Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* IMMUNE SYSTEM 09-APR-02 1LDS *

LOGs for ID: 2604171025022908468

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604171025022908468.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604171025022908468.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604171025022908468.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     97
            First residue number     =      0
            Last  residue number     =     96
            Number of atoms found    =    809
            Mean number per residue  =      8.3

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    31.234806 +/-     8.762661 From:    13.079000 To:    53.413000
 =     0.441617 +/-     6.276875 From:   -12.728000 To:    16.107000
 =     8.159213 +/-     9.461849 From:   -15.758000 To:    30.446000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   9.2541 % Filled.
 Pdbmat>       272661  non-zero elements.
 Pdbmat>        29758 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     73.57 +/-     24.27
         Maximum number =    124
         Minimum number =     10

 Pdbmat> Matrix trace   =  595160.    
 Pdbmat> Larger element =  473.118    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
97 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604171025022908468.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604171025022908468.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604171025022908468.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   809 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    97 residues.
 Blocpdb>     8 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     8 atoms in block      2
 Block first atom:      9
 Blocpdb>     9 atoms in block      3
 Block first atom:     17
 Blocpdb>    11 atoms in block      4
 Block first atom:     26
 Blocpdb>     7 atoms in block      5
 Block first atom:     37
 Blocpdb>     7 atoms in block      6
 Block first atom:     44
 Blocpdb>     9 atoms in block      7
 Block first atom:     51
 Blocpdb>     8 atoms in block      8
 Block first atom:     60
 Blocpdb>     9 atoms in block      9
 Block first atom:     68
 Blocpdb>     7 atoms in block     10
 Block first atom:     77
 Blocpdb>    12 atoms in block     11
 Block first atom:     84
 Blocpdb>     6 atoms in block     12
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    11 atoms in block     13
 Block first atom:    102
 Blocpdb>    10 atoms in block     14
 Block first atom:    113
 Blocpdb>     7 atoms in block     15
 Block first atom:    123
 Blocpdb>     5 atoms in block     16
 Block first atom:    130
 Blocpdb>     9 atoms in block     17
 Block first atom:    135
 Blocpdb>     8 atoms in block     18
 Block first atom:    144
 Blocpdb>     4 atoms in block     19
 Block first atom:    152
 Blocpdb>     9 atoms in block     20
 Block first atom:    156
 Blocpdb>     6 atoms in block     21
 Block first atom:    165
 Blocpdb>     8 atoms in block     22
 Block first atom:    171
 Blocpdb>    11 atoms in block     23
 Block first atom:    179
 Blocpdb>     8 atoms in block     24
 Block first atom:    190
 Blocpdb>     8 atoms in block     25
 Block first atom:    198
 Blocpdb>     6 atoms in block     26
 Block first atom:    206
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    212
 Blocpdb>     7 atoms in block     28
 Block first atom:    224
 Blocpdb>     6 atoms in block     29
 Block first atom:    231
 Blocpdb>     4 atoms in block     30
 Block first atom:    237
 Blocpdb>    11 atoms in block     31
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    10 atoms in block     32
 Block first atom:    252
 Blocpdb>     7 atoms in block     33
 Block first atom:    262
 Blocpdb>     6 atoms in block     34
 Block first atom:    269
 Blocpdb>     8 atoms in block     35
 Block first atom:    275
 Blocpdb>     8 atoms in block     36
 Block first atom:    283
 Blocpdb>     9 atoms in block     37
 Block first atom:    291
 Blocpdb>     7 atoms in block     38
 Block first atom:    300
 Blocpdb>     8 atoms in block     39
 Block first atom:    307
 Blocpdb>     8 atoms in block     40
 Block first atom:    315
 Blocpdb>     8 atoms in block     41
 Block first atom:    323
 Blocpdb>     9 atoms in block     42
 Block first atom:    331
 Blocpdb>     8 atoms in block     43
 Block first atom:    340
 Blocpdb>     4 atoms in block     44
 Block first atom:    348
 Blocpdb>     9 atoms in block     45
 Block first atom:    352
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    361
 Blocpdb>     8 atoms in block     47
 Block first atom:    372
 Blocpdb>     9 atoms in block     48
 Block first atom:    380
 Blocpdb>     9 atoms in block     49
 Block first atom:    389
 Blocpdb>     7 atoms in block     50
 Block first atom:    398
 Blocpdb>     9 atoms in block     51
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    10 atoms in block     52
 Block first atom:    414
 Blocpdb>     6 atoms in block     53
 Block first atom:    424
 Blocpdb>     8 atoms in block     54
 Block first atom:    430
 Blocpdb>     8 atoms in block     55
 Block first atom:    438
 Blocpdb>     6 atoms in block     56
 Block first atom:    446
 Blocpdb>    11 atoms in block     57
 Block first atom:    452
 Blocpdb>     6 atoms in block     58
 Block first atom:    463
 Blocpdb>     9 atoms in block     59
 Block first atom:    469
 Blocpdb>     8 atoms in block     60
 Block first atom:    478
 Blocpdb>    14 atoms in block     61
 Block first atom:    486
 Blocpdb>     6 atoms in block     62
 Block first atom:    500
 Blocpdb>    11 atoms in block     63
 Block first atom:    506
 Blocpdb>    12 atoms in block     64
 Block first atom:    517
 Blocpdb>     8 atoms in block     65
 Block first atom:    529
 Blocpdb>     8 atoms in block     66
 Block first atom:    537
 Blocpdb>    12 atoms in block     67
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    12 atoms in block     68
 Block first atom:    557
 Blocpdb>     7 atoms in block     69
 Block first atom:    569
 Blocpdb>     9 atoms in block     70
 Block first atom:    576
 Blocpdb>    11 atoms in block     71
 Block first atom:    585
 Blocpdb>     7 atoms in block     72
 Block first atom:    596
 Blocpdb>     7 atoms in block     73
 Block first atom:    603
 Blocpdb>     7 atoms in block     74
 Block first atom:    610
 Blocpdb>     9 atoms in block     75
 Block first atom:    617
 Blocpdb>     9 atoms in block     76
 Block first atom:    626
 Blocpdb>     8 atoms in block     77
 Block first atom:    635
 Blocpdb>     9 atoms in block     78
 Block first atom:    643
 Blocpdb>    12 atoms in block     79
 Block first atom:    652
 Blocpdb>     5 atoms in block     80
 Block first atom:    664
 Blocpdb>     6 atoms in block     81
 Block first atom:    669
 Blocpdb>    11 atoms in block     82
 Block first atom:    675
 Blocpdb>     7 atoms in block     83
 Block first atom:    686
 Blocpdb>     8 atoms in block     84
 Block first atom:    693
 Blocpdb>    10 atoms in block     85
 Block first atom:    701
 Blocpdb>     7 atoms in block     86
 Block first atom:    711
 Blocpdb>     7 atoms in block     87
 Block first atom:    718
 Blocpdb>     8 atoms in block     88
 Block first atom:    725
 Blocpdb>     6 atoms in block     89
 Block first atom:    733
 Blocpdb>     9 atoms in block     90
 Block first atom:    739
 Blocpdb>     7 atoms in block     91
 Block first atom:    748
 Blocpdb>     9 atoms in block     92
 Block first atom:    755
 Blocpdb>     8 atoms in block     93
 Block first atom:    764
 Blocpdb>     7 atoms in block     94
 Block first atom:    772
 Blocpdb>     9 atoms in block     95
 Block first atom:    779
 Blocpdb>    14 atoms in block     96
 Block first atom:    788
 Blocpdb>     8 atoms in block     97
 Block first atom:    801

 Blocpdb>    97 blocks.

 Blocpdb> At most,     14 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       272758 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       2427

 Prepmat> Matrix trace    =     595160.0000
 Prepmat> Last element read:    2427   2427         7.4168
 Prepmat>         4754 lines saved.
 Prepmat>         3690 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   809
 RTB> Total mass =         809.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   809
 RTB> Number of blocks =    97
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  129875.8044
 RTB>     36813 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      582
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    36813
 Diagstd> Projected matrix trace =  129875.8044

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    582 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 129875.8044
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      2.4436724      3.0840311      4.1814385      4.5489783
      6.0018899      7.7858930      8.4277950     10.1189409     11.5167001
     12.6515299     13.2655743     14.3533225     15.0910699     16.4290575
     17.2229606     18.2454851     18.6290888     19.5187444     20.3117362
     21.7315906     23.1321471     24.1301131     25.0604827     25.6750986
     26.5807435     27.5182607     29.2236817     30.3877321     31.5425605
     33.3155361     33.4809439     36.1531293     36.3808243     38.5689666
     39.8624796     40.7495695     42.0801760     43.7351376     45.0000987
     45.5993812     46.4083063     47.3768661     48.2526072     49.3227848
     51.1155890     51.3615770     52.9609367     54.0435487     55.0288428
     55.2981218     56.6778434     57.9235217     58.0044962     59.9167319
     60.5293063     61.5782973     65.1181594     65.6265578     65.9272131
     68.0445794     71.8844704     72.2447649     73.1715593     73.7761334
     74.2281252     74.8067184     77.0826972     78.7180035     79.3113880
     79.4392463     80.4059986     81.4858298     82.4205960     82.7500967
     83.2329377     84.2706655     85.1519975     85.7144352     87.6297507
     88.9428050     90.0281571     91.6918989     92.7060880     93.0090901
     93.5706458     94.3326031     95.8720706     97.3355802     97.8009949
     99.2218852    100.3774405    100.9803152    101.2710354    101.6263242
    102.5296527    103.5965209    104.4880928    105.2640752    106.9731202
    108.1768587

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034331      0.0034332      0.0034334      0.0034335      0.0034339
      0.0034345    169.7527332    190.7017400    222.0537636    231.6072835
    266.0353166    303.0047907    315.2479441    345.4321925    368.5185115
    386.2484977    395.5107646    411.4068338    421.8473215    440.1509107
    450.6601789    463.8451159    468.6958268    479.7568884    489.4054528
    506.2220260    522.2798286    533.4269568    543.6132031    550.2389635
    559.8592300    569.6469426    587.0333100    598.6106305    609.8791028
    626.7851283    628.3391598    652.9324111    654.9852915    674.3949064
    685.6104604    693.1971884    704.4238536    718.1423343    728.4538004
    733.2882990    739.7639092    747.4436301    754.3200863    762.6391129
    776.3757557    778.2416239    790.2656572    798.3019855    805.5462318
    807.5147625    817.5266874    826.4617522    827.0392290    840.5611993
    844.8471216    852.1364020    876.2869389    879.7010147    881.7138021
    895.7607879    920.6887129    922.9931361    928.8945937    932.7241577
    935.5769771    939.2162159    953.3968916    963.4569539    967.0814555
    967.8606602    973.7321403    980.2488160    985.8552547    987.8239128
    990.7016626    996.8584440   1002.0576328   1005.3615329   1016.5320319
   1024.1196309   1030.3492526   1039.8262187   1045.5610780   1047.2683486
   1050.4251073   1054.6933066   1063.2645486   1071.3493028   1073.9076020
   1081.6805418   1087.9610287   1091.2233268   1092.7930023   1094.7082449
   1099.5627619   1105.2686849   1110.0145753   1114.1287208   1123.1366831
   1129.4381763

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    809
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     97

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9947E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9965E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9975E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.444    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.084    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.181    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.549    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.002    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.786    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.428    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.2    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    582 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000
 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
 1.00004 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999
 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99996 1.00003 1.00003 0.99998 1.00000
 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99995 1.00003 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000
 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998
 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996
 1.00004 0.99998 1.00001 1.00005 1.00002
 0.99999 1.00003 0.99999 0.99997 1.00004
 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00000 1.00004 0.99997 0.99999 1.00000
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99997 1.00001 1.00004 0.99999 1.00002
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    14562 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000
 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
 1.00004 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999
 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
 0.99996 1.00003 1.00003 0.99998 1.00000
 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99995 1.00003 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000
 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998
 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996
 1.00004 0.99998 1.00001 1.00005 1.00002
 0.99999 1.00003 0.99999 0.99997 1.00004
 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
 1.00000 1.00004 0.99997 0.99999 1.00000
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003
 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99997 1.00001 1.00004 0.99999 1.00002
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604171025022908468.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604171025022908468.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604171025022908468.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604171025022908468.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     97
            First residue number     =      0
            Last  residue number     =     96
            Number of atoms found    =    809
            Mean number per residue  =      8.3

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9947E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9965E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9975E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.444    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.084    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.181    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.549    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.002    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.786    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.428    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.2    

 Bfactors>  106 vectors,   2427 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     2.444000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.355 for     97 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.052 +/-   0.07
 Bfactors> =      9.171 +/-   7.73
 Bfactors> Shiftng-fct=      9.119
 Bfactors> Scaling-fct=    105.660

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604171025022908468.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604171025022908468.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4332E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   169.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   190.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   222.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   231.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   266.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   303.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   315.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   345.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   368.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   386.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   395.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   411.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   421.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   440.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   450.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   463.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   468.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   479.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   489.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   506.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   522.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   533.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   543.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   550.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   559.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   569.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   587.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   598.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   609.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   626.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   628.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   652.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   654.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   674.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   685.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   693.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   704.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   718.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   733.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   739.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   747.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   754.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   762.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   776.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   778.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   790.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   798.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   805.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   807.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   817.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   826.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   827.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   840.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   844.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   852.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   876.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   879.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   881.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   895.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   920.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   922.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   928.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   932.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   935.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   939.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   953.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   963.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   967.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   967.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   973.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   980.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   985.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   987.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   990.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   996.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1002.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1005.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1016.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1024.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1030.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1040.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1046.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1047.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1050.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1055.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1063.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1071.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1074.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1082.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1088.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1091.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1093.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1095.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1099.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1105.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1110.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1114.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1123.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1130.    

 Chkmod>  106 vectors,   2427 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    809 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    33 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    64 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    82 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   103 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9379
      0.0034      0.7358
      0.0034      0.7078
      0.0034      0.7333
      0.0034      0.9466
      0.0034      0.8285
    169.7568      0.1461
    190.6926      0.2508
    222.0326      0.4207
    231.5979      0.1563
    266.0263      0.3084
    302.9939      0.2020
    315.2382      0.4371
    345.4354      0.1659
    368.5555      0.1087
    386.2086      0.0667
    395.5598      0.1116
    411.3416      0.4832
    421.8143      0.1227
    440.1446      0.2713
    450.6021      0.1578
    463.8826      0.4003
    468.6872      0.2597
    479.7517      0.2337
    489.3635      0.2539
    506.1818      0.2752
    522.2332      0.2844
    533.4028      0.3332
    543.5846      0.2342
    550.2679      0.2091
    559.8274      0.0682
    569.6405      0.1969
    586.9711      0.1552
    598.6073      0.3474
    609.8282      0.2188
    626.8002      0.4547
    628.3033      0.3031
    652.8761      0.1772
    654.9498      0.3714
    674.3750      0.2411
    685.5597      0.0942
    693.1711      0.4170
    704.3921      0.1705
    718.1514      0.3594
    728.4217      0.3554
    733.2618      0.3556
    739.7457      0.4339
    747.4363      0.4978
    754.2673      0.3685
    762.5848      0.3537
    776.3759      0.4529
    778.1963      0.2109
    790.2247      0.2275
    798.2415      0.4773
    805.5201      0.4662
    807.4938      0.0662
    817.5071      0.2658
    826.4012      0.3456
    826.9717      0.3049
    840.5480      0.3197
    844.8157      0.4495
    852.1116      0.4023
    876.2617      0.3773
    879.6863      0.2885
    881.6946      0.4014
    895.6922      0.3982
    920.6206      0.3784
    922.9231      0.3471
    928.8448      0.3062
    932.7086      0.3756
    935.5486      0.4280
    939.1965      0.5341
    953.3393      0.4223
    963.4278      0.0748
    967.0315      0.3150
    967.8237      0.3852
    973.7146      0.3969
    980.2318      0.4503
    985.8094      0.1408
    987.7809      0.4454
    990.6417      0.4129
    996.8117      0.1494
   1002.0029      0.4162
   1005.2924      0.4554
   1016.4898      0.4793
   1024.0595      0.1033
   1030.3156      0.2415
   1039.7708      0.3564
   1045.5383      0.4562
   1047.2285      0.3493
   1050.3764      0.4162
   1054.6335      0.2540
   1063.2074      0.2724
   1071.3276      0.4087
   1073.8560      0.1782
   1081.6238      0.2320
   1088.0366      0.4601
   1091.2828      0.4481
   1092.9023      0.3223
   1094.5195      0.4418
   1099.3566      0.3380
   1105.2398      0.4484
   1110.0302      0.3869
   1114.2710      0.4545
   1123.2296      0.3362
   1129.5105      0.1065
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171025022908468 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171025022908468.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171025022908468 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171025022908468.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171025022908468 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171025022908468.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171025022908468 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171025022908468.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171025022908468 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171025022908468.eigenfacs
2604171025022908468.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171025022908468.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171025022908468.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604171025022908468.10.pdb
2604171025022908468.11.pdb
2604171025022908468.7.pdb
2604171025022908468.8.pdb
2604171025022908468.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m2.781s
user	0m2.740s
sys	0m0.038s
rm: cannot remove '2604171025022908468.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know. elNémo has been hacked on november 27th. It has been moved away and runs again. **Still some additional cleaning from time to time** Sorry for the inconvenience.

*** IMMUNE SYSTEM 09-APR-02 1LDS ***

LOGs for ID: 2604171025022908468

Output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* IMMUNE SYSTEM 09-APR-02 1LDS *
