CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2604131948061868348

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604131948061868348.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604131948061868348.atom to be opened. Openam> File opened: 2604131948061868348.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 285 First residue number = 69 Last residue number = 1 Number of atoms found = 4698 Mean number per residue = 16.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 24.793323 +/- 15.592574 From: -4.874000 To: 59.849000 = 0.674412 +/- 8.394283 From: -19.176000 To: 21.247000 = 61.625204 +/- 10.097504 From: 42.331000 To: 88.351000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.3404 % Filled. Pdbmat> 3317915 non-zero elements. Pdbmat> 365583 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 155.63 +/- 46.31 Maximum number = 247 Minimum number = 25 Pdbmat> Matrix trace = 7.311660E+06 Pdbmat> Larger element = 931.708 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 285 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604131948061868348.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604131948061868348.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604131948061868348.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4698 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 285 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 36 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 37 atoms in block 3 Block first atom: 68 Blocpdb> 38 atoms in block 4 Block first atom: 105 Blocpdb> 21 atoms in block 5 Block first atom: 143 Blocpdb> 38 atoms in block 6 Block first atom: 164 Blocpdb> 24 atoms in block 7 Block first atom: 202 Blocpdb> 32 atoms in block 8 Block first atom: 226 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 258 Blocpdb> 33 atoms in block 10 Block first atom: 296 Blocpdb> 29 atoms in block 11 Block first atom: 329 Blocpdb> 21 atoms in block 12 Block first atom: 358 Blocpdb> 38 atoms in block 13 Block first atom: 379 Blocpdb> 35 atoms in block 14 Block first atom: 417 Blocpdb> 27 atoms in block 15 Block first atom: 452 Blocpdb> 27 atoms in block 16 Block first atom: 479 Blocpdb> 34 atoms in block 17 Block first atom: 506 Blocpdb> 44 atoms in block 18 Block first atom: 540 Blocpdb> 36 atoms in block 19 Block first atom: 584 Blocpdb> 24 atoms in block 20 Block first atom: 620 Blocpdb> 28 atoms in block 21 Block first atom: 644 Blocpdb> 41 atoms in block 22 Block first atom: 672 Blocpdb> 36 atoms in block 23 Block first atom: 713 Blocpdb> 30 atoms in block 24 Block first atom: 749 Blocpdb> 29 atoms in block 25 Block first atom: 779 Blocpdb> 22 atoms in block 26 Block first atom: 808 Blocpdb> 36 atoms in block 27 Block first atom: 830 Blocpdb> 26 atoms in block 28 Block first atom: 866 Blocpdb> 39 atoms in block 29 Block first atom: 892 Blocpdb> 33 atoms in block 30 Block first atom: 931 Blocpdb> 30 atoms in block 31 Block first atom: 964 Blocpdb> 28 atoms in block 32 Block first atom: 994 Blocpdb> 33 atoms in block 33 Block first atom: 1022 Blocpdb> 38 atoms in block 34 Block first atom: 1055 Blocpdb> 28 atoms in block 35 Block first atom: 1093 Blocpdb> 45 atoms in block 36 Block first atom: 1121 Blocpdb> 38 atoms in block 37 Block first atom: 1166 Blocpdb> 33 atoms in block 38 Block first atom: 1204 Blocpdb> 33 atoms in block 39 Block first atom: 1237 Blocpdb> 29 atoms in block 40 Block first atom: 1270 Blocpdb> 26 atoms in block 41 Block first atom: 1299 Blocpdb> 43 atoms in block 42 Block first atom: 1325 Blocpdb> 40 atoms in block 43 Block first atom: 1368 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1408 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 1436 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 1475 Blocpdb> 32 atoms in block 47 Block first atom: 1500 Blocpdb> 43 atoms in block 48 Block first atom: 1532 Blocpdb> 36 atoms in block 49 Block first atom: 1575 Blocpdb> 21 atoms in block 50 Block first atom: 1611 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1632 Blocpdb> 31 atoms in block 52 Block first atom: 1662 Blocpdb> 45 atoms in block 53 Block first atom: 1693 Blocpdb> 26 atoms in block 54 Block first atom: 1738 Blocpdb> 36 atoms in block 55 Block first atom: 1764 Blocpdb> 28 atoms in block 56 Block first atom: 1800 Blocpdb> 37 atoms in block 57 Block first atom: 1828 Blocpdb> 28 atoms in block 58 Block first atom: 1865 Blocpdb> 44 atoms in block 59 Block first atom: 1893 Blocpdb> 25 atoms in block 60 Block first atom: 1937 Blocpdb> 38 atoms in block 61 Block first atom: 1962 Blocpdb> 32 atoms in block 62 Block first atom: 2000 Blocpdb> 39 atoms in block 63 Block first atom: 2032 Blocpdb> 41 atoms in block 64 Block first atom: 2071 Blocpdb> 29 atoms in block 65 Block first atom: 2112 Blocpdb> 40 atoms in block 66 Block first atom: 2141 Blocpdb> 33 atoms in block 67 Block first atom: 2181 Blocpdb> 27 atoms in block 68 Block first atom: 2214 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 2241 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2267 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2295 Blocpdb> 30 atoms in block 72 Block first atom: 2328 Blocpdb> 27 atoms in block 73 Block first atom: 2358 Blocpdb> 36 atoms in block 74 Block first atom: 2385 Blocpdb> 24 atoms in block 75 Block first atom: 2421 Blocpdb> 33 atoms in block 76 Block first atom: 2445 Blocpdb> 36 atoms in block 77 Block first atom: 2478 Blocpdb> 37 atoms in block 78 Block first atom: 2514 Blocpdb> 18 atoms in block 79 Block first atom: 2551 Blocpdb> 29 atoms in block 80 Block first atom: 2569 Blocpdb> 29 atoms in block 81 Block first atom: 2598 Blocpdb> 24 atoms in block 82 Block first atom: 2627 Blocpdb> 34 atoms in block 83 Block first atom: 2651 Blocpdb> 35 atoms in block 84 Block first atom: 2685 Blocpdb> 26 atoms in block 85 Block first atom: 2720 Blocpdb> 31 atoms in block 86 Block first atom: 2746 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 2777 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 2804 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 2844 Blocpdb> 33 atoms in block 90 Block first atom: 2877 Blocpdb> 36 atoms in block 91 Block first atom: 2910 Blocpdb> 35 atoms in block 92 Block first atom: 2946 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 2981 Blocpdb> 39 atoms in block 94 Block first atom: 3016 Blocpdb> 33 atoms in block 95 Block first atom: 3055 Blocpdb> 33 atoms in block 96 Block first atom: 3088 Blocpdb> 36 atoms in block 97 Block first atom: 3121 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3157 Blocpdb> 10 atoms in block 99 Block first atom: 3194 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 3204 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 3232 Blocpdb> 29 atoms in block 102 Block first atom: 3262 Blocpdb> 39 atoms in block 103 Block first atom: 3291 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 3330 Blocpdb> 38 atoms in block 105 Block first atom: 3351 Blocpdb> 26 atoms in block 106 Block first atom: 3389 Blocpdb> 35 atoms in block 107 Block first atom: 3415 Blocpdb> 40 atoms in block 108 Block first atom: 3450 Blocpdb> 39 atoms in block 109 Block first atom: 3490 Blocpdb> 32 atoms in block 110 Block first atom: 3529 Blocpdb> 41 atoms in block 111 Block first atom: 3561 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 3602 Blocpdb> 40 atoms in block 113 Block first atom: 3627 Blocpdb> 33 atoms in block 114 Block first atom: 3667 Blocpdb> 33 atoms in block 115 Block first atom: 3700 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 3733 Blocpdb> 35 atoms in block 117 Block first atom: 3760 Blocpdb> 32 atoms in block 118 Block first atom: 3795 Blocpdb> 26 atoms in block 119 Block first atom: 3827 Blocpdb> 24 atoms in block 120 Block first atom: 3853 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 3877 Blocpdb> 35 atoms in block 122 Block first atom: 3904 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 3939 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 3956 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 3994 Blocpdb> 36 atoms in block 126 Block first atom: 4024 Blocpdb> 43 atoms in block 127 Block first atom: 4060 Blocpdb> 28 atoms in block 128 Block first atom: 4103 Blocpdb> 30 atoms in block 129 Block first atom: 4131 Blocpdb> 21 atoms in block 130 Block first atom: 4161 Blocpdb> 30 atoms in block 131 Block first atom: 4182 Blocpdb> 33 atoms in block 132 Block first atom: 4212 Blocpdb> 37 atoms in block 133 Block first atom: 4245 Blocpdb> 33 atoms in block 134 Block first atom: 4282 Blocpdb> 34 atoms in block 135 Block first atom: 4315 Blocpdb> 36 atoms in block 136 Block first atom: 4349 Blocpdb> 45 atoms in block 137 Block first atom: 4385 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 4430 Blocpdb> 31 atoms in block 139 Block first atom: 4451 Blocpdb> 45 atoms in block 140 Block first atom: 4482 Blocpdb> 36 atoms in block 141 Block first atom: 4527 Blocpdb> 28 atoms in block 142 Block first atom: 4563 Blocpdb> 21 atoms in block 143 Block first atom: 4591 Blocpdb> 87 atoms in block 144 Block first atom: 4611 Blocpdb> 144 blocks. Blocpdb> At most, 87 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3318059 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 14094 Prepmat> Matrix trace = 7311660.0000 Prepmat> Last element read: 14094 14094 320.5490 Prepmat> 10441 lines saved. Prepmat> 8735 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4698 RTB> Total mass = 4698.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4698 RTB> Number of blocks = 144 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 376818.5113 RTB> 59220 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 864 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59220 Diagstd> Projected matrix trace = 376818.5113 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 864 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 376818.5113 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.5172782 4.5200838 6.3122272 8.0902446 9.2773604 10.4923849 11.3907805 13.7490166 15.4402311 16.5027841 17.1308486 17.8302295 19.6828755 21.6591125 22.2659816 24.0039067 24.8309123 27.5899605 29.5469419 30.4936861 31.4458648 33.0539040 34.4622695 37.2486548 39.3608029 41.9345384 43.7490528 44.1915992 45.4991873 46.8499121 47.5746002 49.5391894 50.9429077 51.5888907 52.3573202 53.5485826 56.3805421 56.9711501 58.8665235 59.8048968 60.7295437 62.4996828 62.8511865 64.7271962 67.2468659 68.7840497 69.1471465 70.8783052 71.9407690 72.7879485 75.9377374 78.0076640 79.7807023 80.4335060 83.2640098 85.2472864 85.9053037 89.8420651 90.7856523 91.6147539 92.4322390 93.2664909 94.8676570 95.1117434 95.9821567 98.8949094 99.5209989 100.4199819 103.9065683 104.7789738 106.0894241 107.6169267 108.7882092 109.6714709 109.7553335 112.6006417 114.9258840 116.3467492 116.8484422 117.7769104 119.2224870 121.2727928 122.2161395 123.4665141 124.9447494 125.4377715 126.0318660 127.4568013 131.1686560 132.0222657 133.7334665 135.0683740 137.0639672 137.2544259 138.2318930 141.7696342 142.4580004 143.6968365 144.8705918 146.0485847 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034290 0.0034291 0.0034335 0.0034338 0.0034345 0.0034348 203.6566704 230.8705429 272.8265255 308.8702683 330.7558197 351.7486077 366.4983488 402.6531481 426.6995431 441.1374097 449.4534504 458.5363265 481.7697787 505.3771581 512.4083563 532.0301509 541.1175484 570.3885769 590.2711390 599.6533205 608.9435741 624.3191565 637.4809594 662.7512826 681.2825337 703.2038080 718.2565703 721.8802157 732.4822417 743.2752482 749.0017871 764.3103281 775.0632500 779.9618760 785.7492681 794.6378919 815.3797167 819.6392998 833.1620394 839.7763754 846.2433896 858.4879171 860.8986378 873.6524073 890.4946294 900.6149481 902.9888995 914.2225774 921.0491755 926.4564723 946.2896863 959.1000567 969.9385216 973.8986863 990.8865674 1002.6181495 1006.4802776 1029.2838137 1034.6748419 1039.3886976 1044.0156690 1048.7164948 1057.6801838 1059.0399700 1063.8748259 1079.8967864 1083.3097290 1088.1915512 1106.9213934 1111.5585679 1118.4879928 1126.5113533 1132.6251323 1137.2137822 1137.6484965 1152.3004008 1164.1373055 1171.3114994 1173.8341596 1178.4885272 1185.6987682 1195.8507215 1200.4928036 1206.6182054 1213.8199901 1216.2124512 1219.0891426 1225.9613759 1243.6847658 1247.7249831 1255.7851158 1262.0370829 1271.3260012 1272.2089867 1276.7310133 1292.9653598 1296.1005723 1301.7239153 1307.0295227 1312.3327187 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4698 Rtb_to_modes> Number of blocs = 144 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9708E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9718E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.090 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.277 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.0 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 864 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 1.00006 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00004 0.99998 1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 84564 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 1.00006 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00004 0.99998 1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604131948061868348.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604131948061868348.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604131948061868348.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604131948061868348.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 285 First residue number = 69 Last residue number = 1 Number of atoms found = 4698 Mean number per residue = 16.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9708E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9718E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.090 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.277 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.0 Bfactors> 106 vectors, 14094 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.517000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.257 for 284 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.007 +/- 0.01 Bfactors> = 72.605 +/- 32.17 Bfactors> Shiftng-fct= 72.598 Bfactors> Scaling-fct= 3063.121 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604131948061868348.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604131948061868348.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4288E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4290E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1039. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1107. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1164. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1171. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1186. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1196. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1200. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1207. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1219. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1244. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1248. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1262. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1272. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1293. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1296. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1302. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1307. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1312. Chkmod> 106 vectors, 14094 coordinates in file. Chkmod> That is: 4698 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7330 0.0034 0.7247 0.0034 0.8475 0.0034 0.7682 0.0034 0.9687 0.0034 0.7721 203.6399 0.0854 230.8585 0.0538 272.8099 0.3783 308.8523 0.4312 330.7352 0.4140 351.6935 0.2390 366.4701 0.3391 402.6503 0.2498 426.6780 0.2455 441.0813 0.1874 449.4230 0.2085 458.5137 0.3277 481.7139 0.1936 505.3658 0.2822 512.4326 0.3783 531.9640 0.2401 541.0844 0.4455 570.3645 0.4132 590.2763 0.3849 599.5913 0.5367 608.9575 0.3155 624.2555 0.3288 637.4326 0.4908 662.7348 0.5378 681.2463 0.5593 703.1356 0.2576 718.2335 0.4612 721.8362 0.5300 732.4573 0.2996 743.2440 0.4400 748.9334 0.4796 764.2838 0.4273 775.0079 0.4020 779.9368 0.2220 785.7356 0.1874 794.6143 0.2006 815.3408 0.5407 819.5958 0.3786 833.1509 0.3611 839.7059 0.3154 846.2102 0.2333 858.4532 0.5126 860.8536 0.1230 873.6338 0.2372 890.4772 0.2694 900.5498 0.3493 902.9688 0.4295 914.1943 0.3327 921.0047 0.3934 926.4298 0.4373 946.2632 0.3547 959.0732 0.2069 969.8926 0.4316 973.8357 0.3696 990.8202 0.4064 1002.5911 0.4072 1006.4646 0.4240 1029.2278 0.4722 1034.6552 0.2152 1039.3171 0.4910 1043.9582 0.1940 1048.6912 0.3991 1057.6478 0.4207 1058.9848 0.4663 1063.8172 0.4459 1079.8236 0.3511 1083.2578 0.4688 1088.0366 0.4691 1106.8389 0.3080 1111.6224 0.3491 1118.4957 0.4562 1126.3744 0.2607 1132.6379 0.3454 1137.3129 0.4407 1137.8311 0.4963 1152.2477 0.2389 1163.9562 0.4223 1171.0259 0.3714 1173.5404 0.3619 1178.5534 0.4710 1185.5360 0.5016 1195.9335 0.4480 1200.3620 0.5265 1206.7300 0.3723 1213.5505 0.4039 1215.9771 0.4353 1218.8827 0.5121 1226.1165 0.4748 1243.7800 0.4681 1247.5662 0.4869 1255.5741 0.4621 1262.1306 0.3910 1271.4385 0.3706 1272.3656 0.4643 1276.5289 0.3707 1293.0483 0.4465 1296.2360 0.6168 1301.6824 0.4350 1307.1061 0.5115 1312.0581 0.3804 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131948061868348 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom making animated gifs 11 models are in 2604131948061868348.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131948061868348 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom making animated gifs 11 models are in 2604131948061868348.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131948061868348 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom making animated gifs 11 models are in 2604131948061868348.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131948061868348 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom making animated gifs 11 models are in 2604131948061868348.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604131948061868348 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604131948061868348.eigenfacs 2604131948061868348.atom making animated gifs 11 models are in 2604131948061868348.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604131948061868348.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604131948061868348.10.pdb 2604131948061868348.11.pdb 2604131948061868348.7.pdb 2604131948061868348.8.pdb 2604131948061868348.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m19.770s user 0m19.581s sys 0m0.181s rm: cannot remove '2604131948061868348.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.