*** extreme1 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260409133102922495.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260409133102922495.atom to be opened.
Openam> File opened: 260409133102922495.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 633
First residue number = 171
Last residue number = 803
Number of atoms found = 9997
Mean number per residue = 15.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 2.563743 +/- 15.473357 From: -38.017000 To: 39.320000
= 5.844295 +/- 11.362247 From: -22.677000 To: 33.872000
= 4.064138 +/- 17.054783 From: -31.233000 To: 45.695000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.6325 % Filled.
Pdbmat> 7342057 non-zero elements.
Pdbmat> 809297 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 161.91 +/- 44.51
Maximum number = 249
Minimum number = 29
Pdbmat> Matrix trace = 1.618594E+07
Pdbmat> Larger element = 885.378
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
633 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260409133102922495.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260409133102922495.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260409133102922495.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 9997 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 633 residues.
Blocpdb> 74 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 55 atoms in block 2
Block first atom: 75
Blocpdb> 59 atoms in block 3
Block first atom: 130
Blocpdb> 83 atoms in block 4
Block first atom: 189
Blocpdb> 61 atoms in block 5
Block first atom: 272
Blocpdb> 76 atoms in block 6
Block first atom: 333
Blocpdb> 50 atoms in block 7
Block first atom: 409
Blocpdb> 70 atoms in block 8
Block first atom: 459
Blocpdb> 55 atoms in block 9
Block first atom: 529
Blocpdb> 71 atoms in block 10
Block first atom: 584
Blocpdb> 70 atoms in block 11
Block first atom: 655
Blocpdb> 66 atoms in block 12
Block first atom: 725
Blocpdb> 88 atoms in block 13
Block first atom: 791
Blocpdb> 76 atoms in block 14
Block first atom: 879
Blocpdb> 59 atoms in block 15
Block first atom: 955
Blocpdb> 60 atoms in block 16
Block first atom: 1014
Blocpdb> 78 atoms in block 17
Block first atom: 1074
Blocpdb> 76 atoms in block 18
Block first atom: 1152
Blocpdb> 73 atoms in block 19
Block first atom: 1228
Blocpdb> 66 atoms in block 20
Block first atom: 1301
Blocpdb> 60 atoms in block 21
Block first atom: 1367
Blocpdb> 67 atoms in block 22
Block first atom: 1427
Blocpdb> 76 atoms in block 23
Block first atom: 1494
Blocpdb> 56 atoms in block 24
Block first atom: 1570
Blocpdb> 56 atoms in block 25
Block first atom: 1626
Blocpdb> 55 atoms in block 26
Block first atom: 1682
Blocpdb> 53 atoms in block 27
Block first atom: 1737
Blocpdb> 78 atoms in block 28
Block first atom: 1790
Blocpdb> 84 atoms in block 29
Block first atom: 1868
Blocpdb> 70 atoms in block 30
Block first atom: 1952
Blocpdb> 61 atoms in block 31
Block first atom: 2022
Blocpdb> 62 atoms in block 32
Block first atom: 2083
Blocpdb> 74 atoms in block 33
Block first atom: 2145
Blocpdb> 49 atoms in block 34
Block first atom: 2219
Blocpdb> 77 atoms in block 35
Block first atom: 2268
Blocpdb> 62 atoms in block 36
Block first atom: 2345
Blocpdb> 64 atoms in block 37
Block first atom: 2407
Blocpdb> 67 atoms in block 38
Block first atom: 2471
Blocpdb> 81 atoms in block 39
Block first atom: 2538
Blocpdb> 59 atoms in block 40
Block first atom: 2619
Blocpdb> 60 atoms in block 41
Block first atom: 2678
Blocpdb> 77 atoms in block 42
Block first atom: 2738
Blocpdb> 71 atoms in block 43
Block first atom: 2815
Blocpdb> 62 atoms in block 44
Block first atom: 2886
Blocpdb> 66 atoms in block 45
Block first atom: 2948
Blocpdb> 60 atoms in block 46
Block first atom: 3014
Blocpdb> 67 atoms in block 47
Block first atom: 3074
Blocpdb> 69 atoms in block 48
Block first atom: 3141
Blocpdb> 79 atoms in block 49
Block first atom: 3210
Blocpdb> 49 atoms in block 50
Block first atom: 3289
Blocpdb> 49 atoms in block 51
Block first atom: 3338
Blocpdb> 64 atoms in block 52
Block first atom: 3387
Blocpdb> 58 atoms in block 53
Block first atom: 3451
Blocpdb> 48 atoms in block 54
Block first atom: 3509
Blocpdb> 69 atoms in block 55
Block first atom: 3557
Blocpdb> 67 atoms in block 56
Block first atom: 3626
Blocpdb> 66 atoms in block 57
Block first atom: 3693
Blocpdb> 51 atoms in block 58
Block first atom: 3759
Blocpdb> 59 atoms in block 59
Block first atom: 3810
Blocpdb> 48 atoms in block 60
Block first atom: 3869
Blocpdb> 60 atoms in block 61
Block first atom: 3917
Blocpdb> 58 atoms in block 62
Block first atom: 3977
Blocpdb> 49 atoms in block 63
Block first atom: 4035
Blocpdb> 64 atoms in block 64
Block first atom: 4084
Blocpdb> 51 atoms in block 65
Block first atom: 4148
Blocpdb> 52 atoms in block 66
Block first atom: 4199
Blocpdb> 58 atoms in block 67
Block first atom: 4251
Blocpdb> 58 atoms in block 68
Block first atom: 4309
Blocpdb> 55 atoms in block 69
Block first atom: 4367
Blocpdb> 80 atoms in block 70
Block first atom: 4422
Blocpdb> 65 atoms in block 71
Block first atom: 4502
Blocpdb> 68 atoms in block 72
Block first atom: 4567
Blocpdb> 52 atoms in block 73
Block first atom: 4635
Blocpdb> 67 atoms in block 74
Block first atom: 4687
Blocpdb> 59 atoms in block 75
Block first atom: 4754
Blocpdb> 57 atoms in block 76
Block first atom: 4813
Blocpdb> 55 atoms in block 77
Block first atom: 4870
Blocpdb> 65 atoms in block 78
Block first atom: 4925
Blocpdb> 68 atoms in block 79
Block first atom: 4990
Blocpdb> 50 atoms in block 80
Block first atom: 5058
Blocpdb> 63 atoms in block 81
Block first atom: 5108
Blocpdb> 58 atoms in block 82
Block first atom: 5171
Blocpdb> 57 atoms in block 83
Block first atom: 5229
Blocpdb> 50 atoms in block 84
Block first atom: 5286
Blocpdb> 61 atoms in block 85
Block first atom: 5336
Blocpdb> 72 atoms in block 86
Block first atom: 5397
Blocpdb> 72 atoms in block 87
Block first atom: 5469
Blocpdb> 62 atoms in block 88
Block first atom: 5541
Blocpdb> 58 atoms in block 89
Block first atom: 5603
Blocpdb> 59 atoms in block 90
Block first atom: 5661
Blocpdb> 60 atoms in block 91
Block first atom: 5720
Blocpdb> 71 atoms in block 92
Block first atom: 5780
Blocpdb> 57 atoms in block 93
Block first atom: 5851
Blocpdb> 60 atoms in block 94
Block first atom: 5908
Blocpdb> 64 atoms in block 95
Block first atom: 5968
Blocpdb> 60 atoms in block 96
Block first atom: 6032
Blocpdb> 87 atoms in block 97
Block first atom: 6092
Blocpdb> 58 atoms in block 98
Block first atom: 6179
Blocpdb> 54 atoms in block 99
Block first atom: 6237
Blocpdb> 65 atoms in block 100
Block first atom: 6291
Blocpdb> 65 atoms in block 101
Block first atom: 6356
Blocpdb> 73 atoms in block 102
Block first atom: 6421
Blocpdb> 68 atoms in block 103
Block first atom: 6494
Blocpdb> 65 atoms in block 104
Block first atom: 6562
Blocpdb> 53 atoms in block 105
Block first atom: 6627
Blocpdb> 77 atoms in block 106
Block first atom: 6680
Blocpdb> 65 atoms in block 107
Block first atom: 6757
Blocpdb> 59 atoms in block 108
Block first atom: 6822
Blocpdb> 60 atoms in block 109
Block first atom: 6881
Blocpdb> 60 atoms in block 110
Block first atom: 6941
Blocpdb> 74 atoms in block 111
Block first atom: 7001
Blocpdb> 54 atoms in block 112
Block first atom: 7075
Blocpdb> 73 atoms in block 113
Block first atom: 7129
Blocpdb> 54 atoms in block 114
Block first atom: 7202
Blocpdb> 68 atoms in block 115
Block first atom: 7256
Blocpdb> 66 atoms in block 116
Block first atom: 7324
Blocpdb> 69 atoms in block 117
Block first atom: 7390
Blocpdb> 70 atoms in block 118
Block first atom: 7459
Blocpdb> 48 atoms in block 119
Block first atom: 7529
Blocpdb> 47 atoms in block 120
Block first atom: 7577
Blocpdb> 72 atoms in block 121
Block first atom: 7624
Blocpdb> 70 atoms in block 122
Block first atom: 7696
Blocpdb> 70 atoms in block 123
Block first atom: 7766
Blocpdb> 75 atoms in block 124
Block first atom: 7836
Blocpdb> 62 atoms in block 125
Block first atom: 7911
Blocpdb> 66 atoms in block 126
Block first atom: 7973
Blocpdb> 60 atoms in block 127
Block first atom: 8039
Blocpdb> 71 atoms in block 128
Block first atom: 8099
Blocpdb> 61 atoms in block 129
Block first atom: 8170
Blocpdb> 64 atoms in block 130
Block first atom: 8231
Blocpdb> 73 atoms in block 131
Block first atom: 8295
Blocpdb> 59 atoms in block 132
Block first atom: 8368
Blocpdb> 68 atoms in block 133
Block first atom: 8427
Blocpdb> 45 atoms in block 134
Block first atom: 8495
Blocpdb> 41 atoms in block 135
Block first atom: 8540
Blocpdb> 48 atoms in block 136
Block first atom: 8581
Blocpdb> 52 atoms in block 137
Block first atom: 8629
Blocpdb> 67 atoms in block 138
Block first atom: 8681
Blocpdb> 56 atoms in block 139
Block first atom: 8748
Blocpdb> 57 atoms in block 140
Block first atom: 8804
Blocpdb> 67 atoms in block 141
Block first atom: 8861
Blocpdb> 66 atoms in block 142
Block first atom: 8928
Blocpdb> 61 atoms in block 143
Block first atom: 8994
Blocpdb> 64 atoms in block 144
Block first atom: 9055
Blocpdb> 60 atoms in block 145
Block first atom: 9119
Blocpdb> 56 atoms in block 146
Block first atom: 9179
Blocpdb> 66 atoms in block 147
Block first atom: 9235
Blocpdb> 60 atoms in block 148
Block first atom: 9301
Blocpdb> 51 atoms in block 149
Block first atom: 9361
Blocpdb> 83 atoms in block 150
Block first atom: 9412
Blocpdb> 75 atoms in block 151
Block first atom: 9495
Blocpdb> 55 atoms in block 152
Block first atom: 9570
Blocpdb> 66 atoms in block 153
Block first atom: 9625
Blocpdb> 62 atoms in block 154
Block first atom: 9691
Blocpdb> 71 atoms in block 155
Block first atom: 9753
Blocpdb> 42 atoms in block 156
Block first atom: 9824
Blocpdb> 60 atoms in block 157
Block first atom: 9866
Blocpdb> 51 atoms in block 158
Block first atom: 9926
Blocpdb> 21 atoms in block 159
Block first atom: 9976
Blocpdb> 159 blocks.
Blocpdb> At most, 88 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 21 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 7342216 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 29991
Prepmat> Matrix trace = 16185940.0000
Prepmat> Last element read: 29991 29991 302.0152
Prepmat> 12721 lines saved.
Prepmat> 11061 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9997
RTB> Total mass = 9997.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 9997
RTB> Number of blocks = 159
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 386250.0072
RTB> 57339 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 954
Diagstd> Nb of non-zero elements: 57339
Diagstd> Projected matrix trace = 386250.0072
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 954 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 386250.0072
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 4.5888960 5.2006916 7.1895953 8.2412892
10.8104255 11.5149769 13.4004249 14.1106286 15.6706498
16.4290784 18.6689350 19.9458895 21.0814978 22.3454902
23.3594547 24.4549116 26.8220348 27.7086085 29.1464752
30.1017032 31.7136899 31.9346301 35.0133045 36.6658780
37.1208297 39.1360207 39.8513688 41.1124826 43.3983403
44.2796621 46.0684940 46.6048399 48.0546837 49.8111855
50.0486328 50.1560663 50.8921995 52.0516362 53.3325387
54.2938730 55.1966402 56.4427407 57.7769986 60.1091279
60.9076641 61.0597361 62.5496740 63.2928642 64.7838298
65.4675709 66.2327916 68.1760709 70.4272298 71.3174874
71.4138105 72.8579853 74.4357410 75.7401641 76.2932964
77.6260507 79.4601174 80.1264606 81.3621087 81.9382072
83.2073224 84.5629670 85.2393874 86.7394873 87.4577286
88.2902680 88.5736023 90.0939910 91.1883360 92.7061186
93.1011456 93.5289810 94.6225950 95.1311741 95.9207244
96.9367557 97.5634232 99.7047895 100.2247539 101.1979787
102.0336314 102.9450985 104.7848999 106.4650583 107.6423393
108.3016916 109.2138394 110.2138666 111.3677733 112.4243460
113.2579564 115.5381038 116.0980908 116.7380581 118.1309148
119.0383855
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034328 0.0034329 0.0034337 0.0034338
0.0034375 232.6212525 247.6428705 291.1705883 311.7402338
357.0398353 368.4909412 397.5159557 407.9138588 429.8716290
440.1511909 469.1968111 484.9779399 498.5928108 513.3224084
524.8396419 537.0049989 562.3945986 571.6137120 586.2573507
595.7867148 611.5312684 613.6577531 642.5572534 657.5462795
661.6131331 679.3344096 685.5149045 696.2771320 715.3718403
722.5991214 737.0505724 741.3286598 752.7714541 766.4056884
768.2302243 769.0543164 774.6774080 783.4521439 793.0332724
800.1486775 806.7734578 815.8293537 825.4157830 841.9096620
847.4835013 848.5408245 858.8311844 863.9182628 874.0345280
878.6347867 883.7548504 896.6258685 911.3088404 917.0505957
917.6696821 926.9020850 936.8844665 945.0578659 948.5024787
956.7512233 967.9877948 972.0380371 979.5043706 982.9660287
990.5492050 998.5858011 1002.5716970 1011.3551858 1015.5337876
1020.3559415 1021.9918540 1030.7259098 1036.9669757 1045.5612508
1047.7864861 1050.1912166 1056.3132010 1059.1481419 1063.5343108
1069.1521670 1072.6024760 1084.3095697 1087.1332518 1092.3987622
1096.8997870 1101.7882004 1111.5900016 1120.4663759 1126.6443524
1130.0896573 1134.8386483 1140.0224390 1145.9747495 1151.3979852
1155.6588268 1167.2339158 1170.0591556 1173.2795812 1180.2583017
1184.7829463
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9997
Rtb_to_modes> Number of blocs = 159
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9897E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0021E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.589
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.201
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.190
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.241
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.0
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 954 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99997 1.00002 1.00003 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
1.00003 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001
0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001
0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 179946 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99997 1.00002 1.00003 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
1.00003 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001
0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001
0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260409133102922495.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260409133102922495.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260409133102922495.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260409133102922495.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 633
First residue number = 171
Last residue number = 803
Number of atoms found = 9997
Mean number per residue = 15.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9897E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0021E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.589
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.201
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.190
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.241
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.0
Bfactors> 106 vectors, 29991 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.589000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.004 +/- 0.00
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.004
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260409133102922495.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260409133102922495.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4374E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1097.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1156.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1167.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1170.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Chkmod> 106 vectors, 29991 coordinates in file.
Chkmod> That is: 9997 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8527
0.0034 0.7165
0.0034 0.6681
0.0034 0.9005
0.0034 0.7839
0.0034 0.8112
232.6139 0.5445
247.6396 0.5373
291.1663 0.6370
311.7214 0.3625
357.0175 0.5213
368.3955 0.3780
397.4926 0.4060
407.8873 0.6084
429.8443 0.5138
440.1446 0.3616
469.1901 0.4123
485.0071 0.5845
498.5537 0.5525
513.3522 0.2105
524.8232 0.5472
536.9280 0.2721
562.3491 0.4327
571.6035 0.4798
586.2676 0.3653
595.7443 0.3026
611.4694 0.5206
613.5869 0.3099
642.4993 0.3113
657.5550 0.3296
661.5773 0.3407
679.3398 0.3412
685.4737 0.2241
696.2262 0.3925
715.3548 0.4841
722.5709 0.3954
737.0310 0.3973
741.2583 0.5000
752.7025 0.3861
766.3637 0.5174
768.2077 0.3106
769.0515 0.4175
774.6274 0.4363
783.4062 0.3830
792.9804 0.4547
800.0858 0.4466
806.7634 0.4451
815.7745 0.2131
825.4018 0.4927
841.8796 0.4221
847.4634 0.2739
848.5062 0.4190
858.7966 0.4906
863.8616 0.4129
873.9712 0.4111
878.6134 0.5374
883.6983 0.4765
896.6132 0.4726
911.2876 0.3493
917.0274 0.4442
917.6058 0.4533
926.8751 0.4595
936.8710 0.4494
945.0163 0.4796
948.4413 0.3981
956.7345 0.4880
967.9455 0.4208
972.0178 0.3009
979.4496 0.4400
982.9346 0.3453
990.5226 0.3754
998.5254 0.4007
1002.5323 0.4200
1011.3148 0.1369
1015.5034 0.4836
1020.3106 0.3507
1021.9272 0.2234
1030.6588 0.3547
1036.9319 0.4737
1045.5383 0.4703
1047.7351 0.4825
1050.1519 0.5215
1056.2534 0.5297
1059.0961 0.4986
1063.4846 0.5279
1069.1242 0.5179
1072.5376 0.4761
1084.2370 0.4277
1086.9523 0.4745
1092.3628 0.4891
1096.6719 0.4887
1101.4995 0.2726
1111.6224 0.5116
1120.6021 0.4677
1126.3744 0.4079
1130.0323 0.4304
1134.7180 0.4835
1139.9018 0.3548
1146.0913 0.3091
1151.2239 0.4104
1155.8237 0.3202
1166.9913 0.5599
1170.0185 0.4497
1173.0380 0.4877
1180.0532 0.4688
1184.5411 0.4255
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 260409133102922495.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260409133102922495.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 260409133102922495.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260409133102922495.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 260409133102922495.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
260409133102922495.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4374E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1097.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1156.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1167.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1170.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Projmod> 106 vectors, 29991 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 633
First residue number = 171
Last residue number = 803
Number of atoms found = 9997
Mean number per residue = 15.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 633
First residue number = 171
Last residue number = 803
Number of atoms found = 9997
Mean number per residue = 15.8
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 9997 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 3.30
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.078 Sum= 0.006 q= -25.7604
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.051 Sum= 0.009 q= 16.7197
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.602 Sum= 0.371 q= 198.2226
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.137 Sum= 0.390 q= 45.2994
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.185 Sum= 0.424 q= 61.0404
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.134 Sum= 0.442 q= -44.0140
Vector: 7 F= 232.61 Cos= -0.182 Sum= 0.475 q= -59.9341
Vector: 8 F= 247.64 Cos= 0.175 Sum= 0.505 q= 57.5334
Vector: 9 F= 291.17 Cos= -0.180 Sum= 0.538 q= -59.1907
Vector: 10 F= 311.72 Cos= -0.006 Sum= 0.538 q= -2.0422
Vector: 11 F= 357.02 Cos= 0.038 Sum= 0.539 q= 12.5631
Vector: 12 F= 368.40 Cos= 0.066 Sum= 0.543 q= 21.8294
Vector: 13 F= 397.49 Cos= -0.086 Sum= 0.551 q= -28.3222
Vector: 14 F= 407.89 Cos= -0.044 Sum= 0.553 q= -14.5193
Vector: 15 F= 429.84 Cos= -0.064 Sum= 0.557 q= -20.9443
Vector: 16 F= 440.14 Cos= -0.047 Sum= 0.559 q= -15.4929
Vector: 17 F= 469.19 Cos= -0.013 Sum= 0.559 q= -4.4425
Vector: 18 F= 485.01 Cos= -0.025 Sum= 0.560 q= -8.1833
Vector: 19 F= 498.55 Cos= -0.017 Sum= 0.560 q= -5.7308
Vector: 20 F= 513.35 Cos= -0.015 Sum= 0.560 q= -4.8330
Vector: 21 F= 524.82 Cos= 0.074 Sum= 0.566 q= 24.3825
Vector: 22 F= 536.93 Cos= 0.037 Sum= 0.567 q= 12.2456
Vector: 23 F= 562.35 Cos= 0.067 Sum= 0.572 q= 21.9947
Vector: 24 F= 571.60 Cos= 0.080 Sum= 0.578 q= 26.2983
Vector: 25 F= 586.27 Cos= 0.039 Sum= 0.580 q= 12.8415
Vector: 26 F= 595.74 Cos= 0.023 Sum= 0.580 q= 7.6098
Vector: 27 F= 611.47 Cos= 0.001 Sum= 0.580 q= 0.3885
Vector: 28 F= 613.59 Cos= -0.008 Sum= 0.580 q= -2.6972
Vector: 29 F= 642.50 Cos= -0.017 Sum= 0.580 q= -5.7521
Vector: 30 F= 657.56 Cos= -0.037 Sum= 0.582 q= -12.2367
Vector: 31 F= 661.58 Cos= -0.047 Sum= 0.584 q= -15.5618
Vector: 32 F= 679.34 Cos= -0.036 Sum= 0.585 q= -11.9631
Vector: 33 F= 685.47 Cos= 0.015 Sum= 0.586 q= 4.9588
Vector: 34 F= 696.23 Cos= 0.036 Sum= 0.587 q= 11.9654
Vector: 35 F= 715.35 Cos= -0.013 Sum= 0.587 q= -4.2816
Vector: 36 F= 722.57 Cos= -0.014 Sum= 0.587 q= -4.4822
Vector: 37 F= 737.03 Cos= 0.132 Sum= 0.605 q= 43.6319
Vector: 38 F= 741.26 Cos= 0.029 Sum= 0.606 q= 9.4544
Vector: 39 F= 752.70 Cos= 0.069 Sum= 0.610 q= 22.6089
Vector: 40 F= 766.36 Cos= 0.056 Sum= 0.614 q= 18.5835
Vector: 41 F= 768.21 Cos= 0.086 Sum= 0.621 q= 28.3578
Vector: 42 F= 769.05 Cos= 0.069 Sum= 0.626 q= 22.6731
Vector: 43 F= 774.63 Cos= -0.030 Sum= 0.627 q= -9.7801
Vector: 44 F= 783.41 Cos= -0.008 Sum= 0.627 q= -2.6095
Vector: 45 F= 792.98 Cos= -0.021 Sum= 0.627 q= -6.8340
Vector: 46 F= 800.09 Cos= -0.038 Sum= 0.629 q= -12.5946
Vector: 47 F= 806.76 Cos= 0.025 Sum= 0.629 q= 8.3328
Vector: 48 F= 815.77 Cos= -0.001 Sum= 0.629 q= -0.3390
Vector: 49 F= 825.40 Cos= -0.019 Sum= 0.630 q= -6.2341
Vector: 50 F= 841.88 Cos= -0.014 Sum= 0.630 q= -4.6426
Vector: 51 F= 847.46 Cos= -0.048 Sum= 0.632 q= -15.7673
Vector: 52 F= 848.51 Cos= -0.002 Sum= 0.632 q= -0.5563
Vector: 53 F= 858.80 Cos= 0.013 Sum= 0.632 q= 4.1650
Vector: 54 F= 863.86 Cos= 0.011 Sum= 0.632 q= 3.6857
Vector: 55 F= 873.97 Cos= 0.004 Sum= 0.632 q= 1.3505
Vector: 56 F= 878.61 Cos= 0.021 Sum= 0.633 q= 6.9672
Vector: 57 F= 883.70 Cos= 0.028 Sum= 0.634 q= 9.0676
Vector: 58 F= 896.61 Cos= 0.012 Sum= 0.634 q= 3.8282
Vector: 59 F= 911.29 Cos= -0.028 Sum= 0.634 q= -9.1077
Vector: 60 F= 917.03 Cos= 0.009 Sum= 0.635 q= 2.8386
Vector: 61 F= 917.61 Cos= -0.065 Sum= 0.639 q= -21.5131
Vector: 62 F= 926.88 Cos= 0.015 Sum= 0.639 q= 4.9933
Vector: 63 F= 936.87 Cos= 0.096 Sum= 0.648 q= 31.6681
Vector: 64 F= 945.02 Cos= -0.065 Sum= 0.652 q= -21.3693
Vector: 65 F= 948.44 Cos= -0.019 Sum= 0.653 q= -6.1242
Vector: 66 F= 956.73 Cos= -0.056 Sum= 0.656 q= -18.3534
Vector: 67 F= 967.95 Cos= -0.008 Sum= 0.656 q= -2.5039
Vector: 68 F= 972.02 Cos= 0.038 Sum= 0.657 q= 12.4397
Vector: 69 F= 979.45 Cos= -0.068 Sum= 0.662 q= -22.3250
Vector: 70 F= 982.93 Cos= 0.059 Sum= 0.666 q= 19.5932
Vector: 71 F= 990.52 Cos= 0.030 Sum= 0.666 q= 9.8073
Vector: 72 F= 998.53 Cos= 0.049 Sum= 0.669 q= 16.1167
Vector: 73 F= 1002.53 Cos= 0.070 Sum= 0.674 q= 22.9577
Vector: 74 F= 1011.31 Cos= -0.007 Sum= 0.674 q= -2.1904
Vector: 75 F= 1015.50 Cos= 0.028 Sum= 0.674 q= 9.0800
Vector: 76 F= 1020.31 Cos= -0.012 Sum= 0.675 q= -3.9985
Vector: 77 F= 1021.93 Cos= 0.028 Sum= 0.675 q= 9.1715
Vector: 78 F= 1030.66 Cos= 0.030 Sum= 0.676 q= 10.0050
Vector: 79 F= 1036.93 Cos= -0.065 Sum= 0.680 q= -21.2772
Vector: 80 F= 1045.54 Cos= -0.006 Sum= 0.680 q= -2.0254
Vector: 81 F= 1047.74 Cos= 0.016 Sum= 0.681 q= 5.3233
Vector: 82 F= 1050.15 Cos= -0.046 Sum= 0.683 q= -15.2521
Vector: 83 F= 1056.25 Cos= -0.021 Sum= 0.683 q= -6.9674
Vector: 84 F= 1059.10 Cos= -0.026 Sum= 0.684 q= -8.4123
Vector: 85 F= 1063.48 Cos= 0.032 Sum= 0.685 q= 10.5434
Vector: 86 F= 1069.12 Cos= -0.002 Sum= 0.685 q= -0.6294
Vector: 87 F= 1072.54 Cos= 0.038 Sum= 0.686 q= 12.6482
Vector: 88 F= 1084.24 Cos= -0.021 Sum= 0.687 q= -6.8226
Vector: 89 F= 1086.95 Cos= -0.001 Sum= 0.687 q= -0.2393
Vector: 90 F= 1092.36 Cos= 0.015 Sum= 0.687 q= 5.0299
Vector: 91 F= 1096.67 Cos= -0.005 Sum= 0.687 q= -1.6277
Vector: 92 F= 1101.50 Cos= 0.011 Sum= 0.687 q= 3.4986
Vector: 93 F= 1111.62 Cos= 0.001 Sum= 0.687 q= 0.2899
Vector: 94 F= 1120.60 Cos= -0.014 Sum= 0.687 q= -4.5139
Vector: 95 F= 1126.37 Cos= -0.021 Sum= 0.688 q= -6.8704
Vector: 96 F= 1130.03 Cos= 0.039 Sum= 0.689 q= 12.6970
Vector: 97 F= 1134.72 Cos= 0.001 Sum= 0.689 q= 0.4298
Vector: 98 F= 1139.90 Cos= -0.046 Sum= 0.692 q= -15.2009
Vector: 99 F= 1146.09 Cos= 0.036 Sum= 0.693 q= 12.0185
Vector: 100 F= 1151.22 Cos= 0.039 Sum= 0.694 q= 12.9054
Vector: 101 F= 1155.82 Cos= -0.005 Sum= 0.694 q= -1.7430
Vector: 102 F= 1166.99 Cos= 0.023 Sum= 0.695 q= 7.6716
Vector: 103 F= 1170.02 Cos= -0.014 Sum= 0.695 q= -4.5645
Vector: 104 F= 1173.04 Cos= 0.030 Sum= 0.696 q= 9.8013
Vector: 105 F= 1180.05 Cos= 0.008 Sum= 0.696 q= 2.4834
Vector: 106 F= 1184.54 Cos= -0.020 Sum= 0.696 q= -6.4634
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003437
Projmod> Lowest non-zero frequency : 232.613901
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.60 for mode 3 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.362 0.429 0.511 0.556 0.577 0.696
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260409133102922495 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
making animated gifs
11 models are in 260409133102922495.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 633 2.007 581 1.370
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 633 1.978 583 1.334
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 633 1.968 581 1.301
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 633 1.977 577 1.276
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 633 2.006 577 1.295
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 633 2.052 576 1.332
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 633 2.116 575 1.388
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 633 2.195 565 1.423
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 633 2.288 557 1.474
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 633 2.394 546 1.518
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 633 2.510 532 1.560
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260409133102922495 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
making animated gifs
11 models are in 260409133102922495.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 633 2.501 524 1.601
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 633 2.387 535 1.538
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 633 2.283 555 1.510
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 633 2.192 567 1.456
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 633 2.114 571 1.386
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 633 2.052 576 1.332
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 633 2.007 578 1.286
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 633 1.979 576 1.242
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 633 1.970 577 1.236
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 633 1.980 578 1.254
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 633 2.009 575 1.271
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260409133102922495 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
making animated gifs
11 models are in 260409133102922495.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 633 1.993 581 1.447
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 633 1.967 582 1.393
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 633 1.960 584 1.363
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 633 1.972 582 1.333
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 633 2.003 579 1.325
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 633 2.052 576 1.332
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 633 2.118 571 1.356
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 633 2.199 564 1.390
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 633 2.294 556 1.437
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 633 2.401 551 1.510
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 633 2.519 536 1.553
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260409133102922495 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
making animated gifs
11 models are in 260409133102922495.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 633 2.291 566 1.437
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 633 2.212 570 1.412
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 633 2.148 569 1.373
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 633 2.099 570 1.349
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 633 2.067 579 1.364
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 633 2.052 576 1.332
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 633 2.056 572 1.309
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 633 2.077 570 1.309
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 633 2.115 568 1.322
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 633 2.170 561 1.326
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 633 2.240 555 1.344
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260409133102922495 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260409133102922495.eigenfacs
260409133102922495.atom
making animated gifs
11 models are in 260409133102922495.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260409133102922495.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 633 2.314 540 1.508
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 633 2.231 550 1.471
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 633 2.163 558 1.430
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 633 2.109 566 1.388
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 633 2.072 572 1.357
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 633 2.052 576 1.332
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 633 2.050 576 1.310
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 633 2.066 574 1.296
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 633 2.099 573 1.301
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 633 2.148 570 1.311
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 633 2.213 566 1.337
260409133102922495.10.pdb
260409133102922495.11.pdb
260409133102922495.7.pdb
260409133102922495.8.pdb
260409133102922495.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m4.530s
user 1m3.921s
sys 0m0.568s
rm: cannot remove '260409133102922495.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
