*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604151205022182167.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604151205022182167.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604151205022182167.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 22.016933 +/- 7.673025 From: 5.783000 To: 44.264000
= 59.291193 +/- 13.799616 From: 33.552000 To: 87.836000
= 45.190895 +/- 7.996367 From: 26.771000 To: 62.409000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.7074 % Filled.
Pdbmat> 12016 non-zero elements.
Pdbmat> 1177 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 9.89 +/- 2.65
Maximum number = 17
Minimum number = 3
Pdbmat> Matrix trace = 23540.0
Pdbmat> Larger element = 77.4251
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 238 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 714
Diagstd> Number of non-zero elements 12016
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 23540.0000007
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 714
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 714 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 23540.0000007
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1260486 0.1318986 0.1344189 0.1725465
0.1949130 0.2242826 0.2592521 0.2747693 0.3341845
0.3373361 0.3500487 0.4022817 0.4560087 0.5025781
0.5688255 0.6029944 0.6796435 0.7223371 0.7733174
0.8045995 0.8544262 0.8629281 0.8813428 0.9148214
0.9719398 1.0228071 1.1014845 1.1538613 1.2752062
1.3113841 1.3371395 1.4429399 1.5580266 1.6037277
1.6554392 1.6691630 1.7797684 1.8220612 1.8882000
1.9141057 2.0338031 2.0941106 2.1513244 2.2012628
2.2884248 2.3064747 2.4040138 2.4698302 2.5240434
2.5589886 2.6726794 2.7821436 2.8557940 2.9390781
2.9924311 3.0376570 3.1546057 3.1992017 3.2494121
3.2802309 3.3106589 3.4397651 3.5157192 3.5824754
3.5922588 3.7350302 3.7671033 3.8256905 3.8749288
4.1195144 4.1636595 4.2542848 4.3585743 4.4068022
4.5299245 4.5539344 4.6269928 4.8054132 4.9326994
4.9605219 5.0132956 5.1015154 5.1525137 5.2563147
5.3274489 5.4566772 5.5746936 5.6054633 5.7109904
5.7530737 5.8143582 5.8718974 5.9599276 6.0664592
6.1744625 6.2004320 6.2282567 6.3500433 6.3811333
6.4598334 6.4760861 6.6493356 6.7134934 6.7843065
6.8890867 6.9714847 7.0247183 7.0743112 7.2578580
7.2663463 7.4176139 7.4924683 7.5455874 7.6388681
7.6692719 7.7585210 7.8240835 7.9557708 8.0038369
8.1082067 8.1606076 8.3824254 8.5299987 8.5499830
8.6455397 8.6757847 8.7539892 8.8190347 8.9064805
8.9608952 9.0356610 9.2420077 9.3424302 9.3844048
9.4589876 9.5555439 9.6838768 9.6926142 9.8711012
9.8914200 9.9743244 10.0338113 10.1429112 10.1974890
10.3148547 10.3617913 10.4707063 10.5752922 10.6221259
10.7118953 10.9349284 10.9974114 11.0911193 11.1443405
11.2105117 11.3086041 11.3947362 11.4207441 11.6131637
11.7421927 11.8223057 11.9553037 12.0125627 12.0730123
12.1519664 12.2977180 12.3753410 12.4501412 12.5629249
12.6646344 12.8112114 12.8941503 12.9426740 13.1255278
13.1677736 13.2721317 13.3177287 13.3811790 13.5728281
13.5925405 13.7003294 13.7164909 13.7769934 13.9761389
14.0351182 14.1468474 14.2441855 14.2698843 14.4680017
14.5328115 14.5841850 14.7771404 14.8617047 14.9890762
15.0073143 15.0636432 15.2471019 15.3219873 15.4033162
15.4468895 15.4572702 15.5566363 15.6049060 15.7206170
15.8769680 15.9490517 16.1081149 16.2423150 16.3137994
16.3907630 16.4933268 16.5333810 16.6804423 16.7520022
16.8740633 16.9990495 17.1150599 17.1727727 17.3026755
17.3658658 17.4629180 17.4934805 17.7059462 17.7291395
17.8003556 17.9427728 18.0793219 18.1144399 18.2553941
18.3825423 18.4621422 18.5417089 18.7152198 18.7378495
18.8135821 18.9189807 18.9822697 19.0009411 19.1130189
19.2471910 19.3048827 19.3462952 19.4504109 19.5346316
19.5959921 19.6268075 19.7915837 19.8795125 19.9926247
20.1862424 20.2475189 20.2934135 20.3346395 20.5167332
20.6752782 20.7874951 20.9351392 21.0185660 21.0439182
21.1159205 21.1924639 21.3050074 21.3885206 21.5438357
21.5786518 21.6672587 21.7629640 21.8318978 21.8672930
21.9103210 21.9756834 22.0529999 22.1221090 22.2728198
22.3682973 22.4983309 22.5285556 22.5815665 22.7175314
22.7995070 22.8826259 22.9312111 23.0015534 23.0442449
23.1828533 23.1943607 23.3961724 23.4671310 23.4816850
23.5228509 23.6534751 23.7018515 23.7843571 23.8650689
23.9686967 24.0036778 24.0139481 24.0907412 24.2041542
24.3646914 24.4035039 24.4724605 24.5266913 24.5772286
24.6351387 24.7143030 24.7820983 24.8509862 24.9286492
25.0067737 25.0501408 25.1429948 25.2281301 25.2672627
25.4182226 25.4236515 25.5267684 25.5953783 25.6629258
25.7830966 25.8978631 25.9326624 26.0495854 26.1259678
26.1554118 26.2314035 26.2569899 26.3518545 26.4562815
26.5019588 26.5062599 26.6057313 26.6442738 26.7760324
26.8805251 26.9563909 27.2104169 27.3063764 27.3552264
27.4645054 27.5874454 27.6643151 27.7257615 27.8148095
27.8766653 28.0232943 28.1660456 28.2754128 28.3268864
28.4306634 28.4792090 28.5400033 28.6307818 28.6830071
28.8503213 28.9392702 28.9957856 29.0436480 29.2060754
29.2942525 29.3810120 29.4390597 29.4731682 29.6924616
29.7073421 29.7950441 29.9270256 30.0820898 30.1435862
30.1709636 30.2517706 30.3643401 30.4482366 30.5265003
30.7298416 30.7960544 30.8636560 30.9690024 31.1035826
31.1499700 31.3134312 31.4436964 31.5729328 31.6205364
31.8505905 31.8801868 31.9500286 32.0045881 32.0847668
32.1238100 32.2419245 32.3293696 32.4298916 32.5925109
32.6588556 32.7473636 32.8390329 32.8634377 32.9511091
33.1241411 33.2611299 33.3180699 33.3777706 33.4443794
33.5734725 33.6142525 33.6584467 33.7184770 33.8933191
33.9853736 34.1659517 34.2766133 34.4076167 34.4124673
34.5644641 34.6550868 34.7019708 34.8845326 34.9637355
35.0862293 35.2797986 35.3545221 35.4780089 35.6209868
35.6901923 35.8358053 35.9636660 35.9720533 36.0610453
36.2854972 36.3379388 36.4016222 36.5193387 36.5806803
36.6709358 36.7884752 36.8242740 37.0625647 37.2701506
37.4278494 37.5494102 37.6098818 37.8486368 37.8871747
37.9756602 38.1840682 38.3270167 38.4243555 38.6048656
38.7461965 38.8326567 38.9040008 38.9916056 39.0347492
39.2321226 39.3153523 39.4722371 39.5069754 39.6195896
39.8207067 39.9808978 40.1066182 40.1323545 40.3218106
40.4806129 40.5316482 40.6783388 40.8859347 41.0500467
41.1790646 41.3355884 41.4632560 41.5922241 41.6472058
41.9259619 41.9595071 42.0533408 42.1597111 42.2585090
42.4102780 42.5182704 42.6349900 42.8419793 42.9045428
42.9354331 43.0752982 43.3291309 43.5091560 43.5690454
43.9543457 44.0079427 44.3229767 44.4069696 44.4450358
44.5707966 44.6196795 44.8235805 45.0768941 45.0960069
45.2423442 45.3767652 45.4735285 45.6440059 45.6998988
45.8675997 45.9228674 46.1061791 46.2746589 46.4533191
46.5643707 46.7490138 46.9000164 46.9141843 47.0006083
47.1285590 47.3074629 47.3852524 47.4794474 47.7313645
47.7873563 47.8533443 47.9693181 48.0311989 48.1075225
48.1779727 48.5643365 48.6083469 48.7567213 48.9477444
49.0881290 49.3533233 49.4783822 49.5332503 49.7501787
49.8956878 49.9684402 50.0992527 50.2884475 50.4308409
50.5232210 50.7582354 50.8644018 51.0855237 51.1945982
51.3780511 51.4738785 51.5287869 51.5996493 51.8451058
51.8739331 52.2262749 52.3212104 52.4039101 52.5753953
52.9496935 53.2226724 53.2894814 53.3740878 53.5153404
53.6308224 53.9252235 53.9831236 54.1560661 54.2224653
54.4351112 54.6054662 54.6719510 54.7431456 54.9182427
55.1906471 55.2353152 55.4712995 55.5552542 55.8205216
56.0569377 56.2020909 56.3668633 56.5401181 56.8242015
56.8867411 56.9565135 57.1018156 57.3576455 57.4743683
57.6333965 57.8132586 57.8826527 58.1841785 58.2700200
58.6111669 58.6651446 58.7593471 58.9515259 59.2970106
59.4611298 59.4666220 59.7934889 59.8699151 60.2836652
60.3890498 60.6333695 60.6679609 60.8328195 61.3775846
61.4559096 61.7871779 61.8046244 61.9706286 62.2093259
62.4340569 62.9355252 62.9915057 63.2516934 63.3959756
63.4877172 63.5692856 63.9805321 64.3494228 64.5582749
64.6582046 64.8550291 65.0247924 65.4771232 65.6201535
65.7713611 66.0465159 66.1764545 66.4937818 67.0136661
67.1827413 67.3759090 67.6531049 67.7019577 67.8951161
67.9916279 68.3700181 68.5449788 68.7272024 68.9142397
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813.0363535 814.0883071 815.2807991 816.5328015 818.5815488
819.0318823 819.5340050 820.5786983 822.4148395 823.2512210
824.3893782 825.6747516 826.1701383 828.3192108 828.9300119
831.3529922 831.7357198 832.4032384 833.7633597 836.2029205
837.3593201 837.3979915 839.6962775 840.2327431 843.1310914
843.8677281 845.5730483 845.8142145 846.9626388 850.7465114
851.2891647 853.5804509 853.7009526 854.8466835 856.4914424
858.0370838 861.4760550 861.8591067 863.6372358 864.6216879
865.2470674 865.8027197 868.5987584 871.0991866 872.5116587
873.1866772 874.5146907 875.6584994 878.6988850 879.6580905
880.6709991 882.5112222 883.3789127 885.4943558 888.9492524
890.0699534 891.3486250 893.1803228 893.5027505 894.7764555
895.4121850 897.9003226 899.0484642 900.2427104 901.4668583
902.5123396 905.3850326 907.0804595 908.4725959 909.6333887
912.4203758 913.7901633 917.2682002 919.6763400 923.8061655
925.0853101 927.4559960 928.9542134 932.8024159 934.8801940
935.3079290 937.4256422 939.2482961 941.1729727 943.6079974
945.1107270 946.6753537 950.4538356 952.1062938 954.6893623
956.6822833 958.3084500 960.0899374 960.9674924 962.2863340
964.0042882 967.9480713 969.7694022 971.3970793 974.6565072
975.7508907 980.0957973 982.2472562 985.4950349 985.7191648
987.8131437 993.4950364 995.5451959 996.0140925 998.9840097
1003.1576936 1005.8467472 1011.0322280 1011.9320067 1014.5271736
1020.8454158 1021.7596010 1025.0908280 1027.5561725 1029.4487545
1032.6013847 1036.3665528 1038.3066205 1040.7944513 1046.3462465
1050.0246475 1057.2717873 1059.6453423 1062.6372243 1065.3475220
1067.5040947 1085.3495759 1091.9257450 1099.5025247
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604151205022182167.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604151205022182167.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604151205022182167.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604151205022182167.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9688E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9842E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0018E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0057E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1319
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1344
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1725
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1949
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2243
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2593
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2748
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3342
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3373
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3500
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4023
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4560
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5026
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5688
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6030
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6796
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7223
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7733
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8544
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8629
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8813
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9148
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9719
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.023
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.101
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.154
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.275
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.311
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.337
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.443
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.558
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.604
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.655
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.669
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.780
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.822
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.888
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.914
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.034
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.094
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.151
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.201
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.288
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.306
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.404
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.470
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.524
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.559
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.673
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.782
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.856
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.939
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.992
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.038
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.155
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.199
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.249
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.311
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.440
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.516
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.582
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.592
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.735
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.767
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.826
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.875
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.120
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.254
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.359
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.407
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.530
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.554
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.627
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.805
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.961
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.013
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.153
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.256
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.327
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.457
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.575
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.605
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.711
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.814
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.872
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.960
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.066
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.174
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.228
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.350
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.381
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.460
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.126000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.625 for 238 C-alpha atoms.
Bfactors> = 6.668 +/- 10.02
Bfactors> = 20.283 +/- 8.39
Bfactors> Shiftng-fct= 13.615
Bfactors> Scaling-fct= 0.838
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604151205022182167.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604151205022182167.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4285E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4369E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4436E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.0
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Chkmod> That is: 238 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
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0.0034 0.7086
0.0034 0.6434
0.0034 0.9193
0.0034 0.6991
0.0034 0.7255
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39.4366 0.3011
39.8085 0.2373
45.0994 0.0251
47.9383 0.2050
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76.9818 0.4677
81.8948 0.5002
84.3209 0.5617
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100.3708 0.6552
100.8688 0.5776
101.9386 0.2841
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getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604151205022182167 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604151205022182167 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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making animated gifs
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604151205022182167 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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making thumbnail 100x100
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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real 0m5.492s
user 0m5.465s
sys 0m0.023s
rm: cannot remove '2604151205022182167.sdijb': No such file or directory
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