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***  TRANSPORT PROTEIN 23-FEB-99 1NGL  ***

LOGs for ID: 2604161210002404095

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604161210002404095.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604161210002404095.atom to be opened. Openam> File opened: 2604161210002404095.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 179 First residue number = 1 Last residue number = 179 Number of atoms found = 2916 Mean number per residue = 16.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 145.826729 +/- 8.965720 From: 125.893000 To: 172.352000 = -0.025191 +/- 10.545353 From: -22.274000 To: 26.268000 = 0.705164 +/- 10.537817 From: -27.990000 To: 28.986000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.9198 % Filled. Pdbmat> 1882721 non-zero elements. Pdbmat> 207280 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 142.17 +/- 48.58 Maximum number = 243 Minimum number = 22 Pdbmat> Matrix trace = 4.145600E+06 Pdbmat> Larger element = 890.528 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 179 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604161210002404095.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604161210002404095.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604161210002404095.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2916 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 179 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 17 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 12 atoms in block 3 Block first atom: 37 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 49 Blocpdb> 14 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 11 atoms in block 6 Block first atom: 74 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 85 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 97 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 116 Blocpdb> 14 atoms in block 10 Block first atom: 135 Blocpdb> 10 atoms in block 11 Block first atom: 149 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 159 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 173 Blocpdb> 19 atoms in block 14 Block first atom: 187 Blocpdb> 11 atoms in block 15 Block first atom: 206 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 217 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 239 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 255 Blocpdb> 19 atoms in block 19 Block first atom: 269 Blocpdb> 17 atoms in block 20 Block first atom: 288 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 305 Blocpdb> 14 atoms in block 22 Block first atom: 322 Blocpdb> 20 atoms in block 23 Block first atom: 336 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 356 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 373 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 385 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 399 Blocpdb> 20 atoms in block 28 Block first atom: 416 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 436 Blocpdb> 7 atoms in block 30 Block first atom: 453 Blocpdb> 22 atoms in block 31 Block first atom: 460 Blocpdb> 24 atoms in block 32 Block first atom: 482 Blocpdb> 21 atoms in block 33 Block first atom: 506 Blocpdb> 16 atoms in block 34 Block first atom: 527 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 543 Blocpdb> 7 atoms in block 36 Block first atom: 559 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 566 Blocpdb> 10 atoms in block 38 Block first atom: 585 Blocpdb> 7 atoms in block 39 Block first atom: 595 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 602 Blocpdb> 10 atoms in block 41 Block first atom: 616 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 626 Blocpdb> 19 atoms in block 43 Block first atom: 645 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 664 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 688 Blocpdb> 12 atoms in block 46 Block first atom: 703 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 715 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 737 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 749 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 763 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 780 Blocpdb> 17 atoms in block 52 Block first atom: 802 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 819 Blocpdb> 10 atoms in block 54 Block first atom: 840 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 850 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 864 Blocpdb> 21 atoms in block 57 Block first atom: 883 Blocpdb> 15 atoms in block 58 Block first atom: 904 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 919 Blocpdb> 22 atoms in block 60 Block first atom: 938 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 960 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 975 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 987 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 1009 Blocpdb> 21 atoms in block 65 Block first atom: 1020 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1041 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1055 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1071 Blocpdb> 11 atoms in block 69 Block first atom: 1085 Blocpdb> 16 atoms in block 70 Block first atom: 1096 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1112 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1131 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1151 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1175 Blocpdb> 22 atoms in block 75 Block first atom: 1197 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1219 Blocpdb> 10 atoms in block 77 Block first atom: 1241 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1251 Blocpdb> 21 atoms in block 79 Block first atom: 1263 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1284 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 1308 Blocpdb> 24 atoms in block 82 Block first atom: 1327 Blocpdb> 14 atoms in block 83 Block first atom: 1351 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1365 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1385 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1401 Blocpdb> 7 atoms in block 87 Block first atom: 1415 Blocpdb> 11 atoms in block 88 Block first atom: 1422 Blocpdb> 17 atoms in block 89 Block first atom: 1433 Blocpdb> 14 atoms in block 90 Block first atom: 1450 Blocpdb> 7 atoms in block 91 Block first atom: 1464 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1471 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1486 Blocpdb> 14 atoms in block 94 Block first atom: 1506 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 1520 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 1539 Blocpdb> 14 atoms in block 97 Block first atom: 1546 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1560 Blocpdb> 22 atoms in block 99 Block first atom: 1579 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 1601 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 1612 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1633 Blocpdb> 7 atoms in block 103 Block first atom: 1647 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1654 Blocpdb> 14 atoms in block 105 Block first atom: 1673 Blocpdb> 11 atoms in block 106 Block first atom: 1687 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 1698 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 1719 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1738 Blocpdb> 24 atoms in block 110 Block first atom: 1754 Blocpdb> 16 atoms in block 111 Block first atom: 1778 Blocpdb> 16 atoms in block 112 Block first atom: 1794 Blocpdb> 11 atoms in block 113 Block first atom: 1810 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1821 Blocpdb> 14 atoms in block 115 Block first atom: 1835 Blocpdb> 21 atoms in block 116 Block first atom: 1849 Blocpdb> 14 atoms in block 117 Block first atom: 1870 Blocpdb> 17 atoms in block 118 Block first atom: 1884 Blocpdb> 17 atoms in block 119 Block first atom: 1901 Blocpdb> 10 atoms in block 120 Block first atom: 1918 Blocpdb> 17 atoms in block 121 Block first atom: 1928 Blocpdb> 16 atoms in block 122 Block first atom: 1945 Blocpdb> 20 atoms in block 123 Block first atom: 1961 Blocpdb> 20 atoms in block 124 Block first atom: 1981 Blocpdb> 22 atoms in block 125 Block first atom: 2001 Blocpdb> 22 atoms in block 126 Block first atom: 2023 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 2045 Blocpdb> 11 atoms in block 128 Block first atom: 2061 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 2072 Blocpdb> 14 atoms in block 130 Block first atom: 2089 Blocpdb> 24 atoms in block 131 Block first atom: 2103 Blocpdb> 15 atoms in block 132 Block first atom: 2127 Blocpdb> 21 atoms in block 133 Block first atom: 2142 Blocpdb> 20 atoms in block 134 Block first atom: 2163 Blocpdb> 22 atoms in block 135 Block first atom: 2183 Blocpdb> 19 atoms in block 136 Block first atom: 2205 Blocpdb> 14 atoms in block 137 Block first atom: 2224 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2238 Blocpdb> 21 atoms in block 139 Block first atom: 2257 Blocpdb> 7 atoms in block 140 Block first atom: 2278 Blocpdb> 24 atoms in block 141 Block first atom: 2285 Blocpdb> 14 atoms in block 142 Block first atom: 2309 Blocpdb> 22 atoms in block 143 Block first atom: 2323 Blocpdb> 15 atoms in block 144 Block first atom: 2345 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2360 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2379 Blocpdb> 11 atoms in block 147 Block first atom: 2393 Blocpdb> 15 atoms in block 148 Block first atom: 2404 Blocpdb> 19 atoms in block 149 Block first atom: 2419 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 2438 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2460 Blocpdb> 14 atoms in block 152 Block first atom: 2475 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 2489 Blocpdb> 19 atoms in block 154 Block first atom: 2509 Blocpdb> 24 atoms in block 155 Block first atom: 2528 Blocpdb> 20 atoms in block 156 Block first atom: 2552 Blocpdb> 11 atoms in block 157 Block first atom: 2572 Blocpdb> 22 atoms in block 158 Block first atom: 2583 Blocpdb> 11 atoms in block 159 Block first atom: 2605 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 2616 Blocpdb> 7 atoms in block 161 Block first atom: 2635 Blocpdb> 19 atoms in block 162 Block first atom: 2642 Blocpdb> 14 atoms in block 163 Block first atom: 2661 Blocpdb> 15 atoms in block 164 Block first atom: 2675 Blocpdb> 14 atoms in block 165 Block first atom: 2690 Blocpdb> 17 atoms in block 166 Block first atom: 2704 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 2721 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2740 Blocpdb> 20 atoms in block 169 Block first atom: 2756 Blocpdb> 14 atoms in block 170 Block first atom: 2776 Blocpdb> 16 atoms in block 171 Block first atom: 2790 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 2806 Blocpdb> 19 atoms in block 173 Block first atom: 2820 Blocpdb> 12 atoms in block 174 Block first atom: 2839 Blocpdb> 17 atoms in block 175 Block first atom: 2851 Blocpdb> 10 atoms in block 176 Block first atom: 2868 Blocpdb> 19 atoms in block 177 Block first atom: 2878 Blocpdb> 12 atoms in block 178 Block first atom: 2897 Blocpdb> 8 atoms in block 179 Block first atom: 2908 Blocpdb> 179 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1882900 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8748 Prepmat> Matrix trace = 4145600.0000 Prepmat> Last element read: 8748 8748 351.6307 Prepmat> 16111 lines saved. Prepmat> 13806 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2916 RTB> Total mass = 2916.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2916 RTB> Number of blocks = 179 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 460361.7039 RTB> 80259 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1074 Diagstd> Nb of non-zero elements: 80259 Diagstd> Projected matrix trace = 460361.7039 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1074 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 460361.7039 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1623170 0.3690490 1.1087998 3.5682291 4.1324318 5.0255140 6.5067110 7.4379701 8.7660323 9.3688764 10.3782951 12.1892588 12.5691143 14.3921226 15.6878936 17.1730516 18.3036309 20.2382725 20.8941325 22.0361009 23.7533467 25.3145494 26.0248966 27.7112428 27.9396733 29.0865988 29.5575700 30.4275187 31.7503795 33.8221463 34.2422460 35.4533889 37.2742576 38.2950891 39.8965032 41.7158330 42.3909721 43.2732010 44.9652978 47.3332632 48.1346616 48.4036365 50.6386473 51.1604745 52.6665713 53.9169858 54.7183703 56.7753716 58.8679685 59.3359575 61.5404931 62.7330113 64.5048519 65.3029103 65.6078457 66.5512021 67.9479347 70.2068613 71.8969884 72.5581976 73.0877792 74.5016538 76.9484776 77.7384561 78.6488476 79.4469948 82.8161536 83.1324217 84.2220387 84.5316361 86.3875997 87.5331470 89.1591084 89.6139747 90.7106400 91.2706136 92.2422373 92.9859991 94.6174872 94.9504534 97.6471858 99.6560354 100.0437547 100.8716692 102.4195150 103.1165676 103.7968580 105.6074095 106.1096351 109.3189163 109.8726273 110.8558617 111.6789112 112.5754439 113.5369603 114.8211452 115.5371220 116.6803330 118.3693489 118.5387124 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034335 0.0034345 0.0034349 0.0034353 0.0034356 43.7499280 65.9686085 114.3462279 205.1264410 220.7486851 243.4364038 276.9976206 296.1573363 321.5117231 332.3831765 349.8309968 379.1263147 384.9883777 411.9625190 430.1080762 450.0067386 464.5836327 488.5196084 496.3722021 509.7563645 529.2461214 546.3618682 553.9745160 571.6408838 573.9921359 585.6548584 590.3772905 599.0023817 611.8849064 631.5327285 635.4427102 646.5828145 662.9790137 671.9962077 685.9029907 701.3676662 707.0204380 714.3397071 728.1720707 747.0995990 753.3976160 755.4996640 772.7452213 776.7165557 788.0663853 797.3666786 803.2705729 818.2297635 833.1722653 836.4774886 851.8747898 860.0889096 872.1505748 877.5291431 879.5755916 885.8766045 895.1244307 909.8819700 920.7688740 924.9931639 928.3626577 937.2991799 952.5664827 957.4436778 963.0336493 967.9078612 988.2181094 990.1032731 996.5707935 998.4007937 1009.3016516 1015.9715615 1025.3641728 1027.9764142 1034.2473001 1037.4346887 1042.9420894 1047.1383401 1056.2846906 1058.1416318 1073.0628165 1084.0444321 1086.1511634 1090.6361386 1098.9720260 1102.7054077 1106.3368645 1115.9441894 1118.5945290 1135.3844427 1138.2562275 1143.3379302 1147.5744381 1152.1714629 1157.0813979 1163.6067107 1167.2289563 1172.9894615 1181.4488112 1182.2937210 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2916 Rtb_to_modes> Number of blocs = 179 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.109 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.568 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.132 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.026 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.507 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.438 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.5 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1074 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 0.99996 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 1.00003 0.99999 0.99996 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00005 1.00002 1.00001 0.99996 0.99997 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 52488 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 0.99996 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 1.00003 0.99999 0.99996 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00005 1.00002 1.00001 0.99996 0.99997 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604161210002404095.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604161210002404095.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604161210002404095.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604161210002404095.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 179 First residue number = 1 Last residue number = 179 Number of atoms found = 2916 Mean number per residue = 16.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.109 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.568 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.132 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.507 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.5 Bfactors> 106 vectors, 8748 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.162300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.884 for 179 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.057 +/- 0.25 Bfactors> = 1.381 +/- 2.07 Bfactors> Shiftng-fct= 1.323 Bfactors> Scaling-fct= 8.368 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604161210002404095.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604161210002404095.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.2 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1086. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1148. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1157. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1167. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182. Chkmod> 106 vectors, 8748 coordinates in file. Chkmod> That is: 2916 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9493 0.0034 0.7497 0.0034 0.7223 0.0034 0.7234 0.0034 0.9336 0.0034 0.7107 43.7458 0.0759 65.9614 0.0374 114.3516 0.0219 205.1111 0.0509 220.7277 0.1454 243.4377 0.2590 276.9919 0.2288 296.1452 0.1699 321.4973 0.1464 332.3711 0.1677 349.8447 0.1046 379.1216 0.3105 384.9854 0.1897 411.9145 0.2610 430.1185 0.1031 449.9474 0.2229 464.5176 0.4540 488.5195 0.2868 496.3018 0.2994 509.7796 0.3766 529.1861 0.0313 546.2893 0.2811 553.8986 0.2935 571.6035 0.3226 573.9709 0.2207 585.6640 0.2522 590.3762 0.4655 599.0011 0.1682 611.8550 0.2248 631.4856 0.3713 635.3946 0.3050 646.5242 0.3599 662.9127 0.5583 672.0104 0.2356 685.9036 0.4707 701.3726 0.4086 706.9820 0.4571 714.2826 0.2587 728.1789 0.3526 747.0418 0.4423 753.3288 0.2384 755.4389 0.3690 772.7224 0.2227 776.6796 0.0355 788.0582 0.3904 797.3547 0.3684 803.2481 0.3579 818.2280 0.3320 833.1509 0.5194 836.4701 0.3252 851.8348 0.2343 860.0313 0.3910 872.0803 0.0261 877.4719 0.3652 879.5523 0.3380 885.8306 0.3033 895.0996 0.4349 909.8632 0.2156 920.7486 0.2481 924.9649 0.4013 928.3369 0.3256 937.2485 0.3392 952.5350 0.5343 957.4121 0.3929 962.9994 0.2083 967.8846 0.3427 988.1986 0.3909 990.0463 0.3748 996.5160 0.3031 998.3483 0.2563 1009.2723 0.3414 1015.9097 0.2775 1025.3253 0.1495 1027.9095 0.3114 1034.1993 0.2468 1037.3867 0.2420 1042.8847 0.4150 1047.1159 0.3446 1056.2534 0.3163 1058.0937 0.3742 1073.0322 0.3246 1084.0195 0.1848 1085.8670 0.2859 1090.7425 0.3199 1098.8202 0.3404 1102.5695 0.1497 1106.3061 0.4756 1115.8571 0.3471 1118.4957 0.4299 1135.2375 0.5019 1138.3491 0.2504 1143.5164 0.2587 1147.6335 0.2869 1152.2477 0.2738 1156.8434 0.2253 1163.4496 0.1877 1166.9913 0.4375 1173.0380 0.2191 1181.5510 0.4211 1182.0499 0.1294 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161210002404095 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom making animated gifs 11 models are in 2604161210002404095.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161210002404095.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161210002404095.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161210002404095 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom making animated gifs 11 models are in 2604161210002404095.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161210002404095.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161210002404095.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161210002404095 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom making animated gifs 11 models are in 2604161210002404095.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161210002404095.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161210002404095.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161210002404095 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161210002404095.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604161210002404095 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604161210002404095.eigenfacs 2604161210002404095.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604161210002404095.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604161210002404095.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604161210002404095.10.pdb 2604161210002404095.11.pdb 2604161210002404095.7.pdb 2604161210002404095.8.pdb 2604161210002404095.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m20.388s user 0m20.264s sys 0m0.118s rm: cannot remove '2604161210002404095.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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