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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
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* APOPTOSIS 16-FEB-19 6O0L *

LOGs for ID: 2604130126391687724

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604130126391687724.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604130126391687724.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604130126391687724.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    279
            First residue number     =      9
            Last  residue number     =    203
            Number of atoms found    =   2328
            Mean number per residue  =      8.3

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     8.260628 +/-     9.296389 From:   -14.958000 To:    31.877000
 =    22.126105 +/-    14.186602 From:    -9.681000 To:    53.911000
 =    12.253113 +/-    14.261731 From:   -17.339000 To:    43.005000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.4926 % Filled.
 Pdbmat>       851904  non-zero elements.
 Pdbmat>        93119 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     80.00 +/-     21.60
         Maximum number =    124
         Minimum number =     16

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.862380E+06
 Pdbmat> Larger element =  497.574    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
279 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604130126391687724.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604130126391687724.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604130126391687724.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2328 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   279 residues.
 Blocpdb>    20 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    19 atoms in block      2
 Block first atom:     21
 Blocpdb>    17 atoms in block      3
 Block first atom:     40
 Blocpdb>    15 atoms in block      4
 Block first atom:     57
 Blocpdb>    21 atoms in block      5
 Block first atom:     72
 Blocpdb>    18 atoms in block      6
 Block first atom:     93
 Blocpdb>    21 atoms in block      7
 Block first atom:    111
 Blocpdb>    14 atoms in block      8
 Block first atom:    132
 Blocpdb>    20 atoms in block      9
 Block first atom:    146
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    166
 Blocpdb>    23 atoms in block     11
 Block first atom:    182
 Blocpdb>    13 atoms in block     12
 Block first atom:    205
 Blocpdb>     4 atoms in block     13
 Block first atom:    218
 Blocpdb>    15 atoms in block     14
 Block first atom:    222
 Blocpdb>    14 atoms in block     15
 Block first atom:    237
 Blocpdb>    18 atoms in block     16
 Block first atom:    251
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    269
 Blocpdb>    20 atoms in block     18
 Block first atom:    284
 Blocpdb>    12 atoms in block     19
 Block first atom:    304
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    316
 Blocpdb>    17 atoms in block     21
 Block first atom:    332
 Blocpdb>    22 atoms in block     22
 Block first atom:    349
 Blocpdb>    23 atoms in block     23
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    19 atoms in block     24
 Block first atom:    394
 Blocpdb>    16 atoms in block     25
 Block first atom:    413
 Blocpdb>    17 atoms in block     26
 Block first atom:    429
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    446
 Blocpdb>    17 atoms in block     28
 Block first atom:    458
 Blocpdb>    18 atoms in block     29
 Block first atom:    475
 Blocpdb>    14 atoms in block     30
 Block first atom:    493
 Blocpdb>    18 atoms in block     31
 Block first atom:    507
 Blocpdb>    16 atoms in block     32
 Block first atom:    525
 Blocpdb>    15 atoms in block     33
 Block first atom:    541
 Blocpdb>    16 atoms in block     34
 Block first atom:    556
 Blocpdb>    14 atoms in block     35
 Block first atom:    572
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    586
 Blocpdb>    17 atoms in block     37
 Block first atom:    602
 Blocpdb>    22 atoms in block     38
 Block first atom:    619
 Blocpdb>    12 atoms in block     39
 Block first atom:    641
 Blocpdb>    15 atoms in block     40
 Block first atom:    653
 Blocpdb>    18 atoms in block     41
 Block first atom:    668
 Blocpdb>    19 atoms in block     42
 Block first atom:    686
 Blocpdb>    12 atoms in block     43
 Block first atom:    705
 Blocpdb>    22 atoms in block     44
 Block first atom:    717
 Blocpdb>    20 atoms in block     45
 Block first atom:    739
 Blocpdb>     8 atoms in block     46
 Block first atom:    759
 Blocpdb>    15 atoms in block     47
 Block first atom:    767
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    782
 Blocpdb>    15 atoms in block     49
 Block first atom:    795
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    810
 Blocpdb>    20 atoms in block     51
 Block first atom:    825
 Blocpdb>    14 atoms in block     52
 Block first atom:    845
 Blocpdb>    15 atoms in block     53
 Block first atom:    859
 Blocpdb>    15 atoms in block     54
 Block first atom:    874
 Blocpdb>    16 atoms in block     55
 Block first atom:    889
 Blocpdb>    13 atoms in block     56
 Block first atom:    905
 Blocpdb>    22 atoms in block     57
 Block first atom:    918
 Blocpdb>    16 atoms in block     58
 Block first atom:    940
 Blocpdb>    20 atoms in block     59
 Block first atom:    956
 Blocpdb>    19 atoms in block     60
 Block first atom:    976
 Blocpdb>    18 atoms in block     61
 Block first atom:    995
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:   1013
 Blocpdb>    22 atoms in block     63
 Block first atom:   1030
 Blocpdb>    17 atoms in block     64
 Block first atom:   1052
 Blocpdb>    12 atoms in block     65
 Block first atom:   1069
 Blocpdb>    18 atoms in block     66
 Block first atom:   1081
 Blocpdb>    13 atoms in block     67
 Block first atom:   1099
 Blocpdb>    18 atoms in block     68
 Block first atom:   1112
 Blocpdb>    17 atoms in block     69
 Block first atom:   1130
 Blocpdb>    16 atoms in block     70
 Block first atom:   1147
 Blocpdb>    16 atoms in block     71
 Block first atom:   1163
 Blocpdb>    16 atoms in block     72
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    20 atoms in block     73
 Block first atom:   1195
 Blocpdb>    15 atoms in block     74
 Block first atom:   1215
 Blocpdb>    17 atoms in block     75
 Block first atom:   1230
 Blocpdb>    20 atoms in block     76
 Block first atom:   1247
 Blocpdb>    22 atoms in block     77
 Block first atom:   1267
 Blocpdb>    17 atoms in block     78
 Block first atom:   1289
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1306
 Blocpdb>    15 atoms in block     80
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    21 atoms in block     81
 Block first atom:   1336
 Blocpdb>    22 atoms in block     82
 Block first atom:   1357
 Blocpdb>     9 atoms in block     83
 Block first atom:   1379
 Blocpdb>    15 atoms in block     84
 Block first atom:   1388
 Blocpdb>    14 atoms in block     85
 Block first atom:   1403
 Blocpdb>    18 atoms in block     86
 Block first atom:   1417
 Blocpdb>    15 atoms in block     87
 Block first atom:   1435
 Blocpdb>    20 atoms in block     88
 Block first atom:   1450
 Blocpdb>    12 atoms in block     89
 Block first atom:   1470
 Blocpdb>    16 atoms in block     90
 Block first atom:   1482
 Blocpdb>    17 atoms in block     91
 Block first atom:   1498
 Blocpdb>    22 atoms in block     92
 Block first atom:   1515
 Blocpdb>    23 atoms in block     93
 Block first atom:   1537
 Blocpdb>    19 atoms in block     94
 Block first atom:   1560
 Blocpdb>    16 atoms in block     95
 Block first atom:   1579
 Blocpdb>    17 atoms in block     96
 Block first atom:   1595
 Blocpdb>    12 atoms in block     97
 Block first atom:   1612
 Blocpdb>    17 atoms in block     98
 Block first atom:   1624
 Blocpdb>    18 atoms in block     99
 Block first atom:   1641
 Blocpdb>    14 atoms in block    100
 Block first atom:   1659
 Blocpdb>    18 atoms in block    101
 Block first atom:   1673
 Blocpdb>    16 atoms in block    102
 Block first atom:   1691
 Blocpdb>    15 atoms in block    103
 Block first atom:   1707
 Blocpdb>    16 atoms in block    104
 Block first atom:   1722
 Blocpdb>    14 atoms in block    105
 Block first atom:   1738
 Blocpdb>    16 atoms in block    106
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    17 atoms in block    107
 Block first atom:   1768
 Blocpdb>    22 atoms in block    108
 Block first atom:   1785
 Blocpdb>    12 atoms in block    109
 Block first atom:   1807
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1819
 Blocpdb>    18 atoms in block    111
 Block first atom:   1834
 Blocpdb>    19 atoms in block    112
 Block first atom:   1852
 Blocpdb>    12 atoms in block    113
 Block first atom:   1871
 Blocpdb>    22 atoms in block    114
 Block first atom:   1883
 Blocpdb>    20 atoms in block    115
 Block first atom:   1905
 Blocpdb>     8 atoms in block    116
 Block first atom:   1925
 Blocpdb>    15 atoms in block    117
 Block first atom:   1933
 Blocpdb>    13 atoms in block    118
 Block first atom:   1948
 Blocpdb>    15 atoms in block    119
 Block first atom:   1961
 Blocpdb>    15 atoms in block    120
 Block first atom:   1976
 Blocpdb>    20 atoms in block    121
 Block first atom:   1991
 Blocpdb>    14 atoms in block    122
 Block first atom:   2011
 Blocpdb>    15 atoms in block    123
 Block first atom:   2025
 Blocpdb>    15 atoms in block    124
 Block first atom:   2040
 Blocpdb>    16 atoms in block    125
 Block first atom:   2055
 Blocpdb>    13 atoms in block    126
 Block first atom:   2071
 Blocpdb>    22 atoms in block    127
 Block first atom:   2084
 Blocpdb>    16 atoms in block    128
 Block first atom:   2106
 Blocpdb>    20 atoms in block    129
 Block first atom:   2122
 Blocpdb>    19 atoms in block    130
 Block first atom:   2142
 Blocpdb>    18 atoms in block    131
 Block first atom:   2161
 Blocpdb>    17 atoms in block    132
 Block first atom:   2179
 Blocpdb>    22 atoms in block    133
 Block first atom:   2196
 Blocpdb>    17 atoms in block    134
 Block first atom:   2218
 Blocpdb>    12 atoms in block    135
 Block first atom:   2235
 Blocpdb>    18 atoms in block    136
 Block first atom:   2247
 Blocpdb>    13 atoms in block    137
 Block first atom:   2265
 Blocpdb>    18 atoms in block    138
 Block first atom:   2278
 Blocpdb>    17 atoms in block    139
 Block first atom:   2296
 Blocpdb>    16 atoms in block    140
 Block first atom:   2312

 Blocpdb>   140 blocks.

 Blocpdb> At most,     23 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       852044 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6984

 Prepmat> Matrix trace    =    1862380.0000
 Prepmat> Last element read:    6984   6984       159.1714
 Prepmat>         9871 lines saved.
 Prepmat>         8428 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2328
 RTB> Total mass =        2328.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2328
 RTB> Number of blocks =   140
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  188053.2159
 RTB>     49812 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      840
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    49812
 Diagstd> Projected matrix trace =  188053.2159

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    840 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 188053.2159
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.7206321      0.8487652      1.5042825      3.9840728
      4.7368334      6.0505595      7.3158903      8.3198721      8.7735154
      9.4267403     11.0294335     11.4501119     13.2975300     13.7632393
     15.4381779     16.5924611     17.3697342     18.3050866     18.5125629
     20.5435616     22.0006201     22.9551672     23.1703758     23.8818747
     24.7291312     26.5424746     27.0254473     27.8135058     28.0369312
     29.4171421     30.6866790     30.9048033     31.7353640     32.0013070
     32.5022473     32.8667146     32.9410596     33.8486464     34.6384453
     35.2728634     35.9532893     36.5876787     37.0521007     37.6536106
     38.1926823     39.2803436     39.9965314     40.7100436     41.5510752
     41.6731211     42.9448155     43.4604343     44.9240762     45.2713869
     45.5306347     46.5535847     47.3724981     48.1557643     49.0220558
     49.7003330     50.1244178     51.2242898     51.5377132     52.1734754
     52.7009366     53.2199222     53.5083427     54.4118274     54.8066691
     56.9205932     57.3181854     58.1040270     58.2227885     59.0794715
     59.7930531     60.2471750     60.5716317     61.7733088     62.7053711
     63.5551026     63.8428581     64.7520644     65.0067219     65.8583192
     66.2344629     66.7551721     67.1035793     67.7168054     68.7482946
     69.9998284     70.9895017     71.9458795     72.2059227     72.6184695
     72.9151144     73.3642921     74.4504835     74.9430800     75.6848535
     75.9511777

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034337      0.0034337      0.0034338      0.0034345      0.0034350
      0.0034357     92.1832623    100.0435439    133.1864307    216.7499024
    236.3411453    267.1117844    293.7168565    313.2229706    321.6489227
    333.4080264    360.6383304    367.4516021    395.9868546    402.8613559
    426.6711715    442.3343686    452.5763620    464.6021055    467.2276698
    492.1904128    509.3458138    520.2780574    522.7112166    530.6760498
    540.0073982    559.4560644    564.5231107    572.6946782    574.9902996
    588.9731807    601.5479147    603.6820629    611.7402021    614.2980521
    619.0874148    622.5488385    623.2525480    631.7800867    639.1083266
    644.9345429    651.1253370    656.8447127    661.0003635    666.3441571
    671.0970971    680.5858564    686.7622982    692.8609166    699.9812605
    701.0085168    711.6241057    715.8834317    727.8382206    730.6462845
    732.7353307    740.9208979    747.4091731    753.5627462    760.3105912
    765.5524127    768.8116417    777.2008257    779.5749083    784.3685356
    788.3234528    792.1955486    794.3392641    801.0173744    803.9184292
    819.2755405    822.1318944    827.7484895    828.5939939    834.6676494
    839.6932168    842.8758759    845.1424515    853.4846458    859.8994108
    865.7061289    867.6637249    873.8202194    875.5368175    881.2529859
    883.7660003    887.2331090    889.5454105    893.6007221    900.3808407
    908.5394045    914.9394296    921.0818898    922.7449805    925.3772666
    927.2654134    930.1171364    936.9772395    940.0718520    944.7127303
    946.3734249

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2328
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    140

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9983E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9991E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0010E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7206    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8488    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.504    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.984    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.737    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.051    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.316    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.320    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.774    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.427    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.95    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    840 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999
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 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000
 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997
 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997
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 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00002 1.00005 0.99998 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
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 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    41904 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 0.99996
 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000
 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997
 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997
 0.99999 1.00000 0.99996 1.00002 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00002 1.00005 0.99998 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604130126391687724.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604130126391687724.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604130126391687724.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604130126391687724.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    279
            First residue number     =      9
            Last  residue number     =    203
            Number of atoms found    =   2328
            Mean number per residue  =      8.3

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9983E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9991E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0010E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7206    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8488    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.504    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.984    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.737    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.051    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.316    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.320    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.774    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.427    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.95    

 Bfactors>  106 vectors,   6984 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.720600
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.573 for    279 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.040 +/-   0.02
 Bfactors> =     44.754 +/-  17.06
 Bfactors> Shiftng-fct=     44.714
 Bfactors> Scaling-fct=    721.206

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604130126391687724.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604130126391687724.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4348E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4355E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   92.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   100.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   133.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   216.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   236.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   267.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   293.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   313.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   740.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   747.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   760.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   765.5    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   777.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   779.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   784.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   788.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   792.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   794.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   801.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   803.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   819.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   822.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   827.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   828.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   834.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   842.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   845.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   853.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   859.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   865.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   867.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   873.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   875.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   881.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   887.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   889.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   893.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   900.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   908.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   914.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   921.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   922.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   925.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   927.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   930.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   936.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   940.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   944.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   946.3    

 Chkmod>  106 vectors,   6984 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2328 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    83 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8579
      0.0034      0.8466
      0.0034      0.7394
      0.0034      0.6701
      0.0034      0.9300
      0.0034      0.7942
     92.1773      0.7521
    100.0413      0.7090
    133.1682      0.7516
    216.7386      0.6925
    236.3352      0.7456
    267.1100      0.6303
    293.7065      0.2577
    313.2119      0.3162
    321.6440      0.4376
    333.3983      0.3046
    360.6321      0.2680
    367.4340      0.3211
    396.0066      0.3370
    402.7967      0.3918
    426.6780      0.4542
    442.2826      0.0528
    452.5604      0.4992
    464.6445      0.4020
    467.1753      0.3787
    492.1266      0.3245
    509.3168      0.5475
    520.3105      0.5290
    522.6845      0.6125
    530.6324      0.4936
    539.9937      0.4261
    559.4060      0.4304
    564.5464      0.5633
    572.6340      0.3600
    574.9971      0.6051
    588.9765      0.4989
    601.5546      0.3954
    603.6092      0.4559
    611.7586      0.4559
    614.2591      0.4746
    619.0394      0.5909
    622.5532      0.4057
    623.2158      0.2809
    631.7656      0.3663
    639.0952      0.2620
    644.8807      0.5517
    651.0676      0.5072
    656.8374      0.5143
    660.9533      0.4682
    666.2836      0.5371
    671.0447      0.4476
    680.5537      0.3747
    686.7626      0.4907
    692.8308      0.4562
    699.9422      0.4584
    700.9522      0.4546
    711.5537      0.4037
    715.8491      0.2286
    727.7740      0.4768
    730.6037      0.3681
    732.6988      0.3822
    740.8606      0.3436
    747.3574      0.5138
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    800.9695      0.4537
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    839.6357      0.4856
    842.8595      0.5174
    845.0948      0.3495
    853.4252      0.3884
    859.8942      0.3949
    865.7023      0.5277
    867.6071      0.4708
    873.7688      0.4462
    875.5213      0.4707
    881.2264      0.3934
    883.6983      0.4692
    887.2271      0.4822
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    900.3534      0.5716
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    940.0122      0.4109
    944.6419      0.3719
    946.3255      0.4762
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604130126391687724 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
making animated gifs
11 models are in 2604130126391687724.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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2604130126391687724.atom
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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normal mode computation
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2604130126391687724.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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calculating perturbed structure for DQ=60
2604130126391687724.eigenfacs
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2604130126391687724.atom
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604130126391687724 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604130126391687724.eigenfacs
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2604130126391687724.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
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2604130126391687724.eigenfacs
2604130126391687724.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604130126391687724.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130126391687724.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604130126391687724.10.pdb
2604130126391687724.11.pdb
2604130126391687724.7.pdb
2604130126391687724.8.pdb
2604130126391687724.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m8.409s
user	0m8.343s
sys	0m0.064s
rm: cannot remove '2604130126391687724.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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Still some additional cleaning from time to time
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* APOPTOSIS 16-FEB-19 6O0L *
