***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604161119142382331.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604161119142382331.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604161119142382331.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 515
First residue number = 22
Last residue number = 128
Number of atoms found = 4070
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 154.995576 +/- 30.878455 From: 93.587000 To: 208.065000
= 158.952701 +/- 10.809503 From: 136.345000 To: 187.442000
= 165.557434 +/- 7.058531 From: 149.167000 To: 181.024000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.0441 % Filled.
Pdbmat> 1523839 non-zero elements.
Pdbmat> 166641 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.89 +/- 22.94
Maximum number = 142
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 3.332820E+06
Pdbmat> Larger element = 678.597
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
515 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604161119142382331.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604161119142382331.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604161119142382331.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4070 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 515 residues.
Blocpdb> 18 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 21 atoms in block 2
Block first atom: 19
Blocpdb> 28 atoms in block 3
Block first atom: 40
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 68
Blocpdb> 29 atoms in block 5
Block first atom: 90
Blocpdb> 24 atoms in block 6
Block first atom: 119
Blocpdb> 23 atoms in block 7
Block first atom: 143
Blocpdb> 27 atoms in block 8
Block first atom: 166
Blocpdb> 17 atoms in block 9
Block first atom: 193
Blocpdb> 25 atoms in block 10
Block first atom: 210
Blocpdb> 27 atoms in block 11
Block first atom: 235
Blocpdb> 23 atoms in block 12
Block first atom: 262
Blocpdb> 25 atoms in block 13
Block first atom: 285
Blocpdb> 29 atoms in block 14
Block first atom: 310
Blocpdb> 28 atoms in block 15
Block first atom: 339
Blocpdb> 21 atoms in block 16
Block first atom: 367
Blocpdb> 18 atoms in block 17
Block first atom: 388
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 406
Blocpdb> 5 atoms in block 19
Block first atom: 426
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 431
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 445
Blocpdb> 25 atoms in block 22
Block first atom: 464
Blocpdb> 21 atoms in block 23
Block first atom: 489
Blocpdb> 20 atoms in block 24
Block first atom: 510
Blocpdb> 16 atoms in block 25
Block first atom: 530
Blocpdb> 27 atoms in block 26
Block first atom: 546
Blocpdb> 26 atoms in block 27
Block first atom: 573
Blocpdb> 20 atoms in block 28
Block first atom: 599
Blocpdb> 24 atoms in block 29
Block first atom: 619
Blocpdb> 26 atoms in block 30
Block first atom: 643
Blocpdb> 33 atoms in block 31
Block first atom: 669
Blocpdb> 11 atoms in block 32
Block first atom: 702
Blocpdb> 28 atoms in block 33
Block first atom: 713
Blocpdb> 26 atoms in block 34
Block first atom: 741
Blocpdb> 28 atoms in block 35
Block first atom: 767
Blocpdb> 20 atoms in block 36
Block first atom: 795
Blocpdb> 18 atoms in block 37
Block first atom: 815
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 833
Blocpdb> 28 atoms in block 39
Block first atom: 854
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 882
Blocpdb> 29 atoms in block 41
Block first atom: 904
Blocpdb> 24 atoms in block 42
Block first atom: 933
Blocpdb> 23 atoms in block 43
Block first atom: 957
Blocpdb> 27 atoms in block 44
Block first atom: 980
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 1007
Blocpdb> 25 atoms in block 46
Block first atom: 1024
Blocpdb> 27 atoms in block 47
Block first atom: 1049
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 1076
Blocpdb> 25 atoms in block 49
Block first atom: 1099
Blocpdb> 29 atoms in block 50
Block first atom: 1124
Blocpdb> 28 atoms in block 51
Block first atom: 1153
Blocpdb> 21 atoms in block 52
Block first atom: 1181
Blocpdb> 18 atoms in block 53
Block first atom: 1202
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 1220
Blocpdb> 5 atoms in block 55
Block first atom: 1240
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 1245
Blocpdb> 19 atoms in block 57
Block first atom: 1259
Blocpdb> 25 atoms in block 58
Block first atom: 1278
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 1303
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1324
Blocpdb> 16 atoms in block 61
Block first atom: 1344
Blocpdb> 27 atoms in block 62
Block first atom: 1360
Blocpdb> 26 atoms in block 63
Block first atom: 1387
Blocpdb> 20 atoms in block 64
Block first atom: 1413
Blocpdb> 24 atoms in block 65
Block first atom: 1433
Blocpdb> 26 atoms in block 66
Block first atom: 1457
Blocpdb> 33 atoms in block 67
Block first atom: 1483
Blocpdb> 11 atoms in block 68
Block first atom: 1516
Blocpdb> 28 atoms in block 69
Block first atom: 1527
Blocpdb> 26 atoms in block 70
Block first atom: 1555
Blocpdb> 28 atoms in block 71
Block first atom: 1581
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1609
Blocpdb> 18 atoms in block 73
Block first atom: 1629
Blocpdb> 21 atoms in block 74
Block first atom: 1647
Blocpdb> 28 atoms in block 75
Block first atom: 1668
Blocpdb> 22 atoms in block 76
Block first atom: 1696
Blocpdb> 29 atoms in block 77
Block first atom: 1718
Blocpdb> 24 atoms in block 78
Block first atom: 1747
Blocpdb> 23 atoms in block 79
Block first atom: 1771
Blocpdb> 27 atoms in block 80
Block first atom: 1794
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1821
Blocpdb> 25 atoms in block 82
Block first atom: 1838
Blocpdb> 27 atoms in block 83
Block first atom: 1863
Blocpdb> 23 atoms in block 84
Block first atom: 1890
Blocpdb> 25 atoms in block 85
Block first atom: 1913
Blocpdb> 29 atoms in block 86
Block first atom: 1938
Blocpdb> 28 atoms in block 87
Block first atom: 1967
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 1995
Blocpdb> 18 atoms in block 89
Block first atom: 2016
Blocpdb> 20 atoms in block 90
Block first atom: 2034
Blocpdb> 5 atoms in block 91
Block first atom: 2054
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 2059
Blocpdb> 19 atoms in block 93
Block first atom: 2073
Blocpdb> 25 atoms in block 94
Block first atom: 2092
Blocpdb> 21 atoms in block 95
Block first atom: 2117
Blocpdb> 20 atoms in block 96
Block first atom: 2138
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 2158
Blocpdb> 27 atoms in block 98
Block first atom: 2174
Blocpdb> 26 atoms in block 99
Block first atom: 2201
Blocpdb> 20 atoms in block 100
Block first atom: 2227
Blocpdb> 24 atoms in block 101
Block first atom: 2247
Blocpdb> 26 atoms in block 102
Block first atom: 2271
Blocpdb> 33 atoms in block 103
Block first atom: 2297
Blocpdb> 11 atoms in block 104
Block first atom: 2330
Blocpdb> 28 atoms in block 105
Block first atom: 2341
Blocpdb> 26 atoms in block 106
Block first atom: 2369
Blocpdb> 28 atoms in block 107
Block first atom: 2395
Blocpdb> 20 atoms in block 108
Block first atom: 2423
Blocpdb> 18 atoms in block 109
Block first atom: 2443
Blocpdb> 21 atoms in block 110
Block first atom: 2461
Blocpdb> 28 atoms in block 111
Block first atom: 2482
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 2510
Blocpdb> 29 atoms in block 113
Block first atom: 2532
Blocpdb> 24 atoms in block 114
Block first atom: 2561
Blocpdb> 23 atoms in block 115
Block first atom: 2585
Blocpdb> 27 atoms in block 116
Block first atom: 2608
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 2635
Blocpdb> 25 atoms in block 118
Block first atom: 2652
Blocpdb> 27 atoms in block 119
Block first atom: 2677
Blocpdb> 23 atoms in block 120
Block first atom: 2704
Blocpdb> 25 atoms in block 121
Block first atom: 2727
Blocpdb> 29 atoms in block 122
Block first atom: 2752
Blocpdb> 28 atoms in block 123
Block first atom: 2781
Blocpdb> 21 atoms in block 124
Block first atom: 2809
Blocpdb> 18 atoms in block 125
Block first atom: 2830
Blocpdb> 20 atoms in block 126
Block first atom: 2848
Blocpdb> 5 atoms in block 127
Block first atom: 2868
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 2873
Blocpdb> 19 atoms in block 129
Block first atom: 2887
Blocpdb> 25 atoms in block 130
Block first atom: 2906
Blocpdb> 21 atoms in block 131
Block first atom: 2931
Blocpdb> 20 atoms in block 132
Block first atom: 2952
Blocpdb> 16 atoms in block 133
Block first atom: 2972
Blocpdb> 27 atoms in block 134
Block first atom: 2988
Blocpdb> 26 atoms in block 135
Block first atom: 3015
Blocpdb> 20 atoms in block 136
Block first atom: 3041
Blocpdb> 24 atoms in block 137
Block first atom: 3061
Blocpdb> 26 atoms in block 138
Block first atom: 3085
Blocpdb> 33 atoms in block 139
Block first atom: 3111
Blocpdb> 11 atoms in block 140
Block first atom: 3144
Blocpdb> 28 atoms in block 141
Block first atom: 3155
Blocpdb> 26 atoms in block 142
Block first atom: 3183
Blocpdb> 28 atoms in block 143
Block first atom: 3209
Blocpdb> 20 atoms in block 144
Block first atom: 3237
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 3257
Blocpdb> 21 atoms in block 146
Block first atom: 3275
Blocpdb> 28 atoms in block 147
Block first atom: 3296
Blocpdb> 22 atoms in block 148
Block first atom: 3324
Blocpdb> 29 atoms in block 149
Block first atom: 3346
Blocpdb> 24 atoms in block 150
Block first atom: 3375
Blocpdb> 23 atoms in block 151
Block first atom: 3399
Blocpdb> 27 atoms in block 152
Block first atom: 3422
Blocpdb> 17 atoms in block 153
Block first atom: 3449
Blocpdb> 25 atoms in block 154
Block first atom: 3466
Blocpdb> 27 atoms in block 155
Block first atom: 3491
Blocpdb> 23 atoms in block 156
Block first atom: 3518
Blocpdb> 25 atoms in block 157
Block first atom: 3541
Blocpdb> 29 atoms in block 158
Block first atom: 3566
Blocpdb> 28 atoms in block 159
Block first atom: 3595
Blocpdb> 21 atoms in block 160
Block first atom: 3623
Blocpdb> 18 atoms in block 161
Block first atom: 3644
Blocpdb> 20 atoms in block 162
Block first atom: 3662
Blocpdb> 5 atoms in block 163
Block first atom: 3682
Blocpdb> 14 atoms in block 164
Block first atom: 3687
Blocpdb> 19 atoms in block 165
Block first atom: 3701
Blocpdb> 25 atoms in block 166
Block first atom: 3720
Blocpdb> 21 atoms in block 167
Block first atom: 3745
Blocpdb> 20 atoms in block 168
Block first atom: 3766
Blocpdb> 16 atoms in block 169
Block first atom: 3786
Blocpdb> 27 atoms in block 170
Block first atom: 3802
Blocpdb> 26 atoms in block 171
Block first atom: 3829
Blocpdb> 20 atoms in block 172
Block first atom: 3855
Blocpdb> 24 atoms in block 173
Block first atom: 3875
Blocpdb> 26 atoms in block 174
Block first atom: 3899
Blocpdb> 33 atoms in block 175
Block first atom: 3925
Blocpdb> 11 atoms in block 176
Block first atom: 3958
Blocpdb> 28 atoms in block 177
Block first atom: 3969
Blocpdb> 26 atoms in block 178
Block first atom: 3997
Blocpdb> 28 atoms in block 179
Block first atom: 4023
Blocpdb> 20 atoms in block 180
Block first atom: 4050
Blocpdb> 180 blocks.
Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1524019 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 12210
Prepmat> Matrix trace = 3332820.0000
Prepmat> Last element read: 12210 12210 170.2107
Prepmat> 16291 lines saved.
Prepmat> 14588 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4070
RTB> Total mass = 4070.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4070
RTB> Number of blocks = 180
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 232851.1282
RTB> 58572 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1080
Diagstd> Nb of non-zero elements: 58572
Diagstd> Projected matrix trace = 232851.1282
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1080 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 232851.1282
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2535842 0.4290283 0.4963653 1.5775322
2.0668586 2.3780670 2.9440086 3.3883333 3.7458214
4.1545275 5.4280292 5.8651024 7.0154224 7.3334980
7.7099796 8.1248141 8.7377909 9.2604537 9.7697628
10.4224425 10.6070780 12.0976378 12.3425058 13.7900651
14.0767654 14.7904545 15.7220073 16.2593569 16.8642236
17.2432236 17.6949263 19.1460715 19.3977735 20.1330734
20.5661613 21.4704773 21.8085863 21.9915067 22.3902341
23.0751731 23.5457144 23.6316755 24.6565637 25.4576394
25.8993295 26.4758351 26.7529914 27.1481411 27.5286173
28.5182257 28.7344778 29.6523673 29.8911875 30.1606236
31.3955208 31.8598380 32.5582554 33.0024066 33.4381415
33.7336393 34.4098568 34.7771348 35.1474145 35.7114380
36.3040472 36.5725066 36.9976611 37.4713605 37.8022327
38.1711151 39.2178357 39.4896448 40.3374180 40.6293044
41.3592898 41.7726352 42.2603382 42.7804430 43.4271863
43.5052545 44.6867834 44.8985796 45.6967092 46.3459758
46.6321957 46.8844099 47.6284809 48.0369388 48.9664925
49.7708189 50.0767570 50.3760593 50.5002041 51.2817392
51.4264534 51.9329302 52.4753476 53.1401320 53.3404351
53.5135676
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034311 0.0034321 0.0034349 0.0034350 0.0034351
0.0034354 54.6835125 71.1276172 76.5060878 136.3905863
156.1171678 167.4585485 186.3222924 199.8887463 210.1690741
221.3380593 252.9975797 262.9862717 287.6220599 294.0700992
301.5240069 309.5294652 320.9934011 330.4543039 339.4198915
350.5742670 353.6658785 377.6987684 381.5021150 403.2537713
407.4241012 417.6245693 430.5754634 437.8717856 445.9420813
450.9252039 456.7932303 475.1547979 478.2678879 487.2482839
492.4610636 503.1716107 507.1180133 509.2403087 513.8360815
521.6362502 526.9279270 527.8889085 539.2144915 547.9038418
552.6364689 558.7533165 561.6702939 565.8031087 569.7541269
579.9045701 582.0991094 591.3232646 593.6997482 596.3695198
608.4559271 612.9387265 619.6205928 623.8326274 627.9373938
630.7058781 636.9960114 640.3865167 643.7866580 648.9316398
654.2937956 656.7085096 660.5145905 664.7295890 667.6579207
670.9075880 680.0441229 682.3966619 689.6826934 692.1735089
698.3639562 701.8450108 705.9302044 710.2609187 715.6095478
716.2524773 725.9134237 727.6316497 734.0704522 739.2669576
741.5461983 743.5488522 749.4258088 752.6324553 759.8795878
766.0950804 768.4460427 770.7390721 771.6881781 777.6365291
778.7329795 782.5582855 786.6344143 791.6014750 793.0919780
794.3780455
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4070
Rtb_to_modes> Number of blocs = 180
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9835E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9893E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2536
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4290
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4964
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.578
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.067
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.378
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.944
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.388
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.746
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.155
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.428
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.865
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.015
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.333
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.710
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.125
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.738
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.260
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.770
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.51
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 0.99998
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00006 0.99998 1.00000 0.99999
0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000
1.00003 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 73260 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 0.99998
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00006 0.99998 1.00000 0.99999
0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000
1.00003 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604161119142382331.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604161119142382331.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604161119142382331.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604161119142382331.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 515
First residue number = 22
Last residue number = 128
Number of atoms found = 4070
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9835E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2536
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4290
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4964
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.578
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.378
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.944
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.388
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.155
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.428
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.865
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.015
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.333
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.710
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.125
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.738
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.770
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.51
Bfactors> 106 vectors, 12210 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.253600
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.309 for 515 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.052 +/- 0.04
Bfactors> = 70.079 +/- 27.30
Bfactors> Shiftng-fct= 70.027
Bfactors> Scaling-fct= 610.505
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604161119142382331.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604161119142382331.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.3
Chkmod> 106 vectors, 12210 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4070 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 52 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6802
0.0034 0.8062
0.0034 0.7846
0.0034 0.8361
0.0034 0.7840
0.0034 0.9440
54.6829 0.6597
71.1222 0.6294
76.5055 0.4091
136.4050 0.6302
156.1158 0.6230
167.4490 0.6088
186.3140 0.4864
199.8703 0.4872
210.1651 0.3848
221.3411 0.4084
252.9860 0.5839
262.9727 0.6080
287.6011 0.3761
294.0475 0.3587
301.5115 0.5843
309.5197 0.6361
320.9835 0.5815
330.4320 0.5882
339.4094 0.3559
350.5181 0.5067
353.6994 0.4904
377.7194 0.4209
381.4470 0.5303
403.2355 0.4285
407.4534 0.4873
417.6002 0.5531
430.5295 0.5081
437.8616 0.1461
445.8671 0.4079
450.8637 0.3023
456.7100 0.4407
475.1831 0.4216
478.2748 0.6040
487.1902 0.1211
492.4859 0.6455
503.1444 0.4176
507.1127 0.4544
509.2010 0.4917
513.8113 0.5180
521.6684 0.2840
526.9533 0.6130
527.8475 0.4974
539.2289 0.4703
547.9057 0.3787
552.6199 0.4876
558.7733 0.0893
561.6148 0.4430
565.7982 0.4290
569.7440 0.4119
579.8977 0.3450
582.0288 0.3175
591.2743 0.5166
593.6625 0.2682
596.3378 0.5673
608.4732 0.4078
612.9140 0.5542
619.6106 0.5298
623.7831 0.5059
627.9279 0.3836
630.6448 0.1860
636.9700 0.4097
640.3854 0.4932
643.7827 0.4389
648.8907 0.4420
654.2292 0.4647
656.6578 0.4643
660.5071 0.4726
664.6890 0.2527
667.6095 0.4988
670.8690 0.4984
680.0337 0.3555
682.3704 0.4459
689.6752 0.4493
692.1497 0.4299
698.3400 0.4583
701.7927 0.4594
705.8971 0.4436
710.2268 0.4134
715.6020 0.3678
716.2608 0.4597
725.9084 0.4783
727.6119 0.4640
734.0654 0.4062
739.2673 0.4419
741.4969 0.4535
743.4820 0.3637
749.4056 0.4524
752.6241 0.5928
759.8742 0.4271
766.0559 0.5243
768.4379 0.3545
770.7361 0.5064
771.6535 0.4620
777.5900 0.4435
778.7264 0.5198
782.5026 0.3601
786.6355 0.4234
791.5665 0.5736
793.0547 0.3145
794.3175 0.5042
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
making animated gifs
11 models are in 2604161119142382331.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
making animated gifs
11 models are in 2604161119142382331.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
making animated gifs
11 models are in 2604161119142382331.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
making animated gifs
11 models are in 2604161119142382331.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604161119142382331.eigenfacs
2604161119142382331.atom
making animated gifs
11 models are in 2604161119142382331.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604161119142382331.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604161119142382331.10.pdb
2604161119142382331.11.pdb
2604161119142382331.7.pdb
2604161119142382331.8.pdb
2604161119142382331.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m20.640s
user 0m20.505s
sys 0m0.125s
rm: cannot remove '2604161119142382331.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|