CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2604161119142382331

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604161119142382331.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604161119142382331.atom to be opened. Openam> File opened: 2604161119142382331.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 515 First residue number = 22 Last residue number = 128 Number of atoms found = 4070 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 154.995576 +/- 30.878455 From: 93.587000 To: 208.065000 = 158.952701 +/- 10.809503 From: 136.345000 To: 187.442000 = 165.557434 +/- 7.058531 From: 149.167000 To: 181.024000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.0441 % Filled. Pdbmat> 1523839 non-zero elements. Pdbmat> 166641 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.89 +/- 22.94 Maximum number = 142 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 3.332820E+06 Pdbmat> Larger element = 678.597 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 515 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604161119142382331.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604161119142382331.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604161119142382331.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4070 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 515 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 21 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 28 atoms in block 3 Block first atom: 40 Blocpdb> 22 atoms in block 4 Block first atom: 68 Blocpdb> 29 atoms in block 5 Block first atom: 90 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 119 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 143 Blocpdb> 27 atoms in block 8 Block first atom: 166 Blocpdb> 17 atoms in block 9 Block first atom: 193 Blocpdb> 25 atoms in block 10 Block first atom: 210 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 235 Blocpdb> 23 atoms in block 12 Block first atom: 262 Blocpdb> 25 atoms in block 13 Block first atom: 285 Blocpdb> 29 atoms in block 14 Block first atom: 310 Blocpdb> 28 atoms in block 15 Block first atom: 339 Blocpdb> 21 atoms in block 16 Block first atom: 367 Blocpdb> 18 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 406 Blocpdb> 5 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 431 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 445 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 464 Blocpdb> 21 atoms in block 23 Block first atom: 489 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 510 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 530 Blocpdb> 27 atoms in block 26 Block first atom: 546 Blocpdb> 26 atoms in block 27 Block first atom: 573 Blocpdb> 20 atoms in block 28 Block first atom: 599 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 619 Blocpdb> 26 atoms in block 30 Block first atom: 643 Blocpdb> 33 atoms in block 31 Block first atom: 669 Blocpdb> 11 atoms in block 32 Block first atom: 702 Blocpdb> 28 atoms in block 33 Block first atom: 713 Blocpdb> 26 atoms in block 34 Block first atom: 741 Blocpdb> 28 atoms in block 35 Block first atom: 767 Blocpdb> 20 atoms in block 36 Block first atom: 795 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 815 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 833 Blocpdb> 28 atoms in block 39 Block first atom: 854 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 882 Blocpdb> 29 atoms in block 41 Block first atom: 904 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 933 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 957 Blocpdb> 27 atoms in block 44 Block first atom: 980 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1007 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 1024 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1049 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1076 Blocpdb> 25 atoms in block 49 Block first atom: 1099 Blocpdb> 29 atoms in block 50 Block first atom: 1124 Blocpdb> 28 atoms in block 51 Block first atom: 1153 Blocpdb> 21 atoms in block 52 Block first atom: 1181 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 1202 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1220 Blocpdb> 5 atoms in block 55 Block first atom: 1240 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 1245 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 1259 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1278 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1303 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1324 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 1344 Blocpdb> 27 atoms in block 62 Block first atom: 1360 Blocpdb> 26 atoms in block 63 Block first atom: 1387 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 1413 Blocpdb> 24 atoms in block 65 Block first atom: 1433 Blocpdb> 26 atoms in block 66 Block first atom: 1457 Blocpdb> 33 atoms in block 67 Block first atom: 1483 Blocpdb> 11 atoms in block 68 Block first atom: 1516 Blocpdb> 28 atoms in block 69 Block first atom: 1527 Blocpdb> 26 atoms in block 70 Block first atom: 1555 Blocpdb> 28 atoms in block 71 Block first atom: 1581 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1609 Blocpdb> 18 atoms in block 73 Block first atom: 1629 Blocpdb> 21 atoms in block 74 Block first atom: 1647 Blocpdb> 28 atoms in block 75 Block first atom: 1668 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1696 Blocpdb> 29 atoms in block 77 Block first atom: 1718 Blocpdb> 24 atoms in block 78 Block first atom: 1747 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 1771 Blocpdb> 27 atoms in block 80 Block first atom: 1794 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1821 Blocpdb> 25 atoms in block 82 Block first atom: 1838 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 1863 Blocpdb> 23 atoms in block 84 Block first atom: 1890 Blocpdb> 25 atoms in block 85 Block first atom: 1913 Blocpdb> 29 atoms in block 86 Block first atom: 1938 Blocpdb> 28 atoms in block 87 Block first atom: 1967 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1995 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 2016 Blocpdb> 20 atoms in block 90 Block first atom: 2034 Blocpdb> 5 atoms in block 91 Block first atom: 2054 Blocpdb> 14 atoms in block 92 Block first atom: 2059 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2073 Blocpdb> 25 atoms in block 94 Block first atom: 2092 Blocpdb> 21 atoms in block 95 Block first atom: 2117 Blocpdb> 20 atoms in block 96 Block first atom: 2138 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 2158 Blocpdb> 27 atoms in block 98 Block first atom: 2174 Blocpdb> 26 atoms in block 99 Block first atom: 2201 Blocpdb> 20 atoms in block 100 Block first atom: 2227 Blocpdb> 24 atoms in block 101 Block first atom: 2247 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 2271 Blocpdb> 33 atoms in block 103 Block first atom: 2297 Blocpdb> 11 atoms in block 104 Block first atom: 2330 Blocpdb> 28 atoms in block 105 Block first atom: 2341 Blocpdb> 26 atoms in block 106 Block first atom: 2369 Blocpdb> 28 atoms in block 107 Block first atom: 2395 Blocpdb> 20 atoms in block 108 Block first atom: 2423 Blocpdb> 18 atoms in block 109 Block first atom: 2443 Blocpdb> 21 atoms in block 110 Block first atom: 2461 Blocpdb> 28 atoms in block 111 Block first atom: 2482 Blocpdb> 22 atoms in block 112 Block first atom: 2510 Blocpdb> 29 atoms in block 113 Block first atom: 2532 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 2561 Blocpdb> 23 atoms in block 115 Block first atom: 2585 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 2608 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2635 Blocpdb> 25 atoms in block 118 Block first atom: 2652 Blocpdb> 27 atoms in block 119 Block first atom: 2677 Blocpdb> 23 atoms in block 120 Block first atom: 2704 Blocpdb> 25 atoms in block 121 Block first atom: 2727 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2752 Blocpdb> 28 atoms in block 123 Block first atom: 2781 Blocpdb> 21 atoms in block 124 Block first atom: 2809 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2830 Blocpdb> 20 atoms in block 126 Block first atom: 2848 Blocpdb> 5 atoms in block 127 Block first atom: 2868 Blocpdb> 14 atoms in block 128 Block first atom: 2873 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 2887 Blocpdb> 25 atoms in block 130 Block first atom: 2906 Blocpdb> 21 atoms in block 131 Block first atom: 2931 Blocpdb> 20 atoms in block 132 Block first atom: 2952 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 2972 Blocpdb> 27 atoms in block 134 Block first atom: 2988 Blocpdb> 26 atoms in block 135 Block first atom: 3015 Blocpdb> 20 atoms in block 136 Block first atom: 3041 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 3061 Blocpdb> 26 atoms in block 138 Block first atom: 3085 Blocpdb> 33 atoms in block 139 Block first atom: 3111 Blocpdb> 11 atoms in block 140 Block first atom: 3144 Blocpdb> 28 atoms in block 141 Block first atom: 3155 Blocpdb> 26 atoms in block 142 Block first atom: 3183 Blocpdb> 28 atoms in block 143 Block first atom: 3209 Blocpdb> 20 atoms in block 144 Block first atom: 3237 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 3257 Blocpdb> 21 atoms in block 146 Block first atom: 3275 Blocpdb> 28 atoms in block 147 Block first atom: 3296 Blocpdb> 22 atoms in block 148 Block first atom: 3324 Blocpdb> 29 atoms in block 149 Block first atom: 3346 Blocpdb> 24 atoms in block 150 Block first atom: 3375 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3399 Blocpdb> 27 atoms in block 152 Block first atom: 3422 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 3449 Blocpdb> 25 atoms in block 154 Block first atom: 3466 Blocpdb> 27 atoms in block 155 Block first atom: 3491 Blocpdb> 23 atoms in block 156 Block first atom: 3518 Blocpdb> 25 atoms in block 157 Block first atom: 3541 Blocpdb> 29 atoms in block 158 Block first atom: 3566 Blocpdb> 28 atoms in block 159 Block first atom: 3595 Blocpdb> 21 atoms in block 160 Block first atom: 3623 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 3644 Blocpdb> 20 atoms in block 162 Block first atom: 3662 Blocpdb> 5 atoms in block 163 Block first atom: 3682 Blocpdb> 14 atoms in block 164 Block first atom: 3687 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 3701 Blocpdb> 25 atoms in block 166 Block first atom: 3720 Blocpdb> 21 atoms in block 167 Block first atom: 3745 Blocpdb> 20 atoms in block 168 Block first atom: 3766 Blocpdb> 16 atoms in block 169 Block first atom: 3786 Blocpdb> 27 atoms in block 170 Block first atom: 3802 Blocpdb> 26 atoms in block 171 Block first atom: 3829 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3855 Blocpdb> 24 atoms in block 173 Block first atom: 3875 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3899 Blocpdb> 33 atoms in block 175 Block first atom: 3925 Blocpdb> 11 atoms in block 176 Block first atom: 3958 Blocpdb> 28 atoms in block 177 Block first atom: 3969 Blocpdb> 26 atoms in block 178 Block first atom: 3997 Blocpdb> 28 atoms in block 179 Block first atom: 4023 Blocpdb> 20 atoms in block 180 Block first atom: 4050 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1524019 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12210 Prepmat> Matrix trace = 3332820.0000 Prepmat> Last element read: 12210 12210 170.2107 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14588 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4070 RTB> Total mass = 4070.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4070 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 232851.1282 RTB> 58572 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58572 Diagstd> Projected matrix trace = 232851.1282 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 232851.1282 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2535842 0.4290283 0.4963653 1.5775322 2.0668586 2.3780670 2.9440086 3.3883333 3.7458214 4.1545275 5.4280292 5.8651024 7.0154224 7.3334980 7.7099796 8.1248141 8.7377909 9.2604537 9.7697628 10.4224425 10.6070780 12.0976378 12.3425058 13.7900651 14.0767654 14.7904545 15.7220073 16.2593569 16.8642236 17.2432236 17.6949263 19.1460715 19.3977735 20.1330734 20.5661613 21.4704773 21.8085863 21.9915067 22.3902341 23.0751731 23.5457144 23.6316755 24.6565637 25.4576394 25.8993295 26.4758351 26.7529914 27.1481411 27.5286173 28.5182257 28.7344778 29.6523673 29.8911875 30.1606236 31.3955208 31.8598380 32.5582554 33.0024066 33.4381415 33.7336393 34.4098568 34.7771348 35.1474145 35.7114380 36.3040472 36.5725066 36.9976611 37.4713605 37.8022327 38.1711151 39.2178357 39.4896448 40.3374180 40.6293044 41.3592898 41.7726352 42.2603382 42.7804430 43.4271863 43.5052545 44.6867834 44.8985796 45.6967092 46.3459758 46.6321957 46.8844099 47.6284809 48.0369388 48.9664925 49.7708189 50.0767570 50.3760593 50.5002041 51.2817392 51.4264534 51.9329302 52.4753476 53.1401320 53.3404351 53.5135676 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034311 0.0034321 0.0034349 0.0034350 0.0034351 0.0034354 54.6835125 71.1276172 76.5060878 136.3905863 156.1171678 167.4585485 186.3222924 199.8887463 210.1690741 221.3380593 252.9975797 262.9862717 287.6220599 294.0700992 301.5240069 309.5294652 320.9934011 330.4543039 339.4198915 350.5742670 353.6658785 377.6987684 381.5021150 403.2537713 407.4241012 417.6245693 430.5754634 437.8717856 445.9420813 450.9252039 456.7932303 475.1547979 478.2678879 487.2482839 492.4610636 503.1716107 507.1180133 509.2403087 513.8360815 521.6362502 526.9279270 527.8889085 539.2144915 547.9038418 552.6364689 558.7533165 561.6702939 565.8031087 569.7541269 579.9045701 582.0991094 591.3232646 593.6997482 596.3695198 608.4559271 612.9387265 619.6205928 623.8326274 627.9373938 630.7058781 636.9960114 640.3865167 643.7866580 648.9316398 654.2937956 656.7085096 660.5145905 664.7295890 667.6579207 670.9075880 680.0441229 682.3966619 689.6826934 692.1735089 698.3639562 701.8450108 705.9302044 710.2609187 715.6095478 716.2524773 725.9134237 727.6316497 734.0704522 739.2669576 741.5461983 743.5488522 749.4258088 752.6324553 759.8795878 766.0950804 768.4460427 770.7390721 771.6881781 777.6365291 778.7329795 782.5582855 786.6344143 791.6014750 793.0919780 794.3780455 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4070 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9835E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4290 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.578 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.378 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.944 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.155 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.428 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.865 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.015 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.333 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.125 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.770 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.51 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00006 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 73260 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00006 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604161119142382331.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604161119142382331.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604161119142382331.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604161119142382331.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 515 First residue number = 22 Last residue number = 128 Number of atoms found = 4070 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9835E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.578 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.378 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.944 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.155 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.865 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.015 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.333 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.125 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.770 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.51 Bfactors> 106 vectors, 12210 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.253600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.309 for 515 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.052 +/- 0.04 Bfactors> = 70.079 +/- 27.30 Bfactors> Shiftng-fct= 70.027 Bfactors> Scaling-fct= 610.505 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604161119142382331.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604161119142382331.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.3 Chkmod> 106 vectors, 12210 coordinates in file. Chkmod> That is: 4070 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 52 is: 1.0002 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6802 0.0034 0.8062 0.0034 0.7846 0.0034 0.8361 0.0034 0.7840 0.0034 0.9440 54.6829 0.6597 71.1222 0.6294 76.5055 0.4091 136.4050 0.6302 156.1158 0.6230 167.4490 0.6088 186.3140 0.4864 199.8703 0.4872 210.1651 0.3848 221.3411 0.4084 252.9860 0.5839 262.9727 0.6080 287.6011 0.3761 294.0475 0.3587 301.5115 0.5843 309.5197 0.6361 320.9835 0.5815 330.4320 0.5882 339.4094 0.3559 350.5181 0.5067 353.6994 0.4904 377.7194 0.4209 381.4470 0.5303 403.2355 0.4285 407.4534 0.4873 417.6002 0.5531 430.5295 0.5081 437.8616 0.1461 445.8671 0.4079 450.8637 0.3023 456.7100 0.4407 475.1831 0.4216 478.2748 0.6040 487.1902 0.1211 492.4859 0.6455 503.1444 0.4176 507.1127 0.4544 509.2010 0.4917 513.8113 0.5180 521.6684 0.2840 526.9533 0.6130 527.8475 0.4974 539.2289 0.4703 547.9057 0.3787 552.6199 0.4876 558.7733 0.0893 561.6148 0.4430 565.7982 0.4290 569.7440 0.4119 579.8977 0.3450 582.0288 0.3175 591.2743 0.5166 593.6625 0.2682 596.3378 0.5673 608.4732 0.4078 612.9140 0.5542 619.6106 0.5298 623.7831 0.5059 627.9279 0.3836 630.6448 0.1860 636.9700 0.4097 640.3854 0.4932 643.7827 0.4389 648.8907 0.4420 654.2292 0.4647 656.6578 0.4643 660.5071 0.4726 664.6890 0.2527 667.6095 0.4988 670.8690 0.4984 680.0337 0.3555 682.3704 0.4459 689.6752 0.4493 692.1497 0.4299 698.3400 0.4583 701.7927 0.4594 705.8971 0.4436 710.2268 0.4134 715.6020 0.3678 716.2608 0.4597 725.9084 0.4783 727.6119 0.4640 734.0654 0.4062 739.2673 0.4419 741.4969 0.4535 743.4820 0.3637 749.4056 0.4524 752.6241 0.5928 759.8742 0.4271 766.0559 0.5243 768.4379 0.3545 770.7361 0.5064 771.6535 0.4620 777.5900 0.4435 778.7264 0.5198 782.5026 0.3601 786.6355 0.4234 791.5665 0.5736 793.0547 0.3145 794.3175 0.5042 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom making animated gifs 11 models are in 2604161119142382331.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom making animated gifs 11 models are in 2604161119142382331.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom making animated gifs 11 models are in 2604161119142382331.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom making animated gifs 11 models are in 2604161119142382331.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161119142382331 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604161119142382331.eigenfacs 2604161119142382331.atom making animated gifs 11 models are in 2604161119142382331.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161119142382331.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604161119142382331.10.pdb 2604161119142382331.11.pdb 2604161119142382331.7.pdb 2604161119142382331.8.pdb 2604161119142382331.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m20.640s user 0m20.505s sys 0m0.125s rm: cannot remove '2604161119142382331.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.