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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  IMMUNE SYSTEM 28-JAN-19 6NT6  ***

LOGs for ID: 2604150922122157281

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604150922122157281.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604150922122157281.atom to be opened. Openam> File opened: 2604150922122157281.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 556 First residue number = 11 Last residue number = 346 Number of atoms found = 4198 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 70.582789 +/- 15.152969 From: 32.537000 To: 108.709000 = 70.518271 +/- 9.731479 From: 45.932000 To: 95.032000 = 86.746968 +/- 22.319225 From: 38.958000 To: 125.750000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.7006 % Filled. Pdbmat> 1348735 non-zero elements. Pdbmat> 147088 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 70.08 +/- 19.66 Maximum number = 111 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.941760E+06 Pdbmat> Larger element = 473.613 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 556 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604150922122157281.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604150922122157281.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604150922122157281.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4198 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 556 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 24 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 23 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 20 atoms in block 4 Block first atom: 71 Blocpdb> 27 atoms in block 5 Block first atom: 91 Blocpdb> 20 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 21 atoms in block 7 Block first atom: 138 Blocpdb> 20 atoms in block 8 Block first atom: 159 Blocpdb> 24 atoms in block 9 Block first atom: 179 Blocpdb> 26 atoms in block 10 Block first atom: 203 Blocpdb> 8 atoms in block 11 Block first atom: 229 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 237 Blocpdb> 25 atoms in block 13 Block first atom: 257 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 282 Blocpdb> 22 atoms in block 15 Block first atom: 302 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 324 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 346 Blocpdb> 25 atoms in block 18 Block first atom: 365 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 390 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 406 Blocpdb> 26 atoms in block 21 Block first atom: 425 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 451 Blocpdb> 27 atoms in block 23 Block first atom: 480 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 507 Blocpdb> 27 atoms in block 25 Block first atom: 527 Blocpdb> 21 atoms in block 26 Block first atom: 554 Blocpdb> 23 atoms in block 27 Block first atom: 575 Blocpdb> 25 atoms in block 28 Block first atom: 598 Blocpdb> 27 atoms in block 29 Block first atom: 623 Blocpdb> 21 atoms in block 30 Block first atom: 650 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 671 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 690 Blocpdb> 5 atoms in block 33 Block first atom: 705 Blocpdb> 23 atoms in block 34 Block first atom: 710 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 733 Blocpdb> 23 atoms in block 36 Block first atom: 753 Blocpdb> 23 atoms in block 37 Block first atom: 776 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 799 Blocpdb> 26 atoms in block 39 Block first atom: 816 Blocpdb> 19 atoms in block 40 Block first atom: 842 Blocpdb> 23 atoms in block 41 Block first atom: 861 Blocpdb> 23 atoms in block 42 Block first atom: 884 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 907 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 953 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 973 Blocpdb> 25 atoms in block 47 Block first atom: 995 Blocpdb> 32 atoms in block 48 Block first atom: 1020 Blocpdb> 24 atoms in block 49 Block first atom: 1052 Blocpdb> 23 atoms in block 50 Block first atom: 1076 Blocpdb> 26 atoms in block 51 Block first atom: 1099 Blocpdb> 26 atoms in block 52 Block first atom: 1125 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 1151 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 1170 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 1185 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1203 Blocpdb> 22 atoms in block 57 Block first atom: 1229 Blocpdb> 18 atoms in block 58 Block first atom: 1251 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1269 Blocpdb> 21 atoms in block 60 Block first atom: 1290 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 1311 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 1326 Blocpdb> 29 atoms in block 63 Block first atom: 1348 Blocpdb> 21 atoms in block 64 Block first atom: 1377 Blocpdb> 7 atoms in block 65 Block first atom: 1398 Blocpdb> 27 atoms in block 66 Block first atom: 1405 Blocpdb> 26 atoms in block 67 Block first atom: 1432 Blocpdb> 20 atoms in block 68 Block first atom: 1458 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1478 Blocpdb> 21 atoms in block 70 Block first atom: 1495 Blocpdb> 25 atoms in block 71 Block first atom: 1516 Blocpdb> 21 atoms in block 72 Block first atom: 1541 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1562 Blocpdb> 19 atoms in block 74 Block first atom: 1586 Blocpdb> 23 atoms in block 75 Block first atom: 1605 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1628 Blocpdb> 22 atoms in block 77 Block first atom: 1647 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 1669 Blocpdb> 28 atoms in block 79 Block first atom: 1698 Blocpdb> 25 atoms in block 80 Block first atom: 1726 Blocpdb> 31 atoms in block 81 Block first atom: 1751 Blocpdb> 25 atoms in block 82 Block first atom: 1782 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 1807 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 1834 Blocpdb> 24 atoms in block 85 Block first atom: 1852 Blocpdb> 15 atoms in block 86 Block first atom: 1876 Blocpdb> 31 atoms in block 87 Block first atom: 1891 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1922 Blocpdb> 30 atoms in block 89 Block first atom: 1943 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1973 Blocpdb> 20 atoms in block 91 Block first atom: 1992 Blocpdb> 32 atoms in block 92 Block first atom: 2012 Blocpdb> 18 atoms in block 93 Block first atom: 2044 Blocpdb> 23 atoms in block 94 Block first atom: 2062 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 2085 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2100 Blocpdb> 24 atoms in block 97 Block first atom: 2123 Blocpdb> 23 atoms in block 98 Block first atom: 2147 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 2170 Blocpdb> 27 atoms in block 100 Block first atom: 2190 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 2217 Blocpdb> 21 atoms in block 102 Block first atom: 2237 Blocpdb> 20 atoms in block 103 Block first atom: 2258 Blocpdb> 24 atoms in block 104 Block first atom: 2278 Blocpdb> 26 atoms in block 105 Block first atom: 2302 Blocpdb> 8 atoms in block 106 Block first atom: 2328 Blocpdb> 20 atoms in block 107 Block first atom: 2336 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2356 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 2381 Blocpdb> 22 atoms in block 110 Block first atom: 2401 Blocpdb> 22 atoms in block 111 Block first atom: 2423 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 2445 Blocpdb> 25 atoms in block 113 Block first atom: 2464 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 2489 Blocpdb> 19 atoms in block 115 Block first atom: 2505 Blocpdb> 26 atoms in block 116 Block first atom: 2524 Blocpdb> 29 atoms in block 117 Block first atom: 2550 Blocpdb> 27 atoms in block 118 Block first atom: 2579 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2606 Blocpdb> 27 atoms in block 120 Block first atom: 2626 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 2653 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 2674 Blocpdb> 25 atoms in block 123 Block first atom: 2697 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 2722 Blocpdb> 21 atoms in block 125 Block first atom: 2749 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 2770 Blocpdb> 15 atoms in block 127 Block first atom: 2789 Blocpdb> 5 atoms in block 128 Block first atom: 2804 Blocpdb> 23 atoms in block 129 Block first atom: 2809 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 2832 Blocpdb> 23 atoms in block 131 Block first atom: 2852 Blocpdb> 23 atoms in block 132 Block first atom: 2875 Blocpdb> 17 atoms in block 133 Block first atom: 2898 Blocpdb> 26 atoms in block 134 Block first atom: 2915 Blocpdb> 19 atoms in block 135 Block first atom: 2941 Blocpdb> 23 atoms in block 136 Block first atom: 2960 Blocpdb> 23 atoms in block 137 Block first atom: 2983 Blocpdb> 22 atoms in block 138 Block first atom: 3006 Blocpdb> 24 atoms in block 139 Block first atom: 3028 Blocpdb> 20 atoms in block 140 Block first atom: 3052 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3072 Blocpdb> 25 atoms in block 142 Block first atom: 3094 Blocpdb> 32 atoms in block 143 Block first atom: 3119 Blocpdb> 24 atoms in block 144 Block first atom: 3151 Blocpdb> 23 atoms in block 145 Block first atom: 3175 Blocpdb> 26 atoms in block 146 Block first atom: 3198 Blocpdb> 26 atoms in block 147 Block first atom: 3224 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3250 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 3269 Blocpdb> 18 atoms in block 150 Block first atom: 3284 Blocpdb> 26 atoms in block 151 Block first atom: 3302 Blocpdb> 22 atoms in block 152 Block first atom: 3328 Blocpdb> 18 atoms in block 153 Block first atom: 3350 Blocpdb> 21 atoms in block 154 Block first atom: 3368 Blocpdb> 21 atoms in block 155 Block first atom: 3389 Blocpdb> 15 atoms in block 156 Block first atom: 3410 Blocpdb> 22 atoms in block 157 Block first atom: 3425 Blocpdb> 29 atoms in block 158 Block first atom: 3447 Blocpdb> 21 atoms in block 159 Block first atom: 3476 Blocpdb> 7 atoms in block 160 Block first atom: 3497 Blocpdb> 27 atoms in block 161 Block first atom: 3504 Blocpdb> 26 atoms in block 162 Block first atom: 3531 Blocpdb> 20 atoms in block 163 Block first atom: 3557 Blocpdb> 17 atoms in block 164 Block first atom: 3577 Blocpdb> 21 atoms in block 165 Block first atom: 3594 Blocpdb> 25 atoms in block 166 Block first atom: 3615 Blocpdb> 21 atoms in block 167 Block first atom: 3640 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3661 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 3685 Blocpdb> 23 atoms in block 170 Block first atom: 3704 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 3727 Blocpdb> 22 atoms in block 172 Block first atom: 3746 Blocpdb> 29 atoms in block 173 Block first atom: 3768 Blocpdb> 28 atoms in block 174 Block first atom: 3797 Blocpdb> 25 atoms in block 175 Block first atom: 3825 Blocpdb> 31 atoms in block 176 Block first atom: 3850 Blocpdb> 25 atoms in block 177 Block first atom: 3881 Blocpdb> 27 atoms in block 178 Block first atom: 3906 Blocpdb> 18 atoms in block 179 Block first atom: 3933 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 3951 Blocpdb> 15 atoms in block 181 Block first atom: 3975 Blocpdb> 31 atoms in block 182 Block first atom: 3990 Blocpdb> 21 atoms in block 183 Block first atom: 4021 Blocpdb> 30 atoms in block 184 Block first atom: 4042 Blocpdb> 19 atoms in block 185 Block first atom: 4072 Blocpdb> 20 atoms in block 186 Block first atom: 4091 Blocpdb> 32 atoms in block 187 Block first atom: 4111 Blocpdb> 18 atoms in block 188 Block first atom: 4143 Blocpdb> 23 atoms in block 189 Block first atom: 4161 Blocpdb> 15 atoms in block 190 Block first atom: 4183 Blocpdb> 190 blocks. Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1348925 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12594 Prepmat> Matrix trace = 2941760.0000 Prepmat> Last element read: 12594 12594 43.4499 Prepmat> 18146 lines saved. Prepmat> 16515 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4198 RTB> Total mass = 4198.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4198 RTB> Number of blocks = 190 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 198165.0556 RTB> 55830 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1140 Diagstd> Nb of non-zero elements: 55830 Diagstd> Projected matrix trace = 198165.0556 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1140 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 198165.0556 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2765870 0.4761643 0.8887455 1.2676360 1.5389027 2.0080746 2.1034188 2.1651124 2.4262689 2.4929066 2.8024779 2.8647305 3.2484666 3.6420218 3.6788509 4.2201771 4.8537614 4.9558988 5.1521981 5.8434025 6.7580209 6.9533741 7.2598756 7.7189458 7.9871795 8.2722072 8.6233301 8.8425646 8.9570095 9.3090121 9.6158505 9.9975289 10.0289978 10.2023884 10.3893990 11.0948019 11.1721017 11.9216620 12.1741589 12.2604604 12.3697381 13.1575608 13.5004292 14.0637531 14.2776402 14.5354337 15.1255938 15.3054723 15.4893586 15.8903227 16.0975188 16.3489100 16.4390361 17.0664649 17.8014460 17.9273620 18.0671532 18.4973988 18.5427739 18.9913015 19.1921420 19.4105465 19.6205102 20.0771497 20.1644029 20.3054668 20.7006186 20.7327705 21.1423930 21.3569348 21.8470135 22.5052001 22.7820572 23.7673965 23.9958847 24.6193478 24.7741553 24.8409367 25.0497555 25.5218476 25.5769248 26.5143043 26.6911334 27.3018544 27.4651867 27.8605627 28.3624077 28.4832536 29.1408593 29.1676205 29.2318837 29.4179491 30.3273483 30.7762885 31.1213466 31.2653980 31.7285678 31.8703543 32.0742719 32.3829847 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034329 0.0034335 0.0034336 0.0034337 0.0034368 57.1098664 74.9330984 102.3726626 122.2623004 134.7103182 153.8810730 157.4918772 159.7848139 169.1471748 171.4542611 181.7884887 183.7964712 195.7196735 207.2366430 208.2818236 223.0799922 239.2403854 241.7444412 246.4856022 262.4993201 282.2962082 286.3472912 292.5902628 301.6992814 306.8965475 312.3244485 318.8840412 322.9121618 324.9950881 331.3195606 336.7356774 343.3536069 343.8935636 346.8535994 350.0180921 361.7054527 362.9633050 374.9416461 378.8914139 380.2320047 381.9227532 393.8972715 398.9964838 407.2357503 410.3207662 414.0085184 422.3295767 424.8333954 427.3778373 432.8741376 435.6871493 439.0759822 440.2845595 448.6080540 458.1660664 459.7835984 461.5727314 467.0362711 467.6087526 473.2304091 475.7261284 478.4253258 481.0059280 486.5710983 487.6272463 489.3299180 494.0682451 494.4517869 499.3123992 501.8393834 507.5645934 515.1535771 518.3125789 529.4026192 531.9412431 538.8074009 540.4987679 541.2267632 543.4968429 548.5943565 549.1859825 559.1591016 561.0205736 567.4026415 569.0973430 573.1789361 578.3181579 579.5488904 586.2008685 586.4699719 587.1156832 588.9812595 598.0155819 602.4255772 605.7933060 607.1937055 611.6746962 613.0398774 614.9979715 617.9505418 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4198 Rtb_to_modes> Number of blocs = 190 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4762 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8887 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.268 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.539 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.165 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.426 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.802 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.865 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.248 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.642 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.220 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.854 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.956 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.152 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.758 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.953 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.719 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.987 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.272 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.957 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.616 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.998 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1140 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00004 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00005 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 75564 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00004 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00005 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604150922122157281.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604150922122157281.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604150922122157281.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604150922122157281.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 556 First residue number = 11 Last residue number = 346 Number of atoms found = 4198 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8887 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.539 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.165 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.426 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.802 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.865 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.248 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.642 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.220 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.854 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.956 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.758 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.953 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.719 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.987 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.272 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.957 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.616 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.998 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38 Bfactors> 106 vectors, 12594 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.276600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.424 for 556 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.065 +/- 0.08 Bfactors> = 135.202 +/- 28.08 Bfactors> Shiftng-fct= 135.137 Bfactors> Scaling-fct= 371.933 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604150922122157281.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604150922122157281.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.4 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vecteur en lecture: 515.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9 Chkmod> 106 vectors, 12594 coordinates in file. Chkmod> That is: 4198 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7390 0.0034 0.7533 0.0034 0.7675 0.0034 0.9106 0.0034 0.9926 0.0034 0.7485 57.1088 0.7286 74.9327 0.5872 102.3656 0.4258 122.2746 0.6099 134.7088 0.4208 153.8716 0.3761 157.4694 0.2026 159.7738 0.1482 169.1305 0.3253 171.4501 0.3448 181.7652 0.4299 183.7972 0.5942 195.6972 0.0984 207.2271 0.1224 208.2771 0.2035 223.0657 0.2133 239.2360 0.4383 241.7365 0.1981 246.4703 0.4559 262.4790 0.3396 282.2837 0.0629 286.3273 0.0893 292.5802 0.1231 301.6874 0.2248 306.8799 0.4795 312.3071 0.3775 318.8642 0.5139 322.9062 0.3288 324.9810 0.5820 331.3051 0.5027 336.7238 0.5045 343.3470 0.2445 343.8960 0.1779 346.7981 0.2407 350.0132 0.4370 361.6116 0.4828 362.9136 0.4727 374.8994 0.3930 378.8104 0.2602 380.2085 0.1768 381.9104 0.2140 393.9169 0.2866 398.9730 0.3686 407.1639 0.2544 410.3371 0.4462 414.0558 0.3835 422.3730 0.5416 424.8780 0.2868 427.3683 0.5114 432.8512 0.4689 435.7020 0.5837 439.0718 0.3715 440.2786 0.3242 448.6353 0.5202 458.1278 0.4042 459.7977 0.3079 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DQ=-80 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom making animated gifs 11 models are in 2604150922122157281.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604150922122157281.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604150922122157281.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604150922122157281 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604150922122157281.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604150922122157281 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom making animated gifs 11 models are in 2604150922122157281.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604150922122157281.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604150922122157281.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604150922122157281 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604150922122157281.eigenfacs 2604150922122157281.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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