CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2604131717561847512

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604131717561847512.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604131717561847512.atom to be opened. Openam> File opened: 2604131717561847512.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 494 First residue number = 1 Last residue number = 494 Number of atoms found = 3844 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.877758 +/- 13.041435 From: -29.547000 To: 30.344000 = 0.117028 +/- 16.974788 From: -31.562000 To: 41.844000 = 0.032395 +/- 11.253630 From: -34.281000 To: 26.109000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.1884 % Filled. Pdbmat> 1455289 non-zero elements. Pdbmat> 159340 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.90 +/- 22.79 Maximum number = 129 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 3.186800E+06 Pdbmat> Larger element = 505.876 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 494 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604131717561847512.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604131717561847512.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604131717561847512.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3844 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 494 residues. Blocpdb> 25 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 28 atoms in block 2 Block first atom: 26 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 54 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 73 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 97 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 120 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 139 Blocpdb> 22 atoms in block 8 Block first atom: 162 Blocpdb> 20 atoms in block 9 Block first atom: 184 Blocpdb> 22 atoms in block 10 Block first atom: 204 Blocpdb> 28 atoms in block 11 Block first atom: 226 Blocpdb> 24 atoms in block 12 Block first atom: 254 Blocpdb> 27 atoms in block 13 Block first atom: 278 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 305 Blocpdb> 18 atoms in block 15 Block first atom: 327 Blocpdb> 21 atoms in block 16 Block first atom: 345 Blocpdb> 22 atoms in block 17 Block first atom: 366 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 19 Block first atom: 408 Blocpdb> 20 atoms in block 20 Block first atom: 429 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 449 Blocpdb> 22 atoms in block 22 Block first atom: 466 Blocpdb> 31 atoms in block 23 Block first atom: 488 Blocpdb> 23 atoms in block 24 Block first atom: 519 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 542 Blocpdb> 23 atoms in block 26 Block first atom: 566 Blocpdb> 25 atoms in block 27 Block first atom: 589 Blocpdb> 26 atoms in block 28 Block first atom: 614 Blocpdb> 21 atoms in block 29 Block first atom: 640 Blocpdb> 21 atoms in block 30 Block first atom: 661 Blocpdb> 33 atoms in block 31 Block first atom: 682 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 715 Blocpdb> 23 atoms in block 33 Block first atom: 738 Blocpdb> 25 atoms in block 34 Block first atom: 761 Blocpdb> 19 atoms in block 35 Block first atom: 786 Blocpdb> 18 atoms in block 36 Block first atom: 805 Blocpdb> 21 atoms in block 37 Block first atom: 823 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 844 Blocpdb> 27 atoms in block 39 Block first atom: 865 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 892 Blocpdb> 27 atoms in block 41 Block first atom: 918 Blocpdb> 21 atoms in block 42 Block first atom: 945 Blocpdb> 26 atoms in block 43 Block first atom: 966 Blocpdb> 20 atoms in block 44 Block first atom: 992 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 1012 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 1031 Blocpdb> 18 atoms in block 47 Block first atom: 1056 Blocpdb> 33 atoms in block 48 Block first atom: 1074 Blocpdb> 20 atoms in block 49 Block first atom: 1107 Blocpdb> 25 atoms in block 50 Block first atom: 1127 Blocpdb> 23 atoms in block 51 Block first atom: 1152 Blocpdb> 24 atoms in block 52 Block first atom: 1175 Blocpdb> 26 atoms in block 53 Block first atom: 1199 Blocpdb> 18 atoms in block 54 Block first atom: 1225 Blocpdb> 28 atoms in block 55 Block first atom: 1243 Blocpdb> 24 atoms in block 56 Block first atom: 1271 Blocpdb> 26 atoms in block 57 Block first atom: 1295 Blocpdb> 24 atoms in block 58 Block first atom: 1321 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 1345 Blocpdb> 23 atoms in block 60 Block first atom: 1364 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1387 Blocpdb> 27 atoms in block 62 Block first atom: 1410 Blocpdb> 19 atoms in block 63 Block first atom: 1437 Blocpdb> 28 atoms in block 64 Block first atom: 1456 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1484 Blocpdb> 23 atoms in block 66 Block first atom: 1506 Blocpdb> 24 atoms in block 67 Block first atom: 1529 Blocpdb> 26 atoms in block 68 Block first atom: 1553 Blocpdb> 31 atoms in block 69 Block first atom: 1579 Blocpdb> 23 atoms in block 70 Block first atom: 1610 Blocpdb> 31 atoms in block 71 Block first atom: 1633 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1664 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1686 Blocpdb> 28 atoms in block 74 Block first atom: 1708 Blocpdb> 20 atoms in block 75 Block first atom: 1736 Blocpdb> 26 atoms in block 76 Block first atom: 1756 Blocpdb> 26 atoms in block 77 Block first atom: 1782 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 1808 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 1837 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1860 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1884 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1907 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 1927 Blocpdb> 28 atoms in block 84 Block first atom: 1954 Blocpdb> 18 atoms in block 85 Block first atom: 1982 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 2000 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 2024 Blocpdb> 26 atoms in block 88 Block first atom: 2047 Blocpdb> 23 atoms in block 89 Block first atom: 2073 Blocpdb> 23 atoms in block 90 Block first atom: 2096 Blocpdb> 22 atoms in block 91 Block first atom: 2119 Blocpdb> 26 atoms in block 92 Block first atom: 2141 Blocpdb> 18 atoms in block 93 Block first atom: 2167 Blocpdb> 27 atoms in block 94 Block first atom: 2185 Blocpdb> 22 atoms in block 95 Block first atom: 2212 Blocpdb> 27 atoms in block 96 Block first atom: 2234 Blocpdb> 20 atoms in block 97 Block first atom: 2261 Blocpdb> 27 atoms in block 98 Block first atom: 2281 Blocpdb> 25 atoms in block 99 Block first atom: 2308 Blocpdb> 20 atoms in block 100 Block first atom: 2333 Blocpdb> 26 atoms in block 101 Block first atom: 2353 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2379 Blocpdb> 17 atoms in block 103 Block first atom: 2404 Blocpdb> 18 atoms in block 104 Block first atom: 2421 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 2439 Blocpdb> 21 atoms in block 106 Block first atom: 2459 Blocpdb> 23 atoms in block 107 Block first atom: 2480 Blocpdb> 22 atoms in block 108 Block first atom: 2503 Blocpdb> 23 atoms in block 109 Block first atom: 2525 Blocpdb> 21 atoms in block 110 Block first atom: 2548 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 2569 Blocpdb> 22 atoms in block 112 Block first atom: 2590 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 2612 Blocpdb> 22 atoms in block 114 Block first atom: 2636 Blocpdb> 21 atoms in block 115 Block first atom: 2658 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 2679 Blocpdb> 23 atoms in block 117 Block first atom: 2706 Blocpdb> 27 atoms in block 118 Block first atom: 2729 Blocpdb> 22 atoms in block 119 Block first atom: 2756 Blocpdb> 21 atoms in block 120 Block first atom: 2778 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 2799 Blocpdb> 20 atoms in block 122 Block first atom: 2820 Blocpdb> 29 atoms in block 123 Block first atom: 2840 Blocpdb> 18 atoms in block 124 Block first atom: 2869 Blocpdb> 29 atoms in block 125 Block first atom: 2887 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2916 Blocpdb> 14 atoms in block 127 Block first atom: 2940 Blocpdb> 23 atoms in block 128 Block first atom: 2954 Blocpdb> 26 atoms in block 129 Block first atom: 2977 Blocpdb> 27 atoms in block 130 Block first atom: 3003 Blocpdb> 20 atoms in block 131 Block first atom: 3030 Blocpdb> 23 atoms in block 132 Block first atom: 3050 Blocpdb> 26 atoms in block 133 Block first atom: 3073 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3099 Blocpdb> 26 atoms in block 135 Block first atom: 3123 Blocpdb> 21 atoms in block 136 Block first atom: 3149 Blocpdb> 26 atoms in block 137 Block first atom: 3170 Blocpdb> 24 atoms in block 138 Block first atom: 3196 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 3220 Blocpdb> 25 atoms in block 140 Block first atom: 3237 Blocpdb> 23 atoms in block 141 Block first atom: 3262 Blocpdb> 19 atoms in block 142 Block first atom: 3285 Blocpdb> 21 atoms in block 143 Block first atom: 3304 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3325 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 3343 Blocpdb> 28 atoms in block 146 Block first atom: 3371 Blocpdb> 23 atoms in block 147 Block first atom: 3399 Blocpdb> 30 atoms in block 148 Block first atom: 3422 Blocpdb> 22 atoms in block 149 Block first atom: 3452 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 3474 Blocpdb> 21 atoms in block 151 Block first atom: 3496 Blocpdb> 22 atoms in block 152 Block first atom: 3517 Blocpdb> 22 atoms in block 153 Block first atom: 3539 Blocpdb> 21 atoms in block 154 Block first atom: 3561 Blocpdb> 17 atoms in block 155 Block first atom: 3582 Blocpdb> 26 atoms in block 156 Block first atom: 3599 Blocpdb> 29 atoms in block 157 Block first atom: 3625 Blocpdb> 24 atoms in block 158 Block first atom: 3654 Blocpdb> 26 atoms in block 159 Block first atom: 3678 Blocpdb> 27 atoms in block 160 Block first atom: 3704 Blocpdb> 27 atoms in block 161 Block first atom: 3731 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3758 Blocpdb> 22 atoms in block 163 Block first atom: 3779 Blocpdb> 26 atoms in block 164 Block first atom: 3801 Blocpdb> 18 atoms in block 165 Block first atom: 3826 Blocpdb> 165 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1455454 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 11532 Prepmat> Matrix trace = 3186800.0000 Prepmat> Last element read: 11532 11532 96.9097 Prepmat> 13696 lines saved. Prepmat> 11998 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3844 RTB> Total mass = 3844.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3844 RTB> Number of blocks = 165 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 218289.8469 RTB> 58606 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 990 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58606 Diagstd> Projected matrix trace = 218289.8469 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 990 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 218289.8469 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6503509 1.1037000 1.3724609 2.4590189 3.1247328 4.2003801 5.0722709 5.7399381 6.6410482 7.4750963 8.0655713 8.2478237 9.5881149 10.4261830 11.6772744 12.0154680 12.7641404 13.8156028 14.0329453 15.9478175 16.1716318 17.1110867 17.8547166 18.3278660 18.6272036 19.9173042 20.6684588 22.0779868 22.3056417 22.7852816 23.0475742 23.7802816 25.8575056 26.6963351 27.2175482 27.8278839 28.0417949 29.0427970 29.3087766 29.4401931 30.0954489 31.0573040 31.8662792 32.2218036 33.4367371 33.6853716 34.2641238 34.5966632 35.2307087 35.9247288 36.5277607 37.1635317 37.6930835 38.2898281 39.2777556 39.4707901 40.1671636 41.0089007 41.1610704 41.7795913 42.2468498 42.6782598 43.7996713 44.5274506 45.2759007 45.7320077 46.8231898 47.2149188 47.6657828 47.9774890 49.1251898 49.3222150 49.5590200 49.5705229 50.4138681 50.8542606 51.6314974 52.5709461 52.6646861 53.6168303 54.5615595 54.8479331 55.1558461 55.9153159 56.3482486 56.7388681 57.5078484 57.7918633 58.4257568 58.4919927 59.3357797 59.3682651 60.8921841 60.9851680 61.6785381 62.0898630 62.6491377 63.4437147 63.6842615 64.3356599 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034337 0.0034340 0.0034343 0.0034355 0.0034357 87.5727827 114.0829668 127.2170343 170.2849296 191.9560133 222.5561376 244.5662356 260.1650089 279.8424508 296.8955421 308.3989189 311.8637985 336.2496922 350.6371704 371.0786964 376.4138776 387.9636769 403.6269911 406.7894639 433.6565478 436.6889503 449.1941337 458.8510834 464.8910992 468.6721116 484.6302949 493.6843125 510.2406024 512.8645032 518.3492571 521.3242073 529.5461034 552.1900717 561.0752382 566.5259144 572.8426852 575.0401709 585.2137207 587.8873643 589.2038929 595.7248180 605.1696746 613.0006834 616.4107495 627.9242062 630.2544947 635.6456736 638.7227531 644.5490461 650.8666652 656.3066499 661.9935679 666.6933351 671.9500470 680.5634355 682.2337342 688.2256626 695.3994516 696.6884498 701.9034448 705.8175387 709.4121653 718.6719690 724.6181294 730.6827083 734.3539148 743.0632426 746.1650514 749.7192206 752.1665878 761.1099526 762.6347074 764.4632899 764.5520026 771.0282497 774.3886025 780.2838905 787.3506250 788.0522806 795.1441134 802.1187486 804.2210078 806.4752720 812.0086797 815.1461681 817.9666824 823.4909670 825.5219565 830.0370031 830.5073662 836.4762356 836.7051831 847.3757983 848.0225339 852.8296993 855.6686708 859.5137507 864.9471698 866.5853421 871.0060271 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3844 Rtb_to_modes> Number of blocs = 165 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6504 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.125 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.200 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.072 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.740 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.066 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.248 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.34 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 990 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00005 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00003 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 69192 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00005 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00003 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604131717561847512.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604131717561847512.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604131717561847512.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604131717561847512.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 494 First residue number = 1 Last residue number = 494 Number of atoms found = 3844 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6504 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.125 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.200 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.072 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.740 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.066 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.248 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.34 Bfactors> 106 vectors, 11532 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.650400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.395 for 494 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.029 +/- 0.03 Bfactors> = 95.834 +/- 1.18 Bfactors> Shiftng-fct= 95.805 Bfactors> Scaling-fct= 46.813 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604131717561847512.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604131717561847512.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.0 Chkmod> 106 vectors, 11532 coordinates in file. Chkmod> That is: 3844 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7601 0.0034 0.7527 0.0034 0.9023 0.0034 0.8601 0.0034 0.9342 0.0034 0.7454 87.5723 0.5276 114.0936 0.4805 127.1902 0.4120 170.2770 0.6758 191.9560 0.6985 222.5365 0.5042 244.5492 0.3795 260.1552 0.4874 279.8294 0.5324 296.8809 0.4631 308.3939 0.5206 311.8537 0.6259 336.2332 0.1325 350.6863 0.5466 371.1061 0.1789 376.4687 0.3011 387.8841 0.3836 403.6739 0.5432 406.7293 0.2976 433.6676 0.1963 436.6482 0.3425 449.1606 0.5323 458.7708 0.3265 464.8982 0.3400 468.6872 0.2223 484.6423 0.3689 493.6815 0.2305 510.2420 0.4410 512.8926 0.1810 518.3807 0.4196 521.3293 0.3264 529.5202 0.4832 552.1930 0.2851 561.0897 0.5424 566.5271 0.5906 572.8399 0.4441 574.9971 0.3683 585.1604 0.4984 587.8744 0.3623 589.1767 0.3403 595.7443 0.2447 605.1700 0.5233 613.0102 0.4966 616.3670 0.5196 627.9279 0.3921 630.2707 0.5024 635.5801 0.4167 638.7261 0.5140 644.5149 0.4537 650.7959 0.4912 656.2986 0.4429 661.9337 0.4645 666.6374 0.4297 671.9227 0.3837 680.5537 0.4997 682.1976 0.5111 688.2204 0.3818 695.3789 0.5898 696.6495 0.4872 701.8767 0.2194 705.8136 0.3663 709.3962 0.4310 718.6438 0.3629 724.6078 0.4228 730.6844 0.3863 734.3063 0.3153 743.0060 0.3766 746.0942 0.4113 749.7202 0.4848 752.1540 0.5596 761.1145 0.3559 762.5848 0.3732 764.4380 0.4968 764.5152 0.4443 770.9656 0.4641 774.3229 0.5308 780.2391 0.4024 787.3097 0.4240 787.9834 0.4050 795.1335 0.2896 802.0729 0.1885 804.2016 0.3548 806.4710 0.3401 812.0078 0.4622 815.1238 0.4230 817.9397 0.3658 823.4710 0.3954 825.4732 0.5089 830.0315 0.3494 830.4576 0.2682 836.4701 0.4728 836.6815 0.4042 847.3242 0.3144 848.0197 0.4765 852.8032 0.3532 855.6329 0.3782 859.4828 0.4317 864.8847 0.4882 866.5191 0.5341 870.9980 0.3314 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131717561847512 7 -50 50 10 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom making animated gifs 11 models are in 2604131717561847512.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131717561847512 8 -50 50 10 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom making animated gifs 11 models are in 2604131717561847512.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131717561847512 9 -50 50 10 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom making animated gifs 11 models are in 2604131717561847512.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131717561847512 10 -50 50 10 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom making animated gifs 11 models are in 2604131717561847512.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131717561847512 11 -50 50 10 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2604131717561847512.eigenfacs 2604131717561847512.atom making animated gifs 11 models are in 2604131717561847512.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131717561847512.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604131717561847512.10.pdb 2604131717561847512.11.pdb 2604131717561847512.7.pdb 2604131717561847512.8.pdb 2604131717561847512.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m19.877s user 0m19.501s sys 0m0.371s rm: cannot remove '2604131717561847512.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.