*** 6N31 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260409122435875849.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260409122435875849.atom to be opened.
Openam> File opened: 260409122435875849.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 308
First residue number = 94
Last residue number = 415
Number of atoms found = 4556
Mean number per residue = 14.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.005601 +/- 10.625092 From: -28.064000 To: 23.521000
= -28.028114 +/- 10.275779 From: -54.420000 To: -3.271000
= -25.238833 +/- 10.654273 From: -50.345000 To: -0.955000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.7159 % Filled.
Pdbmat> 3471150 non-zero elements.
Pdbmat> 382701 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 168.00 +/- 49.83
Maximum number = 253
Minimum number = 32
Pdbmat> Matrix trace = 7.654020E+06
Pdbmat> Larger element = 881.223
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
308 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260409122435875849.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260409122435875849.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260409122435875849.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4556 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 308 residues.
Blocpdb> 31 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 28 atoms in block 2
Block first atom: 32
Blocpdb> 37 atoms in block 3
Block first atom: 60
Blocpdb> 29 atoms in block 4
Block first atom: 97
Blocpdb> 36 atoms in block 5
Block first atom: 126
Blocpdb> 30 atoms in block 6
Block first atom: 162
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 192
Blocpdb> 29 atoms in block 8
Block first atom: 222
Blocpdb> 25 atoms in block 9
Block first atom: 251
Blocpdb> 37 atoms in block 10
Block first atom: 276
Blocpdb> 38 atoms in block 11
Block first atom: 313
Blocpdb> 21 atoms in block 12
Block first atom: 351
Blocpdb> 32 atoms in block 13
Block first atom: 372
Blocpdb> 30 atoms in block 14
Block first atom: 404
Blocpdb> 25 atoms in block 15
Block first atom: 434
Blocpdb> 43 atoms in block 16
Block first atom: 459
Blocpdb> 35 atoms in block 17
Block first atom: 502
Blocpdb> 34 atoms in block 18
Block first atom: 537
Blocpdb> 29 atoms in block 19
Block first atom: 571
Blocpdb> 30 atoms in block 20
Block first atom: 600
Blocpdb> 31 atoms in block 21
Block first atom: 630
Blocpdb> 35 atoms in block 22
Block first atom: 661
Blocpdb> 24 atoms in block 23
Block first atom: 696
Blocpdb> 26 atoms in block 24
Block first atom: 720
Blocpdb> 32 atoms in block 25
Block first atom: 746
Blocpdb> 34 atoms in block 26
Block first atom: 778
Blocpdb> 26 atoms in block 27
Block first atom: 812
Blocpdb> 40 atoms in block 28
Block first atom: 838
Blocpdb> 31 atoms in block 29
Block first atom: 878
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 909
Blocpdb> 20 atoms in block 31
Block first atom: 929
Blocpdb> 30 atoms in block 32
Block first atom: 949
Blocpdb> 38 atoms in block 33
Block first atom: 979
Blocpdb> 21 atoms in block 34
Block first atom: 1017
Blocpdb> 28 atoms in block 35
Block first atom: 1038
Blocpdb> 29 atoms in block 36
Block first atom: 1066
Blocpdb> 33 atoms in block 37
Block first atom: 1095
Blocpdb> 38 atoms in block 38
Block first atom: 1128
Blocpdb> 39 atoms in block 39
Block first atom: 1166
Blocpdb> 38 atoms in block 40
Block first atom: 1205
Blocpdb> 25 atoms in block 41
Block first atom: 1243
Blocpdb> 23 atoms in block 42
Block first atom: 1268
Blocpdb> 28 atoms in block 43
Block first atom: 1291
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 1319
Blocpdb> 36 atoms in block 45
Block first atom: 1338
Blocpdb> 22 atoms in block 46
Block first atom: 1374
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 1396
Blocpdb> 27 atoms in block 48
Block first atom: 1421
Blocpdb> 18 atoms in block 49
Block first atom: 1448
Blocpdb> 28 atoms in block 50
Block first atom: 1466
Blocpdb> 30 atoms in block 51
Block first atom: 1494
Blocpdb> 26 atoms in block 52
Block first atom: 1524
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 1550
Blocpdb> 18 atoms in block 54
Block first atom: 1569
Blocpdb> 29 atoms in block 55
Block first atom: 1587
Blocpdb> 31 atoms in block 56
Block first atom: 1616
Blocpdb> 18 atoms in block 57
Block first atom: 1647
Blocpdb> 35 atoms in block 58
Block first atom: 1665
Blocpdb> 30 atoms in block 59
Block first atom: 1700
Blocpdb> 36 atoms in block 60
Block first atom: 1730
Blocpdb> 41 atoms in block 61
Block first atom: 1766
Blocpdb> 35 atoms in block 62
Block first atom: 1807
Blocpdb> 30 atoms in block 63
Block first atom: 1842
Blocpdb> 28 atoms in block 64
Block first atom: 1872
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1900
Blocpdb> 24 atoms in block 66
Block first atom: 1918
Blocpdb> 26 atoms in block 67
Block first atom: 1942
Blocpdb> 36 atoms in block 68
Block first atom: 1968
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 2004
Blocpdb> 38 atoms in block 70
Block first atom: 2030
Blocpdb> 28 atoms in block 71
Block first atom: 2068
Blocpdb> 35 atoms in block 72
Block first atom: 2096
Blocpdb> 33 atoms in block 73
Block first atom: 2131
Blocpdb> 18 atoms in block 74
Block first atom: 2164
Blocpdb> 34 atoms in block 75
Block first atom: 2182
Blocpdb> 23 atoms in block 76
Block first atom: 2216
Blocpdb> 27 atoms in block 77
Block first atom: 2239
Blocpdb> 27 atoms in block 78
Block first atom: 2266
Blocpdb> 43 atoms in block 79
Block first atom: 2293
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 2336
Blocpdb> 25 atoms in block 81
Block first atom: 2359
Blocpdb> 34 atoms in block 82
Block first atom: 2384
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 2418
Blocpdb> 21 atoms in block 84
Block first atom: 2440
Blocpdb> 36 atoms in block 85
Block first atom: 2461
Blocpdb> 31 atoms in block 86
Block first atom: 2497
Blocpdb> 43 atoms in block 87
Block first atom: 2528
Blocpdb> 40 atoms in block 88
Block first atom: 2571
Blocpdb> 20 atoms in block 89
Block first atom: 2611
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 2631
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 2647
Blocpdb> 34 atoms in block 92
Block first atom: 2663
Blocpdb> 25 atoms in block 93
Block first atom: 2697
Blocpdb> 33 atoms in block 94
Block first atom: 2722
Blocpdb> 21 atoms in block 95
Block first atom: 2755
Blocpdb> 38 atoms in block 96
Block first atom: 2776
Blocpdb> 34 atoms in block 97
Block first atom: 2814
Blocpdb> 30 atoms in block 98
Block first atom: 2848
Blocpdb> 32 atoms in block 99
Block first atom: 2878
Blocpdb> 25 atoms in block 100
Block first atom: 2910
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 2935
Blocpdb> 36 atoms in block 102
Block first atom: 2965
Blocpdb> 29 atoms in block 103
Block first atom: 3001
Blocpdb> 18 atoms in block 104
Block first atom: 3030
Blocpdb> 25 atoms in block 105
Block first atom: 3048
Blocpdb> 36 atoms in block 106
Block first atom: 3073
Blocpdb> 36 atoms in block 107
Block first atom: 3109
Blocpdb> 43 atoms in block 108
Block first atom: 3145
Blocpdb> 36 atoms in block 109
Block first atom: 3188
Blocpdb> 38 atoms in block 110
Block first atom: 3224
Blocpdb> 23 atoms in block 111
Block first atom: 3262
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 3285
Blocpdb> 20 atoms in block 113
Block first atom: 3304
Blocpdb> 27 atoms in block 114
Block first atom: 3324
Blocpdb> 30 atoms in block 115
Block first atom: 3351
Blocpdb> 33 atoms in block 116
Block first atom: 3381
Blocpdb> 28 atoms in block 117
Block first atom: 3414
Blocpdb> 21 atoms in block 118
Block first atom: 3442
Blocpdb> 40 atoms in block 119
Block first atom: 3463
Blocpdb> 25 atoms in block 120
Block first atom: 3503
Blocpdb> 38 atoms in block 121
Block first atom: 3528
Blocpdb> 35 atoms in block 122
Block first atom: 3566
Blocpdb> 22 atoms in block 123
Block first atom: 3601
Blocpdb> 26 atoms in block 124
Block first atom: 3623
Blocpdb> 34 atoms in block 125
Block first atom: 3649
Blocpdb> 38 atoms in block 126
Block first atom: 3683
Blocpdb> 18 atoms in block 127
Block first atom: 3721
Blocpdb> 30 atoms in block 128
Block first atom: 3739
Blocpdb> 26 atoms in block 129
Block first atom: 3769
Blocpdb> 35 atoms in block 130
Block first atom: 3795
Blocpdb> 41 atoms in block 131
Block first atom: 3830
Blocpdb> 36 atoms in block 132
Block first atom: 3871
Blocpdb> 38 atoms in block 133
Block first atom: 3907
Blocpdb> 20 atoms in block 134
Block first atom: 3945
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 3965
Blocpdb> 33 atoms in block 136
Block first atom: 3984
Blocpdb> 33 atoms in block 137
Block first atom: 4017
Blocpdb> 29 atoms in block 138
Block first atom: 4050
Blocpdb> 27 atoms in block 139
Block first atom: 4079
Blocpdb> 27 atoms in block 140
Block first atom: 4106
Blocpdb> 34 atoms in block 141
Block first atom: 4133
Blocpdb> 30 atoms in block 142
Block first atom: 4167
Blocpdb> 28 atoms in block 143
Block first atom: 4197
Blocpdb> 38 atoms in block 144
Block first atom: 4225
Blocpdb> 26 atoms in block 145
Block first atom: 4263
Blocpdb> 26 atoms in block 146
Block first atom: 4289
Blocpdb> 38 atoms in block 147
Block first atom: 4315
Blocpdb> 18 atoms in block 148
Block first atom: 4353
Blocpdb> 17 atoms in block 149
Block first atom: 4371
Blocpdb> 26 atoms in block 150
Block first atom: 4388
Blocpdb> 41 atoms in block 151
Block first atom: 4414
Blocpdb> 32 atoms in block 152
Block first atom: 4455
Blocpdb> 45 atoms in block 153
Block first atom: 4487
Blocpdb> 25 atoms in block 154
Block first atom: 4531
Blocpdb> 154 blocks.
Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3471304 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13668
Prepmat> Matrix trace = 7654020.0000
Prepmat> Last element read: 13668 13668 153.4279
Prepmat> 11936 lines saved.
Prepmat> 9809 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4556
RTB> Total mass = 4556.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4556
RTB> Number of blocks = 154
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 440137.3937
RTB> 74226 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 924
Diagstd> Nb of non-zero elements: 74226
Diagstd> Projected matrix trace = 440137.3937
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 924 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 440137.3937
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 10.3830370 12.0723763 21.7913058 22.6638803
24.7306359 25.9110027 29.2032334 35.3506244 36.7976138
37.3173018 42.8384042 43.6295089 44.6512171 47.8641882
50.0322215 52.9095745 56.9208722 59.2991150 62.1308185
64.2983212 66.1801923 66.9623103 69.5309281 71.1052858
72.1710366 75.6361526 77.7216597 79.6543635 80.9059232
82.4629403 85.2050146 86.3393520 88.1800088 92.1262595
93.9317062 94.8123477 97.2615458 99.0144363 100.4709495
103.1914496 103.7912159 107.6478977 108.8152148 109.9106619
112.3106695 112.6558053 114.7478457 116.9046654 118.9024109
119.6426707 120.6616189 122.2662164 125.3393271 126.6598148
127.4517886 129.0581930 129.4709627 131.2800825 133.2068712
134.0033923 135.0764615 136.0028793 137.8094339 138.6017688
140.6356205 141.2488542 142.2408211 143.6057114 148.3317797
148.7988211 150.3957837 150.8862422 152.5734497 154.7036486
155.7190384 156.3673319 158.3478512 160.3128024 160.7731175
163.1457638 165.5963233 166.0160470 166.6559115 168.2841171
168.8948472 169.8569537 171.4046563 172.3150365 173.7275733
174.4856422 175.3136551 175.9225630 176.4144638 178.8429478
179.9223696 181.9686191 183.5877311 184.3017562 185.9943181
186.2379239
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034319 0.0034322 0.0034324 0.0034325 0.0034346
0.0034375 349.9109084 377.3042202 506.9170607 516.9665150
540.0238268 552.7609951 586.8278947 645.6450483 658.7264598
663.3617070 710.7419060 717.2745841 725.6244886 751.2779267
768.1042596 789.8823591 819.2775478 836.2177585 855.9508304
870.7532360 883.4038602 888.6085649 905.4913238 915.6852604
922.5220425 944.4087344 957.3402386 969.1702311 976.7545415
986.1084683 1002.3695332 1009.0197631 1019.7186190 1042.2862283
1052.4497898 1057.3718170 1070.9417859 1080.5491846 1088.4676689
1103.1057210 1106.3067959 1126.6734404 1132.7657050 1138.4532257
1150.8157272 1152.5826252 1163.2352404 1174.1165285 1184.1060786
1187.7863492 1192.8335736 1200.7387237 1215.7351113 1222.1224011
1225.9372680 1233.6389422 1235.6101549 1244.2129029 1253.3102576
1257.0518067 1262.0748660 1266.3954216 1274.7785716 1278.4379871
1287.7837691 1290.5883696 1295.1122334 1301.3111072 1322.5508654
1324.6313385 1331.7205789 1333.8902607 1341.3272979 1350.6585074
1355.0837488 1357.9015786 1366.4739834 1374.9261857 1376.8987219
1387.0214615 1397.3996342 1399.1694519 1401.8632213 1408.6945829
1411.2484573 1415.2623254 1421.6954977 1425.4660176 1431.2966571
1434.4160248 1437.8154716 1440.3102525 1442.3224878 1452.2159089
1456.5918023 1464.8512634 1471.3537739 1474.2122548 1480.9661051
1481.9356341
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4556
Rtb_to_modes> Number of blocs = 154
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9882E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9911E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0020E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 156.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 163.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 165.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 166.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 166.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 169.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 171.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 173.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 174.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 175.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 175.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 176.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 178.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 179.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 182.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 183.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 184.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 186.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 186.2
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 924 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 1.00003
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002
0.99998 1.00003 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 82008 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 1.00003
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002
0.99998 1.00003 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998
1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260409122435875849.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260409122435875849.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260409122435875849.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260409122435875849.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 308
First residue number = 94
Last residue number = 415
Number of atoms found = 4556
Mean number per residue = 14.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9882E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9911E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0020E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.2
Bfactors> 106 vectors, 13668 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 10.380000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.004 +/- 0.00
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.004
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260409122435875849.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260409122435875849.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4372E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1188.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1222.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1234.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1236.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1244.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1257.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1262.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1266.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1275.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1278.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1288.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1290.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1295.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1301.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1322.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1325.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1332.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1351.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1358.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1366.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1377.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1387.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1397.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1399.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1402.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1409.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1411.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1415.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1422.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1425.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1431.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1438.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1440.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1442.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1452.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1456.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1465.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1471.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1474.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1481.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1482.
Chkmod> 106 vectors, 13668 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4556 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8800
0.0034 0.7644
0.0034 0.9524
0.0034 0.7702
0.0034 0.8951
0.0034 0.9097
349.8447 0.5999
377.2509 0.5693
506.8801 0.8311
516.9001 0.7517
539.9937 0.5739
552.7266 0.5352
586.7702 0.3587
645.6116 0.5081
658.7195 0.4831
663.3572 0.2637
710.7246 0.6527
717.2478 0.6551
725.5835 0.4095
751.2128 0.5743
768.0542 0.4191
789.8516 0.5683
819.2361 0.3835
836.1881 0.4240
855.9084 0.3508
870.7272 0.2761
883.3647 0.4331
888.5551 0.1990
905.4464 0.3114
915.6763 0.4081
922.4758 0.4092
944.3922 0.5057
957.2889 0.3260
969.1021 0.5150
976.7372 0.4141
986.0486 0.3988
1002.3558 0.4479
1008.9802 0.4626
1019.6748 0.5810
1042.2626 0.3593
1052.3951 0.4390
1057.3133 0.4938
1070.8873 0.3490
1080.4786 0.4322
1088.5783 0.2984
1103.1041 0.2492
1106.3061 0.3547
1126.3744 0.3659
1132.6379 0.4612
1138.3491 0.2215
1150.7117 0.4297
1152.7592 0.4655
1162.9428 0.4005
1174.0427 0.2495
1184.0432 0.4024
1187.5235 0.3709
1192.9721 0.2634
1200.8530 0.4478
1215.4922 0.3366
1222.2638 0.3783
1226.1165 0.4277
1233.7858 0.3812
1235.6957 0.4103
1244.2539 0.2929
1253.2241 0.3883
1256.9819 0.3479
1262.1306 0.4469
1266.3277 0.3952
1274.6802 0.4457
1278.3749 0.5123
1287.5654 0.5146
1290.3098 0.4318
1294.8708 0.4386
1301.2294 0.4150
1322.3524 0.4524
1324.5797 0.5219
1331.6821 0.4985
1333.8938 0.4194
1341.3864 0.4128
1350.5846 0.4168
1354.9427 0.3914
1357.9851 0.3944
1366.2088 0.3924
1374.8123 0.4033
1376.9547 0.4752
1386.7674 0.3064
1397.3552 0.2475
1399.0418 0.3382
1401.9885 0.4281
1408.7006 0.3707
1411.2094 0.3934
1415.3809 0.3666
1421.6152 0.3497
1425.3426 0.3743
1431.1216 0.3435
1434.4135 0.4038
1437.6978 0.3107
1440.1561 0.3790
1442.2014 0.3770
1451.9792 0.3910
1456.4387 0.3073
1464.9147 0.4578
1471.3398 0.4384
1474.1419 0.2997
1480.9252 0.2811
1481.7211 0.4108
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260409122435875849 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
making animated gifs
11 models are in 260409122435875849.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260409122435875849 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
making animated gifs
11 models are in 260409122435875849.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260409122435875849 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
making animated gifs
11 models are in 260409122435875849.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260409122435875849 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
making animated gifs
11 models are in 260409122435875849.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260409122435875849 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409122435875849.eigenfacs
260409122435875849.atom
making animated gifs
11 models are in 260409122435875849.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409122435875849.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260409122435875849.10.pdb
260409122435875849.11.pdb
260409122435875849.7.pdb
260409122435875849.8.pdb
260409122435875849.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m20.362s
user 0m20.080s
sys 0m0.270s
rm: cannot remove '260409122435875849.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
