*** extreme_12 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260409131037910024.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260409131037910024.atom to be opened.
Openam> File opened: 260409131037910024.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 603
First residue number = 171
Last residue number = 773
Number of atoms found = 9668
Mean number per residue = 16.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 6.863384 +/- 13.465699 From: -22.981000 To: 43.357000
= -2.497650 +/- 13.795101 From: -40.250000 To: 29.094000
= -2.197577 +/- 16.779113 From: -41.862000 To: 34.841000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.6848 % Filled.
Pdbmat> 7086822 non-zero elements.
Pdbmat> 781145 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 161.59 +/- 43.88
Maximum number = 247
Minimum number = 26
Pdbmat> Matrix trace = 1.562290E+07
Pdbmat> Larger element = 1062.76
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
603 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260409131037910024.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260409131037910024.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260409131037910024.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 9668 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 603 residues.
Blocpdb> 76 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 54 atoms in block 2
Block first atom: 77
Blocpdb> 64 atoms in block 3
Block first atom: 131
Blocpdb> 75 atoms in block 4
Block first atom: 195
Blocpdb> 63 atoms in block 5
Block first atom: 270
Blocpdb> 74 atoms in block 6
Block first atom: 333
Blocpdb> 64 atoms in block 7
Block first atom: 407
Blocpdb> 83 atoms in block 8
Block first atom: 471
Blocpdb> 53 atoms in block 9
Block first atom: 554
Blocpdb> 59 atoms in block 10
Block first atom: 607
Blocpdb> 49 atoms in block 11
Block first atom: 666
Blocpdb> 74 atoms in block 12
Block first atom: 715
Blocpdb> 86 atoms in block 13
Block first atom: 789
Blocpdb> 76 atoms in block 14
Block first atom: 875
Blocpdb> 62 atoms in block 15
Block first atom: 951
Blocpdb> 60 atoms in block 16
Block first atom: 1013
Blocpdb> 78 atoms in block 17
Block first atom: 1073
Blocpdb> 80 atoms in block 18
Block first atom: 1151
Blocpdb> 62 atoms in block 19
Block first atom: 1231
Blocpdb> 66 atoms in block 20
Block first atom: 1293
Blocpdb> 60 atoms in block 21
Block first atom: 1359
Blocpdb> 60 atoms in block 22
Block first atom: 1419
Blocpdb> 78 atoms in block 23
Block first atom: 1479
Blocpdb> 64 atoms in block 24
Block first atom: 1557
Blocpdb> 56 atoms in block 25
Block first atom: 1621
Blocpdb> 55 atoms in block 26
Block first atom: 1677
Blocpdb> 56 atoms in block 27
Block first atom: 1732
Blocpdb> 78 atoms in block 28
Block first atom: 1788
Blocpdb> 89 atoms in block 29
Block first atom: 1866
Blocpdb> 66 atoms in block 30
Block first atom: 1955
Blocpdb> 74 atoms in block 31
Block first atom: 2021
Blocpdb> 69 atoms in block 32
Block first atom: 2095
Blocpdb> 58 atoms in block 33
Block first atom: 2164
Blocpdb> 51 atoms in block 34
Block first atom: 2222
Blocpdb> 80 atoms in block 35
Block first atom: 2273
Blocpdb> 65 atoms in block 36
Block first atom: 2353
Blocpdb> 68 atoms in block 37
Block first atom: 2418
Blocpdb> 51 atoms in block 38
Block first atom: 2486
Blocpdb> 62 atoms in block 39
Block first atom: 2537
Blocpdb> 70 atoms in block 40
Block first atom: 2599
Blocpdb> 69 atoms in block 41
Block first atom: 2669
Blocpdb> 70 atoms in block 42
Block first atom: 2738
Blocpdb> 76 atoms in block 43
Block first atom: 2808
Blocpdb> 82 atoms in block 44
Block first atom: 2884
Blocpdb> 69 atoms in block 45
Block first atom: 2966
Blocpdb> 69 atoms in block 46
Block first atom: 3035
Blocpdb> 75 atoms in block 47
Block first atom: 3104
Blocpdb> 66 atoms in block 48
Block first atom: 3179
Blocpdb> 77 atoms in block 49
Block first atom: 3245
Blocpdb> 59 atoms in block 50
Block first atom: 3322
Blocpdb> 57 atoms in block 51
Block first atom: 3381
Blocpdb> 46 atoms in block 52
Block first atom: 3438
Blocpdb> 63 atoms in block 53
Block first atom: 3484
Blocpdb> 50 atoms in block 54
Block first atom: 3547
Blocpdb> 66 atoms in block 55
Block first atom: 3597
Blocpdb> 69 atoms in block 56
Block first atom: 3663
Blocpdb> 72 atoms in block 57
Block first atom: 3732
Blocpdb> 58 atoms in block 58
Block first atom: 3804
Blocpdb> 75 atoms in block 59
Block first atom: 3862
Blocpdb> 52 atoms in block 60
Block first atom: 3937
Blocpdb> 63 atoms in block 61
Block first atom: 3989
Blocpdb> 66 atoms in block 62
Block first atom: 4052
Blocpdb> 60 atoms in block 63
Block first atom: 4118
Blocpdb> 51 atoms in block 64
Block first atom: 4178
Blocpdb> 71 atoms in block 65
Block first atom: 4229
Blocpdb> 52 atoms in block 66
Block first atom: 4300
Blocpdb> 51 atoms in block 67
Block first atom: 4352
Blocpdb> 64 atoms in block 68
Block first atom: 4403
Blocpdb> 62 atoms in block 69
Block first atom: 4467
Blocpdb> 68 atoms in block 70
Block first atom: 4529
Blocpdb> 80 atoms in block 71
Block first atom: 4597
Blocpdb> 67 atoms in block 72
Block first atom: 4677
Blocpdb> 72 atoms in block 73
Block first atom: 4744
Blocpdb> 65 atoms in block 74
Block first atom: 4816
Blocpdb> 57 atoms in block 75
Block first atom: 4881
Blocpdb> 53 atoms in block 76
Block first atom: 4938
Blocpdb> 56 atoms in block 77
Block first atom: 4991
Blocpdb> 59 atoms in block 78
Block first atom: 5047
Blocpdb> 75 atoms in block 79
Block first atom: 5106
Blocpdb> 65 atoms in block 80
Block first atom: 5181
Blocpdb> 61 atoms in block 81
Block first atom: 5246
Blocpdb> 64 atoms in block 82
Block first atom: 5307
Blocpdb> 44 atoms in block 83
Block first atom: 5371
Blocpdb> 57 atoms in block 84
Block first atom: 5415
Blocpdb> 59 atoms in block 85
Block first atom: 5472
Blocpdb> 68 atoms in block 86
Block first atom: 5531
Blocpdb> 71 atoms in block 87
Block first atom: 5599
Blocpdb> 72 atoms in block 88
Block first atom: 5670
Blocpdb> 47 atoms in block 89
Block first atom: 5742
Blocpdb> 67 atoms in block 90
Block first atom: 5789
Blocpdb> 59 atoms in block 91
Block first atom: 5856
Blocpdb> 52 atoms in block 92
Block first atom: 5915
Blocpdb> 62 atoms in block 93
Block first atom: 5967
Blocpdb> 60 atoms in block 94
Block first atom: 6029
Blocpdb> 62 atoms in block 95
Block first atom: 6089
Blocpdb> 66 atoms in block 96
Block first atom: 6151
Blocpdb> 55 atoms in block 97
Block first atom: 6217
Blocpdb> 74 atoms in block 98
Block first atom: 6272
Blocpdb> 63 atoms in block 99
Block first atom: 6346
Blocpdb> 58 atoms in block 100
Block first atom: 6409
Blocpdb> 65 atoms in block 101
Block first atom: 6467
Blocpdb> 63 atoms in block 102
Block first atom: 6532
Blocpdb> 72 atoms in block 103
Block first atom: 6595
Blocpdb> 60 atoms in block 104
Block first atom: 6667
Blocpdb> 69 atoms in block 105
Block first atom: 6727
Blocpdb> 52 atoms in block 106
Block first atom: 6796
Blocpdb> 87 atoms in block 107
Block first atom: 6848
Blocpdb> 60 atoms in block 108
Block first atom: 6935
Blocpdb> 69 atoms in block 109
Block first atom: 6995
Blocpdb> 50 atoms in block 110
Block first atom: 7064
Blocpdb> 49 atoms in block 111
Block first atom: 7114
Blocpdb> 70 atoms in block 112
Block first atom: 7163
Blocpdb> 59 atoms in block 113
Block first atom: 7233
Blocpdb> 57 atoms in block 114
Block first atom: 7292
Blocpdb> 75 atoms in block 115
Block first atom: 7349
Blocpdb> 83 atoms in block 116
Block first atom: 7424
Blocpdb> 55 atoms in block 117
Block first atom: 7507
Blocpdb> 73 atoms in block 118
Block first atom: 7562
Blocpdb> 81 atoms in block 119
Block first atom: 7635
Blocpdb> 48 atoms in block 120
Block first atom: 7716
Blocpdb> 49 atoms in block 121
Block first atom: 7764
Blocpdb> 80 atoms in block 122
Block first atom: 7813
Blocpdb> 67 atoms in block 123
Block first atom: 7893
Blocpdb> 70 atoms in block 124
Block first atom: 7960
Blocpdb> 60 atoms in block 125
Block first atom: 8030
Blocpdb> 64 atoms in block 126
Block first atom: 8090
Blocpdb> 72 atoms in block 127
Block first atom: 8154
Blocpdb> 64 atoms in block 128
Block first atom: 8226
Blocpdb> 68 atoms in block 129
Block first atom: 8290
Blocpdb> 56 atoms in block 130
Block first atom: 8358
Blocpdb> 67 atoms in block 131
Block first atom: 8414
Blocpdb> 66 atoms in block 132
Block first atom: 8481
Blocpdb> 62 atoms in block 133
Block first atom: 8547
Blocpdb> 66 atoms in block 134
Block first atom: 8609
Blocpdb> 36 atoms in block 135
Block first atom: 8675
Blocpdb> 48 atoms in block 136
Block first atom: 8711
Blocpdb> 50 atoms in block 137
Block first atom: 8759
Blocpdb> 51 atoms in block 138
Block first atom: 8809
Blocpdb> 70 atoms in block 139
Block first atom: 8860
Blocpdb> 52 atoms in block 140
Block first atom: 8930
Blocpdb> 72 atoms in block 141
Block first atom: 8982
Blocpdb> 58 atoms in block 142
Block first atom: 9054
Blocpdb> 64 atoms in block 143
Block first atom: 9112
Blocpdb> 55 atoms in block 144
Block first atom: 9176
Blocpdb> 72 atoms in block 145
Block first atom: 9231
Blocpdb> 67 atoms in block 146
Block first atom: 9303
Blocpdb> 64 atoms in block 147
Block first atom: 9370
Blocpdb> 64 atoms in block 148
Block first atom: 9434
Blocpdb> 60 atoms in block 149
Block first atom: 9498
Blocpdb> 55 atoms in block 150
Block first atom: 9558
Blocpdb> 56 atoms in block 151
Block first atom: 9612
Blocpdb> 151 blocks.
Blocpdb> At most, 89 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 36 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 7086973 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 29004
Prepmat> Matrix trace = 15622900.0000
Prepmat> Last element read: 29004 29004 320.1864
Prepmat> 11477 lines saved.
Prepmat> 9882 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9668
RTB> Total mass = 9668.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 9668
RTB> Number of blocks = 151
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 366026.2268
RTB> 55119 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 906
Diagstd> Nb of non-zero elements: 55119
Diagstd> Projected matrix trace = 366026.2268
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 906 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 366026.2268
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 4.7530894 4.8643705 6.3853174 9.8847640
12.1357567 12.6817849 13.5062982 14.6098229 16.2911706
19.6648161 20.2259937 20.8652974 21.7610787 22.8132878
27.5090214 28.2732781 29.8971037 32.3532783 33.0328342
34.1071341 35.4637424 36.0285652 38.1030696 38.7901715
41.3784821 42.6422981 43.9614595 44.1728772 44.9165358
46.1040885 48.0978813 49.5934563 50.4025543 51.1104547
52.0040339 53.1489945 54.0892776 56.0773468 57.3357916
59.2224936 59.5144298 60.8990247 62.6584008 63.4792436
64.7499048 65.8539820 66.9074078 67.3053247 68.1276824
70.6756623 71.9051540 73.5238833 74.4817543 75.9793841
77.4371993 78.9650555 80.6928133 81.4522935 81.9173121
83.5267012 84.5687008 85.0078042 86.0492846 87.3388843
88.3582138 89.8817315 90.4453132 92.0174136 93.6643376
94.5863150 96.2433414 96.8463274 97.9329570 98.4904465
100.3397966 101.0451246 103.1431153 103.4297679 105.7987247
105.8091591 106.5520786 107.2171864 107.6077005 109.6137262
110.6608135 111.0620144 111.6674220 115.1134637 115.8035848
117.0659126 118.0009383 119.0588240 120.0850862 121.3994764
122.1195751 123.2277183 123.6257259 125.2959561 126.7475571
126.9549173
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034303 0.0034317 0.0034338 0.0034340 0.0034343
0.0034346 236.7463400 239.5017017 274.4015283 341.4117260
378.2933533 386.7100611 399.0832014 415.0665699 438.2999550
481.5487117 488.3713902 496.0295728 506.5653617 518.6677195
569.5513049 577.4087529 593.7584995 617.6670402 624.1201423
634.1878165 646.6772188 651.8066150 670.3093268 676.3260726
698.5259710 709.1132184 719.9980688 721.7272850 727.7771354
737.3352556 753.1097209 764.7288396 770.9417285 776.3367632
783.0938197 791.6674825 798.6396559 813.1843447 822.2581501
835.6773380 837.7345340 847.4233943 859.5772912 865.1893240
873.8056478 881.2239673 888.2442045 890.8816060 896.3076183
912.9147496 920.8211599 931.1282407 937.1739944 946.5491389
955.5867053 964.9676468 975.4672852 980.0470797 982.8406878
992.4484208 998.6196552 1001.2088491 1007.3233759 1014.8435599
1020.7484856 1029.5110094 1032.7336162 1041.6703230 1050.9508682
1056.1106769 1065.3213397 1068.6533669 1074.6318652 1077.6862294
1087.7570044 1091.5734458 1102.8473462 1104.3787853 1116.9545371
1117.0096157 1120.9241947 1124.4172077 1126.4630630 1136.9143576
1142.3316496 1144.4005383 1147.5154068 1165.0869591 1168.5741689
1174.9259821 1179.6088184 1184.8846535 1189.9804248 1196.4751610
1200.0184478 1205.4507843 1207.3959302 1215.5247536 1222.5456340
1223.5452734
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9668
Rtb_to_modes> Number of blocs = 151
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9788E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9867E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.753
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.864
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.385
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.885
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.0
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 906 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
0.99999 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003
0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 0.99994 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00004 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
0.99998 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002
1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001
0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002
0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002
1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 174024 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
0.99999 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003
0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 0.99994 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00004 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
0.99998 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002
1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001
0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002
0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002
1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260409131037910024.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260409131037910024.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260409131037910024.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260409131037910024.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 603
First residue number = 171
Last residue number = 773
Number of atoms found = 9668
Mean number per residue = 16.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9788E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9867E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.385
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.885
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.0
Bfactors> 106 vectors, 29004 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.753000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.004 +/- 0.00
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.004
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260409131037910024.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260409131037910024.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1148.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1196.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1200.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1205.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1207.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1222.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1224.
Chkmod> 106 vectors, 29004 coordinates in file.
Chkmod> That is: 9668 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 32 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8550
0.0034 0.9516
0.0034 0.7921
0.0034 0.7915
0.0034 0.9748
0.0034 0.7210
236.7339 0.5727
239.4823 0.5667
274.3829 0.6792
341.4011 0.4382
378.3432 0.6231
386.6662 0.3993
399.1208 0.6801
415.0513 0.6022
438.2654 0.4852
481.4691 0.4414
488.3988 0.4000
496.0642 0.5510
506.5311 0.5315
518.6081 0.5761
569.5370 0.5508
577.3505 0.4386
593.7618 0.3412
617.6092 0.6112
624.0666 0.3145
634.1872 0.1646
646.6153 0.2307
651.7916 0.1537
670.2536 0.3837
676.2955 0.2911
698.5088 0.5828
709.0637 0.3277
719.9552 0.4590
721.6728 0.4368
727.7740 0.3975
737.2709 0.2621
753.0940 0.2155
764.6694 0.4354
770.8891 0.2661
776.3000 0.3425
783.0298 0.3574
791.6410 0.4233
798.6107 0.5665
813.1687 0.4528
822.2530 0.4159
835.6239 0.3874
837.6674 0.4141
847.3938 0.5224
859.5514 0.4206
865.1573 0.4386
873.7688 0.4162
881.1595 0.3077
888.2233 0.4822
890.8743 0.5370
896.2844 0.5135
912.9036 0.4230
920.8127 0.4518
931.0637 0.4949
937.1227 0.4327
946.5123 0.4739
955.5630 0.4235
964.9564 0.3767
975.4084 0.3881
979.9912 0.5076
982.8146 0.4443
992.4254 0.1641
998.5845 0.4050
1001.1788 0.4976
1007.2843 0.4830
1014.8065 0.4669
1020.7150 0.5688
1029.4569 0.3644
1032.7160 0.5022
1041.6402 0.5072
1050.8814 0.4947
1056.0859 0.4931
1065.2571 0.4810
1068.6278 0.4291
1074.5695 0.5252
1077.6375 0.5504
1087.4946 0.5080
1091.2828 0.4840
1102.5695 0.4934
1104.1724 0.5419
1116.9133 0.3705
1116.9133 0.4758
1121.1281 0.4490
1124.2788 0.5087
1126.3744 0.5288
1136.7944 0.5596
1142.4848 0.4984
1144.5471 0.5364
1147.6335 0.3887
1164.9688 0.4751
1168.5059 0.5029
1175.0466 0.3884
1179.5535 0.5359
1185.0387 0.5136
1190.0032 0.4816
1196.4264 0.5312
1199.8708 0.5131
1205.2635 0.4496
1207.2185 0.2985
1215.4922 0.5068
1222.2638 0.3455
1223.7100 0.1837
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 260409131037910024.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260409131037910024.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 260409131037910024.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260409131037910024.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 260409131037910024.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
260409131037910024.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1148.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1196.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1200.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1205.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1207.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1222.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1224.
Projmod> 106 vectors, 29004 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 603
First residue number = 171
Last residue number = 773
Number of atoms found = 9668
Mean number per residue = 16.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 603
First residue number = 171
Last residue number = 773
Number of atoms found = 9668
Mean number per residue = 16.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 9668 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 5.29
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.452 Sum= 0.205 q= -235.1550
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.190 Sum= 0.241 q= -98.5472
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.403 Sum= 0.403 q= 209.2437
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.498 Sum= 0.651 q= 258.8106
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.332 Sum= 0.761 q= 172.4615
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.231 Sum= 0.814 q= 120.0521
Vector: 7 F= 236.73 Cos= 0.080 Sum= 0.820 q= 41.4310
Vector: 8 F= 239.48 Cos= -0.010 Sum= 0.820 q= -5.3879
Vector: 9 F= 274.38 Cos= -0.038 Sum= 0.822 q= -19.9447
Vector: 10 F= 341.40 Cos= -0.012 Sum= 0.822 q= -6.1481
Vector: 11 F= 378.34 Cos= -0.125 Sum= 0.838 q= -65.2041
Vector: 12 F= 386.67 Cos= -0.001 Sum= 0.838 q= -0.6835
Vector: 13 F= 399.12 Cos= -0.001 Sum= 0.838 q= -0.5672
Vector: 14 F= 415.05 Cos= 0.040 Sum= 0.839 q= 20.7208
Vector: 15 F= 438.27 Cos= 0.087 Sum= 0.847 q= 45.2218
Vector: 16 F= 481.47 Cos= 0.058 Sum= 0.850 q= 29.9196
Vector: 17 F= 488.40 Cos= 0.092 Sum= 0.859 q= 48.0645
Vector: 18 F= 496.06 Cos= 0.014 Sum= 0.859 q= 7.2047
Vector: 19 F= 506.53 Cos= 0.038 Sum= 0.860 q= 19.6415
Vector: 20 F= 518.61 Cos= -0.005 Sum= 0.861 q= -2.7166
Vector: 21 F= 569.54 Cos= 0.055 Sum= 0.864 q= 28.5498
Vector: 22 F= 577.35 Cos= -0.053 Sum= 0.866 q= -27.6607
Vector: 23 F= 593.76 Cos= 0.015 Sum= 0.867 q= 8.0131
Vector: 24 F= 617.61 Cos= 0.003 Sum= 0.867 q= 1.3863
Vector: 25 F= 624.07 Cos= 0.022 Sum= 0.867 q= 11.6015
Vector: 26 F= 634.19 Cos= -0.034 Sum= 0.868 q= -17.4552
Vector: 27 F= 646.62 Cos= 0.007 Sum= 0.868 q= 3.7065
Vector: 28 F= 651.79 Cos= 0.035 Sum= 0.869 q= 18.0209
Vector: 29 F= 670.25 Cos= -0.014 Sum= 0.870 q= -7.4438
Vector: 30 F= 676.30 Cos= -0.014 Sum= 0.870 q= -7.4970
Vector: 31 F= 698.51 Cos= 0.021 Sum= 0.870 q= 11.1236
%Projmod-Wn> Eigenvector 32 Norm= 0.9999
Vector: 32 F= 709.06 Cos= 0.004 Sum= 0.870 q= 2.3239
Vector: 33 F= 719.96 Cos= 0.021 Sum= 0.871 q= 11.1592
Vector: 34 F= 721.67 Cos= -0.038 Sum= 0.872 q= -19.9669
Vector: 35 F= 727.77 Cos= 0.007 Sum= 0.872 q= 3.6772
Vector: 36 F= 737.27 Cos= 0.003 Sum= 0.872 q= 1.7230
Vector: 37 F= 753.09 Cos= 0.032 Sum= 0.873 q= 16.4951
Vector: 38 F= 764.67 Cos= 0.022 Sum= 0.874 q= 11.6849
Vector: 39 F= 770.89 Cos= 0.016 Sum= 0.874 q= 8.0899
Vector: 40 F= 776.30 Cos= 0.012 Sum= 0.874 q= 6.0268
Vector: 41 F= 783.03 Cos= -0.004 Sum= 0.874 q= -1.9049
Vector: 42 F= 791.64 Cos= -0.033 Sum= 0.875 q= -17.2647
Vector: 43 F= 798.61 Cos= 0.012 Sum= 0.876 q= 6.2232
Vector: 44 F= 813.17 Cos= -0.035 Sum= 0.877 q= -18.3119
Vector: 45 F= 822.25 Cos= -0.043 Sum= 0.879 q= -22.2889
Vector: 46 F= 835.62 Cos= 0.011 Sum= 0.879 q= 5.7528
Vector: 47 F= 837.67 Cos= -0.022 Sum= 0.879 q= -11.2615
Vector: 48 F= 847.39 Cos= -0.029 Sum= 0.880 q= -15.1540
Vector: 49 F= 859.55 Cos= 0.009 Sum= 0.880 q= 4.6690
Vector: 50 F= 865.16 Cos= -0.034 Sum= 0.881 q= -17.4437
Vector: 51 F= 873.77 Cos= -0.030 Sum= 0.882 q= -15.5588
Vector: 52 F= 881.16 Cos= -0.012 Sum= 0.882 q= -6.4193
Vector: 53 F= 888.22 Cos= 0.033 Sum= 0.883 q= 17.0440
Vector: 54 F= 890.87 Cos= -0.031 Sum= 0.884 q= -16.0752
Vector: 55 F= 896.28 Cos= 0.021 Sum= 0.885 q= 11.1465
Vector: 56 F= 912.90 Cos= 0.004 Sum= 0.885 q= 2.1525
Vector: 57 F= 920.81 Cos= 0.027 Sum= 0.886 q= 13.8987
Vector: 58 F= 931.06 Cos= 0.034 Sum= 0.887 q= 17.5340
Vector: 59 F= 937.12 Cos= -0.003 Sum= 0.887 q= -1.6737
Vector: 60 F= 946.51 Cos= -0.004 Sum= 0.887 q= -2.2504
Vector: 61 F= 955.56 Cos= -0.021 Sum= 0.887 q= -10.9070
Vector: 62 F= 964.96 Cos= 0.000 Sum= 0.887 q= 0.0664
Vector: 63 F= 975.41 Cos= -0.008 Sum= 0.887 q= -4.1099
Vector: 64 F= 979.99 Cos= 0.000 Sum= 0.887 q= 0.0784
Vector: 65 F= 982.81 Cos= 0.015 Sum= 0.887 q= 7.9543
Vector: 66 F= 992.43 Cos= 0.027 Sum= 0.888 q= 14.2573
Vector: 67 F= 998.58 Cos= -0.027 Sum= 0.889 q= -14.0798
Vector: 68 F= 1001.18 Cos= 0.016 Sum= 0.889 q= 8.1963
Vector: 69 F= 1007.28 Cos= -0.000 Sum= 0.889 q= -0.2185
Vector: 70 F= 1014.81 Cos= 0.007 Sum= 0.889 q= 3.6844
Vector: 71 F= 1020.71 Cos= 0.024 Sum= 0.890 q= 12.5609
Vector: 72 F= 1029.46 Cos= -0.002 Sum= 0.890 q= -1.2125
Vector: 73 F= 1032.72 Cos= -0.008 Sum= 0.890 q= -4.1885
Vector: 74 F= 1041.64 Cos= -0.000 Sum= 0.890 q= -0.0977
Vector: 75 F= 1050.88 Cos= 0.008 Sum= 0.890 q= 4.1895
Vector: 76 F= 1056.09 Cos= -0.010 Sum= 0.890 q= -5.3443
Vector: 77 F= 1065.26 Cos= 0.022 Sum= 0.891 q= 11.2272
Vector: 78 F= 1068.63 Cos= 0.027 Sum= 0.891 q= 14.2317
Vector: 79 F= 1074.57 Cos= -0.007 Sum= 0.891 q= -3.6518
Vector: 80 F= 1077.64 Cos= -0.001 Sum= 0.891 q= -0.4532
Vector: 81 F= 1087.49 Cos= 0.000 Sum= 0.891 q= 0.2202
Vector: 82 F= 1091.28 Cos= -0.006 Sum= 0.891 q= -3.1126
Vector: 83 F= 1102.57 Cos= 0.014 Sum= 0.892 q= 7.3222
Vector: 84 F= 1104.17 Cos= -0.013 Sum= 0.892 q= -6.6577
Vector: 85 F= 1116.91 Cos= 0.017 Sum= 0.892 q= 8.8601
Vector: 86 F= 1116.91 Cos= -0.001 Sum= 0.892 q= -0.3580
Vector: 87 F= 1121.13 Cos= -0.003 Sum= 0.892 q= -1.7198
Vector: 88 F= 1124.28 Cos= 0.007 Sum= 0.892 q= 3.4815
Vector: 89 F= 1126.37 Cos= 0.001 Sum= 0.892 q= 0.5741
Vector: 90 F= 1136.79 Cos= -0.001 Sum= 0.892 q= -0.6023
Vector: 91 F= 1142.48 Cos= -0.001 Sum= 0.892 q= -0.6882
Vector: 92 F= 1144.55 Cos= 0.014 Sum= 0.892 q= 7.3123
Vector: 93 F= 1147.63 Cos= -0.030 Sum= 0.893 q= -15.4964
Vector: 94 F= 1164.97 Cos= 0.023 Sum= 0.894 q= 11.9995
Vector: 95 F= 1168.51 Cos= 0.009 Sum= 0.894 q= 4.6381
Vector: 96 F= 1175.05 Cos= -0.005 Sum= 0.894 q= -2.8333
Vector: 97 F= 1179.55 Cos= -0.006 Sum= 0.894 q= -3.0823
Vector: 98 F= 1185.04 Cos= -0.014 Sum= 0.894 q= -7.0229
Vector: 99 F= 1190.00 Cos= 0.002 Sum= 0.894 q= 0.9814
Vector: 100 F= 1196.43 Cos= 0.010 Sum= 0.894 q= 5.3371
Vector: 101 F= 1199.87 Cos= -0.039 Sum= 0.896 q= -20.2192
Vector: 102 F= 1205.26 Cos= -0.020 Sum= 0.896 q= -10.4283
Vector: 103 F= 1207.22 Cos= -0.008 Sum= 0.896 q= -4.1309
Vector: 104 F= 1215.49 Cos= -0.016 Sum= 0.896 q= -8.2962
Vector: 105 F= 1222.26 Cos= -0.020 Sum= 0.897 q= -10.2438
Vector: 106 F= 1223.71 Cos= 0.025 Sum= 0.897 q= 13.0010
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003430
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 236.733950
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.50 for mode 4 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.248 0.615 0.814 0.846 0.859 0.897
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260409131037910024 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
making animated gifs
11 models are in 260409131037910024.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 603 2.196 540 1.749
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 603 2.068 554 1.656
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 603 1.953 564 1.563
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 603 1.852 567 1.456
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 603 1.768 569 1.366
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 603 1.703 571 1.301
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 603 1.660 572 1.261
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 603 1.639 573 1.250
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 603 1.643 573 1.265
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 603 1.671 569 1.288
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 603 1.722 568 1.353
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260409131037910024 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
making animated gifs
11 models are in 260409131037910024.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 603 1.945 560 1.524
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 603 1.858 563 1.438
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 603 1.788 564 1.365
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 603 1.738 566 1.317
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 603 1.709 571 1.308
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 603 1.703 571 1.301
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 603 1.719 571 1.325
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 603 1.757 568 1.362
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 603 1.816 563 1.415
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 603 1.894 562 1.505
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 603 1.988 554 1.582
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260409131037910024 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
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260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
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260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
making animated gifs
11 models are in 260409131037910024.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 603 1.859 558 1.427
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 603 1.786 564 1.368
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 603 1.732 566 1.313
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 603 1.700 570 1.292
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 603 1.690 571 1.284
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 603 1.703 571 1.301
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 603 1.739 570 1.340
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 603 1.795 573 1.422
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 603 1.871 572 1.506
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 603 1.964 564 1.581
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 603 2.072 561 1.685
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260409131037910024 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
making animated gifs
11 models are in 260409131037910024.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 603 1.941 554 1.451
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 603 1.855 560 1.402
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 603 1.787 565 1.359
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 603 1.737 570 1.332
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 603 1.709 571 1.307
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 603 1.703 571 1.301
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 603 1.719 570 1.316
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 603 1.757 566 1.337
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 603 1.815 563 1.381
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 603 1.892 557 1.428
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 603 1.984 552 1.497
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260409131037910024 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409131037910024.eigenfacs
260409131037910024.atom
making animated gifs
11 models are in 260409131037910024.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409131037910024.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 603 1.675 572 1.285
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 603 1.633 573 1.235
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 603 1.615 572 1.204
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 603 1.621 572 1.209
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 603 1.651 571 1.240
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 603 1.703 571 1.301
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 603 1.776 567 1.371
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 603 1.867 562 1.451
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 603 1.974 553 1.527
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 603 2.094 542 1.604
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 603 2.225 532 1.688
260409131037910024.10.pdb
260409131037910024.11.pdb
260409131037910024.7.pdb
260409131037910024.8.pdb
260409131037910024.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m1.140s
user 1m0.303s
sys 0m0.777s
rm: cannot remove '260409131037910024.sdijf': No such file or directory
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