***  IMMUNE SYSTEM 28-JAN-19 6NT6  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604150922122157281.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604150922122157281.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604150922122157281.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 556
First residue number = 11
Last residue number = 346
Number of atoms found = 4198
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 70.582789 +/- 15.152969 From: 32.537000 To: 108.709000
= 70.518271 +/- 9.731479 From: 45.932000 To: 95.032000
= 86.746968 +/- 22.319225 From: 38.958000 To: 125.750000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7006 % Filled.
Pdbmat> 1348735 non-zero elements.
Pdbmat> 147088 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 70.08 +/- 19.66
Maximum number = 111
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 2.941760E+06
Pdbmat> Larger element = 473.613
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
556 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604150922122157281.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604150922122157281.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604150922122157281.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4198 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 556 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 23 atoms in block 3
Block first atom: 48
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 71
Blocpdb> 27 atoms in block 5
Block first atom: 91
Blocpdb> 20 atoms in block 6
Block first atom: 118
Blocpdb> 21 atoms in block 7
Block first atom: 138
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 159
Blocpdb> 24 atoms in block 9
Block first atom: 179
Blocpdb> 26 atoms in block 10
Block first atom: 203
Blocpdb> 8 atoms in block 11
Block first atom: 229
Blocpdb> 20 atoms in block 12
Block first atom: 237
Blocpdb> 25 atoms in block 13
Block first atom: 257
Blocpdb> 20 atoms in block 14
Block first atom: 282
Blocpdb> 22 atoms in block 15
Block first atom: 302
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 324
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 346
Blocpdb> 25 atoms in block 18
Block first atom: 365
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 390
Blocpdb> 19 atoms in block 20
Block first atom: 406
Blocpdb> 26 atoms in block 21
Block first atom: 425
Blocpdb> 29 atoms in block 22
Block first atom: 451
Blocpdb> 27 atoms in block 23
Block first atom: 480
Blocpdb> 20 atoms in block 24
Block first atom: 507
Blocpdb> 27 atoms in block 25
Block first atom: 527
Blocpdb> 21 atoms in block 26
Block first atom: 554
Blocpdb> 23 atoms in block 27
Block first atom: 575
Blocpdb> 25 atoms in block 28
Block first atom: 598
Blocpdb> 27 atoms in block 29
Block first atom: 623
Blocpdb> 21 atoms in block 30
Block first atom: 650
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 671
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 690
Blocpdb> 5 atoms in block 33
Block first atom: 705
Blocpdb> 23 atoms in block 34
Block first atom: 710
Blocpdb> 20 atoms in block 35
Block first atom: 733
Blocpdb> 23 atoms in block 36
Block first atom: 753
Blocpdb> 23 atoms in block 37
Block first atom: 776
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 799
Blocpdb> 26 atoms in block 39
Block first atom: 816
Blocpdb> 19 atoms in block 40
Block first atom: 842
Blocpdb> 23 atoms in block 41
Block first atom: 861
Blocpdb> 23 atoms in block 42
Block first atom: 884
Blocpdb> 22 atoms in block 43
Block first atom: 907
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 929
Blocpdb> 20 atoms in block 45
Block first atom: 953
Blocpdb> 22 atoms in block 46
Block first atom: 973
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 995
Blocpdb> 32 atoms in block 48
Block first atom: 1020
Blocpdb> 24 atoms in block 49
Block first atom: 1052
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 1076
Blocpdb> 26 atoms in block 51
Block first atom: 1099
Blocpdb> 26 atoms in block 52
Block first atom: 1125
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 1151
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 1170
Blocpdb> 18 atoms in block 55
Block first atom: 1185
Blocpdb> 26 atoms in block 56
Block first atom: 1203
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1229
Blocpdb> 18 atoms in block 58
Block first atom: 1251
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 1269
Blocpdb> 21 atoms in block 60
Block first atom: 1290
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 1311
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 1326
Blocpdb> 29 atoms in block 63
Block first atom: 1348
Blocpdb> 21 atoms in block 64
Block first atom: 1377
Blocpdb> 7 atoms in block 65
Block first atom: 1398
Blocpdb> 27 atoms in block 66
Block first atom: 1405
Blocpdb> 26 atoms in block 67
Block first atom: 1432
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1458
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1478
Blocpdb> 21 atoms in block 70
Block first atom: 1495
Blocpdb> 25 atoms in block 71
Block first atom: 1516
Blocpdb> 21 atoms in block 72
Block first atom: 1541
Blocpdb> 24 atoms in block 73
Block first atom: 1562
Blocpdb> 19 atoms in block 74
Block first atom: 1586
Blocpdb> 23 atoms in block 75
Block first atom: 1605
Blocpdb> 19 atoms in block 76
Block first atom: 1628
Blocpdb> 22 atoms in block 77
Block first atom: 1647
Blocpdb> 29 atoms in block 78
Block first atom: 1669
Blocpdb> 28 atoms in block 79
Block first atom: 1698
Blocpdb> 25 atoms in block 80
Block first atom: 1726
Blocpdb> 31 atoms in block 81
Block first atom: 1751
Blocpdb> 25 atoms in block 82
Block first atom: 1782
Blocpdb> 27 atoms in block 83
Block first atom: 1807
Blocpdb> 18 atoms in block 84
Block first atom: 1834
Blocpdb> 24 atoms in block 85
Block first atom: 1852
Blocpdb> 15 atoms in block 86
Block first atom: 1876
Blocpdb> 31 atoms in block 87
Block first atom: 1891
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 1922
Blocpdb> 30 atoms in block 89
Block first atom: 1943
Blocpdb> 19 atoms in block 90
Block first atom: 1973
Blocpdb> 20 atoms in block 91
Block first atom: 1992
Blocpdb> 32 atoms in block 92
Block first atom: 2012
Blocpdb> 18 atoms in block 93
Block first atom: 2044
Blocpdb> 23 atoms in block 94
Block first atom: 2062
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 2085
Blocpdb> 23 atoms in block 96
Block first atom: 2100
Blocpdb> 24 atoms in block 97
Block first atom: 2123
Blocpdb> 23 atoms in block 98
Block first atom: 2147
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 2170
Blocpdb> 27 atoms in block 100
Block first atom: 2190
Blocpdb> 20 atoms in block 101
Block first atom: 2217
Blocpdb> 21 atoms in block 102
Block first atom: 2237
Blocpdb> 20 atoms in block 103
Block first atom: 2258
Blocpdb> 24 atoms in block 104
Block first atom: 2278
Blocpdb> 26 atoms in block 105
Block first atom: 2302
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 2328
Blocpdb> 20 atoms in block 107
Block first atom: 2336
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2356
Blocpdb> 20 atoms in block 109
Block first atom: 2381
Blocpdb> 22 atoms in block 110
Block first atom: 2401
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2423
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 2445
Blocpdb> 25 atoms in block 113
Block first atom: 2464
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 2489
Blocpdb> 19 atoms in block 115
Block first atom: 2505
Blocpdb> 26 atoms in block 116
Block first atom: 2524
Blocpdb> 29 atoms in block 117
Block first atom: 2550
Blocpdb> 27 atoms in block 118
Block first atom: 2579
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 2606
Blocpdb> 27 atoms in block 120
Block first atom: 2626
Blocpdb> 21 atoms in block 121
Block first atom: 2653
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 2674
Blocpdb> 25 atoms in block 123
Block first atom: 2697
Blocpdb> 27 atoms in block 124
Block first atom: 2722
Blocpdb> 21 atoms in block 125
Block first atom: 2749
Blocpdb> 19 atoms in block 126
Block first atom: 2770
Blocpdb> 15 atoms in block 127
Block first atom: 2789
Blocpdb> 5 atoms in block 128
Block first atom: 2804
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 2809
Blocpdb> 20 atoms in block 130
Block first atom: 2832
Blocpdb> 23 atoms in block 131
Block first atom: 2852
Blocpdb> 23 atoms in block 132
Block first atom: 2875
Blocpdb> 17 atoms in block 133
Block first atom: 2898
Blocpdb> 26 atoms in block 134
Block first atom: 2915
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 2941
Blocpdb> 23 atoms in block 136
Block first atom: 2960
Blocpdb> 23 atoms in block 137
Block first atom: 2983
Blocpdb> 22 atoms in block 138
Block first atom: 3006
Blocpdb> 24 atoms in block 139
Block first atom: 3028
Blocpdb> 20 atoms in block 140
Block first atom: 3052
Blocpdb> 22 atoms in block 141
Block first atom: 3072
Blocpdb> 25 atoms in block 142
Block first atom: 3094
Blocpdb> 32 atoms in block 143
Block first atom: 3119
Blocpdb> 24 atoms in block 144
Block first atom: 3151
Blocpdb> 23 atoms in block 145
Block first atom: 3175
Blocpdb> 26 atoms in block 146
Block first atom: 3198
Blocpdb> 26 atoms in block 147
Block first atom: 3224
Blocpdb> 19 atoms in block 148
Block first atom: 3250
Blocpdb> 15 atoms in block 149
Block first atom: 3269
Blocpdb> 18 atoms in block 150
Block first atom: 3284
Blocpdb> 26 atoms in block 151
Block first atom: 3302
Blocpdb> 22 atoms in block 152
Block first atom: 3328
Blocpdb> 18 atoms in block 153
Block first atom: 3350
Blocpdb> 21 atoms in block 154
Block first atom: 3368
Blocpdb> 21 atoms in block 155
Block first atom: 3389
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 3410
Blocpdb> 22 atoms in block 157
Block first atom: 3425
Blocpdb> 29 atoms in block 158
Block first atom: 3447
Blocpdb> 21 atoms in block 159
Block first atom: 3476
Blocpdb> 7 atoms in block 160
Block first atom: 3497
Blocpdb> 27 atoms in block 161
Block first atom: 3504
Blocpdb> 26 atoms in block 162
Block first atom: 3531
Blocpdb> 20 atoms in block 163
Block first atom: 3557
Blocpdb> 17 atoms in block 164
Block first atom: 3577
Blocpdb> 21 atoms in block 165
Block first atom: 3594
Blocpdb> 25 atoms in block 166
Block first atom: 3615
Blocpdb> 21 atoms in block 167
Block first atom: 3640
Blocpdb> 24 atoms in block 168
Block first atom: 3661
Blocpdb> 19 atoms in block 169
Block first atom: 3685
Blocpdb> 23 atoms in block 170
Block first atom: 3704
Blocpdb> 19 atoms in block 171
Block first atom: 3727
Blocpdb> 22 atoms in block 172
Block first atom: 3746
Blocpdb> 29 atoms in block 173
Block first atom: 3768
Blocpdb> 28 atoms in block 174
Block first atom: 3797
Blocpdb> 25 atoms in block 175
Block first atom: 3825
Blocpdb> 31 atoms in block 176
Block first atom: 3850
Blocpdb> 25 atoms in block 177
Block first atom: 3881
Blocpdb> 27 atoms in block 178
Block first atom: 3906
Blocpdb> 18 atoms in block 179
Block first atom: 3933
Blocpdb> 24 atoms in block 180
Block first atom: 3951
Blocpdb> 15 atoms in block 181
Block first atom: 3975
Blocpdb> 31 atoms in block 182
Block first atom: 3990
Blocpdb> 21 atoms in block 183
Block first atom: 4021
Blocpdb> 30 atoms in block 184
Block first atom: 4042
Blocpdb> 19 atoms in block 185
Block first atom: 4072
Blocpdb> 20 atoms in block 186
Block first atom: 4091
Blocpdb> 32 atoms in block 187
Block first atom: 4111
Blocpdb> 18 atoms in block 188
Block first atom: 4143
Blocpdb> 23 atoms in block 189
Block first atom: 4161
Blocpdb> 15 atoms in block 190
Block first atom: 4183
Blocpdb> 190 blocks.
Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1348925 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 12594
Prepmat> Matrix trace = 2941760.0000
Prepmat> Last element read: 12594 12594 43.4499
Prepmat> 18146 lines saved.
Prepmat> 16515 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4198
RTB> Total mass = 4198.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4198
RTB> Number of blocks = 190
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 198165.0556
RTB> 55830 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1140
Diagstd> Nb of non-zero elements: 55830
Diagstd> Projected matrix trace = 198165.0556
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1140 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 198165.0556
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2765870 0.4761643 0.8887455 1.2676360
1.5389027 2.0080746 2.1034188 2.1651124 2.4262689
2.4929066 2.8024779 2.8647305 3.2484666 3.6420218
3.6788509 4.2201771 4.8537614 4.9558988 5.1521981
5.8434025 6.7580209 6.9533741 7.2598756 7.7189458
7.9871795 8.2722072 8.6233301 8.8425646 8.9570095
9.3090121 9.6158505 9.9975289 10.0289978 10.2023884
10.3893990 11.0948019 11.1721017 11.9216620 12.1741589
12.2604604 12.3697381 13.1575608 13.5004292 14.0637531
14.2776402 14.5354337 15.1255938 15.3054723 15.4893586
15.8903227 16.0975188 16.3489100 16.4390361 17.0664649
17.8014460 17.9273620 18.0671532 18.4973988 18.5427739
18.9913015 19.1921420 19.4105465 19.6205102 20.0771497
20.1644029 20.3054668 20.7006186 20.7327705 21.1423930
21.3569348 21.8470135 22.5052001 22.7820572 23.7673965
23.9958847 24.6193478 24.7741553 24.8409367 25.0497555
25.5218476 25.5769248 26.5143043 26.6911334 27.3018544
27.4651867 27.8605627 28.3624077 28.4832536 29.1408593
29.1676205 29.2318837 29.4179491 30.3273483 30.7762885
31.1213466 31.2653980 31.7285678 31.8703543 32.0742719
32.3829847
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034320 0.0034329 0.0034335 0.0034336 0.0034337
0.0034368 57.1098664 74.9330984 102.3726626 122.2623004
134.7103182 153.8810730 157.4918772 159.7848139 169.1471748
171.4542611 181.7884887 183.7964712 195.7196735 207.2366430
208.2818236 223.0799922 239.2403854 241.7444412 246.4856022
262.4993201 282.2962082 286.3472912 292.5902628 301.6992814
306.8965475 312.3244485 318.8840412 322.9121618 324.9950881
331.3195606 336.7356774 343.3536069 343.8935636 346.8535994
350.0180921 361.7054527 362.9633050 374.9416461 378.8914139
380.2320047 381.9227532 393.8972715 398.9964838 407.2357503
410.3207662 414.0085184 422.3295767 424.8333954 427.3778373
432.8741376 435.6871493 439.0759822 440.2845595 448.6080540
458.1660664 459.7835984 461.5727314 467.0362711 467.6087526
473.2304091 475.7261284 478.4253258 481.0059280 486.5710983
487.6272463 489.3299180 494.0682451 494.4517869 499.3123992
501.8393834 507.5645934 515.1535771 518.3125789 529.4026192
531.9412431 538.8074009 540.4987679 541.2267632 543.4968429
548.5943565 549.1859825 559.1591016 561.0205736 567.4026415
569.0973430 573.1789361 578.3181579 579.5488904 586.2008685
586.4699719 587.1156832 588.9812595 598.0155819 602.4255772
605.7933060 607.1937055 611.6746962 613.0398774 614.9979715
617.9505418
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4198
Rtb_to_modes> Number of blocs = 190
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.84
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1140 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
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1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000
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1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
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1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 75564 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
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0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604150922122157281.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604150922122157281.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604150922122157281.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604150922122157281.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 556
First residue number = 11
Last residue number = 346
Number of atoms found = 4198
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9885E-10
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8887
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.268
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.957
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.07
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38
Bfactors> 106 vectors, 12594 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.276600
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.424 for 556 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.065 +/- 0.08
Bfactors> = 135.202 +/- 28.08
Bfactors> Shiftng-fct= 135.137
Bfactors> Scaling-fct= 371.933
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604150922122157281.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604150922122157281.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9
Chkmod> 106 vectors, 12594 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4198 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7390
0.0034 0.7533
0.0034 0.7675
0.0034 0.9106
0.0034 0.9926
0.0034 0.7485
57.1088 0.7286
74.9327 0.5872
102.3656 0.4258
122.2746 0.6099
134.7088 0.4208
153.8716 0.3761
157.4694 0.2026
159.7738 0.1482
169.1305 0.3253
171.4501 0.3448
181.7652 0.4299
183.7972 0.5942
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207.2271 0.1224
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m26.698s
user 0m26.548s
sys 0m0.130s
rm: cannot remove '2604150922122157281.sdijf': No such file or directory
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