7785 0.5894 206.3433 0.4980 217.6615 0.5574 238.6191 0.5711 246.8766 0.5703 284.7374 0.6124 307.1680 0.3100 321.0569 0.4013 321.9188 0.3931 334.8276 0.3895 337.5632 0.3800 338.6965 0.3584 368.3955 0.6051 376.1554 0.6206 392.7177 0.6925 396.4530 0.6312 409.3301 0.5769 416.8937 0.5512 422.3730 0.5105 427.9198 0.3387 432.0332 0.4172 439.0718 0.4481 443.2147 0.3495 451.3864 0.4312 459.2845 0.2661 467.9318 0.2428 469.0644 0.2984 475.6792 0.2362 485.9786 0.4682 495.8264 0.4633 501.8539 0.4992 505.1324 0.3629 506.6474 0.4370 514.8430 0.3789 519.8571 0.4574 524.0363 0.2849 527.2888 0.2413 533.9552 0.2915 537.0378 0.2223 541.3023 0.3896 546.7208 0.3391 554.1115 0.3644 562.4540 0.1929 568.2935 0.2646 569.8474 0.4912 575.9191 0.5218 582.9397 0.3435 585.4626 0.3565 591.3740 0.3802 592.4696 0.3996 594.0596 0.2719 604.0974 0.3441 606.3379 0.3744 610.8907 0.3372 615.2182 0.3453 617.8955 0.3685 621.4158 0.4415 624.0666 0.3787 627.7401 0.3393 632.6981 0.2920 633.8153 0.4613 637.7100 0.3598 643.5079 0.3683 646.6153 0.4839 651.6107 0.3283 655.7594 0.4940 658.5405 0.4355 662.7348 0.4551 673.5002 0.3903 675.5105 0.4238 677.7759 0.4873 682.1112 0.4780 684.7853 0.4689 687.9634 0.2680 692.2349 0.4708 696.2262 0.4793 698.2555 0.5095 698.6776 0.4588 702.5484 0.4905 708.3982 0.4880 711.6365 0.2292 714.7777 0.4089 719.7095 0.4537 722.0811 0.4425 723.3048 0.4288 727.6929 0.4053 728.0979 0.4659 734.2260 0.2694 735.0285 0.3146 739.1078 0.3559 744.5913 0.4161 745.8571 0.3463 747.4363 0.3349 752.0756 0.4011 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260409054632825425 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom making animated gifs 11 models are in 260409054632825425.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260409054632825425 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom making animated gifs 11 models are in 260409054632825425.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260409054632825425 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom making animated gifs 11 models are in 260409054632825425.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260409054632825425 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom making animated gifs 11 models are in 260409054632825425.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260409054632825425 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260409054632825425.eigenfacs 260409054632825425.atom making animated gifs 11 models are in 260409054632825425.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260409054632825425.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260409054632825425.10.pdb 260409054632825425.11.pdb 260409054632825425.7.pdb 260409054632825425.8.pdb 260409054632825425.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m36.674s user 0m36.372s sys 0m0.268s rm: cannot remove '260409054632825425.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.