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* 1014_Man *

LOGs for ID: 2604140238591921336

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604140238591921336.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604140238591921336.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604140238591921336.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    407
            First residue number     =     21
            Last  residue number     =    427
            Number of atoms found    =   3160
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    22.318784 +/-     9.821792 From:    -1.173000 To:    47.093000
 =   -27.127078 +/-    11.007042 From:   -59.178000 To:    -4.149000
 =    -8.292526 +/-    17.152094 From:   -48.243000 To:    24.458000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.6725 % Filled.
 Pdbmat>      1201012  non-zero elements.
 Pdbmat>       131358 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     83.14 +/-     22.25
         Maximum number =    130
         Minimum number =     17

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.627160E+06
 Pdbmat> Larger element =  489.045    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
407 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604140238591921336.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604140238591921336.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604140238591921336.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  3160 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   407 residues.
 Blocpdb>    23 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    20 atoms in block      2
 Block first atom:     24
 Blocpdb>    22 atoms in block      3
 Block first atom:     44
 Blocpdb>    21 atoms in block      4
 Block first atom:     66
 Blocpdb>    23 atoms in block      5
 Block first atom:     87
 Blocpdb>    32 atoms in block      6
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    23 atoms in block      7
 Block first atom:    142
 Blocpdb>    24 atoms in block      8
 Block first atom:    165
 Blocpdb>    22 atoms in block      9
 Block first atom:    189
 Blocpdb>    30 atoms in block     10
 Block first atom:    211
 Blocpdb>    23 atoms in block     11
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    29 atoms in block     12
 Block first atom:    264
 Blocpdb>    25 atoms in block     13
 Block first atom:    293
 Blocpdb>    22 atoms in block     14
 Block first atom:    318
 Blocpdb>    25 atoms in block     15
 Block first atom:    340
 Blocpdb>    21 atoms in block     16
 Block first atom:    365
 Blocpdb>    27 atoms in block     17
 Block first atom:    386
 Blocpdb>    22 atoms in block     18
 Block first atom:    413
 Blocpdb>    24 atoms in block     19
 Block first atom:    435
 Blocpdb>    25 atoms in block     20
 Block first atom:    459
 Blocpdb>    22 atoms in block     21
 Block first atom:    484
 Blocpdb>    24 atoms in block     22
 Block first atom:    506
 Blocpdb>    19 atoms in block     23
 Block first atom:    530
 Blocpdb>    21 atoms in block     24
 Block first atom:    549
 Blocpdb>    23 atoms in block     25
 Block first atom:    570
 Blocpdb>    27 atoms in block     26
 Block first atom:    593
 Blocpdb>    29 atoms in block     27
 Block first atom:    620
 Blocpdb>    24 atoms in block     28
 Block first atom:    649
 Blocpdb>    21 atoms in block     29
 Block first atom:    673
 Blocpdb>    25 atoms in block     30
 Block first atom:    694
 Blocpdb>    21 atoms in block     31
 Block first atom:    719
 Blocpdb>    30 atoms in block     32
 Block first atom:    740
 Blocpdb>    26 atoms in block     33
 Block first atom:    770
 Blocpdb>    24 atoms in block     34
 Block first atom:    796
 Blocpdb>    25 atoms in block     35
 Block first atom:    820
 Blocpdb>    28 atoms in block     36
 Block first atom:    845
 Blocpdb>    17 atoms in block     37
 Block first atom:    873
 Blocpdb>    16 atoms in block     38
 Block first atom:    890
 Blocpdb>    21 atoms in block     39
 Block first atom:    906
 Blocpdb>    20 atoms in block     40
 Block first atom:    927
 Blocpdb>    29 atoms in block     41
 Block first atom:    947
 Blocpdb>    29 atoms in block     42
 Block first atom:    976
 Blocpdb>    23 atoms in block     43
 Block first atom:   1005
 Blocpdb>    20 atoms in block     44
 Block first atom:   1028
 Blocpdb>    22 atoms in block     45
 Block first atom:   1048
 Blocpdb>    23 atoms in block     46
 Block first atom:   1070
 Blocpdb>    31 atoms in block     47
 Block first atom:   1093
 Blocpdb>    22 atoms in block     48
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    27 atoms in block     49
 Block first atom:   1146
 Blocpdb>    24 atoms in block     50
 Block first atom:   1173
 Blocpdb>    23 atoms in block     51
 Block first atom:   1197
 Blocpdb>    20 atoms in block     52
 Block first atom:   1220
 Blocpdb>    31 atoms in block     53
 Block first atom:   1240
 Blocpdb>    29 atoms in block     54
 Block first atom:   1271
 Blocpdb>    26 atoms in block     55
 Block first atom:   1300
 Blocpdb>    21 atoms in block     56
 Block first atom:   1326
 Blocpdb>    25 atoms in block     57
 Block first atom:   1347
 Blocpdb>    22 atoms in block     58
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>    17 atoms in block     59
 Block first atom:   1394
 Blocpdb>    23 atoms in block     60
 Block first atom:   1411
 Blocpdb>    20 atoms in block     61
 Block first atom:   1434
 Blocpdb>    19 atoms in block     62
 Block first atom:   1454
 Blocpdb>    22 atoms in block     63
 Block first atom:   1473
 Blocpdb>    24 atoms in block     64
 Block first atom:   1495
 Blocpdb>    28 atoms in block     65
 Block first atom:   1519
 Blocpdb>    20 atoms in block     66
 Block first atom:   1547
 Blocpdb>    27 atoms in block     67
 Block first atom:   1567
 Blocpdb>    21 atoms in block     68
 Block first atom:   1594
 Blocpdb>    22 atoms in block     69
 Block first atom:   1615
 Blocpdb>    28 atoms in block     70
 Block first atom:   1637
 Blocpdb>    17 atoms in block     71
 Block first atom:   1665
 Blocpdb>    19 atoms in block     72
 Block first atom:   1682
 Blocpdb>    25 atoms in block     73
 Block first atom:   1701
 Blocpdb>    22 atoms in block     74
 Block first atom:   1726
 Blocpdb>    29 atoms in block     75
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    24 atoms in block     76
 Block first atom:   1777
 Blocpdb>    24 atoms in block     77
 Block first atom:   1801
 Blocpdb>    23 atoms in block     78
 Block first atom:   1825
 Blocpdb>    23 atoms in block     79
 Block first atom:   1848
 Blocpdb>    20 atoms in block     80
 Block first atom:   1871
 Blocpdb>    17 atoms in block     81
 Block first atom:   1891
 Blocpdb>    25 atoms in block     82
 Block first atom:   1908
 Blocpdb>    22 atoms in block     83
 Block first atom:   1933
 Blocpdb>    22 atoms in block     84
 Block first atom:   1955
 Blocpdb>    19 atoms in block     85
 Block first atom:   1977
 Blocpdb>    21 atoms in block     86
 Block first atom:   1996
 Blocpdb>    18 atoms in block     87
 Block first atom:   2017
 Blocpdb>    24 atoms in block     88
 Block first atom:   2035
 Blocpdb>    23 atoms in block     89
 Block first atom:   2059
 Blocpdb>    23 atoms in block     90
 Block first atom:   2082
 Blocpdb>    20 atoms in block     91
 Block first atom:   2105
 Blocpdb>    21 atoms in block     92
 Block first atom:   2125
 Blocpdb>    26 atoms in block     93
 Block first atom:   2146
 Blocpdb>    19 atoms in block     94
 Block first atom:   2172
 Blocpdb>    24 atoms in block     95
 Block first atom:   2191
 Blocpdb>    20 atoms in block     96
 Block first atom:   2215
 Blocpdb>    24 atoms in block     97
 Block first atom:   2235
 Blocpdb>    25 atoms in block     98
 Block first atom:   2259
 Blocpdb>    24 atoms in block     99
 Block first atom:   2284
 Blocpdb>    24 atoms in block    100
 Block first atom:   2308
 Blocpdb>    24 atoms in block    101
 Block first atom:   2332
 Blocpdb>    31 atoms in block    102
 Block first atom:   2356
 Blocpdb>    25 atoms in block    103
 Block first atom:   2387
 Blocpdb>    21 atoms in block    104
 Block first atom:   2412
 Blocpdb>    23 atoms in block    105
 Block first atom:   2433
 Blocpdb>    25 atoms in block    106
 Block first atom:   2456
 Blocpdb>    21 atoms in block    107
 Block first atom:   2481
 Blocpdb>    23 atoms in block    108
 Block first atom:   2502
 Blocpdb>    21 atoms in block    109
 Block first atom:   2525
 Blocpdb>    27 atoms in block    110
 Block first atom:   2546
 Blocpdb>    22 atoms in block    111
 Block first atom:   2573
 Blocpdb>    23 atoms in block    112
 Block first atom:   2595
 Blocpdb>    16 atoms in block    113
 Block first atom:   2618
 Blocpdb>    25 atoms in block    114
 Block first atom:   2634
 Blocpdb>    24 atoms in block    115
 Block first atom:   2659
 Blocpdb>    19 atoms in block    116
 Block first atom:   2683
 Blocpdb>    22 atoms in block    117
 Block first atom:   2702
 Blocpdb>    25 atoms in block    118
 Block first atom:   2724
 Blocpdb>    28 atoms in block    119
 Block first atom:   2749
 Blocpdb>    22 atoms in block    120
 Block first atom:   2777
 Blocpdb>    21 atoms in block    121
 Block first atom:   2799
 Blocpdb>    24 atoms in block    122
 Block first atom:   2820
 Blocpdb>    25 atoms in block    123
 Block first atom:   2844
 Blocpdb>    31 atoms in block    124
 Block first atom:   2869
 Blocpdb>    26 atoms in block    125
 Block first atom:   2900
 Blocpdb>    23 atoms in block    126
 Block first atom:   2926
 Blocpdb>    20 atoms in block    127
 Block first atom:   2949
 Blocpdb>    18 atoms in block    128
 Block first atom:   2969
 Blocpdb>    21 atoms in block    129
 Block first atom:   2987
 Blocpdb>    21 atoms in block    130
 Block first atom:   3008
 Blocpdb>    25 atoms in block    131
 Block first atom:   3029
 Blocpdb>    21 atoms in block    132
 Block first atom:   3054
 Blocpdb>    27 atoms in block    133
 Block first atom:   3075
 Blocpdb>    22 atoms in block    134
 Block first atom:   3102
 Blocpdb>    23 atoms in block    135
 Block first atom:   3124
 Blocpdb>    14 atoms in block    136
 Block first atom:   3146

 Blocpdb>   136 blocks.

 Blocpdb> At most,     32 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    14 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1201148 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       9480

 Prepmat> Matrix trace    =    2627160.0000
 Prepmat> Last element read:    9480   9480       145.6488
 Prepmat>         9317 lines saved.
 Prepmat>         7961 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  3160
 RTB> Total mass =        3160.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  3160
 RTB> Number of blocks =   136
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  177570.4484
 RTB>     46740 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      816
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    46740
 Diagstd> Projected matrix trace =  177570.4484

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    816 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 177570.4484
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.6334086      1.0376671      2.6528831      4.2954422
      5.0565301      5.8055083      6.8576297      7.4545609     10.5595734
     12.0585194     13.0966632     13.8900555     14.5669867     15.3587142
     15.7355183     16.3399585     16.5181170     17.5346532     18.9768376
     19.5740986     19.8187878     20.4765882     20.9163038     22.3206208
     22.6098399     23.4939232     23.7353299     25.1055238     25.4097474
     25.9837845     26.3878213     28.0506165     28.5580881     29.2355285
     29.9214621     30.1175889     31.1860363     31.7107859     32.2326407
     33.0455184     33.7607185     34.6094039     35.0721707     35.4138923
     36.2844332     36.7445203     37.2935230     38.3465774     38.4800375
     39.3675422     40.0543787     40.9617410     41.1051665     41.6678510
     42.5605233     42.9193785     43.8161139     44.1798812     44.4578081
     45.6350126     47.0916543     47.5357796     48.3314257     49.0209416
     50.0686619     50.3093004     51.2014826     52.1455046     52.9013384
     53.7387294     54.6947734     54.9600698     55.7349046     56.5701624
     56.8934594     57.3740344     58.2122872     58.4556744     59.0786368
     59.9672141     60.9698744     61.1856672     61.7527781     62.7396771
     62.8771618     63.5180289     63.9205499     65.1858150     65.7098200
     66.1203508     66.4779661     66.9990769     68.5186718     69.0503588
     69.2012648     69.5262142     70.2850533     71.1983872     71.8114858
     72.2947437

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034322      0.0034329      0.0034330      0.0034331      0.0034349
      0.0034355     86.4245791    110.6176184    176.8700667    225.0604686
    244.1864610    261.6467874    284.3690282    296.4874490    352.8730302
    377.0876191    392.9846707    404.7131087    414.4576332    425.5716703
    430.7604352    438.9557630    441.3422954    454.7198060    473.0501682
    480.4366896    483.4302516    491.3874707    496.6354896    513.0366787
    516.3498125    526.3480919    529.0453681    544.1015006    547.3882288
    553.5367806    557.8238102    575.1306143    580.3097200    587.1522842
    594.0003299    595.9439022    606.4225888    611.5032687    616.5143982
    624.2399586    630.9589722    638.8403517    643.0971776    646.2225537
    654.1170238    658.2510665    663.1503241    672.4478103    673.6169767
    681.3408548    687.2587538    694.9994870    696.2151762    700.9641896
    708.4329622    711.4133199    718.8068529    721.7845006    724.0512434
    733.5747390    745.1904045    748.6961342    754.9359095    760.3019508
    768.3839289    770.2282070    777.0277854    784.1582529    789.8208791
    796.0474898    803.0973522    805.0427031    810.6976451    816.7497176
    819.0802443    822.5323258    828.5192663    830.2494905    834.6617527
    840.9152273    847.9161953    849.4153997    853.3428035    860.1346037
    861.0765168    865.4535955    868.1915040    876.7420371    880.2588886
    883.0043737    885.3890409    888.8524830    898.8759240    902.3567055
    903.3421944    905.4606294    910.3885137    916.2845388    920.2212048
    923.3123432

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   3160
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    136

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9895E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9938E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6334    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.038    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.653    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.295    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.057    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.806    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.858    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.455    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.29    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    816 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003
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 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002
 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
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 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    56880 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003
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 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001
 0.99997 0.99999 1.00003 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002
 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998
 0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4: 0.000-0.000-0.000
 Vector   5:-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604140238591921336.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604140238591921336.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604140238591921336.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604140238591921336.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    407
            First residue number     =     21
            Last  residue number     =    427
            Number of atoms found    =   3160
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9895E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9938E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6334    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.038    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.653    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.295    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.057    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.806    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.858    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.455    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.29    

 Bfactors>  106 vectors,   9480 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.633400
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.853 for    407 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.030 +/-   0.02
 Bfactors> =     22.754 +/-   5.23
 Bfactors> Shiftng-fct=     22.724
 Bfactors> Scaling-fct=    222.372

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604140238591921336.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604140238591921336.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4320E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4327E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4328E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4347E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4354E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   86.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   110.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   176.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   225.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   244.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   261.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   284.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   296.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   352.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   377.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   393.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   916.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   920.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   923.2    

 Chkmod>  106 vectors,   9480 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   3160 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
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      0.0034      0.7320
      0.0034      0.7766
      0.0034      0.9703
      0.0034      0.7518
      0.0034      0.9001
     86.4203      0.6835
    110.6306      0.6205
    176.8664      0.6336
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    244.1873      0.6060
    261.6466      0.6609
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    352.8650      0.4274
    377.0946      0.1814
    393.0179      0.3984
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    438.9375      0.2859
    441.3485      0.3577
    454.6399      0.2984
    473.0693      0.3738
    480.3658      0.2761
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    920.1722      0.4464
    923.2424      0.3701
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604140238591921336 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2604140238591921336.eigenfacs
2604140238591921336.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
2604140238591921336.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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11 models are in 2604140238591921336.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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11 models are in 2604140238591921336.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604140238591921336.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604140238591921336.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 11
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MODEL 7 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2604140238591921336.8.pdb
2604140238591921336.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m9.975s
user	0m9.867s
sys	0m0.104s
rm: cannot remove '2604140238591921336.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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