***  PDHK1 and DCA  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604162351172680512.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604162351172680512.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604162351172680512.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 365
First residue number = 41
Last residue number = 423
Number of atoms found = 2971
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 2.161342 +/- 10.970344 From: -18.207000 To: 36.247000
= 27.047230 +/- 15.579856 From: -6.364000 To: 61.616000
= -7.309808 +/- 10.634582 From: -37.518000 To: 18.157000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.7717 % Filled.
Pdbmat> 1101045 non-zero elements.
Pdbmat> 120376 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.03 +/- 23.35
Maximum number = 130
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 2.407520E+06
Pdbmat> Larger element = 513.251
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
365 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604162351172680512.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604162351172680512.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604162351172680512.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2971 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 365 residues.
Blocpdb> 9 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 10
Blocpdb> 16 atoms in block 3
Block first atom: 21
Blocpdb> 19 atoms in block 4
Block first atom: 37
Blocpdb> 17 atoms in block 5
Block first atom: 56
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 73
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 95
Blocpdb> 13 atoms in block 8
Block first atom: 108
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 121
Blocpdb> 17 atoms in block 10
Block first atom: 135
Blocpdb> 20 atoms in block 11
Block first atom: 152
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 172
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 188
Blocpdb> 6 atoms in block 14
Block first atom: 203
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 209
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 224
Blocpdb> 17 atoms in block 17
Block first atom: 240
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 257
Blocpdb> 19 atoms in block 19
Block first atom: 276
Blocpdb> 18 atoms in block 20
Block first atom: 295
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 313
Blocpdb> 18 atoms in block 22
Block first atom: 328
Blocpdb> 13 atoms in block 23
Block first atom: 346
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 359
Blocpdb> 17 atoms in block 25
Block first atom: 375
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 392
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 409
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 423
Blocpdb> 16 atoms in block 29
Block first atom: 438
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 454
Blocpdb> 18 atoms in block 31
Block first atom: 470
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 488
Blocpdb> 16 atoms in block 33
Block first atom: 501
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 517
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 532
Blocpdb> 26 atoms in block 36
Block first atom: 547
Blocpdb> 17 atoms in block 37
Block first atom: 573
Blocpdb> 14 atoms in block 38
Block first atom: 590
Blocpdb> 18 atoms in block 39
Block first atom: 604
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 622
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 638
Blocpdb> 17 atoms in block 42
Block first atom: 657
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 674
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 689
Blocpdb> 13 atoms in block 45
Block first atom: 703
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 716
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 730
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 750
Blocpdb> 15 atoms in block 49
Block first atom: 769
Blocpdb> 14 atoms in block 50
Block first atom: 784
Blocpdb> 19 atoms in block 51
Block first atom: 798
Blocpdb> 19 atoms in block 52
Block first atom: 817
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 836
Blocpdb> 18 atoms in block 54
Block first atom: 855
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 873
Blocpdb> 15 atoms in block 56
Block first atom: 888
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 903
Blocpdb> 14 atoms in block 58
Block first atom: 918
Blocpdb> 11 atoms in block 59
Block first atom: 932
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 943
Blocpdb> 21 atoms in block 61
Block first atom: 960
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 981
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 996
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 1007
Blocpdb> 14 atoms in block 65
Block first atom: 1022
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 1036
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1051
Blocpdb> 21 atoms in block 68
Block first atom: 1066
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1087
Blocpdb> 19 atoms in block 70
Block first atom: 1106
Blocpdb> 23 atoms in block 71
Block first atom: 1125
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1148
Blocpdb> 19 atoms in block 73
Block first atom: 1162
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1181
Blocpdb> 19 atoms in block 75
Block first atom: 1195
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1214
Blocpdb> 17 atoms in block 77
Block first atom: 1230
Blocpdb> 16 atoms in block 78
Block first atom: 1247
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1263
Blocpdb> 15 atoms in block 80
Block first atom: 1279
Blocpdb> 18 atoms in block 81
Block first atom: 1294
Blocpdb> 10 atoms in block 82
Block first atom: 1312
Blocpdb> 16 atoms in block 83
Block first atom: 1322
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1338
Blocpdb> 14 atoms in block 85
Block first atom: 1353
Blocpdb> 15 atoms in block 86
Block first atom: 1367
Blocpdb> 16 atoms in block 87
Block first atom: 1382
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1398
Blocpdb> 12 atoms in block 89
Block first atom: 1415
Blocpdb> 21 atoms in block 90
Block first atom: 1427
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1448
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 1461
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1483
Blocpdb> 16 atoms in block 94
Block first atom: 1497
Blocpdb> 24 atoms in block 95
Block first atom: 1513
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1537
Blocpdb> 13 atoms in block 97
Block first atom: 1553
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1566
Blocpdb> 17 atoms in block 99
Block first atom: 1583
Blocpdb> 18 atoms in block 100
Block first atom: 1600
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1618
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1634
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1648
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1661
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1674
Blocpdb> 16 atoms in block 106
Block first atom: 1689
Blocpdb> 19 atoms in block 107
Block first atom: 1705
Blocpdb> 14 atoms in block 108
Block first atom: 1724
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1738
Blocpdb> 20 atoms in block 110
Block first atom: 1754
Blocpdb> 25 atoms in block 111
Block first atom: 1774
Blocpdb> 18 atoms in block 112
Block first atom: 1799
Blocpdb> 17 atoms in block 113
Block first atom: 1817
Blocpdb> 20 atoms in block 114
Block first atom: 1834
Blocpdb> 13 atoms in block 115
Block first atom: 1854
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 1867
Blocpdb> 12 atoms in block 117
Block first atom: 1886
Blocpdb> 17 atoms in block 118
Block first atom: 1898
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 1915
Blocpdb> 13 atoms in block 120
Block first atom: 1935
Blocpdb> 15 atoms in block 121
Block first atom: 1948
Blocpdb> 19 atoms in block 122
Block first atom: 1963
Blocpdb> 14 atoms in block 123
Block first atom: 1982
Blocpdb> 17 atoms in block 124
Block first atom: 1996
Blocpdb> 17 atoms in block 125
Block first atom: 2013
Blocpdb> 14 atoms in block 126
Block first atom: 2030
Blocpdb> 12 atoms in block 127
Block first atom: 2044
Blocpdb> 17 atoms in block 128
Block first atom: 2056
Blocpdb> 16 atoms in block 129
Block first atom: 2073
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 2089
Blocpdb> 17 atoms in block 131
Block first atom: 2103
Blocpdb> 14 atoms in block 132
Block first atom: 2120
Blocpdb> 15 atoms in block 133
Block first atom: 2134
Blocpdb> 8 atoms in block 134
Block first atom: 2149
Blocpdb> 14 atoms in block 135
Block first atom: 2157
Blocpdb> 19 atoms in block 136
Block first atom: 2171
Blocpdb> 17 atoms in block 137
Block first atom: 2190
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 2207
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 2226
Blocpdb> 20 atoms in block 140
Block first atom: 2245
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 2265
Blocpdb> 13 atoms in block 142
Block first atom: 2285
Blocpdb> 12 atoms in block 143
Block first atom: 2298
Blocpdb> 18 atoms in block 144
Block first atom: 2310
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 2328
Blocpdb> 16 atoms in block 146
Block first atom: 2346
Blocpdb> 17 atoms in block 147
Block first atom: 2362
Blocpdb> 12 atoms in block 148
Block first atom: 2379
Blocpdb> 15 atoms in block 149
Block first atom: 2391
Blocpdb> 9 atoms in block 150
Block first atom: 2406
Blocpdb> 15 atoms in block 151
Block first atom: 2415
Blocpdb> 16 atoms in block 152
Block first atom: 2430
Blocpdb> 15 atoms in block 153
Block first atom: 2446
Blocpdb> 14 atoms in block 154
Block first atom: 2461
Blocpdb> 19 atoms in block 155
Block first atom: 2475
Blocpdb> 17 atoms in block 156
Block first atom: 2494
Blocpdb> 21 atoms in block 157
Block first atom: 2511
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 2532
Blocpdb> 12 atoms in block 159
Block first atom: 2552
Blocpdb> 17 atoms in block 160
Block first atom: 2564
Blocpdb> 32 atoms in block 161
Block first atom: 2581
Blocpdb> 14 atoms in block 162
Block first atom: 2613
Blocpdb> 13 atoms in block 163
Block first atom: 2627
Blocpdb> 16 atoms in block 164
Block first atom: 2640
Blocpdb> 15 atoms in block 165
Block first atom: 2656
Blocpdb> 12 atoms in block 166
Block first atom: 2671
Blocpdb> 20 atoms in block 167
Block first atom: 2683
Blocpdb> 17 atoms in block 168
Block first atom: 2703
Blocpdb> 13 atoms in block 169
Block first atom: 2720
Blocpdb> 13 atoms in block 170
Block first atom: 2733
Blocpdb> 14 atoms in block 171
Block first atom: 2746
Blocpdb> 17 atoms in block 172
Block first atom: 2760
Blocpdb> 19 atoms in block 173
Block first atom: 2777
Blocpdb> 14 atoms in block 174
Block first atom: 2796
Blocpdb> 20 atoms in block 175
Block first atom: 2810
Blocpdb> 14 atoms in block 176
Block first atom: 2830
Blocpdb> 19 atoms in block 177
Block first atom: 2844
Blocpdb> 19 atoms in block 178
Block first atom: 2863
Blocpdb> 20 atoms in block 179
Block first atom: 2882
Blocpdb> 15 atoms in block 180
Block first atom: 2902
Blocpdb> 13 atoms in block 181
Block first atom: 2917
Blocpdb> 22 atoms in block 182
Block first atom: 2930
Blocpdb> 13 atoms in block 183
Block first atom: 2952
Blocpdb> 7 atoms in block 184
Block first atom: 2964
Blocpdb> 184 blocks.
Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1101229 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8913
Prepmat> Matrix trace = 2407520.0000
Prepmat> Last element read: 8913 8913 64.6734
Prepmat> 17021 lines saved.
Prepmat> 15061 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2971
RTB> Total mass = 2971.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2971
RTB> Number of blocks = 184
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 248090.3404
RTB> 67764 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1104
Diagstd> Nb of non-zero elements: 67764
Diagstd> Projected matrix trace = 248090.3404
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1104 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 248090.3404
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0001042 0.0015614 0.0298760 0.0553933
0.8332030 1.3383816 1.4684327 2.0113960 2.7728802
3.4012796 3.9412416 5.4598623 5.6733312 5.9957724
6.6108284 6.7725905 6.8439704 7.7877527 8.5706732
9.1187180 9.2686537 9.5186565 9.8927699 10.8224908
12.9490450 13.0238227 13.4371587 14.0737311 14.8023246
15.5586684 16.2921811 17.2700785 17.6374382 18.1714471
19.4025457 19.7291782 20.4386334 21.0152918 21.3637199
21.6759967 22.0494590 22.9313797 23.8035095 24.6758936
25.1585123 25.7220308 26.1045833 26.5677178 27.3796119
28.4337729 29.0632155 29.5234957 29.8963872 30.4551087
31.0652799 31.7371368 32.7435821 33.1273326 34.4870285
35.2410105 35.5384273 35.8752982 36.0287546 36.8258594
37.1003874 37.4466437 38.0351743 38.2280829 38.6495419
38.7805928 39.0619297 40.0935131 40.4145065 40.9364034
41.6812998 41.9927745 42.2688642 43.0454902 43.2428688
43.5402606 44.3427658 44.7407126 45.3332746 45.6420153
45.9459671 47.2183767 47.7796987 48.4552660 49.1648335
49.3415813 49.6614333 50.1710248 50.8132106 51.3218170
51.9372485 52.5468479 53.0083883 53.5600677 54.3586546
54.8452322
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034338 0.0034338 0.0034346 0.0034347
0.0034352 1.1084345 4.2909192 18.7696557 25.5578293
99.1221472 125.6276569 131.5898222 154.0082810 180.8259829
200.2702536 215.5816577 253.7383591 258.6511113 265.8997016
279.2050202 282.6003457 284.0856797 303.0409760 317.9089460
327.9156712 330.6005773 335.0295455 341.5499562 357.2390232
390.7636439 391.8903029 398.0604265 407.3801878 417.7921175
428.3329581 438.3135487 451.2762066 456.0506015 462.9030451
478.3267151 482.3361114 490.9318484 497.8092855 501.9190943
505.5741015 509.9108459 520.0084161 529.8046629 539.4258125
544.6753967 550.7416321 554.8219864 559.7220360 568.2100672
579.0452790 585.4194012 590.0368961 593.7513838 599.2738917
605.2473768 611.7572889 621.3815797 625.0122285 637.7099136
644.6432756 647.3577958 650.4187314 651.8083285 658.9792286
661.4309343 664.5103194 669.7118534 671.4080438 675.0989859
676.2425628 678.6910583 687.5944079 690.3414021 694.7845017
701.0773026 703.6919214 706.0014116 712.4577404 714.0893063
716.5405821 723.1138327 726.3513179 731.1455239 733.6310203
736.0697653 746.1923747 750.6145589 755.9024816 761.4169956
762.7844170 765.2527606 769.1689889 774.0759929 777.9403398
782.5908202 787.1701465 790.6196067 794.7231037 800.6258901
804.2012059
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2971
Rtb_to_modes> Number of blocs = 184
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0419E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5614E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9876E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5393E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8332
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.338
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.468
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.011
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.773
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.401
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.941
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.460
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.673
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.996
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.611
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.773
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.844
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.788
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.571
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.119
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.269
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.519
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.893
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.85
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 0.99997 1.00004 0.99999
0.99996 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
1.00003 1.00001 0.99997 1.00002 0.99998
1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003
0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000
1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001
1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 53478 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00000 0.99997 1.00004 0.99999
0.99996 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
1.00003 1.00001 0.99997 1.00002 0.99998
1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003
0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000
1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001
1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604162351172680512.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604162351172680512.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604162351172680512.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604162351172680512.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 365
First residue number = 41
Last residue number = 423
Number of atoms found = 2971
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0419E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5614E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9876E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5393E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8332
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.338
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.468
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.011
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.773
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.401
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.941
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.460
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.673
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.996
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.611
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.773
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.788
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.571
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.119
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.269
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.519
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.893
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.85
Bfactors> 106 vectors, 8913 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000104
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.105 for 367 C-alpha atoms.
Bfactors> = 46.253 +/- 407.26
Bfactors> = 43.430 +/- 7.34
Bfactors> Shiftng-fct= -2.823
Bfactors> Scaling-fct= 0.018
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604162351172680512.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604162351172680512.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.291
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.2
Chkmod> 106 vectors, 8913 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2971 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 45 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8512
0.0034 0.8654
0.0034 0.8145
0.0034 0.7336
0.0034 0.7839
0.0034 0.8367
1.1084 0.0218
4.2908 0.0145
18.7689 0.0207
25.5567 0.0219
99.1177 0.0219
125.6044 0.5061
131.5648 0.0331
153.9865 0.0441
180.8221 0.4088
200.2534 0.0658
215.5658 0.4628
253.7307 0.0136
258.6325 0.5172
265.8933 0.1335
279.1967 0.1570
282.5968 0.3894
284.0741 0.2570
303.0328 0.3578
317.9014 0.4317
327.9067 0.4649
330.5926 0.5182
335.0212 0.0045
341.5393 0.3623
357.1826 0.4613
390.7613 0.3125
391.8160 0.5099
398.0854 0.3496
407.3087 0.2379
417.7414 0.2323
428.3329 0.4145
438.2654 0.2798
451.2558 0.2760
456.0641 0.3070
462.8647 0.4836
478.2748 0.3839
482.3255 0.3933
490.9272 0.3051
497.8437 0.4635
501.8539 0.0449
505.5991 0.3211
509.8952 0.3029
519.9705 0.3547
529.7429 0.3020
539.4475 0.4959
544.6681 0.4475
550.6962 0.2144
554.7495 0.0147
559.7220 0.2776
568.1897 0.3511
578.9820 0.3166
585.3619 0.3439
589.9766 0.4004
593.7618 0.2223
599.2963 0.4726
605.2674 0.3823
611.7586 0.3469
621.3209 0.2051
625.0106 0.3743
637.7100 0.3849
644.6064 0.0989
647.3443 0.1801
650.4334 0.0657
651.7916 0.1988
658.9880 0.1409
661.3991 0.3200
664.5116 0.2126
669.7256 0.4656
671.3961 0.1050
675.0740 0.2980
676.2084 0.3957
678.6452 0.4165
687.5348 0.5946
690.2733 0.2887
694.7852 0.4364
701.0363 0.4645
703.6385 0.3066
705.9806 0.3684
712.4645 0.0264
714.0350 0.4445
716.5077 0.5668
723.0602 0.3603
726.3144 0.4408
731.0877 0.3685
733.5833 0.3204
736.0705 0.4960
746.1732 0.4957
750.5847 0.4769
755.9070 0.3847
761.3469 0.4531
762.7394 0.0398
765.2089 0.3490
769.1281 0.3166
774.0183 0.3535
777.8932 0.2250
782.5780 0.4710
787.1600 0.4039
790.5977 0.3015
794.6885 0.3951
800.6014 0.4182
804.2016 0.4350
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604162351172680512 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
making animated gifs
11 models are in 2604162351172680512.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604162351172680512 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
making animated gifs
11 models are in 2604162351172680512.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604162351172680512 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
making animated gifs
11 models are in 2604162351172680512.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604162351172680512 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
making animated gifs
11 models are in 2604162351172680512.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604162351172680512 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604162351172680512.eigenfacs
2604162351172680512.atom
making animated gifs
11 models are in 2604162351172680512.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604162351172680512.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604162351172680512.10.pdb
2604162351172680512.11.pdb
2604162351172680512.7.pdb
2604162351172680512.8.pdb
2604162351172680512.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m18.627s
user 0m18.514s
sys 0m0.087s
rm: cannot remove '2604162351172680512.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|