Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* IMMUNE SYSTEM 09-APR-02 1LDS *

LOGs for ID: 2604171641013049662

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604171641013049662.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604171641013049662.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604171641013049662.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     97
            First residue number     =      0
            Last  residue number     =     96
            Number of atoms found    =    810
            Mean number per residue  =      8.4

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    31.225021 +/-     8.760517 From:    13.079000 To:    53.413000
 =     0.438258 +/-     6.273686 From:   -12.728000 To:    16.107000
 =     8.154395 +/-     9.457099 From:   -15.758000 To:    30.446000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   9.2659 % Filled.
 Pdbmat>       273684  non-zero elements.
 Pdbmat>        29871 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     73.76 +/-     24.42
         Maximum number =    125
         Minimum number =     10

 Pdbmat> Matrix trace   =  597420.    
 Pdbmat> Larger element =  473.334    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
97 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604171641013049662.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604171641013049662.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604171641013049662.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   810 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    97 residues.
 Blocpdb>     8 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     8 atoms in block      2
 Block first atom:      9
 Blocpdb>     9 atoms in block      3
 Block first atom:     17
 Blocpdb>    11 atoms in block      4
 Block first atom:     26
 Blocpdb>     7 atoms in block      5
 Block first atom:     37
 Blocpdb>     7 atoms in block      6
 Block first atom:     44
 Blocpdb>     9 atoms in block      7
 Block first atom:     51
 Blocpdb>     8 atoms in block      8
 Block first atom:     60
 Blocpdb>     9 atoms in block      9
 Block first atom:     68
 Blocpdb>     7 atoms in block     10
 Block first atom:     77
 Blocpdb>    12 atoms in block     11
 Block first atom:     84
 Blocpdb>     6 atoms in block     12
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    11 atoms in block     13
 Block first atom:    102
 Blocpdb>    10 atoms in block     14
 Block first atom:    113
 Blocpdb>     7 atoms in block     15
 Block first atom:    123
 Blocpdb>     5 atoms in block     16
 Block first atom:    130
 Blocpdb>     9 atoms in block     17
 Block first atom:    135
 Blocpdb>     8 atoms in block     18
 Block first atom:    144
 Blocpdb>     4 atoms in block     19
 Block first atom:    152
 Blocpdb>     9 atoms in block     20
 Block first atom:    156
 Blocpdb>     6 atoms in block     21
 Block first atom:    165
 Blocpdb>     8 atoms in block     22
 Block first atom:    171
 Blocpdb>    11 atoms in block     23
 Block first atom:    179
 Blocpdb>     8 atoms in block     24
 Block first atom:    190
 Blocpdb>     8 atoms in block     25
 Block first atom:    198
 Blocpdb>     6 atoms in block     26
 Block first atom:    206
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    212
 Blocpdb>     8 atoms in block     28
 Block first atom:    224
 Blocpdb>     6 atoms in block     29
 Block first atom:    232
 Blocpdb>     4 atoms in block     30
 Block first atom:    238
 Blocpdb>    11 atoms in block     31
 Block first atom:    242
 Blocpdb>    10 atoms in block     32
 Block first atom:    253
 Blocpdb>     7 atoms in block     33
 Block first atom:    263
 Blocpdb>     6 atoms in block     34
 Block first atom:    270
 Blocpdb>     8 atoms in block     35
 Block first atom:    276
 Blocpdb>     8 atoms in block     36
 Block first atom:    284
 Blocpdb>     9 atoms in block     37
 Block first atom:    292
 Blocpdb>     7 atoms in block     38
 Block first atom:    301
 Blocpdb>     8 atoms in block     39
 Block first atom:    308
 Blocpdb>     8 atoms in block     40
 Block first atom:    316
 Blocpdb>     8 atoms in block     41
 Block first atom:    324
 Blocpdb>     9 atoms in block     42
 Block first atom:    332
 Blocpdb>     8 atoms in block     43
 Block first atom:    341
 Blocpdb>     4 atoms in block     44
 Block first atom:    349
 Blocpdb>     9 atoms in block     45
 Block first atom:    353
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    362
 Blocpdb>     8 atoms in block     47
 Block first atom:    373
 Blocpdb>     9 atoms in block     48
 Block first atom:    381
 Blocpdb>     9 atoms in block     49
 Block first atom:    390
 Blocpdb>     7 atoms in block     50
 Block first atom:    399
 Blocpdb>     9 atoms in block     51
 Block first atom:    406
 Blocpdb>    10 atoms in block     52
 Block first atom:    415
 Blocpdb>     6 atoms in block     53
 Block first atom:    425
 Blocpdb>     8 atoms in block     54
 Block first atom:    431
 Blocpdb>     8 atoms in block     55
 Block first atom:    439
 Blocpdb>     6 atoms in block     56
 Block first atom:    447
 Blocpdb>    11 atoms in block     57
 Block first atom:    453
 Blocpdb>     6 atoms in block     58
 Block first atom:    464
 Blocpdb>     9 atoms in block     59
 Block first atom:    470
 Blocpdb>     8 atoms in block     60
 Block first atom:    479
 Blocpdb>    14 atoms in block     61
 Block first atom:    487
 Blocpdb>     6 atoms in block     62
 Block first atom:    501
 Blocpdb>    11 atoms in block     63
 Block first atom:    507
 Blocpdb>    12 atoms in block     64
 Block first atom:    518
 Blocpdb>     8 atoms in block     65
 Block first atom:    530
 Blocpdb>     8 atoms in block     66
 Block first atom:    538
 Blocpdb>    12 atoms in block     67
 Block first atom:    546
 Blocpdb>    12 atoms in block     68
 Block first atom:    558
 Blocpdb>     7 atoms in block     69
 Block first atom:    570
 Blocpdb>     9 atoms in block     70
 Block first atom:    577
 Blocpdb>    11 atoms in block     71
 Block first atom:    586
 Blocpdb>     7 atoms in block     72
 Block first atom:    597
 Blocpdb>     7 atoms in block     73
 Block first atom:    604
 Blocpdb>     7 atoms in block     74
 Block first atom:    611
 Blocpdb>     9 atoms in block     75
 Block first atom:    618
 Blocpdb>     9 atoms in block     76
 Block first atom:    627
 Blocpdb>     8 atoms in block     77
 Block first atom:    636
 Blocpdb>     9 atoms in block     78
 Block first atom:    644
 Blocpdb>    12 atoms in block     79
 Block first atom:    653
 Blocpdb>     5 atoms in block     80
 Block first atom:    665
 Blocpdb>     6 atoms in block     81
 Block first atom:    670
 Blocpdb>    11 atoms in block     82
 Block first atom:    676
 Blocpdb>     7 atoms in block     83
 Block first atom:    687
 Blocpdb>     8 atoms in block     84
 Block first atom:    694
 Blocpdb>    10 atoms in block     85
 Block first atom:    702
 Blocpdb>     7 atoms in block     86
 Block first atom:    712
 Blocpdb>     7 atoms in block     87
 Block first atom:    719
 Blocpdb>     8 atoms in block     88
 Block first atom:    726
 Blocpdb>     6 atoms in block     89
 Block first atom:    734
 Blocpdb>     9 atoms in block     90
 Block first atom:    740
 Blocpdb>     7 atoms in block     91
 Block first atom:    749
 Blocpdb>     9 atoms in block     92
 Block first atom:    756
 Blocpdb>     8 atoms in block     93
 Block first atom:    765
 Blocpdb>     7 atoms in block     94
 Block first atom:    773
 Blocpdb>     9 atoms in block     95
 Block first atom:    780
 Blocpdb>    14 atoms in block     96
 Block first atom:    789
 Blocpdb>     8 atoms in block     97
 Block first atom:    802

 Blocpdb>    97 blocks.

 Blocpdb> At most,     14 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       273781 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       2430

 Prepmat> Matrix trace    =     597420.0000
 Prepmat> Last element read:    2430   2430         7.4168
 Prepmat>         4754 lines saved.
 Prepmat>         3684 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   810
 RTB> Total mass =         810.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   810
 RTB> Number of blocks =    97
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  130131.1018
 RTB>     37029 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      582
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    37029
 Diagstd> Projected matrix trace =  130131.1018

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    582 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 130131.1018
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      2.4478622      3.0847095      4.1856208      4.5544241
      6.0154449      7.7973384      8.4332895     10.1195991     11.5186791
     12.6561879     13.2762618     14.3953664     15.0942366     16.4694067
     17.2358005     18.3131269     18.6378947     19.5306579     20.3425571
     21.7490923     23.1596008     24.2146096     25.0996577     25.7305672
     26.6133830     27.5785990     29.2301271     30.4830240     31.6009082
     33.4591389     33.5271748     36.1932959     36.6428933     38.6005978
     39.9023879     40.9273149     42.2462747     43.7749257     45.0077541
     45.7357264     46.4687854     47.8080701     48.5001036     49.3835276
     51.2031512     51.5082082     53.0577977     54.1873561     55.2223850
     55.4358897     56.8351938     58.0179373     58.0497854     60.1930817
     60.8922755     61.7346865     65.5191889     66.2222035     66.3148286
     68.1515348     72.0296559     72.3537922     73.3788017     73.9116031
     74.7742277     75.2903422     77.7493106     78.8098713     79.4802912
     79.6910939     80.5511050     82.0532504     82.5102904     82.9920108
     83.4359110     84.4379514     85.2850961     86.0709060     87.8838956
     89.0116490     90.0791766     92.0684519     92.9278799     93.1597309
     94.0096558     94.9235671     96.1575547     97.5919249     97.9793505
     99.4084023    100.7789126    101.0908533    101.5155573    102.0308502
    102.6502491    104.0440426    104.6555793    105.5615797    107.1227334
    108.2211062

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034332      0.0034333      0.0034337      0.0034338      0.0034338
      0.0034344    169.8981935    190.7227134    222.1647852    231.7458760
    266.3355618    303.2274215    315.3506897    345.4434278    368.5501737
    386.3195958    395.6700553    412.0089419    421.8915787    440.6910779
    450.8281326    464.7041305    468.8065893    479.9032786    489.7766224
    506.4258299    522.5896628    534.3600917    544.0379299    550.8330121
    560.2028611    570.2711228    587.0980419    599.5484776    610.4429220
    628.1345186    628.7728196    653.2950187    657.3401494    674.6713923
    685.9535741    694.7073709    705.8127341    718.4689253    728.5157596
    734.3837713    740.2457806    750.8373819    756.2521346    763.1085770
    777.0404461    779.3517261    790.9879912    799.3634025    806.9615835
    808.5200447    818.6607194    827.1350461    827.3620371    842.4974003
    847.3764344    853.2177930    878.9810989    883.6842081    884.3019974
    896.4645093    921.6180045    923.6893355    930.2091087    933.5801114
    939.0122294    942.2473305    957.5105191    964.0189908    968.1106661
    969.3936585    974.6103776    983.6558408    986.3915385    989.2667762
    991.9088986    997.8473865   1002.8404702   1007.4499220   1018.0050443
   1024.5159017   1030.6411637   1041.9591687   1046.8110413   1048.1161021
   1052.8863893   1057.9918088   1064.8464455   1072.7591373   1074.8863761
   1082.6967353   1090.1345758   1091.8204174   1094.1114977   1096.8848370
   1100.2092303   1107.6534113   1110.9038538   1115.7020229   1123.9218210
   1129.6691393

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    810
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     97

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9963E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9989E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9992E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.448    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.085    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.186    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.554    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.015    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.797    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.433    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.2    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    582 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000
 0.99998 0.99997 1.00002 0.99997 1.00000
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 1.00004
 1.00000 0.99995 1.00000 0.99995 1.00002
 0.99996 1.00003 1.00001 1.00002 1.00001
 0.99998 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002
 0.99998 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00004 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003
 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999
 0.99997 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001
 0.99996 0.99998 0.99997 0.99997 0.99998
 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00004
 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99996

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    14580 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000
 0.99998 0.99997 1.00002 0.99997 1.00000
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 1.00004
 1.00000 0.99995 1.00000 0.99995 1.00002
 0.99996 1.00003 1.00001 1.00002 1.00001
 0.99998 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002
 0.99998 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00004 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003
 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999
 0.99997 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001
 0.99996 0.99998 0.99997 0.99997 0.99998
 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00004
 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
 0.99996

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604171641013049662.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604171641013049662.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604171641013049662.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604171641013049662.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     97
            First residue number     =      0
            Last  residue number     =     96
            Number of atoms found    =    810
            Mean number per residue  =      8.4

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9963E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9989E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9992E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.448    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.085    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.186    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.554    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.015    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.797    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.433    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.2    

 Bfactors>  106 vectors,   2430 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     2.448000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.356 for     97 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.052 +/-   0.07
 Bfactors> =      9.171 +/-   7.73
 Bfactors> Shiftng-fct=      9.119
 Bfactors> Scaling-fct=    105.631

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604171641013049662.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604171641013049662.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4332E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   169.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   190.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   222.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   231.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   266.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   303.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   315.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   345.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   368.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   386.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   395.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   412.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   421.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   440.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   450.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   464.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   468.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   479.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   489.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   506.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   522.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   534.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   544.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   550.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   560.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   570.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   587.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   599.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   610.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   628.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   628.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   653.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   657.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   674.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   685.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   694.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   705.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   718.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   734.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   740.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   750.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   756.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   763.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   777.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   779.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   791.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   799.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   806.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   808.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   827.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   827.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   842.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   847.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   853.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   878.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   884.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   896.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   921.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   923.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   930.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   938.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   942.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   957.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   964.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   968.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   969.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   974.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   983.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   986.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   989.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   991.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   997.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1003.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1007.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1018.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1024.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1031.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1042.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1047.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1048.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1053.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1058.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1065.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1073.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1075.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1083.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1090.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1092.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1094.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1097.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1100.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1107.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1111.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1116.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1124.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1130.    

 Chkmod>  106 vectors,   2430 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    810 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    16 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    79 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    95 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.6447
      0.0034      0.8557
      0.0034      0.9431
      0.0034      0.7740
      0.0034      0.7425
      0.0034      0.9021
    169.8957      0.1448
    190.7235      0.2504
    222.1653      0.4197
    231.7251      0.1547
    266.3143      0.3106
    303.2078      0.2011
    315.3317      0.4373
    345.4354      0.1656
    368.5555      0.1086
    386.3612      0.0658
    395.7088      0.1128
    412.0576      0.4789
    421.8143      0.1216
    440.6801      0.2678
    450.8637      0.1533
    464.6445      0.3980
    468.8129      0.2554
    479.8746      0.2354
    489.7248      0.2532
    506.4147      0.2738
    522.5717      0.2772
    534.2863      0.3285
    544.0183      0.2374
    550.8033      0.2084
    560.1432      0.0694
    570.2611      0.1998
    587.0716      0.1510
    599.4930      0.3450
    610.4079      0.2187
    628.1156      0.3967
    628.7723      0.3238
    653.2372      0.1770
    657.2860      0.3673
    674.6372      0.2420
    685.9036      0.0872
    694.7003      0.3983
    705.8136      0.1817
    718.3977      0.3542
    728.5027      0.3655
    734.3866      0.3518
    740.2237      0.4197
    750.8203      0.4820
    756.2189      0.3631
    763.0486      0.3510
    776.9832      0.4102
    779.3318      0.2191
    790.9705      0.2324
    799.3486      0.4949
    806.9095      0.1873
    808.5153      0.2176
    818.6602      0.2419
    827.1142      0.3627
    827.3280      0.3117
    842.4397      0.3193
    847.3242      0.4466
    853.1488      0.4042
    878.9488      0.3402
    883.6316      0.2134
    884.2318      0.3763
    896.4159      0.4105
    921.5806      0.3789
    923.6255      0.3264
    930.1768      0.2971
    933.5299      0.3295
    938.9454      0.5713
    942.2047      0.4186
    957.4737      0.4251
    963.9784      0.0504
    968.0673      0.3090
    969.3454      0.4116
    974.5619      0.3922
    983.5941      0.4827
    986.3475      0.1219
    989.2123      0.5073
    991.8906      0.3758
    997.8167      0.1703
   1002.8263      0.4505
   1007.4014      0.4194
   1017.9388      0.4871
   1024.4624      0.0893
   1030.6016      0.2656
   1041.9232      0.3663
   1046.7780      0.4751
   1048.0726      0.3380
   1052.8431      0.4274
   1057.9265      0.2996
   1064.8143      0.2458
   1072.7025      0.4010
   1074.8438      0.1745
   1082.6590      0.2469
   1090.2018      0.4667
   1091.8229      0.3914
   1093.9807      0.3086
   1096.6719      0.4330
   1100.4286      0.3539
   1107.3714      0.4577
   1111.0919      0.3888
   1115.8571      0.4604
   1123.7543      0.3426
   1129.5105      0.1129
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171641013049662 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171641013049662.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171641013049662 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171641013049662.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171641013049662 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171641013049662.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171641013049662 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171641013049662.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171641013049662 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604171641013049662.eigenfacs
2604171641013049662.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171641013049662.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171641013049662.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604171641013049662.10.pdb
2604171641013049662.11.pdb
2604171641013049662.7.pdb
2604171641013049662.8.pdb
2604171641013049662.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m2.727s
user	0m2.699s
sys	0m0.026s
rm: cannot remove '2604171641013049662.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know. elNémo has been hacked on november 27th. It has been moved away and runs again. **Still some additional cleaning from time to time** Sorry for the inconvenience.

*** IMMUNE SYSTEM 09-APR-02 1LDS ***

LOGs for ID: 2604171641013049662

Output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* IMMUNE SYSTEM 09-APR-02 1LDS *
