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* APOPTOSIS 10-DEC-22 8HOH *

LOGs for ID: 2604130138361693829

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604130138361693829.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604130138361693829.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604130138361693829.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    138
            First residue number     =     10
            Last  residue number     =    204
            Number of atoms found    =   1153
            Mean number per residue  =      8.4

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -8.371712 +/-     7.601793 From:   -28.035000 To:     7.458000
 =    -3.810559 +/-     9.265194 From:   -24.890000 To:    15.789000
 =    15.827448 +/-     8.049835 From:    -1.550000 To:    38.462000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   6.8479 % Filled.
 Pdbmat>       409782  non-zero elements.
 Pdbmat>        44771 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     77.66 +/-     22.54
         Maximum number =    122
         Minimum number =      9

 Pdbmat> Matrix trace   =  895420.    
 Pdbmat> Larger element =  503.977    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
138 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604130138361693829.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604130138361693829.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604130138361693829.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1153 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   138 residues.
 Blocpdb>     8 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     8 atoms in block      2
 Block first atom:      9
 Blocpdb>    11 atoms in block      3
 Block first atom:     17
 Blocpdb>     9 atoms in block      4
 Block first atom:     28
 Blocpdb>     8 atoms in block      5
 Block first atom:     37
 Blocpdb>     7 atoms in block      6
 Block first atom:     45
 Blocpdb>     8 atoms in block      7
 Block first atom:     52
 Blocpdb>     9 atoms in block      8
 Block first atom:     60
 Blocpdb>    12 atoms in block      9
 Block first atom:     69
 Blocpdb>     8 atoms in block     10
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    10 atoms in block     11
 Block first atom:     89
 Blocpdb>    12 atoms in block     12
 Block first atom:     99
 Blocpdb>     9 atoms in block     13
 Block first atom:    111
 Blocpdb>     8 atoms in block     14
 Block first atom:    120
 Blocpdb>     6 atoms in block     15
 Block first atom:    128
 Blocpdb>     9 atoms in block     16
 Block first atom:    134
 Blocpdb>    11 atoms in block     17
 Block first atom:    143
 Blocpdb>     4 atoms in block     18
 Block first atom:    154
 Blocpdb>    12 atoms in block     19
 Block first atom:    158
 Blocpdb>     9 atoms in block     20
 Block first atom:    170
 Blocpdb>    14 atoms in block     21
 Block first atom:    179
 Blocpdb>     8 atoms in block     22
 Block first atom:    193
 Blocpdb>     5 atoms in block     23
 Block first atom:    201
 Blocpdb>     6 atoms in block     24
 Block first atom:    206
 Blocpdb>     9 atoms in block     25
 Block first atom:    212
 Blocpdb>     7 atoms in block     26
 Block first atom:    221
 Blocpdb>     7 atoms in block     27
 Block first atom:    228
 Blocpdb>    10 atoms in block     28
 Block first atom:    235
 Blocpdb>     8 atoms in block     29
 Block first atom:    245
 Blocpdb>     7 atoms in block     30
 Block first atom:    253
 Blocpdb>     8 atoms in block     31
 Block first atom:    260
 Blocpdb>    11 atoms in block     32
 Block first atom:    268
 Blocpdb>     9 atoms in block     33
 Block first atom:    279
 Blocpdb>     5 atoms in block     34
 Block first atom:    288
 Blocpdb>     7 atoms in block     35
 Block first atom:    293
 Blocpdb>     8 atoms in block     36
 Block first atom:    300
 Blocpdb>     8 atoms in block     37
 Block first atom:    308
 Blocpdb>    11 atoms in block     38
 Block first atom:    316
 Blocpdb>     6 atoms in block     39
 Block first atom:    327
 Blocpdb>    11 atoms in block     40
 Block first atom:    333
 Blocpdb>    11 atoms in block     41
 Block first atom:    344
 Blocpdb>    12 atoms in block     42
 Block first atom:    355
 Blocpdb>    11 atoms in block     43
 Block first atom:    367
 Blocpdb>    11 atoms in block     44
 Block first atom:    378
 Blocpdb>     8 atoms in block     45
 Block first atom:    389
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    397
 Blocpdb>     5 atoms in block     47
 Block first atom:    408
 Blocpdb>     9 atoms in block     48
 Block first atom:    413
 Blocpdb>     8 atoms in block     49
 Block first atom:    422
 Blocpdb>     6 atoms in block     50
 Block first atom:    430
 Blocpdb>     6 atoms in block     51
 Block first atom:    436
 Blocpdb>     9 atoms in block     52
 Block first atom:    442
 Blocpdb>     8 atoms in block     53
 Block first atom:    451
 Blocpdb>    10 atoms in block     54
 Block first atom:    459
 Blocpdb>     8 atoms in block     55
 Block first atom:    469
 Blocpdb>     7 atoms in block     56
 Block first atom:    477
 Blocpdb>     7 atoms in block     57
 Block first atom:    484
 Blocpdb>    11 atoms in block     58
 Block first atom:    491
 Blocpdb>     7 atoms in block     59
 Block first atom:    502
 Blocpdb>     5 atoms in block     60
 Block first atom:    509
 Blocpdb>    11 atoms in block     61
 Block first atom:    514
 Blocpdb>     4 atoms in block     62
 Block first atom:    525
 Blocpdb>    11 atoms in block     63
 Block first atom:    529
 Blocpdb>    11 atoms in block     64
 Block first atom:    540
 Blocpdb>     5 atoms in block     65
 Block first atom:    551
 Blocpdb>     7 atoms in block     66
 Block first atom:    556
 Blocpdb>     7 atoms in block     67
 Block first atom:    563
 Blocpdb>     7 atoms in block     68
 Block first atom:    570
 Blocpdb>     9 atoms in block     69
 Block first atom:    577
 Blocpdb>     9 atoms in block     70
 Block first atom:    586
 Blocpdb>     8 atoms in block     71
 Block first atom:    595
 Blocpdb>    11 atoms in block     72
 Block first atom:    603
 Blocpdb>    11 atoms in block     73
 Block first atom:    614
 Blocpdb>     8 atoms in block     74
 Block first atom:    625
 Blocpdb>     4 atoms in block     75
 Block first atom:    633
 Blocpdb>     7 atoms in block     76
 Block first atom:    637
 Blocpdb>     8 atoms in block     77
 Block first atom:    644
 Blocpdb>    14 atoms in block     78
 Block first atom:    652
 Blocpdb>     4 atoms in block     79
 Block first atom:    666
 Blocpdb>    11 atoms in block     80
 Block first atom:    670
 Blocpdb>     8 atoms in block     81
 Block first atom:    681
 Blocpdb>     7 atoms in block     82
 Block first atom:    689
 Blocpdb>     5 atoms in block     83
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    11 atoms in block     84
 Block first atom:    701
 Blocpdb>    11 atoms in block     85
 Block first atom:    712
 Blocpdb>     9 atoms in block     86
 Block first atom:    723
 Blocpdb>    11 atoms in block     87
 Block first atom:    732
 Blocpdb>     4 atoms in block     88
 Block first atom:    743
 Blocpdb>     4 atoms in block     89
 Block first atom:    747
 Blocpdb>     7 atoms in block     90
 Block first atom:    751
 Blocpdb>     8 atoms in block     91
 Block first atom:    758
 Blocpdb>     6 atoms in block     92
 Block first atom:    766
 Blocpdb>     7 atoms in block     93
 Block first atom:    772
 Blocpdb>     9 atoms in block     94
 Block first atom:    779
 Blocpdb>     6 atoms in block     95
 Block first atom:    788
 Blocpdb>     7 atoms in block     96
 Block first atom:    794
 Blocpdb>     8 atoms in block     97
 Block first atom:    801
 Blocpdb>    11 atoms in block     98
 Block first atom:    809
 Blocpdb>     9 atoms in block     99
 Block first atom:    820
 Blocpdb>     8 atoms in block    100
 Block first atom:    829
 Blocpdb>     6 atoms in block    101
 Block first atom:    837
 Blocpdb>     7 atoms in block    102
 Block first atom:    843
 Blocpdb>     8 atoms in block    103
 Block first atom:    850
 Blocpdb>     7 atoms in block    104
 Block first atom:    858
 Blocpdb>     8 atoms in block    105
 Block first atom:    865
 Blocpdb>     8 atoms in block    106
 Block first atom:    873
 Blocpdb>     8 atoms in block    107
 Block first atom:    881
 Blocpdb>     5 atoms in block    108
 Block first atom:    889
 Blocpdb>     8 atoms in block    109
 Block first atom:    894
 Blocpdb>    14 atoms in block    110
 Block first atom:    902
 Blocpdb>     8 atoms in block    111
 Block first atom:    916
 Blocpdb>     7 atoms in block    112
 Block first atom:    924
 Blocpdb>     9 atoms in block    113
 Block first atom:    931
 Blocpdb>    12 atoms in block    114
 Block first atom:    940
 Blocpdb>     8 atoms in block    115
 Block first atom:    952
 Blocpdb>     8 atoms in block    116
 Block first atom:    960
 Blocpdb>    11 atoms in block    117
 Block first atom:    968
 Blocpdb>    10 atoms in block    118
 Block first atom:    979
 Blocpdb>     8 atoms in block    119
 Block first atom:    989
 Blocpdb>    10 atoms in block    120
 Block first atom:    997
 Blocpdb>     7 atoms in block    121
 Block first atom:   1007
 Blocpdb>    14 atoms in block    122
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>     8 atoms in block    123
 Block first atom:   1028
 Blocpdb>     9 atoms in block    124
 Block first atom:   1036
 Blocpdb>     8 atoms in block    125
 Block first atom:   1045
 Blocpdb>     8 atoms in block    126
 Block first atom:   1053
 Blocpdb>     4 atoms in block    127
 Block first atom:   1061
 Blocpdb>     4 atoms in block    128
 Block first atom:   1065
 Blocpdb>    14 atoms in block    129
 Block first atom:   1069
 Blocpdb>     8 atoms in block    130
 Block first atom:   1083
 Blocpdb>     5 atoms in block    131
 Block first atom:   1091
 Blocpdb>    11 atoms in block    132
 Block first atom:   1096
 Blocpdb>     7 atoms in block    133
 Block first atom:   1107
 Blocpdb>     9 atoms in block    134
 Block first atom:   1114
 Blocpdb>     8 atoms in block    135
 Block first atom:   1123
 Blocpdb>    12 atoms in block    136
 Block first atom:   1131
 Blocpdb>     4 atoms in block    137
 Block first atom:   1143
 Blocpdb>     7 atoms in block    138
 Block first atom:   1146

 Blocpdb>   138 blocks.

 Blocpdb> At most,     14 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       409920 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       3459

 Prepmat> Matrix trace    =     895420.0000
 Prepmat> Last element read:    3459   3459       120.1953
 Prepmat>         9592 lines saved.
 Prepmat>         7923 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1153
 RTB> Total mass =        1153.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1153
 RTB> Number of blocks =   138
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  193232.6307
 RTB>     57978 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      828
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    57978
 Diagstd> Projected matrix trace =  193232.6307

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    828 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 193232.6307
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      4.6794132      5.9779906      6.4221263      8.5734072
      9.2849379      9.9552960     10.9251585     12.4174120     13.9004044
     15.2027309     16.3833468     17.3939129     18.0375571     18.6667183
     20.0052801     21.1464165     22.2707695     23.3576971     24.1730403
     25.3882512     26.1881623     27.4252023     27.6756050     29.0656191
     30.2845681     30.4552119     31.4993464     33.1811644     33.8827186
     35.3355999     36.0352961     37.0382529     38.4140165     38.9523512
     40.0569164     40.9177431     42.8080560     43.7592219     44.4722381
     45.0652792     45.3029169     47.1540724     49.0392584     49.7408843
     50.2610809     51.1553812     52.3346749     53.2255489     53.7073371
     54.6909619     55.6735592     56.6768372     57.6816351     58.8271596
     59.7785431     60.1966487     60.7980664     62.1454171     62.3317183
     62.7131693     63.8531581     65.3552617     66.0330161     66.7427228
     68.2101796     68.3322928     69.4615838     70.5265193     72.0279383
     72.3528626     72.6750401     73.1017796     74.8341364     75.5015989
     76.3649848     77.4972978     77.9640082     79.1701053     79.6707924
     80.6629296     82.1908960     83.2024626     83.6053287     84.2315333
     85.1692876     85.4409295     86.1112469     86.8543895     87.8721662
     88.3357229     88.8984859     90.1717539     91.1028549     91.6834355
     93.4715728     94.1419350     94.4766246     95.8400482     96.1135504
     97.0071233

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034320      0.0034337      0.0034343      0.0034343      0.0034344
      0.0034347    234.9043068    265.5051166    275.1913018    317.9596475
    330.8908682    342.6276200    358.9294994    382.6580249    404.8638479
    423.4050996    439.5381672    452.8912458    461.1945216    469.1689550
    485.6994348    499.3599081    512.4634452    524.8198965    533.9012262
    547.1566393    555.7094630    568.6829404    571.2731884    585.4436086
    597.5936478    599.2749067    609.4611848    625.5198435    632.0979831
    645.5078304    651.8674982    660.8768307    673.0388590    677.7384399
    687.2805246    694.6261298    710.4901037    718.3400419    724.1687394
    728.9811749    730.9006754    745.6841003    760.4439821    765.8646619
    769.8590021    776.6778918    785.5793258    792.2374255    795.8149439
    803.0693688    810.2513694    817.5194309    824.7343089    832.8834260
    839.5913264    842.5223631    846.7206739    856.0513841    857.3335708
    859.9528792    867.7337134    877.8808174    882.4210256    887.1503747
    896.8501331    897.6525665    905.0396809    911.9510037    921.6070161
    923.6834013    925.7376356    928.4515705    939.3883194    943.5683274
    948.9480006    955.9574458    958.8316464    966.2197080    969.2701729
    975.2866420    984.4805438    990.5202772    992.9154296    996.6269654
   1002.1593613   1003.7562501   1007.6859867   1012.0248258   1017.9371086
   1020.6185651   1023.8644462   1031.1706394   1036.4808286   1039.7782280
   1049.8688626   1053.6268770   1055.4981211   1063.0869623   1064.6027663
   1069.5401520

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1153
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    138

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9887E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9985E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.679    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.978    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.422    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.573    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.285    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.955    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.01    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    828 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00002 1.00004 1.00001 1.00003 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99996 0.99996 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001
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 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00005 1.00003 1.00000
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 1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 0.99999
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    20754 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
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 1.00002 0.99996 0.99996 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001
 0.99996 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99998 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00005 1.00003 1.00000
 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99997
 0.99997 0.99995 1.00000 0.99999 0.99996
 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99997
 1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 0.99999
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604130138361693829.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604130138361693829.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604130138361693829.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604130138361693829.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    138
            First residue number     =     10
            Last  residue number     =    204
            Number of atoms found    =   1153
            Mean number per residue  =      8.4

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9887E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9985E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.679    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.978    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.422    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.573    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.285    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.955    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.01    

 Bfactors>  106 vectors,   3459 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     4.679000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.517 for    138 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.028 +/-   0.02
 Bfactors> =     31.856 +/-   9.50
 Bfactors> Shiftng-fct=     31.828
 Bfactors> Scaling-fct=    384.515

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604130138361693829.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604130138361693829.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4319E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   234.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   265.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   275.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   317.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   330.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   342.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   359.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   382.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   404.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   423.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   842.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1050.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1054.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1055.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1063.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1065.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1070.    

 Chkmod>  106 vectors,   3459 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1153 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    82 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7693
      0.0034      0.9183
      0.0034      0.9124
      0.0034      0.7063
      0.0034      0.7236
      0.0034      0.9182
    234.8839      0.0816
    265.4939      0.4438
    275.1768      0.3353
    317.9384      0.0668
    330.8778      0.3282
    342.6078      0.3390
    358.9936      0.3043
    382.6815      0.0629
    404.8406      0.2621
    423.3489      0.3164
    439.4744      0.3136
    452.8209      0.1408
    461.2060      0.3080
    469.1901      0.5379
    485.7359      0.2441
    499.3808      0.5870
    512.4326      0.4246
    524.8232      0.3564
    533.8447      0.5986
    547.1520      0.3998
    555.7051      0.5141
    568.7083      0.5904
    571.2940      0.4609
    585.4626      0.2468
    597.5229      0.3601
    599.2963      0.2431
    609.4413      0.4237
    625.4820      0.3742
    632.0455      0.4382
    645.5203      0.4127
    651.8821      0.3450
    660.8640      0.3143
    672.9748      0.3679
    677.6889      0.3964
    687.2775      0.4011
    694.6155      0.4019
    710.4757      0.3903
    718.3156      0.3345
    724.1194      0.4672
    728.9881      0.5020
    730.8458      0.4044
    745.6199      0.4026
    760.4171      0.4037
    765.8250      0.3154
    769.8177      0.3958
    776.6796      0.4785
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   1064.5374      0.2625
   1069.5101      0.3766
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604130138361693829 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604130138361693829.eigenfacs
2604130138361693829.atom
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11 models are in 2604130138361693829.7.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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11 models are in 2604130138361693829.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130138361693829.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2604130138361693829.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 9
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130138361693829.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130138361693829.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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making animated gifs
11 models are in 2604130138361693829.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130138361693829.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604130138361693829.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604130138361693829 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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11 models are in 2604130138361693829.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604130138361693829.10.pdb
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2604130138361693829.8.pdb
2604130138361693829.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m7.084s
user	0m7.040s
sys	0m0.041s
rm: cannot remove '2604130138361693829.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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*** APOPTOSIS 10-DEC-22 8HOH ***

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Still some additional cleaning from time to time
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