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* APOPTOSIS 16-FEB-19 6O0K *

LOGs for ID: 2604160511322307744

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604160511322307744.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604160511322307744.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604160511322307744.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    141
            First residue number     =      9
            Last  residue number     =    203
            Number of atoms found    =   1264
            Mean number per residue  =      9.0

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    -3.590766 +/-     7.546495 From:   -22.944000 To:    13.206000
 =     1.798072 +/-     7.666256 From:   -14.839000 To:    19.633000
 =   -11.440671 +/-     9.605719 From:   -31.715000 To:    10.469000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   6.8510 % Filled.
 Pdbmat>       492691  non-zero elements.
 Pdbmat>        53913 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     85.31 +/-     25.55
         Maximum number =    139
         Minimum number =     16

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.078260E+06
 Pdbmat> Larger element =  565.076    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
141 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604160511322307744.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604160511322307744.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604160511322307744.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1264 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   141 residues.
 Blocpdb>    12 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     8 atoms in block      2
 Block first atom:     13
 Blocpdb>     8 atoms in block      3
 Block first atom:     21
 Blocpdb>    11 atoms in block      4
 Block first atom:     29
 Blocpdb>     9 atoms in block      5
 Block first atom:     40
 Blocpdb>     8 atoms in block      6
 Block first atom:     49
 Blocpdb>     7 atoms in block      7
 Block first atom:     57
 Blocpdb>     8 atoms in block      8
 Block first atom:     64
 Blocpdb>     9 atoms in block      9
 Block first atom:     72
 Blocpdb>    12 atoms in block     10
 Block first atom:     81
 Blocpdb>    16 atoms in block     11
 Block first atom:     93
 Blocpdb>    10 atoms in block     12
 Block first atom:    109
 Blocpdb>    12 atoms in block     13
 Block first atom:    119
 Blocpdb>     9 atoms in block     14
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    16 atoms in block     15
 Block first atom:    140
 Blocpdb>    12 atoms in block     16
 Block first atom:    156
 Blocpdb>     9 atoms in block     17
 Block first atom:    168
 Blocpdb>    11 atoms in block     18
 Block first atom:    177
 Blocpdb>     4 atoms in block     19
 Block first atom:    188
 Blocpdb>    12 atoms in block     20
 Block first atom:    192
 Blocpdb>     9 atoms in block     21
 Block first atom:    204
 Blocpdb>    14 atoms in block     22
 Block first atom:    213
 Blocpdb>     8 atoms in block     23
 Block first atom:    227
 Blocpdb>     5 atoms in block     24
 Block first atom:    235
 Blocpdb>     4 atoms in block     25
 Block first atom:    240
 Blocpdb>     8 atoms in block     26
 Block first atom:    244
 Blocpdb>     5 atoms in block     27
 Block first atom:    252
 Blocpdb>     6 atoms in block     28
 Block first atom:    257
 Blocpdb>     9 atoms in block     29
 Block first atom:    263
 Blocpdb>     7 atoms in block     30
 Block first atom:    272
 Blocpdb>    14 atoms in block     31
 Block first atom:    279
 Blocpdb>    10 atoms in block     32
 Block first atom:    293
 Blocpdb>     8 atoms in block     33
 Block first atom:    303
 Blocpdb>     7 atoms in block     34
 Block first atom:    311
 Blocpdb>     8 atoms in block     35
 Block first atom:    318
 Blocpdb>    11 atoms in block     36
 Block first atom:    326
 Blocpdb>     9 atoms in block     37
 Block first atom:    337
 Blocpdb>     5 atoms in block     38
 Block first atom:    346
 Blocpdb>     4 atoms in block     39
 Block first atom:    351
 Blocpdb>     8 atoms in block     40
 Block first atom:    355
 Blocpdb>     8 atoms in block     41
 Block first atom:    363
 Blocpdb>    11 atoms in block     42
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    12 atoms in block     43
 Block first atom:    382
 Blocpdb>    11 atoms in block     44
 Block first atom:    394
 Blocpdb>    11 atoms in block     45
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    12 atoms in block     46
 Block first atom:    416
 Blocpdb>    11 atoms in block     47
 Block first atom:    428
 Blocpdb>    11 atoms in block     48
 Block first atom:    439
 Blocpdb>     8 atoms in block     49
 Block first atom:    450
 Blocpdb>    11 atoms in block     50
 Block first atom:    458
 Blocpdb>     5 atoms in block     51
 Block first atom:    469
 Blocpdb>     9 atoms in block     52
 Block first atom:    474
 Blocpdb>     8 atoms in block     53
 Block first atom:    483
 Blocpdb>    12 atoms in block     54
 Block first atom:    491
 Blocpdb>    12 atoms in block     55
 Block first atom:    503
 Blocpdb>    18 atoms in block     56
 Block first atom:    515
 Blocpdb>     8 atoms in block     57
 Block first atom:    533
 Blocpdb>    10 atoms in block     58
 Block first atom:    541
 Blocpdb>     8 atoms in block     59
 Block first atom:    551
 Blocpdb>     7 atoms in block     60
 Block first atom:    559
 Blocpdb>     7 atoms in block     61
 Block first atom:    566
 Blocpdb>    11 atoms in block     62
 Block first atom:    573
 Blocpdb>     7 atoms in block     63
 Block first atom:    584
 Blocpdb>     5 atoms in block     64
 Block first atom:    591
 Blocpdb>    11 atoms in block     65
 Block first atom:    596
 Blocpdb>     4 atoms in block     66
 Block first atom:    607
 Blocpdb>    11 atoms in block     67
 Block first atom:    611
 Blocpdb>    11 atoms in block     68
 Block first atom:    622
 Blocpdb>     5 atoms in block     69
 Block first atom:    633
 Blocpdb>     7 atoms in block     70
 Block first atom:    638
 Blocpdb>     7 atoms in block     71
 Block first atom:    645
 Blocpdb>     7 atoms in block     72
 Block first atom:    652
 Blocpdb>     9 atoms in block     73
 Block first atom:    659
 Blocpdb>     9 atoms in block     74
 Block first atom:    668
 Blocpdb>     8 atoms in block     75
 Block first atom:    677
 Blocpdb>    11 atoms in block     76
 Block first atom:    685
 Blocpdb>    11 atoms in block     77
 Block first atom:    696
 Blocpdb>     8 atoms in block     78
 Block first atom:    707
 Blocpdb>     4 atoms in block     79
 Block first atom:    715
 Blocpdb>     7 atoms in block     80
 Block first atom:    719
 Blocpdb>     8 atoms in block     81
 Block first atom:    726
 Blocpdb>    14 atoms in block     82
 Block first atom:    734
 Blocpdb>     4 atoms in block     83
 Block first atom:    748
 Blocpdb>    11 atoms in block     84
 Block first atom:    752
 Blocpdb>     8 atoms in block     85
 Block first atom:    763
 Blocpdb>     7 atoms in block     86
 Block first atom:    771
 Blocpdb>     5 atoms in block     87
 Block first atom:    778
 Blocpdb>    11 atoms in block     88
 Block first atom:    783
 Blocpdb>    11 atoms in block     89
 Block first atom:    794
 Blocpdb>     9 atoms in block     90
 Block first atom:    805
 Blocpdb>    11 atoms in block     91
 Block first atom:    814
 Blocpdb>     4 atoms in block     92
 Block first atom:    825
 Blocpdb>     4 atoms in block     93
 Block first atom:    829
 Blocpdb>     7 atoms in block     94
 Block first atom:    833
 Blocpdb>     8 atoms in block     95
 Block first atom:    840
 Blocpdb>     6 atoms in block     96
 Block first atom:    848
 Blocpdb>     7 atoms in block     97
 Block first atom:    854
 Blocpdb>     9 atoms in block     98
 Block first atom:    861
 Blocpdb>     6 atoms in block     99
 Block first atom:    870
 Blocpdb>     7 atoms in block    100
 Block first atom:    876
 Blocpdb>     8 atoms in block    101
 Block first atom:    883
 Blocpdb>    11 atoms in block    102
 Block first atom:    891
 Blocpdb>     9 atoms in block    103
 Block first atom:    902
 Blocpdb>     8 atoms in block    104
 Block first atom:    911
 Blocpdb>     6 atoms in block    105
 Block first atom:    919
 Blocpdb>     7 atoms in block    106
 Block first atom:    925
 Blocpdb>     8 atoms in block    107
 Block first atom:    932
 Blocpdb>     7 atoms in block    108
 Block first atom:    940
 Blocpdb>     8 atoms in block    109
 Block first atom:    947
 Blocpdb>     8 atoms in block    110
 Block first atom:    955
 Blocpdb>     8 atoms in block    111
 Block first atom:    963
 Blocpdb>     5 atoms in block    112
 Block first atom:    971
 Blocpdb>     8 atoms in block    113
 Block first atom:    976
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:    984
 Blocpdb>     8 atoms in block    115
 Block first atom:    998
 Blocpdb>    14 atoms in block    116
 Block first atom:   1006
 Blocpdb>    18 atoms in block    117
 Block first atom:   1020
 Blocpdb>    24 atoms in block    118
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>     8 atoms in block    119
 Block first atom:   1062
 Blocpdb>     8 atoms in block    120
 Block first atom:   1070
 Blocpdb>    11 atoms in block    121
 Block first atom:   1078
 Blocpdb>    10 atoms in block    122
 Block first atom:   1089
 Blocpdb>     8 atoms in block    123
 Block first atom:   1099
 Blocpdb>    10 atoms in block    124
 Block first atom:   1107
 Blocpdb>     7 atoms in block    125
 Block first atom:   1117
 Blocpdb>    14 atoms in block    126
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>     8 atoms in block    127
 Block first atom:   1138
 Blocpdb>     9 atoms in block    128
 Block first atom:   1146
 Blocpdb>     8 atoms in block    129
 Block first atom:   1155
 Blocpdb>     8 atoms in block    130
 Block first atom:   1163
 Blocpdb>     4 atoms in block    131
 Block first atom:   1171
 Blocpdb>     4 atoms in block    132
 Block first atom:   1175
 Blocpdb>    14 atoms in block    133
 Block first atom:   1179
 Blocpdb>    16 atoms in block    134
 Block first atom:   1193
 Blocpdb>     5 atoms in block    135
 Block first atom:   1209
 Blocpdb>    11 atoms in block    136
 Block first atom:   1214
 Blocpdb>     7 atoms in block    137
 Block first atom:   1225
 Blocpdb>     9 atoms in block    138
 Block first atom:   1232
 Blocpdb>     8 atoms in block    139
 Block first atom:   1241
 Blocpdb>    12 atoms in block    140
 Block first atom:   1249
 Blocpdb>     4 atoms in block    141
 Block first atom:   1260

 Blocpdb>   141 blocks.

 Blocpdb> At most,     24 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       492832 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       3792

 Prepmat> Matrix trace    =    1078260.0000
 Prepmat> Last element read:    3792   3792        79.7795
 Prepmat>        10012 lines saved.
 Prepmat>         8289 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1264
 RTB> Total mass =        1264.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1264
 RTB> Number of blocks =   141
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  212909.1494
 RTB>     59877 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      846
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    59877
 Diagstd> Projected matrix trace =  212909.1494

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    846 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 212909.1494
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      5.1536445      6.3693702      6.7564724      9.4372346
     10.7892833     11.2721393     11.7362480     15.1956366     16.1337589
     17.1010407     17.4850963     19.0516161     20.1278101     20.5651738
     21.3275670     22.5175976     23.9938669     24.9321559     25.6859442
     26.4478349     26.9920001     28.3264469     28.8012966     30.1921257
     30.8836690     31.7626619     32.8265364     33.4229888     33.9683087
     34.2392303     35.9781415     36.8472777     37.7025750     39.7102491
     41.2473054     42.8779949     43.7056967     44.4754793     45.8312561
     47.5844839     47.6781972     48.5173117     49.0588464     49.5686028
     51.3784088     52.3577127     53.8464860     54.1176806     54.7295858
     55.2582331     55.9915011     56.0065716     57.3201537     59.4383900
     60.2202462     60.8266262     62.0992285     62.2878249     63.3126254
     64.6658493     65.0678824     66.1455772     67.5077120     68.6718147
     69.8932640     70.7580073     71.0944109     72.5055980     74.3344885
     74.8909814     75.8745174     76.9004492     77.9945491     79.6862089
     80.2631839     81.2389290     82.0825641     82.4283302     82.6695332
     83.7735897     84.7473273     85.2841553     86.5671652     87.6463881
     88.3875397     89.0735326     90.6246281     91.4495391     92.5422937
     93.6790812     94.1597783     95.6791550     96.5715547     96.7168250
     97.1957160     97.5122996     98.6912548     99.4096238     99.7544181
    100.4534227

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034320      0.0034323      0.0034334      0.0034343      0.0034347
      0.0034357    246.5201980    274.0586571    282.2638658    333.5935583
    356.6905304    364.5847120    372.0145435    423.3062980    436.1773020
    449.0622521    454.0767806    473.9812818    487.1845902    492.4492414
    501.4942271    515.2954497    531.9188770    542.2195816    550.3551667
    558.4577763    564.1736695    577.9514157    582.7755195    596.6808858
    603.4756138    612.0032472    622.1682016    627.7951006    632.8958415
    635.4147274    651.3503383    659.1708353    666.7772696    684.3000720
    697.4178700    711.0702594    717.9005802    724.1951277    735.1503361
    749.0795861    749.8168458    756.3862835    760.5958406    764.5371957
    778.3691330    785.7522135    796.8452049    798.8493160    803.3528910
    807.2234642    812.5616772    812.6710231    822.1460100    837.1991891
    842.6874837    846.9195235    855.7332015    857.0316546    864.0531182
    873.2382954    875.9485875    883.1728009    892.2200421    899.8798813
    907.8475828    913.4464181    915.6152348    924.6578259    936.2470426
    939.7450376    945.8956999    952.2691580    959.0194295    969.3639465
    972.8669996    978.7626205    983.8315316    985.9015092    987.3429350
    993.9140801    999.6737437   1002.8349390   1010.3500758   1016.6285269
   1020.9178636   1024.8719775   1033.7568469   1038.4510762   1044.6370141
   1051.0335794   1053.7267225   1062.1942493   1067.1362963   1067.9386288
   1070.5793001   1072.3214156   1078.7842959   1082.7033874   1084.5793968
   1088.3727248

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1264
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    141

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9884E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9906E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9965E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0010E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.154    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.369    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.756    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.437    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.5    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    846 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998
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 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
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 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00003 1.00005 0.99999 0.99998
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 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    22752 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998
 0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 1.00001
 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00004 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998
 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00003 1.00005 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00003 1.00004 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604160511322307744.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604160511322307744.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604160511322307744.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604160511322307744.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    141
            First residue number     =      9
            Last  residue number     =    203
            Number of atoms found    =   1264
            Mean number per residue  =      9.0

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9884E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9906E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9965E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0010E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.154    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.369    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.756    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.437    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.5    

 Bfactors>  106 vectors,   3792 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     5.154000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.549 for    153 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.023 +/-   0.02
 Bfactors> =     16.692 +/-   9.55
 Bfactors> Shiftng-fct=     16.669
 Bfactors> Scaling-fct=    436.691

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604160511322307744.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604160511322307744.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4318E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4322E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4332E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4355E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   246.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   274.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   282.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   333.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   356.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   364.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   372.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   423.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   807.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   812.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   812.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   822.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   837.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   842.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   846.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   855.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   864.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   873.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   875.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   892.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   899.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   907.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   913.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   915.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   924.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   936.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   939.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   945.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   952.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   959.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   969.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   972.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   978.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   983.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   985.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   987.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   993.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   999.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1003.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1010.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1017.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1021.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1025.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1034.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1038.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1045.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1051.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1054.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1062.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1067.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1068.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1071.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1072.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1079.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1083.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1085.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1089.    

 Chkmod>  106 vectors,   3792 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1264 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    75 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    89 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8675
      0.0034      0.7540
      0.0034      0.7101
      0.0034      0.8016
      0.0034      0.8331
      0.0034      0.7654
    246.5181      0.0877
    274.0389      0.4968
    282.2419      0.2842
    333.5751      0.2228
    356.6871      0.2291
    364.5345      0.0795
    372.0580      0.3119
    423.3489      0.0236
    436.1078      0.2969
    449.0293      0.4451
    454.1210      0.3749
    473.9408      0.3104
    487.1902      0.2054
    492.4859      0.1589
    501.5013      0.3031
    515.3008      0.4716
    531.8532      0.3209
    542.1729      0.5015
    550.3750      0.1414
    558.4567      0.4054
    564.1285      0.3690
    577.9628      0.4385
    582.7374      0.4422
    596.6343      0.2244
    603.4139      0.2721
    611.9513      0.3730
    622.1743      0.3625
    627.7401      0.0912
    632.8844      0.2923
    635.3946      0.2746
    651.3392      0.4311
    659.1669      0.2774
    666.7259      0.3743
    684.2686      0.4113
    697.4107      0.3937
    711.0564      0.3227
    717.9051      0.3410
    724.2008      0.5433
    735.1087      0.3366
    749.0121      0.2508
    749.7988      0.4189
    756.3748      0.5449
    760.5721      0.3558
    764.5152      0.4064
    778.3478      0.3089
    785.7356      0.3924
    796.8370      0.3521
    798.8321      0.2137
    803.3214      0.3616
    807.2017      0.3753
    812.5159      0.3766
    812.6610      0.4934
    822.1096      0.5404
    837.1746      0.2899
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    857.0098      0.4622
    863.9981      0.3392
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    875.9252      0.5102
    883.1644      0.4706
    892.1969      0.3353
    899.8294      0.3257
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    913.4201      0.2905
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    978.7271      0.4101
    983.7739      0.3089
    985.8692      0.3712
    987.3033      0.3252
    993.8501      0.4052
    999.6466      0.3106
   1002.7675      0.3601
   1010.3232      0.2246
   1016.6058      0.4403
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   1024.8077      0.4014
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   1072.2627      0.3501
   1078.7311      0.3570
   1082.6590      0.3704
   1084.5088      0.3784
   1088.5783      0.3162
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604160511322307744 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604160511322307744.eigenfacs
2604160511322307744.atom
making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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11 models are in 2604160511322307744.9.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 10
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2604160511322307744.eigenfacs
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604160511322307744.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604160511322307744.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604160511322307744 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604160511322307744.10.pdb
2604160511322307744.11.pdb
2604160511322307744.7.pdb
2604160511322307744.8.pdb
2604160511322307744.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m7.550s
user	0m7.504s
sys	0m0.043s
rm: cannot remove '2604160511322307744.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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