CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  APOPTOSIS 10-DEC-22 8HOG  ***

LOGs for ID: 2604130131011690572

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604130131011690572.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604130131011690572.atom to be opened. Openam> File opened: 2604130131011690572.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 144 First residue number = 9 Last residue number = 204 Number of atoms found = 1207 Mean number per residue = 8.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = -7.848893 +/- 7.714813 From: -26.635000 To: 7.870000 = -4.936089 +/- 9.304130 From: -25.925000 To: 16.358000 = 14.563627 +/- 8.081429 From: -1.541000 To: 36.754000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 6.6118 % Filled. Pdbmat> 433580 non-zero elements. Pdbmat> 47377 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.50 +/- 23.39 Maximum number = 131 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 947540. Pdbmat> Larger element = 506.162 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 144 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604130131011690572.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604130131011690572.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604130131011690572.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1207 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 144 residues. Blocpdb> 12 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 8 atoms in block 2 Block first atom: 13 Blocpdb> 8 atoms in block 3 Block first atom: 21 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 29 Blocpdb> 9 atoms in block 5 Block first atom: 40 Blocpdb> 8 atoms in block 6 Block first atom: 49 Blocpdb> 7 atoms in block 7 Block first atom: 57 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 64 Blocpdb> 9 atoms in block 9 Block first atom: 72 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 81 Blocpdb> 8 atoms in block 11 Block first atom: 93 Blocpdb> 10 atoms in block 12 Block first atom: 101 Blocpdb> 12 atoms in block 13 Block first atom: 111 Blocpdb> 9 atoms in block 14 Block first atom: 123 Blocpdb> 8 atoms in block 15 Block first atom: 132 Blocpdb> 6 atoms in block 16 Block first atom: 140 Blocpdb> 9 atoms in block 17 Block first atom: 146 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 155 Blocpdb> 4 atoms in block 19 Block first atom: 166 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 170 Blocpdb> 9 atoms in block 21 Block first atom: 182 Blocpdb> 14 atoms in block 22 Block first atom: 191 Blocpdb> 8 atoms in block 23 Block first atom: 205 Blocpdb> 5 atoms in block 24 Block first atom: 213 Blocpdb> 4 atoms in block 25 Block first atom: 218 Blocpdb> 8 atoms in block 26 Block first atom: 222 Blocpdb> 8 atoms in block 27 Block first atom: 230 Blocpdb> 7 atoms in block 28 Block first atom: 238 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 245 Blocpdb> 6 atoms in block 30 Block first atom: 254 Blocpdb> 9 atoms in block 31 Block first atom: 260 Blocpdb> 7 atoms in block 32 Block first atom: 269 Blocpdb> 7 atoms in block 33 Block first atom: 276 Blocpdb> 10 atoms in block 34 Block first atom: 283 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 293 Blocpdb> 7 atoms in block 36 Block first atom: 301 Blocpdb> 8 atoms in block 37 Block first atom: 308 Blocpdb> 11 atoms in block 38 Block first atom: 316 Blocpdb> 9 atoms in block 39 Block first atom: 327 Blocpdb> 5 atoms in block 40 Block first atom: 336 Blocpdb> 4 atoms in block 41 Block first atom: 341 Blocpdb> 8 atoms in block 42 Block first atom: 345 Blocpdb> 8 atoms in block 43 Block first atom: 353 Blocpdb> 11 atoms in block 44 Block first atom: 361 Blocpdb> 6 atoms in block 45 Block first atom: 372 Blocpdb> 11 atoms in block 46 Block first atom: 378 Blocpdb> 11 atoms in block 47 Block first atom: 389 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 400 Blocpdb> 11 atoms in block 49 Block first atom: 412 Blocpdb> 11 atoms in block 50 Block first atom: 423 Blocpdb> 8 atoms in block 51 Block first atom: 434 Blocpdb> 11 atoms in block 52 Block first atom: 442 Blocpdb> 5 atoms in block 53 Block first atom: 453 Blocpdb> 9 atoms in block 54 Block first atom: 458 Blocpdb> 8 atoms in block 55 Block first atom: 467 Blocpdb> 6 atoms in block 56 Block first atom: 475 Blocpdb> 6 atoms in block 57 Block first atom: 481 Blocpdb> 9 atoms in block 58 Block first atom: 487 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 496 Blocpdb> 10 atoms in block 60 Block first atom: 504 Blocpdb> 8 atoms in block 61 Block first atom: 514 Blocpdb> 7 atoms in block 62 Block first atom: 522 Blocpdb> 7 atoms in block 63 Block first atom: 529 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 536 Blocpdb> 7 atoms in block 65 Block first atom: 547 Blocpdb> 5 atoms in block 66 Block first atom: 554 Blocpdb> 11 atoms in block 67 Block first atom: 559 Blocpdb> 4 atoms in block 68 Block first atom: 570 Blocpdb> 11 atoms in block 69 Block first atom: 574 Blocpdb> 11 atoms in block 70 Block first atom: 585 Blocpdb> 5 atoms in block 71 Block first atom: 596 Blocpdb> 7 atoms in block 72 Block first atom: 601 Blocpdb> 7 atoms in block 73 Block first atom: 608 Blocpdb> 7 atoms in block 74 Block first atom: 615 Blocpdb> 9 atoms in block 75 Block first atom: 622 Blocpdb> 9 atoms in block 76 Block first atom: 631 Blocpdb> 8 atoms in block 77 Block first atom: 640 Blocpdb> 11 atoms in block 78 Block first atom: 648 Blocpdb> 11 atoms in block 79 Block first atom: 659 Blocpdb> 8 atoms in block 80 Block first atom: 670 Blocpdb> 4 atoms in block 81 Block first atom: 678 Blocpdb> 7 atoms in block 82 Block first atom: 682 Blocpdb> 8 atoms in block 83 Block first atom: 689 Blocpdb> 14 atoms in block 84 Block first atom: 697 Blocpdb> 4 atoms in block 85 Block first atom: 711 Blocpdb> 11 atoms in block 86 Block first atom: 715 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 726 Blocpdb> 7 atoms in block 88 Block first atom: 734 Blocpdb> 5 atoms in block 89 Block first atom: 741 Blocpdb> 11 atoms in block 90 Block first atom: 746 Blocpdb> 11 atoms in block 91 Block first atom: 757 Blocpdb> 18 atoms in block 92 Block first atom: 768 Blocpdb> 11 atoms in block 93 Block first atom: 786 Blocpdb> 4 atoms in block 94 Block first atom: 797 Blocpdb> 4 atoms in block 95 Block first atom: 801 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 805 Blocpdb> 8 atoms in block 97 Block first atom: 812 Blocpdb> 6 atoms in block 98 Block first atom: 820 Blocpdb> 7 atoms in block 99 Block first atom: 826 Blocpdb> 9 atoms in block 100 Block first atom: 833 Blocpdb> 6 atoms in block 101 Block first atom: 842 Blocpdb> 7 atoms in block 102 Block first atom: 848 Blocpdb> 8 atoms in block 103 Block first atom: 855 Blocpdb> 11 atoms in block 104 Block first atom: 863 Blocpdb> 9 atoms in block 105 Block first atom: 874 Blocpdb> 8 atoms in block 106 Block first atom: 883 Blocpdb> 6 atoms in block 107 Block first atom: 891 Blocpdb> 7 atoms in block 108 Block first atom: 897 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 904 Blocpdb> 7 atoms in block 110 Block first atom: 912 Blocpdb> 8 atoms in block 111 Block first atom: 919 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 927 Blocpdb> 8 atoms in block 113 Block first atom: 935 Blocpdb> 5 atoms in block 114 Block first atom: 943 Blocpdb> 8 atoms in block 115 Block first atom: 948 Blocpdb> 14 atoms in block 116 Block first atom: 956 Blocpdb> 8 atoms in block 117 Block first atom: 970 Blocpdb> 7 atoms in block 118 Block first atom: 978 Blocpdb> 9 atoms in block 119 Block first atom: 985 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 994 Blocpdb> 8 atoms in block 121 Block first atom: 1006 Blocpdb> 8 atoms in block 122 Block first atom: 1014 Blocpdb> 11 atoms in block 123 Block first atom: 1022 Blocpdb> 10 atoms in block 124 Block first atom: 1033 Blocpdb> 8 atoms in block 125 Block first atom: 1043 Blocpdb> 10 atoms in block 126 Block first atom: 1051 Blocpdb> 7 atoms in block 127 Block first atom: 1061 Blocpdb> 14 atoms in block 128 Block first atom: 1068 Blocpdb> 8 atoms in block 129 Block first atom: 1082 Blocpdb> 9 atoms in block 130 Block first atom: 1090 Blocpdb> 8 atoms in block 131 Block first atom: 1099 Blocpdb> 8 atoms in block 132 Block first atom: 1107 Blocpdb> 4 atoms in block 133 Block first atom: 1115 Blocpdb> 4 atoms in block 134 Block first atom: 1119 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 1123 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 1137 Blocpdb> 5 atoms in block 137 Block first atom: 1145 Blocpdb> 11 atoms in block 138 Block first atom: 1150 Blocpdb> 7 atoms in block 139 Block first atom: 1161 Blocpdb> 9 atoms in block 140 Block first atom: 1168 Blocpdb> 8 atoms in block 141 Block first atom: 1177 Blocpdb> 12 atoms in block 142 Block first atom: 1185 Blocpdb> 4 atoms in block 143 Block first atom: 1197 Blocpdb> 7 atoms in block 144 Block first atom: 1200 Blocpdb> 144 blocks. Blocpdb> At most, 18 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 433724 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 3621 Prepmat> Matrix trace = 947540.0000 Prepmat> Last element read: 3621 3621 128.5149 Prepmat> 10441 lines saved. Prepmat> 8682 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1207 RTB> Total mass = 1207.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1207 RTB> Number of blocks = 144 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 203760.4153 RTB> 61128 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 864 Diagstd> Nb of non-zero elements: 61128 Diagstd> Projected matrix trace = 203760.4153 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 864 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 203760.4153 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 4.1353098 5.9640232 6.6407036 7.3670263 9.4185118 10.2196153 10.4922323 14.3427408 14.8068054 16.3131098 16.8403831 18.5320185 18.7554676 19.5226082 20.2876588 21.4428313 22.2509363 22.9441610 24.3379653 24.8986237 25.9541531 26.4765785 27.0470234 28.3472021 29.2616475 29.7971359 29.9551258 31.2972233 31.6419668 32.3796024 34.4804980 35.0451632 37.8077836 38.4744770 39.1276115 40.2197795 42.1303713 42.5894914 43.7016783 46.1124140 46.9183993 47.0063212 48.0480895 48.7880801 50.0349428 50.7309298 52.1736999 52.7123974 52.8850435 53.4856678 54.0975859 55.0674380 56.8427437 57.0293792 58.3182065 60.1159666 60.5665559 61.1267212 61.3128668 62.0893006 63.0475627 65.7114187 65.7888362 66.3788992 66.9864447 67.8480224 68.0457514 69.5989225 70.4779663 71.4519967 71.7939019 72.5619866 73.9435935 74.3370232 75.3769370 76.5428228 77.0752696 78.2627004 78.3836322 78.6082818 79.9273819 81.1469763 81.9384209 83.0643453 84.1082531 84.5790953 85.0585083 85.4657050 86.2070995 87.1600417 88.1661665 88.8717704 89.6177238 90.5527067 91.0462973 92.4668187 93.0487193 93.4643728 94.3612873 94.9929782 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034330 0.0034330 0.0034333 0.0034345 0.0034346 220.8255412 265.1947613 279.8351907 294.7415683 333.2624817 347.1463111 351.7460491 411.2551549 417.8553471 438.5949831 445.6267620 467.4731195 470.2829436 479.8043710 489.1152977 502.8475571 512.2352075 520.1533155 535.7194496 541.8548331 553.2210686 558.7611615 564.7484118 578.1631133 587.4145060 592.7649844 594.3343816 607.5026612 610.8393630 617.9182697 637.6495314 642.8495191 667.7069390 673.5683048 679.2614205 688.6762773 704.8438640 708.6740128 717.8675767 737.4018270 743.8183254 744.5149318 752.7198036 758.4939903 768.1251483 773.4490163 784.3702231 788.4091655 789.6992278 794.1709404 798.7009903 805.8286726 818.7150925 820.0580612 829.2726841 841.9575538 845.1070399 849.0061398 850.2978711 855.6647954 862.2425120 880.2695964 880.7879862 884.7290820 888.7686855 894.4660826 895.7685024 905.9339565 911.6370392 917.9149961 920.1085341 925.0173154 933.7821257 936.2630047 942.7890352 950.0523081 953.3509563 960.6666069 961.4085329 962.7852587 970.8297445 978.2085424 982.9673109 989.6977967 995.8973729 998.6810243 1001.5073972 1003.9017700 1008.2466715 1013.8039872 1019.6385792 1023.7105907 1027.9979171 1033.3465610 1036.1590500 1044.2109387 1047.4914343 1049.8284268 1054.8536469 1058.3785567 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1207 Rtb_to_modes> Number of blocs = 144 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.135 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.367 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.99 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 864 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 1.00004 0.99998 0.99999 1.00003 1.00004 0.99996 1.00002 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99995 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00004 0.99997 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 21726 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 1.00004 0.99998 0.99999 1.00003 1.00004 0.99996 1.00002 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99995 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00004 0.99997 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604130131011690572.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604130131011690572.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604130131011690572.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604130131011690572.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 144 First residue number = 9 Last residue number = 204 Number of atoms found = 1207 Mean number per residue = 8.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.135 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.367 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.99 Bfactors> 106 vectors, 3621 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.135000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.326 for 145 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.026 +/- 0.02 Bfactors> = 41.953 +/- 13.88 Bfactors> Shiftng-fct= 41.927 Bfactors> Scaling-fct= 610.093 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604130131011690572.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604130131011690572.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058. Chkmod> 106 vectors, 3621 coordinates in file. Chkmod> That is: 1207 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7118 0.0034 0.8759 0.0034 0.7248 0.0034 0.9264 0.0034 0.9702 0.0034 0.7625 220.8078 0.0876 265.1829 0.1850 279.8294 0.4168 294.7284 0.0303 333.2568 0.4846 347.1379 0.3820 351.6935 0.3240 411.1982 0.2388 417.8825 0.2671 438.5344 0.3551 445.6026 0.5284 467.4276 0.1143 470.3196 0.2898 479.7517 0.3675 489.1225 0.4900 502.7928 0.1025 512.2024 0.1992 520.0838 0.2647 535.7188 0.2009 541.8465 0.5443 553.1531 0.3091 558.7733 0.3905 564.7552 0.1568 578.1668 0.3476 587.3728 0.3494 592.7680 0.3570 594.3572 0.4387 607.5035 0.4260 610.7942 0.1828 617.8955 0.4410 637.6176 0.4544 642.8663 0.3046 667.6978 0.3911 673.5002 0.4220 679.2530 0.3844 688.6486 0.5297 704.8105 0.5792 708.6478 0.5695 717.8230 0.4177 737.3509 0.4493 743.7991 0.4026 744.5121 0.5196 752.7025 0.3504 758.4764 0.2999 768.0542 0.4778 773.4087 0.4048 784.3087 0.4172 788.3574 0.3434 789.7023 0.2063 794.1690 0.3358 798.6845 0.3636 805.8128 0.5136 818.6602 0.4826 820.0273 0.3054 829.2498 0.3927 841.9497 0.3229 845.0948 0.2335 848.9925 0.3077 850.2415 0.3540 855.6329 0.2729 862.2222 0.2766 880.2223 0.3980 880.7580 0.3569 884.6984 0.4086 888.7541 0.2121 894.4407 0.0648 895.7580 0.4271 905.9021 0.3613 911.6111 0.2625 917.8628 0.2250 920.0440 0.2655 924.9649 0.3279 933.7194 0.3773 936.2416 0.4075 942.7677 0.4577 949.9940 0.3579 953.3393 0.4213 960.6088 0.3323 961.3450 0.3060 962.7545 0.4414 970.8040 0.2926 978.1848 0.4445 982.9346 0.3899 989.6294 0.4412 995.8650 0.4785 998.6435 0.2858 1001.4732 0.4226 1003.8839 0.4775 1008.2204 0.3214 1013.7602 0.3554 1019.6170 0.3144 1023.6564 0.4071 1027.9668 0.4567 1033.2868 0.3345 1036.1356 0.3940 1044.1841 0.3961 1047.4537 0.4327 1049.7588 0.3640 1054.8012 0.5521 1058.3165 0.4850 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604130131011690572 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom making animated gifs 11 models are in 2604130131011690572.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604130131011690572 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom making animated gifs 11 models are in 2604130131011690572.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604130131011690572 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom making animated gifs 11 models are in 2604130131011690572.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604130131011690572 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom making animated gifs 11 models are in 2604130131011690572.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604130131011690572 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604130131011690572.eigenfacs 2604130131011690572.atom making animated gifs 11 models are in 2604130131011690572.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604130131011690572.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604130131011690572.10.pdb 2604130131011690572.11.pdb 2604130131011690572.7.pdb 2604130131011690572.8.pdb 2604130131011690572.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m8.979s user 0m8.910s sys 0m0.065s rm: cannot remove '2604130131011690572.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.